The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
47
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWHLVLNVWGKVETDLAGHGQEVLIRLFKSHPETLEKFDKFKHLKSEDDMRRSEDLRKHGNTVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSKHPAEFGADAQAAMKKALELFRNDIAAKYKELGFHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
X-ray crystallographic studies of seal myoglobin. The molecule at 2.5 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Phoca vitulina
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| total genus |
47
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1979-03-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X0L B; 1MLQ A; 1V4X A; 2MGF A; 1C7C A; 1Y35 A; 3ZJS A; 4ESA B; 3SZK B; 3QM7 A; 4FH6 A; 2R4X A; 3WFX A; 1HAC B; 1Y0C B; 1RPS A; 2MGK A; 3WCU C; 1O1O A; 1Y0T A; 3G46 A; 1W92 A; 1HDS B; 1BZZ B; 1QI8 A; 1ABW B; 3ZH0 A; 2R4Z A; 1Y4F A; 1CH5 A; 1NPG A; 1VXB A; 1HLM A; 1WMU B; 3U3E A; 1LH3 A; 1CO9 A; 1YOH A; 1IBE A; 3CY5 A; 1K1K B; 1GLI B; 1MDN A; 1LFQ A; 3D1A A; 1XXT B; 2HBC A; 2R80 B; 4H2L B; 3HYU A; 4N7N B; 3QJB B; 3ONZ A; 1AJH A; 2QMB B; 2Z8A A; 4NZI A; 1DO4 A; 1UVY A; 3UHD A; 1I3D A; 4GZG A; 1Y31 B; 1MWC A; 1CIK A; 3K9Z A; 3GQG B; 1DWS A; 1HBA B; 1MNH A; 1CLS B; 2HBS B; 2QFN A; 2BLJ M; 3UHT A; 1G08 A; 1YEV A; 1X3K A; 1A0Z B; 2B7H A; 2MB5 A; 1XZ2 B; 2D5X A; 2C0K A; 1CH2 A; 2G0X A; 1G0B A; 1YG5 B; 2G0S A; 2DN3 B; 1FCS A; 1HBI A; 2BKM A; 1O1M B; 1HDA A; 5KDQ B; 1QXE A; 3NFE B; 1ECD A; 1LFV B; 1MBO A; 4XS0 A; 2VLZ A; 3ECX A; 2HCO A; 1HHO A; 1IWH B; 1PBX B; 1CQX A; 4ZVB A; 1OUT B; 1MOH A; 3ZJM A; 3D1K B; 1MLF A; 4MAX A; 4U8U D; 2EB8 A; 1S5Y A; 2ZST A; 3UHZ A; 2W6V B; 1HV4 A; 3ZHW A; 1V9Q A; 1A6M A; 3MBA A; 1LFZ B; 1N9X A; 1YGF B; 3V2Z A; 5HU6 A; 1MLK A; 5CHR A; 3KMF A; 4WJG A; 1XQ5 A; 3WTG B; 2HBD A; 3MJP A; 3DHT B; 1Y4B B; 1O1J A; 1N9I A; 1QXD A; 1C7B B; 4FWZ A; 3BCQ B; 1EBT A; 2DXM A; 2ZLX B; 2W72 A; 1JDO A; 2ZS1 D; 5E83 A; 3GYS A; 1MYI A; 3UHR A; 2PEG B; 1GCW A; 2OLP A; 4NK1 A; 5CN6 A; 5HLU A; 1R1Y B; 3PI3 A; 2ZSN A; 4C44 A; 1QSI A; 3GKV B; 1MTJ A; 5EE4 D; 1QPW B; 2RAO A; 1V4U B; 1DXU B; 1Y4G A; 3IC0 B; 2GRF A; 1HLB A; 4O1T A; 101M A; 4ILZ A; 3S1I A; 1HGB B; 1Y85 B; 2YRS A; 3UHN A; 3UI0 A; 4M4B A; 3HHB B; 4N7O B; 4F6D A; 3PI9 A; 3ODQ A; 3GLN A; 1MYJ A; 1NS9 B; 1VWT A; 1YIH A; 3PEL B; 2GKM A; 1RQ3 A; 1A3N A; 1Y83 B; 3P5Q B; 2ZS1 C; 2G0R A; 1BJE A; 1U7S A; 5AZR A; 2H8D B; 4NXA A; 1MLS A; 1SDL B; 1YEQ B; 4HRR A; 3LQD A; 1COH B; 2V1J A; 2ZSO A; 2MHB B; 3GOU A; 1Y0W B; 5EE4 C; 2FRK X; 2QSP B; 1VXE A; 3WCV B; 1YIE B; 3ARJ A; 4DC8 A; 1QSH A; 3M38 A; 4DC7 A; 5CN8 A; 1FHJ B; 2WTG A; 2LH5 A; 3A5A A; 1MOC A; 4OF9 A; 1Y7C A; 1OJ6 A; 1UT0 A; 3AQ8 A; 2XYK A; 1NIH B; 4UUR A; 3RGK A; 3LB4 A; 2QU0 B; 2HHB A; 1SDK A; 1FN3 A; 3QM8 A; 1HBG A; 2Z85 A; 3M39 A; 4N7P A; 1C7D A; 1YCB A; 1UX9 A; 1CH1 A; 1BZR A; 1CQ2 A; 3QZZ A; 1MBC A; 4G1B A; 3RJN B; 1F5O A; 2G10 A; 2AA1 B; 3UGY A; 1YEU A; 4F69 A; 1CMY A; 3R5I B; 1EMY A; 1HBB B; 2LH2 A; 1MLM A; 3GQR A; 2OH8 A; 5KKK A; 3HEP A; 4VHB A; 2ZLW A; 1K0Y A; 1LJW B; 1GDI A; 1Y5F A; 3MYM A; 5ILM A; 1JL6 A; 5HY8 B; 3K8B A; 2V1I A; 5KER A; 2XKG A; 1XY0 B; 1Y0D B; 3ZOL A; 3EOK A; 3QJD A; 3G4V A; 2HZ2 A; 4YU3 B; 1A00 B; 4TYX A; 1O1L B; 3CIU B; 2VM0 A; 2RI4 A; 1UFP A; 5B84 A; 1Y09 A; 3WCP A; 3G4R A; 3BJ2 B; 1GVH A; 1HBH A; 1MYH A; 1BZP A; 3KMF C; 2D2M D; 3FS4 A; 4L2M A; 2ZLU A; 4PNJ A; 3WCT A; 3AG0 A; 2MYD A; 2SPL A; 2E2Y A; 1V4W A; 3S65 B; 2ZFO B; 3QJE B; 1MTK A; 1G0A A; 2ZLT B; 1O1I A; 1URV A; 1YEN B; 1Y7D B; 1O1K B; 2W72 C; 4F4O A; 3AT6 B; 2VYY A; 1J3Z B; 3DUT A; 1MNK A; 3NG6 B; 3QJC A; 3QM5 A; 1YEO A; 4MQI B; 1MBI A; 2EF2 A; 2ZSS A; 2PGH B; 3PI8 A; 1HBS A; 4ROM B; 5CNE A; 2DC3 A; 2AV3 A; 2G3H A; 2D2M C; 7HBI A; 2HHE B; 3UH3 A; 1JP6 A; 2LH3 A; 2V1G A; 2VRY A; 1OUU A; 1BVD A; 1Y4V B; 1FAW B; 1MLR A; 1MBS A; 4MPM A; 1RPS B; 3WHM B; 1GDK A; 1O1O B; 106M A; 2ZSP A; 3BA2 A; 4JYQ A; 1JW8 A; 1NZ2 A; 1MTI A; 1BUW A; 3ZJR A; 1QI8 B; 3B75 A; 3WCW B; 4WCH D; 2ZLV A; 1XZ7 B; 5E6E A; 5HAV A; 1THB B; 1J40 A; 1A0U A; 3G4U A; 2D5Z A; 1ABY B; 1DXV A; 1VRE A; 1IBE B; 1GBV A; 1T1N A; 4KMV A; 1HDB A; 1CBL A; 1NZ3 A; 1Y2Z A; 2G14 A; 1O1P A; 3E5O A; 4IT8 A; 1LFQ B; 1S5X A; 2EB9 A; 1R1X B; 3VRE A; 1FSX B; 2W31 A; 1O1N B; 1Y8K B; 2R50 A; 3M3B A; 2CMM A; 1CG8 A; 1YDZ B; 1YE0 B; 1XZ4 B; 3D7O B; 1RSE A; 2MGL A; 3ZJL A; 1J7S A; 2NRL A; 1CG5 A; 1CIO A; 5JDO E; 2MGE A; 1Y5J B; 3HRW B; 1LH2 A; 1A6K A; 1JF3 A; 5SW7 B; 2R1H B; 1MYF A; 3HXN A; 3OO4 A; 3WFW A; 1XZV B; 4O35 A; 1UVX A; 1YH9 A; 3A9M A; 2BNL A; 3BJ3 B; 3WFU A; 2ZS0 A; 3E55 A; 1ECN A; 1S6A A; 1YFF B; 2HCO B; 4LPI A; 1B0B A; 1HGC B; 1UIW A; 1S0H B; 3MKB B; 1H97 A; 1LFL B; 2LHB A; 4KMW A; 1Y0A B; 3MN0 A; 4U8U A; 2AUQ A; 1F63 A; 1PMB A; 2HBF B; 2WY4 A; 3A2G A; 5ILP A; 1SHR A; 2V1E A; 1I3E A; 3WCT C; 1YHE A; 3FH9 B; 1SPG B; 3VRF B; 3MJU A; 2D6C A; 3BJ1 A; 3WCV D; 2Z6N B; 1HCO A; 2OHA A; 1BIJ B; 1LFT A; 1A01 B; 3UHQ A; 1DO1 A; 105M A; 1M6C A; 1NQP A; 3MJP B; 3D4X A; 1O1J B; 3ZJJ A; 1RTX A; 4ROL B; 3MVC A; 1B86 B; 1IT3 A; 1C40 B; 1HBR A; 1Y8I B; 1JL7 A; 3UHX A; 4KJT A; 3QM9 A; 1AJ9 B; 1XZ5 A; 2ZS1 A; 2GLN A; 3GYS B; 1CH9 A; 1GCW B; 1GBU B; 4ODC B; 2D2N A; 1JP9 A; 1OR6 A; 4YU4 A; 2M6Z A; 2DHB B; 4IRO B; 1DKE A; 3TLD A; 1Y4R A; 1LA6 A; 3G4Y A; 3HF4 A; 1YVT B; 4M4A B; 1Y5K A; 2EVK A; 4MQG B; 3D17 A; 3ASE A; 4F6I A; 1JWN A; 1MWD A; 3IC2 B; 2OHB A; 2HBE A; 5HBI A; 3ARK A; 3GDJ A; 1M6M A; 1FLP A; 2FRJ X; 1RQ3 B; 4NI0 A; 4PQB A; 1N9H A; 2O5M X; 1RQ4 B; 2HHD B; 1Y4Q A; 1Y4P A; 4FC3 B; 3UHB A; 1Y46 A; 1JZM A; 107M A; 3G53 A; 2G0V A; 1JZK A; 5C6E B; 1Y8W A; 5EYJ A; 1JZL A; 2ZS0 D; 1VXF A; 5CNG A; 1NS6 B; 2EKT A; 2FAL A; 3MYN A; 1WLA A; 1N9F A; 2ZFO D; 1ABS A; 4MQH A; 1Y7G B; 6HBW B; 1Y7Z B; 1YHR A; 1HAB A; 4AVE A; 5CMV A; 4NS2 A; 3A59 A; 5CN9 A; 2GNW A; 1Z8U B; 1LHS A; 103M A; 1YMB A; 1CP5 A; 1F5P A; 3HEO A; 2HHB B; 1RQA B; 4X0L A; 2EKU A; 2O5L X; 5EU2 A; 4NK2 A; 4ESA A; 3A0G A; 3PT7 B; 3SZK A; 1MBN A; 2BW9 M; 1H1X A; 2ZS0 C; 4F6F A; 3BOM B; 5E29 B; 1HAC A; 1Y0C A; 1DTM A; 2ZFO C; 1GDJ A; 4HBI A; 1G09 B; 1OFJ A; 1Y5F B; 1J52 A; 1XYE B; 1HDS A; 1BZZ A; 3WCW D; 1ABW A; 1YHU B; 2OIF A; 4U8U C; 1A4F B; 4KN3 A; 4BJA A; 1YGD B; 2D2N D; 1UFJ A; 4NI1 B; 1NPF A; 3OZW A; 1YVQ B; 3QZX A; 2ZSY A; 1IRD A; 1WMU A; 2VEE A; 3VRG B; 2DN2 B; 1K1K A; 1KFR A; 3WCP B; 1YOI A; 1DTI A; 3LB3 A; 1NZ5 A; 2D2M A; 1XXT A; 2BWH A; 2EVP A; 3ED9 A; 4N8T B; 2R80 A; 4H2L A; 1EBC A; 2GTL B; 1D8U A; 3NL7 B; 3NMM B; 3QJB A; 2VLY A; 2ZSR A; 3WCU B; 2QMB A; 3NML A; 2G12 A; 1O1I B; 2ZFB B; 1VXH A; 3AQ9 A; 1Y31 A; 4F4O B; 1DUO A; 4B4Y A; 1J41 B; 3GQG A; 1HBA A; 5JGG B; 2VLX A; 1V07 A; 1CLS A; 4O4Z A; 2HBS A; 3GQP B; 2D2N C; 3EDB A; 1HGA B; 3UH6 A; 1J7W B; 1A0Z A; 2ZT2 A; 1X9F B; 1M9P A; 2NX0 A; 2R4Y A; 3W4U A; 1NZ4 A; 2DN3 A; 3MOU A; 1LFY B; 3ZJI A; 1O1M A; 2MGH A; 5F2A A; 5KDQ A; 1VXD A; 4O2G A; 1SI4 B; 5CHQ A; 3NFE A; 4L7Y B; 1LFV A; 1J3Y B; 3EU1 B; 3OO5 A; 1Y01 B; 1IWH A; 3VHB A; 1LH5 A; 1BBB B; 1PBX A; 4F6J A; 1OUT A; 1MBA A; 3ZOM A; 1NWN A; 5EV5 A; 3QQQ A; 3D1K A; 1NEJ A; 3LR9 A; 3A5B A; 3UHU A; 1GCV B; 3UHE A; 2W6V A; 2QLS B; 1MNO A; 3AQ6 A; 2VEB A; 4F6G A; 1HDB B; 3AT5 B; 5EQM A; 1BVC A; 1LFZ A; 2FRI X; 3UHV A; 1MYM A; 1YGF A; 2QSS A; 3PIA B; 1A3O B; 4HSX A; 3H57 A; 2G11 A; 2GNV A; 1HSY A; 3UHK A; 3WTG A; 3DHT A; 1Y4B A; 1MKO A; 4MQJ B; 1C7B A; 1G9V A; 1YZI B; 1VXC A; 1MLH A; 1UMO A; 3UGZ A; 1MCY A; 3BCQ A; 2MGI A; 1JEB B; 2ZLX A; 2VHB A; 5JDO D; 1XZU A; 2QRW A; 1HJT A; 1BZ1 A; 2PEG A; 1BAB B; 1R1Y A; 1AJG A; 3DHR B; 3GKV A; 1QPW A; 1KD2 B; 1V4U A; 3WR1 B; 3ECL A; 3UBC A; 1LH7 A; 5EYS A; 1DLW A; 1JY7 B; 3QQR A; 1HGB A; 1Y85 A; 1FSL A; 5ILR A; 3G4W A; 3HHB A; 4N7O A; 2D60 B; 1V75 B; 1Y45 B; 3KUN A; 5CNC A; 1NS9 A; 1YCA A; 3PEL A; 3ZJO A; 1Y83 A; 5JDO C; 3P5Q A; 1V4X B; 2AUP A; 5ILE A; 1C7C B; 1Y35 B; 2ZSX A; 4G51 A; 2JHO A; 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1Q1F A; 4B3W A; 1YEN A; 1Y7D A; 1HAB B; 1O1K A; 1YMC A; 3AT6 A; 1J3Z A; 3NG6 A; 2ZT0 A; 1YHU C; 1S5Y B; 3ECZ A; 2H35 A; 110M A; 1JF4 A; 5IKS A; 5C6Y A; 4MQI A; 1HV4 B; 5CNF A; 2ZWJ A; 2PGH A; 4WJG 1; 1X9F D; 4O4T A; 5HU6 B; 1XCH A; 4ROM A; 5CND A; 1CPW A; 1XQ5 B; 1A9W E; 3UHW A; 1MLU A; 2HBD B; 3UHC A; 3A0G B; 1NWI A; 4MQK A; 2HHE A; 1QXD B; 1Y4V A; 2GTL C; 1A6N A; 1DO3 A; 2MYA A; 1FAW A; 1MZ0 A; 3WHM A; 1MOA A; 2DXM B; 2W72 B; 5E83 B; 3WCW A; 1GZX A; 1MYT A; 1J7Y A; 4HHB A; 1XZ7 A; 2O5T X; 1WVP A; 1DXT A; 1THB A; 2IN4 A; 1ABY A; 2MGC A; 1IRD B; 1QSI B; 2H8F A; 104M A; 1X9F C; 2RAO B; 4MBA A; 1Y4G B; 3WCV C; 2D2M B; 3QM6 A; 109M A; 3GKT A; 4OOD A; 1R1X A; 2YRS B; 4M4B B; 1FSX A; 1O1N A; 1Y8K A; 3PI9 B; 3ODQ B; 1VWT B; 1YIH B; 1YDZ A; 1YE0 A; 1XZ4 A; 1A3N B; 3D7O A; 2W6X A; 5JDO F; 1MBD A; 1AZI A; 1Y5J A; 3HRW A; 3OJ1 A; 3IA3 B; 2MYE A; 4HRR B; 2W6Y A; 3K3U A; 1NAZ A; 3LQD B; 2VYW A; 1CH4 A; 5SW7 A; 1M9P B; 3GOU B; 2R1H A; 2G0Z A; 1XZV A; 3W4U B; 1LH6 A; 2O5O X; 1QSH B; 2O5B X; 3BJ3 A; 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