The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
QTVTTPLSLTLGHWKDVERIAHNQSVDVKKRRWVTFCSAEWPTFNVGWPRDGTFNRDLITQVKIKVFSPGPHGHPDQVPYIVTWEALAFDPPPWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
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| molecule keywords |
Core protein p15
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| publication title |
Atomic resolution structure of Moloney murine leukaemia virus matrix protein and its relationship to other retroviral matrix proteins.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Moloney murine leukemia virus
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| total genus |
32
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-09-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Gamma-retroviral matrix domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MN8 A; 1UHU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HBK A; 3SYZ A; 1PK1 B; 1FO4 A; 5J0X A; 8ICC A; 4J9M A; 4PJ0 U; 4EEY A; 1PK3 A; 1UA1 A; 4O5E A; 8ICI A; 2YMQ A; 4QIW C; 4OJL A; 5CWR A; 2MU2 A; 4DQQ A; 2JEI A; 1N63 A; 2M9N A; 3MFH A; 9ICA A; 1SGG A; 1BPD A; 3TAR A; 1SZP A; 2W7P A; 1X9S A; 5KFH A; 4G9B A; 1RXV A; 1L3U A; 4DL4 A; 4EX6 A; 2D6F C; 4BXO B; 4Y2Y A; 1BPE A; 4OJP A; 5B66 U; 2G0A A; 1XSN A; 4JV2 A; 4M6W A; 3CW2 C; 2XO7 A; 4C4R A; 4GIB A; 1KBU A; 3Q8R B; 3ALR A; 4DL2 A; 3WKE A; 4A8E A; 4EEN A; 2FMQ A; 1ZQA A; 3PSF A; 5BOL A; 1VLB A; 2J6S A; 1U49 A; 5AM1 A; 5DKW A; 1SWV A; 4CF3 A; 5AI9 A; 2FMP A; 2V9W A; 3Q8S B; 2PKE A; 3B0X A; 1DRG A; 3N97 B; 1MQ2 A; 4KLD A; 3KHH A; 4B9T A; 3ZI4 A; 2WAQ C; 4FS1 A; 2Y1I A; 1Q46 A; 1XO0 A; 3F53 A; 5J2K A; 1TAM A; 1UHU A; 3V72 A; 2JR5 A; 5DDM A; 2LYH A; 3EPG A; 2ISP A; 9ICQ A; 3UXO A; 4QWC A; 3SR6 A; 4R64 A; 1MC8 A; 4F8R A; 2DPI A; 4XUS A; 4Q43 A; 2VIX A; 4F72 A; 1ED1 A; 2JRZ A; 8ICZ A; 1CEZ A; 1HUZ A; 5KFT A; 3BQ2 A; 3PW4 A; 5ALR A; 3GIJ A; 5KFO A; 4U7C A; 5J2B A; 1DXS A; 1FEZ A; 1ZQ1 C; 2IOF K; 5KFL A; 3TAP A; 2WTF A; 3PZP A; 8ICU A; 3KFU F; 2VJ5 A; 4DFK A; 3V6J A; 3OJU A; 1NK6 A; 1T8E A; 4O3Q A; 2K60 A; 2BQ3 A; 2P35 A; 1ZOL A; 1VJ5 A; 5KG0 A; 3FC4 A; 5J0U A; 3WU2 U; 3RH5 A; 2W11 A; 2LYA A; 4X5V A; 5KFB A; 8ICR A; 2FLN A; 1UQV A; 3GFK B; 2AXT U; 5HMM A; 4KN7 A; 2BHN A; 4IRK A; 5D49 A; 5F3X B; 2C22 A; 3TAN A; 4YMM A; 4CE6 A; 3MDA A; 5B5E U; 2KKP A; 5CRX A; 2HDO A; 4QW8 A; 1Y88 A; 3GQC A; 2DL0 A; 3AU6 A; 3NVV A; 3RFA A; 4KLG A; 4WJ3 B; 5ALM A; 3QU5 A; 5KAF U; 3M9M B; 3PSP A; 5DDY A; 1NJY A; 2KP7 A; 4F4Y A; 8ICE A; 4CF4 A; 1F0M A; 2QLT A; 5J0R A; 4UBB A; 5ALW A; 4TUS A; 4F4Z A; 4E0D A; 4NLZ A; 2QKQ A; 5EE1 A; 1NK7 A; 1FFU A; 4EEK A; 5J2H A; 4Y2X A; 3LWL A; 4DSE A; 1ZXI A; 2M0N A; 2E3T A; 3VC8 A; 4I2A A; 3QYP A; 3H0L B; 2DQN B; 4PL2 A; 3Q8K A; 5DG9 A; 2Q0Z X; 4KLU A; 2VA8 A; 3OSN A; 3KTQ A; 1RQN A; 5T14 A; 3GDX A; 3IRU A; 3T5L A; 3R9K A; 2PXI A; 3UQ0 A; 4C8N A; 8ICT A; 1TE2 A; 2OH2 A; 5KFC A; 7ICH A; 5L1J A; 4DOB A; 3DEE A; 2DGZ A; 4UAW A; 1Z4N A; 2DKZ A; 4M47 A; 4ED7 A; 2RRD A; 4QZ8 A; 2DWQ A; 3GV8 B; 3EPI A; 2C2R A; 2NYV A; 2ZTE A; 1V97 A; 4ED8 A; 4QNL A; 3PO4 A; 5KT6 A; 2W8K A; 2HI0 A; 4R63 A; 2HVH A; 4LVS A; 4DF8 A; 2BR0 A; 2CPR A; 1NZP A; 3A0B U; 4ECX A; 3PSI A; 1A77 A; 4PL1 A; 3M8S A; 9ICN A; 1ZQX A; 2GH1 A; 4I2F A; 3AUO A; 1IG6 A; 2KNJ A; 4Y2Q A; 2A19 A; 5KNI A; 3HJE A; 2W9C A; 4M2Y A; 3Q8L A; 4QZG A; 2EDU A; 5DG8 A; 4Y2R A; 3QU4 A; 2GLE A; 5DG7 A; 3LWM A; 2K8B B; 4YR3 A; 4UBC A; 5KT7 A; 4PHD A; 4J9L A; 8ICQ A; 3L5K A; 4ECZ A; 3K1Z A; 3H40 A; 5AKH A; 1HUO A; 2HOF A; 3KHG A; 1JXE A; 4ELV A; 5DLF A; 1NOM A; 1ZET A; 3NUQ A; 4UB1 A; 4MF8 A; 3Q8M A; 1KL9 A; 1Z1V A; 2AU0 A; 3F5A A; 1IV8 A; 4QZF A; 1RM6 C; 4RQ3 A; 5ALF A; 3RTV A; 2WB1 F; 5AK5 A; 3PW5 A; 4KMO B; 5ALN A; 1C7Y A; 3LYS A; 2ATL A; 2MUT A; 3ISB A; 1T3Q A; 4I2J A; 2ODG A; 3QU9 A; 5AKX A; 4UB2 A; 2FLL A; 3KZX A; 2YN4 A; 4UAU A; 4I29 A; 3PX6 A; 3GU3 A; 5ALU A; 2K4H A; 3NRZ A; 3NS1 A; 3NAS A; 4EYI B; 3RJK A; 8ICO A; 5AI6 A; 4ECQ A; 4RUA A; 5HHI A; 5DGA A; 1QSS A; 1T94 A; 3E0F A; 1OUQ A; 1CRX A; 3PR5 B; 4KLL A; 2HHT A; 4FFD A; 3QNM A; 4O5C A; 3MR6 A; 4F5Q A; 3MBY A; 1U47 A; 2KEY A; 3RB3 A; 4OO1 J; 3H7I A; 4BUG A; 1Z00 A; 1QTM A; 3F2D A; 3TI0 A; 4QZB A; 1TVA A; 2KMD A; 5ALT A; 4NJ8 A; 4CNQ A; 5TIS U; 2XY6 A; 2HHV A; 2MUT B; 1A0P A; 4J9P A; 5ALP A; 3ZDE A; 3G6V A; 1TV9 A; 4YFK A; 3BZC A; 4DSK A; 3C29 A; 1N2X A; 4NL9 C; 5KG6 A; 9ICO A; 4QZA A; 2K4P A; 1L7N A; 3IP4 B; 4YR2 A; 5BOM A; 2PMZ C; 1JRP A; 3SV4 A; 1QCK A; 4KTQ A; 5KFV A; 4Y2V A; 3D6J A; 4TQS A; 4KLE A; 2FMS A; 1TK8 A; 1S97 A; 3V6K A; 4IRC A; 4P0P A; 2JGA A; 1NK0 A; 1JAL A; 3JPT A; 2KJ8 A; 2B0C A; 2UVW A; 5FP0 A; 2R8I A; 2KZM A; 7ICM A; 1WCN A; 3H4B A; 1CI4 A; 4KLH A; 4AYB F; 1ZQQ A; 4KLF A; 5J2G A; 5KFY A; 8ICS A; 4IC9 A; 2JXJ A; 2W43 A; 2F1J A; 4QWE A; 1ZYQ A; 2YB1 A; 1QQ5 A; 4RQN A; 8ICY A; 2XIC A; 4FO6 A; 4FZM A; 4DEZ A; 4QZH A; 2K4I A; 1NK9 A; 7ICO A; 4UAV A; 4YN4 A; 3QUT A; 2NRT A; 4M04 A; 5IIO A; 4ECU A; 2XCP A; 4FE3 A; 4RT3 A; 4FBT A; 1T4G A; 1DK2 A; 3IHQ B; 1B22 A; 4M9J A; 1O03 A; 1L6N A; 1SKS A; 3PW7 A; 4C4S A; 2BCU A; 3SV3 A; 4PZN A; 2FPL A; 1J97 A; 4YXJ A; 1D9F A; 3GIM A; 1JMS A; 1HEK A; 3IV6 A; 2ZJA A; 3OHB A; 2F8L A; 2ASJ A; 1Z4O A; 3FYH A; 1NNL A; 3I28 A; 5KFX A; 4UAY A; 4JUZ A; 3RJI A; 5F9N A; 2B21 A; 3WKB A; 3RAX A; 4J9K A; 5AKL A; 1KSP A; 1S0N A; 3AQE A; 2KSO A; 3TQ1 A; 4IQW A; 1X9M A; 1N60 A; 2C2D A; 5AHX A; 2F44 A; 7ICN A; 1SV0 A; 4DSL A; 1M6Y A; 5EE3 A; 3GIL A; 4J9Q A; 1BPZ A; 4UW9 A; 2BCV A; 4DSI A; 4F92 B; 5DB7 A; 3ZD8 A; 3A0H U; 3H8S A; 5ALV A; 4P2H A; 1BGX T; 2NRW A; 2XCA A; 4O3O A; 4O3N A; 1VDV A; 1ZQF A; 1JIH A; 1BPB A; 2RP5 A; 3C2K A; 4UQG A; 4GXI A; 3I1Y A; 3JPQ A; 2DFL A; 1A76 A; 1HJP A; 3Q8P B; 3HP6 A; 1KFS A; 3HW8 A; 3MGI A; 3HIL A; 1QSY A; 4IQV A; 2KZZ A; 9ICP A; 5KFJ A; 4Z6D A; 2PFP A; 3RB6 A; 2Y9T A; 4O3M A; 3AL0 B; 1UA0 A; 4PHP A; 1SKW A; 4J9S A; 4ECR A; 2K4E A; 1ZQB A; 2AHO B; 4Y2U A; 5AKY A; 1DGS A; 1SXE A; 4P0Q B; 3HWT A; 3RJF A; 4DQP A; 2IHM A; 5K4L A; 5ALE A; 4M0A A; 3B0Y A; 4OJO A; 2FDR A; 4QIW F; 5KFP A; 4CGZ A; 5CA7 A; 1J2N A; 4M9L A; 1LV5 A; 3PR4 A; 2W04 A; 2G09 A; 3U26 A; 3PW2 A; 1JRO A; 4RQ6 A; 2W8L A; 4QZC A; 3C23 A; 5KFD A; 1IIP A; 4KLS A; 3N7R C; 2YMP A; 5III A; 1YT3 A; 4ED1 A; 1Z19 A; 5BPC A; 4J9R A; 2QB1 A; 1KW4 A; 3FDS A; 4M9N A; 1LB2 B; 4I2D A; 4F3O A; 2OHF A; 2AGP A; 3NTU A; 1MSW D; 1COO A; 1KFT A; 3HRD D; 4Y2T A; 2DPJ A; 3EW9 A; 3JPS A; 2AGQ A; 3CYM A; 3K1R B; 2YML A; 5AM0 A; 2E8M A; 3JPP A; 5KFZ A; 4R65 A; 2F8K A; 1DOQ A; 3ETR A; 3GZF A; 1V38 A; 3MC1 A; 2EZY A; 4RPZ A; 2KV2 A; 3C1Z A; 1FFV A; 4M6W B; 3J81 j; 3F2B A; 4YP3 A; 1ZQO A; 5KFF A; 2HBM A; 4EEL A; 2K8A A; 3C5F A; 1KEJ A; 4NXZ A; 1U45 A; 2O6K A; 5KFE A; 2Y0S C; 4KN4 A; 4ACO A; 1UPH A; 3HX0 A; 1ZQP A; 3TAD C; 2WAQ F; 2A1J A; 2JV3 A; 3IN5 A; 3ONN A; 1QQ7 A; 1PVP A; 2H3I A; 2Q4T A; 2J6T A; 1X9X A; 3DDH A; 1J2M A; 3QZ8 A; 7ICV A; 1MN8 A; 3QUC A; 2ZXH A; 4RU9 A; 1N62 A; 1ZRN A; 3RBD A; 4NV0 A; 8ICJ A; 4NLB A; 2LYB A; 2D3D A; 4UAS A; 2H3F A; 4UAT A; 1ZQE A; 3V7J A; 1L7O A; 4C7Y A; 5JTI A; 4I2C A; 2F1H A; 1YZ6 A; 1D9D A; 1V85 A; 5ALY A; 4R8U A; 1S5L U; 3M6K A; 1NKC A; 1K1S A; 5KFN A; 4I2B A; 1TKD A; 4IS7 A; 2OCE A; 4BJQ A; 2EQY A; 3WK9 A; 4DSJ A; 2HVI A; 2JHD A; 3RJE A; 2ZUD A; 3JPO A; 5J8Y C; 2CRX A; 5ALQ A; 4KLO A; 4ECY A; 2PFO A; 3UXP A; 1JN3 A; 2Y9U A; 5L1M A; 2A1J B; 1JI7 A; 1XS9 D; 5J0T A; 4B9S A; 2G5I B; 5KAI U; 2F2A B; 3UQ2 A; 4YMO A; 1XWL A; 2VA3 A; 4KLQ A; 1L5U A; 2I9G A; 9ICL A; 1H38 A; 2IHN A; 5AKG A; 4O3P A; 2C28 A; 5AKZ A; 5AIC A; 3KZI U; 5ALO A; 1NI3 A; 3MGV A; 1KKX A; 3KHR A; 2IOH A; 4TQR A; 4RZR A; 3T79 A; 3AM9 A; 3NVZ A; 3BQT A; 4B9V A; 1N56 A; 2KFN A; 2I1Q A; 5HR6 A; 2XI9 A; 2UVU A; 3M6Z A; 2XGP A; 4F4X A; 4R8U B; 2KIC A; 1D8B A; 2P6R A; 3BS5 A; 3IG8 A; 3LDA A; 1ZQI A; 2JH1 A; 3WK6 A; 5A0L A; 2WF6 A; 4F2R A; 4RQ8 A; 2OXO A; 2H3Z A; 3QEA Z; 2KN7 A; 3KBB A; 7ICR A; 3PO5 A; 8ICX A; 4B9M A; 2CXY A; 9ICT A; 2HBL A; 3I76 A; 3HT3 A; 4K4G A; 2E8O A; 9ICS A; 4XRH A; 3ORY A; 5AIA A; 3BQ0 A; 8ICA A; 8ICN A; 5KG3 A; 5CHG A; 2PI4 A; 4IL6 U; 4DL3 A; 3F2C A; 1ZRM A; 5IIK A; 3CNH A; 4C80 A; 2F1I A; 3ZDC A; 4B9L A; 2XY5 A; 2GOL A; 4I2E A; 2G06 A; 1S9F A; 1WCL A; 5DBC A; 1SL2 A; 4YD2 A; 1TAQ A; 5AM3 A; 3WK7 A; 2HHQ A; 3PVX A; 1NKB A; 2R8K A; 3K75 D; 5G5H A; 9ICJ A; 5AM4 A; 2MA1 A; 4LZD A; 1BVS A; 4JV0 A; 1Q3V A; 2J6U A; 2KKV A; 2FJ6 A; 1S77 D; 4UAR A; 3TAD A; 3H4D A; 4I2I A; 8ICG A; 1ZQJ A; 2N1R A; 4F91 B; 2W3S A; 5H2F U; 4ZOH C; 3EZ5 A; 2F76 X; 1DK3 A; 5DQI A; 1BNP A; 5J0Q A; 2UVV A; 3BQ7 A; 2HSZ A; 1QLN A; 2I6X A; 4RQ7 A; 5IIN A; 4GFJ A; 4QZD A; 5DQH A; 5TZV A; 1X6I A; 3NVW A; 3IG5 A; 4Y2J A; 3RJG A; 3IM1 A; 4XQ8 A; 3QXG A; 4ECT A; 1XNS A; 9ICX A; 3TKA A; 2LM1 A; 3M7D A; 1U48 A; 3MR5 A; 3RJJ A; 9ICB A; 3AN1 A; 2KTQ A; 2VA2 A; 2W9C B; 3AU2 A; 3PX0 A; 4RNO A; 4J03 A; 4IRD A; 5AK4 A; 7ICT A; 7ICI A; 3EWA A; 2ZUB A; 2HHU A; 1NK5 A; 2ALZ A; 1ARO P; 3PW0 A; 1PVQ A; 4JMU A; 1X66 A; 8ICF A; 3RR7 A; 2JMG A; 1WYG A; 2KIW A; 2YY6 A; 4JWM A; 3H0R B; 4B9U A; 1T3N A; 4NLK A; 5AM5 A; 5J8Y A; 3JPR A; 4KLI A; 4DS5 A; 4YMN A; 3LVV A; 2KFZ A; 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4DQI A; 2W9B A; 3TFS A; 3M8R A; 3MDC A; 1AQ6 A; 3QX7 A; 5L1L A; 9ICK A; 5KTQ A; 1LKY A; 1B0X A; 3G6X A; 5EE9 A; 4P0P B; 3D2S A; 3WKC A; 2ZIW A; 4I28 A; 5EWE A; 2LPE A; 2HHW A; 4RNN A; 1D8Y A; 3SMV A; 4RQ4 A; 1RQL A; 3CRX A; 3TAQ A; 5KFQ A; 1MQ3 A; 2ZTD A; 5EWG A; 1SV4 A; 5AKK A; 2ZG6 A; 4QWA A; 9ICG A; 2RDI A; 4G3I A; 5KFS A; 3V7L A; 4OJ5 A; 5J0Y A; 9ICC A; 5DGB A; 2K89 A; 3KKA C; 5D4B A; 5J0P A; 3OHA A; 1D8L A; 2W3R A; 5CEH A; 4GLX A; 4ELT A; 5ALH A; 5CP2 A; 4Q8F A; 2OM6 A; 3MAB A; 4BDP A; 5J0O A; 1L8L A; 3UMB A; 4FBU A; 1JX4 A; 5DLG A; 1RYU A; 3V7K A; 1KFD A; 3UPQ A; 3GIK A; 3AEV A; 4PGQ A; 5AI8 A; 4ICA A; 7ICK A; 4UB3 A; 5KFR A; 4P4P A; 1Z1B A; 1ZQC A; 1LKY B; 5KFI A; 4PH5 A; 2B6G A; 4I27 A; 2LKY A; 3RAQ A; 5L9X A; 3ZD9 A; 4YQW A; 4F4W A; 2NV3 A; 2E8N A; 3H8J A; 2WF7 A; 5KFK A; 3LK9 A; 3DV9 A; 9ICE A; 4ED2 A; 3KOO A; 7ICJ A; 1TFR A; 2FLP A; 3N28 A; 1LVH A; 4NL9 A; 5D46 A; 5J2C A; 2ZUC A; 2KSO B; 3ISC A; 5KG5 A; 1Q8K A; 4ECV A; 5ALJ A; 3C5G A; 4NLN A; 3EYZ A; 4QWB A; 5EOZ A; 4Y2P A; 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