The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
65
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structure length |
65
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMDTYKLFIVIGDRVVVVTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDAAKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
immunoglobulin-binding protein G
|
| publication title |
Crystal structures and increased stabilization of the protein G variants with switched folding pathways NuG1 and NuG2
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Finegoldia magna
|
| total genus |
13
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| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GI9 A; 3V3X A; 1FCL A; 2RPV A; 2N7J A; 2PLP A; 2LHE A; 2KQ4 X; 1GB4 A; 2JZP A; 2GB1 A; 1MHH E; 5HG2 A; 2QMT A; 1YNT E; 2NMQ A; 1EM7 A; 1ZXH A; 3FIL A; 2JWU A; 4OZC A; 2KAC A; 2I2Y A; 1MPE A; 4OZA A; 4HKZ E; 5BMI A; 2J53 A; 2PTL A; 4IKG A; 1QKZ A; 4MAC A; 1KH0 A; 2JSV X; 1P7F A; 1GB1 A; 2ZW1 A; 5HI1 A; 1IBX B; 2N9L A; 4OZB A; 1HZ5 A; 2IGH A; 4KGT A; 4WH4 A; 4D2K A; 2OED A; 4HJG E; 1F2R C; 2JXT A; 3MP9 A; 4GLS C; 4KGS A; 2RMM A; 1HZ6 A; 1C9F A; 1JML A; 1K52 A; 5BMG A; 3UI3 A; 1XCQ L; 2KDM A; 2KWD A; 1P7E A; 5HHD G; 5BMH A; 1MHX A; 2N9K A; 2ON8 A; 2JU6 X; 2ZW0 A; 2EEL A; 1IGC A; 2LUM A; 2KN4 A; 1PGX A; 4KGR A; 1IBX A; 1YMH E; 1UWX A; 1K50 A; 2IGG A; 2LGI A; 1K51 A; 1D4B A; 2LHD A; 1HEZ E; 2J52 A; 2I38 A; 1FD6 A; 2QSD A; 3GB1 A; 5JXV A; 1FCC C; 2IGD A; 1XF5 L; 2K0P A; 3FIL B; 5HFY A; 1MVK A; 1XCT L; 2PW9 A; 2ONQ A; 1F2R I; 1K53 A; 1Q10 A; 1IGD A; 1MI0 A; 1PGB A; 4IOI E; 1PGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GI9 A; 3ZYY X; 2O6V D; 2VH1 A; 3P2B A; 1TIF A; 2RPV A; 3Q3M C; 2MBQ A; 1GB4 A; 4H2A A; 2D2Q A; 1D5M C; 2L3Z A; 3ZRC A; 2D3A A; 3A4S C; 2XEW A; 1WYW B; 3Q8C A; 1ESF A; 3JSV B; 3AEE B; 2PE6 B; 3TEY A; 1FXA A; 3PTF C; 3CSF A; 3UF8 A; 4YT0 B; 1OQQ A; 1QKZ A; 2QC8 A; 1WSP A; 5E6N A; 2KJH B; 1K8R B; 2B76 B; 4KGT A; 2MX2 A; 2BF8 B; 4QAY A; 1SIF A; 4II2 B; 2NR2 A; 4GLS C; 3M63 B; 1KLV A; 1LFD A; 1V86 A; 3X0W A; 1KM7 A; 3TBL D; 4ARI A; 3EUB 2; 3VH4 B; 1WX8 A; 3VTU A; 4FJY A; 2IPK D; 2N9E B; 3QAQ A; 4M8N A; 2KQ7 A; 3NZS A; 1OEY A; 1QQR A; 4DHJ B; 1CK1 A; 2J7Q B; 5E6J A; 3EA6 A; 3PO0 A; 1PGX A; 4FN2 A; 1K51 A; 1Y56 A; 3L4P A; 3U7D A; 1V9J A; 2MJ3 A; 2V3N A; 2YLM A; 2L00 B; 3R66 C; 3OAW A; 4TQ0 A; 2PVO D; 5EDS A; 2K9X A; 3QC8 B; 1OTR B; 3GZN B; 3SD5 A; 2LRW A; 2W82 A; 3EFU A; 1QOG A; 5DPT A; 3KQ4 A; 2DZI A; 3AI5 A; 2N9P C; 3V05 A; 2DAF A; 1FNU A; 3RFZ B; 5JH5 C; 3N30 A; 1PGB A; 3KWV A; 3ABV B; 3HIZ A; 1FCL A; 1A70 A; 3LYY A; 4MEM A; 2KO3 A; 4RM8 A; 1YOV B; 3L13 A; 2JRH A; 3DDC B; 3PZ8 A; 4GB9 A; 2KTF A; 5BYS A; 2WXN A; 2XK5 B; 1C76 A; 1WM2 A; 3T9L A; 2Z0E B; 3SFD B; 2UWQ A; 2KDB A; 3V6E B; 3VUX A; 1SE3 A; 1VR9 A; 3HVD A; 4RNA A; 1LGR A; 5CTR C; 2N7E A; 2ZW1 A; 1T0S C; 1RM6 C; 2MEK A; 2K8B A; 4W9G A; 2DAJ A; 1VJK A; 2ASQ A; 4DXA B; 2W3S A; 1D3Z A; 5FR3 A; 3RZW C; 2ZNV B; 2NPT A; 1WRD B; 2KDF B; 4US9 A; 2AQ2 B; 2WDR B; 3B2F A; 5IOI A; 3BZD B; 3VTV A; 2MBO A; 1JRP A; 3VAW A; 2IO2 B; 2LVO A; 2FIF A; 2OOB B; 2AQ3 B; 3H7S A; 4P7I A; 3ZNG C; 4S17 A; 1VRA B; 3A9J B; 2IDY A; 2KZR A; 3X23 A; 2AX5 A; 2O2V B; 3CST A; 4FJV B; 4ZOH C; 1SE2 A; 4ZYN A; 2MWS B; 3Q3F A; 3V61 A; 2KKC A; 1LXD A; 4C80 A; 1UUP A; 4HJK A; 1F0Z A; 4HKQ A; 1JAL A; 2D07 B; 1QT9 A; 1FEH A; 3UQB A; 2KJ6 A; 1E7V A; 3PVL A; 2GBK A; 5EE1 A; 1GC6 A; 4YSX B; 3VR8 B; 4A9A A; 5DPW A; 1JRO A; 2A4Z A; 1I7H A; 2IJ0 A; 5AEK B; 1NEN B; 2ZVO A; 3AM9 A; 4WQM A; 2N1W A; 2WXI A; 5JHB A; 3V62 A; 1UH6 A; 5KHQ A; 1WWT A; 1UD7 A; 1N61 A; 1RAX A; 1FFV A; 1WGR A; 5C2T B; 3EEC A; 2ZCB A; 3FIL A; 2V1Y A; 4A20 A; 1JWU D; 4OVV A; 4CYE A; 3M95 A; 4AUQ C; 2VZK D; 3W1Y A; 4GDK B; 3U2S C; 3I9V 1; 3VUW A; 3L54 A; 3TMP B; 1EU3 A; 4AQ7 A; 2KVR A; 3ECI A; 3AEC B; 2L05 A; 4WH4 A; 1H8C A; 5G5H A; 1UEL A; 3A9K B; 4HJG E; 2WDT B; 4MJS A; 2CHZ A; 4AWJ A; 1TS3 A; 1J7B A; 5BMG A; 1EWY C; 3U30 A; 3TSS A; 2FID A; 1FO4 A; 3OWE B; 3KWL A; 2ZZP B; 3VRA B; 5EE3 A; 2ON8 A; 4ICV A; 3HM3 A; 1OFF A; 3K9O B; 1Q5W B; 4LCD E; 5D2M B; 2PKO A; 3APC A; 2BQQ A; 2C9W B; 2QCZ A; 1TKY A; 1UWX A; 2V4L A; 5DPS A; 1I42 A; 1DOI A; 2JRI B; 3VRB B; 2TSS A; 4RF1 A; 5J18 A; 1JQ4 A; 4JX1 C; 1ZDV A; 3QK0 A; 3ZO5 B; 2EKE C; 1FFU A; 1XF5 L; 2JZ3 B; 2RGF A; 1FNW A; 4I6L B; 2PVG C; 1ZKH A; 1IUE A; 2Y5C A; 3MFG A; 4W9F A; 1PGA A; 3NVW A; 4Q2J A; 5IP4 D; 1SEB D; 5L95 C; 2K8H A; 2JZP A; 5C3J B; 4X57 B; 4KV2 A; 2E3T A; 1ET9 A; 3H6N A; 1WX9 A; 1EO6 A; 3DVG Y; 4DHJ D; 1E8X A; 2LVQ A; 4DXF A; 1D5X C; 2GBJ A; 2BW2 A; 4EZK A; 4MT5 A; 2K22 A; 1DYQ A; 1C4P A; 3JW0 X; 1V81 A; 4IKG A; 2QIE B; 3IG3 A; 2J42 A; 2KT7 A; 4N58 A; 4NJC A; 2Y3A A; 1YN4 A; 4LNO A; 3ZXV A; 1HZ5 A; 2ZCC A; 2BS3 B; 2NBU A; 3W9C B; 3Q6B A; 2OED A; 2WXL A; 2BYF A; 1N5W A; 3UGB B; 2D3B A; 1UNS A; 3ZNH B; 4YTM B; 3GS2 A; 1WGG A; 1KJT A; 3H7P B; 1NYQ A; 2MSE D; 3NHE B; 4N9F 4; 4NAW B; 1E90 A; 4BKS D; 3T8M A; 1CMX B; 5J17 A; 1QOF A; 5JHA A; 1UGJ A; 2DYM A; 1D4B A; 3GE8 C; 5L83 A; 4MGY E; 1F77 A; 4J6I A; 4EFO A; 1FD6 A; 3Q69 A; 2EKI A; 4B0M A; 2Q5W D; 2LVP A; 5DPR A; 1FCC C; 1IPG A; 4MGI E; 4M01 A; 1GC7 A; 1HXY D; 3P42 A; 1TY2 A; 4KZC A; 1R7S A; 1XO3 A; 3ZTD A; 1J7A A; 1K53 A; 4XDC A; 3TJP A; 1QLB B; 4AJY B; 1IP9 A; 1L5P A; 1G6J A; 2G45 B; 2M1M A; 1MJD A; 3A1Q A; 1CZP A; 4KSL C; 1FXI A; 3NS8 A; 1TJE A; 3BWU D; 1TY0 A; 2WU5 B; 4OVU A; 3R8B A; 5I4D A; 4WJQ A; 3UIO B; 1MHH E; 2N4F A; 2DNF A; 2WWZ A; 4KDI C; 4YTN B; 3KUD B; 1AW7 A; 1WZ3 A; 1OQY A; 1YNT E; 3P4S B; 5C23 A; 4HWI B; 3R2T A; 3APD A; 2WXH A; 4I6N B; 1BXT A; 3KLS X; 4B9K A; 4KIK B; 3LXF A; 1HTO A; 3C0R B; 4E3C A; 1ROE A; 4LLG M; 4XWW A; 4GN1 A; 1AYF A; 3Q8B A; 1WZ0 A; 3TEX A; 4REZ A; 4IUM B; 4GSW A; 3R3M A; 4ANW A; 2KLC A; 2IGH A; 3VHT C; 4MSM B; 3UI3 A; 3NOB A; 2OJW A; 3ENE A; 3AV8 A; 4ZRJ A; 4ANX A; 2N9K A; 3I5J C; 4YSZ B; 3P4R B; 2ZW0 A; 1R4N B; 3EC8 A; 4HRS A; 3PZ7 A; 2NTS A; 3OLM D; 4ITK A; 3N1X C; 1V1P B; 2NBW B; 1X1M A; 4YL8 A; 4GIV A; 1TS2 A; 3KH0 A; 3MJW A; 1L7Y A; 4TV3 A; 3Q8F A; 4RM9 A; 1VZ6 A; 5BO4 B; 3JVZ X; 5FK9 C; 2KVZ A; 4W9H A; 3MC9 A; 1I35 A; 2OHF A; 3RNG C; 2KTR B; 4CHK A; 1V2Y A; 2GBN A; 1SGH A; 1A5R A; 2LHE A; 4WJO A; 2PPH A; 4EEW A; 5HG2 A; 2QMT A; 2BB5 A; 2K1F A; 3KW5 B; 2E6X A; 2LGD A; 3RMK C; 2ICI A; 4ACF A; 4FJZ A; 4DHZ E; 2YEP B; 3QAR A; 5BMI A; 1B1Z A; 3WAM A; 5IO9 A; 3VTW A; 3DBH I; 1XD3 B; 3AE2 B; 1IBX B; 4LTU A; 1STE A; 1ZXI A; 4MGZ E; 2BWE S; 2NS5 A; 4ZHP A; 2WNM A; 1ET6 A; 2BPS A; 2JY6 A; 4JL9 A; 3RPF C; 3S2A A; 1NYR A; 4KDL B; 1K52 A; 4FXC A; 5GXG B; 1ZP0 B; 4A8X C; 3ONS A; 2LJ5 A; 2M0X A; 1JWM D; 4FHK A; 2JU6 X; 2KAJ A; 1WJ6 A; 1WJ4 A; 4AP4 C; 3HVZ A; 2DHZ A; 4KGR A; 2D10 A; 5IA7 A; 2BYT A; 1TYG B; 3W1S C; 1F9J A; 1R4M B; 2KFK A; 1BUI C; 1WY8 A; 2WDQ B; 3NJT A; 2O6V A; 3ZTC A; 2GLS A; 2LWP A; 1ISN A; 2WYQ A; 2IGD A; 1WMH B; 2N0S B; 1LO5 D; 4PT5 A; 1MVK A; 3AU4 A; 4HPP A; 3NVV A; 2CS4 A; 1VZ8 A; 2WQY B; 2MJD A; 2JVC A; 2FUG 1; 3SR6 A; 2KX0 A; 1I4H A; 4MM3 B; 1RLF A; 2L8J A; 4I6P A; 2KQ4 X; 3N20 C; 1NDD A; 2GB1 A; 4NQL B; 3ZLZ A; 3E56 A; 2DEN B; 3TEW A; 1WXQ A; 2V3S A; 3TUO A; 2INC C; 3NZU A; 2MBE A; 4N59 A; 2LAS A; 3RYT A; 3O13 A; 4DXG A; 2FNJ B; 4NZL B; 3WA0 A; 3ZJV A; 3RNE C; 4DK5 A; 3SEB A; 2Y5B B; 1KH0 A; 4WWP A; 4RGT A; 2BGF A; 2KK8 A; 4LNI A; 4ZDV A; 2WXK A; 1E0Z A; 4WIP A; 1AN8 A; 3A33 B; 1GG3 A; 2KYW A; 4KGS A; 2KWU B; 2MP2 A; 3DBR I; 4B0E A; 3D32 A; 3ALB A; 1WR6 E; 3DVN V; 1SSN A; 1ZDX A; 4ZRI A; 2LD9 A; 2IBI B; 3AE3 B; 5H92 C; 2Z0D B; 5TR5 A; 2PMV A; 3RNA C; 4BKT A; 2KN4 A; 1T0Q C; 3OJ3 A; 4FUL A; 5FR6 A; 4MEL A; 2DBY A; 3TL5 A; 2LHD A; 2CHW A; 5C1Z A; 4A6Q A; 3ZIM A; 2MA9 B; 3GB1 A; 2MCN B; 3AE8 B; 3U8Z A; 1XLO A; 2D3G A; 4FAD A; 4IW0 A; 1JRU A; 3GP7 A; 3WAO A; 3R7Q A; 2ONQ A; 1T5X D; 1T0Y A; 2WXO A; 2JXX A; 2AWT A; 4GOC A; 3AN1 A; 3LB8 C; 4YTP B; 4RF0 A; 3WAL A; 2WDV B; 1UBI A; 4ZRQ A; 1U4A A; 2MW5 A; 2DYB A; 2LEK A; 4IWQ A; 2G1E A; 1P0R A; 3M62 B; 1N60 A; 1J8C A; 3RZF A; 5AZH A; 4C4V B; 2LRU A; 2DX5 B; 3P4Q B; 4IWP A; 3PSE B; 3N9Y C; 4XC2 A; 3W1S A; 2CU3 A; 4RFB A; 3H8H A; 1ENF A; 2G4D B; 3KYD D; 3WIM A; 1MPE A; 3NUH B; 1KOT A; 3T3N A; 1OEY J; 4GDL B; 3Q2A C; 3DQV A; 3AUL A; 2J53 A; 2NBV B; 3AE9 B; 1V49 A; 4P1C C; 2RR9 A; 1V97 A; 1MG4 A; 1P7F A; 2JYT A; 2UU7 A; 3AE1 B; 1YX5 B; 3BVZ A; 4BBN F; 1E7U A; 3VH3 B; 4E74 A; 5BYQ A; 5G55 A; 4D2K A; 3B08 A; 1D5Z C; 4KVG B; 3DOW A; 3P63 A; 1YQB A; 3ZXR A; 1SF0 A; 4NY0 A; 4K7W A; 5GMV A; 2LXC A; 5EE9 A; 4JWS C; 1V1O A; 3NS1 A; 1WJU A; 2RSU A; 2CJN A; 2LUM A; 3RNF C; 1C4C A; 2K5P A; 3CIR B; 4IWO A; 2NTT A; 1YQ4 B; 2WP9 B; 1WX7 A; 1YD8 U; 1P98 A; 4ZRP A; 1V1P A; 2I1J A; 4P16 A; 1L2N A; 2J52 A; 4IC7 B; 3Q3O C; 4YWG G; 5J2R A; 3ZJU A; 1V6E A; 1UF0 A; 2WGS A; 1OQR A; 1S1Q B; 2LGS A; 2FCN A; 3PS6 A; 1QZE A; 1T3Q A; 1IGD A; 3N1Z C; 4XDD A; 4URK A; 1YJ1 A; 4JLC A; 1UBQ A; 3QX1 A; 4A55 A; 1Q0W B; 2VH2 A; 1WGY A; 1Z2M A; 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3H1U A; 3URY A; 4CQN A; 1ACC A; 2NPT B; 3LDZ E; 1L6V A; 2KFJ A; 5G2N A; 4JIO U; 4OZA A; 3DBL I; 4R3D A; 4USA A; 3JYU A; 4US8 A; 2V0G A; 2MH7 A; 1CQV A; 2G9H D; 4MH0 E; 1GAQ B; 3K9P B; 5HI1 A; 3ZNZ B; 4HDQ A; 4WWM A; 1C3T A; 3UIP B; 1ZPS A; 2XK5 A; 4BKS A; 2JXT A; 3A4R A; 3M3J A; 1HZ6 A; 3VXW A; 2DYO A; 3ZJT A; 2QJL A; 3J9C A; 2N9X A; 3PGE A; 4IM2 A; 2QIL A; 3RNC C; 4HK2 A; 5LNK 1; 1SJE D; 4DHZ B; 1B9R A; 2KDI A; 4TKN A; 1JWB D; 4B6W A; 1I4X A; 1SXT A; 4KKI A; 3IAS 1; 1S3S G; 1SE9 A; 3IHP C; 3V60 A; 3O65 B; 1N62 A; 4DWF A; 2I38 A; 3ZDM C; 4BOZ B; 1YIW A; 4JE3 B; 2G3Q B; 1FRR A; 5JXV A; 3FIL B; 3IBE A; 1FXT B; 3IVF A; 2R2Q A; 3U4E G; 1PQS A; 2JF5 A; 5LLI A; 2LJI A; 1JW9 D; 2V3P A; 1P9D U; 4RGN A; 3I3T B; 1WIA A; 3FAH A; 2PE9 A; 1KTK A; 4K81 A; 3A9J A; 1Z5S B; 2INP E; 3BYY B; 1KLU D; 1UGM A; 2O2V A; 4EOY A; 3BIN A; 4MJS B; 1PDX A; 3W2D A; 1ZXH A; 2JX5 A; 1WF9 A; 2Z59 B; 4LK0 M; 3U52 E; 2KC1 A; 2PTL A; 5EE0 A; 4MAC A; 4IDI A; 4P1B C; 1GB1 A; 3GZN I; 1KFY B; 1VZ7 A; 2WXM A; 1M94 A; 4NJ6 A; 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