The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
FYN
|
| publication title |
Solution structure and peptide binding of the SH3 domain from human Fyn.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
9
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1996-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9H A; 3REA B; 1AWJ A; 2AZV A; 2CT4 A; 2VKN A; 4ZNX A; 4R0K A; 2KRO A; 4LNP A; 2RQU A; 2I0N A; 1A0N B; 1OPL A; 2DRM A; 2RMO A; 1QCF A; 3RBB B; 3I35 A; 1TG0 A; 2FPF A; 2AZS A; 2M51 A; 3LH5 A; 2KT8 A; 3H0I A; 2LQN A; 4CC4 B; 1MV3 A; 3I5S A; 3VS1 A; 4HVU A; 1AZE A; 1SSH A; 1AWO A; 1M8M A; 2CH4 W; 2A28 A; 4RTT A; 2O88 A; 2MIO A; 1NYG A; 4AG2 C; 2CSQ A; 3M0S A; 2MCN A; 3CQT A; 2KNB B; 2LJ0 A; 2AK5 A; 2F2W A; 1X6B A; 1VA7 A; 2EYZ A; 1UHC A; 2RNA A; 1PNJ A; 3NGP A; 2RPN A; 3KFV A; 4A63 B; 1YWP A; 2D1X A; 3FJ5 A; 2EBP A; 3SHW A; 3UA7 A; 2O31 A; 5FW9 A; 1I0C A; 2JT4 A; 1B3Q A; 4CC2 A; 3PE0 A; 4F17 A; 3TSZ A; 2J6O A; 4OMO A; 4D8K A; 1N5Z A; 4F16 A; 2L3Q A; 4CC7 A; 1T3L A; 1JXO A; 2VWF A; 1CKA A; 1UJY A; 1KSW A; 4RTZ A; 1HSQ A; 2YUP A; 2ED0 A; 2X3W D; 1SPK A; 1SRL A; 1K1Z A; 3EHR A; 2DL8 A; 2CUB A; 4GLM A; 1UG1 A; 2LJ3 A; 2AKL A; 2ED1 A; 1NLO C; 4IIO A; 3SEM A; 1UJ0 A; 1M3C A; 2DRK A; 2V1R A; 4J9C A; 1WXT A; 2XMF A; 2KGT A; 3VS6 A; 1U3O A; 2J05 A; 4Z88 A; 3VS2 A; 4EIK A; 2EPD A; 2OJ2 A; 1WYX A; 4JJB A; 2FO0 A; 1H3H A; 2JM9 A; 2CRE A; 2L2P A; 2LZ6 B; 1OOT A; 4M4Z A; 3EG2 A; 1KIK A; 2NWM A; 5IHN A; 1GCP A; 1AVZ C; 2YUN A; 2FG0 A; 1T0J A; 1Y0M A; 2DYB A; 2KRN A; 1ZLM A; 4J9D A; 1VYU A; 2SRC A; 2DL3 A; 1KJW A; 1WDX A; 4LN2 A; 2JW4 A; 3EHQ A; 1HJD A; 2L3S A; 2DIL A; 2RQT A; 3I9Q A; 5IXB A; 5HCK A; 1ZUY A; 2J6F A; 2H8H A; 2LNH B; 3EG1 A; 2C0T A; 3VS3 A; 2BZ8 A; 2KRM A; 2MOX A; 2CDT A; 3UAT A; 1UFF A; 2YT6 A; 3I5R A; 1MV0 B; 3VRY A; 2C0I A; 1I1J A; 2B86 A; 3VS7 A; 1UUE A; 2W0Z A; 1QWF A; 3H0H A; 2DM1 A; 2HCK A; 2DJQ A; 2RQW A; 2NUZ A; 4JZ4 A; 3EG3 A; 2OI3 A; 1T0H A; 3EG0 A; 1WX6 A; 2CSI A; 1WIE A; 2YUQ A; 1YP5 A; 1IO6 A; 2EYW A; 2EGE A; 2E5K A; 2K3B A; 1YNZ A; 4JJC A; 1NEB A; 4J9E A; 1M3B A; 2KRS A; 5I11 A; 1I07 A; 5GJW B; 4RUG A; 5IXF A; 1M30 A; 1VYV A; 4KRT A; 2D8J A; 2YSQ A; 2GBQ A; 5IHI A; 4K11 A; 1K9A A; 4J9B A; 2CUD A; 1AWW A; 4Z89 A; 1UGV A; 2W10 A; 1E6G A; 1M27 C; 1J3T A; 2KXD A; 1T3S A; 3PVL A; 2LP5 A; 2K79 A; 2EGC A; 4JPB W; 1PRM C; 1SRM A; 1NEG A; 1AD5 A; 4J9G A; 2K2M A; 3ZL7 C; 1WXU A; 2JTE A; 3EGU A; 4F14 A; 1PKS A; 2KEA A; 2P4R A; 2ROL A; 1AZG B; 2BTT A; 3M0R A; 4RTY A; 1UEC A; 3UA6 A; 2DMO A; 2BZX A; 3NPF A; 1LCK A; 2QDL A; 3H41 A; 4HVV A; 1JXM A; 3UF4 A; 2DBK A; 2C0O A; 1TUD A; 4ORZ A; 4Z8A A; 1U5S A; 3PVQ A; 4AFQ C; 1WFW A; 1WI7 A; 1OV3 A; 2YDL A; 2F2V A; 2EGA A; 2KT1 A; 1QWE A; 4OML A; 2LMJ A; 2K9G A; 3THK A; 2DBM A; 2L3P A; 1AEY A; 3A98 A; 1W6X A; 2F2X A; 1CKB A; 2HDA A; 2DL7 A; 1RI9 A; 4AFS C; 1BB9 A; 1MUZ A; 5I22 A; 2V1Q A; 2KBT A; 1YWO A; 4HXJ A; 5IHK A; 1Z9Z A; 2JMC A; 3JV3 A; 2IIM A; 4LUE A; 2DNU A; 1NM7 A; 1ZUU A; 3NMZ C; 1BU1 A; 2HBW A; 1JO8 A; 1VYT A; 2DL4 A; 1ABQ A; 2EW3 A; 1K76 A; 2RN8 A; 1H8K A; 4RTV A; 1PHT A; 2CT3 A; 3R6N A; 4WCI A; 1BK2 A; 2FRW A; 2SEM A; 4IIM A; 2GQI A; 1EFN A; 1NG2 A; 2DA9 A; 1W1F A; 2D0N A; 1Z9Q A; 2EKH A; 2HSP A; 3M0Q A; 1ARK A; 2CH4 A; 2FRY A; 2FEI A; 2DF6 A; 1PRL C; 3QWX X; 4JZ3 A; 5GJV B; 1ZUK A; 4OMN A; 2A08 A; 1V1C A; 2G6F X; 1X6G A; 1UTI A; 3O5Z A; 4QT7 A; 2JM8 A; 4GBQ A; 4AFZ C; 1JU5 C; 2ECZ A; 1QKX A; 3TVT A; 4D8D A; 1GBR A; 2D8H A; 2J6K A; 2LJ1 A; 2LCS A; 5IH2 A; 2O9V A; 2GNC A; 1Y57 A; 2KYM A; 2RQR A; 1YCS B; 1M3A A; 1K4U S; 1E7O A; 5L23 A; 1X27 A; 1X69 A; 4ESR A; 1FMK A; 4RTU A; 1NLP C; 4OMP A; 4J9F A; 1PWT A; 1H92 A; 3GBQ A; 3NHN A; 4X1V A; 2RF0 A; 1X43 A; 1ZBJ A; 3QWY A; 1SHF A; 1RUW A; 1WLP B; 2DLP A; 3REB B; 1GRI A; 1ZSG A; 2JMA A; 4JJD A; 3M0P A; 4OMM A; 3RNJ A; 1UDL A; 1UE9 A; 2DL5 A; 1SHG A; 2JS2 A; 1W70 A; 2L0A A; 2LX7 A; 4J9I A; 1G2B A; 4DEX A; 1OPK A; 2GTO A; 1QLY A; 2RQV A; 2LQW A; 2DX1 A; 1JQQ A; 1E6H A; 2BZY A; 1HD3 A; 1RLQ C; 1AOJ A; 2GGR A; 2YUO A; 1KFZ A; 1WXB A; 2PZ1 A; 1S1N A; 1NYF A; 3VS5 A; 4HCK A; 2PNI A; 2AKK A; 5ECA A; 2K7A A; 4LUD A; 2J7I A; 4HVW A; 2A36 A; 1GFC A; 2ABL A; 1QKW A; 1BBZ A; 1U06 A; 1GCQ C; 1GL5 A; 1SEM A; 2ENM A; 2EQI A; 1OEB A; 2KXC A; 2FPD A; 2PTK A; 4Y92 A; 4AG1 C; 4RTX A; 2JXB A; 1GBQ A; 4OMQ A; 2HEQ A; 2ROT A; 1TUC A; 1PKT A; 1X2Q A; 1YN8 A; 3IQL A; 1WA7 A; 2FPE A; 3C0C A; 2O9S A; 4AFU C; 1FYN A; 3U23 A; 4LE9 A; 5FWC A; 5EC7 A; 1RLP C; 2EYY A; 2O2O A; 3ULR B; 1JEG A; 2KR3 A; 1ZX6 A; 2EVR A; 1AWX A; 3VS0 A; 1G83 A; 2OAW A; 2A37 A; 1CSK A; 2K6D A; 2KE9 A; 2KYB A; 4E6R A; 5FWB A; 3VS4 A; 2GTJ A; 1K0S A; 1X2K A; 1K0X A; 4RTW A; 3M0T A; 1XOV A; 2X3X D; 3M0U A; 2VVK A; 2DE0 X; 3TSW A; 2DVJ A; 1B07 A; 4DEY A; 2J06 A; 1GCQ A; 2EYX A; 1GFD A; 2ESW A; 3VRZ A; 4FSS A; 2JS0 A; 4CC3 A; 1ABO A; 3H0F A; 2M0Y A; 1UHF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J9H A; 2RJE A; 2XG8 D; 2CT4 A; 2EJF A; 1BI0 A; 5I21 A; 3OMC A; 1IGU A; 4C8Q B; 3CD6 A; 4IUT A; 4DBQ A; 2DRM A; 3HHT B; 1TG0 A; 2FPF A; 4J6W A; 2AZS A; 3HRU A; 2KT8 A; 2CGH A; 5CKF A; 4JS4 A; 1D0X A; 3HFO A; 1MV3 A; 1UGQ B; 2QQ9 A; 1IRE B; 3VS1 A; 3JCM J; 1AZE A; 1AWO A; 4PJO G; 3QZ5 B; 1NYG A; 3M0S A; 2MCN A; 5FRN A; 3CCV T; 4HA8 A; 2KNB B; 3OYC A; 2AK5 A; 1TU0 B; 1UHC A; 3CBM A; 3KFV A; 2JTF A; 1YWP A; 1FX7 A; 3UA7 A; 4KGV B; 2YHT A; 4M75 D; 1D3B A; 1I0C A; 4CC2 A; 1Y96 B; 2EJ9 A; 1YJW Q; 2J6O A; 3SWN A; 2L3Q A; 4CC7 A; 1T3L A; 2YLB A; 1JXO A; 3M55 A; 5GAM g; 4FU6 A; 2RJF A; 4C0D C; 5LJ5 e; 1UJY A; 1VQP T; 1KSW A; 2PUK B; 2QXF A; 3X28 B; 3JCM b; 2OTJ T; 3P8H A; 4ZN1 A; 1UG1 A; 2LJ3 A; 2AKL A; 3M9Q A; 3OS0 A; 3OYH A; 4PJO C; 1OU9 A; 4X34 A; 1NLO C; 3EFO A; 4OB3 B; 1UJ0 A; 1M3C A; 2DRK A; 2V1R A; 2V8K A; 4J9C A; 2XMF A; 2E10 A; 3VS2 A; 4DBF A; 4EIK A; 2OJ2 A; 2IVW A; 1WYX A; 3CC2 T; 1OX8 A; 3CCL A; 5GAO l; 4PJO F; 3CCR Q; 2LRQ A; 2CKK A; 1VQ4 Q; 1GCP A; 4Y91 A; 4OGC A; 1T0J A; 3V7R A; 3R6O A; 5AT1 B; 3DB4 A; 1D0Z A; 4F7U G; 4LN2 A; 5IAY A; 2DTO A; 2L3S A; 5LJ3 j; 4L6V 5; 2DIL A; 4MZT A; 4PJO A; 5GAM e; 3LGF A; 3S3M A; 2J6F A; 2H8H A; 3EG1 A; 5GAO r; 4LDW A; 2KRM A; 2MOX A; 1XTD A; 3EGX A; 4IKF A; 1WQW A; 4PJL A; 2JTM A; 3UAT A; 1N8R U; 1TUG B; 3JB9 G; 2YT6 A; 1VQK A; 1IHW A; 1MV0 B; 3VRY A; 2FHD A; 3I55 T; 5A0L A; 4P5N A; 1R77 A; 4BE0 A; 1UUE A; 2VYT A; 2DM1 A; 3QO3 A; 2XIC A; 4C0Z A; 1N9R A; 3EG3 A; 2X9H A; 1RAC B; 1NJI R; 1T0H A; 4FW1 A; 3X20 B; 5KE2 A; 2DO3 A; 2CSI A; 1WIE A; 2AT1 B; 2GFA A; 1TOV A; 5GAO q; 1X01 A; 2E5K A; 2R58 A; 3I56 T; 2FYK A; 5GJW B; 5IXF A; 3M4Y A; 2EQU A; 4KRT A; 3C4S A; 1LJO A; 2DAQ A; 3L1A A; 2L5Q A; 3NFC A; 4Z02 A; 1N8R C; 5IHI A; 3J81 E; 1K9A A; 4F7U F; 2W10 A; 3FJP A; 4IUU A; 5KCH A; 1T3S A; 3CCQ Q; 2LP5 A; 4ZGD B; 2FZC B; 1SRM A; 5DY9 A; 3OYN A; 2K2M A; 3H9N A; 4LD6 A; 3G71 Q; 5GAN j; 1C1A A; 3QZ9 B; 3EGU A; 2RHU A; 3JB9 F; 4F7U A; 2KEA A; 1RAD B; 2ROL A; 1RAG B; 1BCM A; 4RTY A; 2BZX A; 1OUL A; 4QW2 A; 3GF5 A; 3UT1 A; 3QII A; 3RUX A; 1OV3 A; 2YDL A; 2F2V A; 1ZHI A; 2PVG B; 1QWE A; 4OML A; 4R56 A; 2DBM A; 2GQV A; 2E6Z A; 5C0M A; 3JB9 H; 4JJN K; 2DET A; 1IRX A; 3P8B B; 1CKB A; 1D0Y A; 5LJ3 g; 1G3S A; 4AFS C; 4FCY A; 1QVF S; 1N6A A; 1D3B B; 1MUZ A; 1N27 A; 3GIB A; 4HXJ A; 1Z9Z A; 4M77 D; 2XU8 A; 4LUE A; 3DLL A; 1NM7 A; 4QQG A; 1VQ9 A; 4JLG A; 2NUT A; 4XU1 A; 3NMZ C; 1BU1 A; 2QG9 B; 2BUD A; 1ZSZ C; 3M59 A; 2DL4 A; 4Y28 E; 4HCZ A; 4E7J A; 2RN8 A; 4FT4 A; 4XTY A; 1H8K A; 2DD5 A; 4BD3 A; 4WCI A; 1BK2 A; 2FRW A; 3LWI A; 2X4W A; 5CR2 A; 2GQI A; 4FL6 A; 1TS9 A; 2HSP A; 3EFO B; 3M0Q A; 3V7C A; 2HSE B; 3CCR A; 3QWX X; 1PM3 A; 3G4S T; 4M7D B; 4XAX B; 1N8R R; 2QA4 Q; 1X6G A; 4NOY A; 4J7F A; 2JNG A; 3LWH A; 1UTI A; 4V2S A; 1D1A A; 4GBQ A; 4X9C A; 5GMK e; 4M77 E; 1K8A U; 1JJ2 P; 3TVT A; 4M75 F; 2DTH A; 1ZSZ A; 1M1G A; 3C95 A; 2J6K A; 3CXC A; 3A8O B; 3GNF B; 2GNC A; 3CCU T; 1Y57 A; 1VQ7 A; 1YCS B; 1M3A A; 4KUD K; 4PJN A; 5L23 A; 2EWN A; 4ESR A; 3RR6 A; 4OGE A; 1VQN Q; 4RTU A; 1NLP C; 4J9F A; 1V76 A; 3GBQ A; 3NHN A; 5FU7 C; 2RF0 A; 2RO0 A; 3EGX B; 3OA6 A; 4C92 D; 2DLP A; 1GRI A; 2P0Q A; 1M2V B; 1K8A C; 1KC8 U; 1R0C B; 2L0A A; 1YBY A; 1G2B A; 1VIE A; 2CP3 A; 4DEX A; 3T9N A; 2GTO A; 1VQ5 Q; 1WHL A; 3CMA T; 4JDS A; 1RLQ C; 2YXY A; 4ELZ C; 2OTL T; 2YUO A; 1VQL Q; 2DZC A; 3SB2 A; 2AKK A; 3EH1 A; 3FEO A; 1K73 C; 5ECA A; 2K7A A; 1GXI E; 1VQ6 Q; 4A4K A; 1HK9 A; 1YI2 T; 4XU2 A; 3OYB A; 3HP9 A; 3QSU A; 2F5K A; 3MEU A; 5EG2 A; 3CCE Q; 1KD1 C; 2QAS A; 1GCQ C; 3CCV A; 2LC4 A; 1SEM A; 2ENM A; 2ZPG B; 4C92 E; 2KXC A; 4Y92 A; 3MEV A; 3HRS A; 3QXE B; 4AG1 C; 1Y71 A; 5KYX A; 5A0D A; 1KC8 C; 3KBG A; 2VXE A; 2ROT A; 1TUC A; 1PKT A; 2X4J A; 3IQL A; 2FPE A; 1SF9 A; 2O9S A; 3U23 A; 4LE9 A; 3JRZ A; 2DXU A; 2V8I A; 3CD6 Q; 1JEG A; 3VS0 A; 5KYW A; 2MMP A; 1TTH B; 2OAW A; 2RI5 A; 3G7Z A; 2KYB A; 1C0M A; 3F70 A; 1Y7X A; 2FL7 A; 2GTJ A; 2HKN A; 3KUF A; 1VQP A; 4M7D D; 1K0S A; 4RTW A; 1XOV A; 4PJM A; 2HMA A; 1EZZ B; 3M0U A; 1Y07 A; 2EJG A; 2DE0 X; 3QBY A; 3TSW A; 2OTJ A; 1GCQ A; 1I5L A; 3BDL A; 1WZO A; 2QQS A; 3LLR A; 4M78 C; 4OP0 A; 2QGF B; 2QQB A; 3OB9 A; 3H0F A; 4M77 G; 1Q7Y C; 2LVM A; 3BY7 A; 3FRN A; 4JLI A; 1NE8 A; 3A5Z B; 3CC2 A; 1RAB B; 1WJQ A; 4A4E A; 2EFI A; 5LJ5 j; 1WHM A; 2RJD A; 3CC7 T; 4CC4 B; 3I5S A; 1R8O B; 2QGG A; 1SSH A; 2A28 A; 2O88 A; 4AG2 C; 1Q95 G; 1VQM T; 1X6B A; 4M78 A; 1VA7 A; 1G3Y A; 3CC4 T; 1I4K 1; 2RPN A; 2VGM A; 1VUB A; 2EBP A; 4PJJ A; 2O31 A; 1M90 U; 3ER0 A; 1B34 A; 3TSZ A; 3CCL Q; 3AHU A; 3I55 A; 1UGS B; 1M9S A; 2X4Y A; 1I81 A; 3CEY A; 4XTU A; 1JB0 E; 3LW5 E; 1ZSZ B; 1EIF A; 4B9X A; 1S72 T; 1QW1 A; 4M77 F; 1JJ2 S; 3A8H B; 2GCX A; 2X3W D; 2F5T X; 1K1Z A; 3EHR A; 4C5H A; 2CUB A; 4M7A C; 5GAM j; 2M0O A; 1DJ7 B; 4PKC C; 4C92 G; 4IIO A; 3L2W A; 1Q82 U; 1OI1 A; 2KY9 A; 4EMK C; 3V8J A; 1WXT A; 1P92 A; 2YRD A; 3VS6 A; 4Z88 A; 5GAO p; 3EFR A; 1YJN T; 2EPD A; 2V26 A; 1H3H A; 1VQK Q; 2JM9 A; 2CRE A; 3OS2 A; 1KIK A; 2NWM A; 5LL6 S; 1AVZ C; 2HKQ B; 2IPO B; 2YUN A; 3CPW A; 1D1B A; 2DYB A; 1VYU A; 1M1K U; 1VQ6 A; 2CZ6 B; 1KJW A; 1WDX A; 3BFM A; 4E7H A; 2JW4 A; 3EHQ A; 4KUL A; 2RJC A; 1HJD A; 1PSE A; 4IUQ A; 5GAO m; 3CCE A; 3CCJ T; 2YRV A; 4FYW B; 4EMK A; 2C0T A; 2E64 A; 1N9S A; 5FU7 B; 2CDT A; 2COY A; 1WQ7 A; 5KE3 A; 1NJI U; 5LJ5 g; 8AT1 B; 3I5R A; 2C0I A; 3EH2 A; 1I1J A; 3VS7 A; 1WGS A; 2DJQ A; 3M4G A; 2DFU A; 2E12 A; 3SWN C; 4C92 F; 1KQ2 A; 2NUZ A; 4JZ4 A; 2NUP A; 2OI3 A; 3G6E T; 1M1K C; 2F1L A; 3QHS A; 1YIJ Q; 4E7L A; 1PD0 A; 5CAI A; 5IT9 E; 1M4Z A; 4C0G A; 2HZY A; 1YP5 A; 3MKD A; 2R5A A; 1IO6 A; 2EYW A; 2EGE A; 1YNZ A; 1NEB A; 3HRT A; 2KRS A; 1I07 A; 4RUG A; 2RD1 A; 1YIT A; 2CZ0 B; 3UPU A; 1NJI C; 4Z89 A; 4PLI A; 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