1NGE | Genus

Total Genus 125

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	125
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFSLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
total genus	125
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngeA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngeA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngeA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngeA04

1K8KA 1ZBSA 3B8AX 4BR7A 2ZGZA 4BRQA 2GUPA 4BRCA 3ULEB 1GLAG 5AQIA 1LCUA 4PL7A 3TU5A 2FLOA 1NGGA 3LDNA 3A8YA 3GL1A 2DPNA 4PKHA 1RDWX 1NGEA 2A41A 5AQOA 3H45C 1YUWA 2QWMA 2CGKA 3FE1A 3AAPA 2YHWA 3U4LA 2KHOA 4ISGA 3DWLA 2BUPA 4RCHA 1BA1A 3IUCA 5F2RA 4WQ5A 3WEEA 4H5NA 2I7PA 3H3NO 1MA9B 4BC5A 1DEJA 3UB5A 3GDQA 1U2VB 4DHYA 1Q18A 2VYPA 1KAYA 3FZFA 1GLDG 1HLUA 5BRFA 1V4SA 5BPMA 3DXKA 3LM2A 3MN5A 3CJ9A 1X9JA 4B1YB 3KHYA 2D1KA 4QS7A 4MLHA 2CGLA 2E1ZA 3D2EB 3L0QA 5AFUA 2V7ZA 4H0OA 1Z05A 1YXQA 3WUHA 1SZ2A 4H5VA 3R9PA 2HF3A 2Q0RA 5F1XA 3A5OC 4MLEA 4B9QA 3F9MA 4IJNA 3GBTA 1BO5O 4HWIA 3O8MA 2F9WA 3O5BA 3UKRA 2Q1NA 5JICA 1NGCA 5BR9A 1S22A 2E8AA 1Z6RA 2P9NB 1TUYA 4HTLA 3JS6A 4EHTA 2D0PA 4FOEA 4Z94A 4IZ9A 1TYQB 4DQ8A 4EAHD 5AQNA 5AQGA 3CIPA 2CH6A 2P9KB 5FPEA 3EKSA 5AQSA 2GWJA 2E20A 4NO7A 3ZETA 1NWKA 1QQOA 4XEIA 1G99A 1E4FT 4M7YA 5E84A 4RTFD 5FPNA 4BREA 2P9LA 3EL2A 4H5TA 3UKUA 5AFUH 1T6DA 3I8BA 4BRPA 4B1ZA 5EVZA 2NRHA 3VEZA 5AQJA 4FWNA 1HKBA 3RSEB 4LC9B 4FSVA 1BOTO 3AAQA 2QXLA 4F9OA 5AQQA 4BG9A 1MWMA 2IVNA 4BGAA 1ESVA 3M6GA 2QWPA 3U8XA 3FZMA 4FWMA 2IIRA 4BRGA 3FGUA 1OKJA 1ATSA 2FSNA 4JD2B 3QMLA 3WXJA 5BPLA 1BU6O 2P9UB 2QWNA 2E88A 3HTVA 2CGJA 4WQ5C 4PL8A 3EZWA 5KQDA 3ATVA 3FZHA 1YVNA 1QHAA 1SQKA 3CHWA 2GELA 5AZJB 1QZ5A 3MMVA 4QS9A 5JLFA 2NZTA 3P4IA 1WUAA 1JCGA 2YI1A 2YHXA 3LDOA 1QQMA 3WT0A 2F9TA 2GWKA 4JNEA 3HI0A 4AM7A 3GE1A 2EWSA 2Q2RA 2YJFA 1BWFO 5EXWA 5AQFA 4GY2B 3DXMB 5AQMA 4CZEA 2YCHA 4C23A 3CQYA 3D2FB 1NMDA 5JMVA 3IDHA 3HBTA 3O6WA 1HX1A 2FF6A 1GLFO 3VESA 3WQUA 4RWTA 2P9IA 4BQLA 2V7YA 4BGBA 4BR9A 4CZKA 3IMXA 3EO3A 4H0VB 4H5WA 1XUPO 3ATUA 5EOYA 4BRNA 4H5RA 3MK6A 3ZEUB 1BA0A 4L3QA 3CJBA 3FZKA 2Q97A 4YDUA 4PKIA 4B1UB 5AZJA 1H1VA 2WUSA 3QBXA 1CZAN 2IVOA 3WXLA 4BRMA 4BVPA 4B1VA 4BG8A 4BRAA 1GLEG 4IXCA 4EHUA 2IVPA 4BRIA 5AQZA 3VETA 1MWKA 4K41A 1P8ZA 4WQ4C 3R8EA 3LDLA 4CZFA 1HJOA 3H1QA 3ULEA 2P9PB 2BTFA 1U6ZA 3QFUA 4FWLA 1KAZA 4O5FA 4IWVA 5AQYA 3LM9A 3VEWA 2ASOA 3WXKA 1X3NA 3QBWA 2Q31A 3L4IA 5AQKA 3BUZB 3QDKA 2PBDA 2YJEA 1U2VA 3FFKB 3SLCA 4I6MB 1NGBA 3BF1A 3EN9A 4MO4A 4BR5A 5LY3A 2HF4A 4CZHA 1MDUB 2AP1A 1GLJO 4FO0A 5KPZA 4B1XB 1S3XA 4EFHA 4XH4A 2UYTA 3D2EA 4CBUA 1NGFA 2P9SB 1V4TA 2HMPA 2OANA 3CETA 3ENHA 3VEOA 1E4GT 3R6MA 3VF2A 4JAXA 3VGKA 1LOTB 2CH5A 3WXIA 4K42A 4IO8A 4CZJA 5BPNA 3WQTA 4A2AA 3VEYA 3M3ZA 4ISEA 1BG3A 3VGMA 4CZLA 4JHDB 2P9NA 4K25A 4A2BA 5BRDA 4CBWA 4BRHA 5AQVA 1K8KB 1TYQA 1YAGA 4CI6A 2W41A 4FL9A 3A5MC 1T6CA 2P9KA 3BF3A 1X3MA 1XC3A 3MN7A 2QM1A 4BRFA 1GLCG 2FXUA 3DJCA 3GG4A 3MDQA 5AR0A 3GOIA 3O1BA 4CBXA 1J6ZA 4KBOA 3VOVA 1QQNA 5BN9A 3J8AA 4BROA 5ADXA 4YDUC 4H0YB 1JCEA 5BREA 3WEEB 2FF3B 3BP8A 3VERA 1NGJA 4BR4A 2A3ZA 3H46O 5AQLA 5AQTA 3IFRA 4EIAA 1ZXOA 4XH5A 4BC4A 3H1VX 4CJ7A 1T44A 1DKGD 4BVOA 2PAVA 1GLBG 3RSEA 3DXKB 5I9EB 4FWOA 2QWLA 3OHRA 1C0GA 3HSCA 5JLHA 2W40A 3SMSA 3ZX0A 4H0XB 1GLLO 3ZX3A 5LJVA 3S41A 2GTDA 2J4RA 2H3GX 3EKUA 2ASMA 4K43A 5LJWA 4JD2A 5ELZA 5CE3A 4BR2A 2P9UA 2E2QA 3VF4A 4XH1A 5AQHA 4IJAA 3KZBA 2NLXA 3MN6A 3UKRB 4BC3A 4E1JA 4BR0A 4BQZA 2VWBA 3LDQA 3LL3A 3CERA 3O1WA 4FWKA 5AQUA 1RGIA 3TPQA 1DGKN 1C0FA 5ADXH 1JCFA 4J8FA 4FWSA 3ZETB 5BRHA 3I33A 2E2PA 3VEVA 3W0LA 2ZF5O 4FWPA 3DXMA 3SMPA 3A5NC 4FPBA 4GNIA 4AM6A 2Q0UA 3JXUA 2P9LB 3D2FA 3O08A 2GEMA 2Q36A 1XQSC 2V52B 4Y0WA 3FZLA 2VCPA 3UKUB 2V51B 3FR0A 4BRDA 3CJAA 2AA4A 1BUPA 3HM8A 4H0PA 2E2NA 3W3DA 2A40A 4JN4A 3AARA 4BRLA 5F0XA 1KXPA 3CJ7A 4FPAA 3H3OB 1NGIA 2D0OA 1NGDA 3ZEUA 4M63C 1NLVA 1HKGA 5KPTA 1RFQA 1SAZA 4MO5A 3CJCA 3C7NB 3O80A 4ISFA 1IG8A 2QWOA 1ATRA 3U9ZA 4DB3A 1HPMA 2A42A 5FPDA 3U9DA 1ATNA 4NB4A 3VGLA 3CI5A 3VF6A 2HOEA 3ENOA 3MCPA 2I7NA 2ZWHA 1HUXA 1ZC6A 5B8HA 2E1YA 2FSJA 2P9PA 4H0TB 5AZIB 2A6AA 3ID8A 3QICA 1Y64A 3SJHA 2ITMA 3CJ1A 3CQXA 3M1FA 4WQ4A 5TKYA 4FOIA 3VPZA 4BRKA 3ZX2A 3BEXA 3UE5A 4DCHA 1NGAA 1D4XA 3FLCO 3A0IX 5KQ8A 3L6QA 2YHYA 1NM1A 1BDGA 4CZMA 2FSKA 3VENA 3VEXA 5AQWA 1WOQA 2ASPA 4CD1A 3DAWA 1IJJA 4I6MA 3SK3A 4A61A 3D7EO 1NBWA 2QW9A 3H6EA 2A5XA 5AQRA 2QWQA 4BC2A 1KAXA 2QWRA 2P9IB 4M7XA 3QB0A 3C7NA 4CZGA 3LDPA 1EQYA 4FWQA 2P9SA 3C0BA 4PKGA 5FPMA 4O8KA 4H03B 4CD3A 5AQPA 3KVGA 2ZGYA 1TUUA 3G25A 4CZIA 1QZ6A 4FWRA 3A5LC 4QS8A 5KPRA 1R59O 5E26A 5EX5A 1NGHA 3O4WA 4WYBA 1HKCA 4A62A 3QFPA 5AZIA 4B1WB 4JHDA 5EY4A 2D4WA 3MN9A 5BN8A 5AQXA 2E2OA 3HZ6A 3AY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1K8KA 2UUBK 4BR7A 4M3UA 4WFBL 5GAGP 2Y1JA 1RT1A 2IGIA 3ULEB 1W7AA 3TU5A 1I39A 4U7BA 1NGGA 3LDNA 3A8YA 3QERA 5FLXO 1NGEA 3KHWA 3VQ4A 3KP0A 4CHPA 1FW6A 5AQOA 1C55A 2C1GA 1S1WA 1C0MA 1SKWA 4NXNK 4WQ5A 5F2RA 3WEEA 3CCRN 4BC5A 4OPJA 2QKKA 5HP1A 4DHYA 1Q18A 1KAYA 1I2UA 2UXCK 3U3GA 4A5BA 5BRFA 4YFUA 4C8MA 2GX9A 2F8TA 1X9JA 2CGLA 3D2EB 5SWMA 3KIOA 2V7ZA 3WUHA 3AVKA 1ZVGA 1RTHA 1QQCA 2HF3A 2Q0RA 2BE2A 3KLFA 4M45A 3GBTA 4CFAA 1BO5O 2N2QA 3O8MA 2F9WA 5C2DA 2P5GA 4DR7K 2QI2A 3AA2A 1VNAA 2GMOA 4HTLA 2VWKA 1QHTA 4LF8K 4J2DA 3AO5A 4FOEA 3TWHA 4DQ8A 4EAHD 4FZYA 3THWA 4GMJB 3CFOA 3CCLN 4C8LA 3D0PA 1TK5A 2GWJA 3ZETA 3T1YK 5KI6A 3L3UA 2GBZA 3LZJA 3BZKA 4XEIA 1SS6A 3V9WA 4M7YA 1OH7A 2IDOA 3AA4A 3ZLJA 4LFCK 3V9SA 2O8DA 4R79A 4E7JA 2P9LA 4H5TA 5AFUH 2JGUA 2PYJA 3LANA 3LPTA 4B1ZA 3MWTA 5JS1A 1GPTA 2F7TA 1IG9A 4ELVA 4KHYA 3MXJA 4CK1A 4DR6K 4NYFA 1BOTO 4DFKA 3ZCMA 2Q3SA 4M3YA 4F9OA 1QVFM 4BG9A 4CGHA 4AF1A 1MWMA 4BGAA 4B9TA 1HNXK 4BACA 1K9MO 3NMUA 4HE7A 2FBVA 1CHZA 1OKJA 2FSNA 4B9SA 5BPLA 4CJFA 3EZWA 1QSSA 4LF7K 2LR3A 4AILC 1W0HA 1RBTA 1QHAA 1SQKA 1RTIA 1W9HA 2GELA 3MMVA 4QS9A 3RR7A 3T69A 4FLVA 1W2BM 4PUOA 3K9KA 2Z1HA 2W6KA 5M1PA 3M8QA 2GWKA 1ZBLA 1PE4A 3RMAA 1CZBA 4LFBK 3MX2A 4B9VA 3KOXA 3HI0A 1U48A 2ITGA 5FRMA 2EWSA 3DYAA 5AQFA 2YCHA 3CQYA 4AB0A 1NMDA 3HP6A 1A5WA 3IDHA 2FF6A 3E66A 1GLFO 2P9IA 5TKWA 1LAVA 4BR9A 4W5TA 3CG7A 1RT2A 4CZKA 2RE2A 2HHSA 3HVRA 4DMNA 3ATUA 3B6OA 2UXDK 4BRNA 4H5RA 1BHLA 3BGRA 3BY5A 3ZEUB 3TR8A 2Q97A 4PKIA 4Z0UA 2C1IA 3ISNC 4BVPA 4BRMA 2MN5A 3NGIA 1IKYA 3D6RA 4HUGA 3QEVA 4XJXA 4BRIA 2SN3A 5AQZA 3M8RA 1MWKA 4K41A 1P8ZA 3OVNA 4OPAA 4WFAL 2UUCK 3K5OA 1WSFA 3FFIA 3HYFA 2HHUA 2YILA 1VQNN 1U6ZA 3QFUA 4O5FA 4B3RK 4IWVA 3DRPA 3DLRA 1XMQK 3OYBA 3QBWA 2Q31A 4IFEA 3T1AA 2HHQA 2BANA 4GW6A 1JJ2M 1M1KO 3PY8A 2XRIA 2Z1JA 1U2VA 2E3FA 4I6MB 5LY3A 3BF1A 4CZHA 2AP1A 1GLJO 3ZSWA 4E3SA 1L3UA 4KHSA 1L3TA 2OZSA 4EFHA 2X74A 2OYQA 1IKWA 1NGFA 2P9SB 3O4NA 5C12A 2OANA 4C8OA 4CF2A 1XWLA 2ZE2A 3TANA 4TSXA 3R6MA 1X9SA 1X9MA 3BZCA 4AH9A 1NOZA 1YHQN 1KLMA 3WXIA 3CCQN 1SL1A 4IO8A 1GOBA 4DTMA 5AJ3K 3SUQA 3G10A 3VQ8A 4ISEA 3AVLA 3AVGA 2KQ2A 3E7UX 4CIFA 3CCEN 4BRHA 1W97L 3G71N 1TYQA 2W41A 4JK8A 1MR4A 1KVBA 3BF3A 4W5OA 1X3MA 3OS0A 4BE0A 1ZUTA 1NJXA 4BRFA 3SUOA 4DTOA 3THXB 4CFBA 3AVCA 4DV3K 3DOLA 4KBOA 2YNIA 2R7YA 4CE9A 2VG7A 4H4OA 4BROA 4KKOA 1HPZA 4H0YB 1O1WA 3H46O 5AQLA 4BC4A 1HJRA 5K14A 2OZMA 1Z26A 3DXKB 3OS2A 1KQSM 2N69A 2QEXN 3MEGA 1KC8O 1Q7YO 3CFRA 3HSCA 1JLBA 4E7IA 3SMSA 1VQ5N 4CJWA 4GVEA 2HBMA 1GLLO 2K35A 1NK0A 1CZ9A 1VQKN 1KTQA 1JLGA 4CK3A 1NK5A 3KD5E 1D5AA 5M1QA 4KTZA 4BR2A 5C0YA 3KZBA 5C25A 1RTDA 1FH3A 4BR0A 1IKXA 3QO9A 3OYCA 1NOYA 3LDQA 3N4QA 1VQ7N 5AQUA 1RGIA 5J2QA 1I2VA 1ZYQA 2QXFA 1C1AA 4CFDA 5ADXH 4CW7B 1DT9A 4J8FA 5CY4A 2HNYA 1NG9A 1PTXA 4FK4A 3L3VA 2E2PA 3Q7CA 3MXIA 3G0ZA 3V9UA 2O4GA 1L3SA 4ZTJA 1HNWK 4LF6K 1TKZA 3A5NC 3SQ4A 1C0TA 1B9FA 1XQSC 1B92A 2V52B 2O8BB 4DF8A 3UIQA 1VQ8N 3KK2A 4OGCA 5HRPA 3HK2A 3AARA 1WWNA 3TTCA 4JKBA 4CEOA 2VQFK 4FJ7A 5FDLA 4JI6K 3NHGA 4IOXA 1HKGA 4B08A 5KPTA 4CGFA 1N8RO 3K5LA 4C1NK 1N34K 2QWOA 1WSJA 2WFBA 1SL2A 3U9ZA 3HP9A 1ATNA 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4DQQA 1CXQA 4H0OA 3F5TA 4E7KA 1Z05A 4IO9L 3A5OC 4MLEA 1BCOA 3F9MA 4FJKA 2O8CB 1T03A 2O8FA 4HWIA 3BDPA 2W42A 5M1OA 1VQLN 5BR9A 4DV5K 3EE9A 1Z6RA 2KPYA 1F21A 4YOYA 2P9NB 1HQUA 2D0PA 3K58A 4E0DA 2G8FA 2G8HA 5AQGA 4ID1A 5I42A 4AHSA 1L4VA 1JLEA 1RT6A 2KFNA 1HYVA 4KHPK 1ZYVA 5CY0A 2YX6A 2W00A 3V1QA 4BREA 4AHTA 3EL2A 3I8DA 3KC6A 1D8YA 4YHHK 3SV3A 3UKUA 4C1NI 4BRPA 4FJMA 5AQJA 1RILA 1Y97A 2O4IA 4AQYK 1RDCA 3VQDA 3RSEB 2B3CA 3J7ZO 4DR3K 1Q9XA 2QXLA 5AQQA 4DQIA 3TAQA 2QWPA 3U8XA 4GVMA 4FWMA 4BRGA 5CZ2A 2VQEK 4HVJA 3WXJA 4JD2B 1A5VA 2D0CA 2LSNA 3L2VA 1VQPN 2P9UB 2WONA 4WQ5C 1QTMA 1ICAA 4B3MK 2IC3A 3U6FA 3RRGA 1ZBIA 1YVNA 3OYAA 3NVMA 5AZJB 4CGJA 2VGNA 1QZ5A 3OA9A 2KW4A 3O3GA 2YHXA 3LDOA 4FJJA 2D0BA 2F9TA 1K8BA 1K73O 3J81O 2IAJA 3MECA 3AO3A 2YJFA 4B9LA 5EXWA 3AA3A 2OCEA 4CZEA 1N5YA 3CCVN 1NKCA 4CJEA 4DR4K 4PWDA 3D2FB 3HJFA 3SAHA 3HBTA 4FLYA 2DFEA 3CYMA 1HX1A 4JKEA 3VESA 4KV8A 4RWTA 4BQLA 4F4KA 3IMXA 5M1KA 1JXBA 4G9ZA 2XY6A 1D9DA 4KYPA 2I5JA 1JLFA 2DTUA 4LSNA 2AJQA 4JI0K 3MK6A 3HT3A 3P31A 4M41A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K8K A;  2UUB K;  4BR7 A;  4M3U A;  4WFB L;  5GAG P;  2Y1J A;  1RT1 A;  2IGI A;  3ULE B;  1W7A A;  3TU5 A;  1I39 A;  4U7B A;  1NGG A;  3LDN A;  3A8Y A;  3QER A;  5FLX O;  1NGE A;  3KHW A;  3VQ4 A;  3KP0 A;  4CHP A;  1FW6 A;  5AQO A;  1C55 A;  2C1G A;  1S1W A;  1C0M A;  1SKW A;  4NXN K;  4WQ5 A;  5F2R A;  3WEE A;  3CCR N;  4BC5 A;  4OPJ A;  2QKK A;  5HP1 A;  4DHY A;  1Q18 A;  1KAY A;  1I2U A;  2UXC K;  3U3G A;  4A5B A;  5BRF A;  4YFU A;  4C8M A;  2GX9 A;  2F8T A;  1X9J A;  2CGL A;  3D2E B;  5SWM A;  3KIO A;  2V7Z A;  3WUH A;  3AVK A;  1ZVG A;  1RTH A;  1QQC A;  2HF3 A;  2Q0R A;  2BE2 A;  3KLF A;  4M45 A;  3GBT A;  4CFA A;  1BO5 O;  2N2Q A;  3O8M A;  2F9W A;  5C2D A;  2P5G A;  4DR7 K;  2QI2 A;  3AA2 A;  1VNA A;  2GMO A;  4HTL A;  2VWK A;  1QHT A;  4LF8 K;  4J2D A;  3AO5 A;  4FOE A;  3TWH A;  4DQ8 A;  4EAH D;  4FZY A;  3THW A;  4GMJ B;  3CFO A;  3CCL N;  4C8L A;  3D0P A;  1TK5 A;  2GWJ A;  3ZET A;  3T1Y K;  5KI6 A;  3L3U A;  2GBZ A;  3LZJ A;  3BZK A;  4XEI A;  1SS6 A;  3V9W A;  4M7Y A;  1OH7 A; 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1NGEA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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