1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, dna binding protein
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
4NDLA 4A69C 4XKNA 4W1UA 1MXYA 4BDRA 2JK3A 4LVQA 2L7MP 1ELJA 2UVHA 3K6VA 2AYSA 5FHOA 1XVYA 4M3GA 3BQYA 3IV5A 4EDPA 2MW8A 4TQUQ 4MFEA 2ONRA 2UXAA 4ZEIA 1UIVA 3DLNA 4ONYA 2O1MA 2DTZA 2D21A 4H8IA 3W9WA 2WKYA 2ZYOA 3WAEA 1MG1A 5J1DA 4R74A 1NK3P 4LZ8A 2CJJA 2ME0A 1LSTA 2I3WA 2XXIA 2P1SA 2L7ZA 3TQWA 3TCFA 3LSFB 4U4SA 1NTCA 2R6GE 4ZZEA 2WV1A 3FISA 1Y1VJ 3U94A 1B0HA 2V93A 4IO2A 4A3EJ 2ONSA 2Y7RA 1G2HA 2DWIA 2H4IA 4BDOA 1JGGA 3V8XB 4LZ5A 1US5A 1B8IB 4C3HJ 3LBSA 3MAMA 4B1RA 1D3KA 4IHWA 2ZB9A 1MBKA 3BT9A 1LFIA 1H45A 3USDA 5IPAA 2O68A 3PMWA 3L1PA 4YKJA 1HOMA 2F7BA 1ANFA 3FK7A 4FATA 3TQLA 4PFYA 1Y3NA 1Y1MA 1QVSA 3EF7A 4FJPA 3BTCA 4MLQA 9ANTA 2F8DA 2N8GA 2DWJA 1JNFA 3K6UA 1RPWA 1LB9A 4BBRJ 1MY0A 2L0KA 5AA2D 2NVTJ 1MH3A 4G68A 1B1HA 3JRBA 5CC2A 3S2HJ 4JBZA 3DCFA 4U1OA 3BKIB 3T9HB 3HHGA 4DYRA 4DE8A 5DTDA 3LUYA 1DU0A 2YLNA 4KQPA 5GPCA 2IBDA 1JJ8C 5DS9A 3RLFE 2RC8A 2O84X 3SJMA 4I76A 5M5XJ 4CYCA 2A5TB 4XIDA 1BW5A 4LATA 4JX6A 4F2QA 3UKGA 4LZ7A 4QFKA 5K7FA 1HDDC 4ZEBA 3BFTA 1IRZA 1TXFA 2R71A 2E2JJ 2JA8J 5C4JJ 2ZYMA 2OZZA 1OIBA 2I10A 4P0IA 4GLIA 5EG0A 1SW4A 2IEKA 3RZDJ 3RUMA 3GXAA 1N04A 4DCXA 1P1UA 1IXHA 2IA4A 3KJ7A 3SEWA 4HNVA 4A3CJ 1B3LA 5FKLA 1RKWA 5GPAA 1JVYA 4LOCA 4Q5TA 3T9VA 3PPPA 4P11A 1MBHA 3HPIA 1AU7A 1URGA 4IB2A 3JRGA 5E3LA 4XXUA 2GHAA 1GVCA 1Y20A 1QPIA 1II5A 3T93B 3RQTA 1GV5A 1OVBA 1FQCA 1POTA 4F2OA 3M3LA 4FISA 5CMMA 3C32A 3S16J 1XOCA 1BJZA 1FQAA 3BQZA 3JRHA 1GTKA 3A02A 3FVNA 3BBRA 3TTLA 4UACA 1WPKA 4LA9A 3QYTA 3NAUA 3O6GA 3IH2A 5IP7J 1Z7ME 5DEXA 3O66A 4RY1A 1NMUA 4C2MJ 2DMUA 3FXRA 3Q0WA 3T22A 2DS9A 3H7MA 2L7FP 5IAIA 1ETQA 1Y9UA 4YB7A 1QUKA 1ETKA 3GTPJ 2OJTA 4QFNA 3R7XA 5EGOA 1EU8A 1HSLA 1M5DA 1N3XA 3K1PA 3N26A 1P7IA 2O9LA 3RNNA 2F5XA 2DE4A 3C35A 1F43A 4MF3A 3G1MA 1A54A 2FYIA 2O7UA 3GTKJ 4ZEFA 3SKPA 3Q26A 2RINA 4JSDA 3SETA 1A7LA 5CMKA 4IEJA 4NE4A 3U93A 4KYEA 1B46A 3TELA 2F34A 1B32A 3Q0UA 3ZQFA 3OXNA 1JUPA 2R5YA 1UTHB 1WODA 4U4XA 3VLUA 2DA4A 3G3JA 1SYHA 1MSEC 3PV0E 3S14J 4DW6A 5IYCJ 1YTVA 1F9BA 4G68B 4BLAA 1ZR4A 1HDPA 3UP9A 3GTGJ 2TCTA 5AE4A 3FASA 1W0UA 4F19A 4TOZA 5E3NA 3SERA 2COBA 1AHDP 1LAFE 4LP2B 4R2FA 2E1SA 4HW8A 3OSFA 1X2NA 1JQFA 2HQ0A 2A5SA 3HGGA 4IGRA 4CYCB 2QS4A 3TPAA 3FZVA 3OO8A 3KJTA 2DA2A 4PE5B 2XXQA 2LLKA 3M3FA 3Q29A 3N94A 3MW0A 1SVXB 5ICQA 4JX4A 3QPSA 5I56A 4A3DJ 3QXMA 1USYE 1MXWA 3K0VA 3LR1A 3PPOA 3TAJA 3FJMA 4Y52J 5EG0B 2Y7WA 3W15C 1ZMGA 2WB1N 1AL3A 3PUVE 4FAJA 2H1KA 1MY3A 3V5AA 2XB0X 4JB7A 1FQFA 2CMOA 4YB6A 1ATGA 3HOWJ 3KN3A 4F31B 3BG5A 1EZOA 1VFEA 3CI8A 4ND9A 2HFBA 3JV9A 1FTJA 3O8HA 1R9TJ 3K02A 1MXXA 2ZXTA 4DDDA 5L9MA 2EZLA 4X9TA 4NF8A 4HTGA 1P1NA 4G77A 3Q3SA 3HM5A 1MQGA 1B0LA 2Z8DA 1MBEA 4YU0A 5IYBJ 2I4BA 2DA1A 2Z8EA 4ZE8A 2DQVA 2QL3A 3E7LA 1MQHA 1ZTYA 4QF9A 1UMQA 5DEXB 3A03A 3BTIA 1JT0A 1A40A 3Q0VA 5F27A 1MS7A 3O9PA 2V84A 3UORA 1FTZA 3FJGA 4KD5A 3EPEA 2GLOA 2Q88A 4OETA 4ELQA 4LQ2A 3C9HA 1POY1 3K2DA 4V2GA 4A93J 1TWYA 2K40A 3S15J 5HBCA 2PT1A 1O63A 4IHXA 4QFOA 3CSBA 2IAIA 1B2HA 3FVOA 2EZHA 3JRDA 5L9SA 4E0XA 1PEBA 1QRYA 4DYQA 1LAHE 2LK2A 2R7ZJ 1H89C 4R9GA 4Z7EA 1W0TA 2O8KA 4WXJA 4Z0IA 4QSHA 3O2AA 4GFRA 2R5YB 1YRNA 3VXBA 3RN8A 1XC5A 4HCWA 2P0SA 2NS7A 5K7ZA 1MY2A 3H6VA 3SDFA 1EZPA 4ABZA 1XS9A 3O6HA 3BR3A 5EDNA 1B6HA 2XD3A 3HOYJ 1FTLA 1JKQC 2D5WA 3HGYA 1DTZA 3TDJA 5CBSA 3KFMA 3THIA 2XD2A 3GLBA 4YKKA 1I6QA 1MXVA 5ISUA 2RCBA 3FGSA 1LFHA 4GOTA 3K1NA 5F7VA 2XXVA 1NNKA 3HN0A 1SW1A 2FJ1A 1URSA 5F0FA 1OLAA 3FXQA 4DIGA 5FKMA 4Q30B 5FLVA 3K01A 5HM4B 4TLMB 3BG9A 4YKIA 3IB1A 2XX9A 4RDUA 1TWGJ 1QUIA 3S1NJ 1XC1A 4ISUA 4ELPA 5I56B 1RESA 3FIWA 3KG2A 1XVXA 4PETA 4F3SA 4IY5A 2HOTA 2DXRA 2XB5A 2AIXA 4C3JJ 1VR5A 3DP4A 3ZKLA 3ONMA 3E13X 1H76A 2QF7A 3C34A 2PVUA 3CCYA 2BJJX 3S9EA 4HS7A 2ELKA 2DMPA 3K2AA 1POGA 4QHQA 5TP9B 5C3EJ 1IGNA 1FW0A 3MP1A 4NF8B 2CRGA 4U1ZA 1A99A 3B6WA 1IZ1A 1MPBA 3ZKKA 2X6OA 3W6VA 2UVIA 2XPUA 3TKDA 3R26A 3IJXB 1MSFC 2RC9A 1VNDA 1WVJA 4GXSB 4X6AJ 4FIMA 3RY3A 2Y2ZA 2DVZA 3R6UA 3MP6A 4ESWA 3A01B 2Y7IA 1FQEA 3Q27A 3SFIA 1QULA 1WGXA 1NNPA 5DVJA 1ETYA 3G1LA 3LSRA 3PGFA 3IL1B 4XICA 4C1UA 1JW5A 4KCDA 4JWYA 3MVXA 4GF8A 4KR5A 2XXTA 3PPQA 1AOVA 3GZGA 2PMZN 3IH4A 1OVTA 1FTOA 4EQ7A 4BDQA 5FHNA 5C44J 3O97A 1OQGA 1Y4TA 1DPEA 1X2MA 3ZQIA 5EYFA 3S1MJ 1TT1A 3UN6A 4D7MA 2UYEA 3MQ9A 1BIYA 5K7HA 1YRNB 3TTMA 1L5TA 2QS3A 2B3FA 5ELVA 1PB8A 2NUVA 3RTFB 1S9TA 1XT8A 4JYKA 1ZR2A 2XXWA 3VVFA 4I6ZA 2QS2A 2DVCA 3KN7A 5HODA 3HBLA 4K3FA 1LCTA 2O6AA 3H6TA 1LBCA 1S7EA 3PD8A 4GL8A 5M5YJ 1QKBA 4DXCA 2B3BA 4J19A 3RGYA 3BR1A 1FTMA 5ITOA 1D9VA 4BDMA 3IOWA 4JX5A 4F29A 1SDXA 5LOMA 4DCYA 2R93J 5H8SA 4D5CA 1GR2A 3BG3A 4OESA 1PB9A 3C2BA 3OIOA 2HAUA 1UTHA 1QUJA 2FA7A 4V2FA 3FXUA 2KLFA 2XGCA 1URDA 3PUYE 3SEYA 3PPRA 1Z0XA 3S9MC 2DA6A 2H98A 4XK4A 4H5FA 1TWFJ 3JRFA 1GVDA 2VKVA 4F1UA 2Q2AA 5CRYA 2Q2CA 2THIA 1I6BA 3TEDA 4JP0A 4OMBA 5ICTA 1UQWA 1N7XA 5I57B 2TRTA 3ZS6A 3ZSFA 3WAFA 4KHZE 4KFQA 3K1MA 1YAEA 1NL5A 4IO5A 2V25A 3BFUA 4BBSJ 5H8FB 3GTJJ 1Y3PA 4JDFA 1MXZA 3K6WA 5H8NA 3H6WA 4OERA 1MM6A 3K6XA 1LGBC 1N84A 3HKZN 5EYRA 3CRBA 1LFUP 4JXIA 1Q1KA 2HOSA 1U8BA 1MPCA 1MXUA 2PBWA 5DYHA 1BKAA 3KOTA 5AA2A 2JWTA 2OCUA 5KDTA 1HSEA 4ZZAA 2R9JA 5IP6A 2YUSA 2M0CA 1JEVA 1MY4A 1TFDA 1GV8A 5FHMA 4O3BA 2HCAA 4KPTA 1ZTRA 3L6GA 1PBQA 2DXYA 2NVUB 2ECCA 2HEUA 2REGA 1HLVA 3QAXA 3C36A 1E3OC 4RYAA 3W9VA 5CMBA 2XRLA 3TTNA 4OFLA 4THIA 4NF5A 2XXRA 1I50J 4MFIA 4IO3A 4PFUA 1B4ZA 1B40A 4OZ9A 1SD3A 1NNFA 2G0EA 2E19A 3MZ1A 4R6HA 5DVIA 2EZIA 4OQOA 2XXPA 3UA8A 3F11A 2M34A 1MDP1 2XXYA 3PD9A 2NWJA 4GRKA 5F1QA 4H0WA 3T66A 3U72A 1LE8A 3DP8A 2UVGA 2VD2A 5CBRA 1XG1A 2FQ4A 4A3LJ 3IOTA 3SEUA 1Y4CA 2XHDA 4IHYA 3V89B 4BXXJ 2Y9ZA 1AH5A 2F7CA 4ELOA 5IP9J 1LB8A 2VKEA 4NMYA 4PP0A 3BTJA 4WEPA 3KGCA 2Q9TA 1VFCA 3MUQA 2YU9J 2NOGA 4D5FA 2XPWA 2EH3A 4IGTA 4XKRA 4ZDMA 3Q25A 1WDNA 4H6DA 4NWCA 2HXOA 2DA7A 5EHSA 2Y31A 4C1TA 4LONB 4Y7NJ 3CG3A 5AA4A 3VVEA 3LSLA 4AUXA 4L5EA 3CVGA 1T0KA 3OMBA 1B58A 2I3VA 4FE7A 4F3PA 4EEFG 1H8AC 3G3FA 1Y3QA 4HCYA 1Z7NE 1I6AA 3DEWA 4M6VA 1LFGA 3D4CA 2Y7PA 5L9OA 5EZHA 5KCJA 3QIMA 2MGQA 3VFJA 1H3DA 1PC3A 3VLWA 4GFBA 1MQDA 4C0RA 4R72A 1FIPA 4OYVA 5H8NB 4A3GJ 1A8FA 2OF7A 1IXGA 1P1OA 2V3QA 1AIVA 4AB6A 3RPWA 4R9FA 1B05A 3OSRA 2NOOA 2H8RA 1NKXA 4A3MJ 2E1OA 3D4GA 3U92A 2OWSA 1YPNA 4EQBA 1D5YA 5AA2B 2DOJA 5KDTB 4OHNA 1IDZA 2H9BA 4LQ5A 4F1YA 3JRIA 5M3FJ 1DSNA 2EQRA 1OMPA 1TWAJ 2F78A 1RYOA 4MLOA 1RKTA 2ZYKA 5TP9A 5A5XA 4KI0E 3VVDA 3SEXA 2ONKE 2M9HA 3FUZA 2NVYJ 1ZK8A 1B7ZA 4A3IJ 3U1OA 3QSLA 3HSTA 3MZ9A 3VLVA 4EF2A 3SESA 2HYJA 2O7OA 2XXUA 2CUFA 4NF5B 4FE8A 4XTCQ 2Q8JA 4PFTA 2QMWA 4GXAA 3P7IA 3BR6A 1NNTA 3HOXJ 3CFLA 1B3HA 4OEVA 3T96B 3S4UA 2XSDC 3T9UA 4A3BJ 4DZJA 3OSGA 3A01A 4RJZA 4DZ1A 3I3VA 2NVXJ 3MVWA 4EUOA 4R2BA 4X1EA 3JREA 5JEIA 2RKMA 3SDGA 3UK4A 1B4HA 1LE8B 3C4MA 4G8HA 3S2VA 3PUZE 5F04A 2MG4A 3FV1A 5M2VA 2YJPA 2PX1A 3B6TA 2XGDA 1ZU0A 2V3TA 3KBRA 1HSJA 4ZECA 5F0CA 3MVZA 1H88C 1OJLA 1K61A 3TCGA 3A09A 4ZE9A 5I58A 3GTLJ 3OD7A 4I62A 4O3CA 1UTBA 1B51A 1XHYA 3IJOB 1MM7A 3KSJA 1R1NA 5I2NA 1Q1VA 2HZKA 3QUFA 1PUFA 1PDAA 3QUJA 4OTEA 3G3KA 2D3IA 1WH5A 1GT0C 2FX0A 1U9NA 1SI1A 2ZMBA 3TCHA 2IEEA 3IX1A 2VHAA 1HCRA 4N07A 3LSGA 2VUMJ 1GV2A 3K7AJ 5AA4B 2ESNA 3SEVA 4G8MA 1ETVA 3BR5A 4C3IJ 1ZIUA 3CR9A 4D7NA 1FTTA 2XX8A 4M3EA 3LC8A 3TYHA 3HDDA 1MBGA 1ZKBA 2DN0A 3K00A 3LSWA 2AL5A 3TP3A 2OLBA 5KCJB 4AYBN 2EZKA 1VSOA 3PPNA 1MNMC 5E3OA 1Y1WJ 4EF1A 2QPQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3FMR A;  2CUE A;  4R73 A;  3EHU A;  4Q0C A;  2X7P A;  3RT8 A;  1FY7 A;  4FHT A;  3F3X A;  3MBP A;  1YYZ A;  2FNP A;  2HI3 A;  2P6T A;  1QJM A;  2W7Y A;  3ROU A;  4BXU A;  5KZT A;  2DK8 A;  2HOA A;  2GFE A;  1P1Q A;  2ZNZ A;  2R0Q C;  2PFZ A;  4X48 A;  1V5E A;  4BAC A;  3IAZ A;  4H1X A;  1Z7L A;  1D4N A;  4U7D A;  3VV5 A;  1LNW A;  2E5Z A;  5FO5 A;  2OA4 A;  2E2I J;  4BNC A;  3WHB A;  2AO9 A;  1BM9 A;  2H5Y A;  1KGS A;  4FTH A;  3K4U A;  5TPA B;  3S9N C;  2CU7 A;  3E5X A;  2IS1 A;  1GDT A;  1AMF A;  4O7M A;  3F6O A;  4E7Z A;  5E8I A;  1KZ8 A;  2L5Q A;  2RF1 A;  5GP9 A;  3J7Y J;  2KJB A;  3OYE A;  4IZZ A;  3B7D A;  2L01 A;  1NV3 A;  4GVO A;  5DT6 A;  1U5T B;  2DMT A;  4UVC A;  3K70 D;  3IO4 A;  4IO7 A;  5J16 A;  1R6Z A;  2X26 A;  2XIG A;  1BN5 A;  5KHD A;  1M5B A;  4H67 A;  2GH9 A;  2ZME B;  4YMB A;  4N81 A;  3LSP A;  1GHC A;  4XKP A;  3LSM A;  2CFX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4NDL A;  4A69 C;  4XKN A;  4W1U A;  1MXY A;  4BDR A;  2JK3 A;  4LVQ A;  2L7M P;  1ELJ A;  2UVH A;  3K6V A;  2AYS A;  5FHO A;  1XVY A;  4M3G A;  3BQY A;  3IV5 A;  4EDP A;  2MW8 A;  4TQU Q;  4MFE A;  2ONR A;  2UXA A;  4ZEI A;  1UIV A;  3DLN A;  4ONY A;  2O1M A;  2DTZ A;  2D21 A;  4H8I A;  3W9W A;  2WKY A;  2ZYO A;  3WAE A;  1MG1 A;  5J1D A;  4R74 A;  1NK3 P;  4LZ8 A;  2CJJ A;  2ME0 A;  1LST A;  2I3W A;  2XXI A;  2P1S A;  2L7Z A;  3TQW A;  3TCF A;  3LSF B;  4U4S A;  1NTC A;  2R6G E;  4ZZE A;  2WV1 A;  3FIS A;  1Y1V J;  3U94 A;  1B0H A;  2V93 A;  4IO2 A;  4A3E J;  2ONS A;  2Y7R A;  1G2H A;  2DWI A;  2H4I A;  4BDO A;  1JGG A;  3V8X B;  4LZ5 A;  1US5 A;  1B8I B;  4C3H J;  3LBS A;  3MAM A;  4B1R A;  1D3K A;  4IHW A;  2ZB9 A;  1MBK A;  3BT9 A;  1LFI A;  1H45 A;  3USD A;  5IPA A;  2O68 A;  3PMW A;  3L1P A;  4YKJ A;  1HOM A;  2F7B A;  1ANF A;  3FK7 A;  4FAT A;  3TQL A;  4PFY A;  1Y3N A;  1Y1M A;  1QVS A;  3EF7 A;  4FJP A;  3BTC A;  4MLQ A;  9ANT A;  2F8D A;  2N8G A;  2DWJ A;  1JNF A;  3K6U A;  1RPW A; 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