1NVSA

The complex structure of checkpoint kinase chk1/sb218078
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
271
structure length
264
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Structural Basis for Chk1 Inhibition by UCN-01
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 264
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1nvsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1nvsA01
4MKCA 1KE9A 4JG7A 3V5LA 2VTNA 3GENA 1IA9A 3Q96A 5AAFA 3NW7A 5CT0A 4ZSGA 4CG8A 4ORKA 5DR9A 3POZA 3ZSIA 4DT9A 3D15A 5EH0A 4I20A 2XP2A 2W05A 3TUBA 3GXLA 1Q99A 5FEEA 5DRDA 4RVKA 3GC8A 4X2NA 5HLWA 3MFTA 5J79A 3V8SA 4JT3A 1YXUA 1OM1A 2CGWA 2QOHA 3K5VA 4EOIA 4X21A 4XRJA 5DOSA 5AX9A 3F9NA 5EG3A 4X2FA 4D2WA 3A7GA 3E5AA 4ACDA 5AP6A 1REJA 4BKYA 4V0GA 2FSTX 3QAME 3ZO4A 1AQ1A 5BVOA 2YWVA 2PVMA 4MXXA 2UW3A 2YZLA 4YHTA 4GT4A 5AM6A 2E9NA 4KINA 4BDEA 2BKZA 4LL0A 3ZC5A 4G2FA 5EQPA 4JDHA 4ZTHA 1QCFA 4OBOA 4ANSA 3QLGA 4MD8E 3HNGA 4YC8A 2PVLA 5CEOA 1L3RE 1DS5A 2NP8A 5HE3A 4FBXA 5C4LA 2O2UA 3AC4A 3EYHA 2BRBA 2YIQA 1BL7A 3RWQA 5L8KA 3DLZA 2VTTA 2WMAA 3EOCA 3ZSGA 2XS0A 2XK9A 2PL0A 3JY9A 2CGXA 4KKHA 5HCZA 5HCYA 3BBWA 3BX5A 4UYAA 1YI3A 2DS1A 2BROA 3DAEA 4EK8A 1WVWA 1PXNA 5ANEA 4X6QC 3WYYA 3R1NA 2ETKA 2QC6A 3RMFA 4BCOA 4JVGA 5IQDA 1L8TA 1YKRA 3FC2A 2XNMA 4FZAB 1UVRA 2R0IA 3MB7A 4QP9A 4RVMA 4AGUA 4ZZNA 3OW4A 5H3QA 2GDOA 2W17A 3SGCA 3ODYX 4MK0A 1IAHA 2XNEA 3OEZA 4FTTA 1KE7A 5KZ0A 4IVDA 4OTIA 4X3JA 5HO6A 4J8MA 4CFVA 4BIBA 4O7LA 2F7XE 3O71A 5HE0A 4CQGA 5KBRA 5H8BA 3CE3A 3DK3A 2J7TA 4JAIA 2C47A 1ZYDA 3CBLA 4AZSA 3CTHA 2WD1A 5I3RA 4FKLA 4YLKA 2YITA 1GIHA 3KN5A 2CNUA 2QLUA 3M42A 4WO5A 2OIDA 4FV9A 3EL8A 4GG5A 3DXQA 4FV3A 3VS5A 4E3CA 4QMQA 3SX9A 1ZY4A 4G34A 3ZH8A 4AZEA 3BYOA 2W1CA 5ANOA 4BWPA 1GAGA 3PP1A 4NM7A 3C13A 5AUZA 4CCUA 4TL0A 1PHKA 4F7LA 4J95A 3H9FA 5FLFA 3QC4A 4ZMEA 3KXNA 5I9XA 2JIVA 3FMLA 3Q5IA 1M14A 4UB7A 4EOQA 4M68A 4YJVA 3CC6A 3E8NA 3PIXA 4K18A 5BX0A 5FD2A 4EBVA 5AR7A 5EOBA 4FNYA 4JQ7A 4QMMA 4PQNA 4XP0A 4V05A 4BN1A 3UO5A 1WVXA 3Q4UA 4NTSA 4O22A 5A4QA 3HP5A 4O7YA 5LWNA 5L2TA 3NCGA 3NUUA 4F4PA 3VBTA 3HP2A 5J87A 3B2TA 4D5KA 2C6TA 2XK3A 1OL7A 1M2PA 2XKDA 5KMMA 3RM6A 4PX6A 2BKKA 1OIYA 5JMSA 3AMYA 2BDFA 1K3AA 5H8GA 3RK7A 4YTFA 4FG8A 4HZSA 4EQCA 4IZYA 1I44A 4WUAA 4FTIA 2ZOQA 4R7BA 1XH5A 4L52A 5DBXA 4KKEA 1RW8A 2BVAA 2G1TA 3IDCA 3ZMMA 3QD3A 2C5YA 2Q0BA 4H36A 1M2QA 3OD6X 4ACGA 3QYZA 3RPRA 2O63A 3LQ5A 1FOTA 4D0WA 4HYHA 2R3HA 4QPMA 4CRSA 3W2OA 3IW8A 5B7VA 3PG1A 5D7VA 5E8XA 3OCGA 5IH5A 4EC8A 2AC5A 5HHWA 4XP3A 1U59A 3FMDA 1YXSA 3W2QA 3W16A 4ZP5A 4KS7A 4CFWA 3F82A 3UG2A 3NYNA 4JRVA 4RG0A 3C4XA 3KB7A 5IQHA 4PNKA 2GNFA 2YDJA 4HJOA 4EOSA 2XM8A 4GUEA 3UPZA 4R78A 3AT2A 5FBNC 2OO8X 4YLLA 3PVUA 1JQHA 4ZTRA 4BWKA 4BGHA 1XO2B 4HYSA 1J3HA 3SDJA 2VU3A 2VAGA 4EUTA 4U42A 4FA2A 3HA8A 4O2ZA 1XH9A 3IKAA 3R21A 3FLZA 4ZSAA 3VBYA 5EFQA 4ZZMA 3WZJA 3QRKA 1Q24A 2X8DA 4BI1A 4J52A 1J1CA 5E4HA 3M1SA 4E4NA 4FT7A 5A6NA 2ONLC 2FUMA 3U51A 4QYHA 2FSLX 3WZEA 3RGFA 4UWBA 3O23A 2W7XA 4E7WA 3LJ2A 4O0XA 4FKVA 2UZNA 4I4FA 5AV1A 1YWRA 3QTWA 3QUPA 4O1OA 4FK6A 1RE8A 4H1MA 3OS3A 1FMOE 2BAJA 2UZEA 5CAOA 3RCJA 4IMYA 3IDPA 3KREA 3C4ZA 4L7SA 4RX7A 5ETCA 4OT5A 4FSQA 2CLQA 2WQNA 4H1JA 3QHWA 5C27A 5HIEA 3Q2MA 4QMYA 2QG5A 2W1ZA 3LM5A 4CYIA 4EL9A 2EWAA 2X4ZA 4JBQA 5LVMA 2GNJA 3LXPA 1PW2A 3ZS5A 3HX4A 3Q4ZA 5ANIA 3TL8A 4AN9A 2UW6A 5AEPA 5DMZA 5IEXA 1T46A 1YHWA 3F66A 4XS2A 4ZTNA 3L9MA 1Q3DA 3KCFA 2J0IA 3LW0A 3MTLA 5LCJA 4O0RA 4FIHA 1OPLA 4RJ4A 3RCDA 3ZUUA 2JDRA 1F0QA 3IPHA 3IW6A 2PZPA 4BYJA 1UU3A 2YLEA 4A9YA 2UZUE 4FTNA 3QQKA 2YACA 2YM3A 3ZO3A 2ZJWA 3VW8A 3EQBA 1G8AA 2X0GA 5J7BA 5DEWA 2ACXA 4WD5A 2H6DA 4QTDA 4FSNA 3L8VA 3FY0A 2HW7A 4LGDA 2XIKA 4H3PA 4PL3A 4UALA 3TCPA 5AR8A 4EOMA 3PY3A 2HCKA 3U55A 3SV0A 3LFBA 2AYPA 4GIHA 4AAAA 4EH7A 4F1MA 1UKIA 5HD4A 3QGYA 2E2BA 5BVDA 2EXCX 3TIYA 4MTAA 5JQ5A 3WF5A 5HKMA 3BI6A 3QTRA 2R64A 2YIYA 2BR1A 5CU6A 3HV4A 5E8UA 1P2AA 2XZSA 4HPUE 3WYXA 5LCKA 1JPAA 3MVJA 5IUIA 4BDKA 3DXNA 2WPAA 3G9LX 2X8EA 3FKLA 1A06A 2VWIA 3IK3A 3VBVA 3QTSA 3RPOA 2CN8A 3HGKA 5AUWA 5HX8A 5JZJA 3DK6A 4NEUA 3PE2A 3V5JA 4LM5A 4LRKA 5CANA 3UZPA 3DJ6A 4EZ7A 4OTWA 4WG4A 5M53A 4NW5A 2C0OA 1O6YA 2VUWA 4I93A 4QMTA 4V01A 4WNKA 4X3FB 4I0TA 4A06A 4Z7GA 5J9LA 5B0XA 4KNBA 1GZKA 2FGIA 2ZV7A 5FGKA 4TN6A 4RIWA 4AN2A 5KUPA 2YWPA 3FYJX 2C4GA 5IUHA 2W9ZB 2PMLX 3PJ3A 5EI8A 5F20A 5IF1A 4XG9A 5L4QA 4DBNA 2VO3A 1Q8WA 3R7IA 3UP7A 2WMTA 4GRBA 3FUPA 3NLBA 3W18A 2JKMA 5BQ0A 3OOGA 1ERKA 5DYJA 4FG9A 3ZC6A 2YABA 4BKZA 2ZDUA 4I24A 4MAOA 3Q9XA 3WIGA 4DH1A 2DWBA 3KC3A 4AE6A 2X6EA 2OU7A 3UO6A 4ONAA 3FYKX 4FOBA 4XBRA 3G51A 2YDIA 5FG8A 3UBDA 4A4LA 4O83A 3VBQA 3SG9A 1JBPE 3OTUA 1YDRE 2PZIA 3HV6A 2W5HA 4TWCA 5TOZA 4ZZOA 3AC5A 5AFVA 1LEZA 3NYVA 4OAVB 3HMNA 2V7OA 3EKNA 3KL8A 5HQ0A 3RP9A 4Y73A 4M12A 2HZ4A 3CTJA 2ITYA 2QOKA 3G90X 4C0TA 4IZAA 4Z16A 3ZM9A 5EKNA 2B1PA 2ITTA 5KHWA 5BMMA 3M2WA 3OY3A 2JC6A 3ULZA 3ZLXA 1W7HA 4BDHA 5JKGA 4DAWA 4TY1A 5E92A 3F5PA 2WFYA 4FTOA 3WZKA 3I60A 3UYSA 2OIBA 3UOJA 3QCSA 3DA6A 1WBVA 2VGOA 3R02A 4P2KA 1YXXA 4QP8A 4AW0A 4E6CA 3RBWA 4EOKA 1U54B 2PE0A 4KIKA 4JG6A 3SRVB 3DJ5A 4EH2A 4O81A 3QRJA 1LP4A 4PNIA 2PUNA 4ZY4A 1ZMWA 3MFUA 3WBLA 4DGGA 5L8LA 3DNDA 4CMOA 4WSYA 3D5VA 4I6QA 4QP6A 4EK6A 3AD6A 3ORZA 1ZWSA 5CQUA 5D12A 4F08A 1Q8YA 4LYNA 1U5QA 2J0KA 2Q0NA 3QQJA 2OI4X 4PY1A 4QMVA 4FI1A 1PMEA 4J7BA 2QU6A 4U8ZA 4O7NA 2BHHA 2GMXA 3VJNA 4IVAA 5I9ZA 1AGWA 4DLIA 3PYYA 2WMXA 3QF9A 3O96A 4GFOA 3HUBA 5ETAA 5FDXA 4DCAA 4M7IA 4PMPA 3WOWA 5CWZA 4OTPA 3DOGA 3GC0A 5GZ9A 1UU7A 3U87A 4L3JA 3LQ3A 5HU3A 4PPCA 3TKHA 5FTQA 4GVJA 4D0XA 2F57A 4NCTC 4ZK5A 5M51A 3UQFA 4KBAA 2CMWA 3FY2A 5HO7A 2QVSE 4JL9A 4EJ7A 1MRUA 4RX8A 3UIBA 4K77A 4QMSA 3MA3A 3QXOA 5FQDC 5K0KA 3UPXA 3ZRMA 4EKLA 5IA0A 1XH6A 3WE4A 4AOIA 4LL5A 4CFFA 1NVRA 2UW5A 3Q6UA 4TWOA 3W32A 2OW3A 1Q41A 3A7JA 3T9TA 2GCDA 4IDVA 1FVRA 2XJ2A 3OHTA 2JIIA 4GKIA 3IQ7A 4KBCA 2XRUA 4FKWA 2F9GA 3L8SA 5K9IA 3G33A 3CGFA 1Y6BA 3FQHA 3MWUA 4QTBA 4IZ7A 3OOMA 3FAAA 3HMMA 2OJFE 3TI1A 3DY7A 5G6VA 3VS1A 3N4VA 4UMUA 1K9AA 2IO6A 3KULA 3RHXA 3F3WA 3T9IA 4FYOA 3UOHA 5A4TA 1QL6A 3UVQA 3DDQA 1VZOA 4D4VA 1WCCA 3RZBA 2ZM4A 2YM8A 4FKPA 3IGGA 2VX1A 3QQGA 5I9YA 3KGAA 2I6LA 5DNRA 4J96A 3NIEA 4NW6A 1QMZA 4IX4A 3R7VA 3SOAA 5H9BA 1OL2A 5A4LA 4MF1A 2VZ6A 1E1VA 3R83A 4M69B 5BYLA 2JDVA 4FICA 5JFSA 4I5PA 1JKKA 4LMUA 4BDGA 2XKCA 1OPJA 1VJYA 1XKKA 2JD5A 4FSWA 4FEQA 4RVTA 4XCUA 2GNIA 4B7TA 2XJ1A 2YCQA 3FXXA 3EQDA 2WMVA 4RQKA 3ULIA 5HORA 4OBQA 3U6IA 4CRLA 1Q61A 4L53A 2IG7A 1M7QA 1RJBA 4DCEA 4XLIA 4G16A 4TYHB 4CZYB 4BTKA 4EWHA 4JQEA 3FSKA 5DT0A 5IQFA 2WQEA 3QYWA 2W1DA 4FTCA 1JKLA 3NUNA 4BBMA 1GJOA 4IXPA 1B39A 2R3FA 2VTIA 2YLFA 3C0GA 3LMGA 3MY0A 4NM5A 4R3PA 4WA9A 4ZAUA 5AR5A 1W98A 4E4MA 3PJCA 4FT5A 2O8YA 1OBGA 3ZDIA 3OZ6A 4YJSA 2XH5A 3TJCA 4R1YA 2WMRA 1BX6A 2BRHA 4JDJA 1ZYCA 5FXSA 4U41A 4KAOA 4NKSA 4BCGA 4G17A 4ACHA 1CM8A 3MY1A 3QX2A 2R3OA 2O3PA 2RKUA 2ITNA 3JY0A 4IAIA 2H96A 3Q6WA 4AFEA 3NNXA 4HCTA 3EHAA 4HVSA 1YWVA 3NZ0A 4IW0A 1R78A 3DAJA 5EK7A 1X8BA 4FKOA 3MBLA 1ZYLA 2Z60A 4O0YA 4QMLA 4B4LA 5D11A 1SM2A 4HGLA 1MRYA 4RJ7A 4UY9A 4ZIMA 4QMXA 3UNJA 5T68A 3ZO1A 3NMUF 3QCYA 5CEMA 2JITA 2CKPA 3OFMA 4RIYB 3GUBA 5ETFA 5CEKA 4U81A 4EHEA 5FRIA 2XA4A 1UNLA 1WBOA 4RZVA 2HWPA 2YCSA 4C3FA 5HICA 4RGJA 4FIJA 1Z57A 2REIA 5IMEA 3ZCLA 3E7OA 5LMAA 3VUDA 3AC2A 3DZQA 4FKSA 4NL0A 4TTHB 2HZNA 4H39A 4B6LA 4N6YA 2XNBA 4IWOA 3ZLWA 3LMIA 3FHRA 4EONA 2YIXA 3BHUA 4FEUA 2XKFA 3MV5A 5HCXA 4EYMA 4AXAA 3BLQA 4FIEA 3C5UA 1XJDA 4RA5A 3FJQE 3FZSA 4J97A 5CU0A 4CZUA 4C62A 4FT0A 2W1GA 3LHJA 3P79A 3W33A 5IQCA 3KMUA 3HV5A 2BHEA 3ID6C 1PRYA 3F7ZA 4CMUA 1Q4LA 4I6HA 3MPTA 4UEUA 1LR4A 1WVYA 2YDKA 3AOXA 3CY2A 3OP5A 2IW9A 4GSBA 3R7EA 3BGZA 4I23A 4QYFA 3RM7A 4UWYA 2WTVA 3VN9A 4BRXA 4O7ZA 3P7BA 4QP2A 4TNDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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