1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, dna binding protein
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
1MH3A 4GOTA 3U93A 2PT2A 4KFQA 2O68A 1ETOA 3HBLA 5JTYB 1FTMA 3SEYA 5F1QA 4MBPA 2N8GA 2UXAA 3O9PA 1N04A 2XX7A 2HOAA 2JJ7A 1TWCJ 4YB7A 2L9RA 4G68B 5L9MA 3V5AA 3HGGA 4R9GA 2VHAA 1BKAA 2GLOA 4G8HA 2XXHA 3BR0A 4LP2B 1GTKA 2CZLA 4IHVA 4IO6A 1IUFA 3KJTA 5IYCJ 1B1XA 4KCDA 4NDLA 3SDFA 3GTPJ 5H8QB 2W7YA 2OWTA 2Y2ZA 2QSXA 3PUWE 1T56A 4JX4A 3HM5A 5DT6A 1IXCA 2CUEA 2YS9A 1LB8A 1N3XA 1UIUA 1IXHA 3FASA 4XKQA 1JUSA 3IR1A 1ZR2A 1LSTA 2E2JJ 4ZEFA 4A3KJ 3RN8A 2GH9A 2DA1A 2PMSA 4FE8A 3ZS6A 4A69C 4NE4A 3R6UA 1BIYA 1B7ZA 1NTCA 3BR2A 4R2FA 4ZE8A 1ETKA 3IB0A 3OO9A 5JLXA 3LSFB 2GM4A 4C1TA 1RYOA 4EQ9A 4H6DA 4EF2A 4FORA 1IGNA 2D5WA 4A3GJ 3USDA 3BR5A 4NMYA 1SBPA 1MXUA 3H6UA 1POY1 2HQ0A 4M1VA 4ZDMA 4NF6A 5C4JJ 5DYHA 1JW4A 3IX1A 3OXNA 1N3WA 1XC5A 1IITA 2LAOA 1JUMA 4A3DJ 1AL3A 2X48A 3KGCA 5CBRA 1U9NA 4OESA 1ETYA 5L8DA 5A5XB 2R9JA 4EQ7A 2D21A 4GXAA 3SEUA 1ETVA 4JXIA 2AHQA 4E0WA 4BDOA 2DA7A 3VVFA 4XKRA 2RC9A 4JWYA 4IY5A 4MLVA 1QVUA 2CRGA 2F7BA 4G4PA 4E0XA 2LP0A 2V3UA 3C31A 3MAMA 3S1QJ 5E3OA 5F27A 2ESNA 3K4UA 3MP1A 1OFCX 4TLLB 3OD7A 1M5DA 2O1LA 4P0GA 3T9UA 1IQ7A 4V2FA 2E2IJ 4QSHA 3OOUA 4U1ZA 3ZQHA 4YKJA 3QPLA 4JSDA 3L1PA 3O8HA 4GF8A 1DSNA 1NL5A 4JX5A 2REGA 4GL8A 4KR5A 4RPNA 1MQGA 2V3TA 1HSEA 1K83J 1ZTRA 5E3LA 1AOVA 5CC2A 1POGA 1JKRC 3S1RJ 2ZNUA 2ALUA 1VR5A 3FIWA 1H88C 3PMXA 4R72A 2R5ZB 2H98A 1I3QJ 3H06B 2OLBA 4GFBA 1E3OC 1ZMGA 4OEVA 2CQQA 4B1RA 2ZXTA 5EGOA 4MFDA 3H3GA 3UA8A 4G68C 1JETA 1P99A 1FW0A 2DJNA 2DA3A 3KOTA 3UIFA 2F7CA 1WPKA 2KT0A 2F5XA 3DM0A 3RZOJ 4R73A 5ISUA 4ELRA 3TTLA 2JA6J 3OSQA 5AA4A 4ZZEA 3U72A 2GBYA 3HOZJ 2QPQA 2P2AA 5J1YA 4A3IJ 2Y84A 2F97A 4IEJA 4M3GA 4BLAA 5K2XA 2ZYNA 3L6GA 3G1LA 1URSA 4HS7A 2OK2A 1ZTYA 1IRZA 2M0CA 2R5YB 5K7FA 4OMBA 3GLBA 1FTKA 3TTNA 2THIA 1JW5A 1PEBA 2PX1A 2QS2A 4FATA 3LSRA 3MPKA 4GL0A 3W9WA 2XB5A 1MQIA 3GTQJ 1IZ1A 2QS4A 3T9VA 1GVDA 1LAHE 2I4CA 3ZSFA 4BY7J 2XPUA 2L7ZA 3S14J 3BG5A 4IY6A 1US4A 2XXTA 4LZ5A 1KWHA 1RKWA 1HDDC 4BDNA 1D4NA 1P1OA 3NAUA 4OHNA 2RC8A 4RK9A 4R75A 1W0TA 4G77A 1ZKBA 2XXXA 3PU5A 4BY1J 5EYFA 4I1DA 4A3LJ 2XHDA 3TMGA 2MGQA 3FJ7A 3S1MJ 2H9BA 4DE8A 1N7WA 2QS3A 5EZGA 3M4OJ 3CSGA 1B52A 3E3KA 1IDZA 1R1NA 5JLWA 5EYRA 3FXUA 4ONYA 4F2QA 4R2BA 5F1JA 1LB9A 1MXYA 4QFOA 1JKPC 5KDTB 5L9SA 1A54A 3S2VA 1SYHA 1M5BA 1BA5A 1OQHA 4AB5A 1MBJA 1GV2A 1B3LA 4BDLA 1WVJA 4TQUQ 2A5TA 1VF9A 5JK4A 4RPOA 1IXGA 1MBFA 5EZHA 1MXZA 1P1WA 2AL5A 5ICQA 1B40A 2DOJA 4F31B 3SEXA 1I69A 4OWDA 1JKOC 2WV1A 1B4HA 2F7AA 5HM4B 1BL0A 3GBGA 4OTEA 1TXFA 1D3KA 4JBZA 2LR8A 4X1BA 5FTHA 2G93A 2XX8A 5EDNA 1DTGA 3ZQIA 1MDP1 3IL1B 1SANA 2CU7A 3DCFA 3K2AA 3H7MA 1BJZA 1MY2A 3OO8A 1B7UA 3JRIA 1DTZA 1IG7A 2G0EA 1AKHA 1CB6A 4QF9A 1H3DA 2NOOA 1ZBMA 1P1UA 1ENHA 5EGOB 1EZ9A 1LAGE 3IOUA 3VVDA 5IAIA 2Q9TA 4QFLA 3HHFA 1Y3NA 1HCRA 2RCAA 2OJTA 3JRHA 4KYDA 3SJMA 2QL3A 2VGQA 1MM7A 1WDNA 1SW2A 2QMXA 5AA4B 1RETA 3CVGA 2LY9A 1YAEA 3MJNA 3FK6A 3DLNA 3IAZA 1WODA 3KG2A 4IGRA 1MQDA 4IHWA 2F34A 3PPNA 4QSCA 4O3CA 4YMAA 5EG0B 4WKMA 3B6AA 5IP6A 1BP5A 3FJGA 2XGDA 4YB5A 2NVTJ 5FLMJ 3VLUA 3KSXA 1NK2P 3CSBA 4W97A 2HAUA 5I2KB 3OSFA 1RKTA 3HOWJ 1Y3QA 4MFEA 4ELOA 5K7HA 1H89C 2JK3A 4NF5A 4WEPA 4G8MA 3G3FA 3QK6A 3TODA 2AL4A 2XSDC 1JQFA 2RKMA 3KEIA 3HB9A 4P11A 4PFYA 5I2NA 1NNPA 3HGYA 5H8NA 3K2DA 2E0SA 1R9QA 1YPNA 4I76A 2PVUA 3A09A 3IH2A 1Q1VA 2PYYA 3Q29A 1R9LA 3T9HB 1USYH 4XK4A 4DLDA 5CRYA 1ETXA 1M5CA 2AYSA 1CE2A 3A01B 5BUUA 5J1UA 4NF4A 3Q26A 2TRTA 3PUYE 3WAEA 5H8FA 1H45A 4NEDA 1QUIA 2H4IA 3S4UA 4ZEKA 3BTLA 2OBGA 1L5TA 3CFZA 3ZQGA 2HFBA 1PC3A 3HOYJ 3BKIB 5DTDA 3CDLA 4Q5TA 3K0VA 4C3JJ 1EF4A 4K3FA 5ITPA 2H1KA 3Q25A 1FQBA 2XPVA 3KFMA 3B6CA 3QSLA 2A5TB 1NMUA 3L6HA 2DXYA 1QKAA 3OEKA 4BKXA 3K6XA 1QKBA 2HQ5A 3ZKKA 2O9LA 3S9LC 1NH7A 3K1MA 3K02A 4UUSA 1IV6A 3LBSA 3TQWA 3ILTB 1XOCA 3MZ1A 3CRBA 3LSGA 3O8GA 2QJEA 4DYQA 2P0SA 2RC7A 4F18A 3PD9A 2Y0SN 3W15C 1BW5A 2ANJA 3PPPA 4F39A 3IOVA 4BBSJ 2GHBA 2UYEA 4UA8A 4ZEDA 3S9EA 3GTKJ 2XXPA 2FNCA 1EU8A 5FLVA 4JP0A 1ANFA 3QUFA 1MM6A 4RY1A 2DVCA 5GPCA 1AKHB 1U8BA 5F0FA 4EUOA 1LFBA 2O69A 3HO7A 1SD3A 3IO4A 3CG3A 3TYHA 3N5LA 1ATGA 3OELA 4KYSA 5EHMA 5FHMA 3CCYA 3TTRA 3EF7A 5CI5A 1MY3A 1OVTA 4M3EA 3RKQA 2H5YA 4LQ5A 2DQVA 1MBEA 1OJLA 2R0QC 3CQZJ 1VFDA 4H67A 2ZNSA 3FXRA 1JTYA 4OFOA 2YLNA 3MW0A 3MVWA 2M8CA 4H65A 2DN0A 1HSLA 2DWAA 3RTFB 2NS8A 1BTJA 2NXOA 3H6VA 5BNGA 1GDTA 2VKVA 3RLFE 1B6HA 4XIGQ 4HTGA 2RAEA 4M3FA 5AA1A 2XXVA 3IJOB 1B51A 3TTMA 4YZZA 3G1OA 4F3BA 1LE8A 2M8GX 2FA7A 1OLCA 1DU6A 1H43A 3B7DA 1ZIUA 2I49A 2V25A 1JJ8C 4DXCA 1Q1KA 4C1UA 3IOWA 4NF5B 1RKMA 4M3DA 2O84X 3B6TA 4KQPA 2O7UA 1B3EA 4Q8RA 4GFRA 1J1NA 4YKIA 3R7XA 3FUZA 4IGTA 2RCBA 5H8NB 4POWA 3VLVA 3W6VA 1YRNA 2RF1A 4DCXA 1URDA 3M3YJ 3C4MA 2DMPA 2Y31A 1F43A 3HKZN 1K61A 3DP6A 1DPEA 3MQ9A 2R93J 4MIMA 1MXXA 4EDPA 1JT0A 5TPAA 3VVEA 1H8AC 1JT6A 2MSYA 2GRVA 4LQ2A 4LUBA 4PQJA 2DP8A 2EZIA 4FCYA 3FVGA 3BR6A 3JRBA 1EH3A 4YU0A 3CG1A 3ZKLA 3O29A 1B3HA 3UKGA 4OETA 1SQYA 4QHQA 1F9BA 2DMNA 1UHSA 3HOXJ 1SW5A 1A6IA 2EZHA 2P81A 1LBBA 5J3LA 2XPWA 1FTZA 4IB2A 1S50A 1USYE 2L7FP 5GP9A 3K01A 5CMMA 3TEDA 3RY3A 5HODA 4QRZA 3JZJA 5IOZA 1Z7NE 1DU0A 4XKPA 2X6OA 5CMCA 1QRYA 5CBSA 1U9OA 3IH4A 3PV0E 3O66A 4FAJA 1UTHB 1XC1A 4I8CA 4O3AA 1JEUA 1G2HA 4FECA 1MY1A 2RINA 2EBIA 3ZQFA 2R6GE 1O7TA 3BTCA 5M3FJ 3W9VA 5K2YA 3HSTA 4GIZA 3FXQA 4ZECA 2VI6A 4HCYA 4JWXA 4LATA 3Q0WA 2B3FA 4XRSG 2NVQJ 3D1NI 2Q2AA 1AIVA 3MP6A 1II5A 1QVSA 4Q30B 3DEWA 4FE4A 1OCPA 4N13A 3A3UA 2Y7RA 4R74A 3SEVA 1P1QA 1R6ZA 2DMUA 2FYIA 3OO6A 4AB6A 1WH5A 4Z0IA 1IDYA 4A3JJ 3MP8A 2F8DA 1X58A 1ITYA 3GBBA 1TT1A 5DEXA 2Z8EA 1ZGWA 4I6ZA 1ZLQA 4U23A 2V3QA 2XD2A 1PB8A 3HEFA 3UORA 2UVJA 2WB1N 4F29A 2UVHA 2HXWA 4RA1A 3TW7A 1JNFA 5LOMA 4BXXJ 1A8EA 3BBRA 1IUDA 3TCHA 1N7XA 3AXFA 3E4RA 1JTXA 4D5CA 4EXKA 2G29A 3PUXE 3BTJA 2IA4A 3TQLA 1PBQA 5K7ZA 3SKPA 2OZZA 3PMWA 4OXVA 2R92J 4I9DA 3CFLA 5F08A 3HHGA 4G12A 2OWSA 3F0CA 1YRNB 4DZ1A 1T33A 4EXLA 3WAFA 3TCGA 5I57A 1H76A 3FKIJ 2DA2A 3PPOA 4NF6B 2CJJA 4GVOA 3G3JA 4PE5B 1RPWA 3BG9A 2CMOA 3PM1A 4QIWN 3LSWA 1GVCA 4JB7A 5JEIA 4DYCA 2F78A 3A02A 4RJZA 2XXRA 5KZTA 5TU0A 4ZZAA 3KBRA 2W48A 3S2HJ 2JWTA 2LFBA 4NF8A 3KN8A 2R7ZJ 4H5FA 2NOGA 4F3PA 4ZS9A 4GLIA 4F19A 4DIGA 2I4BA 3P7IA 5KCJA 2LTPA 1N76A 1SI0A 2WAQN 1A55A 1I6AA 1RESA 3KN7A 3LR1A 2NS7A 3QIMA 1QVTA 2HXIA 4M3BA 5E3NA 1U78A 4WXJA 1FJLA 3C36A 1JKQC 5TP9A 4KHZE 2GHAA 2ZMBA 3JRAA 1B46A 1W0UA 2CQXA 2ECBA 5FHOA 2WKYA 4NWDA 1HDPA 4NTLA 2ELKA 2Q89A 5C3EJ 3BR1A 4LA9A 3T66A 3IORA 2K9QA 4Q0CA 1ETQA 5F0HA 3KZGA 2DTZA 4MLQA 2ID3A 3FVOA 1LFUP 5HPQA 5DS9A 1Y9UA 3GZGA 3EQ1A 3HDDA 3FD3A 4A3BJ 2E2HJ 1FTLA 3DP4A 2UYFA 4FJPA 4IO4A 3N6UA 2DWHA 5ELVA 5M5YJ 1S9TA 4NWCA 5HBCA 1FTOA 2I3VA 2MW8A 3UGWA 1B7HA 4H5GA 3JRDA 5EHSA 1DOTA 4PETA 3MC2A 4CYCA 2H8RA 4N6PA 1X2NA 3FATA 2Q88A 4PFTA 1AU7A 2X9DA 3TFLA 4F1YA 1JVXA 5DEXB 5H8SA 1MS7A 4L17A 2ABHA 2O7IA 1QULA 3BG3A 4OEUA 1QUKA 4XRMA 1QUJA 3MBPA 4W1UA 4OFJA 3TPAA 5JTYA 3NARA 4B3AA 3U94A 3Q0UA 2I58A 4EQBA 3HPIA 3V8XB 1LLSA 4ZEIA 2EZLA 3GTOJ 3JYRA 3RTWB 1B2HA 5EF6A 3DELB 2NWJA 1LAFE 4FEDA 3G1MA 2QMWA 2QS1A 1B8IA 3TW6A 1Y20A 4DZPA 1MSFC 3K00A 4QFPA 4N07A 4ABZA 2AIXA 3CR9A 1LAXA 1I6QA 2E1SA 5IOYA 1MG1A 4QFKA 1VNDA 4YMBA 4F1VA 4Y52J 1S7YA 4X6AJ 4U22A 1NFTA 3A3CA 2F6GA 1ORKA 1P7IA 2Q2CA 3O97A 5IPAA 1JUPA 5M5XJ 3TTKA 3C2BA 5FKNA 3D4CA 2HXOA 2L7MP 2LK2A 3SETA 3SDGA 3PO2J 4KI0E 5I57B 3GBAA 5H8HA 3ILUB 4D7NA 3LSPA 4OFLA 3U1OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1MH3 A;  4GOT A;  2IS4 A;  1YG2 A;  3F21 A;  2PT2 A;  3CLQ A;  3U93 A;  1XMA A;  3ZCO A;  3AL0 C;  1B9N A;  4KFQ A;  2O68 A;  3HRU A;  1ETO A;  3HBL A;  5JTY B;  1FTM A;  2PMZ A;  3SEY A;  1LBZ A;  2QWW A;  5F1Q A;  3SZP A;  1I6X A;  2FNA A;  2N8G A;  4MBP A;  3LSK A;  4XLE A;  2BY1 A;  2QLZ A;  2UXA A;  4ZYA A;  3VDX A;  4GX6 A;  3E79 A;  3O9P A;  1N04 A;  5LEK A;  1A6Q A;  2HOA A;  2JJ7 A;  4XM3 A;  1KZH A;  1TWC J;  2XX7 A;  4YB7 A;  2L9R A;  4G68 B;  5L9M A;  3V5A A;  3C2H A;  3HGG A;  1Z9C A;  2VPL A;  4P9K A;  4R9G A;  4ANJ A;  2VHA A;  2W84 A;  3KFW X;  1BKA A;  2GLO A;  1RZ4 A;  2M87 A;  2XXH A;  4G8H A;  3BR0 A;  2HQR A;  3U9G A;  4LP2 B;  3CD6 I;  1JXS A;  1GTK A;  1KYW A;  1QO0 D;  2XGX A;  2CZL A;  3OR2 C;  2QM3 A;  4IHV A;  4IO6 A;  1IUF A;  2ZFU A;  3KJT A;  3BIH A;  5IYC J;  2STW A;  1B1X A;  1X19 A;  4KCD A;  2VJI A;  4NDL A;  4C9Y A;  2HU9 A;  3JAM K;  2X1D A;  3SDF A;  2COM A;  3GUD A;  3GTP J;  5H8Q B;  2VPO A;  2PFY A;  2W7Y A;  2OWT A;  2Y2Z A;  2QSX A;  3PUW E;  3DLL F;  1ZG1 A;  1T56 A;  4JX4 A;  4U0W A;  3CC4 I;  4HF2 A;  2VIX A;  1YOV B;  3HM5 A;  5DT6 A;  1J7K A;  5DEQ A;  1IXC A;  1MZB A;  2CUE A;  1ZLJ A;  2YS9 A;  4WXC A;  1LB8 A;  3DEU A;  1IXH A;  1N3X A;  1UIU A;  4G6T B;  3FAS A;  4XKQ A;  2V4C A;  1JUS A;  3IR1 A;  2M3A A;  1R71 A;  3OL3 A;  4MNC A;  2ELH A;  2L3D A;  2YSR A;  2ZJP F;  4X8R A;  1ZR2 A;  1LST A;  2E2J J;  2H8W A;  4ZEF A;  4A3K J;  3RN8 A;  2FBK A;  2DA1 A;  3L2R A;  3E6B A;  2GH9 A;  2PMS A;  4FE8 A;  3EUH A;  1F5T A;  3ZS6 A;  4PFB A;  2LMD A;  2IT0 A;  4A69 C;  4BUP A;  4NE4 A;  2J5P A;  3R6U A;  1BIY A;  1Y0U A;  4ON0 A;  1B7Z A;  2GA2 A;  1NTC A;  2Z1D A;  3BR2 A;  5KAI C;  4ENN A;  1KU3 A;  4R2F A;  3K0L A;  3G2B A;  1ETK A;  4ZE8 A;  3RPL B;  5LGU A;  2DPU A;  3IB0 A;  4DBQ A;  4M72 A;  5KAF C;  3OO9 A;  1G3W A;  3RPU A;  3MYU A;  3CC2 I;  5JLX A;  3LSF B;  2GM4 A;  1NHA A;  4C1T A;  3HKZ A;  5BOX A;  1RYO A;  5E8G A;  4OVT A;  2EJR A;  4EQ9 A;  4H6D A;  4EF2 A;  3EPZ A;  3G3Z A;  4FOR A;  1IGN A;  2D5W A;  5IM2 A;  4L9J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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