1MDUB

Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (gs-1)
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords gelsolin precursor
publication title Structure of an F-actin trimer disrupted by gelsolin and implications for the mechanism of severing
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 360
sequence length 369
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1mduB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mduB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1mduB04
4IZ9A 3H6EA 4O8KA 4EAHD 3EKUA 3QB0A 4L3QA 5AQSA 5LJVA 5KQDA 4BREA 4DCHA 4BR7A 1JCEA 1LOTB 2V52B 3O80A 2A41A 3ENOA 4FOIA 3VERA 1OKJA 3UKUB 4BRPA 3M3ZA 4H0VB 3SK3A 4BRGA 5BN8A 4A62A 3H1VX 1XUPO 1BU6O 3MN5A 2Q1NA 3LDOA 3VEZA 4F9OA 1NWKA 1WOQA 4CZJA 5JICA 4BRNA 4CZHA 4AM7A 1U2VA 2QW9A 4NO7A 4B1ZA 5BPLA 2YCHA 3FE1A 3QFUA 3HZ6A 3UE5A 4H0PA 3SMSA 2QWOA 4YDUC 4BRDA 2V51B 1GLFO 2P9LB 4BRFA 3GBTA 4H5RA 1EQYA 4BRQA 2HF3A 4JN4A 1HKBA 2GELA 4FWPA 5F0XA 3GOIA 4HWIA 3SLCA 1BA1A 2CGJA 4QS7A 4MO5A 4FWSA 5EVZA 3ULEB 3QDKA 3FGUA 3WXLA 3L4IA 3A5MC 4PKHA 2ZF5O 2GUPA 4EHUA 2E2NA 2FF3B 3A5NC 3BF3A 3GE1A 2E8AA 4AM6A 1DEJA 2UYTA 3JS6A 3HM8A 4CJ7A 5BN9A 3UKUA 1GLBG 4BR2A 1S3XA 2Q36A 2GWJA 4GY2B 5I9EB 3ZX2A 3BP8A 4BRAA 2YI1A 4BRIA 1KXPA 3A5LC 1P8ZA 3KHYA 1CZAN 3EN9A 3WEEB 3VEOA 4CD1A 2P9SB 1HKCA 3CIPA 3CI5A 4FWLA 2P9LA 1MWMA 3FZKA 3DAWA 2QWLA 3FZLA 5AQJA 5AZJB 1SAZA 3ZX0A 1E4GT 1WUAA 3CJBA 3O1BA 5BRFA 3LDLA 4K42A 1QQOA 2J4RA 1ESVA 3FR0A 2D0PA 3A5OC 3DJCA 3WT0A 4BQZA 4IJAA 5BPNA 5ADXA 1DGKN 5E84A 2PAVA 1ZC6A 3FFKB 1YUWA 1GLLO 3ULEA 3ZETB 2HOEA 3H46O 2P9KB 2CGLA 4JD2B 5AQXA 4B1UB 1HUXA 4H0OA 2YHXA 4CZEA 4JAXA 1TUUA 2P9IB 4K41A 2E20A 3KZBA 3VESA 5BREA 3IDHA 4BR4A 3FLCO 4CBWA 3CJ7A 2I7PA 1KAXA 1KAYA 3QMLA 4B9QA 4CZIA 1NM1A 5EOYA 2CH6A 5KPZA 3UB5A 3O6WA 3GDQA 5EY4A 5AQMA 4ISGA 4CBXA 1G99A 3IFRA 3VF6A 3HBTA 1Y64A 4WQ5A 5BRDA 2I7NA 2CGKA 5BR9A 3WEEA 1DKGD 3F9MA 3TU5A 4FWOA 1K8KB 2AA4A 2EWSA 2P9SA 3H45C 2A40A 3G25A 4RTFD 3B8AX 1BDGA 5AZJA 3HSCA 3CQYA 3A8YA 4WQ4A 3UKRB 1MWKA 5AQKA 1T6CA 3FZFA 5EXWA 4WYBA 3MCPA 3FZMA 2E1YA 3C0BA 4FOEA 4BG8A 4BR0A 2W41A 1ZBSA 3AY9A 1YAGA 2QWQA 4XH1A 3ZETA 2VYPA 5AQQA 3R8EA 1Q18A 3IMXA 2P9KA 3H3NO 3D2EB 4ISEA 4JD2A 1XQSC 1YVNA 2D0OA 2QWRA 2GTDA 4FWNA 3EO3A 5AQPA 2P9IA 4H5WA 5AQZA 3EL2A 1NGCA 1BUPA 1GLJO 4FWQA 2P9NB 4H0YB 4BC2A 1TYQB 2E2QA 4BG9A 4RWTA 5AZIB 2Q0UA 2IIRA 1J6ZA 4PKIA 1NGHA 1NLVA 4IJNA 4BC4A 4BR9A 1NGBA 4A2BA 4H0TB 1BG3A 4H03B 3W0LA 4HTLA 2ASOA 3WXIA 1U6ZA 1NGIA 3DXMB 2A3ZA 3ENHA 5AFUH 2FSNA 3CERA 2D1KA 3ATVA 5AFUA 1NGEA 5AQUA 5KQ8A 3QICA 3O4WA 4DQ8A 1V4TA 1Z05A 5FPDA 1K8KA 3L0QA 4BVOA 3BF1A 3ATUA 3VGMA 2V7YA 2IVPA 5B8HA 1S22A 2NZTA 2P9UB 4BC3A 3UKRA 5BPMA 3D7EO 3AARA 2P9PB 3FZHA 4IXCA 1GLEG 2ZGYA 4WQ5C 3EZWA 4BQLA 3U9ZA 1ZXOA 2YHWA 4MO4A 5AQNA 4FO0A 3LDNA 3CETA 3L6QA 3D2EA 4JHDB 1QQMA 5KPRA 2ASMA 3O8MA 4Z94A 3MK6A 4WQ4C 1Z6RA 1SQKA 1C0GA 2P9NA 1XC3A 2E2OA 1TYQA 3VETA 3M6GA 4BVPA 2V7ZA 3AAPA 4PL7A 3P4IA 3QBXA 1RDWX 5AZIA 3D2FB 2D4WA 3RSEB 1GLCG 2GWKA 2QWMA 2OANA 1JCGA 3MN7A 2FLOA 4J8FA 3DXMA 3C7NB 4PKGA 4NB4A 4K43A 3DXKB 4JNEA 1KAZA 3VF4A 3CHWA 2PBDA 2QM1A 2NRHA 2YJEA 3S41A 3U8XA 3VEWA 3J8AA 4CZKA 5KPTA 1X3NA 1QHAA 5TKYA 3QFPA 4K25A 3WXJA 3CJCA 2Q31A 3ZX3A 2AP1A 3MMVA 5LJWA 1D4XA 5AQWA 2P9UA 4E1JA 1BOTO 3SMPA 3GL1A 2CH5A 4A2AA 2E88A 2P9PA 5BRHA 3WXKA 5AQIA 4B1YB 4CZFA 3O1WA 1T44A 5LY3A 1ATNA 5E26A 3O08A 4JHDA 3BEXA 4QS8A 1HX1A 3DWLA 5AQGA 3CJAA 4M7XA 4H5VA 5AQYA 4BC5A 1NGDA 1NGGA 4CZGA 3CQXA 4H5NA 2A42A 3CJ1A 2A6AA 4BRLA 3W3DA 3EKSA 3VOVA 4A61A 1YXQA 4IO8A 3D2FA 3H3OB 4BR5A 4EIAA 4I6MB 3AAQA 2BTFA 3MN6A 3RSEA 1HJOA 3A0IX 1TUYA 4FL9A 2E2PA 2ITMA 2GEMA 2ASPA 4BROA 4Y0WA 5FPMA 1GLDG 1HPMA 3C7NA 3MN9A 3TPQA 3WQUA 5AQVA 3ZEUB 3DXKA 3LDPA 1LCUA 1RGIA 2ZWHA 3U9DA 3R6MA 3BUZB 1E4FT 3SJHA 3H1QA 2QXLA 1T6DA 5AQRA 3WUHA 3I8BA 1NGAA 2ZGZA 4CZMA 5AR0A 1C0FA 1JCFA 3O5BA 1BWFO 3MDQA 3VGLA 2IVNA 2KHOA 2NLXA 4C23A 3LM2A 4FPBA 3WQTA 4XH4A 3VEVA 2DPNA 5AQOA 3VEYA 2A5XA 1QQNA 2W40A 3VPZA 3VF2A 3CJ9A 4BRKA 3VENA 4CD3A 4FWKA 3KVGA 4GNIA 4IWVA 3VGKA 1NBWA 2QWNA 5ELZA 5AQLA 5FPNA 4XEIA 1X3MA 3GG4A 4FPAA 4BRCA 3HI0A 4LC9B 2F9WA 4MLEA 4BGAA 3ID8A 1R59O 5F1XA 4I6MA 1H1VA 5JLFA 4M7YA 2BUPA 5JLHA 2IVOA 2FSJA 3HTVA 1HLUA 4B1VA 1QZ5A 2YHYA 5AQFA 1IJJA 3U4LA 2HMPA 4DB3A 3R9PA 3ZEUA 3JXUA 1RFQA 4YDUA 1BA0A 3IUCA 4M63C 2H3GX 4RCHA 4H0XB 4MLHA 3QBWA 4EFHA 5EX5A 3VEXA 4BGBA 4BRHA 1MDUB 2VCPA 1ATSA 2WUSA 4XH5A 1NGFA 5ADXH 4EHTA 3OHRA 1NMDA 4BRMA 1U2VB 5AQHA 3LM9A 4FSVA 5CE3A 4KBOA 5AQTA 4O5FA 1SZ2A 4CZLA 1NGJA 2VWBA 2FXUA 4DHYA 2Q0RA 2F9TA 1X9JA 3I33A 2FF6A 2E1ZA 1HKGA 1ATRA 2QWPA 2YJFA 5F2RA 1MA9B 1BO5O 3M1FA 4CI6A 4ISFA 4FWRA 1QZ6A 3LL3A 2FSKA 4H5TA 4PL8A 4B1XB 1V4SA 1IG8A 5JMVA 4B1WB 5FPEA 2Q2RA 1GLAG 4CBUA 2HF4A 4FWMA 4QS9A 3LDQA 2Q97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KK2A 3QB0A 3VQ9A 4FZXC 5LJVA 1FKPA 5KQDA 1XWLA 4DWIA 2HBJA 1C1CA 4LH5A 5LMUK 3KK1A 2HHQA 3KD1E 5KRSA 4BRPA 1HYSA 4GW6A 3M3ZA 3EE8A 3SK3A 3T3FA 3HK2A 2KZMA 3LDSA 4EP4A 5D3GA 4DFJA 2O4GA 2DFEA 4KTQA 4CHQA 4CZHA 3MWPA 1NJXA 1XHXA 4KHUA 2QW9A 1JL2A 5BPLA 3HZ6A 1FW6A 1XMQK 3UE5A 1I94K 4H0PA 3OYDA 5GIOA 4F3OA 1P90A 2V51B 2X6SA 4RW9A 2PYJA 4CJWA 1RT2A 2HF3A 4JN4A 1HKBA 4M3WA 4FWPA 3GOIA 5CZ2A 2O8DA 3CCQN 4N56A 4HUGA 2CGJA 4QS7A 4MO5A 1FK9A 1IKYA 1W97L 1Q9YA 4LF7K 1VSFA 3QDKA 1NK5A 3WXLA 3PX6A 4DTUA 3T69A 3CM5A 5HBMA 3V9XA 4KHNA 2QA4N 1NKEA 3O9SA 2E2NA 3A5NC 4B3SK 1LAWA 1YVUA 2E8AA 4AM6A 4DTPA 4CJSA 3F9KA 2UYTA 3JS6A 2JLEA 4LF4K 3AVMA 1QSYA 3DLBA 3NFAA 2FBVA 3SQ2A 1C1AA 1GLBG 1NNEA 1VSDA 3R1XA 4CFDA 4FJGA 1S3XA 2HMIA 1EX4A 5I9EB 1TL3A 2Y1IA 4WFBL 4CEBA 1RDCA 2YHAA 2YI1A 3HP6A 1S6QA 3CCRN 1T3VA 4TSXA 3A5LC 3I0SA 3ULDA 3CC7N 3NVKA 3VEOA 2P9SB 3CIPA 3DAWA 5FROA 2NRWA 1WUAA 3CJBA 3O1BA 3CMEN 2W6KA 3LDLA 1CLQA 3TTFA 4BQZA 4IJAA 5ADXA 3V1OA 1RT5A 2YNGA 2HHUA 1QQCA 2X6NA 1JLQA 3SUQA 3FFKB 1GLLO 2UXBK 4O4GA 4CF0A 3FFIA 2HOEA 3H46O 2P9KB 1TKTA 4B1UB 1HUXA 5LMNK 3KK3A 3TANA 5TKWA 5HRRA 4ILGB 4JKGA 2RKIA 3KZBA 5J2QA 3TAEA 3SQ0A 1JLBA 1KAYA 3WXMB 4DU1A 2IGIA 4O8UA 3VN5A 1Q7YO 1NM1A 1RDDA 5KPZA 4FYDA 5J1EA 2D0BA 5C10A 3K58A 4ISGA 1EXQA 4IG3A 3VQ8A 1X9WA 3IFRA 1JLCA 1Y64A 1RBSA 5BRDA 2CGKA 3DMJA 2UUAK 5BR9A 3U3GA 3CFRA 2AA4A 2P9SA 4RTFD 2A40A 3QINA 2RHKA 1HR0K 1BL3A 3CQYA 4WQ4A 2OZSA 1MU2A 4JI3K 1RDAA 1T6CA 4ICLA 3K0SA 3ZSOA 2G8UA 5H1SQ 4WYBA 3MCPA 4CVNE 4IO9L 3AO4A 2OPPA 3SBTA 1ZBSA 4CK2A 2QWQA 5KTQA 4OPHA 3SPYA 4KI4A 2P9KA 1RT7A 3OJUA 1XMOK 1JL1A 3EO3A 4H5WA 5AQZA 1M90O 1NGCA 2O8FB 4FWQA 4H0YB 4JK7A 3J7ZO 4BC2A 3TAFA 1C6VA 2Q0UA 3M8SA 3L2VA 3SZ2A 1KVCA 4BC4A 1BG3A 1S1UA 4LF8K 1IKVA 3O4NA 3WXIA 4W5TA 2NUBA 2XO7A 2IDOA 4ID5A 2FSNA 3CERA 2D1KA 5JVGL 5CYMA 3VA3A 4DS5A 5HLFA 4JS4A 4KREA 1W2BM 4BE0A 5AQUA 4DLEA 3QICA 3O4WA 4H8KA 4IKFA 1RTIA 3TAMA 2RF2A 4FZYA 2V7YA 1YJWN 1J9AA 1VSKA 2GBZA 2P9UB 1BHLA 5BPMA 1JLGA 3ZCMA 2ZGYA 4L8RB 1ZBLA 2YNIA 3I0RA 4DV0K 3U9ZA 5AQNA 2KTQA 1NK7A 3LDNA 3CETA 3CYMA 1BGXT 2JWLA 4Z94A 3MK6A 4WQ4C 3KKRA 3TARA 1NU0A 4JI7K 1IO2A 3LAMA 1ITGA 2O8FA 3AO5A 4ZTJA 3PIPL 3M6GA 3AAPA 3QBXA 4DR1K 3AVNA 3TR8A 2OANA 4JLHA 4KO0A 4J8FA 3WNEA 4UY8O 4CHZA 4JNEA 2QM1A 1EWRA 2PFUA 2YJEA 3S41A 3U8XA 3J8AA 4G9ZA 1S1TA 4K25A 3RVCA 4JI2K 4Z4GA 1D4XA 5AQWA 1VQPN 2O8CB 2P9UA 4BDPA 4E1JA 3HL8A 1RILA 2VQEK 2E88A 3Q7BA 3AVLA 4BWJA 1RT1A 5HP1A 3AO3A 3AVCA 1T44A 5C42A 5LY3A 4CHPA 4CEDA 3RWUA 4QS8A 4KTWA 2RN2A 3VQ7A 4BC5A 2UXCK 1HNIA 4JI5K 3CJ1A 2A6AA 3EKSA 4IO8A 4FJIA 1Q9XA 3AAQA 4CGFA 1DLOA 3A0IX 4FL9A 2E2PA 5C0YA 2OPRA 2GEMA 4CJPA 1A5WA 1W0HA 5FPMA 1GLDG 1KVBA 4IEEA 4IOCL 5AQVA 2ZWHA 1BIZA 4A59A 4M3UA 3BUZB 3OYFA 1GOAA 3TWHA 2HSTA 1CXUA 2ZGZA 1RDBA 4CJRA 5SWMA 2O8CA 1KTQA 5SZTA 4CFAA 4C23A 2HNYA 3ENBA 4JRQA 2A5XA 3KD5E 2WFBA 2W40A 3RMDA 4G1QA 3TAPA 2GUIA 4QOZB 2D0CA 3RMCA 4DFMA 3CJ9A 4CD3A 4FVUA 1GOCA 3DRRA 5J2MA 1U45A 5C24A 4O55A 4FPAA 4JKCA 4JK9A 4BWMA 3CCLN 2HHSA 4BGAA 5F1XA 2FC0A 3QEVA 5JLFA 3PSFA 2P5OA 2BUPA 2IVOA 4DSLA 4F3TA 1ZBIA 2YHYA 4B08A 4JI4K 4OPKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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