The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| molecule keywords |
NEBULIN
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| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
4
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PRM C; 2LQN A; 4F14 A; 2L3S A; 2DBM A; 2DL7 A; 2DRM A; 2DX1 A; 2DL8 A; 2OI3 A; 4GLM A; 4LUD A; 4AG2 C; 1ZSG A; 1AVZ C; 1NEB A; 2RQW A; 4RTT A; 1CSK A; 1OPL A; 1XOV A; 1GBR A; 4DEY A; 3M0T A; 3VS5 A; 1JO8 A; 3O5Z A; 3UA6 A; 3H0F A; 1M3C A; 2YUQ A; 3M0Q A; 2K2M A; 2JS0 A; 4OMP A; 3PE0 A; 5IH2 A; 2A28 A; 2C0T A; 1BK2 A; 1AWX A; 2EKH A; 2AK5 A; 2EGE A; 2J05 A; 2I0N A; 2HDA A; 2CSQ A; 2L0A A; 1AD5 A; 2FEI A; 5EC7 A; 1HSQ A; 1CKA A; 1YCS B; 2DF6 A; 2QDL A; 2D8J A; 4RTY A; 2AZS A; 2LQW A; 3REB B; 2JS2 A; 3VRY A; 2ROL A; 4EIK A; 2ENM A; 2D1X A; 2P4R A; 1AZG B; 1ABO A; 1PKT A; 2YUP A; 2PTK A; 3I5R A; 2ECZ A; 2O9V A; 4JJC A; 2J7I A; 3PVQ A; 1WIE A; 2EW3 A; 3IQL A; 3EHR A; 4OMN A; 2JM8 A; 2DBK A; 2CSI A; 1YP5 A; 2DA9 A; 4LE9 A; 1WI7 A; 2FPD A; 2CT3 A; 2KXC A; 2ED1 A; 4A63 B; 3M0R A; 2M51 A; 2XMF A; 2O88 A; 2BTT A; 2DL3 A; 1H3H A; 2AKK A; 1JEG A; 1RI9 A; 1NLP C; 1E6G A; 4E6R A; 1UEC A; 2O2O A; 3VS6 A; 4K11 A; 1T3S A; 1W70 A; 2KXD A; 4Z89 A; 1GL5 A; 3U23 A; 4HXJ A; 1KSW A; 4F17 A; 3UA7 A; 2CH4 A; 2RF0 A; 1T3L A; 2OAW A; 2FO0 A; 2KYM A; 2SRC A; 1Y0M A; 3TVT A; 4J9I A; 5IHI A; 1N5Z A; 1A0N B; 1SSH A; 2LJ1 A; 2GTO A; 4J9E A; 2LMJ A; 2KBT A; 1ZUK A; 1AZE A; 1VYU A; 2CUD A; 3REA B; 1QCF A; 4GBQ A; 2BZY A; 2HCK A; 3LH5 A; 2JTE A; 1AWW A; 1BB9 A; 1HJD A; 1W1F A; 1UJY A; 5GJV B; 2DE0 X; 1MV0 B; 4D8D A; 2RQT A; 2X3X D; 2KEA A; 4J9G A; 4AG1 C; 2J6K A; 1BU1 A; 2RQV A; 1M30 A; 2EQI A; 2GBQ A; 4QT7 A; 1PKS A; 4LN2 A; 1NG2 A; 1M3A A; 5FWC A; 4X1V A; 2JXB A; 2DVJ A; 1NYG A; 1E7O A; 3M0P A; 5FWB A; 2M0Y A; 1NM7 A; 1T0H A; 3VS1 A; 1OOT A; 4FSS A; 3ZL7 C; 1WX6 A; 2RN8 A; 5L23 A; 1GCQ A; 1GFD A; 4OMM A; 2KRN A; 1M27 C; 3SEM A; 2AZV A; 4JJD A; 4D8K A; 4RUG A; 4RTW A; 2LZ6 B; 1EFN A; 1QWE A; 3H0I A; 1ZLM A; 3FJ5 A; 1ARK A; 2L2P A; 1NYF A; 4OML A; 2ESW A; 4WCI A; 1FYN A; 2NUZ A; 4LNP A; 2FG0 A; 2CUB A; 1X2Q A; 1H92 A; 4RTV A; 1GCQ C; 1AEY A; 2DNU A; 2O9S A; 2KYB A; 4JJB A; 3VS0 A; 4RTU A; 2HSP A; 2K79 A; 4F16 A; 2YSQ A; 1MV3 A; 4KRT A; 5I11 A; 4CC7 A; 5HCK A; 4OMQ A; 2LP5 A; 1ZUU A; 1VYV A; 3TSZ A; 1WFW A; 2CT4 A; 4JPB W; 3RNJ A; 4HVW A; 1PRL C; 1AOJ A; 2GQI A; 3EG2 A; 2DMO A; 2EGA A; 2EYW A; 3M0U A; 4LUE A; 4Z8A A; 2YT6 A; 1E6H A; 1SHG A; 2RQU A; 5FW9 A; 1TUD A; 2MOX A; 2K6D A; 1TG0 A; 2F2X A; 2GTJ A; 2NWM A; 2JM9 A; 2PZ1 A; 4CC4 B; 3EG1 A; 3EHQ A; 1UG1 A; 4JZ3 A; 1U3O A; 4HCK A; 2ED0 A; 4ORZ A; 2J6O A; 4OMO A; 4RTZ A; 4AFQ C; 1S1N A; 2GGR A; 1AWJ A; 4ESR A; 1YWO A; 2DJQ A; 4M4Z A; 2E5K A; 2FPE A; 1FMK A; 1I07 A; 1YNZ A; 1G83 A; 1UDL A; 3TSW A; 3EGU A; 4J9D A; 1PHT A; 3QWY A; 2EPD A; 4Y92 A; 4J9F A; 1X69 A; 4IIO A; 1X27 A; 2JMC A; 5IHK A; 1UGV A; 1ABQ A; 1ZX6 A; 2DL4 A; 1GCP A; 2K3B A; 1RLQ C; 2ROT A; 3EG3 A; 1LCK A; 4CC3 A; 4DEX A; 3ULR B; 1X43 A; 1SRM A; 2FRY A; 2D0N A; 1Z9Q A; 5IHN A; 2EYZ A; 1OV3 A; 2F2V A; 2A36 A; 1K0S A; 3GBQ A; 5GJW B; 1K76 A; 2DL5 A; 2JW4 A; 2DIL A; 2V1Q A; 4HVV A; 2KGT A; 3R6N A; 1QWF A; 2DM1 A; 2BZX A; 1WXU A; 2KRS A; 1WXB A; 3NMZ C; 2YUN A; 1ZBJ A; 4AFZ C; 1I1J A; 1OEB A; 2L3Q A; 2KNB B; 2O31 A; 3KFV A; 1V1C A; 2RQR A; 2DYB A; 2AKL A; 3NHN A; 1UHF A; 2CRE A; 2RNA A; 3H0H A; 1Z9Z A; 1M3B A; 2J6F A; 2L3P A; 2PNI A; 1WXT A; 4IIM A; 1NLO C; 2DLP A; 1TUC A; 3VS7 A; 2CDT A; 1QKX A; 1RLP C; 1KIK A; 3VS3 A; 2CH4 W; 5ECA A; 1JQQ A; 4J9B A; 1X2K A; 1SEM A; 2EYX A; 1WDX A; 4CC2 A; 1B3Q A; 2LJ3 A; 3EG0 A; 2A08 A; 1W6X A; 1UJ0 A; 2MCN A; 2EVR A; 2K7A A; 3I9Q A; 2KT8 A; 3UAT A; 2C0O A; 2LX7 A; 2JMA A; 2EGC A; 2V1R A; 1KJW A; 3UF4 A; 2KE9 A; 1X6G A; 2DRK A; 1RUW A; 2C0I A; 3PVL A; 3H41 A; 1H8K A; 3M0S A; 1T0J A; 1Y57 A; 2EBP A; 2KT1 A; 1VYT A; 3I35 A; 1M8M A; 4JZ4 A; 1PWT A; 3NGP A; 1JU5 C; 1K0X A; 2JT4 A; 2D8H A; 1QKW A; 2F2W A; 1B07 A; 2VKN A; 2HBW A; 1NEG A; 2RMO A; 1K4U S; 5IXF A; 2X3W D; 2LNH B; 2OJ2 A; 1OPK A; 1YN8 A; 1QLY A; 2BZ8 A; 3SHW A; 1BBZ A; 1WLP B; 1MUZ A; 1YWP A; 2MIO A; 1JXM A; 3A98 A; 2LJ0 A; 4RTX A; 3QWX X; 2KR3 A; 1UUE A; 1GBQ A; 2J06 A; 4R0K A; 2KRM A; 1WYX A; 1I0C A; 1X6B A; 1UFF A; 1IO6 A; 2LCS A; 2A37 A; 1ZUY A; 2SEM A; 2FPF A; 2FRW A; 3JV3 A; 5I22 A; 1U06 A; 1J3T A; 2EYY A; 3VRZ A; 4J9H A; 2VVK A; 1K1Z A; 1K9A A; 1SRL A; 2KRO A; 4AFS C; 2VWF A; 1WA7 A; 2HEQ A; 3C0C A; 1UHC A; 2GNC A; 2RPN A; 1JXO A; 2W10 A; 2W0Z A; 1SPK A; 1GRI A; 5IXB A; 2G6F X; 1PNJ A; 2YUO A; 3I5S A; 1CKB A; 4HVU A; 1UE9 A; 1AWO A; 2YDL A; 3RBB B; 4Z88 A; 3NPF A; 1HD3 A; 2B86 A; 2K9G A; 3THK A; 2H8H A; 1GFC A; 4AFU C; 1G2B A; 1UTI A; 1U5S A; 4J9C A; 1KFZ A; 1SHF A; 1VA7 A; 3VS4 A; 2ABL A; 3VS2 A; 2IIM A; 3CQT A; 4ZNX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Q86 C; 2V8I A; 5KYU A; 3CMA A; 5GAO q; 4DBF A; 3EH2 A; 3SDZ A; 2DL7 A; 4N0A A; 4M7A C; 2YLB A; 4BDZ A; 2OTJ Q; 4LUD A; 3G7Z A; 3OYK A; 1ZSG A; 1AVZ C; 2FZC B; 4RTT A; 3EFO A; 2KQW A; 2JTM A; 2P0P A; 1ZBX A; 4M77 G; 4L59 A; 4E7L A; 2K2M A; 2MF2 A; 5IH2 A; 3NTH A; 3JCM c; 3EH1 A; 5I2M A; 2KAF A; 2C0T A; 2OX7 A; 2WSE E; 2EKH A; 2XI9 A; 1OX9 A; 1WHK A; 4C8Q G; 3LX7 A; 1AD5 A; 4KH0 B; 3EGD B; 5CKE A; 3CCL A; 2DF6 A; 2JZ2 A; 2QGG A; 2D8J A; 1YJ9 Q; 2LC4 A; 4QVZ A; 4RTY A; 2LQW A; 2BIV A; 3VRY A; 4M77 A; 2EJG A; 4EIK A; 3UPU A; 1AZG B; 2RJD A; 2PUO B; 2OAU A; 1U1S A; 6AT1 B; 3CCU A; 2YUP A; 2PTK A; 2ECZ A; 4C8Q A; 4XTU A; 3FDR A; 3C4S A; 1KC8 U; 5D6Y A; 3E9G A; 4QKU A; 2CSI A; 2QA4 T; 2DA9 A; 3D7S B; 1WI7 A; 1KHC A; 2R5A A; 1N8R R; 1YJW Q; 2OTL T; 3SB2 A; 2DL3 A; 3OYJ A; 1K73 R; 1KQS S; 4PJO F; 4XQ3 A; 1BI1 A; 2V26 A; 1IRX A; 4NOY A; 5LJ5 e; 4Z89 A; 4F17 A; 3UA7 A; 4PFZ A; 4DA4 A; 2OAW A; 1IXD A; 2SRC A; 4M75 E; 5GAM g; 2MMP A; 3OYG A; 1BI3 A; 5IHI A; 1A0N B; 2FHD A; 2GTO A; 1ZA1 B; 1VQL Q; 2KBT A; 2QQ9 A; 3REA B; 5A0L A; 1YIT A; 3PMT A; 2CZ7 B; 3CCS A; 3LH5 A; 1BB9 A; 1VQ8 T; 2NLU A; 3QII A; 3CCJ T; 3DLL A; 2QEX Q; 1MV0 B; 3L2Z A; 3MEV A; 4KUI A; 1I5O B; 3G71 A; 4MZT A; 1U1T A; 2GBQ A; 3P8B B; 1D1C A; 4QT7 A; 5GAN g; 2VUB A; 1M3A A; 5FWC A; 4X1V A; 2JXB A; 3HP9 A; 3CCV Q; 4BI8 B; 5CAI A; 1NM7 A; 1T0H A; 1QVP A; 4M78 G; 1OOT A; 4FSS A; 4E47 A; 1K9M R; 2ATC B; 2O4X B; 3NFC A; 4Y91 A; 1BKB A; 3C94 A; 1GFD A; 3G6E T; 1MNE A; 1M27 C; 4X9D A; 5GAO l; 1MMA A; 1WHL A; 3JB9 J; 3OS0 A; 1ARK A; 4OML A; 3E1S A; 2ESW A; 3P8H A; 4NL2 A; 4OGC A; 4ME7 A; 3OW2 P; 3RKY A; 2FG0 A; 2ZCF B; 2H3E B; 2LNV A; 1X2Q A; 2CP2 A; 1PSE A; 1HK9 A; 1AEY A; 4F7U G; 4EDU A; 1NZ9 A; 2HSP A; 3WVD B; 4XU1 A; 2ZPF B; 2RA2 A; 2QK0 A; 1VQN Q; 4OMQ A; 3MEA A; 4LDY A; 3JCM P; 3C12 A; 4FL6 A; 5CVI A; 3LGF A; 4M75 B; 4EMG A; 2K4Y A; 5L8R E; 2NUP B; 1JJ2 A; 2QYZ A; 3MP1 A; 3V7S A; 1AT1 B; 3ME9 A; 1YIJ A; 1N8R C; 3EG2 A; 5LJ5 h; 4JRK A; 2EGA A; 2H3J A; 5LJ3 e; 1Y96 A; 2RQU A; 2DEU A; 4A4H A; 3RER A; 1K73 C; 1YCY A; 2MOX A; 3QJY A; 3CC7 T; 3CCQ A; 2GFU A; 2GTJ A; 2DTO A; 1PG5 B; 2ZPE B; 3H9N A; 2PZ1 A; 4PJJ A; 2YXY A; 3EHQ A; 3DB4 A; 2DVE A; 2M9U A; 4JZ3 A; 1U3O A; 3QKJ A; 4JRP A; 2RHX A; 4J6W A; 2P0Q A; 4CRI A; 3JB9 D; 3HRU A; 4ESR A; 1YWO A; 4D6W A; 1I07 A; 3URG A; 2X4Y A; 1G83 A; 2DTI A; 4J9D A; 4M7D F; 3OYH A; 3FEO A; 4Y92 A; 3JB9 H; 4PKC C; 4C5H A; 1X27 A; 2JMC A; 3OYB A; 1UGV A; 1ABQ A; 4FYV B; 4FSX A; 2JJ9 A; 1WJS A; 4DEX A; 1VQM Q; 3JAM E; 2O01 E; 1Z9Q A; 2WAC A; 4Z02 A; 2EYZ A; 1OV3 A; 2F2V A; 1VQ5 A; 3N5B B; 2CYZ B; 4OB0 B; 1BI0 A; 2Y90 A; 4HVV A; 2V1Q A; 4ANJ A; 1PSF A; 3R6N A; 1QWF A; 2BZX A; 3CC4 Q; 4C92 F; 2KRS A; 4XTX A; 4XU2 A; 1VQ9 A; 4ELZ C; 1K9M C; 3NMZ C; 1OEB A; 3KFV A; 2RQR A; 3VUB A; 4L5G A; 2AKL A; 3OYM A; 3CCE T; 1ZQ1 A; 1BIA A; 1YJN T; 1GXI E; 1M3B A; 2D0Q B; 5KH6 A; 1TUC A; 3EGD A; 3CCM T; 1M1G A; 2CP7 A; 2E70 A; 1QMC A; 2EYX A; 1WDX A; 1B3Q A; 2A08 A; 1UJ0 A; 2MCN A; 2EVR A; 4M7A E; 2KT8 A; 4HT8 A; 2C0O A; 2JMA A; 1MMN A; 3UF4 A; 2EWN A; 3AHU A; 3A8H B; 3PVL A; 1RAA B; 5LJ3 h; 3M0S A; 1NBE B; 1T0J A; 5GAM d; 2EQK A; 4OMF B; 3WVE B; 3I35 A; 1M8M A; 4JZ4 A; 5D6X A; 1K0X A; 1JU5 C; 3KUF A; 2F2W A; 3SWN C; 3J81 E; 1YJ9 A; 3JCM J; 2P4T A; 2RMO A; 1M1K R; 3M56 A; 4FW1 A; 2OJ2 A; 2PQW A; 1OPK A; 1QLY A; 5GAN 5; 4OGE A; 5J3B A; 4DBR A; 3A1P A; 3T9N A; 5LJ5 j; 2DEQ A; 4MDW A; 1UUE A; 4BE0 A; 4R0K A; 3CPW A; 2KRM A; 1VQO T; 4IKF A; 1ZUY A; 3L2Q A; 5GAN d; 4XTV A; 2KI7 A; 2XDB A; 2FRW A; 4LDW A; 1VQ4 Q; 5I22 A; 1U06 A; 1YI2 Q; 1MND A; 4PJO B; 3RDV A; 1R0C B; 2VVK A; 1KG1 A; 1NE8 A; 1QP2 A; 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2ZZD A; 1H3H A; 2AKK A; 2MAM A; 4C0D C; 4C8Q C; 1NLP C; 4E6R A; 2JTF A; 4GLK A; 4FCY A; 1D3B B; 3HKS A; 4X34 A; 5CKH A; 1UGR B; 2KXD A; 3GNF B; 1WHM A; 4PJO C; 2DIG A; 4HXJ A; 1B34 B; 1X6O A; 4EPC A; 4KGV B; 1T3L A; 2QA4 Q; 4XU3 A; 4C5I A; 4JS5 A; 4HA8 A; 3TVT A; 4NS5 A; 1Q82 U; 2MYS A; 2OTL Q; 1N5Z A; 1KHI A; 1EZZ B; 1QVF A; 4RMO A; 1LVK A; 4GBQ A; 2JTE A; 4RCC A; 5HK3 A; 1HJD A; 5CK9 A; 2DE0 X; 5LJ3 f; 2JN0 A; 2CP0 A; 4D8D A; 2X3X D; 4J9G A; 2Y4Y A; 3CCR T; 1Q86 U; 1BU1 A; 2V8K A; 1M30 A; 3CPW S; 1VQM A; 1X75 C; 1D0Y A; 4RG8 A; 5CCA A; 3M0P A; 2M0Y A; 5CR2 A; 5KYW B; 1JBM A; 2MK5 A; 3SD4 A; 5L23 A; 5GMK e; 1GCQ A; 3PIP A; 1VQ8 Q; 3CCJ Q; 3CC4 A; 3SEM A; 4XAX B; 4D8K A; 2E5Q A; 1XTD A; 4PLI A; 5IAY A; 2LZ6 B; 1M90 R; 2KY9 A; 3H0I A; 2L2P A; 3JCM e; 3OSS C; 2G3R A; 2DK3 A; 1FYN A; 2NUZ A; 3J80 E; 4M7D D; 3G1J A; 4KT0 E; 3FB9 A; 1KQS P; 1N27 A; 1H92 A; 3M5A A; 4BE1 A; 2O9S A; 4JJB A; 5GMK m; 3L2R A; 4RTU A; 3MP6 A; 4M77 F; 1MV3 A; 5J39 A; 5J26 A; 5I11 A; 3G6E Q; 2DO3 A; 3TCJ A; 2LP5 A; 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