1NGB | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINQPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngbA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngbA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngbA04

1ATRA 1V4TA 3ZETA 1NGHA 3ATVA 3FZKA 1SAZA 2IVOA 2QWNA 4BR9A 1R59O 2Q0RA 4H5TA 1NBWA 3CJ1A 3JXUA 2Q97A 4YDUC 5FPDA 2HF3A 2D0OA 3HSCA 2CH6A 5ELZA 3L4IA 3HZ6A 3H3OB 1KXPA 2E2NA 5E26A 3H6EA 4QS7A 5FPNA 1HJOA 4GY2B 2AP1A 3J8AA 4QS8A 4XEIA 4NO7A 4C23A 4FWLA 3A8YA 2IVPA 3A5LC 2Q31A 3CJ9A 4IJNA 5AQJA 3R9PA 3KZBA 3ID8A 2A5XA 3VF4A 3SK3A 1DGKN 2ASMA 4FL9A 3FZHA 3MDQA 1HKCA 2QWRA 4PKGA 1YVNA 1GLLO 4EHTA 4B1XB 4BG8A 4AM6A 3ATUA 4BRCA 2YHYA 3F9MA 4H0OA 3W3DA 3MN6A 2WUSA 2YHWA 5AQYA 5EY4A 2HF4A 2P9PB 2E2OA 2D1KA 4Y0WA 3VEVA 3WXJA 1U2VB 5LJWA 4BRNA 3AAPA 1GLCG 4EHUA 3RSEA 3FZMA 3C7NA 3CJ7A 5EXWA 3O5BA 5ADXH 3LM2A 2CH5A 3AY9A 2QWMA 4CZHA 4H0VB 3QBXA 4WQ4A 3EN9A 4H03B 2F9WA 2P9KB 4BRAA 4B1YB 1X9JA 1BOTO 4FO0A 1NGEA 4WYBA 2AA4A 5BRDA 1SZ2A 3MN5A 3DJCA 5KQDA 1KAYA 1MWKA 3CHWA 3SJHA 3TPQA 1ESVA 3UE5A 2HOEA 3IFRA 1K8KB 3QBWA 4MLHA 3SLCA 3IDHA 2P9PA 4BR0A 4RTFD 5BN8A 1NGDA 2W40A 3IMXA 4B1VA 4BGBA 5AQUA 4EIAA 4E1JA 5EVZA 3ZEUB 2Q1NA 3G25A 2QM1A 4F9OA 1E4FT 3CIPA 4DB3A 4CZJA 1ZXOA 2BUPA 2CGKA 4JNEA 3U8XA 4JD2B 3MCPA 1KAZA 5AQWA 4GNIA 4H5VA 4H0PA 3VPZA 3ZETB 4FWOA 3GBTA 3CJBA 2P9SB 3WT0A 4KBOA 4IZ9A 4AM7A 4CJ7A 1QZ6A 5KPRA 4FOEA 3BF1A 3AAQA 2P9KA 4FWPA 4A2AA 3P4IA 1NGJA 4IO8A 3H3NO 1D4XA 5CE3A 3ULEA 1BDGA 4CZMA 3VEZA 3FZLA 4WQ4C 2E2QA 4M7YA 2HMPA 3C0BA 1K8KA 4JAXA 1X3MA 4RCHA 5BPLA 1C0GA 1HKBA 1TUUA 1HX1A 4K25A 3D2EA 4HWIA 4CD3A 3A5MC 5AQXA 3QFUA 1HLUA 2P9NB 1C0FA 2FSNA 4BGAA 4BVPA 4JD2A 3I8BA 5KQ8A 4BC2A 5AQZA 5AQIA 1Q18A 3I33A 2P9SA 5AZIA 3CETA 3RSEB 3C7NB 2FF6A 4DHYA 4L3QA 4BR2A 2E8AA 4BR4A 3GOIA 1NWKA 2NRHA 1LOTB 3VEWA 1U6ZA 2EWSA 2NLXA 2V51B 3H1QA 3A5NC 2FSJA 3QMLA 3D7EO 4ISFA 4B1ZA 2P9LA 4CZFA 1QQMA 4IJAA 3VETA 1H1VA 2GTDA 1Y64A 4XH4A 1DEJA 5AZJA 3FE1A 1NGIA 2QWLA 1NLVA 1QHAA 4B1UB 2ITMA 2P9NA 5BREA 1GLAG 1Z6RA 2D0PA 4CBWA 3HBTA 3O6WA 1TYQB 2ZGYA 1ATNA 2GWKA 3WQTA 5EX5A 4FWNA 5AQPA 3LDOA 2YJFA 2QW9A 4CD1A 1CZAN 4LC9B 1BWFO 3O1WA 4K42A 5AQSA 5FPEA 1QZ5A 2YJEA 1EQYA 1MDUB 3ENHA 1HPMA 1IG8A 5E84A 1YUWA 2IVNA 1QQOA 3S41A 5JLFA 2ZGZA 4ISEA 2OANA 4CZGA 1BA0A 4BRIA 2VYPA 2V7ZA 5AR0A 5FPMA 2E88A 2Q36A 3GDQA 3VGKA 4MO4A 3SMPA 4XH5A 5B8HA 4QS9A 2P9UB 3ULEB 3VF6A 3W0LA 5JICA 1BO5O 5AQOA 4MLEA 2ZF5O 3EL2A 2FXUA 2GUPA 3O80A 1TYQA 3LDNA 3D2EB 1YXQA 5F0XA 3H45C 2H3GX 4BR5A 1NGBA 2PBDA 1JCEA 2GEMA 2NZTA 2ASOA 2YHXA 3KVGA 5AQNA 1BG3A 1GLBG 1HUXA 3WEEB 1ZC6A 3ENOA 5JMVA 3JS6A 4HTLA 3BUZB 3EZWA 5AZIB 5KPTA 1IJJA 1GLEG 3UKRA 1TUYA 3FFKB 3GG4A 3VEYA 2UYTA 3MMVA 5LY3A 3FZFA 2VWBA 5LJVA 5BN9A 2P9UA 2GWJA 3O4WA 4FWKA 1P8ZA 2A40A 2I7PA 2D4WA 3WXIA 1LCUA 3CJCA 4DCHA 2P9LB 5AQGA 3UKUA 1QQNA 3O8MA 5AQLA 1JCFA 4CBXA 5AZJB 4PKIA 4JHDA 1GLJO 1HKGA 4BREA 4Z94A 4JN4A 4B9QA 4CBUA 1BU6O 3D2FB 3BF3A 1XQSC 1YAGA 1T6CA 2PAVA 3WEEA 3U9ZA 3BP8A 4PL7A 4K41A 3EO3A 4B1WB 2E20A 3MN7A 1NMDA 3CJAA 3O1BA 1RGIA 5ADXA 4NB4A 4WQ5A 1ZBSA 4CZKA 4CZLA 5AFUH 4M63C 2E1YA 5BRHA 4EAHD 3L6QA 2W41A 2DPNA 3CERA 3LDPA 3A0IX 4FWSA 3VOVA 4EFHA 2I7NA 3EKSA 1NGFA 2V7YA 4ISGA 1E4GT 5BPNA 1S3XA 3VEOA 3GE1A 4FOIA 3VGLA 3WXLA 2F9TA 2ZWHA 3QFPA 5AQMA 3LDLA 2QWQA 4CZIA 1RDWX 3OHRA 5AQRA 5BRFA 3AARA 4H0YB 3U4LA 4BQZA 3B8AX 4FPAA 1BUPA 2IIRA 4BRMA 1J6ZA 3VF2A 1Z05A 1NGAA 3LDQA 3DXKA 3D2FA 4O8KA 1GLFO 3FGUA 5AQTA 5TKYA 2A6AA 1DKGD 3GL1A 3BEXA 4A62A 3LL3A 3IUCA 3ZX0A 2VCPA 1MA9B 4MO5A 4BC5A 3DWLA 1NM1A 2QWPA 1GLDG 4DQ8A 5BR9A 2CGJA 2P9IA 3R6MA 2Q2RA 3UKRB 4FPBA 3TU5A 2YCHA 2YI1A 4WQ5C 4BRPA 3QICA 2CGLA 3CQYA 3U9DA 4CZEA 1XUPO 5EOYA 3VGMA 5AQVA 1SQKA 4BRLA 4CI6A 2KHOA 4BVOA 5AQFA 3KHYA 4IWVA 3MN9A 4BRHA 1G99A 3HM8A 3VESA 3UKUB 4I6MB 4H0TB 4O5FA 4FSVA 4H5RA 5KPZA 2QWOA 1BA1A 5F2RA 4H5NA 4K43A 4JHDB 4BRKA 2Q0UA 1WUAA 3UB5A 3ZX3A 1MWMA 3WUHA 5F1XA 1JCGA 1T6DA 3CI5A 3M3ZA 4BR7A 1NGCA 5BPMA 1WOQA 3MK6A 5AFUA 4BRQA 4BQLA 4IXCA 2QXLA 4A2BA 3R8EA 4H0XB 1U2VA 4PL8A 3ZX2A 3O08A 1V4SA 2V52B 3DXMB 3M1FA 4YDUA 1NGGA 1ATSA 4BG9A 3QDKA 5JLHA 4FWQA 3WQUA 3L0QA 1KAXA 4H5WA 4I6MA 4BROA 5AQQA 4BRFA 1RFQA 2BTFA 2FLOA 3CQXA 3FR0A 4A61A 3LM9A 4BRGA 3HI0A 3M6GA 2A3ZA 2E2PA 2FF3B 3A5OC 3DXKB 1X3NA 4BC4A 3VERA 4M7XA 3WXKA 4BC3A 2ASPA 2E1ZA 3FLCO 1OKJA 2A41A 2J4RA 1S22A 3H46O 3QB0A 3VENA 4BRDA 1T44A 4XH1A 5I9EB 2FSKA 4FWMA 4PKHA 3DAWA 4J8FA 5AQHA 2GELA 3ZEUA 3EKUA 4RWTA 3H1VX 4FWRA 2A42A 2P9IB 3SMSA 1XC3A 5AQKA 3HTVA 3DXMA 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1Q9XA 5CZ2A 1V4TA 4CF9A 3ID6A 2IVOA 1R59O 1W97L 4MDAA 3DMJA 3JXUA 1S5JA 3LZJA 1RT7A 2C1IA 3VQ5A 2CH6A 1NKCA 3NF7A 3L4IA 2WFBA 1ZU3A 2QXFA 2E2NA 5E26A 3H6EA 1RCHA 2X6NA 4IFYA 2AP1A 4BY9C 4FWLA 4LF6K 3ENBA 5AQJA 1N33K 2LI7A 3OYLA 1WSEA 5J2NA 1DGKN 2ASMA 5GAHP 4FL9A 5LMNK 1RNHA 3MDQA 2XY8A 2RF2A 3AVHA 1KD1O 4NCAA 2HW3A 4FLXA 1T05A 3NGZA 4B9LA 1R0AA 4BRCA 2YHYA 4UQGA 3WXJA 5AQYA 2HF4A 2P9PB 3I55N 2E2OA 5I3UA 4OKEA 1HYVA 3NH1A 3ZSXA 2LSNA 4BRNA 3AAPA 1GLCG 3CJ7A 2AJQA 2CH5A 1VSIA 4CGHA 4DUYK 3RMCA 4YOYA 3QBXA 2O8CB 2F9WA 1W7AA 2P9KB 2HBLA 2BDPA 3OYNA 1GOAA 3TABA 1SZ2A 3V9SA 5KQDA 2BANA 4W5QA 3RR8A 3KK1A 3CHWA 4JS5A 1ZFUA 3QINA 2HOEA 4FLTA 1I6FA 1K8KB 4MLHA 1Z25A 3IMXA 1NGDA 3JYTA 4FM1A 4CK3A 5GIPA 1N36K 2LT8A 5EVZA 3PV8A 3G25A 3PSMA 3DLRA 3CIPA 3RWUA 3T19A 1C1AA 3AA3A 2E6LA 2ZQBA 4JNEA 3U8XA 5IWAK 1TV6A 3C6TA 3N4QA 4GNIA 4H5VA 3ZETB 4FWOA 3EYZA 1U48A 3AO3A 3CJBA 1KLMA 4CHYA 2K35A 2VWKA 3ZT2A 4KBOA 5DMRA 4IZ9A 4EP4A 3LALA 3F9KA 3O9RA 1TK5A 4FOEA 2G8FA 3AAQA 3ASMA 3L3UA 1D5AA 1HNXK 4A2AA 3P4IA 1N5YA 1D4XA 4DFKA 5CE3A 4DV6K 3VQEA 3KOXA 1BDGA 3U3YA 2DY4A 3FZLA 1KSPA 4WQ4C 2FBXA 2OTJN 2HMPA 3C0BA 2GUIA 3NCIA 1NKEA 4RCHA 2A1RA 1C0GA 2W6KA 1HKBA 1HX1A 3UIQA 4CD3A 4YORA 3QEPA 4E19A 4YNQA 4DTSA 4F3OA 4UADE 4DQQA 2HSTA 2UUBK 4OGEA 2O8FA 4JD2A 3I8BA 4FK0A 4M3YA 4C8NA 3HPHA 3QNNA 5AZIA 3IKMA 3QEXA 2PY5A 1VQMN 5JENA 4V1DC 2OCEA 4L3QA 3LWMA 1TAUA 2KW4A 1QSYA 1EP4A 3VEWA 1U6ZA 4LD0A 1ZYVA 2B3CA 1NK9A 3QIOA 4ISFA 3A5NC 1XMQK 1IH7A 1RBSA 4FJ8A 4JI0K 3NF9A 1H1VA 4HHFA 4XH4A 4NXMK 3E01A 3KOZA 2VWJA 4DSJA 5SZTA 4N41A 4KYPA 1Z6RA 3SV4A 2UUAK 2KBKA 2P5GA 2G8HA 3PIPL 1TYQB 2G8UA 4X64K 1UWBA 3WQTA 4DQSA 5EX5A 1RILA 5AQPA 1JLAA 3QEVA 2YJFA 2QW9A 1JLGA 4DSEA 1BWFO 4K42A 1OZZA 1KV0A 5FPEA 1XWLA 3HP6A 3SUOA 3T1HK 3A2FA 3E9LA 1TK0A 3BK3C 4JI7K 1MDUB 2O8EA 3ENHA 2A1SA 3AA5X 1IG8A 4CJRA 3PSFA 5E84A 2IVNA 3S41A 3PY8A 5DM7L 4F4KA 2GMOA 4DG1A 3QNOA 3HK2A 5JVGL 4CGIA 2E5LK 2YV0X 2XY7A 5B8HA 4CECA 4V19S 3VF6A 3J7ZO 4FJJA 4OGCA 4JI2K 4F8RA 1N32K 1TKXA 3WNGA 3AO1A 1TK8A 2FXUA 2GUPA 4B3MK 4J2AA 2Y1JA 1Q86O 4LFAK 4W5TA 3M8QA 3H45C 2D0AA 2XY6A 2O8BA 1GOBA 4OPAA 2D0CA 4FVUA 1JCEA 4CJUA 3TTFA 1N34K 1S6QA 3KVGA 1HUXA 3S9HA 3NE6A 4J2DA 4LY7A 2KYQA 1VQ6N 2QTDA 2G8VA 1WAJA 3K57A 3GG4A 1HMVA 2UYTA 3NVMA 3MXJA 5LY3A 4E7JA 2HBKA 2KLAA 4DV3K 3ZSRA 1NK0A 3AVLA 2N2QA 3VTIA 3LP2A 4AEIA 3CJCA 3D0PA 4RG8A 2P9LB 2NRTA 4HUEA 3AA4A 4JK8A 1OH6A 1QQNA 3GKUA 3TTCA 2FBVA 4PKIA 2PZSA 3CCEN 3TSPA 3PLAA 4DR5K 2KFNA 1MU2A 2Z1GA 4Z94A 1XNQK 4JN4A 4DV0K 4Q0BA 3WNEA 3D2FB 1B9DA 3FFIA 1T6CA 4FK2A 3G6EN 1YJWN 4PL7A 1L3SA 2D5RA 4DV1K 3CJAA 2RPIA 4PWDA 1BI4B 5ADXA 1CXUA 4NB4A 3LAKA 4M3ZA 1DTTA 5H1SQ 5BR8K 1RT3A 1RT2A 4CZLA 4M63C 4DSLA 1T7PA 4B08A 3AA2A 3L6QA 2W41A 1TVRA 3A0IX 1BRZA 4FWSA 4AHRA 3EKSA 1T03A 1NGFA 2V7YA 1BL3A 1S3XA 4X66K 3NAEA 2LR3A 3LWLA 3C6AA 4CEEA 3WXLA 1GPSA 1CXQA 2B4JA 5HLFA 5LL6Z 3DM2A 2OPPA 5AQRA 4N56A 2IOCA 4CGDA 1BUPA 2IIRA 1S1UA 3VQCA 4BRMA 1VNAA 1VK0A 3CMAN 3RTVA 1SNBA 2P51A 2NRRA 1E3MA 2VCPA 1MA9B 4BC5A 2KFZA 4PQUA 1GLDG 4DQ8A 4M41A 4RW8A 4A59A 4ID1A 2N66A 2Q2RA 4CJTA 4DFPA 3QI7A 3M8SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1Q9X A;  5CZ2 A;  1V4T A;  4CF9 A;  3ID6 A;  2IVO A;  1R59 O;  1W97 L;  4MDA A;  3DMJ A;  3JXU A;  1S5J A;  3LZJ A;  1RT7 A;  2C1I A;  3VQ5 A;  2CH6 A;  1NKC A;  3NF7 A;  3L4I A;  2WFB A;  1ZU3 A;  2QXF A;  2E2N A;  5E26 A;  3H6E A;  1RCH A;  2X6N A;  4IFY A;  2AP1 A;  4BY9 C;  4FWL A;  4LF6 K;  3ENB A;  5AQJ A;  1N33 K;  2LI7 A;  3OYL A;  1WSE A;  5J2N A;  1DGK N;  2ASM A;  5GAH P;  4FL9 A;  5LMN K;  1RNH A;  3MDQ A;  2XY8 A;  2RF2 A;  3AVH A;  1KD1 O;  4NCA A;  2HW3 A;  4FLX A;  1T05 A;  3NGZ A;  4B9L A;  1R0A A;  4BRC A;  2YHY A;  4UQG A;  3WXJ A;  5AQY A;  2HF4 A;  2P9P B;  3I55 N;  2E2O A;  5I3U A;  4OKE A;  1HYV A;  3NH1 A;  3ZSX A;  2LSN A;  4BRN A;  3AAP A;  1GLC G;  3CJ7 A;  2AJQ A;  2CH5 A;  1VSI A;  4CGH A;  4DUY K;  3RMC A;  4YOY A;  3QBX A;  2O8C B;  2F9W A;  1W7A A;  2P9K B;  2HBL A;  2BDP A;  3OYN A;  1GOA A;  3TAB A;  1SZ2 A;  3V9S A;  5KQD A;  2BAN A;  4W5Q A;  3RR8 A;  3KK1 A;  3CHW A;  4JS5 A;  1ZFU A;  3QIN A;  2HOE A;  4FLT A;  1I6F A;  1K8K B;  4MLH A;  1Z25 A;  3IMX A; 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1NGBA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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