1ME8A

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with rvp bound
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
491
structure length
356
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSIITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSIVEGGAHDVI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title Crystal Structure of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with the Inhibitor Ribavirin Monophosphate Reveals a Catalysis-dependent Ion-binding Site
pubmed doi rcsb
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 116
structure length 356
sequence length 491
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1me8A00
3L65A 3W23A 4K37A 1IXNA 1XUZA 1W5NA 3S8HA 5DY2A 1P0KA 4MIMA 1I2NA 3JRKA 3LCLA 2Q8ZA 3QPZA 3F1QA 3N14A 5HWNA 3GR8A 3HPSA 4WOQA 1X8FA 4O57A 3MWAA 3NL5A 3IIZA 1QPOA 4PEKA 5U7SA 4FX7A 1GYNA 4UFIA 5D2VA 1WQ5A 5D09A 1DKWA 1Q45A 1KM2A 2X1TA 4A29A 2QCCA 3W7EA 1K8ZA 3NNTA 5KZEA 1GVRA 1SW3A 3NL6A 3TK7A 5F1VA 3NQEA 3KVKA 4JNMA 1DJNA 1UASA 1AW2A 3O1NA 1A5BA 1EUAA 3FOKA 4NXSA 4ONVA 1Q6OA 4EIVA 4AWUA 3TFXA 4GUGA 4NQ1A 1ME8A 2YX0A 3QMTA 4UIOA 1FDJA 4LV9A 3ATYA 3LXBA 1FUYA 4PH6A 3ZFHA 4ZL1A 1R30A 3P80A 1D3GA 3DAQA 4NJGA 1JRCA 1H5YA 4AHOA 3D0CA 1RQHA 1PS9A 3PF3A 3EWXA 2Q3RA 1MEIA 4AXKA 3QSTA 1TYGA 4BI5A 4EWND 2F7FA 1H61A 1LDCA 4WJEA 5L6UA 4Q33A 3TE9A 4IPJA 3W7MA 4O1CA 3BW2A 4K38A 3O6YX 4YMZA 4NX0A 5LKYA 3HF3A 1AL7A 1P0NA 1NSJA 1I2QA 3NYZA 3BPWA 3NZ1A 1WAUA 2ZA3A 4TX9A 2HS8A 4KWVA 2BXVA 3LTPA 3HIJA 1L9WA 2X30A 4FX8A 3ZWTA 3CWOX 3G1XA 2BTMA 4LRTA 1TPWA 1O5KA 3H53A 4JIPA 3MI6A 1QWGA 5LNUA 2VEIA 3DKLA 1YXCA 3ATZA 3T40A 3B0PA 5K9CA 1XXXA 2A7NA 2EGZA 1ME9A 3NPUA 2E5BA 3TDFA 4M7SA 2OT1A 3PM6A 2ZCGA 2XFWA 4LW7A 5AHMA 1ZALA 5DXXA 1WYIA 4ALDA 3TMQA 5CGQA 2V2HA 4O28A 3QZEA 3SW6A 3RU6A 1EP3A 3B8DA 1UJPA 4WUIA 4UTIA 1G6CA 1OHLA 1HTIA 2NXHA 3W7JA 1PHWA 3TX9A 4BFAA 1FXQA 3GKAA 2WNNA 4L4MA 1P4CA 3LLFA 4HSNA 2IQTA 5LNWA 5K3VA 3UYCA 2W79A 3B05A 4I7UA 5C6MA 3DI0A 4O16A 1FDYA 2H8XA 3STFA 2GVGA 1G4PA 4O10A 2GVJA 2ZZ5A 4XKYB 3BV4A 1WOBA 1M6JA 1F74A 3CU2A 2DJLA 4ICNA 2ABBA 1YTDA 2ISWA 1K3UA 3PG9A 3LHZA 5TQLA 2JKPA 4OT7A 1IF2A 4S2BA 2E6DA 2FQIA 1SO5A 5CPLA 3B04A 1GJPA 3RFAA 3MJYA 4M6QA 4P61A 4QISA 3UWWA 3HG2A 3CWNA 4JICA 1F5ZA 5C2XA 2VFFA 3N2XA 1KM3A 5AN7A 4UFMA 1WBHA 2FPVA 2QCFA 3NQ2A 4JTUA 4WQ6A 3O16A 5AFDA 3WJZA 3I65A 3HG3A 3I7QA 1DHPA 2XN1A 1D9EA 1DVJA 4JY8A 1W8SA 2ZZ7A 3PBYA 3W76A 3PBVA 3EX6A 4JTEA 1NAL1 1TQJA 3GAKA 3UY7A 5HWMA 3GK0A 1TCDA 4H4IA 3DFSA 1Z48A 4AAJA 2NLIA 3PUOA 3HJZA 1ZCOA 1H63A 4LS2A 1Z42A 3P8JA 2BLEA 1A5CA 4GBUA 3SR7A 1VLWA 3R13A 3GIYA 3LCGA 5H2ZA 3O8AA 3TJLA 1W56A 4AMAA 4WXZA 4FNUA 5EPDA 3THAA 2VEPA 3BLEA 4JYEA 2A21A 2GUUA 5AYYA 3G8EA 2Y7EA 1A53A 4UNLA 3NG3A 2TPSA 5IBXC 5E1QA 4O4VA 2ATMA 3FFSA 2YW3A 1VRDA 5GVJA 1KV8A 1G69A 3TNOA 4POCA 3I7SA 4PL2A 4E2DA 2FB3A 1W5OA 3G1HA 2FLIA 4Q32A 4QJ1A 2V0TA 3DFPA 2QCDB 1M5WA 2ZA2A 4IUOA 2G5WA 4NZFA 3GNDA 5D2XA 4DF2A 4UTJA 4AWSA 3E02A 1NVMA 3S1VA 3FKRA 2QF7A 3I68A 3HG5A 2QDHA 1YTKA 2NX1A 3EX3A 3BG3A 2DZVA 3NQAA 4CQ8A 2QAPA 2OT0A 2QCLA 3PBUA 4K36A 3NPXA 2I14A 1ALDA 4UXDA 2NXGA 2C14A 2RDTA 1QMLA 2NWSA 3FA5A 1PHQA 1NF7A 3LB0A 5AHFA 2NUWA 4MY1A 2Y62A 3OVQA 1YTEA 2JK2A 3P7YA 3M5ZA 3CM4A 4PFMA 3V75A 4G1KA 3TQVA 1W5MA 4AF0B 3NDOA 4RK8A 1KFEA 4YL2A 1GVOA 4PC8A 1IXPA 4MOZA 1MEWA 1LOSA 1YPFA 3W74A 2X1SA 3ELFA 1GVQA 1LBLA 1WXJA 5L9FA 1SU5A 1H51A 4EF9A 4AVFA 2D73A 4HPXA 4Z1DA 3BGGA 5F4XA 4FNPA 1EWDA 1JUBA 3BGJA 3P5ZA 3W75A 2VKZG 8TIMA 3OEXA 4O18A 1K7EA 2V5LA 2HTMA 3N34A 2A7RA 3NPWA 5H91A 1VCVA 1ME7A 3MP4A 3TC7A 1KLZA 2NWRA 2NV1A 3TW7A 1H7PA 5FF2A 2J9XA 5BMXA 2C18A 4JYFA 3DFOA 3LHUA 5KTLA 2O7QA 3MO7A 4GC4A 4NNCA 3EEGA 3NQ6A 5AC8A 2PC4A 2XN0A 3T55A 1SFJA 1FCBA 2FB2A 4WD0A 3MHUA 2YPIA 1GTHA 5TIMA 3DGRA 1GVFA 2E5DA 3LCHA 3BARA 1H7XA 4TMCA 2J24A 4MJMA 4JX4A 2C16A 1PCKA 1F05A 4HNVA 3HG4A 1VHNA 3I7RA 3G1YA 1KTBA 1EWEA 1TPEA 5CZSA 1S5WA 1HO4A 3DKJA 5F2IA 3W1PA 4M6PA 1TB3A 3TQ0A 1K8YA 1SZFA 3M6YA 3QJAA 3S1UA 4Y8FA 4BI7A 1GG1A 1LOQA 3G1AA 2FDSA 2YYUA 1YPIA 4RZ5A 2B7QA 2P1FA 3ABRA 4E2BA 5BNKA 2X1RA 3GZ3A 1PE1A 4LS1A 4LV4A 3UZ5A 3W6YA 1DOSA 3EWZA 3W1TA 2GVLA 3F03K 4Y9AA 1K7FA 3LLDA 1LROA 3PULA 4BWLA 4YWIA 2VFGA 2P10A 3E49A 1FWSA 3W1QA 3IRDA 1W54A 1XI3A 3WJXA 5EKYA 2QUTA 4UR8A 4N9DA 3EKZA 3L21A 2WOQA 4UTHA 3W1LA 1LCOA 4OQVA 3LCWA 5HR7A 1GT8A 2DP3A 4PCFA 2EAWA 3WK0A 1YXDA 4UR7A 5A5WA 1W5PA 3N9SA 1G7UA 3BK0A 1W1ZA 2A0NA 3IV3A 4YCOA 3SZ8A 3N9RA 4FXSA 2R91A 2PRHA 4PODA 1OX4B 3UWVA 3W88A 4TMBA 2RFGA 4ZQOA 3RLVA 3M43A 5DCEA 3WK1A 2YCEA 2BWGA 5K4ZA 1B9BA 4IWWA 4IOTA 1JUKA 1TRIA 1LOLA 3YPIA 5BMWA 3W86A 2O7SA 2Q8LA 3UWZA 4JDYA 2V9DA 4GFSA 1I4NA 3WFAA 1GPWA 3QPYA 2ZZ2A 5LHEA 3A9IA 3DFNA 5CSSA 3CT7A 1HFBA 1TPUA 5EA9A 5IM51 1KBIA 3T7VA 3PSVA 2HS6A 4NJJA 5BRBA 1OX6A 1OFDA 4GRSA 4X9SA 3MHFA 1SZGA 3L5MA 1R47A 3LHTA 5DELA 1C8VA 1W31A 1BWKA 1LLZA 3T4CA 3L68A 1P5BA 1EUNA 3B06A 3O05A 2ISSA 2CLFA 3M9YA 4MYAA 5A8GA 3NR0A 2DZTA 2ZQ0A 4HIBA 4N2YA 2B4GA 3GLCA 3LGEA 3P82A 4PL1A 1A5SA 4NX5A 3KXQA 1W3NA 5CSRA 1I2RA 1YLVA 4FF7A 4H3DA 4RZ4A 3SFKA 1T8XA 4HN4A 3W1MA 3A5FA 2NV2A 3W71A 3PUDA 4FIRA 1KM0A 3KVLA 3F4NA 3HO8A 3UWUA 4JY9A 3P60A 3AJXA 4HNTA 3UY8A 2Y61A 2NX3A 4HKPA 1SW7A 3W9ZA 3IIXA 5DCBA 1FY6A 1CW2A 4CNNA 1JCLA 3A24A 1TQXA 4UFKA 4A22A 1OK6A 4EOUA 3SY5A 3VFLA 3IVUA 2ZRZA 1TJPA 4RR4A 4LVBA 3C0JA 3O15A 4UTUA 4QM1A 3JS3A 2G97A 2TMDA 3STGA 5HUOA 1Z41A 1MO0A 3M16A 3PVFA 1X1OA 3FS2A 3L0KA 4ML9A 1VYSX 4S2CA 1XBYA 1N8FA 2E6YA 3INPA 3WJSA 4IMGA 1KFLA 4FX6M 4DBDA 1YDNA 5HWJA 3TAKA 4MPQA 2NUYA 2Z6IA 2YFOA 3TMLA 2PRLA 4UUIA 4LUIA 2V30A 1VR6A 3GVGA 1X1ZA 3QFEA 4OGZA 4HSOA 4OV4A 1R2TA 4JYDA 4OU1A 3NVTA 5D02A 4LVAA 2X1UA 3G1SA 1HL2A 2R94A 2ZYFA 3GKFA 2GOUA 1ONRA 1AG1O 3W83A 3GDLA 3EX1A 4B5NA 4IXXA 1ZJIA 2CW6A 2JKAA 4Y96A 1GTEA 3P67A 4WY0F 4XZ9A 4Z1AA 2TYSA 4A2SA 2C13A 2CLOA 3M7WA 3ABSA 4A21A 1LBFA 1W3TA 1AW1A 4GE8A 2CFFA 5AHLA 4LVFA 3MI2A 1OYBA 3B0VC 1TSIA 1JCNA 3UNDA 4NXKA 4CCDA 1DJQA 2Z6JA 3OHIA 1Z44A 4OHQA 3W7HA 1PVNA 3LXAA 4IGHA 4QNWA 2DJXA 2QCDA 4JTLA 4Z0JA 3PAJA 1F76A 3EWBX 1SO6A 2QCNA 3TH6A 3W84A 3ZS4A 2BZNA 4DEFA 1PV8A 1R2RA 5KINA 3BG5A 3PB2A 4RJEA 5I3FA 1IIHA 1OFOA 1QO5A 4M7TA 2G95A 2QJGA 4JTGA 5HINA 3KRZA 3NQFA 1R2SA 4MY8A 4RXGA 1JCXA 1KA9F 3C2OA 2C0AA 4R53A 2WQPA 3TV8A 4I7WA 1LRNA 1QPNA 2E68A 1BWLA 3S0CA 2FTPA 3NQMA 3UXAA 3MUXA 4QITA 1THFD 5G2IA 1VPXA 3VCRA 2ALDA 1D3HA 4TR9A 1S5VA 3RK8A 4D2JA 3HGJA 2XN2A 3MP3A 3CC1A 3M1ZA 1NFBA 2GQ8A 4XTIA 4GNJA 4EF8A 3GYEA 5C54A 4FNSA 3HGOA 2H90A 2RHGA 2R8WA 3WK2A 4MLRA 1LRTA 4DPQA 1JCJA 1SZEA 4OV9A 1ICSA 3C8FA 3NPVA 3CQ0A 3MI3A 3BVJA 4CCCA 1GZGA 4OBTA 5BW6A 1DQWA 1KM1A 5I3GA 2B7OA 4O14A 2EHHA 2QCEA 3LM7A 3GX9A 2RKXA 4CQ9A 4ZZ9A 1NEYA 3L66A 2YZRA 4IPIA 3CEPA 3C2FA 1ZY9A 4O1BA 3QM3A 4ZQMA 2LLEA 3W7NA 2J27A 4K7YA 1AW5A 3WJWA 1VS1A 3M5XA 5FEWA 4MZYA 3W2MA 2VOMA 1KFCA 3B03A 4RLIA 5HUPA 1FWRA 3P5YA 1HO1A 3STCA 1H7NA 5F4SA 1B3OA 3ABQA 2ZDRA 2BX7A 1H7WA 4GUHA 2V5BA 4NJKA 4XBSA 3DZ1A 3QSRA 1T0OA 4O52A 3TQKA 4UTTC 3ANYA 1GG0A 4JEQA 3G3DA 2ZRYA 1ZFJA 5FF0A 4O15A 3UPBA 4K8EA 3OVPA 1VLIA 3QW3A 3F4WA 3NQDA 3A21A 2H8ZA 1J2WA 5EBUA 1K03A 4JTHA 5SWUA 3TW6A 4N9EA 2BSLA 2OX1A 3PY2A 1LP6A 4IX2A 1YXYA 1YADA 2WV8A 1F7BA 2TRSA 5LSMA 4Y90A 1DL3A 3C3NA 3BW3A 3KHJA 1FWNA 1UUOA 3LHWA 3L0NA 1A5AA 5F4WA 5AC6A 5E93A 3QF0A 5EY5A 3G0UA 3C2RA 2V82A 2HMCA 4WX2A 4E38A 5G4EA 4AHPA 4DO4A 4EVZA 4GJ1A 3A23A 2KZHA 1IXOA 4R33A 1VGAA 3E12A 2J88A 1JR1A 1C9DA 1FBAA 2Q3OA 4GUIA 4LC6A 3TXVA 2QAFA 1J4EA 4ADUA 3LX9A 2CLEA 1K7XA 3PG8A 4ORMA 5IBXA 2A7PA 2QR6A 4UMBA 3W7IA 2WO5A 3GXNA 3HPZA 5LGXA 2ZRUA 2JGYA 2I1OA 1ZAJA 3S5OA 5HNRA 3CTLA 1JVNA 2WNZA 3BW4A 2WSYA 5FEPA 1O94A 4E0CA 4JTKA 3KX6A 4MVAA 1KFKA 4JD4A 1GQNA 2ISVA 3BLIA 3EWYA 3NQVA 4GUFA 2F84A 4Z1CA 4MZ1A 2WPBA 5EMUA 5FEXA 3S1WA 1RVGA 5J5DA 2B7PA 3FEMA 4WY0B 3LBCA 4XBKA 2VFDA 4IMFA 3IGSA 1QOPA 1H7OA 3G3MA 1G4TA 3QYQA 3UWYA 3L5LA 4NJIA 1QPRA 5I3JA 4MLJA 3Q94A 4BWLC 3LI0A 1QR7A 2A2IA 2FPYA 1FWWA 2E09A 3DU0A 5AC7A 3R89A 1VH7A 5LGZA 3RMJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HOW A;  1O68 A;  4F0L A;  1IXN A;  3VKK A;  3S8H A;  4A6G A;  5TAO A;  4MIM A;  3RLH A;  3JRK A;  3N4F A;  2OLH A;  2PD9 A;  3TZF A;  1US3 A;  3N14 A;  2HCV A;  3HPS A;  1QNO A;  3U9I A;  1UC5 A;  3GUG A;  4WOQ A;  2GGI A;  3MWA A;  3FN9 A;  5FL0 A;  3IIZ A;  5U7S A;  1GYN A;  2QCC A;  1LJY A;  4MDO A;  4IPL A;  2D3L A;  5C9W A;  5KZE A;  3THC A;  3NL6 A;  1SW3 A;  2XUC A;  1YDY A;  1DJN A;  4C6E A;  5JBF A;  7ODC A;  3O1N A;  3V4B A;  3KS6 A;  1KGU A;  1ECQ A;  3TFX A;  1S2T A;  4GUG A;  4US5 A;  1HF6 A;  3GTI A;  3KOX A;  4HA1 A;  1EFZ A;  4LV9 A;  3BZJ A;  4H8N A;  1DJW A;  1JRC A;  3LPP A;  1PS9 A;  4IUG A;  4ZB5 A;  1MQR A;  3EWX A;  1UQZ A;  4AXK A;  2VR2 A;  1LDC A;  5DQP A;  2Z26 A;  3BW2 A;  1CZ1 A;  2ODO A;  2X7W A;  4JZ5 A;  2D20 A;  1I2Q A;  3NYZ A;  3BPW A;  1Q6F A;  1HX0 A;  4HCL A;  1T7L A;  4KWV A;  3GNR A;  2OFJ A;  2X30 A;  1PWL A;  1HKI A;  1V3H A;  3WUB A;  3H53 A;  4JIP A;  1QWG A;  3L4W A;  4NAS A;  4F66 A;  2W62 A;  1XCW A;  2WYS A;  4IGS A;  4YN5 A;  5G1M A;  2F38 A; 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