The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
CGAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
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| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
8
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X2K A; 2J6F A; 1RUW A; 1KFZ A; 2K6D A; 3GBQ A; 2J06 A; 2D1X A; 1K76 A; 2MOX A; 1QWF A; 1OOT A; 1UTI A; 1RLP C; 1JXO A; 1YP5 A; 1PWT A; 2IIM A; 1WYX A; 1KIK A; 4HVU A; 4FSS A; 2BZX A; 2DL3 A; 1KJW A; 1YWP A; 1SEM A; 2HDA A; 1TUC A; 2W0Z A; 1H8K A; 5L23 A; 2KGT A; 2KBT A; 1QLY A; 3UA6 A; 2RNA A; 4OMM A; 2CT3 A; 4LUE A; 2EW3 A; 3I5R A; 2B86 A; 4JZ4 A; 2JW4 A; 3U23 A; 1X43 A; 4CC7 A; 2GGR A; 4OMN A; 2DMO A; 2O31 A; 4J9I A; 1UUE A; 1ZLM A; 4JJC A; 2JM9 A; 4Z8A A; 4Y92 A; 1UGV A; 2CSQ A; 4J9E A; 3H0F A; 2FRW A; 2YUO A; 1FMK A; 1B3Q A; 5FWB A; 2FRY A; 2KT8 A; 4J9C A; 2EYX A; 4LE9 A; 3ZL7 C; 2VWF A; 2KR3 A; 3VRZ A; 1M3C A; 3IQL A; 2LJ1 A; 2FEI A; 3PE0 A; 2K9G A; 4D8K A; 2L3Q A; 3UF4 A; 1MUZ A; 1WA7 A; 1GRI A; 1BU1 A; 1K9A A; 1TG0 A; 2RF0 A; 1G2B A; 2DNU A; 3M0T A; 2QDL A; 2KXC A; 2M0Y A; 2RQV A; 1ZUY A; 2OAW A; 2K2M A; 2O88 A; 2FG0 A; 3LH5 A; 2A36 A; 1HJD A; 1W6X A; 2DRK A; 3EGU A; 4ESR A; 1MV3 A; 3THK A; 1Z9Z A; 4ORZ A; 1M8M A; 1ZUK A; 3NMZ C; 5ECA A; 2ENM A; 4JPB W; 2HEQ A; 4AFZ C; 1VA7 A; 2O9S A; 2DM1 A; 3EG3 A; 2F2W A; 2FPE A; 1WXB A; 2I0N A; 2X3X D; 1YNZ A; 1AVZ C; 3UAT A; 2LMJ A; 4JZ3 A; 1HSQ A; 4CC3 A; 1EFN A; 2GBQ A; 2KYB A; 2HSP A; 2EGC A; 2CUB A; 4Z89 A; 4RTT A; 3PVL A; 2RQT A; 1AZG B; 4F17 A; 1NLP C; 1I0C A; 2DBK A; 2KT1 A; 2ROL A; 4X1V A; 1YN8 A; 1NM7 A; 1BK2 A; 2RMO A; 3JV3 A; 1PRM C; 2RPN A; 1UHF A; 2CDT A; 1Y57 A; 1V1C A; 3REA B; 1S1N A; 2NUZ A; 2X3W D; 2EGE A; 1PHT A; 1U06 A; 1UJ0 A; 4OMP A; 4AG2 C; 4AG1 C; 4A63 B; 2LJ0 A; 2EKH A; 1E6G A; 2AZS A; 4QT7 A; 5EC7 A; 3I5S A; 1X6B A; 2L0A A; 2C0T A; 3FJ5 A; 2PNI A; 1M3A A; 1U5S A; 1BBZ A; 1UHC A; 2VKN A; 1T0J A; 1GCQ A; 2BZ8 A; 1AOJ A; 1CKA A; 2PTK A; 1NG2 A; 1E6H A; 1JU5 C; 2DA9 A; 2ED1 A; 1LCK A; 1T0H A; 1ZBJ A; 2AKL A; 1X69 A; 2J05 A; 3EG1 A; 2YUP A; 2KYM A; 2L3S A; 3M0U A; 4DEY A; 2DRM A; 1SRL A; 3SEM A; 2DE0 X; 3VS3 A; 4HXJ A; 1AWO A; 2EQI A; 2YT6 A; 1CSK A; 1NYF A; 2MIO A; 1X6G A; 3VS0 A; 2ESW A; 1JEG A; 1NYG A; 3EG0 A; 2G6F X; 2KNB B; 5IHI A; 2YUN A; 2KE9 A; 4LUD A; 1MV0 B; 1J3T A; 4HVW A; 4GLM A; 3O5Z A; 1GCP A; 4KRT A; 2CRE A; 2EYZ A; 1SSH A; 2PZ1 A; 2DYB A; 3EHQ A; 2K79 A; 2GTO A; 5IXF A; 1KSW A; 2M51 A; 3RBB B; 4J9B A; 3VS4 A; 4AFQ C; 1OPK A; 1X27 A; 2HCK A; 2LNH B; 1GFC A; 2JM8 A; 3VS2 A; 1NLO C; 2JS2 A; 2DLP A; 1RLQ C; 4D8D A; 1IO6 A; 1AWJ A; 4RTZ A; 3QWY A; 2J6K A; 2DL4 A; 4F14 A; 2AK5 A; 1ARK A; 1GL5 A; 2BTT A; 1TUD A; 2D8H A; 2DL5 A; 4ZNX A; 2J6O A; 5GJV B; 2DBM A; 2KXD A; 3TVT A; 4CC4 B; 2AKK A; 1U3O A; 1I1J A; 1WDX A; 2AZV A; 1RI9 A; 2MCN A; 2K7A A; 1AWX A; 2RQR A; 3QWX X; 1ABO A; 3NGP A; 1YCS B; 4R0K A; 2LJ3 A; 1W70 A; 5IHK A; 1UJY A; 3H41 A; 1QWE A; 2HBW A; 2YDL A; 1M27 C; 1GBR A; 3EG2 A; 1Y0M A; 2F2V A; 2YUQ A; 2K3B A; 2EVR A; 4RUG A; 1JXM A; 1B07 A; 2F2X A; 2JTE A; 4HVV A; 2JXB A; 2DL7 A; 4J9F A; 3NPF A; 2ECZ A; 1I07 A; 2LX7 A; 4EIK A; 1VYV A; 1ABQ A; 1UFF A; 1PKT A; 1N5Z A; 2CH4 A; 2E5K A; 4JJB A; 3M0R A; 1AWW A; 2YSQ A; 2D8J A; 2SEM A; 2OI3 A; 4AFU C; 4LN2 A; 1BB9 A; 1M30 A; 4F16 A; 2CUD A; 3VS1 A; 2RN8 A; 4Z88 A; 4M4Z A; 3KFV A; 1UG1 A; 2DIL A; 1PRL C; 4RTV A; 1Z9Q A; 1JQQ A; 1AD5 A; 4DEX A; 1NEB A; 1GCQ C; 2EPD A; 1PKS A; 2A37 A; 1WFW A; 4J9G A; 4LNP A; 1NEG A; 1WIE A; 1M3B A; 2L3P A; 5I11 A; 1PNJ A; 4OMO A; 2FO0 A; 1YWO A; 2XMF A; 4E6R A; 4JJD A; 1QCF A; 2BZY A; 2CSI A; 3VS5 A; 4OML A; 2LQN A; 3UA7 A; 3TSZ A; 4AFS C; 2KEA A; 1JO8 A; 1K4U S; 3H0I A; 3M0Q A; 2JT4 A; 1OV3 A; 1SRM A; 3C0C A; 3VS7 A; 4K11 A; 2GQI A; 2ROT A; 2EGA A; 2LCS A; 2EYY A; 3VS6 A; 5IXB A; 2VVK A; 1E7O A; 2V1R A; 1WI7 A; 1K0X A; 4IIO A; 1T3L A; 4IIM A; 1K1Z A; 1QKW A; 5IH2 A; 1QKX A; 1K0S A; 2OJ2 A; 1AEY A; 2LZ6 B; 1WLP B; 2A28 A; 3A98 A; 1CKB A; 2LQW A; 2ED0 A; 3H0H A; 2L2P A; 1G83 A; 4OMQ A; 5GJW B; 2DF6 A; 3REB B; 2CT4 A; 1VYU A; 5FW9 A; 5HCK A; 2A08 A; 2FPD A; 2KRN A; 1T3S A; 1UDL A; 1A0N B; 5IHN A; 1AZE A; 3RNJ A; 3NHN A; 2SRC A; 1WXU A; 2KRM A; 1H3H A; 4RTU A; 2DL8 A; 1HD3 A; 3EHR A; 4RTX A; 4HCK A; 4RTY A; 3R6N A; 2ABL A; 2J7I A; 1VYT A; 3ULR B; 2NWM A; 3M0P A; 3I9Q A; 4J9H A; 2EYW A; 1ZSG A; 2DX1 A; 1GBQ A; 1OEB A; 5I22 A; 2FPF A; 1H92 A; 3SHW A; 1XOV A; 1ZX6 A; 4RTW A; 4CC2 A; 2GTJ A; 1UEC A; 2KRO A; 2GNC A; 2V1Q A; 1W1F A; 2RQU A; 1SPK A; 2DVJ A; 2W10 A; 4WCI A; 2O2O A; 3I35 A; 2LP5 A; 3VRY A; 1OPL A; 5FWC A; 2H8H A; 2P4R A; 4J9D A; 1UE9 A; 2JMC A; 2DJQ A; 3M0S A; 1ZUU A; 2CH4 W; 2D0N A; 4GBQ A; 2JS0 A; 1SHG A; 1X2Q A; 3CQT A; 2C0O A; 2EBP A; 1GFD A; 3PVQ A; 2KRS A; 2C0I A; 1FYN A; 1SHF A; 1WX6 A; 1WXT A; 2RQW A; 3TSW A; 2JMA A; 2O9V A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MK5 A; 2E3I A; 2J6F A; 2K6D A; 2HAX A; 2AT1 B; 3GBQ A; 2R5A A; 3OS0 A; 3J7A F; 2D1X A; 2CZ7 B; 1QWF A; 3CME A; 1BCM A; 1IHV A; 1OOT A; 1RLP C; 1PWT A; 1M90 C; 3CCL T; 3Q1J A; 4FSS A; 2BZX A; 1IB8 A; 2DL3 A; 2HBP A; 4PNO A; 4BE0 A; 2KGT A; 1WJR A; 2M0O A; 1KHI A; 4OP0 A; 2CT3 A; 5GAO q; 3CPW P; 1NJI R; 3MEV A; 1YIJ A; 4NOY A; 4JZ4 A; 1K73 R; 1K8A C; 3U23 A; 2LX9 A; 1WNL A; 1KQS A; 2DEU A; 1MHN A; 5GAO l; 3M54 A; 2O31 A; 2CZ1 B; 4M78 G; 2X9H A; 4JJC A; 4Z8A A; 3LWH A; 4ZGD B; 4J9C A; 1O75 A; 4LE9 A; 5CIU A; 1VQL A; 3N5B B; 3MCA B; 4M75 D; 1YBY A; 4IUP A; 5HY6 A; 4D8K A; 1MUZ A; 2V8I A; 4FM4 B; 1VQM T; 1K9A A; 1MNE A; 4BY6 B; 3E2U A; 2QDL A; 1ZUY A; 2OAW A; 2K2M A; 2O4X B; 4XAX B; 5DLO A; 2A36 A; 1QP2 A; 4RKU E; 1W6X A; 4RCB A; 1BIA A; 1MV3 A; 2QK0 A; 1PSE A; 4M7A F; 1ZQ1 A; 1Z9Z A; 1ZUK A; 3CCJ A; 1K73 U; 1U1S A; 3NMZ C; 2ENM A; 3OYY A; 2KY9 A; 4AFZ C; 4C0Z A; 1VA7 A; 2DM1 A; 2F2W A; 3QO3 A; 1WXB A; 5LJ3 e; 2RJF A; 2E4H A; 1RI0 A; 2ZPE B; 3FB9 A; 2GQV A; 1WJS A; 4JZ3 A; 4M77 D; 1HSQ A; 2P84 A; 2E6N A; 3PGG A; 3CCU A; 2KYB A; 2EGC A; 4PJJ A; 5A0L A; 3PVL A; 5DM7 R; 4F17 A; 1QVF A; 1M90 U; 1NLP C; 3SD4 A; 1I0C A; 6AT1 B; 3CCL A; 5KYW A; 4HT8 A; 2RI5 A; 2ROL A; 3JCM b; 2RI3 A; 3FJP A; 4R55 A; 2NLU A; 3JV3 A; 1LVK A; 2X51 A; 2OTJ A; 5LJ5 e; 2CDT A; 1PC0 A; 3UPU A; 2YRV A; 3G4S T; 4LDU A; 5GAM d; 2DXT A; 4OMP A; 3HPW A; 2LJ0 A; 2KQW A; 4YTL A; 5CAI A; 2DD4 A; 2RD1 A; 2OX7 A; 4DBH A; 2M1H A; 1X6B A; 2L0A A; 2PNI A; 3V7R A; 1VQ7 Q; 2VKN A; 3QUI A; 5FU7 C; 1CKA A; 2PTK A; 1NG2 A; 2DA9 A; 2ED1 A; 1LCK A; 1ZBJ A; 2AKL A; 1X69 A; 1VQM A; 2EAY A; 4N4H A; 2YUP A; 1RAI B; 3M0U A; 3S3M A; 4QW2 A; 4FSX A; 3OYL A; 1IZ6 A; 3LX7 A; 1VQN T; 2MIO A; 3G6E T; 2ESW A; 4X34 A; 3SB2 A; 1KC8 C; 3CCQ T; 3CC4 T; 3MO8 A; 1OQK A; 2COY A; 3R6O A; 3BDL A; 2RH2 A; 3EFR A; 2IVW A; 5GMK i; 3GOX A; 2HL3 A; 2DZC A; 2P0Q A; 1G3S A; 3X24 B; 4KRT A; 3AT1 B; 1MMN A; 4L59 A; 2PZ1 A; 2DYB A; 2KSS A; 4E7S A; 3JCM d; 3CXC S; 4M7A G; 5C0M A; 2M51 A; 3RBB B; 4AFQ C; 4WF2 A; 2HCK A; 2JM8 A; 4LXC A; 1NLO C; 2MF2 A; 3M57 A; 5CO7 A; 2K4Y A; 4FIB A; 1I8F A; 3UT1 A; 3I56 Q; 5KYU B; 1BI1 A; 1TUD A; 1B34 B; 1VQ9 T; 3G4S A; 2AKK A; 3L2R A; 1M1K C; 2AZV A; 1KD1 C; 2X4X A; 1AWX A; 1YCS B; 2E10 A; 2LJ3 A; 1W70 A; 5IHK A; 1UJY A; 4E7Z A; 3QZ9 B; 2EQK A; 1M27 C; 1TSF A; 1GBR A; 1Y0M A; 7AT1 B; 3VKI A; 2YUQ A; 4C8Q G; 2K3B A; 1G3T A; 3M9Q A; 1JXM A; 2HMA A; 2JTE A; 5IT9 E; 2LC4 A; 2DL7 A; 4M78 E; 1I07 A; 1VYV A; 2X4W A; 3JCM Q; 5J3B A; 4AT1 B; 1PKT A; 3CPF A; 1VQO A; 1N9S A; 2DYI A; 2QQS A; 3OYN A; 4JJB A; 4QVZ A; 3M0R A; 4B9W A; 1AWW A; 3EGD A; 4J7I A; 2D8J A; 2XU8 A; 1M30 A; 2EJG A; 4M78 C; 4OB3 B; 4E47 A; 3VS1 A; 4F16 A; 3G71 Q; 2VYT A; 1QMC A; 4M4Z A; 3L2U A; 1PD0 A; 1C6V X; 1JQQ A; 3CCQ A; 4HCC A; 2MAM A; 3CBP A; 1PKS A; 3CC7 Q; 1WFW A; 2QGF B; 2XD0 A; 1NEG A; 1ZA2 B; 2PU9 B; 1KQS S; 2L3P A; 3CD6 Q; 4OMO A; 5GAN d; 1HK9 A; 1M1F A; 3OB9 A; 2BZY A; 2R5M A; 2XDB A; 3UA7 A; 2RI2 A; 3OYC A; 1G5V A; 1JO8 A; 3CBM A; 3PIO A; 3H0I A; 5IN1 A; 4EMH A; 4E2F B; 3CC2 A; 2RJD A; 2GQI A; 3NTH A; 1VQ5 T; 1FX7 A; 5FU7 B; 2HKN A; 3A8G B; 1XNI A; 3VS6 A; 1VQ8 T; 4KUL A; 1ZA1 B; 4IIM A; 1RL2 A; 1T3L A; 1VQ9 A; 1M4Z A; 2VXF A; 2RK2 A; 4PJO F; 4ELZ C; 2LT4 A; 1KD1 U; 4O6J A; 3QSU A; 4PFP A; 2LQW A; 8AT1 B; 3H0H A; 2DF6 A; 3REB B; 2L8D A; 5HCK A; 3E9F A; 2KRN A; 4OGE A; 1T3S A; 4Y28 E; 3OMC A; 4HT9 A; 4BDY A; 2CKK A; 2RO0 A; 1OI1 A; 2E41 A; 2DEQ A; 2JZ2 A; 1H3H A; 1SG5 A; 1G3W A; 1ZHI A; 3M59 A; 3PFS A; 3L2V A; 3C94 A; 4M7D F; 5M9O A; 2ABL A; 3OYE A; 4MZP A; 3M4G A; 5GAM h; 1Q86 C; 3MEU A; 5HK3 A; 3CBO A; 1G8X A; 2QTX A; 2DX1 A; 5KCH A; 1C1A A; 1MND A; 1H92 A; 2KI7 A; 1QQJ A; 2QA4 Q; 1V76 A; 4PJL A; 3CMA Q; 2GTJ A; 1TXQ A; 1YI2 Q; 2V1Q A; 2GNC A; 3INZ A; 1IRE B; 2E12 A; 2FL7 A; 3BFM A; 4DBQ A; 3OYI A; 1Y96 A; 4WCI A; 1Y96 B; 3C4S A; 1VQ7 T; 2LP5 A; 3OBY A; 5GAN 8; 2H3J A; 2PVG B; 2H8H A; 2Y90 A; 5LJ3 j; 4J9D A; 1MMA A; 5FRM A; 1VQP T; 1YJN T; 1ZUU A; 1WGS A; 1VQ5 A; 4M7A E; 2CH4 W; 2D0N A; 2FB7 A; 2JS0 A; 1O9S A; 1WHH A; 3M4Y A; 1GFD A; 3FIF A; 2X4J A; 3OA6 A; 1FYN A; 3TRE A; 3URG A; 5GAO m; 2JMA A; 1X2K A; 3EGX B; 4M7A C; 3P8D A; 1FMW A; 4M78 A; 4M78 B; 1Y7X A; 1YHQ T; 2EJ9 A; 1K76 A; 5GMK l; 2CZ0 B; 3JCM h; 1JXO A; 1YP5 A; 3V8K A; 5GAN 7; 2IIM A; 1WYX A; 1KIK A; 2MWP A; 1R0B G; 4HVU A; 1EX4 A; 2DZ9 A; 3LH0 A; 1OU9 A; 1KJW A; 2HDA A; 1H8K A; 5EG2 A; 4PJO G; 2KBT A; 4OMF B; 4LUE A; 2GFU A; 2Y4Y A; 3I5R A; 4C8Q E; 2K3X A; 4OGC A; 2JW4 A; 1HYO A; 3BY7 A; 1QVF P; 4P5N A; 4J9I A; 1UUE A; 1Q86 U; 3I56 T; 1ZLM A; 2FZK B; 3JSC A; 4JRK A; 1QVG P; 3H0F A; 1FMK A; 5FWB A; 4C92 F; 2FRY A; 3L1A A; 3HFN A; 5D6Y A; 2VWF A; 2KR3 A; 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