The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
MDIFREIASSMKGENVFISPPSISSVLTILYYGANGSTAEQLSKYV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
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| molecule keywords |
Serine proteinase inhibitor 2
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| publication title |
Crystal structure of viral serpin crmA provides insights into its mechanism of cysteine proteinase inhibition
pubmed rcsb |
| source organism |
Cowpox virus
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| total genus |
15
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JJO A; 1M93 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I08 A; 3J7A U; 1OZ0 A; 3G6B A; 2H94 A; 4U3J A; 3TET A; 5EC2 C; 3K0G A; 5GON A; 4H33 A; 3BPZ A; 1SC5 B; 4XDK A; 1WAZ A; 4O2A A; 1P49 A; 4EKW A; 1SQB H; 4CZZ A; 4CC5 A; 1IXB A; 1QBZ A; 1V55 C; 4MSW C; 3RYH A; 3CWB H; 1PPJ H; 2WLL B; 4P30 A; 1NR1 A; 1GO3 F; 1N36 O; 4QGP A; 2HKO A; 3JD1 A; 1HWY A; 1AR5 A; 4MVM A; 3BAA A; 1M56 B; 5LXT A; 3JAK A; 3OR6 C; 4HZ3 A; 2QA4 V; 1HW7 A; 2FB5 A; 2ILM A; 4PEL A; 3BEH A; 2L35 A; 1SQG A; 4R7C A; 5H2F Z; 3BHP A; 1MNG A; 4X20 A; 1JJO A; 2A7W A; 5JVD A; 1K5Q A; 1AJP A; 2EIN B; 3DXR B; 4WFA V; 3UKM A; 2WA3 A; 3FB6 C; 1N32 O; 2YIB D; 3CYO A; 5L3E A; 3GWK C; 4UFZ A; 5KA5 A; 1SQP H; 2DWD C; 1F7Y A; 1VIB A; 1KKC A; 3IC9 A; 2JJ2 G; 4XDJ A; 1VQP V; 3VOU A; 4QPJ A; 2V7Q G; 3HKE B; 3K57 A; 3HKD B; 4CS2 A; 3KKY A; 1N36 B; 2WLN A; 4X88 A; 1H2S B; 3SPH A; 3CXH F; 2XAF A; 1LUW A; 1S5J A; 1SF9 A; 2EX3 A; 1BCC H; 4JAV A; 5FPR A; 2Z0A A; 4CS3 A; 4PA4 A; 1SRY A; 3AK1 A; 3X2Q B; 1NTM H; 4IHJ B; 1XMO O; 5BR8 B; 4MW3 A; 3W7T A; 4GT1 A; 2FL4 A; 4QE7 A; 3GVM A; 3CCU V; 4MW8 A; 2Y0P A; 1S5H C; 3L72 H; 1VF6 A; 1ZAU A; 1N32 B; 1FXH A; 4MVU A; 2BOB C; 4J9Y B; 4FLX A; 4JTA B; 4I7Z B; 1XMQ O; 4UCR A; 1Q8I A; 3L73 H; 1SQV H; 2QR4 A; 1EZJ A; 1BHB A; 4KFM A; 1JR9 A; 3KZI Z; 4EB6 B; 1OCR B; 2RJZ A; 1M4U A; 3RGB A; 3QO8 A; 2KG7 B; 3CCM V; 5IYD O; 5GTI Z; 5L3C A; 4K0K B; 4LFA B; 2PYL A; 4FLV A; 1EN6 A; 4LNU B; 5FNV B; 5EC1 C; 1SS3 A; 5J9P C; 4PDR A; 1QU7 A; 3C3S A; 3MHH C; 1K4C C; 2JS3 A; 3I56 V; 1F51 A; 1XMO B; 4DV2 O; 4JI7 O; 2GBO A; 1QLE B; 3E8B A; 2Q6A A; 1VQ6 V; 5DN6 G; 1XNQ O; 1Y4M A; 4PD4 F; 2UU9 O; 1XL6 A; 3STL C; 3OR7 C; 4J41 A; 3OEE G; 4FMT A; 4C7U A; 1XMQ B; 2HLD G; 2JEU A; 1Y76 A; 2QGN A; 4PA7 A; 4DUY O; 1S72 V; 1SZT A; 2PZS A; 2VQE B; 3FAV A; 4UVA A; 2GTA A; 5KHH A; 3K9S A; 3L75 H; 3E8F A; 2A9H A; 1KP2 A; 3E22 B; 3ZIA G; 1W2B U; 3SJA C; 2YIA A; 5CMU A; 4AIL C; 4QNH B; 1NI8 A; 5GW7 A; 4B7K A; 2OIG A; 3A8T A; 2XND G; 1H2M A; 1XQ8 A; 5BMV A; 1I7F A; 4ZI7 B; 2YC0 A; 4DV2 B; 4JI7 B; 2HP8 A; 4YJ2 B; 3P3P A; 2Q7H A; 4BIZ A; 3EFF K; 1H38 A; 4I0X B; 3CRR A; 1QVF U; 2UU9 B; 3BAB A; 1AI5 A; 4LBE C; 5BXZ A; 2LO1 A; 2FTK A; 3JD4 A; 3K03 A; 3ZHV A; 2YXL A; 1GN4 A; 4DRX A; 1L1F A; 3BVO A; 3I5D A; 2N04 A; 3AG1 B; 2B1I A; 4NVP A; 3R66 A; 4DUY B; 1RSO A; 3H1J H; 4FLW A; 3OMI B; 4FFB B; 3WB2 A; 4LH7 A; 4LC1 A; 2PUS A; 4IYI A; 3UM7 A; 4PI2 A; 3ABK B; 1K97 A; 5KUK A; 1MA1 A; 1JMK C; 2XHB A; 4DR6 O; 3GB7 C; 3BFR A; 4FLU A; 4LR3 A; 4LWS A; 1LNQ A; 5LA6 B; 1XOU A; 5C8Y B; 5EK0 A; 5EBM C; 1WA8 A; 4JZ2 A; 2B1G A; 2WLM A; 3ABL C; 1R3J C; 5IYC O; 1Q7Y W; 1WJZ A; 3EHB B; 4A5U B; 2MK3 A; 4B3M O; 5EZY A; 1OV9 A; 4FZ1 A; 3N27 A; 3D8C A; 1S3J A; 3FB8 C; 3TGU H; 3K58 A; 3JAW A; 2HHH O; 2F66 C; 1P7B A; 2UXB O; 3N2K B; 1QCE A; 5L3F A; 1RFY A; 2M7W A; 2D2C B; 3DGE A; 4X62 O; 3ASN C; 4H13 B; 1QR8 A; 2GHY A; 1UJW B; 2UXC O; 5LOV A; 2N74 A; 4ZHQ B; 3SYQ A; 1Q86 W; 1XIL A; 3H1H H; 4DR6 B; 5TIS Z; 4HAM A; 2ZE6 A; 1Y74 B; 2A06 H; 3SJC C; 2OTJ V; 4AQY O; 5KHK A; 1WNS A; 3OEH G; 4PHZ A; 3KG2 A; 1JX9 A; 1VP7 A; 3D36 C; 4LF8 O; 1XUQ A; 1FFX B; 3MHS C; 2AGA A; 4FLT A; 1VQ9 V; 1CPY A; 3UO2 A; 4B3M B; 4DK0 A; 4QPK A; 1IVS A; 2YI8 A; 3UO3 A; 4J10 A; 2XT9 A; 3ZMS A; 2OTL V; 2HHH B; 1VQN V; 2UXB B; 1M57 B; 4FM1 A; 3BY6 A; 4D6T H; 4LH6 A; 1KYO F; 1K9M W; 2DQ0 A; 4X62 B; 4WF9 V; 5LP6 C; 4IL6 Z; 1ZL8 A; 2X6A A; 2UXC B; 4HYO A; 5LP6 B; 2ZQM A; 2FML A; 2VS0 A; 4EFB A; 3OTO O; 4I9W A; 4O4L A; 3LSS A; 2EBO A; 2E74 B; 5A9G A; 3ZMZ A; 1N33 O; 4FK5 C; 1J5E O; 2QWP B; 3JD2 A; 4AQY B; 2QKS A; 5KUM A; 4LF9 O; 5D5P A; 2E3C A; 4FPP A; 4DK1 A; 2P06 A; 1QQC A; 2JVD A; 4LF8 B; 1WLE A; 1N8R W; 3CCR V; 5B3S C; 5HFL A; 3SYP A; 2DE0 X; 4UB6 Z; 4DUZ O; 4JPR A; 3ETE A; 4BIU A; 5LYJ B; 5B3S B; 3VQX A; 4FM0 A; 1PNM A; 2JGD B; 5GTH Z; 3ETD A; 3JCZ A; 1Q6U A; 2LFR A; 2K9P A; 1AVM A; 1NR7 A; 5B1B C; 4UVB A; 2WPD G; 4KP4 A; 3K79 A; 1AP5 A; 2F4V O; 5B1B B; 2F93 B; 1KD1 W; 3W7W A; 2EIM C; 3OTO B; 1KUQ A; 5GON B; 1TUB A; 4PDM A; 2VWJ A; 2X7R B; 3E83 A; 2EZP A; 1J5E B; 4GCZ A; 1AJN A; 4N23 A; 4B3R O; 3LUT B; 1I94 B; 4LF9 B; 1P4R A; 1MOF A; 3RYH B; 3T1Y O; 5DED A; 2YSU B; 3BA8 A; 4KHP O; 1N0J A; 1VQ5 V; 4ZOL B; 2P67 A; 4DUZ B; 1IDS A; 4W4L A; 2ZNI A; 1O9G A; 4IGG A; 2IU0 A; 3S3W A; 4NR1 A; 2UUB O; 2ZIO A; 3K5M A; 4U3F H; 1GKF A; 2NN4 A; 4H0L B; 3FYI B; 2O57 A; 3NR7 A; 2FYU H; 2GDS A; 1X4T A; 3B40 A; 1FKA O; 2F4V B; 4U7N A; 1DF4 A; 5KMG A; 4K8Z A; 3CC2 V; 5LMU O; 2DYS B; 5BZB A; 4NKG B; 5FL7 G; 1QNM A; 2Q9L A; 1L0N H; 2EIJ C; 1GK9 A; 3T1C A; 1FXK B; 1HR0 B; 1OCO C; 2EIJ B; 3CB2 A; 3RVY A; 1HNZ O; 3JD3 A; 2IJJ A; 3H1K H; 4KHP B; 2P90 A; 3ZED A; 2A0L A; 3OT7 A; 1I5Y A; 1PL0 A; 3FB7 C; 1OCZ C; 2E5L B; 3LDC A; 2UUB B; 4TUY A; 4X64 B; 4JYC A; 4DW0 A; 3J81 N; 4Z1V A; 2WLI A; 2DQ3 A; 2Y69 C; 5JCO A; 1OCZ B; 3S3X A; 5KX5 B; 3CCL V; 2Y69 B; 1JFF B; 1US6 A; 2P7T C; 1W59 A; 2B9Z A; 5EBW C; 3MAQ A; 4RAI A; 3AK3 A; 1VF6 C; 1Q3E A; 3A0R A; 3T4D A; 3HKB A; 5JQG B; 5B1A C; 1PNK A; 4GLX A; 2ADP A; 5B1A B; 3G67 A; 2UUC O; 4ABM A; 1IZ3 A; 2CH7 A; 2P6J A; 1U97 A; 4AHC A; 2GV9 A; 3EVK A; 2AZ2 A; 4UXN A; 2Q0O C; 4O4I A; 1NU1 H; 2RDC A; 3JAR B; 4DW1 A; 5CA1 A; 5EIB C; 2Q67 A; 1HNZ B; 1YI2 V; 1R73 A; 1H2L A; 3W7S A; 3SYO A; 5IYB O; 2IH1 C; 1WP8 A; 2OCH A; 5CN0 A; 5ITZ A; 2OYQ A; 4DV0 O; 2F23 A; 5JJE B; 1ORQ C; 1V55 B; 4KXR A; 4P9O A; 4IT5 A; 5KHG A; 1YTF D; 1KC8 W; 3OUS A; 4OPH A; 4DR1 B; 5CA0 A; 3IJ4 A; 3CCQ V; 3QVN A; 5C93 A; 2JJ1 G; 2UUC B; 2DYR C; 2YEV A; 3RYF A; 2YXH A; 1SES A; 2YID A; 1K4D C; 3TCU A; 5H6Q A; 2QSA A; 3FX7 A; 2EJR A; 4HNA A; 2DYR B; 1F4N A; 1FAF A; 4F6E A; 5IY5 C; 2CUG A; 3CS5 A; 4TV8 A; 3OGI B; 1Y76 B; 5BR8 O; 1SA0 B; 1EN5 A; 2Q8V A; 5IY5 B; 3TJT A; 3FAV B; 2IH3 C; 1TVK A; 3AG2 C; 1YHQ V; 4KL1 A; 3CMA V; 4DR3 O; 3KCY A; 4QE9 A; 3AG2 B; 2GUZ B; 1T5E A; 1KEC A; 4O4J A; 1VQ4 V; 3D3Q A; 2BTO A; 4I4T A; 3A0H Z; 3QG5 A; 4JI8 B; 2EUL A; 3CJH A; 2LGQ A; 1RM1 C; 2ZR2 A; 3RW0 A; 3K59 A; 4DV0 B; 3HPL C; 1ARO P; 4I50 A; 4DV3 O; 3B77 A; 5BMV B; 3M7M X; 3E8G A; 2JS5 A; 2MW2 B; 3SYA A; 5DM6 V; 2N05 A; 2A79 B; 4K0K O; 3J80 N; 2IJH A; 4LFA O; 4UV8 A; 4UCO A; 3ZMT A; 3HR0 A; 1ZX3 A; 3G6E V; 4JAA A; 1VQL V; 3HKC A; 3VQV A; 2RCV A; 5CBH A; 3ETQ A; 4DV7 B; 3RYC A; 2BE3 A; 1SER A; 1LUV A; 1R6N A; 3OMN B; 3RYI A; 1YIJ V; 4DR3 B; 5H6R A; 3JAL B; 4TV9 A; 4TQD A; 3LNM B; 1QVG U; 3DC6 A; 3JYC A; 5IWA B; 3JAS A; 4WBN B; 5IYZ A; 1Z5V A; 3D3I A; 2VQE O; 4DV3 B; 2IJK A; 2BSK B; 3B8N A; 3ZS8 C; 3K06 A; 4JI6 O; 2HJF C; 1GRJ A; 4DYL A; 3N2G A; 1GN2 A; 1EM1 A; 1THZ A; 4X8A A; 3UT5 A; 3WG7 C; 5CA3 A; 3CC7 V; 5KAF Z; 3E89 A; 4RO2 A; 3ZRW B; 5CB4 B; 3H9V A; 1R3L C; 2AHY A; 3JAW B; 5CBG A; 4WFE A; 1NTK H; 4OXS A; 4Z2W A; 1VQK V; 5JH7 A; 3K5L A; 3K04 A; 1AR1 B; 2KKW A; 2QM7 A; 4MTG A; 3IAY A; 4MS2 A; 3F7V C; 4I55 B; 3JSL A; 4JYY A; 5LOV B; 2VWK A; 1RPR A; 2WA4 A; 4J42 A; 1PD3 A; 2WLL A; 3E2E A; 1G4Y B; 3JD0 A; 4JAS A; 4UCS A; 4YHH B; 2QWN B; 5KHJ A; 3CRQ A; 3ZRV A; 3P3N A; 5L3D A; 5K1P A; 2DN9 A; 2B5U A; 4LF6 B; 3OMA B; 1XHZ A; 1NS1 A; 4JGS A; 2ZR3 A; 1XNR O; 3FB5 C; 4UCV A; 4JI6 B; 1IBK O; 3CP1 A; 1H8E G; 2CTQ A; 4DR4 O; 3ZHS A; 5E1A C; 2Q5Z A; 4MVZ A; 3ABM C; 3I55 V; 3ZN0 A; 2W6I G; 4DR2 B; 4K3A A; 2ZM6 O; 4JV5 O; 2XAJ A; 5B66 Z; 1ZL8 B; 2NNU A; 4WFB V; 4IIJ A; 4LFC O; 3HKD A; 3QF7 A; 3SJQ C; 4MTO A; 4R50 A; 2LW1 A; 2QDO A; 2QM4 A; 3FD9 A; 3F5W C; 2K1E A; 2X6C A; 4J7K A; 1G6U A; 3WB1 A; 2KSD A; 3SGI A; 2KQX A; 4MVQ A; 1QR9 A; 4TWK A; 1YSC A; 5AG2 A; 2JEX A; 1XNR B; 2NLJ C; 5J2U A; 2OWO A; 4LF5 O; 1O9H A; 1YDX A; 4UB8 Z; 5FPO A; 1IBK B; 5IJ9 B; 4LF7 O; 2R9I A; 4IHJ A; 1YJ9 V; 4DR4 B; 3H1L H; 5EIB D; 2UXX A; 2DOS A; 4O4H B; 2YDE A; 1SQQ H; 2PTM A; 1ZSP A; 3H1I H; 4BWA A; 2F95 B; 2V4D A; 3QO5 A; 4Q6G A; 4YY3 O; 1QHT A; 3SJB C; 2ZM6 B; 4LCU C; 4JV5 B; 3LDE A; 3ABL B; 3UQ8 A; 3Q4H B; 2DW4 A; 1F23 A; 4OX9 O; 2ODM A; 2IU3 A; 1GM7 A; 2QE7 G; 4LFC B; 2ETN A; 5KHI A; 4KUM A; 1VEW A; 3AG4 C; 1KP3 A; 3AG4 B; 4X65 O; 1IX9 A; 2YIC A; 4L87 A; 3ASN B; 4RWU A; 3OE7 G; 4LNU A; 5FNV A; 4F4L A; 1YJW V; 1GH6 A; 3LSU A; 4LF5 B; 4F6R A; 4PA9 A; 4LF7 B; 4D7S A; 3IGA C; 2E75 B; 1XL4 A; 3F7Y C; 3RFR A; 1EFR G; 3CRC A; 1MG1 A; 1BGY H; 1PNL A; 1SKV A; 1YTF B; 4YY3 B; 3K5N A; 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2OT5 A; 3CCJ V; 5L3B A; 3N2K A; 1MZF A; 1SQX H; 3KCX A; 2QKC A; 1IXM A; 4GYC B; 2CE4 A; 4NXN B; 1NTZ H; 4J7Z A; 3ASO C; 3T4Z A; 5LXT B; 3JAK B; 5CA0 B; 2E5L O; 2LW7 A; 4X64 O; 2CTP A; 1N4C A; 2IJI A; 3L74 H; 3U0Z A; 1PM9 A; 4X20 B; 5JVD B; 1N34 O; 3QO7 A; 4TV8 B; 2RMK B; 3RN4 A; 1BS3 A; 2QWO B; 5EYP A; 3JCU Z; 1K7D A; 1JA8 A; 2CGN A; 5LGT A; 2RQ6 A; 4FFK A; 2ZDI A; 1HNW B; 1B6Q A; 2Q7G A; 1FFX A; 1E1R G; 4BW5 A; 4I4T B; 1M5I A; 5IJ0 A; 3G4S V; 4G28 B; 3ZX6 A; 4JI3 B; 3CJH B; 2X6B A; 1OCO B; 2IBZ H; 1JCH A; 3MDS A; 4JI2 O; 4PI0 A; 3CXC U; 1E79 G; 2YIB A; 1Q81 W; 4YIP A; 2W6J G; 4B08 A; 1DLB A; 3BCC H; 2ZXW C; 1D5A A; 5LP6 A; 2DMX A; 1AP6 A; 1G1X B; 4GKK O; 2X0L A; 3FFQ A; 1N34 B; 1M9N A; 3C3T A; 3RYC B; 4PA6 A; 1B06 A; 2VRZ A; 4JYB A; 4DR1 O; 3T1H O; 1TA8 A; 5LMN B; 1S0V A; 2AW9 A; 2BOC C; 2Q0A A; 1P7G A; 4L8J A; 3QNE A; 2YI9 A; 3OM3 B; 1K34 A; 2P4K A; 3K0D A; 2BTQ A; 5IYZ B; 2AZ0 A; 4MVR A; 1FJG B; 1CXZ B; 2XOK G; 2JGD A; 1K33 A; 3P30 A; 4LFB O; 2ATK C; 1W0K G; 3CC4 V; 2RNB A; 4DV5 B; 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