The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1S72 Q; 3CMA Q; 1YIT Q; 1K73 R; 1KC8 R; 3CC4 Q; 1KD1 R; 2OTL Q; 3CCM Q; 3CD6 Q; 1K8A R; 1Q7Y R; 1YJW Q; 1QVG P; 3CXC P; 1K9M R; 3CME Q; 1VQ7 Q; 3CCQ Q; 1VQL Q; 3CCR Q; 3CCE Q; 2QEX Q; 1VQM Q; 1VQK Q; 1M1K R; 1YJ9 Q; 3G4S Q; 1N8R R; 1Q86 R; 3I55 Q; 1VQ6 Q; 1M90 R; 1KQS P; 3I56 Q; 3CCS Q; 1W2B P; 3G71 Q; 3CPW P; 1YIJ Q; 1YI2 Q; 1VQ5 Q; 3CCV Q; 1Q82 R; 3CC7 Q; 1Q81 R; 3CCU Q; 3CCL Q; 1VQ8 Q; 1VQN Q; 3G6E Q; 3OW2 P; 1VQ9 Q; 2QA4 Q; 1VQ4 Q; 2OTJ Q; 3CCJ Q; 3CC2 Q; 1QVF P; 1NJI R; 1JJ2 P; 1VQP Q; 1VQO Q; 1YJN Q; 1YHQ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2O9V A; 2OJ2 A; 3H0F A; 2QEX A; 4XU0 A; 5M9O A; 4J9F A; 2EJ9 A; 1MMD A; 2CKK A; 2HQH A; 4MDX A; 3HRT A; 1Y71 A; 4HCK A; 2DL4 A; 1MGQ A; 2FVU A; 5GAN j; 2X3X D; 4EMG A; 4LD6 A; 3MKD A; 1Q81 R; 3S3M A; 1H8K A; 5AT1 B; 1WXU A; 1NG2 A; 1JJ2 P; 1MV3 A; 3TCJ A; 1VQ9 T; 4FU6 A; 2BKD N; 2KAF A; 1WQ7 A; 2XG8 D; 4AFZ C; 3I35 A; 3ZL7 C; 1PD0 A; 3EGD A; 2L3P A; 1OQK A; 5CCA A; 2CS7 A; 1VQ6 Q; 1NEB A; 1SKU B; 2DBM A; 2MF2 A; 1X6G A; 4PJO C; 2J6O A; 1QP3 A; 1T3L A; 3A8G B; 3ME9 A; 3CCR T; 3JB9 J; 5GAN e; 1OYX A; 4Y91 A; 1UEC A; 1G3S A; 4M77 B; 5D6W A; 3H8Z A; 4Z02 A; 5FWB A; 1MND A; 4ATO A; 1VQK A; 5HK0 A; 1BYM A; 1SEM A; 1Y57 A; 5DLO A; 1I5O B; 2HEQ A; 4PLL A; 3R6N A; 3QXE B; 2X4X A; 1GXI E; 3CCQ T; 4Q5W A; 4C92 B; 2JW4 A; 2EGA A; 2M0Y A; 2YDL A; 4Z88 A; 1NYF A; 2FPF A; 3EAE A; 3PT9 A; 1UFF A; 2RK2 A; 2OTL A; 2XMF A; 2F2X A; 5FU6 C; 2E4H A; 2D1X A; 2VGN A; 1YHQ Q; 2IPO B; 3NPF A; 1YWP A; 2RJD A; 1V76 A; 2P84 A; 1UE9 A; 2E70 A; 4PJL A; 3WVD B; 4R55 A; 3EH2 A; 2E5K A; 2DET A; 4AFS C; 2FEI A; 4IUT A; 4L59 A; 4K11 A; 2PU9 B; 2BTT A; 3G6E Q; 1M3C A; 5IXB A; 2D0N A; 1VQ4 Q; 4N0A C; 2ATC B; 2KRM A; 2E10 A; 1JU5 C; 1XOV A; 3PIP A; 2CYZ B; 3V8J A; 2RQT A; 2WAC A; 5AYF A; 4M75 E; 2D6F A; 2RMO A; 4E7Z A; 1K76 A; 2DTO A; 3M0R A; 1W1F A; 2E64 A; 1VQ8 A; 2YUQ A; 4KUD K; 2JTF A; 5A0D A; 4DEY A; 2QQ9 A; 3H41 A; 3ER0 A; 1Q82 U; 3JCM X; 3RKW A; 1PNJ A; 2BUD A; 3I9Q A; 3EGX B; 3QKJ A; 2V8J A; 3I5S A; 2FPE A; 4PLI A; 4RTW A; 4M78 C; 1SSF A; 1YIT Q; 4FIB A; 3RKX A; 2K2M A; 2Y90 A; 2K5L A; 4N0A A; 2K3X A; 2X9H A; 1AEY A; 5CQY A; 2ZPH B; 1ZUU A; 1HYO A; 2RN8 A; 3EFR A; 2AKK A; 1EZZ B; 2EPD A; 3CCL Q; 2YHT A; 2LT4 A; 2JT4 A; 4PJJ A; 1WXB A; 1U06 A; 1NEG A; 1ABO A; 3M57 A; 1VQL A; 3CC2 T; 3M53 A; 1KQS A; 2RNA A; 2C0O A; 1YJN T; 4ZGE B; 3L2W A; 3VJP A; 4QVC A; 3HSB A; 4QT7 A; 2JXB A; 4M78 A; 1MV0 B; 2D8H A; 3UDC A; 1KC8 C; 3T9N A; 2J7I A; 2FZC B; 3D7S B; 5IHN A; 2K7A A; 4XTZ A; 2DD5 A; 3Q1J A; 2GQI A; 4MZT A; 2YLC A; 1UDL A; 2QQS A; 1U8R A; 2CSI A; 2E5Q A; 4JJC A; 3CPF A; 2B86 A; 2PZ1 A; 3CCM A; 2VGM A; 1YJW A; 3GNF B; 1V1C A; 1WX6 A; 2EYX A; 1WJQ A; 1UUE A; 4KUL A; 4KT0 E; 3G71 A; 3VKI A; 4RG8 A; 2KRS A; 3H0H A; 4C0Z A; 4FSX A; 2NWM A; 2QGG A; 2LDM A; 2JJ9 A; 1VQP A; 3OYF A; 3JB9 D; 1IHV A; 2EWN A; 2IVW A; 2RI5 A; 3SWN A; 3RBB B; 4JJD A; 2QAS A; 1B07 A; 1OU8 A; 3HPW A; 2RO0 A; 3I5R A; 4F7U E; 3CEY A; 1ABQ A; 2DFU A; 1TOV A; 1CSK A; 5LL6 S; 2QTV A; 4FYV B; 1KHC A; 2X51 A; 1SF9 A; 2MCN A; 5I2S A; 5FU7 C; 5HKC A; 3LX7 A; 1QVF S; 2QGF B; 2CP2 A; 1WGS A; 2RHX A; 3BDU A; 1ZBX A; 1YCS B; 2DXU A; 2F5K A; 2HL5 C; 2MWP A; 1TXQ A; 2LQ8 A; 3BY7 A; 3JCM f; 2LJ3 A; 3CCE T; 4IUV A; 3CCJ A; 2KBT A; 1T0H A; 3PTA A; 4RCC A; 2FRW A; 3EG2 A; 5FWC A; 4CC2 A; 1NLO C; 5GAO n; 4A4G A; 3EG0 A; 1UEB A; 3PFS A; 3LGF A; 2DIQ A; 5DLQ E; 2W10 A; 2RQW A; 1R0C B; 3CBO A; 1Q86 U; 1BI1 A; 4DQ2 A; 5GAN 3; 4OB2 B; 2L3Q A; 1OZ2 A; 2RQU A; 2AT1 B; 4CRI A; 1YIJ T; 2K3B A; 2YUN A; 4M75 A; 1UHF A; 2L8D A; 4C0D B; 3G7Z A; 2LNH B; 1K0S A; 1YIT T; 1M2V B; 1QP2 A; 2QYZ A; 2GF7 A; 4HVV A; 3A1P A; 1LVK A; 4A63 B; 4FW2 A; 1RAF B; 3VUZ A; 1PM3 A; 1UGV A; 2CP0 A; 2C0I A; 3TRE A; 1WHH A; 2E1H A; 1GCP A; 4R0K A; 3JB9 F; 3CCL T; 2X35 A; 3SEM A; 3MP6 A; 3OYN A; 4EMK A; 2COW A; 2YT6 A; 2NYS A; 4OP0 A; 1Q7Y R; 4OGC A; 4PJO D; 1KSW A; 2JS0 A; 1K73 C; 1OX9 A; 3OS0 A; 1WDX A; 2RI2 A; 3EHQ A; 3CCV Q; 3J80 E; 2LMJ A; 1IHW A; 3OMC A; 2OTJ Q; 1BKB A; 2KY9 A; 4X9C A; 2DRM A; 2QK0 A; 3OSS C; 2DJQ A; 3CME A; 5J39 A; 4XTW A; 4MZP A; 4WCI A; 2DKG A; 2DER A; 1I5L A; 2P4R A; 1G2B A; 3C94 A; 2ZCF B; 1BB9 A; 4LN2 A; 3TQ7 P; 4LE9 A; 2M9U A; 5GMK h; 4J6X A; 2LQK A; 3UT1 A; 1AVZ C; 4C5E A; 5ECA A; 3THK A; 2DD4 A; 2O2O A; 3JB9 I; 1TTH B; 3JCM g; 5LJ3 d; 1U5S A; 1WJS A; 3NTH A; 5FW9 A; 2BE9 B; 3M56 A; 3C4S A; 4OB0 B; 2A0F B; 3HL8 A; 1JB0 E; 1JXM A; 1RAG B; 2VB6 A; 2LC4 A; 2J05 A; 4D8D A; 4AT1 B; 3JRZ A; 1Y96 B; 4BUG A; 5DM7 R; 1K1Z A; 2DA9 A; 2EYW A; 3FEO A; 2COZ A; 2LCC A; 4QQD A; 1KQ2 A; 1V29 B; 3OYK A; 5KYN A; 1NYG A; 1Q82 C; 4Y92 A; 4F7U A; 1VQM A; 4M78 G; 3QO3 A; 2RB6 A; 3VS0 A; 1K4U S; 5LJ5 h; 4HKE A; 4CC3 A; 4X9D A; 4E7S A; 2JMA A; 1D3B B; 4L5G A; 2O88 A; 1M8V A; 1D1A A; 3C0C A; 4J6Y A; 4M78 D; 3M0S A; 4JUV A; 3NTK A; 5KYW B; 1AT1 B; 4PNO A; 1VQ7 A; 4J9E A; 1RAC B; 1X6O A; 1VQ6 A; 3QPH A; 2PUO B; 4M7A A; 2OTL T; 2NUP A; 4N4I A; 5D6Y A; 4FL6 A; 5HK3 A; 2RM4 A; 3JCM d; 4ANJ A; 4LUD A; 4PJO F; 1X69 A; 4C0F A; 1BK2 A; 3EFO B; 3J81 E; 5CR2 A; 3C95 A; 1K9M C; 4R56 A; 2CZ1 B; 3M4G A; 1AZG B; 3G1J A; 4X34 A; 1M4Z A; 1NLP C; 3GLX A; 5GAM h; 1OV3 A; 2WSC E; 4J83 A; 3QUI A; 3UF4 A; 2EQJ A; 1KC8 U; 1PHT A; 4KGX B; 1W70 A; 4JJN K; 3CCQ Q; 4IUR A; 3HRU A; 3QZ5 B; 2DEU A; 1ZUY A; 2QA4 A; 3JCM J; 2FRY A; 2ZZD A; 5D6X A; 2A3L A; 1GL5 A; 1KJW A; 1QVF P; 1FMW A; 2CP3 A; 2K5I A; 4J7I A; 1PSF A; 2GTO A; 3NFC A; 4ME7 A; 4DOV A; 1M8M A; 2EBP A; 3LH0 A; 1XQH A; 2KQW A; 2EQI A; 5GMK e; 1HSQ A; 1FYN A; 1UGR B; 3GOX A; 1VQ4 A; 2W0Z A; 2DMO A; 4J9G A; 2ZPI B; 1UGP B; 2EYZ A; 1N8R R; 5GJV B; 1QKW A; 1ZSZ B; 5GAN f; 3M0U A; 1NBE B; 8AT1 B; 3CC4 Q; 5LJ5 j; 3G4S A; 1W2B A; 4DEX A; 1KQ1 A; 4PFP A; 3OB9 A; 1Q86 R; 2RK1 A; 1VQL T; 3QII A; 1QVP A; 4M75 G; 3MO8 A; 1M9S A; 2V26 A; 3CXC A; 4M78 F; 2P0P A; 1ACM B; 1YJ9 A; 4GY5 A; 1MMN A; 2DEQ A; 1S1N A; 5LJ5 e; 2GCX A; 1QVG S; 3KXT A; 2X4J A; 2GNC A; 1BCO A; 3L42 A; 2HQX A; 3PGG A; 5GAM j; 9ATC B; 2JMC A; 3O5Z A; 2RA2 A; 3CC2 Q; 2JUF A; 4E6R A; 3P8D A; 2RH2 A; 3QZ9 B; 2LX7 A; 5GAO m; 2O4X B; 2KYM A; 1JRI A; 5A0L A; 4FYW B; 2VYT A; 2AKL A; 2CH4 A; 2HL3 A; 2CRE A; 2CUB A; 1R8O B; 5GAO q; 1FXX A; 5CAI A; 5GAM e; 5IAY A; 2CP5 A; 3L2V A; 1H92 A; 2PVD B; 4M7D E; 1VYT A; 1BIA A; 2JM9 A; 4ZN3 A; 4M77 A; 3OYA A; 4CC4 B; 3I55 A; 2VWF A; 4C8Q E; 2HCK A; 5KE3 A; 2CZ0 B; 2QQR A; 1KHI A; 1BBZ A; 3PNW C; 2JS2 A; 3LWH A; 3E2U A; 3FC3 A; 4GBQ A; 1SPK A; 3RUX A; 1EFN A; 3QJY A; 2DL7 A; 1A0N B; 4PFZ A; 2DM1 A; 4C92 A; 1GRI A; 2OAW A; 4D8K A; 5IH2 A; 2MI6 A; 4ZTF A; 3VYG A; 1KG1 A; 1VYV A; 1K73 U; 3HTR A; 3FLG A; 1M2O A; 3M0P A; 5GJW B; 5GAN g; 1FMK A; 1VQ5 A; 4FT4 A; 4RCB A; 3JV3 A; 2DIG A; 3UAT A; 1Y7X A; 2JOY A; 3CCS T; 2LT1 A; 1ZLM A; 1SRM A; 3MHX A; 1PKT A; 2E3H A; 5GAN 2; 4F7U G; 5CKE A; 4J9H A; 1ZQ1 A; 1LJO A; 2DL5 A; 2HQE A; 4JDS A; 3M9Q A; 3OYI A; 5L23 A; 3CCE Q; 4ZGD B; 4OMF B; 2I2L A; 2LJ0 A; 3BE3 A; 2K4Y A; 5FRN A; 1AWO A; 2CT3 A; 1LNX A; 2PVO B; 2DAQ A; 1M90 U; 3EGX A; 4M7A G; 4XTV A; 1N5Z A; 1I81 A; 3M55 A; 3CC4 T; 3M4Y A; 2L89 A; 2OI3 A; 4RTT A; 2RHZ A; 3P8H A; 1YIJ Q; 4E47 A; 2I0N A; 4MMK A; 4PJO B; 1QWE A; 3M0Q A; 2KVQ G; 3VV0 A; 1IXD A; 3NHN A; 5GMK i; 4MZM A; 2LZ6 B; 2DTH A; 1OX8 A; 1KC8 R; 1JQQ A; 2V8K A; 4FYY B; 2PQW A; 2HAX A; 2A36 A; 2V8I A; 2RJC A; 2QAZ A; 3FB9 A; 2GGR A; 2RF0 A; 1B7T A; 3CMA A; 4IKF A; 1TUC A; 2QTX A; 4DBQ A; 5FU6 B; 3OYB A; 4BD3 A; 2LCS A; 2XKO C; 2EGC A; 3MEV A; 3E19 A; 2L5Q A; 2LTO A; 4D6W A; 4M7D C; 3OYH A; 2DBK A; 4RTZ A; 2COY A; 5LJ3 h; 1K9M U; 4LD9 K; 2ZPE B; 3KBG A; 3V7C A; 2R5M A; 4C8Q C; 3UA6 A; 1C6V X; 1YBY A; 4KBM B; 5KYU B; 1QCF A; 3CPW S; 3L1A A; 3SWN C; 2DIL A; 3VU3 C; 4KGV B; 1X75 C; 3GP8 A; 3MEA A; 2YWW A; 2DE0 X; 1NZ9 A; 4RMO A; 1Y0M A; 3QWY A; 2ROT A; 1KK7 A; 2QEX Q; 2KXD A; 3RMS A; 2XDD A; 1K9A A; 5GMK l; 4NL2 A; 1VQM T; 4M7D A; 4JPB W; 2Y4Y A; 3I56 T; 2JVV A; 1YNZ A; 2M1H A; 1LCK A; 2K6D A; 3BFM A; 4C8Q A; 2DK3 A; 3CD6 A; 2VV5 A; 3VS3 A; 4M78 B; 3LH5 A; 3MET A; 1C0M A; 4JRP A; 4A4E A; 7AT1 B; 1QVG P; 1IO6 A; 2H8H A; 1VQN A; 1VQ7 T; 4KGZ B; 5KYY B; 1W2B S; 1B3Q A; 1S72 A; 3H9N A; 2RHY A; 1WJR A; 4OML A; 4DBH A; 3JCM c; 2ESW A; 2L0A A; 3LGL A; 4J9C A; 1NJI C; 1YI2 A; 2VXE A; 4HVU A; 3UWN A; 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2X3W D; 2HKQ B; 4BE2 A; 4KUI A; 2CZ6 B; 2GFU A; 2BZX A; 2QEX T; 2R58 A; 1Q82 R; 1Y96 A; 1VQO A; 1G83 A; 2HMA A; 1QW1 A; 2YUO A; 3H0I A; 2MAM A; 2VVK A; 1MHN A; 4J9D A; 4F14 A; 3OA6 A; 1GCQ A; 3CCM Q; 2E12 A; 2KE9 A; 4WTO B; 4HCC A; 2EYQ A; 1YJW Q; 1M90 C; 4IUU A; 1SHG A; 4II1 A; 5GAO r; 3CCU A; 4VUB A; 3G71 Q; 4OMM A; 2QQA A; 1RAA B; 1YJN A; 1QLY A; 1D3B A; 5CVI A; 4E7L A; 4OMO A; 1G3Y A; 1VQP Q; 4M7A C; 2KRN A; 1RI0 A; 3QDR B; 5KE2 A; 2D0Q B; 5GAN 8; 1P92 A; 2LNV A; 2FL7 A; 2EAY A; 2Y4X A; 1QCO A; 2DF6 A; 1K9M R; 2EIF A; 3VS4 A; 3A8L B; 4IIO A; 1D0Y A; 4M77 E; 4IIM A; 1BI0 A; 4CI0 C; 3CPW P; 1VQK T; 1VIF A; 2BIV A; 1AWW A; 4ZNX A; 1Y07 A; 5GAO l; 1RAE B; 4J9B A; 1M1F A; 1WYX A; 2ZPG B; 3EFO A; 4OB1 B; 4BY6 B; 2HBW A; 2YRC A; 3V8L A; 2CSQ A; 4C92 E; 2VXF A; 1I1J A; 4HCZ A; 3A8H B; 3RES A; 1PKS A; 4M7D G; 2WSE E; 1B34 A; 2DVE A; 2K57 A; 4OMP A; 3L2U A; 1KQS S; 2YXY A; 1K8A C; 5LJ5 f; 4C8Q G; 2YSQ A; 4Z89 A; 1FMV A; 3CCJ Q; 3RDV A; 2MWO A; 3QBY A; 4M7D D; 2P0K A; 3V7S A; 3L2R A; 3MEW A; 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