1NGC | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngcA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngcA04

2QWPA 3C7NA 5AQTA 2V52B 4GNIA 3MDQA 1GLDG 4XH5A 5JLFA 4JHDA 3HBTA 1MA9B 1GLBG 1MWKA 3O1BA 4MLEA 4IJNA 4IJAA 3SJHA 1CZAN 2IVNA 3ENOA 2Q0UA 2A42A 3BF1A 4BVOA 4CZMA 2YHWA 4WQ5C 5AQKA 4A2BA 1ZC6A 3WEEA 2CGLA 4H5RA 4AM7A 1X3NA 2P9SB 4BRLA 2PAVA 3MN9A 2QWNA 3FGUA 3MCPA 2P9UB 1ZBSA 3VF2A 3RSEB 3EKSA 5AQLA 4FL9A 1E4GT 2A3ZA 5AQGA 3I33A 2VWBA 1S22A 5TKYA 3LDQA 3AAQA 1C0FA 3CJAA 5AZIB 3UKUB 5AQNA 2E2PA 3CQYA 4RCHA 5EOYA 3WXJA 3D2FA 2Q0RA 4Y0WA 3ZEUA 3VOVA 1HKBA 4BRIA 2QWRA 1V4TA 3H6EA 3JS6A 4PKGA 2NRHA 5AZJB 4B1VA 1NGFA 4HTLA 3IMXA 4JAXA 4B1ZA 2J4RA 4BGAA 1GLLO 5BR9A 4WQ4A 4XH4A 2YJFA 1V4SA 1NGAA 1BO5O 4QS7A 1BA1A 3GG4A 5BRHA 5LY3A 4H5TA 1QZ5A 4QS9A 2VCPA 1YXQA 5AQHA 1NWKA 3M1FA 4CD3A 1DGKN 1RFQA 3A5MC 3F9MA 1QQMA 2Q1NA 3ZX2A 4CZLA 3ZX0A 2GWJA 4M7XA 5BN8A 2E1ZA 5AQRA 3UB5A 3IUCA 3ULEB 4BR0A 4JD2B 4Z94A 3MN6A 3CJ1A 5FPNA 3B8AX 3VF6A 2P9NA 3DJCA 1WUAA 1BUPA 3LL3A 5AQSA 1EQYA 3FR0A 3DXMB 2I7NA 2YHXA 4PKIA 1SZ2A 1X3MA 1TYQB 3WXKA 1T6DA 3ENHA 4EAHD 4GY2B 4BRMA 2P9PB 4CZEA 4FWPA 4YDUA 2D0PA 4H5VA 2P9KB 5FPEA 4FWRA 4PL8A 3U9DA 3U9ZA 2WUSA 3BUZB 1NMDA 3CERA 3ZETB 4QS8A 3WUHA 1GLCG 4FWQA 3DXKA 3D2EB 3WXLA 2IVOA 4DHYA 3AY9A 4ISGA 2F9TA 2W40A 4J8FA 1KAYA 4BREA 3A5LC 1YAGA 3LDPA 1HX1A 5B8HA 3SMSA 4FPBA 2P9LB 3VEXA 4A62A 3H1VX 3QDKA 3MN5A 1GLJO 3QMLA 2FLOA 1QZ6A 5LJVA 5AQJA 2QM1A 3CJ9A 3C7NB 1D4XA 3EO3A 1ATRA 5BPMA 3I8BA 3FZFA 4JHDB 2CH5A 2QXLA 2CH6A 2A41A 4LC9B 3VGMA 4A2AA 1U6ZA 2Q2RA 3O5BA 2E1YA 2ASOA 3BEXA 4B1WB 5KPTA 4CZFA 3QFUA 3G25A 3GE1A 3GOIA 2GUPA 5JLHA 3CJBA 4B1YB 4BC5A 3IDHA 1U2VA 3A0IX 4BRQA 1T44A 1ESVA 2VYPA 3VEVA 2ITMA 4CBXA 4CD1A 1BU6O 3WEEB 2H3GX 3M3ZA 1E4FT 1GLAG 3O80A 2YHYA 2V7YA 4JN4A 3UKRB 3LM9A 3FLCO 4H0XB 4PL7A 5E84A 4K42A 2FF3B 2EWSA 4CZJA 4CBUA 3VERA 3BP8A 3P4IA 1DKGD 1Z6RA 5FPMA 3WQTA 4ISEA 2QWQA 3QFPA 3L4IA 2HF3A 3VETA 4WQ4C 3WQUA 2E88A 2Q31A 1XUPO 4CZHA 3EZWA 2HF4A 4CZGA 4KBOA 2CGKA 3VEYA 4EFHA 2E20A 4MO4A 2ZF5O 3D2FB 5AFUA 3ZEUB 4BG9A 1K8KA 4B9QA 3LDNA 5I9EB 5AFUH 4F9OA 1HPMA 4BC4A 3VGKA 2GWKA 2UYTA 4BRDA 1KXPA 3U8XA 3VEOA 3UE5A 2YI1A 3H46O 2BTFA 3EKUA 3H1QA 3CI5A 5ELZA 1C0GA 2FF6A 4PKHA 2P9IA 5BN9A 3HTVA 3FZLA 4BG8A 3TPQA 4BR7A 1TUUA 2AA4A 4CZKA 2GELA 3GL1A 3SLCA 5JMVA 2ZGZA 4IO8A 4EHUA 3HSCA 5BRFA 3VF4A 4CJ7A 4H0TB 1X9JA 5BREA 5KPRA 4FPAA 4YDUC 1Y64A 3LDOA 3IFRA 3HM8A 5KQDA 4FOIA 4BQLA 2P9NB 2YCHA 4BC2A 1TUYA 5F0XA 3CJ7A 3FFKB 4BRGA 4BRHA 4DQ8A 4MLHA 1GLEG 3DWLA 3DXMA 4FO0A 3TU5A 4ISFA 4EHTA 2GTDA 1KAXA 2E2OA 2FXUA 1ATSA 3HZ6A 3GDQA 1NGDA 3EN9A 3BF3A 3H3NO 3KHYA 3VPZA 4BR9A 4CBWA 2IIRA 2NZTA 1NGEA 1SQKA 1HKCA 2FSKA 2P9KA 4FWOA 2ASPA 1Z05A 4I6MA 3VESA 3QB0A 3LDLA 3S41A 2GEMA 4BR2A 4DCHA 1S3XA 1RGIA 2QW9A 2QWMA 3GBTA 4BRNA 1WOQA 5FPDA 3LM2A 3EL2A 4FWMA 3DXKB 2HOEA 4XH1A 4H5NA 1IJJA 2D0OA 3R6MA 4BR5A 3O6WA 3O08A 3D7EO 2D1KA 5AQXA 5EX5A 1NLVA 4H5WA 3CETA 2FSNA 4HWIA 2NLXA 4E1JA 1BOTO 2D4WA 1JCEA 2HMPA 5AQIA 3AARA 3DAWA 4BROA 4C23A 5CE3A 5ADXA 5F2RA 3CJCA 3KZBA 4RTFD 1YUWA 1J6ZA 5BRDA 5ADXH 2QWLA 3A5NC 1HKGA 5AQMA 1ATNA 3WXIA 1HUXA 3SMPA 3ATUA 3FZKA 1NBWA 4M7YA 4MO5A 3FZMA 4BQZA 3ZX3A 4H0YB 2W41A 4BR4A 4AM6A 1KAZA 3VENA 5KPZA 1NGJA 2P9SA 5AQZA 1U2VB 2A6AA 4NB4A 5AQVA 2YJEA 5JICA 4FOEA 1LOTB 2P9UA 1QQNA 3O4WA 4WQ5A 3UKRA 4BRAA 3RSEA 1MDUB 1T6CA 1QQOA 3QBXA 3C0BA 4A61A 1XQSC 3L0QA 1H1VA 1XC3A 4B1UB 1NGGA 3MMVA 3WT0A 1BWFO 5AZIA 3UKUA 3H45C 1BDGA 5AQFA 1GLFO 2PBDA 1RDWX 3W3DA 1MWMA 2ZGYA 1HLUA 4JNEA 3J8AA 3QBWA 5AQUA 3W0LA 5AZJA 4RWTA 4K41A 4BVPA 5AQQA 4BC3A 1NGHA 1YVNA 1K8KB 4NO7A 3SK3A 5AQYA 1G99A 3CQXA 1BG3A 3VEZA 4M63C 1P8ZA 4L3QA 4FWNA 4CI6A 3VGLA 2QWOA 2F9WA 3A8YA 4K25A 2CGJA 5AR0A 1NGBA 3ID8A 3OHRA 3A5OC 3JXUA 4WYBA 4B1XB 2P9IB 4H0VB 1JCFA 1DEJA 4DB3A 4FWLA 1NGCA 3ULEA 4JD2A 3R8EA 3HI0A 2E2NA 1JCGA 3O1WA 2I7PA 3AAPA 3FE1A 3CHWA 4FWKA 5KQ8A 2OANA 4IZ9A 3ATVA 1TYQA 1LCUA 5BPNA 2Q36A 4BGBA 1NGIA 2A40A 5LJWA 1ZXOA 3KVGA 2P9PA 1SAZA 3MK6A 2ZWHA 4FSVA 1QHAA 2ASMA 4BRCA 4BRFA 3M6GA 3R9PA 5AQWA 2DPNA 4IXCA 3FZHA 5EY4A 5E26A 3ZETA 3VEWA 2IVPA 2V7ZA 4XEIA 4H03B 4I6MB 4IWVA 5EVZA 3D2EA 3L6QA 2E2QA 4H0PA 4O5FA 3O8MA 3CIPA 5AQOA 1Q18A 1NM1A 2E8AA 5F1XA 3QICA 1IG8A 4CZIA 5BPLA 1OKJA 4O8KA 3H3OB 2BUPA 4EIAA 2P9LA 2FSJA 3MN7A 5EXWA 4FWSA 4H0OA 2A5XA 1R59O 1BA0A 3U4LA 2KHOA 2Q97A 4BRKA 4BRPA 1HJOA 4K43A 2AP1A 5AQPA 2V51B
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1S72N 2QWPA 2GUIA 3CMEN 4XH5A 4DWIA 1GLBG 4AHCA 3O1BA 1ASUA 1IKWA 4IJNA 3SAHA 4KHQA 2Q0UA 3BF1A 4CZMA 2B68A 4CJPA 1UGLA 5J2QA 5HROA 2G2KA 5AQKA 1RT1A 3K5OA 1ZC6A 4JLHA 3IG1A 3SPYA 3L2WA 5J2PA 5DM7L 4H5RA 1Z25A 4U67L 2G8KA 4CJVA 4X65K 3MN9A 3LAKA 3RRGA 3FGUA 4BEBA 3E9PA 1N8RO 3T7ZA 2E3GA 1ZBSA 4H8KA 4FW1A 3E66A 2IDOA 3RMBA 4F2SA 4CGJA 3HK2A 3LDQA 3RWUA 4H4OA 5J2MA 3HOTA 3CJAA 4DU3A 1HNZK 3THYA 3C95A 4B3MK 2VG6A 1N34K 1TL3A 3PUFA 3AO4A 4RCHA 2NY9X 3HPGA 3QEXA 3L2RA 1V4TA 3KJVA 1C1CA 4YORA 5K14A 1NGFA 4IFVA 4HTLA 3IMXA 1XMOK 4BGAA 4XH4A 4ICLA 4C1NI 1BI4B 1V4SA 5I42A 4QS7A 1TK8A 3GG4A 4FM0A 1RTJA 3TANA 1QZ5A 3LP2A 4KTZA 4PQUA 3HRGA 2MN5A 2NRVA 3M1FA 1DGKN 4JI4K 2F96A 3ULDA 4KREA 2C1IA 3A5MC 4LH5A 1JZAA 1QQMA 2N69A 2QI2A 4E7HA 4CZLA 3ZX0A 3THXB 3BK3C 3QETA 1YTAA 3HP6A 1A5XA 3PV8A 4DV6K 3MN6A 1OH6A 3B8AX 1EETA 5CY0A 3VF6A 5GIOA 3SQ0A 1SZ2A 1X3MA 1YJ9N 5CYMA 3U6FA 3ENHA 4FJXA 4BRMA 1S1XA 4L8RB 4FWPA 4YOWA 1VSFA 2YX6A 4FWRA 3KKRA 4CERA 1CZ9A 2G8IA 4FVMA 3MXJA 4N76A 4PY5A 4RW4A 3ZETB 1WB9A 4YFUA 4QS8A 1K8BA 4DV0K 1SKRA 3QERA 3KOXA 3WXLA 1JKZA 4DQQA 3DOKA 3QEPA 1NK6A 3L56A 1YAGA 3LDPA 5SWMA 5JS1A 2VWJA 1QHTA 1VSIA 3SMSA 5HL7L 3P39A 3VQPA 4Q0BA 3O3HA 2ASCA 2IOCA 3QDKA 1GLJO 3QMLA 2RKIA 3LPUA 3QI7A 4DV5K 4JV5K 4FZYA 3PIPL 3EO3A 1ATRA 1GOBA 1WNSA 2R7YA 2QXLA 4B3OA 3VGMA 4A2AA 3NDKA 2Q2RA 4DTNA 4DFPA 1KD1O 1QSLA 2ASOA 4BACA 3GE1A 3GOIA 2HBLA 4W5QA 3N4QA 4B1YB 4BC5A 2PFUA 3IDHA 5FROA 3V9WA 1JLEA 4X64K 1BU6O 2H3GX 4JI5K 3KKSA 2YHYA 4CGFA 2G8WA 4CJ4A 1QS4A 3CFRA 2M8BB 3FLCO 2KPYA 1WAFA 1FH3A 4CHOA 4FJNA 1BL3A 3OJSA 1ASVA 3QESA 3VERA 1NK8A 3BP8A 1NMNA 4NCAA 1XHZA 1I2VA 4QCLA 4DV4K 4NLCA 4BE1A 3QFPA 1YJWN 3WQUA 1B3CA 3VA3A 4WFAL 1XUPO 4CZGA 1T3VA 3VEYA 4MO4A 2ZF5O 3HXMA 4GKKK 1I6FA 1X9SA 3ZEUB 4BG9A 5A2QO 1K8KA 4B9QA 3LDNA 2JGUA 3MEEA 3K5NA 4K0KK 1JL2A 1TI5A 2VY6A 1HNXK 4NYNA 4BC4A 4CECA 3PSMA 1CN2A 1W0HA 3KD5E 1KXPA 4R79A 1VSKA 1PE4A 3P38A 3Q7BA 2F4VK 3T1HK 4UAEF 1SN1A 3H46O 3H1QA 4CEBA 1C0GA 3OS1A 3K59A 4AHTA 4HUGA 3TARA 5C12A 4CEZA 3TPQA 4BR7A 1NJXA 2VQEK 4KHPK 4K8ZA 3HSCA 1N32K 5HRPA 4MDBA 4AHVA 4AHUA 1Y64A 3LDOA 3IFRA 3M5RA 1T7PA 1RDAA 2YCHA 4DV3K 2B6AA 2YKMA 5GIPA 4M45A 3OYBA 4G1QA 5KRTA 3NHGA 4B9NA 1GLEG 3ZLJA 4BWJA 2LJ7A 1VQKN 5D3GA 1MYNA 1LQIA 3HZ6A 3H3NO 3VPZA 4BR9A 4I7FA 2IIRA 3PX6A 3M8PA 4DV2K 3PO4A 1JXCA 1HKCA 1C0MA 2O8CB 3F73A 4I6MA 1UAXA 4NXNK 3LDLA 4BR2A 4CIEA 4F3OA 1D9FA 2KGQA 3L3UA 1UA1A 1IJJA 4JKGA 5AQXA 2IC3A 4CF9A 1KLNA 3NH1A 2LSNA 2A1SA 4OPAA 3MXMA 1BOTO 2RPIA 4JK9A 5M1FA 2HMPA 3DAWA 4CJQA 5ADXA 5F2RA 2NY8X 2XY6A 1RT4A 1NKCA 3QIPA 3MX2A 1RBTA 1BMRA 3S5TA 1HKGA 4NLBA 2NRXA 4C8NA 3MWTA 5KTQA 4DSIA 3KK7A 3CCMN 1L3VA 5CZ2A 4FCYA 4DTMA 2W41A 4Y1CA 3SF4D 3NE6A 2A6AA 5JICA 3DLKA 5GAGP 3AA4A 5CR4A 3K9JA 3SV4A 3RSEA 4WCEL 1XHXA 2QKKA 2X6SA 4FLXA 4DFKA 5MLCQ 1T6CA 4ZHRA 3TAMA 4CEOA 2ETJA 3PX4A 2E5LK 1NGGA 3NF9A 3KOWA 2XY8A 3LPTA 4W5TA 4AEIA 1O1WA 3ZSVA 2PBDA 5KK4A 1D5AA 3W0LA 4KB1A 4BVPA 5AQQA 3MECA 3SQ4A 2YIOA 2HB5A 4LY7A 1G99A 1CLQA 1BG3A 1BCGA 3LALA 3U3GA 2W00A 3DRPA 1S1VA 4A5AA 1QSYA 4YNQA 2A1RA 2QWOA 4OPJA 1ZU3A 3A8YA 4OGEA 1T05A 1DTTA 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1GLLO 3HSTB 1BHLA 1BQMA 4YOVA 1DQ7A 1NGAA 1BO5O 1AYJA 3S3OA 1L3SA 3HP9A 3OS2A 5GAEP 5AQHA 2HBJA 1NWKA 1C0TA 2DFFA 4M3YA 4F3TA 1RBUA 4CD3A 4ELVA 1LWFA 3OYJA 3VQQA 2QTDA 4CEFA 3CCEN 2Q1NA 4PHTX 3ZX2A 1OVQA 3P31A 3OY9A 4HVJA 5M1KA 2GBZA 5BN8A 3UB5A 3ULEB 4YHHK 2QXFA 3DLRA 3CJ1A 1VNBA 3V9XA 3DJCA 3O4QA 3KK1A 2XO7A 1SL1A 3FR0A 2HHWA 3DXMB 5E41A 2OPRA 2YHXA 1S1TA 1Q9YA 1RTHA 1TYQB 3V1QA 2X74A 2Z1IA 3WXKA 5HRRA 4DTRA 4GY2B 5KRSA 4XJXA 4DQRA 4CHNA 3CC7N 4HCBA 3CG7A 5H1SQ 5JENA 4CEDA 4PL8A 3OBYA 2WUSA 4DG1A 4F8RA 4M3TA 5HOOA 4DKWA 1T1TA 3ISNC 2OA8A 1NKEA 1ZYQA 3NF8A 5M1QA 3DXKA 3SAGA 3OYIA 4IEEA 2N2QA 4CVNE 4ISGA 2F9TA 2W40A 3TTCA 1KAYA 2HBKA 3EYZA 3T3FA 1NOYA 4ELTA 4ILJA 2VWKA 1VQNN 3S3NA 1HX1A 5B8HA 3J7AP 5JS2A 4FLWA 3Q7CA 2ATBA 1NK0A 2P9LB 3VEXA 2HVIA 1FKPA 3L2QA 3MN5A 2YIPA 1QZ6A 5LJVA 3E7RL 4KHYA 4E7JA 3C7NB 1D4XA 3I8BA 1SEGA 3KLIA 1KVBA 2A41A 1P90A 1RILA 4LC9B 5BR8K 4B1WB 1BIUA 2BGGA 3O9TA 4FK4A 1RT7A 3TWHA 2IGIA 3CJBA 3OYFA 4M3WA 2KJAA 3KP0A 1EWRA 1VSMA 1S1UA 2WBNA 3A0IX 4BRQA 4CD1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1S72 N;  2QWP A;  2GUI A;  3CME N;  4XH5 A;  4DWI A;  1GLB G;  4AHC A;  3O1B A;  1ASU A;  1IKW A;  4IJN A;  3SAH A;  4KHQ A;  2Q0U A;  3BF1 A;  4CZM A;  2B68 A;  4CJP A;  1UGL A;  5J2Q A;  5HRO A;  2G2K A;  5AQK A;  1RT1 A;  3K5O A;  1ZC6 A;  4JLH A;  3IG1 A;  3SPY A;  3L2W A;  5J2P A;  5DM7 L;  4H5R A;  1Z25 A;  4U67 L;  2G8K A;  4CJV A;  4X65 K;  3MN9 A;  3LAK A;  3RRG A;  3FGU A;  4BEB A;  3E9P A;  1N8R O;  3T7Z A;  2E3G A;  1ZBS A;  4H8K A;  4FW1 A;  3E66 A;  2IDO A;  3RMB A;  4F2S A;  4CGJ A;  3HK2 A;  3LDQ A;  3RWU A;  4H4O A;  5J2M A;  3HOT A;  3CJA A;  4DU3 A;  1HNZ K;  3THY A;  3C95 A;  4B3M K;  2VG6 A;  1N34 K;  1TL3 A;  3PUF A;  3AO4 A;  4RCH A;  2NY9 X;  3HPG A;  3QEX A;  3L2R A;  1V4T A;  3KJV A;  1C1C A;  4YOR A;  5K14 A;  1NGF A;  4IFV A;  4HTL A;  3IMX A;  1XMO K;  4BGA A;  4XH4 A;  4ICL A;  4C1N I;  1BI4 B;  1V4S A;  5I42 A;  4QS7 A;  1TK8 A;  3GG4 A;  4FM0 A;  1RTJ A;  3TAN A;  1QZ5 A;  3LP2 A;  4KTZ A;  4PQU A;  3HRG A;  2MN5 A;  2NRV A;  3M1F A;  1DGK N;  4JI4 K;  2F96 A; 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1NGCA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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