1MYR | Genus

Total Genus 190

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	190
sequence length	499
structure length	499
Chain Sequence	EITCQENNPFTCGNTDGLNSSSFEADFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPDKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNQKGIDYYHGLIDGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKQFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGARLPTFSPEETNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNATNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFESDGGDGSSNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGSENRKESMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNNGFTVRFGLSYINWNNVTDRDLKKSGQWYQKFISP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Glycosidase
molecule keywords	MYROSINASE
publication title	The crystal structures of Sinapis alba myrosinase and a covalent glycosyl-enzyme intermediate provide insights into the substrate recognition and active-site machinery of an S-glycosidase. pubmed doi rcsb
total genus	190
structure length	499
sequence length	499
ec nomenclature	ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date	1997-03-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00232	Glyco_hydro_1	Glycosyl hydrolase family 1

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1myrA00

2XFFA 3QGVA 2ZUTA 5IFPA 1CPUA 1FHDA 3AIUA 1W9UA 1XGZA 2VUYA 3HN3A 3GH7A 1HIZA 4LGXA 4NI3A 4YPJA 3OG2A 3OLGA 2EO7A 2O9TA 1RH9A 1R87A 3AYRA 2PWGA 1HVQA 3BMVA 3HJEA 4MAZA 4W8BA 1D2KA 1J12A 1W9DM 3GNOA 3CZJA 4BA0A 4LYRA 2XUCA 3EMZA 4TX6A 3VIJA 2J7EA 4AD5A 3CGTA 4QCFA 1QNQA 2YDSA 5HPOA 3WD2A 1G5AA 3ZOAA 1DWJM 5A6SA 1V02E 2DEPA 4PSRA 3GXIA 2WZIA 1WB0A 4GZJA 1GNXA 3W29A 5BXPA 1JF6A 3EYPA 1OGSA 5A6MA 4CKQA 3EDJA 2YKKA 2YL8A 1E71M 2XTKA 1CNVA 4JFVA 5BXTA 1FH7A 2EEXA 4JHZA 4U3CA 3K8LA 1JFHA 2OWXA 3IAPA 1JG9A 5A6LA 3AXXA 3CTTA 1EHNA 1RP9A 4D71A 2G41A 3CIVA 5BROA 4PTVA 3RPMA 1FHLA 2O9OA 3S6TA 2WMGA 2DSKA 1DTUA 5E6YA 4UFKA 1HXJA 4HZ6A 4ZENA 4WIWA 1C93A 5I23A 4WLCA 3PTKA 3ARYA 3SUWA 4JCLA 2CETA 4NZCA 1ODUA 1BSIA 4AD4A 4D6CA 3SUSA 1H11A 3OGRA 4DWSB 3WQ5A 1LWHA 4J3TA 3A4AA 3QHMA 4Z2JA 1W1YA 3LPOA 5IHSA 3BAXA 3CPUA 3MO4A 1V3IA 2J7HA 4JFTA 2A3AA 1LQ0A 3BLKA 1UR0A 1UD5A 1JD9A 3AIWA 3B9EA 3QOMA 3NDZA 4AD0A 1R8LA 2DQXA 3AIQA 1US3A 2G3JA 2Y8KA 5FCZA 1ISWA 3RIKA 1DWGM 2J7GA 2EBNA 4AD2A 3RJXA 5FL1A 2X09A 1LL4A 4MNKA 4DWSD 5IDIA 1IV8A 4X0NA 1C7SA 3WD4A 1TG7A 1B3WA 4V28A 4TUFA 1I1XA 3ZR6A 1ISVA 1E40A 1UD6A 5FD0A 3VGFA 1RP8A 3WNOA 4P8WA 1LL6A 3N12A 3VUPA 2D23A 2GSJA 3WNNA 2CITA 2V3FA 2V5DA 5D9MA 5IHRA 2BY3A 4UOJA 1XRVA 3WMCA 4TTUA 5A69A 2W61A 2J8FA 3WKZA 4ZXLA 1MFUA 1TMQA 4P8VA 1E73M 1J01A 6TAAA 4L4PA 4B9YA 1PBGA 1WO2A 1PZ2A 4WSJA 1E6PA 3MMWA 2ZXQA 3ZT6A 3SIMA 2GJRA 2OWWA 1TA3B 1HJVA 1QHZA 2ZXAA 3APGA 3I3EA 3VILA 2G3IA 9CGTA 4H2CA 3AQUA 2VCAA 5BRPA 1H4PA 3MUZ1 4OZOA 4AIUA 2VX7A 5JBFA 3VNZA 2EPOA 1YQ2A 1GVIA 1E56A 1BHGA 1WZMA 4BZYA 2E40A 4HOZA 3THDA 4OJYA 1KB3A 1XV8A 1E4IA 1BF2A 3D3AA 4JFUA 4AW7A 5EBAA 3GNRA 3BCFA 1AQ0A 2GFTA 3SEPA 5M3WA 3K8MA 4UFLA 2OLHA 1EO5A 1US2A 3AISA 2DIEA 1B9ZA 5EMYA 3LPGA 4OBSA 3GM8A 2JE8A 3QHOA 1J0JA 1TVPA 2J47A 1JZ3A 1JZ8A 5ABEA 3VMNA 4MB1A 2WMKA 1VFFA 3CHFA 4GXPA 4OOUA 4CCCA 4ATDA 4CCDA 4AIEA 1CDGA 2VRKA 2X1IA 4OIFA 2XPKA 1E3XA 1BTCA 5A2BA 2GK1B 1UWRA 1KGWA 2VT0A 1ZBKA 4BCEA 3PZGA 3WQ6A 1CGTA 4AEFA 2VZOA 1XSJA 1V03A 4B16A 4B3LA 3ARSA 2JEQA 2WNWA 5KEZA 3T0AA 2FH6A 3MS8A 1DWIM 1BQCA 4AZGA 2W91A 1UA7A 3WUEA 1BYCA 1L8NA 4PMUA 1JDAA 2XVKA 1B0IA 3GXFA 1GQLA 2J78A 3ZSSA 3SCOA 2XFRA 1GOOA 5C70A 1G94A 3ZJ8A 2CEQA 1VFOA 1XHGA 3AI0A 2XVLA 5A8NA 1SMAA 2Y24A 2BFGA 3WL1A 2WCAA 4WF7A 1EQCA 3GXDA 5HNNA 4PMZA 3WUBA 1J10A 3VMOA 2F8QA 3WNKA 1M01A 3UCQA 3BAYA 4P7LA 2OYMA 4DWSC 3B8SA 1ZBVA 2FGZA 1VEPA 1H09A 1ECEA 1OT1A 4FMVA 1E6RA 1LG2A 1CLVA 2QMKA 4H8UA 4ATWA 4E2OA 3N1AA 4M1RA 3WNPA 2CESA 4YN5A 1K6AA 2QHAA 1UHVA 1DWAM 3G6LA 3VD3A 4PUDA 1FFRA 4MNLA 3OB8A 1E0VA 1E6QM 1EOKA 4AZ5A 2VNCA 1DP0A 5ECUA 1H3GA 1MQQA 4MB3A 3QR3A 5HXMA 3WH9A 2A3BA 2HVMA 2UY2A 3VX0A 1MQRA 4JZ5A 4U5IA 2IUZA 3VU2A 2WBKA 3UG4A 5EFDA 1KGUA 1PX8A 2ZOXA 3N18A 3MV11 3VIKA 4AWEA 4MTVA 1OB0A 1BFNA 5M5DA 3UR7A 2JFEX 4UZSA 1MXGA 4HMCA 4E8CA 1GW1A 4QCEA 2B31A 3VPLA 1W3HA 2VURA 1UKPA 4GIAA 2VTFA 2UY4A 1NP0A 3N15A 3EDFA 2VX5A 4URIA 2WHJA 3U7BA 4PRWA 1VB9A 5A6BA 2NSXA 4PSPA 2DSWA 3F5KA 3VINA 3WMBA 1XCXA 2J25A 1J18A 4AXNA 1B2YA 1IZJA 2C7FA 4GI8A 5DMYA 1KWKA 1WE5A 2E0PA 4IISA 2CBJA 3CLWA 3VIPA 1UR8A 3W37A 4KH2A 4UQCA 4CN4A 3PZTA 4OKDA 3OGSA 2QLYA 3PZIA 2DT3A 3WF2A 3ARVA 1W3LA 1MXDA 1E0XA 2E9MA 1UG6A 4PMYA 1CXFA 3FNDA 2Z1KA 1EIBA 3AROA 3F5JA 3AXHA 4RL3A 1E55A 1LG1A 3WSUA 4JFSA 5A8MA 2BXZA 3BSHA 1JZ6A 3E1F1 4HP5A 5D4YA 4W87A 3VGDA 4BS0A 3CMGA 3BXWA 5FKYA 3KL5A 4X0VA 1CWYA 2WHLA 2JALA 1FH9A 5LYRA 4ACZB 4HA1A 1WDPA 6A3HA 1VEOA 4LPCA 2YL9A 1OSEA 1J0IA 4C7GA 1NOUA 3DYMA 5CGMA 2CCRA 3VGBA 1UD4A 2WBGA 1C7TA 3WF0A 1CIUA 4PTMA 3KL3A 2NW0A 3VGEA 3EBVA 4MAVA 1NQ6A 3CHDA 4LXFA 4C7FA 2Z1SA 3U5UA 4ATLA 1ISZA 1HVXA 3O2LA 2F2HA 2XFYA 2X2YA 2WANA 1KBBA 5A6AA 1JDCA 4BQ4A 4CVUA 2XIBA 2YL6A 4U31A 1JIBA 3WBEA 3WDRA 4PBGA 1W9BM 5BRQA 1MW1A 3CZLA 1X6LA 2WVSA 3UG3A 3M6DA 4UQBA 3OA5A 3WBAA 1U30A 2ZXBA 3PTMA 3AIBA 1D7FA 4PMQA 1JFXA 1VJSA 3M46A 2D24A 5JIPA 4XX6A 3SCVA 4YHEA 3RDKA 3VDCA 1E70M 4CVWA 1F4AA 5DO8A 2GDVA 2OYLA 5A2CA 1FFQA 1UKQA 1MYRA 3J7HA 2WLYA 1RPKA 1E5NA 4EK7A 3WENA 3EMQA 3AHYA 4JL1A 2PBOA 1V3MA 4J3SA 2QPSA 2WSKA 2WVUA 1UR9A 5I0DA 4WJXA 4CUCA 1VJZA 3WD1A 3W6LA 2CERA 1W1TA 4W5UA 2JEPA 4NF7A 2ZX7A 4Z2KA 1X1NA 2FGLA 1OWQA 3BAIA 1VIWA 4PN2A 1BYAA 1QI5A 4FK9A 1WKYA 3IK2A 3VX1A 1PIGA 2J8GA 3D5HA 4HOXA 3ZT7A 2Y2WA 1ISYA 4GO8A 4PTXA 1N82A 1UD3A 1JDDA 2YDRA 1H2JA 2D20A 2BHYA 1I1WA 3VIOA 5D8ZA 3RM4A 3FAWA 4JL2A 2D22A 4PCSA 1JZ5A 5D9NA 1ZJAA 2TAAA 4P7OA 2X0YA 2ZUSA 1HKKA 1NP2A 5I24A 1QI3A 4QDMA 1C8XA 3WF4A 2WXDM 1UOKA 2OSYA 1V6XA 4AIOA 5FIPA 1QI4A 2JF7A 5TD4A 2VQTA 3ALGA 1BGGA 1W2PA 2E4TA 3SCSA 2DIJA 3AICA 4U3AA 1KCLA 5IXEA 1JL8A 3VDBA 2Y5EA 2ZXDA 3VD9A 4P8UA 4TX8A 5E0CA 3WUGA 4A3YA 2XSBA 5CLTA 3SCPA 1V6WA 3ZJ6A 4Z2GA 5E09A 1W32A 4DUWA 1UWQA 4PMXA 2MANA 4PCTA 2WWDA 3SUTA 3ZJ7A 3ALFA 3PZOA 3TOPA 3RM8A 1HJWA 3T0DA 3SUUA 1QHOA 4F66A 3WDIA 4M24A 1QW9A 1O6IA 4QLKA 5BXRA 4HZ8A 1BG9A 1AQHA 4DM1A 1KXTA 1B31A 4QP0A 2BY1A 4ZE5A 2DH2A 3RILA 1QNRA 3AJ7A 4JIEA 3SCQA 3CUJA 4MNMA 1XYZA 4EKJA 1QVBA 1SMDA 3FY1A 2Q8XA 1Q6EA 2VCCA 4Z2HA 4TVDA 1E4MM 1VFMA 4MPKA 5A6KA 4W7UA 1XSIA 3RJYA 4D6IA 5I79A 3W0KA 2YLAA 3L4XA 2O9RA 5M17A 3AMCA 2VRQA 3PHAA 3PZQA 5GPRA 1UQYA 2BY2A 1W3JA 2YA2A 3ECQA 2EPKX 1TUXA 2VX4A 4EAMA 2BS9A 3POCA 1B3YA 3GH4A 1BLIA 3WH5A 4W93A 2OSWA 3FXYA 1HKIA 1G0CA 4D6GA 1V3LA 1ZU8A 2V3EA 2CYGA 3T09A 1V3JA 3I3DA 3AHTA 3AS3A 1FA2A 1UR1A 3VO0A 3W6MA 3A47A 2D0HA 1BPLB 3BH4A 4OUEA 1CTNA 4YHGA 2D1ZA 1GJWA 4C7DA 2GDUA 1HKJA 3CHCA 1WCGA 4AD3A 1EDQA 3ARTA 3BGAA 2WHMA 1E3ZA 4W85A 2EPMX 4HMEA 1GOQA 1TFVA 1XD0A 1E4NA 1LWJA 2AMGA 1BVNP 3A3HA 1C8QA 2ZICA 4QLLA 1HP4A 4S3KA 3TP4A 1M03A 1BGAA 4HPGA 4AC1X 4TXEA 2YIHA 1UQZA 3L4WA 3VD4A 3MU7A 1W9VA 3GBEA 3TTSA 1ODZA 1EH9A 4Q22A 1HF6A 1UKTA 1TVNA 1UUQA 3UETA 1CEOA 5AYBA 2Y4SA 1GOKA 2A3CA 1GZJA 1E6SM 3BSGA 2VL4A 3MUY1 4J7RA 3SUVA 4MJ2A 1NOWA 1MW0A 2XSAA 3OLEA 1DWFM 1QNSA 2ZUVA 3L4YA 1E1FA 1GVYA 1PX3A 1HJXA 3A4WA 5DEZA 1AQMA 4M29A 2XVNA 3VIIA 2CKSA 4M56A 3AMLA 3ARXA 2CBVA 4XZWA 5I6SA 8A3HA 2GJXA 2J7BA 3OLIA 4CD5A 4PMOA 5I3DA 1KXQA 5HPCA 4WKHA 4BQ3A 2DSZA 3T2PA 3AHZA 2XWEA 1UR2A 2E8YA 5M03A 3ARQA 1WDSA 2WZHA 1OIMA 1G01A 4MB5A 4AZCA 1UYQA 1DWHM 1HJQA 1UWUA 2WCSA 1GHRA 1EHAA 2EJ1A 5CGTA 3AHXA 3PZ9A 2WPGA 5CG0A 4D6DA 1JXKA 4N42A 1EXPA 1KQYA 1UH2A 2VX6A 1QPKA 1XH0A 3K4AA 4HPHA 1CXKA 1OT2A 1V0NA 3WF3A 3VM5A 2W92A 3DECA 2C0HA 4GKLA 5CSUA 3BC9A 3NUKA 1CXHA 2C8NA 5JIWA 5BWFA 1UZ1A 1J0YA 2VZVA 3WMSA 1HJSA 7CGTA 1E15A 3HU7A 1J9YA 1HL8A 5A6JA 1HP5A 4CN1A 1UA3A 4HMDA 3B9AA 4H7VA 2PB1A 3BAJA 3N04A 1BVZA 2J75A 2J7DA 4CD7A 1V6UA 1XH1A 2V5CA 1VRXA 3K8KA 1JI2A 1V08A 4J3VA 2VR4A 2DSVA 5CPTA 3VDHA 3ZIZA 4JFWA 6CGTA 1K9TA 4FLRA 2WAGA 3SCWA 3WUFA 1E72M 3WFZA 3OBAA 4GZIA 4MNJA 2PBGA 3K4DA 1M04A 5CPSA 1R7AA 2O92A 4IPNB 4F79A 4U5KA 7A3HA 3BCDA 3WELA 1TCMA 3ZO9A 1DEDA 2VZUA 1KFWA 2Y8VA 1WDQA 2AAAA 5E0FA 2G8ZA 3NIYA 5D9PA 4BQ5A 1I75A 4CD8A 1S46A 1CGUA 3RM9A 3KZSA 3CZGA 3G6MA 4K68A 1JXJA 3T0BA 3AXIA 1NOFA 1H5VA 1EO7A 1U2YA 4XB3A 1C92A 2WC4A 4GI9A 2OSXA 4W84A 4W89A 1SFSA 3ZMRA 1JD7A 1E43A 4J28A 1ZBWA 4CN6A 3T2QA 5BXSA 3VD5A 1OD8A 5I78A 1J0KA 3MKKA 3GTNA 4FLQA 1JGIA 3NSMA 3VOCA 1E5JA 3WQWA 1H0IA 1WPCA 3BAKA 2ZWZA 4D1JA 2VJXA 1VAHA 1D3CA 2VCBA 1NWTA 2YOCA 4LYPA 1GCYA 5CSYA 1VF8A 1QNPA 3KEHA 1ESWA 2XGIA 4AYSA 3SCTA 1QW8A 2ZUUA 2GJPA 5BCAA 2V38A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1MYRA

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