1MUAA

Structure and energetics of a non-proline cis-peptidyl linkage in an engineered protein
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPALLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure and energetics of a non-proline cis-peptidyl linkage in a proline-202-->alanine carbonic anhydrase II variant.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1muaA00
3SBHA 1XQ0A 4K0ZA 4CACA 2NN1A 3R16A 4HF3A 4WW6A 3UYNA 3DCSA 4Z1KA 4FVNA 3DVDA 3K34A 1TH9A 3LXEA 1IF5A 4FRCA 4KNMA 3T82A 4E9OX 4FPTA 5EH7A 3KS3A 1HEAA 2WEOA 1I9QA 2HFWA 8CA2A 4Z1NA 2QP6A 4Q6DA 4Q7VA 2CABA 1TEQX 3KOKA 3MHMA 4Q6EA 3M04A 5E2SA 4ZWYA 3L14A 1HEDA 1CNYA 3W6HA 4KUWA 3P3JA 3KLDB 4RIVA 3P3HA 4QK1A 5FNKA 3V7XA 3CZVA 5AMGA 3NB5A 1I90A 1CAYA 1YDBA 3SBIA 4HEZA 5EH5A 1ZGEA 1TE3X 4IWZA 2NMXA 3S73B 5A6HA 4M2VA 3DAZA 1I9MA 1CNIA 3V3GB 1OKLA 4QJWA 3CAJA 4M2UA 5SZ0A 2NXRA 2OSFA 2X7SA 4YVYA 3MDZA 5DSNA 3D0NA 3RZ7A 4E5QA 1BV3A 1HCBA 2POVA 1G52A 4Q83A 4XE1A 4HT0A 1RAZA 4L5WA 1KWRA 4Z1JA 4YHAA 3RYYA 3BETA 3T84A 1HCAA 1FSQA 2OSMA 2WD2A 1RAYA 1BNVA 4KNJA 4PYYA 9CA2A 1ZNCA 2NWOA 3FFPX 2VVAX 3S71B 5BYIA 3HS4A 2IT4A 4Q99A 4QJOA 4Q7SA 2O4ZA 4QSAA 4XFWA 4Q06A 2FW4A 4R5BA 3CA2A 4PXXA 2FMZA 3M1KA 4FU5A 3D92A 4MO8A 2WEGA 1I9OA 3V5GA 1CA3A 3VBDA 3ZNCA 3P5AA 5FDIA 1CNKA 2CBDA 1UGDA 4BF1A 3DC3A 3D8WA 5JG5B 1BNTA 3B4FA 5EKMA 3RGEA 1FQNA 4Q08A 1I91A 1CRMA 3M1QA 3OYQA 1XEGA 1BN4A 1CVFA 3D93A 3BL1A 4YGNA 1TTMA 1V9EA 4HEYA 1TEUX 4LHIA 5LMDA 3U47A 4YYTA 1CRAA 2HD6A 3TMJA 3MNIA 1CVEA 5EOIA 3U7CA 5JDVB 3NJ9A 3IGPA 6CA2A 1HUHA 4R5AA 4WUQA 1H9NA 5HPJA 1MUAA 2FOQA 1YDCA 3P55A 5FL6A 5FLOA 5EHEA 1EOUA 3TVNX 3M67A 1BNNA 3MWOA 1JD0A 1CVDA 2VVBX 4XIXA 3IEOA 5G0CA 2AW1A 1I9LA 4RUYA 5EHVA 3HKTA 4YXIA 4E3DA 5E2NA 5FL4A 5AMLA 1G53A 4RFDA 1ZGFA 1I9NA 3MNJA 1THKA 1FR4A 3MYQA 3RYZA 4YX4A 4E3GA 1Z97A 4YGKA 1RZCA 3S77B 4MDGA 1ZFKA 1KWQA 1G6VA 3MHIA 3N0NA 2FNMA 5G0BA 2EU2A 4G0CA 5JG3B 2FOUA 5DSJA 4QSJA 1CNJA 5FNHA 3RJ7A 4ILXA 4CA2A 2HOCA 3FE4A 4E4AA 4Q9YA 4JSSA 1UGFA 5FLTA 1Z9YA 1ZH9A 3QYKA 4ZAOA 4CNRA 5BRWA 1ZSBA 1XPZA 3N2PA 4BF6A 1IF7A 5BRVA 1BICA 3UYQA 1CZMA 1UGGA 3IAIA 4CNVA 5CJFA 1HECA 2CBEA 4L5UA 1BZMA 4Q09A 5DSRA 3SAPA 1YDDA 2POWA 1JV0A 4R59A 4FL7A 2X7TA 4ZWZA 1CANA 3EFTA 4KP8A 1OKNA 4Q78A 4Q81A 3TVOX 5C8IA 1DMXA 4QEFA 2H15A 4RIUA 3S9TA 2NNSA 2WEJA 1G1DA 3M5EA 5DVXA 3KOIA 3V2JA 4DZ7A 3D9ZA 4E49A 1RZEA 4QY3A 1MOOA 3DVCA 4FVOA 4CNXA 4Q7WA 3RLDA 3JXFA 1UGAA 1CAZA 1URTA 2FMGA 5EKHA 3T5ZA 5SZ4A 4Q49A 3IBNA 4E3FA 3JXHC 5DSOA 3OY0A 3S76A 3PJJA 1UGCA 4Z0QA 4KUVA 2NWPA 1CINA 3DA2A 3V3HB 5DRSA 4YGLA 1LG6A 5FLQA 1UGBA 3P5LA 1CVCA 5CLUA 3DC9A 3T5UA 3MNHA 3HKUA 4YWPA 1G46A 3Q31A 1XEVA 5DSMA 4ZWIA 2H4NA 3F7BA 3MNAA 1H4NA 2Q1QA 5JEHB 1CCUA 1G4OA 1TG9A 4DZ9A 1RZDA 3DV7A 3P44A 3ML5A 1IF8A 3S72B 12CAA 1RZAA 1ZSCA 3MNKA 5FLRA 3R17B 3U3AX 1FSRA 1KOPA 1FQLA 2CA2A 5DOHA 2GD8A 1KEQA 4MDLA 2CBCA 1BNUA 1CNCA 3KKXA 3IBIA 5AMDA 3HLJA 4WUPA 1CNGA 4Y0JA 5E5RA 1H9QA 2W2JA 2NWYA 4MTYA 3FW3A 5EKJA 1BN1A 3RG4A 4E3HA 1BCDA 5BNLA 3M14A 4M2WA 1CCTA 1RJ5A 3OIMA 5FNJA 3M5SA 2ABEA 2WD3A 1F2WA 3S75B 1CA2A 1BNWA 5E5UA 3MHCA 4HEWA 5FLSA 4KNNA 4WR7A 2HKKA 2FOVA 3M2ZA 4YXOA 4KV0A 5SZ1A 1RJ6A 5IPZA 3CYUA 4PZHA 1CAIA 3HKNA 1J9WA 4ITOA 1G54A 3F8EA 4MLTA 3V2MA 1IF6A 1LUGA 5FNIA 3DCCA 2AX2A 2X7UA 3JXGA 5DSKA 5E2RA 3DD0A 4YXUA 1AVNA 3M3XA 5FNMA 1DCAA 1CAHA 3M1WA 1G48A 3OKVA 4PQ7A 4RH2A 4M2RA 4N0XB 4COQA 5DSIA 1HUGA 3V3IB 1HVAA 1IF9A 5E2MA 3RZ8A 1LZVA 3F7UA 1CVBA 3MNUA 3DBUA 3SAXA 1YDAA 4Q8YA 4QJ0A 3KIGA 7CA2A 1CVHA 3M2NA 2ILIA 3RG3A 1OKMA 4FIKA 1ZFQA 4Q0LA 4HU1A 3IBUA 4K0SA 4ZX1A 1JCZA 4ZX0A 4CNWA 2ZNCA 3N4BA 1YO1A 3OKUA 4QJMA 4Q87A 5CA2A 2FNNA 1TB0X 3M2YA 1RZBA 1G0FA 1LG5A 4UOVA 5JGSB 2EZ7A 4ETQC 1V9IC 5JEPB 5BRUA 2HL4A 1FSNA 4MLXA 1CAMA 1CAKA 5SZ2A 3M40A 1G3ZA 3N3JA 3DVBA 2POUA 4Q7PA 1IF4A 1G45A 3K2FA 1Z93A 5FDCA 1DMYA 5J8ZA 3M96A 1FR7A 4K0TA 3DD8A 2NNVA 5L3OA 2NWZA 4QSIA 2CBAA 1CCSA 4LP6A 1G4JA 1OQ5A 1CILA 5JQ0A 4IDRX 1T9NA 3IBLA 1FQMA 3S78B 4QSBA 4QIYA 2EU3A 3RYXB 1CAJA 5SZ6A 4RFCA 4QJPA 5E2KA 4KP5A 1I9PA 4JSZA 1YO0A 4JSAA 4RUXA 3DCWA 3M98A 4N16A 5E28A 3RYJB 5DSQA 2FOYA 3EFIA 3F4XA 4XZ5A 4JSWA 5EIJA 1BNQA 1CALA 1BN3A 4Q8ZA 4TWLA 1CVAA 1CAOA 2F14A 3HFPA 4TWMA 3T83A 3V3FA 1CNBA 1YO2A 3BL0A 3KWAA 2NNOA 3OILA 1FLJA 1ZSAA 4K1QA 4CQ0A 2CBBA 1DCBA 4Q8XA 5A25A 2GEHA 3KNEA 2Q1BA 3K7KA 2Q38A 3C7PA 4C3TA 1A42A 3MHOA 1CNXA 1I8ZA 1FQRA 4HT2A 4YGFA 4Q90A 5DOGA 3PO6A 4KNIA 4L5VA 3T85A 1BNMA 4JS6A 4ZWXA 5JEGB 3PYKA 3P58A 4PYXA 4Z1EA 5FLPA 1AM6A 1LGDA 1TG3A 3MMFA 2FOSA 3RZ0B 3RZ1B 4QK2A 3HKQA 1TBTX 5SZ3A 5L6KA 4GL1X 1ZE8A 5G01A 5JESB 1UGEA 2HNCA 4K13A 4QTLA 3M1JA 3S97A 1CNWA 3NI5A 4KUYA 4YGJA 2QO8A 3KONA 2WEHA 5SZ7A 5FL5A 4QIZA 4HBAA 4KAPA 4WL4A 4G7AA 5CACA 3M2XA 4LU3A 2NXTA 2QOAA 3ML2A 1KOQA 5DSPA 3RYVB 5EZTX 4ITPA 1G0EA 4QK3A 3MZCA 5FNGA 5JGTB 4QJXA 4RN4A 5EH8A 4BCWA 3P4VA 4Q07A 5G03A 3ZP9A 2NN7A 1HEBA 4X5SA 3W6IA 3OYSA 5SZ5A 1CIMA 4RUZA 3M5TA 3OIKA 2NNGA 3MHLA 3U45X 3B1BA 2NXSA 1Y7WA 3V3JA 5JQTA 1AZMA 3GZ0A 4MDMA 2FNKA 4XIWA 5DSLA 3S74B 1CNHA 3RZ5A 4WW8A 5EHWA 3S8XA 5FNLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SBH A;  1XQ0 A;  4K0Z A;  4CAC A;  2NN1 A;  3R16 A;  4HF3 A;  4WW6 A;  3UYN A;  3DCS A;  4Z1K A;  4FVN A;  3DVD A;  3K34 A;  1TH9 A;  3LXE A;  1IF5 A;  4FRC A;  4KNM A;  3T82 A;  4E9O X;  4FPT A;  5EH7 A;  3KS3 A;  1HEA A;  2WEO A;  1I9Q A;  2HFW A;  8CA2 A;  4Z1N A;  2QP6 A;  4Q6D A;  4Q7V A;  2CAB A;  1TEQ X;  3KOK A;  3MHM A;  4Q6E A;  3M04 A;  5E2S A;  4ZWY A;  3L14 A;  1HED A;  1CNY A;  3W6H A;  4KUW A;  3P3J A;  3KLD B;  4RIV A;  3P3H A;  4QK1 A;  5FNK A;  3V7X A;  3CZV A;  5AMG A;  3NB5 A;  1I90 A;  1CAY A;  1YDB A;  3SBI A;  4HEZ A;  5EH5 A;  1ZGE A;  1TE3 X;  4IWZ A;  2NMX A;  3S73 B;  5A6H A;  4M2V A;  3DAZ A;  1I9M A;  1CNI A;  3V3G B;  1OKL A;  4QJW A;  3CAJ A;  4M2U A;  5SZ0 A;  2NXR A;  2OSF A;  2X7S A;  4YVY A;  3MDZ A;  5DSN A;  3D0N A;  3RZ7 A;  4E5Q A;  1BV3 A;  1HCB A;  2POV A;  1G52 A;  4Q83 A;  4XE1 A;  4HT0 A;  1RAZ A;  4L5W A;  1KWR A;  4Z1J A;  4YHA A;  3RYY A;  3BET A;  3T84 A;  1HCA A;  1FSQ A;  2OSM A;  2WD2 A;  1RAY A;  1BNV A;  4KNJ A;  4PYY A;  9CA2 A;  1ZNC A; 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