1MZHA

Qr15, an aldolase
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MIDVRKYIDNAALKPHLSEKEIEEFVLKSEELGIYAVCVNPYHVKLASSIAKKVKVCCVIGFPLGLNKTSVKVKEAVEAVRDGAQELDIVWNLSAFKSEKYDFVVEELKEIFRETPSAVHKVIVETPYLNEEEIKKAVEICIEAGADFIKTSTGFAPRGTTLEEVRLIKSSAKGRIKVKASGGIRDLETAISMIEAGADRIGTSSGISIAEEFLKRHLILEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, aldolase
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
publication title Crystal Structure of Aquifex Aeolicus Aldolase, Northeast Structural Genomics Consortium Target QR15
rcsb
source organism Aquifex aeolicus
total genus 86
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2002-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mzhA00
3QPZA 1W5QA 4I7UA 3TE9A 1TPC1 4GXMA 1H7PA 3W76A 2A1YA 4TMBA 1LDCA 3DFNA 3LXBA 5DY3A 1TPB1 1N8FA 4WUIA 2G95A 4O0KA 3U2OA 1DBTA 1LYXA 4NX0A 5F2MA 1TQJA 1GVFA 3M43A 1Z48A 3LCGA 1Q45A 1MEHA 2G5WA 4UFLA 2CLFA 1VRDA 3K30A 2JKPA 2O7QA 3NQ2A 3HGSA 4TX9A 1ICPA 4WJEA 4KKXA 3EX3A 3RNDA 4OWGA 1QNVA 4O52A 2J9YA 2W6RA 1K3UA 1I2PA 1R47A 5FEPA 3QZEA 3ABSA 3L0KA 3TMLA 4U28A 3Q2DA 4AH7A 1E51A 4GUHA 2WO5A 3EXSA 2W79A 1PCKA 2ZZ4A 3A5FA 5LGZA 3O1NA 4CCCA 3DHFA 2AAMA 4AHPA 3TXZA 3W7IA 5FEZA 3HG4A 5EBUA 1MSSA 1TTIA 1FX6A 4HSNA 3ZWTA 4J9JA 4LV4A 2FPVA 4G1KA 4JY8A 3WJSA 5H91A 2V5BA 2RDWA 3M9YA 5FF4A 3KVMA 3O15A 4IPIA 3MP3A 2OT1A 2BLEA 2ISSA 1SW3A 3HBLA 3OHIA 4M6PA 3STGA 2E6FA 2RH9A 2VEKA 3UNDA 2ZBTA 3S1VA 3G1FA 1TJPA 2NX1A 3TV8A 5E0KA 4NZJA 5IBXA 4JTSA 3N2MA 4UIOA 3H53A 3VI2A 3PY2A 1JR1A 1FY6A 3G1XA 3U8GA 3UWYA 3WK0A 1QOQA 4XWUA 3QF0A 3L68A 1G4EA 4Z1BA 2GJNA 4JGDA 1ME9A 4LW7A 3KVJA 5EKYA 1SW7A 4IXHA 5D03A 3C6CA 1OX4A 1K7EA 4IWWA 1H7NA 3LCFA 4HSOA 3QM3A 5EYWA 4GFSA 4FNQA 4P2VA 4JDBA 3QMTA 3A5VA 3VNDA 1VYPX 4LC8A 1TPH1 4NJJA 3W7RA 4ALDA 5LNWA 2Z0IA 3TAOA 4RV8A 1KTCA 3DENA 4ZVJA 3NL3A 3UWQA 4FX7A 3L65A 5HUPA 1WDWA 3EB2A 1KFJA 4GUIA 1LCOA 2Q8ZA 3C2RA 3G24A 1TMHA 1GT8A 1K8YA 3TC6A 5LSMA 1CX9A 3ZWSA 5EL1A 4UTWA 1OX6A 4OBTA 5AC7A 2R14A 4E0CA 3QSRA 4MJZA 2FB3A 3FA5A 3KX6A 2Q3OA 3FKKA 4E38A 4P61A 2GQ8A 2C0AA 3UY8A 3I68A 5LNRA 1EB3A 2V8ZA 3PAJA 2HTMA 1DOSA 5D32A 4Z1CA 4MOZA 3T44A 4FXRA 4NJKA 1T0OA 3NQGA 6TIMA 3HB9A 1VC4A 1EIXA 4CQAA 4XZ9A 4WXYA 5LKYA 1OHLA 1EWEA 5G1TA 3C3NA 1KBIA 3EXTA 4L4LA 3TJXA 5K4XA 1KV8A 2QDGA 1XBVA 1C29A 5DXXA 2QJHA 1N55A 1EX5A 1Q3NA 3UPBA 4O1CA 1TPEA 4XQ6A 4K7YA 3LXAA 2CLEA 4IXXA 3G1DA 3NNTA 2QR6A 3ANYA 1G4SA 1FWNA 4ZL1A 2FJKA 2DZPA 3TU9A 2A6LA 2QAPA 1PV8A 1U83A 1L6WA 3NL6A 1IXPA 2ZA1A 3USBA 3W3OA 1DVJA 4WY0A 1G67A 3INPA 3WFAA 2TSYA 5LZLA 4UFJA 5LNUA 3L67A 1O5KA 4GNJA 5CZJA 5AYZA 2QAFA 4A29A 2ZYFA 2QJIA 1UASA 4AAJA 4TU1A 3W7LA 4K39A 4UR8A 1CW2A 2F7FA 2P1FA 3NM3A 3IVSA 5BMWA 3NOEA 3LHVA 3LLDA 1YXDA 2Y70A 4XKYA 1TSIA 3CEPA 4MZ8A 2ALDA 3E02A 1VCFA 3L21A 2GVGA 3W1TA 4S2BA 4HNTA 1WA3A 2CZFA 1BWKA 2BWGA 4W9TA 2YZRA 3P8IA 4Y6GA 3C61A 2DJLA 2E68A 2Y7EA 5FI8A 1O60A 5TQLA 1G4PA 4O4VA 3P62A 2CLIA 4MY1A 3TW6A 4UNLA 1XCFA 3H54A 4IUOA 4DBEA 3LOTA 1I8JA 1QDSA 4N9BA 3BK0A 3C2EA 4LOCA 1AG1O 3I65A 3RF9A 4JTKA 4LS1A 1HTIA 3VE7A 4WQ6A 3NEVA 5D2XA 3W83A 2OZ0A 4UTHA 5LNVA 1G6CA 4ORIA 3QQ0A 5EY5A 3G1AA 3EWZA 1FCUA 1LRNA 4OGZA 3OVRA 2A4AA 1WOBA 4Q4KA 2NX9A 3TKFA 4FNSA 2TRSA 3G1VA 3NPUA 4A21A 3TK7A 1DV7A 4O57A 4JEQA 3LI0A 4N6FA 1WYIA 3B03A 1YDOA 3LX9A 5MHBA 3IEBA 1GJPA 4Z08A 2E5DA 1EUNA 5I3GA 5F2IA 3G8EA 4JTFA 2ZRXA 2IQTA 1NVMA 3JS3A 4K36A 1T8XA 5CZ0A 4RCXA 1UCWA 3JRKA 3TX9A 3WJYA 4UMBA 2GVJA 1QFEA 3UD6A 2CFFA 1RD5A 4LNYA 4ORMA 3STFA 2Q3RA 1W3NA 4ZQRA 5H2ZA 3KRUA 1AL7A 3SGZA 4CCDA 1V5XA 5C2XA 5AHEA 3DH7A 1YXCA 2WJZA 1VYRA 3S0CA 1RV8A 1R2RA 1XBYA 3D0CA 3QSTA 2B7OA 2NLIA 2DP3A 4UXDA 1Q6QA 3S9YA 4OV9A 1Q6OA 5L6UA 4QISA 4XBKA 1KFCA 3LBCA 1DQXA 1DQWA 2VFFA 3UXDA 4RXFA 2V9DA 5FESA 1YTKA 3BV4A 2E5BA 2Z1BA 3CIWA 4NVTA 1DKWA 1R2TA 3G3DA 2XFWA 3BPWA 2VC6A 4RZ4A 3TIMA 2RFGA 1QWGA 5AHLA 2A21A 1H1ZA 3KXQA 3PC0A 4MYXA 1UJPA 5AHFA 5AHMA 1ZHAA 5HNRA 2NWRA 5J5DA 2YFNA 4E2BA 5DBTA 3NQAA 1TV7A 1SUXA 4OU1A 3SI9A 1TIMA 1EP1A 3N3MA 4WZHA 2JGYA 3LHZA 2B7QA 2QCDA 2CZDA 1QAPA 1KM6A 2KZHA 3LM7A 1XL9A 3W2MA 3B0VC 3W6YA 2CZ5A 2H8XA 3EKLA 3IGSA 5HULA 1MEWA 8TIMA 2C14A 3GB6A 2PURA 3QRHA 5IBXC 1OF8A 2ZA2A 1EWDA 2DZWA 3IGXA 5KMYA 3DXIA 3W7DA 1A53A 1J2WA 4IMEA 3R12A 3BGJA 5D2WA 2Y62A 1I2NA 4X22A 2NXHA 3FLUA 1LZOA 4DO6A 3W71A 3C2OA 1I2RA 4JICA 1VH7A 3L5MA 1U5JA 3IIPA 1KM5A 3DFOA 5KZEA 2X1SA 4Q32A 3RK8A 2GPTA 4M6QA 1YTEA 3B0UX 1GVOA 3RMJA 4TR9A 5D37A 1SZEA 1OJXA 2WSQA 5HR7A 2YYUA 1IIGA 1HO4A 4I7VA 1LM1A 1HFBA 5I3FA 3LRKA 1OK4A 3RLVA 4DXVA 4H6KA 3W22A 3CHVA 3G0UA 2YYTA 2WKJA 1GZGA 3M47A 3W7NA 2O7SA 4YXGA 1LROA 3NQ6A 2QUTA 3S6DA 3GIYA 5DCEA 1TPFA 2ISWA 2PC4A 3W2JA 3LV6A 1MO0A 3EX1A 3M44A 3S5OA 1KFLA 3G1SA 3E0IA 3KVLA 3IIXA 2VFDA 1GTEA 4HKPA 4UTWC 1SO3A 3HG2A 2VEIA 2GJLA 1IF2A 1K8XA 1GG1A 3M1ZA 3W7KA 1THFD 1FQ0A 3OA3A 2A7NA 3TC7A 3MJYA 1IXQA 3DKJA 2JKEA 3O6CA 2EF9A 2FDSA 3GYEA 3O16A 1ZJIA 2Y7FA 3WJWA 3BW3A 4IGHA 4JD4A 1OG0A 4DBDA 1SPQA 5KINA 4GUGA 4M7TA 3NZ1A 3G0XA 4NNCA 3I7QA 3W1PA 1KM1A 2E6AA 4UTUA 3GAYA 3QPYA 4JX4A 1H7RA 1N7KA 1OFAA 5KZDA 5BRBA 4ONVA 3BG3A 3V75A 3TFCA 3LCLA 4MFEA 1OFPA 1F6KA 5KITA 2UV8G 1RR2A 4MUZA 4R53A 2R94A 1PCWA 3TMQA 1QOPA 1G69A 3B04A 3HOJA 4QIUA 3GZ3A 4MY8A 2Y7GA 3L66A 1LP6A 1LLZA 2QUUA 3LRMA 3I7SA 3O6YX 1XM3A 1XUZA 4RK8A 2NV1A 5K9XA 3ATYA 3TQ0A 4N2YA 3W7CA 1Z41A 2J9ZA 3MO7A 4MJMA 3LCWA 5CPMA 2ZA3A 2DZUA 4YWIA 4H4IA 3MP5A 4AXKA 4A2SA 5I3HA 4PL1A 3CPRA 2NV2A 3HG5A 1H62A 1L9WA 2OJPA 5CSSA 4GWEA 1W54A 3T4CA 4Z1AA 3W84A 1ZENA 4NXSA 4OE7A 4JYFA 4KFNA 1W1ZA 3L9CA 1B3OA 3H55A 3GXNA 3Q58A 4K8HA 5F4XA 3NL2A 1F76A 4LWWA 3W1MA 1YDNA 4BI5A 3CWNA 1L6SA 2YPIA 3DHDA 3PBYA 2I14A 4JXCA 3W7EA 3DI1A 3PM6A 1H60A 2ZCGA 1OX5A 4S2CA 5HWJA 1TTJA 4Y90A 2NX3A 3TSBA 4XUGA 2WNNA 4JTGA 1F5ZA 4IMDA 3W72A 2Y63A 4NZFA 4ZZ9A 1J5TA 2F84A 3ATZA 1WX0A 2ZZ6A 2E77A 4O19A 1TYGA 2C1HA 4QQ3A 3R89A 5D09A 3UZ5A 1AL8A 4DELA 1KTBA 2V0TA 2EAWA 2V5LA 1QO2A 1QR7A 1MZHA 3LCIA 4PFMA 1GWJA 2AQWA 4NNBA 3WK1A 3MHGA 4JTIA 5D2VA 3RU6A 1K03A 3CEUA 4LVAA 2H3BA 1VJIA 1H63A 4YLWA 3PULA 3TXVA 4WXZA 1W37A 1GTHA 3GR7A 2C13A 2VFGA 3VFLA 3L2IA 2WPBA 3BVJA 1W5NA 3HO8A 5G4EA 3EWUA 3TUUA 1SR9A 1JUKA 1OFBA 3FJLA 5DXYA 2B7PA 4DO4A 3EX2A 3GDRA 4O0ZA 5E93A 4E2DA 4QNWA 3TFXA 4IMFA 2PE4A 3OG3A 5CZSA 4Z0JA 4R33A 3E9AA 4ADSA 1GQNA 4TIMA 4DPQA 3BLEA 3NQEA 2A5HA 1WQ5A 5AB3A 3MYOA 2I1OA 2DORA 5LGXA 3EX6A 4JTUA 1W31A 2OCZA 5LHEA 2J9XA 5AYXA 3NQ7A 4HN4A 1ZFJA 4AWTA 1Y0EA 5KTLA 3W1RA 1FWSA 1TB3A 4BF9A 1A50A 3MYPA 4B5NA 3O05A 3GDLA 5AHIA 2BX7A 1LRQA 3QC3A 4JR5A 1XBXA 4ZQCA 1D9EA 1FUYA 1O94A 4O17A 3W1NA 1XI3A 2Z2UA 3P7YA 2PRMA 2P10A 2RDTA 3DAQA 3WJZA 3W7GA 2Y85A 3ABOA 2Y61A 1ADOA 1DJNA 5CGQA 3LHUA 5D05A 3W74A 4JTHA 4JNMA 2ZRVA 1HG3A 4XBSA 3S1UA 1JRBA 4UTTC 2E6YA 4FNUA 4Z1DA 5K9CA 4PH6A 3TQKA 3SR7A 4IX0A 3DZ1A 3FS2A 3BLIA 3W23A 4FEZA 3NO5A 3CQ0A 4LT9A 3QEZA 4BK9A 4K38A 4NJIA 3R13A 2V2CA 3OVPA 2J27A 3KFTA 1TTPA 4GUJA 4ICNA 1TPDA 2QCNA 1VS1A 4Y9AA 4QM1A 3PG8A 2HMCA 2YFOA 1JQVA 1GVRA 2H8ZA 4CQ9A 1WBHA 3B0PA 3LERA 5FF0A 4BI6A 1DHPA 1K7XA 1LOQA 4FXSA 1ME7A 2C18A 2X2GA 4R7JA 4NNAA 3EXRA 2B0MA 3UWUA 5AHNA 4O54A 1R2SA 3KOFA 4AHOA 1VQTA 4MPQA 5EPDA 3PVFA 4UC5A 4JIQA 1PIIA 1JCMP 3P81A 3S5YA 2FB2A 1QPRA 4GRSA 4OQVA 1QPQA 3N19B 3QJAA 1IGSA 1YDVA 3C56A 4UTIA 3YPIA 1FDJA 1TV5A 2QUVA 4NJHA 4DF1A 3NQDA 3GXTA 5CG7A 4AF0A 5FF2A 3G22A 4K8EA 3A22A 5F4SA 1S5VA 5L9FA 1OABA 1PE1A 4Q33A 3ZR4A 1JQXA 5F1VA 1F6PA 5FF3A 3RLUA 1EA0A 1F7BA 1UBSA 1S5WA 1BWLA 4LV9A 4UUIA 4CLMA 3S1WA 4JTLA 2ZTJA 3W2LA 4FNRA 1T96A 4BR1A 2A7RA 3AJXA 3A24A 3LLFA 3M16A 3P67A 3HGJA 3GX9A 2ABBA 1CI1A 1TPWA 2YW4A 2Q8LA 3BO9A 1LBLA 2X30A 1MEIA 3O6DA 3UQNA 5DCBA 2VELA 2WNZA 1QPNA 2FLIA 2NXGA 2ZDRA 1GPWA 1X7FA 1OYBA 4UFKA 4MLJA 1PL9A 4NT0A 5CSRA 3P5YA 1KLYA 5K2ZA 3HGRA 3W2UA 3KVKA 2ZZ2A 2HS8A 3GK0A 4ZQMA 1A5CA 4ZQPA 1FCQA 3L5LA 1WXJA 1UUOA 2J88A 5EA9A 4AWSA 4LVBA 3NQCA 1JCNA 1T99A 5D38A 1M6JA 2V2DA 1VCVA 3FFSA 4YCOA 3C2FA 4OHQA 3IVUA 2GOUA 2A2IA 1ZALA 3B8DA 3LCHA 5A8GA 3DFPA 4LRSA 2CU0A 2JK2A 4QAIA 1YADA 2V30A 3W7PA 2YR1A 3F1QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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