The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
|
sequence length |
46
|
structure length |
46
|
Chain Sequence |
SEALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
|
| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
|
| publication title |
The H-NS dimerisation domain defines a new fold contributing to DNA recognition
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
16
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-12-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MW2 B; 1LR1 A; 1OV9 A; 3NR7 A; 4ICG A; 1NI8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1W2B U; 1XI1 A; 1QBZ A; 1KBH A; 4LFB O; 3ABL B; 3AG1 B; 1FFT B; 2Q9L A; 1S72 V; 1H2M A; 4I50 A; 4DRX A; 3JCZ A; 5KHH A; 3E8G A; 4DV7 O; 1AJP A; 1GRJ A; 2WLN A; 5IT9 N; 5BR8 O; 4JTD B; 4X1Y B; 3T1C A; 2XTA A; 5LP6 B; 1Q86 W; 4B08 A; 2ZM6 B; 1RSO A; 2P5O A; 3QTC A; 4QE9 A; 1B04 A; 4LF4 B; 3E8B A; 3OMI B; 4U3J B; 2DYS C; 4NB5 A; 1ARO P; 5IJ0 B; 2H94 A; 1NTZ H; 1IVS A; 3AEI A; 4P30 A; 4NXN O; 4LF8 O; 4UFZ A; 4DUY B; 1SRY A; 1DF4 A; 1VQK V; 2YI8 A; 4ZIB A; 2EBO A; 4TQD A; 3AG7 A; 2LFR A; 1Y67 A; 2F95 B; 2EIM B; 1VQ7 V; 3S3W A; 1MNG A; 1UJW B; 3MHH C; 5EC1 C; 1N34 O; 2DN9 A; 4LFA B; 2DYR B; 2EIN C; 2Q69 A; 2QWQ B; 1FS0 G; 1X59 A; 1BCC H; 3ZRX A; 1GTO A; 4HNA B; 3BAA A; 2P67 A; 2HLD G; 2UU9 B; 3D3I A; 3F7V C; 3JD0 A; 4LF4 O; 1R3I C; 1R6T A; 2OCH A; 1TVK B; 4KP4 A; 3B40 A; 2ZR3 A; 5LMN B; 3N2G B; 1M4U A; 4RUE A; 2ZR2 A; 3CRM A; 4LF5 B; 4DUY O; 3QO5 A; 1QLE C; 3E83 A; 1ZL8 A; 2RJZ A; 1S5J A; 2VWK A; 1FKA O; 3SJQ C; 2YEV A; 5IWA O; 3F7Y C; 4K35 A; 3OUF A; 3KZI Z; 2DWE C; 4D6T H; 4X1I A; 3UO2 A; 1QR9 A; 3GVM A; 5CMU A; 4CH6 A; 2ZQM A; 4UUJ C; 4TWK A; 3H9V A; 3JAW A; 4TV9 A; 1K5Q A; 2K1E A; 3SPJ A; 2E5L B; 4EB6 A; 4U7N A; 1GAX A; 1A32 A; 4JYY A; 4CBC A; 2C2A A; 4BWA A; 2UU9 O; 3LSU A; 2WWW A; 2Q7H A; 1XQ8 A; 3ICX A; 1E1Q G; 1QHT A; 4B3T B; 3AK2 A; 1MSW D; 3ZMZ A; 3Q4H A; 5LMN O; 5H2F Z; 2DWD C; 5B66 Z; 2QWN B; 4O4I B; 2P6J A; 3SYP A; 2DJV A; 5LHG A; 4DR6 B; 3CCS V; 1MSD A; 3ZX6 A; 1IX9 A; 1LUV A; 2EJR A; 1PNL A; 2L6L A; 3QG5 A; 1GK9 A; 1BHB A; 1I5Y A; 5EBW C; 2B1G A; 4MW8 A; 1H8H G; 4UVB A; 4UB6 Z; 3K08 A; 1Y76 B; 3ABK B; 4X62 B; 1ZWI C; 3ZBH A; 1GN6 A; 3OTO B; 2MK3 A; 3CRA A; 4FVM A; 2LFS A; 3E35 A; 3B8N A; 5JH7 B; 1I0H A; 4LWS B; 4I55 B; 4KXR A; 3SJC C; 4YHH B; 2UUC O; 5IY5 C; 4B3S B; 1AI7 A; 2P22 C; 2D3O W; 1PL0 A; 4B3T O; 3IC7 A; 5B1A B; 1OZ0 A; 3EFF K; 2M6Y A; 1AP6 A; 3UQ8 A; 5KHG A; 4XDL A; 3CX5 F; 2UXB O; 3AG2 B; 4DR6 O; 2XAS A; 1XNQ B; 3SYA A; 2ODM A; 3KCY A; 4CC5 A; 3K0D A; 2UUA B; 5FNV B; 4NTX A; 2YSU B; 3TXS A; 4H37 A; 4X1K B; 3K58 A; 2VQF B; 1XIL A; 1JX9 A; 3K0G A; 4MTG A; 1WLE A; 4X62 O; 3CCJ V; 1N4C A; 4BR6 A; 1KKC A; 4X8A A; 3OTO O; 1SKV A; 1XOU A; 4D7S A; 1XUQ A; 4WFF A; 4YHH O; 4W4K A; 4B3S O; 3DGE A; 4JI2 O; 1HP8 A; 1YIT V; 3I55 V; 2HFE C; 3CC7 V; 5KAI Z; 5JQG B; 4J80 A; 3RYC B; 1M90 W; 2XAJ A; 3VQW A; 3JAR A; 4YIO A; 5B5E Z; 4GKK B; 2IU0 A; 1XNQ O; 4PI2 A; 3CME V; 4HAM A; 3JSL A; 4PA3 A; 2M7W A; 4NTW A; 4MS2 A; 4BIU A; 2W6J G; 4I9W A; 4E4E A; 2RN9 A; 2VQF O; 1ZTE A; 1O9G A; 1BZK A; 4GX2 A; 4O2A A; 5LOV A; 5C8Y A; 4GKJ B; 2IH1 C; 2EZO A; 1RM1 C; 1XHZ A; 5L3B A; 1N32 B; 1NS1 A; 5CA1 B; 4TUY B; 2ETN A; 3OEH G; 4DR2 B; 4BIO A; 4WFH A; 3LDE A; 3GWO A; 2Q67 A; 5H5N A; 1YSC A; 3CCU V; 4FM1 A; 3U10 A; 4DR7 B; 3HKD B; 3H1I H; 4O2B B; 1GMG A; 4DV0 B; 3DXR A; 1WPB A; 3JAK B; 4JI6 O; 2QR4 A; 4GKK O; 5IJ9 A; 4K8X A; 2EUL A; 5A2Q N; 1FD9 A; 1O9H A; 4YIP A; 1WP8 A; 2WSS G; 3JAL A; 2EIJ C; 1SET A; 2E75 B; 3RVZ A; 4OX9 B; 3JYC A; 3DC5 A; 3OD4 A; 1EM1 A; 2YDE A; 2OIG A; 4O4J A; 4GKJ O; 3X2Q B; 5JVD B; 4LP8 A; 5ITZ B; 1WB8 A; 1N32 O; 2XHB A; 1XMO B; 2Q7G A; 1P4R A; 1KP2 A; 1FPO A; 3CCV V; 3EXA A; 1S3J A; 4X64 B; 1TUB A; 1JCH A; 3JD3 A; 4PV1 B; 1M9N A; 2F23 A; 1J95 A; 4DV0 O; 2QJ1 A; 1GM9 A; 4PDR A; 2R9I A; 3N2K B; 4LCU C; 2W0X A; 2BTO A; 5JCO A; 5J9P C; 2JS3 A; 1MAB G; 1V54 B; 2QM4 A; 4Z1M G; 1HR0 B; 5CB4 A; 4DR4 B; 5EZY B; 3L9D A; 2QKC A; 3T1Y B; 4P9P A; 3APQ A; 1VQP V; 3OFN G; 5J2U A; 4J41 A; 4PA7 A; 3L70 H; 4CS4 A; 3BFR A; 2ZCE A; 1F4N A; 4ZI7 B; 1CEZ A; 2NLJ C; 3UKM A; 1Z5W A; 1XMO O; 4DUZ B; 3B09 A; 5KHJ A; 2Q73 A; 2VRZ A; 4GLX A; 2BTQ B; 3OMA B; 4RUF A; 4PD4 F; 4QE7 A; 1PL4 A; 4XDJ A; 5KMG B; 3J80 N; 4PEL A; 3EVK A; 4UCO A; 2QE7 G; 2RNB A; 4K0K B; 4MVO A; 5H6Q A; 4DV3 O; 2WLL B; 1N36 B; 2H3O A; 3W7T A; 4EEQ A; 1HR0 O; 5GON A; 2KG7 A; 4DR4 O; 1EN5 A; 5KX5 A; 3T1Y O; 3ZHU A; 2UXD B; 2PF4 E; 3M8A A; 4AQY O; 4WCE V; 1V55 C; 1Q3E A; 2QA4 V; 1YJ9 V; 1SS3 A; 4WFG A; 3K06 A; 3CHX A; 2R70 A; 1VP7 A; 4JAA A; 5C93 A; 4DUZ O; 1JOY A; 1K92 A; 3WB2 A; 4ZHQ B; 1VF6 C; 1PP9 H; 3AG4 B; 3E22 B; 2EIL B; 3OGI B; 2P4V A; 2JEX A; 3NR7 A; 4RO2 A; 2Q0O C; 4FM2 A; 2BSK A; 3ABM B; 3OMN B; 2VWJ A; 2CK3 G; 1IBK O; 3LDD A; 3CCL V; 5LA6 A; 4JI4 O; 3IAY A; 4JI8 B; 4K0K O; 1FFX A; 2AW9 A; 3ETG A; 1WJZ A; 1HWY A; 1MA1 A; 2RMK B; 3FYI B; 1JJO A; 1Y66 A; 3E8H A; 3JAT B; 4H44 B; 1E1R G; 1N8R W; 3ZRW A; 4FIP C; 4TT3 G; 4UVA A; 1XMQ B; 2LO1 A; 3B8M A; 2UXD O; 4LC1 A; 1AVM A; 4MSW C; 3HB3 B; 3A0B Z; 1DK1 A; 2HJD A; 2QSA A; 3BPZ A; 4LH7 A; 1DTO A; 5IYZ B; 3B2E E; 3JD1 A; 1FXK A; 2OIE A; 3WG7 B; 4PA4 A; 3RBZ A; 4LBE C; 3OUS A; 2WA3 A; 1OJH A; 3BRC A; 1YIJ V; 5LMU O; 1FYJ A; 5LP6 A; 3JCU Z; 2AHZ A; 4U3J A; 2Y4T A; 1GO3 F; 2LP7 A; 4JI8 O; 5IJ0 A; 4PHZ A; 3AG3 C; 4LFB B; 1ROP A; 2KB1 A; 2BCC H; 2GV9 A; 4DXW A; 3LNN A; 4J7K A; 4DV7 B; 3K03 A; 5EBL C; 4GUN A; 4IIJ B; 3AK3 A; 1XMQ O; 3VQY A; 2HP8 A; 1M1K W; 1CP9 A; 5D5P A; 1NR7 A; 3ZHS A; 4DV6 O; 3CS5 A; 3W7S A; 2XND G; 1OCO B; 3C3S A; 3RYF B; 4GX1 A; 2GBO A; 4DK0 A; 4CH4 A; 1NJI W; 3EHB B; 1KEC A; 4HNA A; 3SPC A; 2FTK A; 1FXV A; 4ZOL B; 4G28 B; 4OXS A; 1SA0 B; 1YTF B; 1S76 D; 2CAZ C; 3AK1 A; 2ZE6 A; 1IDS A; 1TVK A; 2WLM A; 1QU7 A; 3N2G A; 1XEQ A; 3OR7 C; 3HPL C; 2YXL A; 1L1F A; 1K8A W; 1OCC B; 1H2L A; 1K34 A; 2ZDI A; 3HKB B; 2LGQ A; 1AIL A; 1RPR A; 1M5I A; 1H2K A; 4WFE A; 1SQB H; 2CDY A; 4PDM A; 5EBM C; 1JFF B; 2X0L A; 3R66 A; 4MVU A; 2PGG A; 3L72 H; 4JZ2 A; 3T4Z A; 4YJ2 A; 2OCC C; 1I7F A; 1K73 W; 5IWA B; 4N23 A; 4P9O A; 2P4K A; 1EN6 A; 2Z3Y A; 3MDS A; 4L8J A; 2YIB A; 2HHH B; 4IHJ B; 3I56 V; 4N21 A; 5EYP B; 2NNU A; 4O4I A; 1I5X A; 3K79 A; 5LHH A; 4FFB B; 2YXY A; 3OR6 C; 1YZB A; 2E74 B; 5BY1 A; 1YI2 V; 1IBL B; 1JJ2 U; 2CTW A; 2DYS B; 2WAM A; 2V4D A; 1HNX B; 1NQT A; 1SZX A; 1M56 C; 1YJN V; 3K3W A; 4UCV A; 4Z1V A; 4DO2 A; 3G80 A; 5LXT B; 1VQ6 V; 3K04 A; 2JGD B; 1XNR O; 4X9Q A; 1NTM H; 1DF5 A; 2VS0 A; 5LBQ A; 3ZMS A; 1F4M A; 5B3S B; 4LWS A; 1KQS U; 2GUZ B; 4I55 A; 1P7B A; 1COW G; 2WLI B; 5BZB A; 2HHH O; 2EIN B; 1M93 A; 3E89 A; 2YUA A; 5KAF Z; 4D7T A; 2UXX A; 1I94 O; 2LW1 A; 4LNU A; 1HDJ A; 3JAS B; 2MW2 B; 5LL6 Y; 4UVC A; 4GX0 A; 2DMX A; 1URF A; 1IBL O; 4J42 A; 1QR8 A; 5FNV A; 2UUC B; 4EFB A; 4X1K A; 1VF7 A; 5JJJ B; 1BMF G; 1HNX O; 3G6B A; 3E86 A; 1SF9 A; 4HYO A; 5E79 Z; 4UV8 A; 1QLE B; 3OT7 A; 2EZP A; 2UXB B; 3RYH B; 2FKX A; 4BW5 A; 2EIK C; 4E2L A; 2HG5 C; 2Q0A A; 3G71 V; 4KFM A; 1BS3 A; 5EC2 C; 2QM8 A; 1XHX A; 2Y69 B; 1N33 B; 5JQG A; 1G1X B; 4J7Z A; 1K5S A; 1NKD A; 3B4S A; 3RYC A; 4JV5 O; 3AG2 C; 2N05 A; 3BY6 A; 3H1L H; 5E1A C; 5LYJ B; 2OYQ A; 1NI8 A; 1B3Q A; 3K59 A; 4FFK A; 4JI2 B; 5CA0 B; 2WLH A; 5FL7 G; 1S5L Z; 3S3X A; 1ZL8 B; 1G4Y B; 5HFM A; 3BAB A; 2ITD C; 2JRI A; 4GX5 A; 3CYO A; 3OM3 B; 2YEV B; 1Y4M A; 4IL6 Z; 4QIW F; 4TV8 A; 5CA1 A; 2QKA A; 4TUY A; 3L71 H; 3ZMV A; 3UCS C; 4YXW G; 2Q4P A; 1B6Q A; 2P90 A; 1FAF A; 3SJB C; 1WN7 A; 1N33 O; 1NVP D; 4J9Z B; 3HKD A; 4BAY A; 4O2B A; 2JK5 C; 2X6B A; 2ADP A; 2IJJ A; 1Q43 A; 2GHY A; 2ZD9 A; 1K4D C; 4XDK A; 4O4H B; 5JWP A; 4JI6 B; 3OTF A; 3G67 A; 1WA8 B; 4FK5 C; 1KUQ A; 2Y48 A; 5JVD A; 2XAH A; 3SYQ A; 3CP1 A; 2P06 A; 3WB1 A; 4ZBM A; 4ABM A; 1KKD A; 1G6U A; 4Z2W A; 3FX7 A; 3NXS A; 3CEI A; 1TA8 A; 1P7G A; 3HKE B; 2LJ2 A; 3ASN C; 3FYE B; 1Q6U A; 3ABT A; 2CGO A; 1AJQ A; 4UXN A; 1QCE A; 2JGU A; 4I0X A; 4X66 B; 5L3C A; 2AGA A; 5EZY A; 2YID A; 4IT5 A; 1AJN A; 3K5L A; 1XL6 A; 4MVQ A; 3KKY A; 5DEC A; 1BQ0 A; 1OCZ C; 3SDL A; 4ZI7 A; 2ZXW C; 2ADQ B; 2RCV A; 1VQ5 V; 2Y4U A; 1YTF D; 1Y74 B; 1BSM A; 3HR0 A; 3P3P A; 1SZT A; 2BTQ A; 1PKX A; 3LNM B; 3IGA C; 3CCM V; 2JIZ G; 5IDJ A; 4JF3 A; 4TSF G; 4A5U B; 3E8F A; 2ZKO A; 5KMG A; 3ASO C; 5B1B C; 4GYC B; 4U7O A; 1XDC A; 1AR1 B; 4X66 O; 2HVJ C; 1YF2 A; 3H1K H; 2CTR A; 5EIB C; 2A3Q A; 2WLL A; 2QWR B; 2VQE B; 3T4D A; 3N27 A; 1AI6 A; 4L87 A; 4LF6 B; 1VQ4 V; 2DQ0 A; 4F6R B; 5A9G A; 1M57 B; 2BE3 A; 1PD3 A; 1ZUQ A; 2Z0A A; 2KKW A; 1GN3 A; 1D5A A; 3H01 A; 2EIJ B; 3QF7 A; 3UT5 A; 4QJF B; 1Q90 D; 3LSS A; 1JMK C; 3BA8 A; 2W6I G; 4FLW A; 5D5Q A; 3THO A; 4DV3 B; 1NT2 B; 1H8E G; 3UM7 A; 4G2K A; 4ZHQ A; 2IW5 A; 5BMV B; 2F93 B; 5J2T B; 1OCR B; 1E79 G; 4O2A B; 2IU3 A; 5FPO A; 4JI1 B; 1IUR A; 3RYI A; 1VQO V; 3FFQ A; 4AQY B; 2BOC C; 2JS5 A; 4JI0 O; 4JGS A; 4KUM A; 2WLK A; 3ML0 A; 2GTS A; 5H9C A; 3SYC A; 3OGC C; 4FZ1 A; 2JVD A; 1JVM A; 1N0N A; 1VEW A; 3RWR D; 3GB7 C; 2VQE O; 1SES A; 3JAT A; 3F5T A; 1IXM A; 4AI8 A; 5IJ9 B; 4LF6 O; 2IJI A; 1I08 A; 5L3E A; 2QGN A; 4RQF A; 4AIL C; 4TQF A; 2UUB B; 3JAL B; 1FJG O; 1IBK B; 3SGI A; 5JCO C; 5IYZ A; 4JI4 B; 4OGQ B; 2QWP B; 1CPY A; 1W59 A; 2ZIM A; 1U97 A; 3CCQ V; 2LW7 A; 4UCU A; 3UO3 A; 1Q6H A; 4JI1 O; 5JJN B; 4O4J B; 3J81 N; 3CE2 A; 3BEH A; 1JR9 A; 5KA5 A; 3KG2 A; 3J7A U; 4OPA A; 3RFR A; 4R8C A; 1SER A; 3ABM C; 1AR5 A; 2X6C A; 4UCR A; 1QVF U; 3ZS8 C; 5CN0 A; 4JTC B; 5CBG A; 2AZ2 A; 2WLJ A; 2F4V B; 3A0H Z; 3FD9 A; 4O4L B; 4F6E A; 5LMU B; 2YS8 A; 3KCX A; 4IIJ A; 4FLX A; 4PDV A; 4WBN B; 4I5S A; 4KL1 A; 2UUB O; 5F2V O; 4DK1 A; 1VF5 B; 3L73 H; 4DR1 B; 3ZN0 A; 4PJ0 Z; 3CJH B; 5LGT A; 4JAV A; 3OAA G; 3M99 B; 1NVP B; 3RYF A; 5DM6 V; 2CH7 B; 1LUW A; 3JAM N; 3CMA V; 2Q6A A; 1Y6X A; 1L8D A; 4EKW A; 1MZE A; 3ZIA G; 4ZOL A; 2PZS A; 2D2C B; 2HJF C; 2F66 C; 1SA0 A; 3GWK C; 4DV6 B; 1Z2G A; 1PNM A; 1LNQ A; 3CRC A; 3C90 A; 3TGU H; 1F7Y A; 1K33 A; 2N04 A; 2F4V O; 3U11 A; 4MW3 A; 3BA9 A; 1ORQ C; 3SPH A; 4X1Y A; 1TGO A; 2NR5 A; 1K97 A; 3HKB A; 5FLX N; 1VQL V; 2AXT Z; 1W0K G; 2IJK A; 5LHI A; 1WP7 A; 2FYU H; 2V1D A; 3ZHR A; 4DR1 O; 1IBM B; 1JFF A; 4B3R O; 1JQ0 A; 1OCO C; 2GTA A; 4DR3 B; 4DV4 B; 1TUE B; 3B77 A; 1V9P A; 5L3G A; 1LR1 A; 1H2N A; 2CE4 A; 3MD0 A; 2F1M A; 4WF9 V; 1AB3 A; 4JPR A; 4B7K A; 5KLV H; 4IHJ A; 4PA9 A; 1Q7Y W; 4EFE A; 1FXK C; 3IFX A; 2YIC A; 5EYP A; 4JAU A; 4FLT A; 3ABL C; 3AG1 C; 3FAV B; 4PA6 A; 4ICG A; 4FFB A; 3MHS C; 3FB7 C; 2BSK B; 1R1B A; 3CD6 V; 1NH2 D; 5LP6 C; 1HNW O; 1ENV A; 3HKC B; 4YJ3 B; 2BOB C; 1FFX B; 3AG3 B; 1BE3 H; 1DGS A; 2H8P C; 4JI3 B; 4K3A A; 3ZED A; 1IBM O; 2IJH A; 4J11 A; 5L3D A; 3R65 A; 3ZRW B; 4F4L A; 5LXT A; 2N74 A; 2B5U A; 2EJ7 A; 4JZG A; 4DR3 O; 4DV4 O; 2A79 B; 2GUZ A; 5IYB O; 1EZV H; 4WFA V; 1Q8I A; 2EIM C; 1U96 A; 1S77 D; 2WLI A; 3QVN A; 4CH3 A; 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