1MSSA

Large scale structural rearrangements of the front loops in monomerised triosephosphate isomerase, as deduced from the comparison of the structural properties of monotim and its point mutation variant monoss
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTSSHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title Three new crystal structures of point mutation variants of monoTIM: conformational flexibility of loop-1, loop-4 and loop-8.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 91
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mssA00
2X1SA 2ISVA 2RHGA 3SW6A 5AB3A 5LNVA 4ZVJA 4AWUA 5K4XA 2B7OA 4M6QA 5CSRA 4R33A 2JGQA 1ZFJA 2NV1A 4UTIA 3QPZA 3LCWA 1P5BA 5F2MA 4AHQA 3A22A 2H6RA 2F7FA 3NA8A 4JEQA 4WUIA 3QYQA 1O5KA 4O17A 5AC7A 5AYXA 3DHDA 1YXCA 4PC8A 1TJRA 4Y9AA 4YLWA 1TPVA 1FCUA 2JGYA 2A0NA 2WNNA 2ZTJA 3F4NA 4QQ3A 2QCMA 4TMBA 4Y96A 1UUOA 1LLWA 1A50A 2Z0IA 1W0MA 2WQPA 3LI0A 3CTLA 2EKCA 3LHZA 3ABOA 1K03A 3SGZA 3T55A 5HWMA 4OBTA 2C0AA 1XCFA 3GLCA 4QISA 5BMXA 2ZZ6A 3STGA 4EF8A 1P4CA 2E5CA 3LV6A 1S5TA 4C1LA 4LY8A 2NXHA 1X6UA 5C54A 5LNRA 4MYXA 4XWUA 2C3ZA 1FXQA 1KV8A 1TPDA 1ZNNA 3PB2A 1YPIA 1QFEA 1KLZA 3HJZA 3O15A 3QSTA 3NAVA 4PODA 1G67A 1LOQA 1P0NA 2V5BA 3MYPA 4N9DA 4CCCA 1TPH1 5D38A 2QF7A 3W1UA 5DXYA 3W7PA 2A2IA 3BPWA 5LGXA 3TV8A 1EP3A 3KX6A 2J9YA 3QRHA 1G7UA 2CFFA 3EWUA 5J5DA 3UXAA 3TAOA 3PG8A 3W9ZA 1SSDA 3LCHA 2CLMA 5LGZA 1YPFA 3CEPA 4O1BA 3FKKA 3DAQA 3DFNA 4FHAA 3LRLA 3WJZA 1JRCA 1OYAA 4O57A 3FLUA 1VLIA 2V2DA 1AL8A 1EUNA 3A5VA 4X3ZA 4ADTA 3B8DA 4IPIA 2HTMA 5HINA 5DCEA 4E38A 2EF9A 1IIHA 3O05A 3M44A 4BWLA 4FB7A 4UTUA 1OF8A 3QC3A 1E51A 1H7NA 1GJPA 1QPRA 1SUXA 3KRSA 1H50A 1UASA 4G1KA 5G5IA 5CPLA 2E6YA 3KRZA 4IUOA 2FLIA 2Q8LA 3C8FA 4AVFA 3TSMA 3G24A 4HN4A 1YXYA 3BLEA 3N9RA 2QCLA 4LVDA 1XM3A 1JRBA 3KVKA 4MOZA 3DI0A 2NX9A 5AN7A 4AWSA 1FY6A 4MLRA 2CU0A 4UTTA 1GOXA 3NPXA 4N4QA 1TV8A 2FDSA 4JTHA 4BI6A 4O8RA 3O6CA 1XDLA 1AL7A 3ABQA 1R2SA 1VCGA 5IM51 1XUZA 2D73A 4IPJA 2VFEA 1TTIA 3T44A 4NZJA 1QMLA 4FNTA 3CPRA 4NJHA 4PTNA 1GG1A 4XKYB 4FNRA 4FNUA 4O28A 1HFBA 4ADSA 5CZ0A 2VC6A 5HUOA 1C8VA 4CLMA 1DL3A 2Y6ZA 2AGKA 4MY9A 2QCGA 4XZ9A 3HPXA 3W84A 3S5ZA 2QDGA 3V75A 2A7NA 4MKNA 3N3MA 4CCEA 1W5NA 5KMYA 2ZCGA 2QDHA 2P0OA 4OV4A 4RKAA 3EX1A 4IGHA 4JY8A 2E6AA 3W2NA 5I3JA 4NXKA 4UR7A 3W7QA 1GT8A 4L4LA 1J4EA 1Z41A 3NDOA 4PL1A 3W7RA 5CG7A 1XBXA 1JCXA 2FIQA 4NZFA 1KM2A 4MFEA 1K8XA 2JK2A 4UIOA 3MI3A 4IQLA 4JYFA 3FYPA 1XC4A 1LCOA 1Q6RA 3A9IA 3PSWA 1DJNA 4JX4A 1KM1A 1G7VA 4OT7A 1YXDA 4MIMA 2DU2A 3HG5A 3NXFA 1SZNA 3MUXA 4UFLA 2FB3A 3PBUA 4UFJA 3N2XA 3UD6A 2GQAA 3UXDA 1EA0A 2HMCA 4AF0A 1KM6A 4UNLA 1GVSA 1GQNA 1J2WA 4FXSA 4LS0A 1SSGA 1R2TA 4NXSA 1QR7A 2ATSA 3W73A 2V0TA 1W1ZA 3W1AA 4D2JA 2BXVA 1KA9F 2DZXA 2CLIA 3L0NA 3IIPA 5DBTA 4NJIA 4M19A 3UZJA 1FWTA 4S2CA 2PRMA 2R14A 2VENA 4TMCA 5KZEA 5LZLA 3NPVA 3GDTA 1FCBA 4WOZA 4RXFA 1I2RA 3C2EA 4HNTA 8TIMA 3QQ0A 4TX9A 4UFKA 1SO5A 1OX4B 2ABAA 2VFFA 4OQVA 3T78A 2PE4A 4UTMA 5AHMA 1ICPA 4FX8A 3JRKA 3RNDA 4O52A 3TU9A 4DEFA 2I9EA 1VPXA 3S8HA 2YSWA 1TB3A 4GUJA 1TYGA 1X8FA 1WOBA 3L9CA 1F7BA 5D33A 2BX7A 4JTFA 4A2SA 4H6KA 1C9DA 3CLMA 3UY8A 1LBLA 3EWWA 3PM6A 2ALDA 2PRHA 5A8GA 3N73A 4OHQA 1IXNA 4GWEA 5LNWA 1GVFA 2RFGA 5CPOA 5D2XA 3WK2A 1VHNA 2E5BA 4OWGA 2QR6A 3LM7A 1D9EA 3IIXA 4Z1AA 2TYSA 2C16A 3UWVA 3L66A 5AOUA 3G1DA 2X30A 1PCWA 2Y62A 4Z1CA 3ABRA 3IGXA 4HNUA 3MJYA 2YZRA 4PA8A 2ZZ1A 3INPA 3FOKA 3CEUA 1VQTA 1LOSA 3LXAA 4FXRA 4LUJA 5T26A 2V81A 4EIVA 1T99A 3G8RA 1FWNA 3W7CA 1JUKA 1OK6A 5BOOA 1NEYA 4JDBA 2XN1A 3P82A 4IX2A 3LTPA 2QUUA 4M7SA 3W2UA 4OV9A 4UTKA 2Y70A 4K8HA 3TSBA 3TQ0A 4UCGA 4S1FA 2GQ8A 3TX9A 5DLCA 2TMDA 5D37A 1QAPA 5DXXA 4GJ1A 1DORA 1FXPA 3S1UA 3W85A 1LDCA 3HPZA 3KAOA 4QITA 1YADA 3H54A 5GVJA 1RVGA 2BWGA 3VCRA 3ELFA 2DJLA 1UUMA 4KWWA 3QJAA 3EX4A 2E1DA 4UFMA 4QAIA 3BGGA 3L21A 2QCNA 2HS6A 2XN2A 3SI9A 2VOMA 5BNKA 1WAUA 3M5ZA 4I9AA 1LOLA 1GYNA 1NSJA 3JR2A 2WSRA 4QM1A 4AWTA 5KSWA 1K7XA 5BW6A 2V2CA 3GKAA 5EY5A 4Q32A 2R91A 1FDYA 5DY3A 3UPWA 5I3KA 5HWNA 4DF0A 4WQ6A 5C6MA 4M5PA 3BW3A 1R30A 1SW7A 3R89A 4MZYA 3TK7A 2ZA1A 1PHQA 2NX3A 2OCZA 1KM0A 5AYYA 4RCXA 1NF0A 3HGSA 4KFOA 2CZFA 4HSOA 3STCA 5HR7A 1PVNA 3MI2A 4AH7A 3AO0A 3VE9A 4JTUA 5SWUA 1SW0A 4N6FA 3TA6A 5EKYA 3DHFA 3G3DA 5AC6A 3RU6A 3W1QA 3CM4A 3E49A 4WY0B 1WBHA 2Z6IA 1L6SA 4RX0A 1S5VA 3DKLA 3P80A 4O13A 1W37A 3EWZA 3FIGA 3NPWA 4JR5A 4ADUA 1A53A 3STFA 1ZAHA 4LT9A 3BW4A 2C13A 3MW7A 4RV8A 3G0UA 5C55A 4HNNA 5C2XA 1ICQA 2AQWA 1TREA 1JUBA 3TC7A 2C6QA 1QPOA 4A3UA 3GZ3A 3LTYA 4ZQPA 2VXNA 4CQAA 1KV5A 3JS3A 2BTMA 1N8FA 3B05A 3LCIA 1KTNA 3M16A 1QOPA 1OFDA 4WXZA 4RXGA 2Y61A 2QCFA 3GX9A 1WOAA 5K9CA 2H3DA 5FI8A 3W2LA 4MVAA 2Z6JA 2A7PA 3DH7A 4O16A 1H7RA 2QJIA 3FS2A 1ME8A 1T8XA 3LLFA 3I7SA 3MI6A 3BW2A 3TJXA 2QCCA 1HTIA 1OYBA 3HBLA 1VYPX 4JD4A 4NQ1A 1I2QA 4JGDA 4DO4A 3S6DA 2BSLA 5D32A 4YL2A 4CQ9A 1MEWA 1H1ZA 1RQHA 3QEZA 2VFHA 2DP3A 1K3UA 1W5MA 3P8JA 2ZA3A 4RZ4A 2VKZG 2PCQA 2JKPA 4TU1A 3SR7A 4N9EA 2P1FA 1Z44A 1PL9A 2J24A 5KITA 3WFAA 4BI7A 1EEPA 1PIIA 2G5WA 3IIOA 3NYZA 4E2BA 1BWKA 4GE8A 2AAMA 2WNZA 3HG4A 3PWAA 5D2VA 4O4WA 2RDUA 3DU0A 1H7WA 2BZNA 4B5NA 4FF7A 4R7JA 1EWEA 3IV3A 2QKFA 1FCQA 2VEKA 5KZDA 2GUUA 1I2NA 3NL5A 5KINA 3CU2A 1OX5A 2DZTA 3TR2A 1MEHA 5KTLA 3CIWA 3W7DA 3NM1A 1JCJA 3OVQA 4LVAA 2I1OA 4BR1A 3VNDA 2ZYFA 3IVUA 4I7UA 1Z48A 1O4UA 3Q37A 3HG3A 2J9ZA 1D3GA 1KFEA 4DBDA 5MHBA 2ZRYA 2Y88A 1HUVA 1FWSA 4BFAA 2DORA 1I45A 3QF0A 3KRUA 4OE7A 3PUEA 1KBJA 5CPMA 1UJPA 1F6KA 3C2VA 1BEUA 2PRLA 1ZHAA 4N4PA 1QDSA 2QJHA 1R47A 1XKYA 5I3HA 2CLFA 2WNQA 3UNDA 4K39A 1W31A 4I7WA 5FEPA 3B04A 5ABTA 1GVRA 4FNQA 1MEIA 4BK9A 1NAL1 1XDMA 2DZWA 4GRSA 3B06A 3TAKA 1X1ZA 3V1PA 2PURA 3O63A 4XKYA 3LHWA 4JYEA 1B57A 3OBKA 3Q2DA 4UXDA 1LORA 1ZAJA 4KWVA 4NNAA 4IWWA 4Z1BA 1G69A 1G4PA 3M47A 5AHIA 3O16A 3BV4A 1OFQA 2GQ9A 4O4VA 3I7RA 3R5EA 3TCEA 5F1VA 3UPBA 3MP3A 4A2RA 2WKJA 1KFJA 4LV4A 3S42A 3C2RA 3W71A 3M9YA 4P2VA 1JQXA 4I7VA 2V2HA 2JBMA 5HJLA 3PVFA 4UMBA 1H7PA 5BMWA 4ZQNA 2YYTA 5HULA 2GPTA 4MLJA 3M7WA 3H53A 4K8EA 3P84A 4X22A 2C14A 3W6YA 3EX2A 2ZBTA 3I68A 5FEWA 1EX5A 3GVGA 1H7XA 3LHUA 3KXQA 2GVGA 3GDRA 5K4ZA 3EB2A 2V9DA 5DBUA 3VKJA 1H7OA 3TNOA 1PHWA 3P74A 4OU1A 4DXVA 1ZAIA 3TQKA 4N9CA 3THAA 1QPNA 2I14A 1GTHA 3DFQA 5LHFA 1LM1A 1TPB1 2WPBA 1TTJA 1F73A 4POCA 3GR7A 3S5YA 5FEZA 5EBUA 3W7GA 3MHGA 4HPXA 4Y8FA 2E5DA 3G0SA 1MO0A 3G1VA 4NUWA 4UR8A 5FEXA 3GNNA 3U2OA 1SZGA 4AHPA 2CLOA 5K9DA 3RMJA 4A21A 3G1XA 5F2GA 3P61A 4PCFA 3BVJA 3C2OA 1M5WA 4N2YA 4LVFA 2C15A 2GOUA 3EX6A 3SSJA 1O95A 3NR0A 4IMDA 2YCEA 4O1DA 2WOQA 4FNSA 1JVNA 1OF6A 3N14A 3S5NA 1WX0A 3NOEA 3TIMA 2FPYA 1OX4A 1N55A 4QSHA 1F6PA 4ALDA 1F76A 4NX5A 1R46A 1H51A 3IRDA 4JXCA 4WD0A 1SZFA 2ISWA 5HR6A 2OT0A 2QCHA 4RZ5A 5CZSA 4WZHA 2YPIA 3BARA 3W72A 4IXHA 1SO6A 3W83A 1DVJA 1VS1A 4WY0F 3B0VC 4ICNA 1AW5A 2VFIA 1TPC1 1W56A 3GXTA 2VFDA 3E9AA 1UB3A 2E09A 3GIYA 1XUUA 1XL9A 3UZ5A 3O1NA 1ZJIA 3G1HA 3WJYA 1MSSA 4NNCA 1MZHA 1WYIA 2CZEA 4NJJA 1H1YA 2XFWA 2DZPA 4PFMA 1JJKA 3MYOA 5CGQA 3GYEA 3RK8A 1I2OA 2VELA 3EKZA 1QNVA 4JY9A 4ZMGA 4TR9A 4UFHA 3GKFA 1B4EA 2FPVA 1ME7A 3LI1A 4A29A 4ORIA 1SFJA 4DPPA 4O50A 5LNUA 2QUVA 1WDWA 1TRIA 1OHLA 4LTSA 4YCOA 5DY2A 1F5ZA 1YDOA 1HO1A 3LTSA 3NQFA 4U28A 3STEA 1EPXA 3DFTA 3F1QA 4IMCA 1JCNA 2GVJA 4K6AA 2ZA2A 2GVLA 2W0UA 4K38A 3FEMA 3TROA 1SO3A 5FF0A 1KTBA 2QCDB 1LRNA 1SR9A 3WJWA 2ZZ7A 3O8AA 3CWOX 3MHUA 4MYAA 1W5OA 2OX1A 4Y6GA 5TQLA 1AW2A 3CIXA 3BLFA 3DGRA 3NGJA 4Q4KA 2XN0A 2A6NA 1TSIA 1XFBA 2ZRZA 2ZZ4A 3M43A 3W2JA 3GDKA 5D03A 3WK0A 3S1VA 1QPQA 4O14A 1PE1A 5D02A 1ZALA 4Z0SA 4M6PA 4MFDA 1TQXA 3QPYA 1OX6A 2V30A 1T0OA 1KFKA 1AK5A 5FF3A 2FQIA 3EXTA 1K7EA 2CZ5A 4WY0A 4W9TA 4JTIA 1TCDA 1THFD 3P5ZA 4UTWA 3F4WA 2QAFA 1H62A 2KZHA 3LHVA 3MHFA 4LOCA 5LSMA 1G4SA 1JCYA 4M6VA 1JCLA 3BG3A 3PB0A 3SGUA 4E0CA 3W3OA 3LV5A 1VC4A 1TPWA 3ANYA 1KW1A 3EWYA 2EHHA 3R13A 3LCGA 4MJZA 2Q3RA 3C52A 2FPTA 3LXCA 4RZ6A 3M1ZA 1SZEA 1O94A 4JIPA 3C3NA 4XQ6A 3S1XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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