1NGA | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
total genus	120
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngaA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngaA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngaA04

1NGFA 1K8KB 4FSVA 1GLDG 2ZGYA 1XQSC 2P9IA 5LJVA 2HF3A 4JHDB 4WQ5C 2A5XA 2ASMA 2Q97A 3GBTA 2FXUA 4DB3A 4IO8A 4BR2A 5AQGA 3LM2A 2NLXA 4BVOA 5BRFA 4YDUC 5FPDA 2E2NA 4DCHA 4JHDA 3VF6A 5BRDA 3VESA 3U9DA 3KZBA 3CHWA 2GWJA 5FPNA 5AZIB 4MLHA 3FLCO 5AQXA 4CZIA 2YHWA 5BRHA 3U8XA 5KPTA 1QQMA 1NGIA 3CETA 4BRPA 4FWOA 5KQDA 3BEXA 3DJCA 2OANA 5FPMA 1J6ZA 2A40A 4BRCA 3BF3A 3HZ6A 3O08A 3HTVA 1CZAN 3CJ1A 4CZGA 1XUPO 2H3GX 4PKIA 1RFQA 1WUAA 3WQUA 1TYQB 4MLEA 3O5BA 3CJAA 5AQPA 3IUCA 4B1XB 5KPRA 1JCGA 2YHYA 1NGCA 3M1FA 4RTFD 1QHAA 4EAHD 3A5NC 2ASOA 3O80A 2QWOA 5EY4A 5BPLA 4BRLA 2GEMA 4E1JA 1HKGA 3DXMB 1TYQA 4K25A 3WXLA 1H1VA 1BWFO 3FGUA 3SMPA 3VGMA 2ITMA 2Q31A 4A61A 1YAGA 4BC5A 2P9SB 2IVNA 1WOQA 3H1QA 3ZX0A 3ENHA 4IXCA 3VENA 2HF4A 4BQLA 2P9LB 2QM1A 1C0GA 1T6DA 3ZX3A 4JAXA 2E1YA 5ADXA 5AQHA 2P9SA 3P4IA 1BA1A 5AFUH 3VOVA 5AQOA 1NGHA 4JN4A 4IWVA 2E2OA 2D0PA 3H1VX 1BO5O 3D2EB 2J4RA 4BRKA 4H5RA 1GLLO 2P9LA 3HM8A 1GLBG 2YHXA 2Q36A 2DPNA 2P9NA 2BUPA 3VF2A 2QWPA 2Q1NA 4BRDA 1R59O 1YUWA 5BPMA 3B8AX 4WYBA 1S22A 5AQUA 3WQTA 4GNIA 3LM9A 4BQZA 3QDKA 3D2EA 3MN7A 4CJ7A 4Y0WA 3C7NB 4BG9A 4O8KA 4JNEA 2CGKA 3MN6A 1EQYA 1NWKA 3AAPA 3EZWA 1Y64A 1BG3A 1HX1A 3FZHA 1OKJA 2CGJA 2V51B 5EOYA 4BGBA 4B1ZA 1ATNA 3L4IA 3GOIA 3O6WA 4FO0A 3SJHA 4BRIA 1GLAG 2YJEA 3FZKA 1SQKA 4QS8A 3AAQA 4BRHA 2CH6A 1YVNA 4YDUA 4EIAA 3DXKB 3JXUA 4BROA 3HI0A 3CIPA 3FZLA 1TUUA 4AM6A 3A5OC 1Q18A 2F9WA 2W41A 3VEOA 3SLCA 3J8AA 3O8MA 2P9PB 1E4GT 4BRNA 4CBWA 1IJJA 2A6AA 3H45C 1RDWX 5AQIA 1X3NA 1MWKA 2P9KB 4IZ9A 3WXIA 4BREA 3UKUB 1TUYA 3IMXA 1ESVA 4PKGA 3CERA 3M3ZA 4K42A 2P9PA 4FWMA 1K8KA 5BREA 4BRGA 2AP1A 2D0OA 2QWRA 4MO4A 4LC9B 3VEYA 3VGLA 4H5NA 5JICA 4CZKA 3CQXA 2BTFA 2QWMA 3BUZB 4CZJA 3R8EA 2PBDA 3GDQA 5AQWA 4RWTA 2VWBA 5EXWA 3EN9A 3A0IX 3VEXA 4BR9A 2GTDA 3CJBA 5AQRA 1T6CA 1IG8A 2A3ZA 3ATUA 3A5LC 3W3DA 1YXQA 4BRAA 1NGEA 4CI6A 4WQ4C 4H0TB 3SMSA 5EX5A 1HKCA 4KBOA 5AZIA 5AQFA 3HBTA 5AQNA 1XC3A 2E8AA 1GLJO 4FWQA 1KXPA 4FWRA 4BGAA 1ZC6A 3MN5A 4H0OA 2ZF5O 1QQOA 4CD1A 5JMVA 2W40A 4B1UB 5AQJA 2Q2RA 4BR7A 4DHYA 2D1KA 5AQSA 3O4WA 2V7ZA 4EFHA 1QQNA 4BRFA 3QMLA 3LL3A 5FPEA 5BN8A 2E2QA 2E1ZA 4H0PA 2EWSA 3I33A 3DXMA 5ELZA 3FR0A 2YJFA 4BC4A 1ATRA 1V4SA 1MA9B 3QBXA 5KPZA 2Q0UA 5F0XA 3WXJA 1DKGD 2QWNA 3L0QA 2I7PA 4M63C 3ULEB 1U6ZA 2P9UB 2HMPA 3LDPA 2ZGZA 4MO5A 4PKHA 3ID8A 3D2FB 1DGKN 2A41A 3QICA 4B1YB 1ZBSA 1S3XA 2FSJA 1BOTO 1HPMA 4QS7A 2HOEA 3UE5A 3VETA 3ZETB 5AZJB 4M7XA 2V7YA 4EHTA 2P9UA 2I7NA 3EKSA 4A62A 2KHOA 3S41A 3D2FA 3C0BA 4GY2B 2GWKA 1HLUA 3OHRA 4HTLA 4CD3A 3BF1A 1E4FT 1LCUA 1HUXA 4Z94A 2WUSA 5AQKA 4B9QA 4H0VB 4FWPA 4BRQA 4CZLA 3C7NA 2A42A 4FOEA 4IJNA 2IVOA 2YCHA 4FWSA 2V52B 1KAYA 4O5FA 1QZ6A 2FSNA 4JD2B 4NB4A 3H3NO 1P8ZA 4QS9A 3DWLA 3VERA 4BG8A 3O1BA 1BU6O 1QZ5A 3VF4A 4B1VA 1RGIA 3MK6A 4XH4A 1KAXA 3CQYA 1GLCG 4H5WA 3A5MC 1LOTB 4CBXA 3DXKA 4IJAA 5E26A 1DEJA 4FPBA 1NLVA 4WQ4A 1NGJA 4M7YA 1NGDA 1Z05A 3EL2A 3CJCA 4H03B 4BRMA 3AARA 4AM7A 3UKRB 4CZEA 4H0YB 1JCEA 1X3MA 4BR4A 5BPNA 3FE1A 5AQTA 1D4XA 2P9KA 3H3OB 4CZHA 1U2VB 3UKUA 2VCPA 1T44A 3F9MA 3QFUA 3KHYA 4FL9A 4BR0A 3IFRA 4EHUA 3UKRA 3O1WA 3FZFA 3VPZA 5JLFA 4BR5A 3TPQA 1U2VA 1KAZA 3VEWA 3H46O 1NM1A 1GLFO 4ISGA 3L6QA 4B1WB 5EVZA 1NBWA 1NMDA 3LDNA 4K43A 4PL8A 4F9OA 3A8YA 3CI5A 1Z6RA 2F9TA 3QFPA 4FWLA 2CH5A 1GLEG 3CJ7A 4BC3A 3D7EO 4L3QA 3M6GA 4K41A 4J8FA 2GELA 5JLHA 1V4TA 2FLOA 1MWMA 3MCPA 1ZXOA 3MN9A 1MDUB 3TU5A 5B8HA 1G99A 5LY3A 2PAVA 4XEIA 2ZWHA 5TKYA 1BUPA 4FWKA 3R9PA 3G25A 2QWQA 5AFUA 5AQLA 2AA4A 3ZEUB 4BVPA 3AY9A 3GL1A 3VEZA 4C23A 4I6MB 3CJ9A 1BDGA 3HSCA 1SAZA 4A2AA 2VYPA 2QWLA 2D4WA 2Q0RA 3VGKA 1NGGA 5AQVA 3LDOA 3R6MA 1X9JA 4HWIA 5AR0A 3ZEUA 3ZX2A 2UYTA 5AQYA 2IVPA 4I6MA 1C0FA 2E20A 4DQ8A 2E2PA 4ISFA 3QB0A 5AQQA 3ULEA 3FZMA 2P9NB 3UB5A 2GUPA 5KQ8A 3WXKA 3KVGA 2IIRA 4H0XB 3RSEB 1JCFA 3ENOA 3WEEB 3SK3A 3U4LA 3MMVA 1HKBA 3EO3A 5AQMA 5ADXH 3ZETA 3IDHA 5AZJA 1HJOA 5CE3A 3EKUA 3GG4A 3RSEA 3QBWA 4FPAA 3WEEA 3I8BA 2CGLA 3JS6A 4FOIA 5BR9A 4XH5A 5AQZA 5LJWA 2QW9A 4CZMA 4BC2A 4A2BA 4NO7A 4RCHA 3LDLA 4H5VA 1NGBA 2NZTA 2ASPA 2FF3B 2NRHA 5E84A 3W0LA 4JD2A 3LDQA 5F2RA 3WUHA 5F1XA 1NGAA 2QXLA 3H6EA 2YI1A 4WQ5A 4CZFA 5BN9A 2E88A 5I9EB 3GE1A 4ISEA 2FSKA 2FF6A 3ATVA 4PL7A 3MDQA 2P9IB 3BP8A 1BA0A 3U9ZA 3WT0A 3FFKB 4FWNA 1SZ2A 4XH1A 3VEVA 3DAWA 4CBUA 4H5TA 1ATSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1K8KB 2RF2A 3TANA 2NY8X 2VG5A 1YI2N 4CF8A 4A5BA 5LJVA 2E3GA 2A5XA 3BY5A 4DQRA 4G9ZA 4WCEL 4DB3A 5H1SQ 4IO8A 1LAVA 4O8UA 3HSTB 4FW1A 2QXFA 2F96A 3SI6A 2E2NA 5FLXO 3ZSYA 4CQKA 4JKCA 2WBNA 5FPNA 2HHVA 5AZIB 5AQXA 4CZIA 2IOCA 2YHWA 5BRHA 3U8XA 2D0CA 2ETJA 2FBXA 1ZYWA 4AF1A 3K9JA 4XJXA 1OH5A 3PIPL 2OANA 4I7FA 5CYMA 1NK5A 4M3WA 3HZ6A 4CGDA 3CJ1A 4M41A 4JKDA 4FM2A 4FLVA 4MLEA 3OYDA 4M3UA 4DUYK 2QK9A 3O5BA 3CJAA 5AQPA 3MXIA 3S9HA 2HHIA 3MXMA 4U67L 1KLMA 3SAFA 2GEMA 2O8DA 4E1JA 1BHLA 2PFUA 1FXXA 2DTUA 3IG1A 3E9PA 3SMPA 1SL2A 2ITMA 2Q31A 1LW0A 1J9AA 1SL0A 2AJQA 1XHXA 2YC1C 4I9LA 3HYFA 4BE1A 1NK0A 4DR4K 3T69A 2NNWA 3KP1A 1QS4A 3SJJA 4BQLA 2P9LB 1T6DA 3NHGA 3AVFA 4JAXA 2E1YA 2P9SA 1BA1A 3VOVA 5HOOA 4ELTA 4IWVA 4CHPA 4CF9A 3H1VX 1BO5O 3CYMA 2BGGA 4LH5A 1YTUA 4BRKA 4H5RA 3NVKA 1N34K 4JI3K 3JAMO 2DPNA 4PHTX 2BUPA 1NKEA 1YUWA 3O3FA 4GNIA 3LM9A 3QDKA 4RW7A 3ZT2A 3D2EA 3MN7A 4DG1A 5KRSA 3L3VA 4KTZA 1HMVA 3MEEA 4IG3A 2VQFK 3KD1E 4JNEA 2CGKA 3SUOA 1NWKA 1P00A 1KTQA 1FH3A 1NG9A 3HVRA 5EOYA 4BGBA 3L4IA 1I2VA 1GOAA 4IOAL 3FZKA 2E3FA 3L2RA 4YNQA 4W5TA 1T7PA 3ULDA 1YVNA 4CE9A 2LSNA 3N4PA 4CJLA 3P5JA 1OH6A 3TWHA 1Q8IA 3A5OC 3DLEA 3SLCA 1WT7A 4BWJA 4CBWA 4AAZA 3H45C 1RDWX 5M1OA 1NJXA 5AQIA 4KHQA 3KK2A 4KI6A 4CHZA 1X3NA 4IZ9A 3SQ1A 4BREA 3UKUB 4KHYA 4LFBK 4PKGA 4J2DA 3CERA 1HNIA 3NCIA 4K42A 4FWMA 4CJEA 3I56N 3BZKA 3M8PA 4ILHA 5KTQA 4O0IA 2QI2A 4MO4A 2HW3A 2KBJA 5GIPA 4DSLA 4AHSA 3HRGA 1OVYA 1S1XA 3HT3A 4TSXA 1T7EA 4F2SA 3KWIA 4CZJA 3OY9A 3QLHA 3GDQA 5AQWA 3C65A 2HNYA 3A0IX 2GL1A 3TSPA 3CJBA 1HNZK 4AHCA 2W42A 4DWIA 3ATUA 3ZT0A 4Z4EA 1IH7A 3V9UA 4WQ4C 5C15A 4DV3K 1VQ5N 5EX5A 4OGEA 1HKCA 5AQFA 2HHHK 2KYQA 3CPEA 3HBTA 1XC3A 4E0DA 5JENA 4WFNL 1GLJO 3JYTA 4IDKA 4F3TA 4FWQA 1FKPA 1ZC6A 3CW4A 4H0OA 1EETA 1RT4A 3QERA 3C6HA 2Q2RA 4BR7A 3LP2A 3AGRA 1AYJA 2DFEA 4HUFA 3J81O 3OYAA 2JGUA 2RE2A 3LL3A 4FLWA 5BN8A 3DYAA 2E2QA 2NRXA 2VGMA 1QE1A 1DLOA 4FVUA 4AH9A 3OYCA 2KTQA 3J7ZO 2IDOA 1VNAA 3L2WA 2EHGA 3E9OA 3OS0A 1VSFA 5KPZA 2Q0UA 2HMIA 5F0XA 1QQCA 4OKJA 3WXJA 1W7AA 4M63C 3ULEB 4RW4A 4Z4IA 4CEBA 3D2FB 3LPUA 1S3XA 3CCJN 4GKKK 1HPMA 3VETA 2O8FA 1D9DA 2YIOA 3T1YK 1ZBHA 2I7NA 5FDLA 1WSEA 3KWGA 3AA2A 1C56A 1HLUA 4HTLA 3BF1A 4FZZA 2MZ0A 4FJ9A 1E4FT 1LCUA 2E6MA 4E7KA 2WUSA 2KFZA 4H0VB 4BRQA 1OVQA 3O9QA 2B4JA 3C7NA 3O9UA 2A42A 4IJNA 3EZ5A 1UA1A 2IVOA 1U4BA 3NFAA 4KTWA 1R0AA 4IG0A 4OPAA 3H3NO 1P8ZA 3DWLA 3VERA 1E3MA 1JJ2M 4YY3K 4Z4HA 4X65K 2PZSA 2YKMA 1CXUA 4I9QA 1FKOA 2KPYA 2X74A 4M3RA 2HVHA 1MU2A 4F2RA 1HYZA 1YJWN 4NLCA 2HNDA 4FPBA 1KVAA 4M7YA 2G8VA 1T05A 3CJCA 1D9FA 3CG7A 3TAMA 4BRMA 4AM7A 4E3SA 1JCEA 4BR4A 1UAXA 1D4XA 5MLCQ 5FROA 4CERA 1P90A 3F9KA 4CEZA 3F9MA 3QFUA 2N2QA 5C25A 2X78A 4MDBA 2GBZA 4FVMA 2XO7A 3FZFA 1KSPA 4BR5A 5AJ3K 3OYLA 4DTPA 4WE1A 1KAZA 1HJRA 3H46O 2KQ2A 3M8SA 3HOTA 4HHTA 4CW7B 3F2KA 4PL8A 4IFVA 4FWLA 4KV8A 1QHTA 3CJ7A 3G0ZA 4IFEA 1BCGA 3M6GA 4FJXA 3TTCA 3EE9A 2ATQA 4AEIA 4IO9L 1XMQK 1S9EA 5GIOA 4KHUA 5CYQA 4JV5K 3MN9A 3SZ2A 1GOBA 2N2RA 4GV6A 2PAVA 3AO3A 3IAYA 3RR8A 4GMJB 2FBYA 1LAWA 5J1EA 3LWMA 1FW6A 5AQLA 3VMFB 1SV5A 1XRSB 3AY9A 3GL1A 3VEZA 3RMDA 3CJ9A 2LY6A 4A57A 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3AVCA 1ZBFA 1JCGA 4B9LA 1NGCA 2DY4A 4EAHD 3SUQA 3RR7A 3O80A 2QWOA 1C1BA 1HKGA 1ITGA 3WXLA 1BWFO 2VWKA 5DMRA 2EX3A 3VQCA 4Z4FA 1ASVA 1JLGA 4E1MA 1YAGA 4BC5A 3KC6A 1TV6A 4HUGA 1LW2A 3K59A 1WOQA 2I5JA 3H1QA 3ZX0A 2YIPA 3VQQA 1I6FA 3LZIA 2HF4A 1C0GA 1VQ9N 1LQQA 3NH2A 1JXBA 3WNGA 3THXA 4JN4A 1NGHA 3KLEA 4DS5A 3HPGA 2D0PA 2O4GA 3IS9A 4BWMA 4B3TK 1GLBG 2YHXA 4W5NA 2RPIA 2P9NA 3AVGA 3VQ5A 5C2DA 1C0TA 1QSLA 4BRDA 5AQUA 3AVHA 3CFRA 1XC9A 3VQBA 3O9SA 3WNEA 3NF9A 4YOYA 3KK7A 3C7NB 4BG9A 3SV3A 4CGGA 3VQ9A 3OYKA 3MN6A 2F7TA 1JLAA 3ZSVA 2OPRA 3K5NA 1HX1A 5FRMA 4JRQA 1JZAA 1RT5A 3GOIA 2HBLA 5KRTA 1L5UA 3KLGA 2O8EA 1SQKA 3BGRA 4CGIA 4QS8A 3AAQA 4BRHA 1YJNN 2CH6A 4HUEA 1HPZA 4DFKA 4BROA 4B9MA 1RBVA 4NYFA 4M3XA 3FZLA 3DOLA 3EE8A 1TUUA 1WSHA 4AM6A 5J2NA 4J2BA 4JS4A 3KD5E 1TK0A 3OS1A 3SBGA 1NE5A 1IJJA 3HL8A 1RT2A 4HE7A 4MFBA 3PSMA 4LY7A 4UQGA 1MWKA 2F8SA 3CCVN 4ILJA 3AGKA 3IMXA 1ESVA 4FXDA 1L3UA 1U48A 5CR4A 3KOYA 3M3ZA 2P9PA 3LP3A 1SKRA 4C8KA 4IOXA 3QI7A 4LC9B 3TSUA 4H5NA 5JICA 4CZKA 1VSJA 3ZCMA 3V6DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K8K B;  2RF2 A;  3TAN A;  2NY8 X;  2VG5 A;  1YI2 N;  4CF8 A;  4A5B A;  5LJV A;  2E3G A;  2A5X A;  3BY5 A;  4DQR A;  4G9Z A;  4WCE L;  4DB3 A;  5H1S Q;  4IO8 A;  1LAV A;  4O8U A;  3HST B;  4FW1 A;  2QXF A;  2F96 A;  3SI6 A;  2E2N A;  5FLX O;  3ZSY A;  4CQK A;  4JKC A;  2WBN A;  5FPN A;  2HHV A;  5AZI B;  5AQX A;  4CZI A;  2IOC A;  2YHW A;  5BRH A;  3U8X A;  2D0C A;  2ETJ A;  2FBX A;  1ZYW A;  4AF1 A;  3K9J A;  4XJX A;  1OH5 A;  3PIP L;  2OAN A;  4I7F A;  5CYM A;  1NK5 A;  4M3W A;  3HZ6 A;  4CGD A;  3CJ1 A;  4M41 A;  4JKD A;  4FM2 A;  4FLV A;  4MLE A;  3OYD A;  4M3U A;  4DUY K;  2QK9 A;  3O5B A;  3CJA A;  5AQP A;  3MXI A;  3S9H A;  2HHI A;  3MXM A;  4U67 L;  1KLM A;  3SAF A;  2GEM A;  2O8D A;  4E1J A;  1BHL A;  2PFU A;  1FXX A;  2DTU A;  3IG1 A;  3E9P A;  3SMP A;  1SL2 A;  2ITM A;  2Q31 A;  1LW0 A;  1J9A A;  1SL0 A;  2AJQ A;  1XHX A;  2YC1 C;  4I9L A;  3HYF A;  4BE1 A;  1NK0 A;  4DR4 K;  3T69 A;  2NNW A;  3KP1 A;  1QS4 A;  3SJJ A;  4BQL A;  2P9L B;  1T6D A;  3NHG A;  3AVF A;  4JAX A;  2E1Y A; 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1NGAA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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