1MEW | Genus

Total Genus 111

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	111
sequence length	482
structure length	344
Chain Sequence	AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title	Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism pubmed doi rcsb
source organism	Tritrichomonas foetus
total genus	111
structure length	344
sequence length	482
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2002-08-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1mewA00

4OT7A 4HNUA 1HUVA 2F84A 3P5ZA 3MMTA 4N4QA 2ZYFA 4DF1A 3EXRA 2NX9A 2VFIA 1SW3A 1VJIA 3E49A 3QMSA 1RD5A 5BNKA 3MYOA 4JY8A 4UUIA 1ML1A 3T55A 3TSMA 2BTMA 3EX3A 4JR5A 4WOZA 3ATYA 4JTUA 3ELFA 2C3ZA 4OWGA 3G1YA 3JS3A 3SIZA 3GZ3A 4JYEA 3KRSA 1YXYA 1X1OA 4K7YA 2CZFA 3W1QA 1SR9A 1D3GA 3N2MA 5LNVA 1T0OA 4JX5A 4K7VA 3TQVA 1JUBA 1QPQA 3W7NA 2GVLA 3UPBA 3QMTA 2NXIA 1WQ5A 4PC8A 4MFEA 1K03A 1HO4A 3QW4B 4N6FA 4NNAA 3W7GA 4O17A 3C61A 4ADTA 5BMWA 4ORIA 2B7QA 3NO5A 2TMDA 3QC3A 2DP3A 1GZGA 3M1ZA 3SR7A 3FYPA 3GNNA 1QDSA 2W0UA 2RDTA 3I7QA 2E1DA 3M47A 5DXYA 2NUYA 3S5ZA 5HR7A 3STEA 3M7WA 1H7WA 3W75A 3RLUA 4MLJA 3EX1A 1LOLA 3C2FA 3U8GA 4QAIA 6TIMA 1N7KA 2H8XA 1YPFA 1JVNA 2VFHA 1LBLA 2DZTA 3QSRA 1TRDA 1KFBA 2Y7DA 3W76A 1DQWA 2QUTA 5D33A 1DQXA 3FIGA 4ML9A 4B5NA 4N02A 1AL8A 3RU6A 5FF0A 1MEHA 3O06A 5AC6A 3N3MA 2YYTA 3LBMA 4JIQA 1O5KA 4FIQA 2BZNA 3CC1A 2ZTKA 3TXVA 3S1VA 3BG5A 3PULA 4KWWA 4BWLA 4MJMA 3WJYA 4DEFA 3DFQA 5IM51 3LERA 2CU0A 3QYQA 1LP6A 1KM4A 4D2JA 3KVJA 4Y8FA 4NUWA 3CM4A 1DHPA 2Y63A 4UCGA 2CLEA 3W2NA 5DY2A 3AJXA 3UY8A 3OVRA 1DBTA 2QCNA 3HO8A 4CNOA 3HG3A 1TV5A 5HNRA 3GR7A 4UR7A 2WNZA 3IV3A 3MW7A 3EWBX 3C4UA 4UNLA 1FWNA 1S5WA 4A29A 2QCDB 5DCBA 2DZWA 5HJLA 3S42A 3PM6A 2Y7FA 3LCWA 2G95A 1FCQA 1F7BA 4IXXA 3TX9A 2Y85A 1GG0A 2YFOA 3L2IA 2WJZA 4LS1A 5G1YA 3QFEA 3P8JA 1LORA 1FUYA 3LTYA 3W73A 1T96A 3TC7A 3NZ1A 3W84A 3WK0A 3BW4A 3HGJA 3STFA 3VKJA 3WK1A 4JTIA 3LXCA 1OFEA 2A4AA 1DORA 3T78A 4GUJA 4KFPA 1TPUA 3S0CA 1GQNA 3NA8A 1BWKA 3L5LA 5KITA 3W1UA 3IIZA 5LGXA 3GX9A 4M5PA 3I7SA 3L0GA 2Q3RA 1P5BA 4EIVA 3BVJA 3UZJA 1XBYA 1TJRA 3TNOA 4CLMA 1P1XA 4DELA 2NWSA 3B05A 2WSQA 3GR8A 2QAFA 1D3HA 3M16A 3N73A 4JX4A 3MI6A 3S9YA 1GOXA 3S1XA 3HGOA 1AW2A 1EWEA 5F1UA 4O1DA 5G4EA 2DZUA 2WOQA 4O53A 1VLIA 1SO5A 4L4LA 4Y6GA 1WX0A 1LRQA 3LCGA 3W7IA 5FEWA 5CZ0A 2V2CA 5CZSA 3W7KA 4UTIA 4IOTA 1PV8A 5AHNA 1O5XA 2E09A 4XZ9A 2QUVA 3NL6A 4NXSA 3BG9A 3O07A 3UD6A 4S2BA 2QCGA 2Y61A 4QSHA 1DJQA 3SECA 3HB9A 1K02A 1OFRA 1MSSA 1IXOA 3M41A 5A5WA 4FEZA 2B4GA 3NL3A 4RZ4A 1KM2A 1VGAA 1TPH1 1OF8A 3T44A 4AB4A 2V8ZA 2X30A 4BF9A 1QAPA 3OEXA 2CLHA 3CIWA 3NQCA 4YL2A 1TPWA 2ZRXA 3GNDA 3L21A 4FNPA 4WXYA 1GPWA 3QJAA 1B4EA 3SGZA 5D32A 4A2SA 1KTCA 1ICSA 1FWRA 5G2WA 1XM3A 4WZHA 4OQVA 2J9ZA 1D9EA 4AH7A 4AHPA 1QOQA 3F4WA 3ZFHA 3HG5A 5EBUA 3TE9A 2QCDA 1GVRA 2EAWA 3IGXA 2E5DA 3QQ1A 3B03A 1G4TA 2HS6A 2FFCA 2JKPA 5LNRA 3BLFA 1GVQA 5G4WA 2YPIA 3G8EA 3THAA 4LV4A 2CZEA 3LRMA 3QMRA 2ATMA 5FF3A 5CSRA 4IMDA 4KWVA 3N14A 5FESA 4YCPA 1H60A 4LRTA 1XBZA 1CX9A 3DXIA 3PUOA 4QJ1A 4NJIA 4NVTA 1GYNA 1I2RA 1X6UA 2QCLA 3W1XA 1OABA 1R47A 5TQLA 4JTSA 4UC5A 3W1RA 2DZXA 3CT7A 3W71A 3LXAA 3TA6A 3HPSA 3GVGA 3IVUA 3LHYA 5SWUA 4LVGA 5KMYA 2PE4A 3LLFA 1SPQA 1JCJA 3N34A 1EP3A 1VCFA 3R89A 1YXDA 3LI1A 4UIOA 1Q6RA 1UUOA 2XFWA 4ZVJA 2JGQA 4N9DA 5HULA 4Y96A 3QH2A 1Q3NA 3W2LA 3CLMA 1WXJA 1F73A 3E0IA 4IWWA 3PVFA 2NXGA 2FPTA 4NJKA 3B8DA 1EUAA 1PVNA 2YX0A 3WJWA 2YZRA 3O6DA 5I3JA 4O57A 2W79A 4ZZ9A 1V7YA 1H51A 5F4XA 2PC4A 1QO2A 4H6KA 4HHPA 1Y0EA 2VFFA 4O54A 1SZFA 2E6FA 5AN7A 3W74A 2V9DA 4LC8A 2E5CA 3LHUA 5D03A 1KM6A 2ZRUA 1ZJIA 4O11A 1YXCA 3SY5A 5CPLA 5LHEA 4PH6A 3PUEA 4O12A 1Q6OA 1TCDA 5G1TA 3TAOA 1GTEA 3O6CA 2XN2A 1GEQA 4AWSA 1JRBA 1RQEA 2QEZA 4CQ8A 4PODA 1TV8A 1SO6A 2DJLA 3RLVA 3O63A 4MPQA 1KBJA 4O13A 1AW1A 5J5RA 2GQAA 1Z42A 5G2IA 2V5BA 1VPXA 3FS2A 3O6YX 3NPUA 4Q4KA 4CCDA 5AHLA 1LOSA 1QOPA 4CNNA 3BG3A 2ZZ6A 3GB6A 1EUNA 2ABAA 3A5VA 1SSGA 3TJXA 1R2RA 3W1LA 4UTTC 4AXKA 3C2RA 2A85A 2B7PA 5BOOA 2ZRWA 1NVMA 1TPEA 4E2BA 1UJPA 1VC4A 1EWDA 1F2JA 3IEBA 3HGSA 3B0VC 4NNCA 4O1BA 4PEKA 3SFKA 4EF9A 4LT9A 3BPWA 2CLFA 5K2ZA 4EVZA 3TK7A 3Q94A 1H1ZA 1K7XA 4UMCA 2H90A 1Q45A 1KFJA 1SSDA 1QNVA 2I1OA 2VXNA 4WX2A 4TU1A 3P80A 3MP3A 3LHVA 1G4SA 3KVKA 3SGUA 5DXXA 1EB3A 1OF6A 5EPDA 4KFOA 4Y90A 3MBFA 4UTJA 4LNYA 2A2IA 1ZY9A 4FB7A 3HQ1A 5EA9A 1MEIA 1TPDA 3ABOA 3A5FA 5AHIA 4DO6A 3IGSA 3HGRA 5IBXC 2CW6A 2W6RA 4FX7A 1KLYA 4BI6A 1ICPA 3MBDA 3G3MA 4QIUA 1RQHA 4ZQPA 1W3IA 1SO4A 4A21A 3GLCA 3A24A 4JTEA 3L67A 1KFCA 4Z1DA 3NG3A 4HKPA 3MP5A 4CCCA 1FBAA 2JBMA 1FDJA 4R53A 4RLIA 1A53A 3EWXA 3TMQA 4LWWA 3MJYA 3GDMA 3W1PA 5G5IA 4LS2A 4O0KA 1B4KA 3CIXA 1KTNA 1H61A 1NSJA 3HPXA 3YPIA 3JR2A 1X7FA 1H63A 2E77A 2ZCGA 1NFBA 1M7OA 3M44A 3NQ6A 4OGZA 1SW7A 4O50A 3NVTA 4TX9A 3LHZA 5D38A 4P2VA 2R91A 1XBVA 3VE7A 1FXPA 1HFBA 3BLIA 2B0MA 3DBPA 2X1RA 4LU0A 5H91A 3NQVA 1G4EA 3THQA 1FWWA 2GVJA 4WY0F 4UFKA 2P1FA 1EX5A 1W3TA 1S3HA 3E02A 1W5PA 4M6VA 3M5XA 4QITA 2NLIA 1ZNNA 1ZCOA 3LHTA 4GBUA 5FF7A 5C55A 4FNQA 4MVAA 2ABBA 5I3FA 5CSSA 3OVPA 2H6RA 1SQ7A 3MHFA 3NQDA 4IGHA 3P60A 3I6RA 3UWZA 1B9BA 1MEWA 3NM1A 3CTLA 3ZWSA 1XBXA 1JUKA 1XFBA 1JR1A 2E6AA 2YW3A 4NJHA 4CQ9A 1FCBA 4FNRA 2LLEA 2P0OA 1W8SA 4UMAA 3LM7A 4DBDA 3TU9A 2X16A 3W07A 4WD0A 1KM5A 1KV8A 5K7JA 5D37A 3DKLA 3KX6A 4A2RA 1FWTA 1KV5A 4GJ1A 2Q3OA 5I3IA 2X1TA 3QPZA 1H7NA 2Z6IA 3G1VA 4K8HA 5EL1A 4MKNA 1NEYA 1UBSA 5HUOA 1P4CA 2FDSA 1VS1A 3S6DA 3GAYA 1PCKA 1OFPA 3G0UA 3IVSA 1WBJA 4NZFA 4FXRA 2EF9A 2RKXA 4K6AA 4JXCA 1Q6QA 3KVMA 5U4NA 3W7MA 5DCEA 1VYRA 2WKJA 3RF9A 3N19B 1F6KA 1BTMA 3NL2A 2WNNA 2Y62A 4YXGA 4OHQA 3EX2A 5I3GA 3B06A 5D2YA 4ZL1A 2UV8G 4R34A 5F2LA 1J4EA 1LLZA 1ZAHA 5D2TA 1AK5A 3KRUA 1OFBA 1RR2A 3NM3A 4LVFA 3FA5A 4N9EA 3TH6A 3W83A 4HIBA 2BLEA 4UTMA 4TR9A 3CB8A 3RMJA 4OV4A 2ISVA 4UTWA 2E6DA 4BR1A 4AAJA 3OG3A 3W88A 2OT1A 3D0CA 3ANYA 3BW3A 2ALDA 1TYGA 2RDUA 2JKEA 1ZAIA 4N9BA 2B7NA 4Q33A 3W2KA 3C2OA 5BRBA 3C8FA 4K38A 4AVFA 1RPXA 4Z0JA 2VFEA 2E5BA 5TIMA 4LV9A 3PB2A 2A6LA 5LNWA 1GVOA 3CHVA 4X2RA 3R12A 2G97A 4UTKA 5DBTA 1QWGA 1IIHA 4HSOA 3QQ0A 4MFDA 3G8RA 3ZS4A 4TMBA 1PCWA 2PRLA 3B0UX 3QZEA 2TSYA 3HF3A 2QUUA 3LCHA 4IMEA 3QM3A 1JCLA 5CGQA 1TPFA 3GKAA 4BWLC 3DKJA 2BX7A 4NJGA 4PL2A 1A50A 2EPHA 4JICA 3PC0A 3DI1A 2FLIA 5KSWA 4RV8A 3PR2A 3MHUA 1GJPA 4ZQMA 3TJLA 3EXSA 3IIXA 1OK6A 3TQKA 5CZJA 1MO0A 1K7FA 4HNTA 3TR2A 2G96A 1OVDA 4MYAA 1WYIA 3C3NA 3HOJA 3GAKA 1IIGA 2YCEA 4XQ6A 1WOBA 1WAUA 2EKCA 1L9WA 1CI1A 5I3KA 4NU7A 1TTJA 2VEKA 1FX6A 1LBMA 5FI8A 1EA0A 1G69A 1CW2A 2FPYA 3C0JA 1N55A 1I2OA 2VOMA 4NNBA 2VEPA 4G1KA 5DY3A 1SO3A 3DFNA 1TTIA 3LHWA 1T99A 3UWQA 2TRSA 3S5OA 2TYSA 3BGJA 1GWJA 4IMCA 2Q8LA 2KZHA 1IXQA 1W3NA 3L5AA 3QEZA 4JDBA 1YDOA 4H3DA 5D2WA 3STCA 4A22A 8TIMA 1KLZA 3W6YA 3PSVA 2YW4A 4WJEA 5AYXA 3W7HA 3C6CA 1SW0A 2YGYA 1YLVA 3LCFA 3UNDA 2RH9A 3T40A 2C15A 1KTBA 2CLMA 3VI2A 5CPMA 3LTSA 4O15A 3IGUA 3KRZA 4AWTA 1C9DA 3DZ1A 1G7UA 2CLOA 2ZQ0A 4X22A 5T26A 3K30A 1XI3A 2DORA 5LZLA 4GE8A 3TAKA 4MJZA 2VFGA 5DELA 3PAJA 3MYPA 4LRSA 1TRIA 4ZQNA 5D2XA 1G67A 5G2HA 1G4PA 4NJJA 1VH7A 3OHIA 4GUIA 2GVGA 3LTPA 3W23A 2H3DA 3W72A 3PUDA 3P82A 1W37A 5KTLA 4AHOA 3KOFA 2C16A 3LI0A 3U2OA 1BEUA 3S5NA 4JIPA 5E1QA 1Z44A 1O4UA 4FNSA 2GPTA 3EB2A 1NAL1 4MZYA 1SFJA 2R8WA 1JCMP 3HJZA 1R46A 4RZ6A 2EGZA 3TW6A 1FWSA 2I14A 5DCDA 3WK2A 4FNTA 1JJKA 4UTHA 3LCIA 1E51A 4O52A 2A7NA 3W7QA 4R7JA 5HWMA 5AC8A 4MZ8A 1SFLA 4O0ZA 3PBYA 4QM1A 4DBEA 4Z1CA 1QPOA 1FDYA 4RJEA 4JYDA 5LSMA 3TROA 3G24A 1OFDA 1OJXA 2OMAA 1VCVA 4GFSA 1SUXA 4N4PA 1WV2A 4IPJA 3WJSA 1HO1A 1RZMA 1LOQA 2RHGA 2WQPA 4PL1A 5FEZA 1KFLA 1B57A 4R33A 4O14A 1W5QA 1VRDA 3PG9A 1F5ZA 3LCLA 4FIRA 3EX6A 2Y6ZA 1H7OA 3EWWA 4GNJA 2R14A 2AGKA 2CWNA 3W2UA 3M9YA 3G1SA 1QMLA 1GG1A 1BKSA 5K9CA 2FB3A 4JNMA 3GDLA 3M43A 5EYWA 5LNSA 4IPIA 2GQ9A 1LCOA 4QISA 4ADUA 2DJXA 2J24A 3ABRA 1TTPA 3UQNA 2C1HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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