1MWMA

Parm from plasmid r1 adp form
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
316
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 316
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwmA01
4JHDA 1DKGD 4PKHA 3R6MA 4PL7A 1NGGA 3BEXA 3BUZB 3O5BA 2Q97A 1TUYA 3ZX3A 4BC5A 2A40A 4XH1A 1G99A 5CE3A 2YHYA 3HTVA 5KPZA 5AQWA 2D4WA 3LL3A 4QS9A 3O4WA 3UKRA 1NGHA 5AQLA 2GUPA 3WXJA 1V4SA 2Q31A 2DPNA 1C0GA 3O80A 4CZIA 5FPEA 5KQDA 3ZETB 2QWLA 4A62A 1JCGA 1QZ6A 5AQPA 2FSKA 2P9SB 4MLHA 2P9LB 3FZHA 2D0PA 2ZGYA 1HKCA 1R59O 3AY9A 4JNEA 5FPMA 5AZIB 4B1XB 2GTDA 2NLXA 3VF6A 2P9NB 4K42A 2Q36A 2IVNA 4RTFD 4IWVA 2D0OA 4CI6A 2WUSA 3EN9A 3UE5A 5F2RA 2E2QA 3FR0A 5BR9A 4PKGA 1S22A 2V52B 3WQUA 3W3DA 1X9JA 2CGJA 3D2FB 5AQSA 3I33A 2V7ZA 2P9KA 4GNIA 4BC2A 2HMPA 3GDQA 3D2EA 2YJEA 3H3NO 1NWKA 3BF3A 3VF2A 1DEJA 5F0XA 2FSJA 4M7YA 4JD2B 4BR0A 4FWRA 1ATNA 2BUPA 3FE1A 2W40A 5AFUH 2Q1NA 4PKIA 3DXKB 2YHXA 4WQ4C 2QM1A 4MLEA 3FFKB 1Z05A 3L6QA 4WQ5C 5LJVA 2V51B 3BF1A 3G25A 3CETA 5BRDA 3VGLA 4H0YB 4RWTA 3ID8A 3VERA 4ISFA 2UYTA 3GL1A 2AP1A 5AQHA 4CZLA 4M7XA 1HUXA 2YI1A 2I7NA 2ASPA 3LDNA 5AQJA 3RSEA 2Q0UA 1V4TA 4FOIA 3ULEB 2BTFA 5BRFA 3LDQA 4CZEA 2FXUA 2W41A 3ZX0A 3ATUA 2CGLA 4B9QA 3CHWA 4CZHA 1IJJA 1ZXOA 1NGCA 1WUAA 3H1QA 3A5LC 4K43A 1WOQA 3L4IA 3O1WA 3R8EA 4PL8A 1BA1A 3VEWA 4YDUC 2VCPA 4DQ8A 5KQ8A 2ITMA 4H5RA 4FO0A 3LDOA 2A6AA 5E84A 4A61A 4O8KA 4BRIA 2PBDA 4CZJA 1NGBA 3H45C 4FWQA 4BGBA 5ADXA 1HPMA 5EY4A 1HX1A 3VEVA 5AZJA 4H5VA 2FF6A 2P9UB 4DHYA 3MN6A 2E2OA 4EHTA 2D1KA 4JN4A 3CJ9A 4BG8A 1KAYA 4E1JA 3P4IA 3FZMA 5AQKA 4H0OA 4O5FA 4F9OA 3LM9A 2CH6A 4KBOA 5AQQA 5KPRA 4NO7A 4H0VB 1T44A 3FLCO 3M1FA 4BRQA 4HWIA 3OHRA 3JXUA 1QQOA 1C0FA 4XEIA 2HF4A 3QFUA 1ZC6A 2HF3A 2QWQA 4BR7A 4JAXA 5JICA 3IDHA 2P9IA 5I9EB 3A0IX 3EO3A 3SJHA 4M63C 1BG3A 1GLFO 3CJ7A 1MDUB 3IUCA 4FWLA 3MMVA 4BVOA 3H6EA 4CZMA 1QHAA 3C7NA 3B8AX 1J6ZA 3QBWA 3EKUA 1BO5O 5AQFA 3WEEA 3CIPA 3FZLA 3DAWA 5E26A 5F1XA 1KXPA 3UB5A 1LCUA 3EL2A 4H5TA 3DXMB 3WT0A 5EOYA 2F9WA 1T6CA 3CJCA 3O6WA 4BR9A 4DB3A 1SZ2A 3H46O 2I7PA 5AQXA 2QWNA 3QB0A 2HOEA 4A2BA 2J4RA 2ZGZA 5AQOA 4RCHA 3VOVA 1E4GT 4I6MB 1GLJO 2EWSA 4FOEA 4B1UB 4ISEA 1BWFO 1P8ZA 4H5WA 3JS6A 5BREA 3WXIA 3W0LA 2P9LA 3WXKA 3FZKA 3MDQA 1TYQA 2CH5A 3SK3A 1CZAN 3O8MA 1NGAA 3LDPA 4BQZA 4XH4A 3RSEB 5BPNA 2E20A 5AQZA 3U9ZA 5ADXH 2V7YA 2ZWHA 3GBTA 5BN9A 4FWSA 2IVOA 4MO5A 3ZX2A 3QFPA 4BRGA 2VYPA 1BU6O 4BC4A 2A5XA 4GY2B 1Y64A 5AQMA 3D2FA 2QW9A 3MK6A 1YXQA 3LM2A 3GOIA 3EKSA 3U8XA 5AR0A 1U2VA 3HZ6A 2H3GX 4K41A 3UKUA 4B1YB 3CI5A 2IIRA 1TUUA 3H1VX 3HSCA 4BRHA 4BVPA 4EHUA 3VEXA 3IFRA 4CBXA 3HM8A 1NM1A 3FZFA 4NB4A 3VESA 4QS8A 1NGJA 3DXKA 4FWPA 2QWRA 4B1WB 4XH5A 5BPLA 1E4FT 3ZEUB 4AM6A 4ISGA 1QZ5A 2P9PA 4EAHD 3QDKA 1RFQA 2FF3B 2E8AA 3S41A 3A5NC 4FWMA 1SAZA 4JHDB 3SMPA 1LOTB 3ENHA 4BRNA 4CD3A 3EZWA 4BRPA 1H1VA 1KAXA 1U6ZA 3F9MA 3VEOA 4BG9A 5FPNA 4LC9B 2YCHA 1GLCG 3ENOA 3ULEA 4BR2A 3VENA 4K25A 4B1VA 3UKRB 4C23A 1D4XA 1YAGA 1BOTO 4CD1A 5LY3A 5AQTA 4HTLA 1HKGA 3O08A 5ELZA 1DGKN 5AQVA 3SMSA 5AQNA 3HI0A 2A41A 4BRAA 1ESVA 3CJ1A 1XUPO 1HLUA 4IXCA 4EFHA 4H0XB 3WEEB 4FPBA 4BR5A 4J8FA 4BRMA 4FWKA 4B1ZA 5TKYA 4BR4A 2ASOA 3A5OC 3KVGA 4AM7A 1YVNA 5JLHA 1GLBG 2VWBA 4CZFA 4MO4A 2QWPA 4CJ7A 1QQNA 3BP8A 4L3QA 4BC3A 1MWMA 2P9KB 4IZ9A 3VEZA 2P9UA 4CBWA 1GLEG 3AAPA 3D2EB 4QS7A 3R9PA 1RGIA 3QMLA 1BUPA 2GELA 4H03B 3VEYA 1K8KA 5AQRA 3M6GA 1NMDA 3J8AA 3VGMA 3U4LA 4WQ4A 2GWJA 3I8BA 3QBXA 3TU5A 3VF4A 1TYQB 3CJBA 3HBTA 2QWMA 4WQ5A 3A5MC 2ZF5O 1NGEA 2FSNA 4H0TB 3ATVA 3ZETA 5LJWA 1GLDG 1NBWA 5EVZA 1GLAG 4BREA 2QXLA 2IVPA 2P9SA 1BA0A 3WUHA 5AZIA 1X3NA 5AQGA 2P9NA 4BRLA 4IJAA 1MWKA 2YHWA 4FSVA 5EXWA 1JCEA 1U2VB 2OANA 1QQMA 3SLCA 3UKUB 4CBUA 4DCHA 3MN5A 1GLLO 3DXMA 3WQTA 1NGFA 4FL9A 3CQYA 4BRCA 5AQUA 5AQYA 3AAQA 1SQKA 2E2NA 3DWLA 1HKBA 4YDUA 4CZKA 4FPAA 1YUWA 4BQLA 3H3OB 4IO8A 3O1BA 3VETA 1XQSC 1Q18A 3KHYA 4H5NA 4I6MA 2NRHA 2CGKA 4WYBA 2GEMA 2P9PB 3A8YA 2YJFA 4JD2A 3M3ZA 1XC3A 2QWOA 4A2AA 3GG4A 2KHOA 3CQXA 2E1ZA 3QICA 3IMXA 5FPDA 4BRKA 3MN9A 5AZJB 1NGDA 1IG8A 2A3ZA 3CJAA 3FGUA 5AQIA 2Q0RA 1RDWX 5B8HA 5BN8A 5JMVA 1HJOA 2NZTA 2A42A 5JLFA 3VPZA 3GE1A 3MN7A 2E88A 5KPTA 2AA4A 5BRHA 1EQYA 1S3XA 2P9IB 3AARA 3L0QA 5AFUA 3C0BA 3U9DA 3MCPA 2F9TA 1ATSA 2E2PA 1NGIA 1X3MA 1NLVA 3KZBA 2FLOA 1OKJA 4H0PA 3C7NB 4CZGA 4BRDA 3CERA 1MA9B 3LDLA 5EX5A 3WXLA 4Y0WA 3ZEUA 2PAVA 4BGAA 2E1YA 1T6DA 3D7EO 3TPQA 4BROA 4FWNA 1JCFA 2Q2RA 4EIAA 4Z94A 1BDGA 2ASMA 2GWKA 4FWOA 1ATRA 1K8KB 3DJCA 4IJNA 1KAZA 3VGKA 1ZBSA 5BPMA 1Z6RA 4BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FZYA 4LF7K 3MWTA 2O4GA 4JHDA 2E4LA 4JRQA 1NGGA 3BEXA 3BUZB 3O5BA 4JYAK 2A40A 4YOXA 3ZLJA 3SPYA 3SZ2A 5AQLA 2DY4A 1RDUA 5FPEA 1C0GA 3O80A 4A5BA 5KQDA 2VWKA 2QWLA 4A62A 2FSKA 5LL6Z 2P9LB 4JNEA 4DFPA 3CCEN 3G71N 3D0PA 3B6OA 1Q8IA 3TTDA 4CFBA 2NUBA 2IVNA 5M1PA 4KPYA 4CI6A 3TAFA 1WBBA 3EN9A 3OVNA 3UE5A 1HPZA 3I0SA 2E2QA 4EP5A 4DS5A 1T03A 3T1HK 2UU9K 1TL1A 4GV9A 4BC2A 1HR0K 3AVBA 5C25A 3LWLA 2YJEA 3H3NO 1NWKA 3DLGA 4O8UA 3D6RA 4CGHA 3HOSA 4BRFA 3HRGA 4CJ4A 4M3TA 1BGXT 4JD2B 4BR0A 1ATNA 2BUPA 5AFUH 3PUFA 3DXKB 4J2DA 4CECA 4MLEA 1IH7A 3FFKB 4OKKA 1Z05A 3L6QA 1XMQK 4W5NA 3BF1A 4H0YB 4KRFA 3ID8A 1WB9A 3CCLN 4CK2A 2UYTA 5AQHA 3KKRA 4CZLA 3SAHA 3T19A 2YI1A 4N5SA 4DTUA 4QAGA 3BZCA 3NFAA 3RSEA 1HQUA 4FOIA 3V9ZA 3ULEB 4CZEA 3LDSA 2W41A 1RNHA 5C42A 5M1OA 3C95A 3ATUA 2CGLA 4CZHA 4OPKA 3RTVA 4K43A 4ILHA 2RKIA 4OLBA 1QTMA 3O1WA 3L4IA 3RRHA 5KQ8A 2VCPA 3THYA 4CJVA 2QKBA 1RILA 4H5RA 2OA8A 3LDOA 2A6AA 4A61A 4O8KA 2P5OA 2G8IA 1FK9A 2X74A 3PX4A 3AVGA 2X78A 4ZTFA 5CR4A 4DTOA 4BGBA 3MX5A 4FCYA 3TSUA 5EY4A 3K5OA 1IBLK 2FF6A 1Y97A 3C6HA 2E2OA 2D1KA 1S5JA 3O9TA 4IFEA 4H0OA 4O5FA 4F9OA 1G15A 1FXXA 4KBOA 1NKCA 5AQQA 5KPRA 1NOYA 4NO7A 4FJHA 2BANA 4FLTA 3FLCO 4C8KA 4LFAK 1KC8O 4CGDA 3TAQA 2HB5A 3JXUA 3CD6N 4JI3K 3QFUA 3EE8A 1W2BM 3G6EN 3CM5A 1GLFO 4FWLA 1K73O 3MMVA 5GAGP 3H6EA 3CCVN 1C0UA 2ZJPL 4KAZA 4FK2A 4CEQA 3B8AX 5JVGL 4B3TK 3QBWA 3AO3A 2Z1IA 1A5XA 1BO5O 2Q3SA 3WEEA 3PV8A 4FK4A 3FZLA 3HSTB 3UB5A 3AVCA 2WONA 1O1WA 4E0DA 3EL2A 3DXMB 2E5LK 1UAXA 4DSIA 4OLAA 1Z25A 2O8FA 1TAUA 4DR2K 2I7PA 3R3LA 2ITGA 5BR8K 4DTSA 3VOVA 4RCHA 4HTUA 4I6MB 2OTLN 1JKHA 2EWSA 3OYAA 3OYIA 5IT9O 1BWFO 1P8ZA 4H5WA 3JS6A 3TAPA 1ZBFA 2UXDK 3CCRN 2DFFA 1TYQA 2CH5A 1YF5L 3O8MA 1NGAA 4DV0K 4BQZA 3RSEB 5BPNA 4KHWA 1QVFM 3U9ZA 3MEDA 5C24A 3OYKA 5BN9A 4F3TA 4LSNA 3OYHA 4CHZA 4X64K 4YFUA 3OYJA 3QEXA 3L8BA 3NGIA 3VA0A 4BC4A 4CJSA 1VSJA 2YNIA 1CXQA 5AQMA 3D2FA 2UXCK 3MK6A 4B8CA 3U8XA 2BE2A 2IGIA 3M8SA 2H3GX 5SZTA 2HBMA 3HSCA 4BRHA 4DSKA 3MX2A 4BVPA 4W5QA 3O9UA 2G8FA 3VEXA 3IFRA 3U3YA 5E41A 3WXMB 5KRTA 3VQ5A 3G0ZA 1BQMA 2B4JA 4CF9A 5DM6L 5BPLA 2B5JA 1JL2A 4CCHA 4JRPA 1E4FT 4AM6A 1S9GA 1ZBUA 1BCMA 2P9PA 3QDKA 2HHXA 3G10A 3I0RA 2FF3B 4E3SA 4CK3A 3DRRA 3RVCA 4DUYK 4BE2A 3QEIA 2RHKA 3OS2A 3ENHA 4V19S 5K14A 3OYDA 1U6ZA 3F9MA 3F2KA 1SKRA 2YCHA 3QETA 1RT2A 4C23A 3DI6A 5LY3A 2RE2A 1JLBA 4HTLA 3O08A 3F73A 3VQ6A 3TABA 1KSPA 3O9SA 4HUGA 1L5UA 4DTRA 1YIJN 4CEAA 3IS9A 4CHOA 2A41A 4BRAA 3CJ1A 3WEEB 3V1QA 1NJYA 4J8FA 1K9MO 2XY5A 1K8AO 4B1ZA 1EWQA 4N47A 4AM7A 1YVNA 1Q9YA 2QI2A 4MO4A 4M3WA 2IS3A 4CJ7A 3N4PA 3CG7A 1JLFA 5HLFA 1MWMA 1YVUA 4IZ9A 3AGKA 4R79A 5CYMA 2VG5A 3PSFA 4ZHRA 3QNOA 1K8KA 2PZSA 3SJJA 5DMRA 5DM7L 2GWJA 3LANA 4CF1A 3KK7A 3QBXA 1SL2A 3O3FA 5GAEP 1Q86O 1TYQB 5C12A 3WNEA 2FBVA 2QWMA 4WQ5A 1IV0A 1MU2A 4DS4A 3U6FA 2FSNA 4H0TB 4BREA 5LMNK 2ZE2A 1BA0A 3VA3A 3N4QA 4JKGA 1EXQA 2IC3A 4DQQA 4DR5K 2P9NA 1MWKA 2YHWA 1B9DA 1QQMA 4Z4IA 1A5WA 1SV5A 1XC9A 4CGIA 5HP1A 4FVUA 5AQUA 3AAQA 2NRXA 5J2NA 1RDAA 4IO8A 1BL3A 4A57A 4ELTA 1C1BA 1XQSC 4WYBA 2P9PB 3NHGA 3A8YA 4FW1A 2OZSA 2QWOA 4DQRA 3GG4A 1VQMN 3CQXA 5FPDA 4KHYA 3LPTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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