1NGD | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
total genus	120
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngdA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngdA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngdA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngdA04

3IMXA 4WQ5C 3TPQA 5BPNA 1TUUA 5AQWA 1BO5O 2CGLA 4BRFA 5AQKA 1NGJA 2FSJA 2P9UB 3AARA 1NWKA 5EX5A 5BREA 1LCUA 2P9NA 1IG8A 3ZEUB 4BRPA 5AQLA 3H3NO 3UKUB 4F9OA 5ELZA 1S3XA 1TUYA 1BWFO 5AQSA 3M6GA 1J6ZA 4EHUA 5AQZA 2QWQA 2W40A 3H46O 4FWQA 2A3ZA 2GTDA 1BA1A 4XH5A 4BRKA 5AQFA 2GUPA 1KXPA 4BC2A 3VPZA 2V52B 4H0XB 1LOTB 3LL3A 2EWSA 4A2AA 5F0XA 4H0VB 3L6QA 5AQOA 4CZFA 3C0BA 4B1XB 3WXLA 1NGFA 3VETA 3W0LA 1GLFO 4FPAA 1NGHA 4BR0A 1SAZA 3WEEA 4BG9A 4BVPA 1DGKN 4BRAA 1QZ6A 2E8AA 5AQQA 3A5LC 3MN6A 1H1VA 3UKRA 2A42A 5CE3A 2HMPA 3RSEA 1BUPA 1RGIA 4NB4A 1YAGA 3DAWA 2YJFA 3WUHA 3EN9A 1D4XA 2OANA 3H6EA 4O5FA 3WEEB 4BRLA 1QQMA 3LDPA 4DHYA 1JCFA 4XH4A 4BRCA 2V51B 3J8AA 3WXIA 3VEOA 4WQ4A 4H0YB 5AQMA 3CJAA 4BRGA 2H3GX 3RSEB 2PAVA 5AZIA 2A41A 3AY9A 1YUWA 3EZWA 4PKGA 3HI0A 4RWTA 1NGBA 3EKSA 3UB5A 4EHTA 3M1FA 1NGEA 4FSVA 2CGKA 5E84A 1QQOA 3SLCA 4I6MA 5JLHA 3FZLA 5AZJA 3GE1A 4K42A 3L4IA 4DCHA 4BC4A 3FR0A 3O08A 3B8AX 1MA9B 4MO4A 1ATRA 3MK6A 4CD3A 3D2FA 4K25A 4WQ5A 3SMPA 3FLCO 1E4GT 4CZHA 3QB0A 4I6MB 3I8BA 1NBWA 3H3OB 4EAHD 4QS8A 4H0TB 5AZJB 2FF6A 5AR0A 3O5BA 3UE5A 1SQKA 3MCPA 1T6CA 3GL1A 1CZAN 5KQDA 4CZGA 3VGLA 4K43A 1IJJA 3ULEA 5LY3A 4FWLA 4FOEA 5FPMA 4LC9B 3H45C 2ZGZA 4M7XA 2QW9A 2YHWA 2HF3A 1KAZA 4ISEA 4DQ8A 3A0IX 2P9KA 3MMVA 4QS7A 5AQRA 3H1VX 3I33A 5KPRA 1YXQA 4ISFA 4E1JA 5AFUH 3LDQA 2HOEA 1Q18A 1Y64A 4B9QA 1NGCA 3KVGA 3DWLA 4BVOA 3U9DA 3ULEB 4CJ7A 3S41A 1RFQA 2QM1A 1WUAA 1Z6RA 2NLXA 2I7NA 2I7PA 3DXKB 2V7ZA 2QWLA 1TYQA 4BR4A 3FZHA 2E2OA 3HTVA 5AQJA 1ZC6A 4H5NA 3IUCA 2DPNA 3HSCA 2A5XA 3MN5A 2E88A 3QMLA 5AQHA 1ATSA 4L3QA 3O1WA 4BG8A 1KAYA 2P9NB 4Y0WA 3LDNA 1GLEG 4WYBA 4AM6A 1GLCG 3FZMA 5FPDA 1TYQB 1SZ2A 4A62A 1MWKA 1U2VA 2ZWHA 2KHOA 4ISGA 3VERA 4FWMA 3ZX2A 1NGDA 1JCEA 5F2RA 4B1WB 5F1XA 1OKJA 3DXMA 1Z05A 3EO3A 3C7NA 2F9TA 4NO7A 4CD1A 2YJEA 1GLJO 1HUXA 1XQSC 5EOYA 4H5VA 1P8ZA 3O6WA 2QXLA 3BUZB 3WT0A 1QZ5A 3SJHA 2NRHA 3SK3A 1C0FA 2Q36A 1DEJA 3DXMB 1ATNA 3C7NB 4A2BA 3QFUA 1ZBSA 3VF4A 4BREA 1MWMA 3CERA 5BRFA 3CQXA 1X9JA 1HKBA 3UKRB 4EFHA 3BP8A 3OHRA 5AQNA 5FPNA 4BRDA 4A61A 5JLFA 3LDOA 2QWPA 3VF6A 3WXJA 3QBXA 1NLVA 4CBUA 4B1YB 1HKCA 1T44A 1QHAA 3CJCA 3F9MA 5EXWA 3HBTA 2P9SA 1NGGA 2AP1A 4QS9A 3W3DA 5AQXA 2NZTA 2BUPA 2E1ZA 3CJBA 4BRHA 1BG3A 4MLEA 3IFRA 3JXUA 5ADXH 2Q31A 3CHWA 2F9WA 4IXCA 4C23A 2GWJA 4CI6A 5AZIB 4BRNA 2IVPA 2IIRA 4BROA 2YCHA 3CIPA 4PKIA 1X3NA 3LM2A 4Z94A 2P9SB 1DKGD 4YDUC 5AFUA 4FPBA 1R59O 3CQYA 4PL7A 5AQYA 2Q97A 3U4LA 3U9ZA 3ENHA 2FF3B 4BR9A 1HKGA 5E26A 4BC5A 1NMDA 4H0OA 2VWBA 1GLBG 3FFKB 2FXUA 4M7YA 5BR9A 2ASOA 1NGAA 3R8EA 3O8MA 2VCPA 1QQNA 4B1ZA 4CZJA 4JD2A 1BA0A 3BF1A 1XC3A 3D2FB 3VEXA 3LM9A 3VOVA 1HJOA 4IJAA 3ID8A 4FWRA 3TU5A 2P9LA 1JCGA 1G99A 4JAXA 4O8KA 4CZEA 3VEWA 4H03B 2A6AA 2BTFA 2FSNA 4IZ9A 5AQIA 4BGAA 4KBOA 3VGKA 3ZX0A 5JMVA 3VENA 4JD2B 3DJCA 3EL2A 2D0OA 3O4WA 5AQPA 5KPZA 3EKUA 1HX1A 2FLOA 2P9KB 3WQTA 1U6ZA 1S22A 3G25A 1RDWX 2CGJA 2QWNA 3ZETA 4H5RA 5LJVA 5BN8A 2PBDA 4BRMA 2P9IA 3HM8A 2V7YA 3SMSA 3U8XA 3AAQA 3BEXA 3D2EA 3GDQA 3HZ6A 3O1BA 1WOQA 3KZBA 2J4RA 4BR2A 5B8HA 1KAXA 4M63C 3ATVA 4EIAA 2Q1NA 3ZETB 2D4WA 4IJNA 3IDHA 4FWKA 2Q0RA 2P9IB 3ENOA 4FWNA 4BC3A 2CH5A 2YHXA 4CBXA 4DB3A 4BRIA 4CZKA 3D2EB 1NM1A 2WUSA 3CJ7A 4HTLA 2IVNA 2YHYA 3JS6A 4BQLA 4H5TA 3D7EO 4XEIA 1V4SA 4JNEA 3GBTA 1U2VB 5ADXA 5KQ8A 2Q0UA 5LJWA 4RCHA 1NGIA 2ZGYA 2Q2RA 2YI1A 1MDUB 1ZXOA 4CZLA 3MDQA 5EY4A 3VEVA 1X3MA 3CI5A 5FPEA 4CZIA 3VF2A 4J8FA 2D0PA 3WQUA 4YDUA 4FWSA 4H0PA 2E2NA 3QDKA 2IVOA 3ATUA 4FWOA 2AA4A 2E1YA 2VYPA 4GY2B 4K41A 4PKHA 3GOIA 3MN7A 4JHDA 5AQTA 3A8YA 4RTFD 2GWKA 4AM7A 2GELA 4MO5A 3R9PA 2FSKA 3WXKA 3P4IA 2ASPA 5BRHA 1GLAG 1E4FT 1ESVA 3QFPA 1GLLO 4FO0A 1K8KA 1BOTO 5EVZA 3AAPA 5BRDA 2ITMA 2GEMA 4CZMA 4JHDB 4PL8A 3VGMA 4IWVA 3FE1A 2P9PA 2W41A 4FWPA 5BPMA 4BGBA 3A5NC 5BPLA 4BQZA 2E2QA 3ZX3A 2QWMA 5AQUA 2HF4A 1YVNA 3O80A 2QWOA 3FGUA 4FL9A 1BDGA 3BF3A 3R6MA 2D1KA 4B1UB 1K8KB 4JN4A 4BR5A 3L0QA 4FOIA 3VESA 4BRQA 3MN9A 4WQ4C 4GNIA 4CBWA 1V4TA 3LDLA 1GLDG 2ZF5O 3FZFA 3GG4A 3QBWA 4IO8A 1EQYA 3A5OC 1HLUA 2CH6A 3KHYA 2P9PB 5JICA 4HWIA 3CJ9A 1HPMA 3M3ZA 3QICA 5TKYA 3CJ1A 1BU6O 2UYTA 2A40A 1T6DA 2E20A 5AQGA 2QWRA 1C0GA 5BN9A 2P9UA 3FZKA 4XH1A 1XUPO 5I9EB 3ZEUA 3UKUA 4MLHA 2E2PA 2ASMA 2P9LB 3DXKA 4BR7A 4H5WA 3VEYA 5AQVA 3A5MC 3H1QA 3VEZA 4B1VA 5KPTA 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4O8UA 3RVCA 4CJPA 3OYLA 4KI6A 3MWPA 4JRPA 5AQWA 1BO5O 2CGLA 1WN7A 4KREA 1OH8A 5BREA 5M1QA 2X74A 4HE7A 1A5VA 3SUOA 1LCUA 3K9JA 4JKDA 4I9LA 2QTDA 2G8IA 3OBYA 4UQGA 1ZVGA 4U67L 5AQSA 5CYMA 1J6ZA 2QWQA 4DQIA 3PSMA 1REVA 4KHPK 4JKAA 2GTDA 5C2FA 4XH5A 1LQQA 3O9TA 4DR1K 2GUPA 1P90A 1BCMA 3TSUA 4O0IA 4A2AA 4NYFA 4FM2A 3MECA 3L6QA 5AQOA 4CZFA 1ZBHA 3C0BA 2KYQA 1F21A 1S1UA 3K9KA 1JLCA 1DGKN 4FJMA 5AQQA 4CGHA 3A5LC 2A42A 2OYQA 5CE3A 3ZSQA 4DQSA 1Q81O 2D0BA 4IFYA 5HRNA 3NHGA 5C15A 1YAGA 1SKWA 2JWKA 3PX6A 2N69A 1YIJN 4IEEA 3PLAA 2VQFK 2YHAA 3WEEB 2YBRC 3PV8A 4FVMA 4CEDA 4KPYA 3VTHA 3LDPA 1QHTA 4DHYA 4AB0A 2PFUA 4BRCA 2HHTA 3WXIA 1RTDA 3HSTB 5DM7L 1D9DA 1VQON 4OLAA 2A41A 1YVUA 3HOSA 5HOOA 1JLGA 3K59A 3HI0A 3ZSVA 3RR8A 3UB5A 1DTTA 4FSVA 4E19A 3QNOA 5E84A 4B3MK 2YHBA 4DQPA 3E1YA 3J7YP 3FZLA 3R3LA 1IG9A 1NE5A 3THWA 3GE1A 1JXEA 4K42A 3L4IA 1HNIA 5FLXO 4DCHA 2QKBA 1DT9A 4NLBA 2LJMA 1NK8A 3FR0A 5KGWA 1U4BA 1GPTA 3QEIA 4MO4A 4DR6K 3KKSA 3MK6A 2QK9A 1Q8IA 4CD3A 3THYB 5I3UA 4CIEA 4K25A 4AF1A 4JS4A 4RW8A 5FDLA 2VGMA 1I3AA 4E1MA 1RCHA 4RW4A 2XO7A 1RBSA 1SQKA 3V1RA 1T6CA 2OTLN 2M8BB 4CEEA 1JJ2M 2BDPA 1JKZA 3LWLA 3L2UA 4JI8K 3V9WA 3M8QA 4FWLA 4DTRA 4CGJA 3H45C 3F2KA 4M7XA 3NF6A 3A0IX 1ZBUA 4QS7A 4YNQA 1W97L 4ISFA 2HOEA 1Y64A 4Z0UA 3V9SA 4FW2A 4B3TK 4YFUA 1D8YA 4CGGA 1KRPA 3CYGA 1VQKN 5T7BA 2QM1A 1WT7A 1RBVA 1Z6RA 2NLXA 3SPZA 1QVFM 5CZ1A 2V7ZA 1VSJA 1UA1A 3AVAA 1TYQA 1X1PA 1TKZA 3AVGA 4DV7K 3MX5A 1ZC6A 3MEGA 4H5NA 3IUCA 3CCVN 3HSCA 3MN5A 1IV0A 4BG8A 1VQPN 4Y0WA 4YY3K 3KOXA 1GLCG 3OBWA 1YJWN 3FZMA 2JLEA 3NH1A 3O9QA 1SZ2A 3TR8A 3VERA 1PTXA 4E7JA 3ZX2A 1JCEA 1BI4B 4RW9A 4I2QA 3DXMA 4DFJA 2UXDK 3K5MA 3C7NA 3OW2M 3TAEA 1U48A 4DFKA 4BDPA 1SV5A 1TL3A 1ASWA 4GKKK 2O8BB 3E9LA 3O6WA 4GKJK 1QZ5A 5J2MA 3O9UA 1C0FA 1BRZA 2Q36A 4CEFA 5GAGP 1RT2A 3P31A 1HNWK 1P00A 1P0AA 4AHVA 3CQXA 4HHTA 3HOTA 5AQNA 4FZYA 2ZD1A 2VGNA 1VNAA 4A61A 5JLFA 4JI3K 1BQNA 2RF2A 1NK9A 1IBKK 4M3RA 1IO2A 1WB9A 1CN2A 1FKOA 1BG3A 4BRHA 2HMIA 3SPYA 1SL0A 3RMBA 3DI6A 5ADXH 4DV1K 3CHWA 2OZSA 4IXCA 4C23A 4KI4A 2O8DA 1GOBA 2YCHA 3LAKA 3C65A 3O3HA 5KRSA 4PKIA 4DMNA 3M8PA 1X3NA 2Q3SA 4NXNK 3M5RA 3OVNA 3J7AP 2YIPA 1R59O 3OYKA 4WFAL 3U4LA 1C1CA 1VHXA 4FK0A 4R5PA 4E89A 3CFOA 2VWBA 3FFKB 2FXUA 2ASOA 4W5RA 1ZBFA 2VCPA 1BHLA 3SBGA 4JD2A 1RT7A 2G8UA 4G1QA 1HNZK 3BZKA 3LM9A 1JLQA 3AVMA 3ID8A 2ZJQL 1BCOA 4O8KA 4CF8A 4V19S 1JLBA 2A6AA 3LDSA 4E7LA 4ICLA 1N4NA 3ZX0A 3TSPA 3LP2A 2DTUA 3PSFA 3DJCA 3EL2A 3NF9A 3HL8A 3I0SA 3KOYA 2UUCK 1KVBA 3EKUA 4KB0A 4PY5A 1QVGM 2FLOA 3WQTA 2A7TA 2QWNA 4IOCL 1YTAA 3E9OA 4E7KA 4BRMA 2KQ2A 2P9IA 3HM8A 3MWTA 3Q7BA 3OJSA 2BANA 3U8XA 1VQMN 3AAQA 3BEXA 1WBBA 1IH7A 5M1KA 3D2EA 3GDQA 1B3CA 1TKTA 3HVTA 4KTZA 5C10A 4OKEA 1WLJA 2WBNA 4KFBA 1EP4A 4M63C 3ATVA 1OVYA 2RN2A 1PX9A 3SI6A 2DFHA 4FWKA 1R0AA 1QSSA 2W42A 2G8VA 1YJ9N 1TAUA 3ENOA 4Z4GA 2HHHK 4DB3A 4CZKA 3LPTA 1WAFA 4KHNA 4O55A 1NM1A 4HTLA 1HYZA 3V81A 3DRSA 4YOTA 2D56A 4E72A 5M1PA 3D7EO 4F2RA 3GBTA 5ADXA 1ZBIA 3O4QA 5I42A 2KW4A 4PHTX 2WOMA 4OGEA 4F3TA 2E3GA 2LR3A 1C0MA 2ZGYA 4KO0A 2Y1IA 1QTMA 1MDUB 4CZLA 3MDQA 5EY4A 3CG7A 3VEVA 3ALYA 3CCJN 2G8WA 2D0PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4O8U A;  3RVC A;  4CJP A;  3OYL A;  4KI6 A;  3MWP A;  4JRP A;  5AQW A;  1BO5 O;  2CGL A;  1WN7 A;  4KRE A;  1OH8 A;  5BRE A;  5M1Q A;  2X74 A;  4HE7 A;  1A5V A;  3SUO A;  1LCU A;  3K9J A;  4JKD A;  4I9L A;  2QTD A;  2G8I A;  3OBY A;  4UQG A;  1ZVG A;  4U67 L;  5AQS A;  5CYM A;  1J6Z A;  2QWQ A;  4DQI A;  3PSM A;  1REV A;  4KHP K;  4JKA A;  2GTD A;  5C2F A;  4XH5 A;  1LQQ A;  3O9T A;  4DR1 K;  2GUP A;  1P90 A;  1BCM A;  3TSU A;  4O0I A;  4A2A A;  4NYF A;  4FM2 A;  3MEC A;  3L6Q A;  5AQO A;  4CZF A;  1ZBH A;  3C0B A;  2KYQ A;  1F21 A;  1S1U A;  3K9K A;  1JLC A;  1DGK N;  4FJM A;  5AQQ A;  4CGH A;  3A5L C;  2A42 A;  2OYQ A;  5CE3 A;  3ZSQ A;  4DQS A;  1Q81 O;  2D0B A;  4IFY A;  5HRN A;  3NHG A;  5C15 A;  1YAG A;  1SKW A;  2JWK A;  3PX6 A;  2N69 A;  1YIJ N;  4IEE A;  3PLA A;  2VQF K;  2YHA A;  3WEE B;  2YBR C;  3PV8 A;  4FVM A;  4CED A;  4KPY A;  3VTH A;  3LDP A;  1QHT A;  4DHY A;  4AB0 A;  2PFU A;  4BRC A;  2HHT A;  3WXI A;  1RTD A;  3HST B;  5DM7 L;  1D9D A;  1VQO N;  4OLA A;  2A41 A;  1YVU A; 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1NGDA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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