1M9BA

Crystal structure of the 26 kda glutathione s-transferase from schistosoma japonicum complexed with gamma-glutamyl[s-(2-iodobenzyl)cysteinyl]glycine
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-Transferase 26 kDa
publication title Characterization of the electrophile binding site and substrate binding mode of the 26-kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 69
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1m9bA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m9bA01
4FO5A 4USSA 1F9MA 3CTFA 2FA4A 1ST9A 4TW5A 5IMVA 4G19A 2VCVA 3QAWA 1TTZA 2F51A 3NIVA 4MK3A 3QCPA 1R26A 2IPAA 2YPMA 4EO3A 3QFAC 4TVEA 1ML6A 2IJYA 2DSAA 1WE0A 2LJAA 4ZXGA 2FUG2 1PL2A 2HZEB 5B8AA 3BD2A 5CRWA 2H76A 4NAXA 5IM9A 2XHFA 1TP9A 2HRNA 1V9WA 2C0DA 3GA4A 4ZL8A 2I1UA 1T4YA 3Q74A 3RHCA 2LS5A 2DJ1A 2IMEA 1K0BA 1IYIA 4WBRD 1Y6EA 1XFLA 4F9ZA 5ID2A 4CHSA 2GT6A 4BVXA 2VIMA 4AJ6A 4G10A 3TKSC 3HZ4A 1M7TA 5D93A 2NBSA 4NWYA 3FR9A 5D8IA 4MLYA 3O76A 2DJKA 2GQMA 3VWVA 2C0EA 4GSTA 4JRRA 1GULA 4MPFA 1GUMA 5HR2A 4X43A 5ECRB 3KP9A 3SWLA 3A5WA 1Z9HA 8GSSA 3GX8A 3PH9A 3TKRA 3I9V2 3BCKA 3WYWA 3IA1A 2QKEA 2EC4A 2AUVA 3HYPA 1JZDA 4LL4B 3FRCA 1TKDB 5ECMB 1UVZA 4ECCA 2DMLA 2GSTA 5J9BA 4IP1A 4TR1A 3EWLA 6GSWA 1M9AA 2VCTA 2OBIA 2YCDA 1RQMA 4YAPA 3EMPA 5CRGA 5IMZA 1TRSA 1F37A 3H8QA 1EGRA 2WGRA 5G1KA 3BJ5A 3G7JA 1W4VA 4EE0A 1ERUA 4TRXA 4K0NA 1UC7A 3L9UA 2XBIA 3GHAA 1OKDA 1A0FA 4AJ7A 2C80A 5ABRA 1GNEA 2WZ9A 3LEFA 2KHPA 3C8EA 1FW1A 2YWNA 1ZYEA 2HI7A 4PUFC 2JU5A 1TOFA 4IGJA 3UL3A 1E2YA 1ERTA 3FKFA 4I6XA 2HT9A 4YAVA 1XZOA 3IBHA 4MPGA 2WRTA 4MP4A 5GSTA 1PRXA 2FWGA 3LORA 1FVJA 2H75A 3Q6OA 4BA7A 2LV3A 4JR6A 3NZNA 1ZCPA 4RUVA 3LSZA 2GQKA 4IQAA 3F0IA 5JWOB 3WT1A 3C7MA 3H1NA 2AHEA 3M1GA 6GSVA 3VWUA 2DLXA 1X5DA 2YZHA 3VK9A 3G9BA 2P31A 2MBSA 4EL1A 4NXIA 1SKSB 4POMA 3ME8A 1YKCA 2CX4A 1LJRA 3QD9A 1SKWB 14GSA 3TJJA 3F9UA 5INYA 2HSHA 3ZREA 3DYRA 5CYYA 3CMIA 4G0IA 4OMVA 1QMVA 1T7PB 1GSSA 4OFNA 1OKTA 5H5QA 1FO5A 2LRTA 3F63A 3D4MA 1YQ1A 4WETA 1QXHA 3WGDA 5JWRB 4ZB8A 1B4QA 3LQ7A 1OE7A 3FHKA 3C1RA 2KP2A 3ZZXA 1XIYA 3DVWA 2PPTA 3EU4A 3LWAA 7GSSA 5J9CA 2KLXA 2KOKA 1G6YA 2DIYA 4JBBA 16GSA 3QAVA 5DQYA 2PBJA 5AN1A 2FGXA 4L8EA 3JCML 5HFKA 2NVLA 4XRAA 2JZSA 2MMOA 3TDGA 4NHWA 1XOBA 4GSSA 3RDWA 1EV9A 1FOVA 2CV4A 3FYGA 3GL3A 4MMMA 2GT5A 4DVCA 2HRKA 3HJPA 1Q4JA 1U87A 1MEKA 2DMMA 3APSA 5DDLA 5J41A 1TU7A 3TUEA 2B5XA 4AGSA 5JWQB 2R2JA 3FK8A 3GH9A 4KDUA 1A24A 1FB0A 1XWGA 3FZ5A 3A2WA 2XPDA 1GTIA 2UZ8A 3APOA 1GSEA 4RI7A 2DJ0A 4DEJA 3A2XA 2FLSA 4XS6A 3IRAA 4POBA 1URMA 2BMXA 5A5KA 3GURA 1BJXA 1VF3A 1R5PA 2JL4A 5KN1A 3ZVJA 2FWFA 2FWEA 2B7KA 2R6KA 3HDCA 3I6AA 5DAKB 2FD3A 1GNWA 3WT2A 3D4TA 1XWCA 4Q5FA 3LGCA 1PA3A 3TJKA 1GSUA 2H72A 4HQZA 3GKNA 1QUWA 4XS4B 3CBUA 4HS1A 3CRTA 3DWVA 4HZ2A 1SL2B 3ZTLA 1GP1A 3TCOA 4O5RA 4IVFA 3D0ZA 2YANA 2AAWA 1K3YA 1Z3EA 1MD4A 4K7IA 4HU9A 5J4UA 2VM1A 1GTUA 2CVKA 5D9XA 4MZWA 1A8YA 3D6IA 1AUCA 4X1UA 3GNJA 2VD1A 4KA0A 4ZL9A 4DSSB 1TW9A 5FHIA 4GSNA 5D9TA 3FZAA 4Q5RA 2J23A 1SJZA 2H73A 2H01A 2CA8A 2LQOA 1PMTA 4FYCA 5IO0A 4PUAA 2V41A 2L59A 1XBSA 4D73B 2L6DA 5A4UA 2IWTA 4BL7B 3L4NA 2LRNA 2TRXA 3DEXA 5HR1A 2K6VA 3D5JA 1OAZA 2B6MA 1KTEA 4F03A 4I2TA 1G0TA 1ZOFA 3ZFBA 5KN0A 5G5EA 5DJMA 1M0UA 5DALA 3LXTA 2O89A 1A2LA 3ZVJD 2HRFA 2YP6A 2CVBA 1XW6A 3M8NA 3TGZA 1GSQA 4YQUA 1HYUA 3P90A 3ISOA 2VL2C 1Z6MA 1W89A 3KP8A 2H6ZA 3P8WA 4EF0A 1OYJA 1UN2A 5JCWA 5GSSA 3D22A 5KN3A 4PXOA 1BG5A 5EY6A 2HZFA 2QSIA 2H74A 2YZUA 3KTLA 5IQYA 1OC9B 2BTOT 4NV2A 5GAND 4GQFA 1T1VA 1DSBA 5HFGA 1JZOA 3GYKA 3ZIJA 2YWMA 4IJIA 4DSRA 4ZIJA 4IHUA 2PWJA 2V2GA 2R37A 3V1WA 10GSA 4L5LA 5JCGA 2PU9C 1YEXA 4N0VA 1HNCA 3FZ4A 2C0FA 2M80A 4GQCA 5IMFA 3QPMA 4JE1A 4BWSA 1SU9A 1A8LA 2PN8A 1HNAA 2HRAA 3UMAA 2H1GA 2TIRA 2GZPA 2RM6A 2C8UA 3SBCA 5ECIB 4KNDA 1SYRA 2QC7A 3RAZA 1EEMA 5A4WA 2OJLA 3P7XA 1X9MB 4LA1A 2Z9SA 4NMUA 3LG6A 1WP0A 2DIZA 4KAEA 4Z7XA 4HJ2A 1K0MA 4TOPA 4F0BA 1TI1A 1WIKA 5E4WA 1TDIA 2CT6A 3HJOA 3GIXA 4KE3A 2ZUPA 1TI3A 3GTUB 2E2GA 3UAPA 2WULA 3RHBA 4MZBA 2V6OA 4Q5NA 1PD21 1SL0B 5BMUA 3AY8A 2HXKA 1SD8A 5F07A 3HZ8A 1YF0A 3TRQA 2JSYA 2LTKA 3LJRA 2MMZA 3HVVA 1I5GA 2N5FA 1XOAA 1K0CA 3PGTA 2CX3A 4V2LA 4MJBA 3CTGA 1EGOA 2VO4A 3TRPA 4XHMA 1GH2A 3R2QA 4EDYA 5D9WA 1PN9A 2I81A 4HQSA 1Y25A 1EP7A 4J56E 1A2MA 4MF6A 1ZGNA 5J3RA 3CSHA 2HSMA 5CRHA 1BYEA 2L5OA 1MD3A 1J0FA 4V1Ap 5ECLB 2NTOA 5IMCA 4JEDA 2IMDA 1F3AA 2CAQA 1B9XC 4IJ3A 4MA9A 2JADA 4HDEA 1USBA 1YJ6A 2WCIA 3J7Yb 2EIRA 2F3MA 4KW6A 1JLVA 3R3EA 1J08A 1K0DA 4PGTA 5JCUA 3UBKA 4ISDA 3KZQA 2LJKA 6GSXA 3ERGA 4OCFA 2FA8A 5G30A 1GLPA 1A2JA 3IXRA 1XVWA 4MH3A 3IC8A 3MSZA 1M2BA 2HZEA 2H0GA 5CRDA 3HHVA 2G2QA 4J57E 4IELA 4GXZA 2AYTA 2X64A 3GSSA 3M3MA 4WEYA 1VGLA 4HUAA 5G1LA 4ULXA 3J7Yk 5C00A 4WR4A 3LFLA 4JU5A 3ERWA 2M72A 2K8SA 1XPVA 4GWRA 5HR0A 3GUSA 2IMFA 1TRWA 4FYUA 3GKMA 1O81A 4MJCA 3I43A 5J5NA 5CAXA 2O85A 3GRXA 3IPZA 3DKSA 1FG4A 2FWHA 4E8EA 2HFDA 3PPUA 2VM2A 5IO2A 1AQWA 1AQVA 1KEBA 2O7KA 2MZCA 4XCSA 2LUSA 4I2UA 3ZL5A 1GSYA 4NHZA 4FQUA 1NM3A 3K8NA 5A4VA 4F82A 1GTBA 2ALBA 2F8FA 1AIUA 5DCGA 1ZZYA 4JZQA 1I9DA 5ECSA 1SK0A 4N11A 1RW1A 2MMNA 1O8XA 2YV9A 4K7NA 1CQHA 2JZTA 4KDXA 1NSWA 3UARA 3UOMA 1PKWA 2RUFA 4QQ7A 2O87A 3DD3A 3QDNA 2KP1A 2ZNMA 2XC2A 3F4SA 3C71A 1DBYA 1XW9A 2P0GA 2MBTA 1GSDA 2REMA 1K0NA 5D73A 3GX0A 3QR6A 1G7EA 4OD7A 2N5BA 3GL5A 2VLUA 2H66A 1JLWA 2H0IA 1LU4A 2GDRA 3VI5A 2V6KA 1FB6A 3S9FA 4ZB9A 1Z7PA 3I69A 2F8AA 4O32A 2FCHA 1OC8A 12GSA 4PX1A 3EINA 3IR4A 1O85A 5ELGA 2DC5A 5B8BA 3IOSA 1QGVA 5ECHB 4ILFA 4O7HA 1SL1B 3IAS2 1ON4A 1XWAA 3FZ9A 1T8EB 4N30A 3VPQA 2QGVA 1TK5B 1B9YC 3Q19A 2ON5A 4ZBBA 4G0KA 5C04A 2IFQB 1GRXA 3ZRDA 3DVXA 1ZL9A 5G31A 2GLRA 1BEDA 2B3SA 5DBQA 5B6MA 3VFIA 1YY7A 4PNGA 6GSSA 2R5GA 4YH2A 3HY2A 1VRSD 2ES7A 5EVOA 3KM6A 1S3CA 4RI6A 4WBJA 2AV4A 3GV1A 4TXOB 3EYTA 3G7YA 4RQXA 3ME7A 3G7IA 2H6XA 3CYNA 3CSIA 1SK2A 2OE3A 1F6MC 4G2EA 3E9JB 4V1Ag 3DXBA 2GGTA 1DUGA 2C3TA 2G0FA 1TXXA 2J9HA 5ECKB 4K8MA 4PQ1A 2GSSA 2CQ9A 1XXUA 2DBCA 2GVPA 3F6DA 2NPBA 3KH9A 1LBKA 2HLSA 1Q98A 1PX7A 4QL7A 2OBKA 2X8HA 2M46A 4OO5A 3UVHA 3TJFA 1V58A 4PNFA 1JZWA 4N0ZA 1YZXA 1FVKA 3TKPA 1QFNA 2X99A 5COHA 1MDJA 2OE1A 3EE2A 2PERA 4LMWA 5D96A 3FW2A 4YQVA 1QQ2A 1ZMAA 1XWBA 2PVOC 1PKZA 4WXTA 3IC4A 2JSZA 4CDOA 1AW9A 4TR4A 3TJGA 4GF0A 2RUEA 2MMAA 4KF9A 17GSA 1R5AA 1O73A 4X0XA 1O6JA 4K1FA 1ERVA 2B5YA 5CO3A 1SJ6A 3U6VA 5ECNB 1AQXA 4HOJA 3IE3A 1FHEA 2OA7A 3OR5A 2YN1A 4XIHA 3C73A 3VURA 5ECOB 4I97A 3CXGA 2K8VA 3EURA 3H79A 4ML1A 4PQHA 2IN3A 3HKRA 2XPEA 3ZLPA 2VLTA 3UEMA 3TOUA 2EIOA 1R7HA 3L9SA 1R4WA 1YEPA 5ID2B 1AXDA 5DAKA 2LQQA 5HR3A 3O3TA 1EEJA 5IOWA 4BVXB 4KH7A 3PINA 2LNSA 3P2AA 2VCQA 4TXOA 3ZMKA 3HJMA 4LL1B 4V2NA 3IDVA 1KNGA 5AISA 3WGEA 4XS4A 5B6NA 4WF5A 1MTCA 2H6YA 4L5OA 5DVBA 2GSRA 2RIIA 3DIEA 1PL1A 1V98A 2HE3A 2VL2A 4FYBA 3HA9A 5E59A 1A0RP 4YQMA 1PQNA 1X5CA 4NPBA 4BVYB 3M9KA 4DSQA 4TR1B 3TOTA 1PGTA 1OE8A 1U88A 3GN3A 4DSSA 4GLTA 4PURA 4MCUA 3E0UA 2AJQB 4N10A 1TRUA 3VWWA 4KX4A 3NOFA 5DQSA 1XVQA 3KH7A 4ZILA 3H93A 1ZYQB 2HNLA 5F06A 2L57A 2VOCA 4OFTA 1X9WB 1T3BA 2GZYA 1XWKA 2HQTA 3H4KA 3VPTA 4D73A 2VCZA 4WR5A 3TKSE 4BL7A 5G2ZA 3BOAA 2YWOA 3UVTA 3TB2A 3RBTA 5KEJA 1M9BA 1O8WA 2FY6A 3MNGA 1YDKA 5ECPB 1F3BA 3EVIA 3ED3A 1AAZA 2VCXA 3KMNA 1GUKA 1NHOA 4ZBDA 5G5FA 2IL3A 2F9SA 2E2MA 3ZITA 3TJBA 2H30A 2PVQA 1JZRA 1V2AA 4ZBAA 1M2DA 2K9FA 4MF5A 3Q18A 3VLNA 2VCWA 1CQGA 4POKA 1G6WA 2DJ3A 3F4TA 2I3YA 5IIZA 6GSUA 2ON7A 5IPGA 2NDOA 2C3QA 3CRUA 1TJDA 3ZIVA 1M99A 5DCHA 1OC9A 3TKSA 2LNTA 3HXSA 5F8BA 2XBQA 5DJLA 2E0QA 2YOIA 4V2MA 3WGXA 1T4ZA 4IN0A 3DMLA 1EV4A 3EC3A 4OWYA 3FR3A 20GSA 4BVYA 5ENUA 1S3DA 4K7OA 4RQRA 1Z5YE 4KSOA 2L6CA 2WFCA 1WPIA 18GSA 2A2RA 2L5LA 4G0LA 1XW5A 1SYXA 2MYGA 2OKAA 1F2EA 3EMXA 3U5RE 4WF4A 2I4AA 3GFKA 1U3AA 2FHEA 4NV5A 1GLQA 5IOXA 1HNBA 2CAIA 2JACA 2P5QA 4LMVA 4KB3A 3QAGA 3KIJA 2HSNB 4L0UA 4MF7A 4TXVA 2HRKB 1ILOA 1ACVA 4TR3A 2R3XA 4XTSA 2VAFA 2CZ2A 4J2FA 1EWXA 2E7PA 4MABA 4KCEA 4HJMA 1K3OA 2JZRA 1KBNA 3DGQA 2H71A 2VLVA 1U3IA 3APQA 3F8UA 4TKYA 4KUNA 3BBYA 1BQ7A 3GTUA 2H1BA 2WDUA 2IMIA 1HD2A 1X0RA 5GAPD 1MDIA 4G9HA 4MJEA 1GL8A 2L4QA 4CW9A 3D21A 4WKWA 3A2VA 2H1DA 1U6TA 3F6FA 3MWHA 2YV7A 1O7UA 1BAYA 3BCIA 1MDKA 2WS2A 3ERFA 2OE0A 4HEA2 3W6GA 4EXJA 5F0GA 1IYHA 3QMXA 1WRYA 1XCCA 4GTUA 19GSA 3US3A 4MDCA 1B48A 3IK9A 4IP6A 2DJJA 2IIYA 5AIXA 5CNWA 2LJRA 2A4VA 2K18A 4KGIA 9GSSA 1RK4A 4OCEA 4EC0A 2ZCTA 1VF1A 5B7CA 3UBLA 2B1LA 3QFBC 2O8VB 1SD9A 5IPHA 3C1SA 2X8CA 2H1AA 2C1YA 1SK1A 1JFUA 5LNKe 2VL9A 3QOUA 5HFIA 3L78A 1N8JA 3KMOA 1H4OA 3VI7A 1X9SB 2C3NA 1M2AA 1GUHA 3IK7A 2C4JA 4TR0A 5CREA 2H70A 3KEBA 13GSA 3GKKA 5D9VA 3UIWA 1SJIA 2VUPA 3RPNA 6GSYA 2P5RA 2GSQA 5LCZA 5IMAA 3ZYWA 2VD0A 3F4RA 4FH8A 3KD0A 2IMKA 4BPYA 4ZB6A 2CZ3A 4K0GA 3PR8A 4TN8A 3A3TA 4IS0A 4MH2A 1DE2A 1EOHA 1TU8A 1V57A 4KSMA 3HVSA 1ERWA 5FT3A 4FIWA 1HQOA 1WWJA 2PGTA 5AIVA 5ECQB 3KTBA 4HZ4A 2I9HA 4IBPA 5EL8A 3LXZA 3KXOA 1WOUA 1GTAA 4BWQA 3FEUA 1EOGA 1J9BA 3UJ1A 4GCIA 3M0FA 3CSJA 3KCMA 1NHYA 1TK0B 4F2IA 1YKAA 3M9JA 1S3AA 1SENA 3O6TA 3ZFLA 2FNOA 4JR4A 2RM5A 1V40A 3E3EA 3MAKA 1YF1A 1Z6NA 2RLIA 4XS1A 2V32A 5DALB 2WJUA 3ZMLA 1PX6A 2L4CA 3L0HA 4KCAA 3HCZA 5LD0A 1WMJA 4EDZA 2B1KA 3DRNA 4ACSA 2LKUA 1A23A 2WB9A 2EIQA 2DJ2A 4ML6A 3IAM2 1SKRB 3FR6A 4IW9A 5HQPA 1C72A 4ECIA 4ECBA 3GKXA 2R4VA 2PUKC 3TKQA 1OC3A 4LLRA 2VL3A 2GS3A 4IQ1A 5FWGA 2TRCP 4OO4A 3WD6A 5H5SA 3N9JA 2LSTA 2A2SA 4EVMA 4QL9A 3IHQA 3GH6A 4XRDA 1TK8B 1DE1A 4AJ8A 4OFMA 3HVXA 5IMDA 1EP8A 3TRXA 2H0HA 2V1MA 1K3LA 4POLA 3KGKA 4HI7A 1VF4A 1JHBA 3EU3A 1AC1A 2BJXA 4Q5QA 4I8BA 4K6XA 4O92A 5ELAA 3KJYA 4E8HA 1N2AA 1GSFA 1PSQA 5H5RA 1THOA 4EUYA 2YJ7A 2YWIA 1TRVA 3L9VA 1B4PA 22GSA 3HD5A 2X8GA 1NW2A 5L71A 1K0OA 5F05A 2N5AA 2IFQA 3N5OA 2GTUA 4ECJA 5GZZB 2C0GA 4IKHA 2GQLA 4P3YB 4L0WA 2B5EA 1T00A 2LRCA 1VF2A 2HSYA 4AF2A 1FAAA 2D2ZA 1K0AA 1UA5A 2AB6A 1THXA 4MZCA 3W8JA 4ZL7A 1G7OA 4EKZA 1WJKA 2YNXA 2YJHA 4GRFA 3GMFA 2PMTA 4HU7A 1X5EA 3MDKA 4MJAA 5CP1A 4PQIA 2H8LA 1EZKA 3F3QA 2KUCA 2GZZA 1GWCA 2CVDA 2LEGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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