The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
152
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structure length |
139
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Chain Sequence |
SSTLTPMHLRKAKLMFFWVRYPSSAVLKMYFPDIKFNKNNTAQLVKWFSNFREFYYIQMEKYARQAVTESELYRVLNLHYNRNNHIEVPQNFRFVVESTLREFFRAIQGGKDTEQSWKKSIYKIISRMDDPVPEYFKSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
Protein prospero
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| publication title |
Structure of the DNA Binding Region of Prospero Reveals a Novel Homeo-Prospero Domain
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Drosophila melanogaster
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| total genus |
45
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| structure length |
139
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Homeo-prospero domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MIJ A; 2LMD A; 1XPX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V5F A; 1R1T A; 4M3E A; 2GOX B; 1DU0 A; 3LQQ A; 1VQP I; 3GTJ J; 3PFI A; 2BW3 B; 4AD9 A; 1WRJ A; 2RAE A; 3DKW A; 3PIO F; 2LKS A; 2V9K A; 2NXN B; 2VJJ A; 1J7K A; 3CC4 I; 3CES A; 1VFC A; 2W48 A; 3SZT A; 5KK1 A; 5FRO A; 1ON1 A; 4LGW A; 1LUJ B; 4RBO A; 1BM9 A; 3L2Q A; 3CUO A; 1T2K A; 2K9L A; 1A35 A; 3H35 A; 1BA5 A; 2D1H A; 2V6C A; 5CVR A; 5EEH A; 5DUK A; 2WA0 A; 4A3I J; 1T8I A; 4NQW A; 3VOD A; 1TL8 A; 1XDU A; 3MN2 A; 1X1B A; 2MD5 A; 3R0A A; 2PLY A; 2X1C A; 3I3L A; 4Y3O A; 3JR9 A; 3S1R J; 3LSM A; 2JRM A; 3DV8 A; 4L9V A; 3U1D A; 2W7N A; 2ZB9 A; 1U5T C; 3L2U A; 3JRF A; 1K4T A; 2XAS A; 2W57 A; 1J2X A; 2EFN A; 3NWS A; 2JN6 A; 1GXP A; 3CUQ C; 5E20 A; 2XKO A; 4IHS A; 3HOT A; 3W3C A; 4M73 A; 1G3Y A; 1OQY A; 3J7A O; 1H88 C; 5TGT A; 3M1C A; 5IP7 J; 1LEA A; 2JSC A; 4NBQ A; 1IZ1 A; 2Y31 A; 5DM7 F; 5E1Z B; 1O3T A; 2XRN A; 5J40 A; 4HBL A; 3BTL A; 2YUS A; 1R49 A; 2FEZ A; 3GFM A; 4WX9 A; 1ZRD A; 4IKF A; 2ZJ2 A; 5K5R A; 4A3L J; 3FMR A; 4M74 A; 1EH8 A; 2FBK A; 3V8J A; 4OIP F; 4BS9 A; 3S2W A; 2JA5 J; 4BQO A; 4N9H A; 1HKT A; 1OMI A; 1U3E M; 2VLA A; 3V7R A; 2HNH A; 3WU1 B; 1XD7 A; 2JVH A; 2VKD A; 1LFU P; 2FA5 A; 4G6D A; 3BQZ A; 3ZN0 A; 1W7P D; 4PFO A; 5EYR A; 1IN8 A; 1XSV A; 2QSF X; 4OMZ A; 3JAM Z; 2FBI A; 3BR6 A; 2F4I A; 1BIB A; 4G7H F; 1ETW A; 4NNJ A; 3LSR A; 2X1D A; 2GZW A; 4ZDL A; 1YS6 A; 4MTE A; 2FJ1 A; 4E4H A; 2QKL B; 1P4A A; 3ASO H; 1YIT I; 3H5A A; 4A3J J; 2NRA C; 4XKC A; 2UZK A; 1X1C A; 3F3X A; 3E6C C; 4GO1 A; 1DP3 A; 1BJZ A; 1WH7 A; 3HOY J; 4RAG A; 1ZRE A; 3G71 I; 3F8B A; 1WI9 A; 3HKZ A; 1Q1V A; 2QSH X; 3BTJ A; 4XLN F; 2VPL A; 3KP3 A; 2YSR A; 5FFZ A; 2DW4 A; 3JRB A; 1G6N A; 2O0Y A; 3KCC A; 3JRI A; 2ZSI B; 1BI2 A; 4BHB A; 4FTH A; 3M3Y J; 3ECH A; 4BDZ A; 5F0C A; 3JSP A; 2N8G A; 3H9G A; 4XBF A; 4NDL A; 2XSD C; 1MBF A; 1MMD A; 2O03 A; 2XF5 A; 2YR2 A; 1JKO C; 1FOK A; 1FY7 A; 1OCO H; 2EB7 A; 2F5E A; 2MLK A; 4Q47 A; 1V4R A; 2E19 A; 3PUF A; 1U5T A; 2Q2E A; 1TNS A; 3I71 A; 3GZ6 A; 4JQF A; 5FFX A; 2MH2 A; 1FEX A; 1PDN C; 4Q4Z F; 1ETO A; 5IY5 H; 3FXQ A; 2KZG A; 2DLL A; 1VQ8 I; 2DYS H; 3CF5 F; 2ZKZ A; 1KYW A; 3CUQ A; 3S93 A; 5EZH A; 3AG2 H; 4M71 A; 4J01 A; 1YIO A; 3RKX A; 4F7Z A; 2V1U A; 2OQR A; 1A04 A; 4X6A J; 4A5N A; 4I0B A; 2MSY A; 2VXD A; 3I4P A; 4ON0 A; 4BH9 A; 1MBK A; 4AM3 A; 2CW7 A; 3E6B A; 4RB3 C; 2R5Z B; 3RYP A; 5F6F A; 1U9O A; 2DOF A; 2ZFW A; 4ITV A; 2Z5U A; 1OYW A; 2MG4 A; 5BPD A; 2BY2 A; 3RZO J; 1OFC X; 2JUC A; 3MZH A; 1PJR A; 4EEF G; 1YRN A; 2HYJ A; 4AYB A; 5CPR B; 2XGC A; 3BJA A; 1D0Z A; 2WBM A; 1G3W A; 1Z3Y A; 5F04 A; 5LGT A; 3SHF A; 1YJW I; 3OOP A; 2NNN A; 1GVJ A; 2VJ4 A; 3H1C A; 4QSH A; 3A2K A; 2P81 A; 3ZQH A; 2ESH A; 4KIB A; 2CRG A; 1X2M A; 5B66 C; 2M7B A; 3TGN A; 3C18 A; 5L3B A; 1WZ2 A; 1YG2 A; 3EDP A; 3BOQ A; 4D5F A; 5FD6 A; 2V4J C; 2HKX A; 3IC7 A; 1XSX A; 1IXS B; 5AIQ A; 2LYC A; 5B1B H; 1ZG3 A; 2OTL I; 4F91 B; 3LSI A; 4M3G A; 3HDD A; 1FBU A; 3G1M A; 5L3C A; 3OV8 A; 5AIP A; 3QRF F; 4ZZD A; 3KYD B; 1U8R A; 1HW5 A; 2E2H J; 1RR8 C; 4MIM A; 1B8I B; 5HLH A; 1XMA A; 2WAQ N; 2DT5 A; 3S2D J; 1BOB A; 2PMZ A; 3G4S I; 1B1B A; 4Z2Y A; 4OIQ F; 3HSE A; 1IN7 A; 4ABZ A; 3ZQQ A; 3S16 J; 2WAF A; 3K2Z A; 3HHH A; 1OYY A; 1SD4 A; 1IW7 F; 5EJC A; 5FKL A; 2P7C B; 2KL4 A; 2OQG A; 3H9Q A; 3CJR B; 1RC9 A; 5DTD A; 5EGO B; 1RUN A; 3ZMZ A; 3JSO A; 1MNE A; 5DYM A; 3TO7 A; 4WXC A; 4HF1 A; 2STW A; 3BT9 A; 2ID6 A; 4ESB A; 3NWT A; 4A3K J; 2AXL A; 1D5Y A; 2X6W A; 3ZQG A; 2HR3 A; 2PJR A; 5FLX K; 1XGO A; 2JTV A; 3L9F A; 4BY1 J; 5EDN A; 2DA3 A; 3FXM A; 2E1M B; 3HL2 A; 2Y30 A; 1HA8 A; 3I56 I; 2E34 A; 3SFZ A; 3WHC A; 5GAD J; 3OSG A; 3GTQ J; 2M4G A; 2DT7 B; 3ABT A; 3HSF A; 2O6G E; 2DK8 A; 2EA4 A; 2VT3 A; 3JRH A; 4ZTF A; 5EF6 A; 2HOT A; 2IA1 A; 1W0T A; 5HS9 A; 1VQM I; 4BKX A; 3V8L A; 1ZAO A; 4M9Z A; 3HRT A; 2TRT A; 4G94 A; 4A93 J; 1X19 A; 4HF0 A; 1SFO J; 2OA4 A; 3G3Z A; 3MVP A; 4UUS A; 2P5L C; 4A3G J; 2YU3 A; 1S8N A; 4YIR X; 5IP9 J; 1TQI A; 4HZF A; 3I4N J; 1J9I A; 1Z9C A; 3T1B A; 2GA1 A; 2K9M A; 3TW6 A; 4L0Z B; 3JW4 A; 2A61 A; 1KA8 A; 4XLA A; 3DTE A; 4LD5 A; 5FGM A; 1FYL A; 1HKQ A; 5E79 C; 4U0Y A; 1JT0 A; 3GTM J; 1IXR C; 4G6T B; 3HRM A; 4KA4 A; 3J81 Z; 4CCO A; 4XLF A; 3LSK A; 4CZC A; 2MBF A; 4IO9 F; 3LQR A; 2BXZ A; 1MW7 A; 1SVM A; 3RKY A; 4ENK A; 1LE8 B; 2EBI A; 3ECO A; 2WAD A; 5M5X J; 3OL3 A; 5JFR A; 4AIH A; 1VQO I; 4BE2 A; 4C2U A; 1J0R A; 2KRF A; 1ZG5 A; 2V26 A; 1Q1H A; 5E8G A; 1Y1V J; 2CQ7 A; 3AG4 H; 1OJL A; 2G7U A; 3CO7 C; 4NQW B; 2CUJ A; 4HPQ A; 4HNV A; 3HUG A; 1B9N A; 1WH5 A; 2P6T A; 1G8X A; 2QQB A; 4HV5 A; 3ROU A; 1JJ8 C; 1VQ4 I; 4IRH A; 3SZG A; 4FT8 A; 4ZC3 A; 5DCM B; 3OS1 A; 3HKZ N; 4IJA A; 4JK1 X; 1ZLK A; 1D3Y A; 3IWF A; 3CC7 I; 4H0E A; 2QM3 A; 1ZEL A; 4PGG A; 2G9W A; 2VQC A; 3KLO A; 1X1P A; 4B44 A; 2EJR A; 2GWR A; 2EWN A; 1WQ2 A; 1I3A A; 3I59 B; 4IEJ A; 5L3E A; 3AL0 C; 3DEE A; 2Z2S B; 3V4G A; 2IJL A; 1T0F C; 1I1G A; 4CHU A; 1Z6T A; 1HCR A; 2DOD A; 5EZG A; 3I64 A; 3Q0V A; 1XN7 A; 1Z67 A; 1S5L C; 1LVK A; 1ACI A; 2FNA A; 2ZJR F; 1UHM A; 5ILV A; 3RQI A; 3P9I A; 3IRR A; 3KZZ A; 2XAQ A; 1ZLJ A; 2DYR H; 2HU9 A; 4UV8 A; 5EEG A; 2QEX I; 2VI6 A; 1LDJ A; 5M5Y J; 4DGW B; 1FTT A; 5ICF A; 2PJP A; 3V7C A; 4AUX A; 2XB5 A; 2L5Q A; 5HNH A; 4XLP F; 3OYK A; 2VPR A; 1Z05 A; 1KQ9 A; 2VJ5 A; 3QOE A; 2QQ8 A; 4JOM A; 4EJW A; 2NS8 A; 2AQF A; 1K78 B; 4II3 A; 4P9F A; 4AYB N; 3L2R A; 4PK4 A; 3WTT C; 4HF2 A; 1ZGW A; 1YJ9 I; 4F3Q A; 3FHZ A; 2BYV E; 4WCG A; 2ZFU A; 5IYD J; 1GV2 A; 4KT5 C; 4PCQ A; 5E3L A; 3FM5 A; 3TBI A; 3HM5 A; 1MSF C; 1BW5 A; 1W36 C; 3K4J A; 3ZQI A; 3V42 A; 3DTI A; 1B59 A; 3SQN A; 5JVG F; 5C4J J; 1B9M A; 2L01 A; 3T5X A; 1RET A; 2JWT A; 4EM0 B; 3CO6 C; 3G2B A; 3M8F A; 5B1A H; 2BZT A; 5BS6 A; 1AOY A; 1FPQ A; 2MLG A; 2YX4 A; 3QU6 A; 5K7Z A; 3KP5 A; 3NAU A; 4LFU A; 4Z6Y A; 1ZN2 A; 1RKT A; 1U5T B; 1P6R A; 2Q2E B; 2ADU A; 1W7P A; 3HYI A; 4LIT A; 4X1E A; 4NB5 A; 4MO7 A; 1MDM A; 4DZJ A; 2HVQ A; 3W2A A; 5LHI A; 2ZBK A; 3K4B A; 1T38 A; 2PMZ N; 3IWZ A; 1ONV A; 3CUQ B; 1DGR M; 2R5Y A; 3DFG A; 4BNC A; 1T0F A; 5K5Q A; 2VBX A; 2W1O A; 4JYK A; 3FXU A; 2OC6 A; 3EET A; 1J5Y A; 4N9I A; 3U2R A; 1VQ9 I; 1JTX A; 1DQU A; 3LST A; 2EA2 A; 1QPI A; 2A3S A; 1W5T A; 4G8X A; 2LMD A; 5D6E A; 4R8H A; 3F6O A; 3GZN B; 3L1P A; 3O8G A; 1YFH A; 3CCU I; 3N97 A; 1OYI A; 3K9T A; 3VPR A; 1G2H A; 1YRN B; 2IVM A; 2V1X A; 3F23 A; 4ZJZ A; 4MQV A; 2QGU A; 4A0Z A; 4F52 A; 5HDN A; 4CXF A; 1EF4 A; 3DPU A; 5F27 A; 1YW7 A; 1DPU A; 4RLF A; 3TQN A; 2HVR A; 4HA8 A; 3CDH A; 3L00 A; 1SVL A; 3DU6 A; 3GWZ A; 3LSH A; 2HQN A; 2OZU A; 5J3L A; 3CLQ A; 5C44 J; 5DS9 A; 1IDZ A; 5K5O A; 2Z9O A; 2EZL A; 1RI7 A; 2Y9Y A; 1P92 A; 2ECB A; 3K4K A; 4U87 A; 3FMQ A; 2V7F A; 3H3U A; 4BY7 J; 5IP6 A; 5D8L B; 1U2W A; 4A69 C; 3RJP A; 1MBG A; 2ZC2 A; 3GBG A; 5F1J A; 2QSG X; 1Y8Q B; 2L7K A; 3D1N I; 2DMU A; 2JUG A; 2XRO A; 3RYR A; 5E18 F; 1LEB A; 4XRF A; 4WK8 F; 4IOA F; 1PP8 F; 2I8D A; 4OAY A; 2ME6 A; 4BJT A; 4KUM A; 3H3V K; 1KYZ A; 2KT0 A; 2QCO A; 2CMP A; 2E1N A; 1WSU A; 2CWE A; 2GXG A; 1BR4 A; 4E7S A; 4EGZ A; 3IUO A; 1HOM A; 3KZI C; 1GLN A; 4ZYG A; 4AIJ A; 3RDI A; 3H92 A; 5D8K B; 3DEU A; 3F21 A; 4BUP A; 4KIT B; 4KNY A; 3GCM A; 3L2V A; 3E97 A; 5HLG A; 3OYF A; 2L9S A; 2R7O A; 3BJ6 A; 1QBJ A; 3FM3 A; 1V5E A; 3VB2 A; 2KMU A; 3ZMT A; 2IAI A; 1MKM A; 2PJR B; 4R79 A; 5GPC A; 2QLZ A; 3LAP A; 1Y0U A; 2Y69 H; 1FYK A; 1TZL A; 4MHG A; 4EAT A; 5H6R A; 3CCS I; 5CQE A; 5JLW A; 3M1E A; 1QGP A; 3GLL A; 4PJN A; 4OU0 A; 1O3Q A; 2E7W A; 3EYY A; 4CZZ A; 3A01 A; 2RVC A; 4DNC A; 1FWZ A; 3E1S A; 2PMU A; 2DMQ A; 4K2E A; 4RLQ A; 5LEK A; 2M5W A; 2JK3 A; 2HKO A; 1XGS A; 4CCK A; 2LLK A; 2LF8 A; 3CC2 I; 2DQR A; 3BPX A; 3WTX C; 4E70 A; 3QU3 A; 4UUS B; 3S1M J; 3OYJ A; 1WPK A; 4A2U A; 3FKJ A; 4UXN A; 1FX7 A; 1RIO H; 1IUF A; 2V1N A; 4OWR B; 1REP C; 4UB8 C; 4YEJ A; 2WTE A; 1FJL A; 1V5G A; 1SFK A; 1XTA A; 4A5M A; 4BDY A; 2P8T A; 1JUP A; 2A6E F; 4Y4R A; 1X3W B; 3BR5 A; 4LIU A; 3S3O A; 4GDF A; 1WJ5 A; 2K3F A; 5DUI A; 4AID A; 3K1N A; 5JLX A; 2PQ8 A; 4IRI A; 2BOL A; 2MH9 A; 3QPH A; 1KGS A; 5J1U A; 2KQR A; 3F8N A; 3FDY A; 3PJR A; 2EK5 A; 1BC7 C; 1UAA A; 1UCR A; 3OYM A; 3FWE A; 1Y0N A; 3CCM I; 2A68 F; 1OCP A; 2JSP A; 3BG6 A; 2LOO A; 3BTI A; 5KAF C; 3HUG B; 2A07 F; 1ZRC A; 5C4X J; 1R7J A; 2QF7 A; 2FXA A; 3OOU A; 5JHU A; 4EJU A; 4HSR A; 5LRS A; 2RKH A; 1A6Q A; 4BHC A; 4BQN A; 3MKZ A; 4YIF A; 3KP2 A; 1ZGA A; 2VOD A; 3O2P E; 3TMO A; 2K9S A; 3WTZ A; 2ECC A; 3QOD A; 2BY0 A; 1QVU A; 2DN0 A; 4FE7 A; 3IH3 A; 2X1E A; 2K5C A; 1LPQ A; 2IGN A; 5CVU A; 3GTG J; 2WAQ A; 2X9D A; 4CA0 A; 5KVR A; 2WY8 Q; 1K4S A; 4I01 A; 3IKV A; 1A31 A; 2BY3 A; 1D8K A; 1S7E A; 3MKY B; 4IPA A; 5IOY A; 1EH6 A; 1R6R A; 5GTH C; 2RC4 A; 1YHQ I; 4CO8 A; 4ZYE A; 3ZMS A; 2VE9 A; 1D1B A; 2X6X A; 1TC3 C; 3ZQ7 A; 2YS9 A; 2F5V A; 2JA6 J; 3F9K A; 4D7N A; 3D5R C; 2RNG A; 2DK5 A; 3F22 A; 4CCN A; 3OYA A; 1GVD A; 2P0W A; 2A6H F; 4OIO F; 2NVT J; 3ERE D; 1VQ6 I; 1XSD A; 3FIW A; 3LNQ A; 3NQO A; 4HDV A; 3CDI A; 1BN5 A; 1F43 A; 3KX2 A; 1RR7 A; 3C2G A; 3DPL C; 1Z6R A; 5GTI C; 4I76 A; 1J75 A; 5L3G A; 3E3V A; 2G0E A; 5LEJ A; 3CMM A; 1YLF A; 1WJA A; 2Y9Z A; 3G1L A; 2RRE A; 2VKH A; 2MC3 A; 2ZXJ A; 3NRV A; 1WJD A; 3MFK A; 1I6X A; 4LK0 F; 1Z3X A; 2VC1 A; 3CMY A; 1VF9 A; 2LNB A; 4HQE A; 2ZME C; 2CG4 A; 3SJM A; 1IXC A; 1H9T A; 4F92 B; 1IN4 A; 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