1M9AA

Crystal structure of the 26 kda glutathione s-transferase from schistosoma japonicum complexed with s-hexylglutathione
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-Transferase 26 kDa
publication title Characterization of the electrophile binding site and substrate binding mode of the 26-kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 69
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1m9aA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m9aA01
4PQHA 1K0DA 1S3CA 1BG5A 3QR6A 5L71A 5J41A 1PD21 2L6CA 3IXRA 3F4RA 1AXDA 3TOTA 1EWXA 3BCIA 2HZEA 1O81A 4TVEA 2YV9A 5INYA 3ERWA 4EVMA 3F4TA 5EY6A 5LCZA 1OC3A 4QL7A 3AY8A 4ZIJA 5FWGA 4IQ1A 2CA8A 1PX7A 2VCWA 1SL1B 5AGYA 5KN1A 2E2GA 1GSFA 1AAZA 2C0DA 2H66A 1FO5A 3RDWA 4POLA 3QCPA 2M72A 2HFDA 2H74A 1TRVA 4X1UA 4WBJA 3UEMA 1OKDA 3ISOA 1EP7A 4JR4A 4F82A 5GAPD 1EEMA 3LYPA 4K8MA 2GQLA 2H0HA 22GSA 3TJGA 4DSSB 3IA1A 5G1KA 4GSSA 3HY2A 1WP0A 3HJPA 1TRWA 3GYKA 4EC0A 5BMUA 4MLYA 3WT2A 4XRAA 3VPQA 4ZB8A 1T3BA 5G1LA 3PGTA 2EC4A 4KDUA 3A2XA 5AIVA 4TN8A 2H6ZA 2LRCA 1XWBA 3HZ8A 14GSA 3MNGA 1MEKA 3M8NA 3L9UA 3M1GA 4BVXB 4RQRA 1GSDA 3P2AA 2FLSA 3VURA 2VL3A 1XW5A 2QGVA 3KD0A 1JHBA 1UC7A 5IMZA 2CZ3A 1ERTA 2K8VA 2O89A 5D9XA 3NOFA 4TW5A 3QMXA 1TOFA 1A8LA 5KEJA 1A0FA 2L5LA 1F37A 2R6KA 1W89A 4N11A 1PX6A 2VUPA 3IAM2 2PUKC 2H01A 2FY6A 1M2AA 3GKKA 2PPTA 3ZFLA 4TR4A 2XBQA 4V2LA 4WF4A 1ZZYA 1SKRB 1ZMAA 2CX3A 3C1SA 2VD1A 2R2JA 1Y6EA 3H8QA 1A2MA 5ECQB 3GFKA 3HCZA 1GL8A 3F4SA 4HEA2 1A0RP 2CZ2A 3FZAA 4IS0A 2LQOA 3FKFA 2FD3A 3APSA 2RIIA 5JCGA 1K0BA 2LQQA 1PKZA 1GTBA 3CSJA 1Q98A 2DJ2A 19GSA 2MZCA 4AJ6A 3GSTA 1A24A 2PMTA 2DIYA 1GNEA 4GSTA 4K7NA 3IOSA 2P5QA 2GSQA 1M2DA 1XWGA 5DAKA 2L6DA 1FB0A 3GH9A 2PBJA 3C1RA 3KCMA 3KMOA 2DJ3A 3GX0A 5HFIA 4ZBDA 2GZYA 2B7JA 4PQIA 3PINA 2JACA 3KIJA 3LXTA 1XPVA 4OO5A 1EV4A 1SJZA 4OMVA 4KDYA 2YWOA 5F06A 1AQWA 4ECIA 4PXOA 3DXBA 5J5NA 2CAQA 1NSWA 3TDGA 1PA3A 1TI3A 1SYXA 3LGCA 5AN1A 2DBCA 4GCIA 4I2UA 3L9SA 3GH6A 2GT5A 1GUMA 3KTLA 2GSSA 3ZRDA 4XS1A 1M99A 4Q5RA 4ACSA 2PGTA 1KBNA 1S3AA 3ZTLA 4PGTA 3ZZXA 5D9WA 3A5WA 1OC9B 3FEUA 4OFTA 1K3YA 1GWCA 1TU7A 1ZL9A 3LG6A 1EOHA 4IBPA 1BX9A 1EV9A 1PSQA 5CNWA 4IGJA 4K6XA 4NV5A 2ON7A 4WF5A 5J9BA 1XIYA 3M9KA 3DIEA 5DDLA 4IHUA 1X5EA 1E6BA 4V2MA 4ML1A 3QFAC 3F3RA 2XPDA 5DJLA 6GSVA 1G7EA 5J9CA 2GLRA 1CQHA 4YAPA 3L0HA 3HKRA 5IPGA 3U5RE 4G2EA 3RPNA 4G0IA 1JZDA 5IO2A 4FH8A 2RM5A 17GSA 5AIXA 3IBHA 3U6VA 3ZMLA 5HQPA 4MK3A 4FYCA 3JCML 1XXUA 3NIVA 1U3IA 5IQYA 3FRCA 2WGRA 3RHBA 2VM1A 5HFKA 2DSAA 4K7OA 1U87A 2HRKB 4O5RA 3SBCA 5LNKe 4MF6A 4YQMA 4J56E 1K0OA 3CBUA 1U88A 3DRNA 18GSA 1T1VA 2H1DA 4LLRA 2GTUA 2GZZA 3Q6OA 4QL9A 2QKEA 1ST9A 1FHEA 1TP9A 3UIWA 2V1MA 3GA4A 3CRTA 5JWRB 1VF2A 2RM6A 5IMFA 3KMNA 1NW2A 1VF4A 3R3EA 3HXSA 5FHIA 4OD7A 1H4OA 1FVJA 2L4QA 4I2TA 5JWOB 3E0UA 2HRNA 2GZPA 1TK8B 5D73A 3ZMKA 2I4AA 1MDIA 3FR9A 1YZXA 3QOUA 2J9HA 4EKZA 5ECIB 1YY7A 4G10A 4NXIA 2CVBA 2LTKA 4ZL8A 3WGEA 4IJ3A 5ECHB 5F07A 1K0CA 2YJHA 4XS6A 10GSA 2QSIA 5DCGA 2IL3A 3MSZA 3KM6A 1DSBA 2L4CA 4K0NA 3QDNA 5JCWA 1YEPA 2P31A 4V1Ap 4PUAA 1M9BA 3OR5A 1BQ7A 2OA7A 3KXOA 3LWAA 3KP8A 1YKCA 3VI5A 2C4JA 3VWVA 4L8EA 1A23A 1XW6A 5GSTA 1B4QA 4OCFA 1Z6MA 2IFQA 2KLXA 3EMXA 2NDOA 1SJ6A 1T8EB 4O92A 4KGIA 1XVQA 5IMDA 2PN8A 5D8IA 4PX1A 2IIYA 4KCAA 2EIRA 1MD3A 2GSRA 2LV3A 4TR1B 4J2FA 2AB6A 4EDYA 5ECNB 4D73B 1EP8A 2V6OA 4X0XA 4EUYA 2XBIA 4EO3A 1GTAA 1B9YC 1ERWA 2DJ1A 2K6VA 5HR0A 5J3RA 3VWUA 4HS1A 2WULA 5B6MA 1QXHA 4CW9A 1ZOFA 1HNCA 2R3XA 5CYYA 2MMZA 4F2IA 1S3DA 3D4TA 3DD3A 2R37A 4TOPA 1SK2A 2PWJA 4IP6A 1WJKA 2R5GA 3QAWA 4ECBA 4RI7A 2RUEA 2YCDA 1V98A 3EU4A 4EDZA 1WMJA 3TJBA 4XHMA 3CSHA 3IDVA 3US3A 4DVCA 3ZITA 3FR6A 3EWLA 2IN3A 4LA1A 1I9DA 2OE3A 1BAYA 1O73A 1R5PA 4MCUA 2IMFA 4BVYB 4XTSA 3KTBA 3UVHA 2ZUPA 2B6MA 5ECMB 4JR6A 1A2LA 5ECRB 4K0GA 4LMWA 1DUGA 2LUSA 2H19A 2LJRA 2TRXA 4N30A 1GSSA 5G2ZA 13GSA 3TRQA 3EU3A 11GSA 3IR4A 2P5RA 4XS4A 3HVXA 2F3MA 2H1AA 4I97A 4K1FA 3ZLPA 1K0MA 1USBA 1RK4A 1E2YA 1GSQA 2FCHA 2CQ9A 4USSA 3EMPA 4BVXA 1Z7RA 2HZEB 3IC8A 2LJAA 3DGQA 2A2SA 4KH7A 1GUHA 3TUEA 1ZYEA 4NMUA 2H76A 2OACA 1T7PB 4I6XA 5G5EA 4HJ2A 2YNXA 2E0QA 1X5DA 1SD9A 5IIZA 5KN3A 3TKSC 2YOIA 3L78A 3LXZA 2DMLA 2C80A 2FWGA 2VO4A 2L57A 3VWWA 3W8SA 4GF0A 2BJXA 2FGXA 3EURA 4KUNA 5E59A 4RQXA 5IMVA 2VAFA 1OVNA 4N0ZA 3KEBA 4L5LA 9GSSA 3HD5A 3GKXA 1GSYA 3KJYA 3TRXA 5F05A 5HR2A 5CRDA 2YN1A 1JFUA 4KE3A 3GIXA 6GSXA 2VL2A 1A2JA 4TR3A 1NHYA 1SL0B 2AUVA 4K7IA 2IMEA 3ED3A 3GURA 1M9AA 2H0GA 4HJMA 2OBKA 4HZ4A 2NVLA 5ECLB 4YAVA 5B7CA 2LS5A 1K3OA 2E2MA 2HYXA 4HI7A 2JU5A 3ZVJD 1FAAA 2C0EA 1GNWA 3D4MA 2ON5A 3GV1A 4K9ZA 4O7HA 2OE0A 1G7OA 5B6NA 3KH7A 4FYUA 1XWKA 2HQTA 3CTFA 5ELAA 1CQGA 2TRCP 4KSOA 5C00A 2H75A 2YWIA 1SK0A 2OE1A 3DEXA 1SENA 2I81A 5DQYA 3VLNA 3ZIJA 4TRXA 1YQ1A 3I69A 1X9SB 2X64A 4BL7A 3HHVA 4ILFA 3C73A 5J4UA 4WEYA 1TDIA 3IC4A 1SYRA 3CXGA 3CMIA 4GLTA 2GS3A 1MDJA 3D0ZA 3WGDA 4I8BA 2DJ0A 1IYIA 3BOAA 1FVKA 1PN9A 3KP9A 2HT9A 5DQSA 4P3YB 2KP2A 1BYEA 2GVPA 1XOAA 1O7UA 3MDKA 3MWHA 3E9JB 3IE3A 3ME7A 4TR0A 3LORA 3ERFA 4NWYA 2KUCA 4ML6A 3D21A 2H30A 1SD8A 3DVXA 3CSIA 3UMAA 3P8WA 1SL2B 2YWMA 1ACVA 4MDCA 2FA8A 2HXKA 3FHKA 1TXXA 2KHPA 5DAKB 1TJDA 2C1YA 1ZYQB 4GTUA 3N5OA 1SKWB 1AQXA 3DYRA 4MMMA 5HFGA 2G0FA 3IV4A 2AHEA 1XFLA 1QMVA 3WD6A 3UOMA 5DJMA 4GRFA 3FW2A 5ABRA 1ON4A 4DEJA 3M9JA 1TTZA 2WDUA 4JZQA 1F3BA 4IN0A 2HSMA 2FNOA 1K0NA 3O6TA 1B9XC 2OBIA 4N10A 4NV2A 2O7KA 4ZL9A 3HDCA 4PNGA 2AV4A 3IRAA 6GSUA 5IOXA 1K3LA 4KB3A 3ME8A 2O87A 2C0GA 1EGOA 4NPBA 3GKMA 3FZ5A 1WIKA 2FHEA 1QUWA 1TKDB 3MAKA 5DALA 4CHSA 4DSQA 3IAS2 3RBTA 2I1UA 2OADA 2JZTA 2CVKA 4IKHA 4ID0A 4FIWA 2DIZA 3P90A 4OCEA 3TKQA 4RUVA 1J9BA 1YJ6A 4G0KA 1QGVA 2OJLA 5CRHA 2KP1A 3HVSA 3TKRA 1O85A 3C71A 3EVIA 4GQCA 2M46A 4MJCA 4HU7A 1X5CA 4V2NA 1Z6NA 4TXVA 1PQNA 1IYHA 2JZSA 4ZBAA 4F0BA 4HOJA 3A2VA 3BBYA 5ID2A 4YQUA 1YF1A 2B3SA 2NBSA 4E8EA 2G2QA 4OFMA 3IK7A 2AYTA 1G6YA 3D5JA 4JE1A 3L4NA 1QK8A 3UL3A 1XBSA 1M7TA 4ZILA 1RW1A 2RLIA 3TB2A 5JWQB 2YWNA 1OKTA 4WKWA 2M80A 4HZ2A 2FWFA 3DWVA 4BPYA 1OE7A 1UA5A 4POBA 2HNLA 4MA9A 2N5AA 1J0FA 4HDEA 1PKWA 2YZHA 3APQA 3ZIVA 2IMIA 4IP1A 1PRXA 2O8VB 1OYJA 3ERGA 3ZYWA 3QFBC 3TKSE 1G0TA 3EYTA 1N2AA 1YEXA 3O3TA 5C04A 2JSZA 4WBRD 3RHCA 1DE2A 1SJIA 1F2EA 4KDXA 4IVFA 3L9VA 2JSYA 4FYBA 1VF1A 4OWYA 1HYUA 2B1KA 4ZL7A 1DE1A 2YPMA 4ZBBA 2QC7A 1UVZA 3TGZA 4KNDA 1SKSB 2X99A 3I9V2 2FWHA 1R26A 3UAPA 2LRNA 5D96A 1N8JA 4LL1B 2BMXA 1GSUA 5IPHA 5A4UA 3K8NA 1HNAA 2B7KA 2VLVA 4AJ8A 4F9ZA 3ZFBA 5D93A 3UBLA 2ES7A 4WXTA 2VLTA 1Z9HA 1ZCPA 4RI6A 2CAIA 4CDOA 5A4WA 2YANA 4TXOA 1U3AA 5EPFA 5CP1A 3G7IA 2IWTA 2YV7A 3KGKA 6GSWA 1SU9A 3GTUA 2DMMA 2C0FA 3CTGA 2VCTA 4XRDA 4L5OA 2MMNA 1ILOA 3DKSA 4HQZA 2LNTA 2V32A 2GGTA 8GSSA 4TKYA 2XHFA 2IFQB 5EVOA 2A4VA 4G0LA 4GQFA 3IK9A 2VCZA 1C72A 5DVBA 1VGLA 5CRWA 1AW9A 3FK8A 2UZ8A 2VCVA 3C8EA 1K0AA 3I6AA 1GLQA 2VL9A 5A5KA 3GHAA 2DC5A 1T00A 4JU5A 4HQSA 4AJ7A 3UBKA 3WYWA 3IHQA 2VM2A 5DCHA 1FG4A 1JLVA 2RUFA 1URMA 2H71A 3PH9A 3LJRA 1YDKA 1FW1A 2H0IA 2N5FA 2P0GA 2HRAA 2CVDA 4MF5A 2HSNB 2VD0A 2MMOA 3UVTA 4POKA 4KF9A 1Z5YE 12GSA 1JZOA 4DSSA 4YQVA 1M0UA 5FT3A 5ECPB 4QQ7A 2LNSA 2GQMA 1U6TA 3GNJA 1M2BA 2F8AA 1VRSD 3QD9A 3KZQA 4ECCA 1OE8A 2X8GA 2L59A 1KEBA 2MYGA 3VK9A 3O76A 1TK0B 2AAWA 3GX8A 2F51A 2WCIA 1MDKA 2K8SA 4KA0A 5B8AA 1AQVA 3G7JA 3F6DA 4FO5A 1Z3EA 3HJMA 3P7XA 3G7YA 1HQOA 4MZWA 3LSZA 1Y25A 1EZKA 5ENUA 1AIUA 1JZRA 2NPBA 4Q5QA 4KX4A 1LBKA 2F9SA 4MPGA 4V1Ag 1PMTA 1QQ2A 2VL2C 3SWLA 2DJKA 2HRFA 1GTIA 1ABAA 4KAEA 3LEFA 1NHOA 4EXJA 1R4WA 1V2AA 2E7PA 5IOWA 2DLXA 1LU4A 1V40A 4N0VA 4XS4B 5HR3A 1GP1A 4ZB9A 1FB6A 1GRXA 1TI1A 1FOVA 1MD4A 2DJJA 2WB9A 1R5AA 1PL2A 3J7Yk 1EEJA 3G9BA 3F0IA 3F63A 5IO0A 5ECSA 3C7MA 1F6MC 3HJOA 4BWQA 4F0CA 3F9UA 4PNFA 3LYKA 4E8HA 3CYNA 5D9VA 4J57E 7GSSA 1YKAA 1WE0A 3TKSA 1G6WA 3FR3A 5EL8A 1XOBA 2MBSA 3APOA 3VPTA 2B1LA 1JZWA 2K9FA 2WRTA 1TRSA 4WR5A 2XPEA 1ZGNA 3FZ4A 3J7Yb 1HNBA 2LJKA 4GWRA 1X9WB 2VCXA 2V41A 3GUSA 6GSYA 1XWAA 1I5GA 5KN0A 4XCSA 5B8BA 1LJRA 4EE0A 3D22A 2C3QA 5HR1A 4AF2A 3GMFA 4YH2A 2IMKA 4AGSA 4MH3A 4IELA 1XCCA 1GLPA 2GDRA 1KTEA 16GSA 1EOGA 4PUFC 2IJYA 4OFNA 5G31A 1TK5B 4WR4A 3UJ1A 2H1GA 4PQ1A 4EL1A 2HSHA 3VFIA 1V58A 2VCQA 3GRXA 1OC9A 5A4VA 4ZB6A 2PU9C 5GAND 3GL3A 5DBQA 5CAXA 4MH2A 3EC3A 4I5QA 4L0UA 5ECKB 2FWEA 1DBYA 3DVWA 2Z9SA 2NTOA 1THOA 3UARA 3QAGA 4OO4A 2H70A 2GSTA 2N5BA 1V57A 2V2GA 2ZNMA 4BL7B 1R7HA 2YZUA 2YP6A 2X8CA 4G9HA 2PERA 5COHA 1ERVA 2EIQA 3FY7A 1QFNA 1GH2A 2WZ9A 2C3TA 2IMDA 5IMAA 3A2WA 2I3YA 2VOCA 3LQ7A 3S9FA 2CV4A 3BD2A 4PTSA 4FQUA 2H1BA 2WJUA 1B48A 3D6IA 4PURA 2HRKA 3ZL5A 1X9MB 1W4VA 2MBTA 3TCOA 4IW9A 4MPFA 2WS2A 2O85A 1OC8A 3TRPA 3FYGA 2EIOA 4NHWA 2C3NA 3GL5A 5CO3A 3HA9A 4EF0A 4JEDA 1TW9A 4MZCA 3KH9A 4WETA 5GZZB 2H73A 1KNGA 2C8UA 2KOKA 1O8XA 4HU9A 4HUAA 2H8LA 3PR8A 5CRGA 2LKUA 1BEDA 3GSSA 5H5QA 6GSTA 4IQAA 4BA7A 4G19A 1THXA 5KN2A 3H93A 2LSTA 1ERUA 3ZVJA 4MZBA 3TKPA 1AC1A 2FA4A 3ZREA 5ELGA 3WGXA 3LFLA 3TOUA 3TJKA 3QAVA 2LEGA 1OAZA 1VF3A 3R2QA 1B8XA 2A2RA 2HSMB 3EE2A 5F8BA 3M0FA 3F6FA 4DSRA 1GSEA 2L5OA 1XW9A 4H86A 3QPMA 3RAZA 1TU8A 5H5SA 4KSMA 1Z7PA 2H6XA 4Q5FA 4MP4A 2HI7A 1XWCA 4X43A 2ZCTA 1WWJA 1JLWA 4LMVA 2CT6A 5DALB 3HVVA 2AJQB 2V6KA 5E4WA 1GUKA 2VIMA 20GSA 3A3TA 1H75A 2B5XA 6GSSA 3BJ5A 4XIHA 2HLSA 4IJIA 3TJFA 2X8HA 1T4ZA 1YF0A 2OKAA 3F8UA 2GT6A 3W8JA 4MJAA 1V9WA 2IPAA 2HZFA 4L0WA 1BJXA 4TR1A 5LD0A 5D9TA 2J23A 3RPPA 4D73A 5IM9A 4Q5NA 3DMLA 3I43A 4ZXGA 4MABA 2D2ZA 5ID2B 2VLUA 1PL1A 5GSSA 1RQMA 3Q74A 2I9HA 3IPZA 2R4VA 1X0RA 4ULXA 3E3EA 2YJ7A 3TJJA 1ML6A 2JZRA 4KW6A 5G5FA 4JRRA 3VWXA 3V1WA 1T4YA 3F3QA 1WOUA 3HYPA 2B5EA 1F3AA 1PGTA 5JCUA 5ECOB 3FZ9A 1B4PA 2GQKA 3Q19A 5AISA 4JBBA 3Q18A 2PVQA 2JADA 2K18A 4NAXA 2PVOC 1WPIA 4GXZA 1MTCA 2WFCA 5H5RA 3H4KA 3H79A 3GN3A 2REMA 4K2DA 4F03A 1GULA 4BWSA 3EINA 5IMCA 5F0GA 3W6GA 3VI7A 1Q4JA 4O32A 2CX4A 2XC2A 1TRUA 3NZNA 4BVYA 3PPUA 2B5YA 3HZ4A 1O6JA 1SK1A 1XZOA 4KCEA 2BTOT 3BCKA 4MJEA 1O8WA 3WT1A 4NHZA 2LRTA 3N9JA 3M3MA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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