The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PEG B; 1DO7 A; 5EU2 A; 3ONZ B; 1YG5 A; 1JP6 A; 2Z6N B; 1EW6 A; 1LFT B; 1YEN B; 3GOU A; 1A3O B; 2PGH B; 1Q1F A; 3NMM B; 2FRJ X; 3HYU B; 1J52 A; 1JPB A; 1HBR B; 3ORD A; 1ECD A; 4NXC A; 1Y8H B; 5B84 A; 4MQH B; 3GQR A; 1URV A; 4MQC A; 7HBI A; 1COH A; 1MOH A; 1T1N A; 2LH2 A; 1HDS B; 4DWT A; 1BUW A; 1JZK A; 2V1F A; 3ECZ A; 1CLS B; 1LH6 A; 3HRW B; 2DHB B; 1FN3 B; 2ZLU A; 2SPN A; 1O1N A; 2FRK X; 1KFR A; 4O1T A; 1MBN A; 3UH3 A; 1XZ2 A; 2MGG A; 3PIA B; 3R0G A; 1O1I B; 4MQK A; 3OO5 B; 1OFJ A; 4TWU A; 3H57 A; 1CBM A; 3PT8 B; 2W31 A; 1HDB B; 2DN3 B; 4L7Y A; 5CNF A; 1CMY A; 4ESA B; 1Y0W B; 1G0B B; 2GTL D; 3ECL A; 1QI8 A; 2G12 A; 5EQM A; 1NEJ B; 1Y8W B; 3WCW C; 2HHE B; 1YZI A; 3D17 A; 3UHV A; 2ZFO B; 1GVH A; 1HBG A; 1MBD A; 1NZ5 A; 1YDZ A; 2D2M D; 3A5G A; 1HCO A; 3GKV B; 4UZV A; 1W92 A; 4X0L B; 3IC0 B; 3ZJM A; 5E83 B; 1QSH A; 3UH7 A; 1X9F B; 1A6N A; 1YIH A; 3EU1 A; 1RVW A; 4L2M A; 1QPW A; 5EV5 A; 2RI4 A; 3G4W A; 2E2Y A; 1Y8K B; 1RQ3 A; 2AUQ A; 5HBI A; 3ZJI A; 3ODQ A; 1J40 A; 3GK9 A; 1Y7C B; 2BLJ M; 5KER A; 2LH5 A; 1V5H A; 1Y31 B; 1J7W B; 2DN2 A; 3D1K A; 2HBC B; 4MPM A; 4KMV A; 1NS9 B; 2MGL A; 3S65 A; 1JY7 A; 3BOM B; 1OJ6 A; 1BZZ A; 3LQD A; 2MYE A; 1EBC A; 1Y8I A; 2FAM A; 1GDJ A; 5ILM A; 2NRM A; 1HGC A; 3AT5 A; 1MTI A; 2VYY A; 4B4Y A; 1N9H A; 2SPO A; 1Y01 B; 3WFU A; 1MYI A; 2Z6T A; 2H35 B; 1LJW A; 2DXM B; 4M4B A; 1C7B A; 3GQP B; 1AZI A; 1THB A; 5EUI A; 1C7D B; 1J41 B; 5AB8 A; 2ZFB B; 2V1J A; 3PI3 A; 1Y4F B; 1MNK A; 1XY0 A; 3LR7 A; 5KDQ A; 4BJA A; 3G53 A; 1N9X A; 4N8T B; 4ROL A; 2W72 B; 3PI1 A; 4IRO B; 3QJC A; 3VRE B; 1YEV B; 4UUR A; 2GL3 A; 2ZS1 B; 1VXH A; 3P5Q A; 3WR1 A; 5JGG A; 3A5A A; 1F65 A; 5E29 A; 1NS6 A; 2HBF B; 1XQ5 A; 1J7Y B; 1H97 A; 1DKE B; 1GJN A; 1LFQ B; 2V1G A; 4LPI A; 1LFY A; 5D1V A; 3WCU C; 1YIE A; 1J3Z B; 1C40 A; 2HHB A; 1G09 A; 3BJ3 A; 2BLI A; 3QZX A; 1QXE B; 1LH2 A; 3LB2 A; 1MWC A; 3DHR B; 1PBX B; 2H8D B; 1NGK A; 1O16 A; 4MQI B; 111M A; 2ZSS A; 3S66 B; 1YFF B; 2LH7 A; 3AG0 A; 4GZG A; 4DC8 A; 1RQ4 A; 3QJE B; 3UHI A; 5AZQ A; 3LB3 A; 3AQ6 A; 2ZT2 A; 3UHQ A; 2R4X A; 1SDL A; 1GCW A; 1SHR A; 4PQB A; 1HAC A; 1Y46 A; 2GTL B; 3OZV A; 3HXN B; 2C0K A; 3ZJH A; 4KMW A; 1FSX B; 5CNE A; 1YCA A; 1DO1 A; 2ZLV A; 1A3N B; 2D2M C; 4VHB A; 3UH6 A; 2DC3 A; 1SDK B; 1UX9 A; 1N9I A; 1A0Z B; 3D1A A; 4O35 A; 1WVP A; 2YRS A; 4NI1 A; 1Y7Z A; 2MB5 A; 3PT7 B; 3VRF B; 2MYC A; 2MGF A; 3ED9 A; 1MYM A; 4TYX A; 4MXK A; 1B86 A; 1A0U A; 3UGY A; 3DHT A; 1NIH B; 1Y83 A; 2QU0 A; 5HLX A; 1FAW B; 1CG5 B; 1HSY A; 3A59 A; 1YGF A; 3V2Z A; 1Y0A A; 3SDH A; 104M A; 1HHO B; 2ZSQ A; 1HLM A; 1A9W E; 3OO4 B; 103M A; 3S1J A; 1VWT A; 1G0A A; 3HC9 A; 3OJ1 A; 3O7N A; 1RTX A; 1XZU B; 1HBS B; 1BBB A; 1BZ0 B; 1HAB A; 2QMB B; 3M3A A; 3HF4 B; 1CP5 A; 1KD2 B; 4HRT A; 2HBS B; 3TM3 A; 3NL7 B; 5HY8 A; 1YHU A; 1YHE B; 4HHB A; 1AJ9 A; 1CQ2 A; 3OK5 A; 5CMV A; 1JL7 A; 3FH9 B; 4DWU A; 5JDO E; 1O1L A; 1Y2Z A; 4N7N A; 3BCQ B; 1VXG A; 1F63 A; 1S5X B; 5E6E A; 2NSR A; 2MYD A; 2V1I A; 1Y22 B; 1XYE A; 1O1K A; 2BWH A; 1LFL A; 1HDA A; 2RAO A; 1BIJ B; 1HGB A; 1YOH A; 1JEB A; 3GOU B; 2WTH A; 3PI9 B; 1XZ7 B; 3GQG B; 1LH7 A; 4OF9 A; 4MAX A; 1FHJ B; 4IT8 A; 3GQR B; 1XZV A; 4M4A A; 1DXV A; 4TWV A; 3UHG A; 1T1N B; 1V75 A; 2ZLW A; 1BUW B; 1YMC A; 1CH3 A; 4F6G A; 1RTE A; 2W6W A; 2O5L X; 3WCT D; 1OR6 A; 2QSS B; 2Z6S A; 1YVQ A; 2GRZ A; 3NFE A; 1DWR A; 1C7C B; 1I3E A; 1BZP A; 1YEU B; 3WCU A; 1MLO A; 1PMB A; 3CY5 B; 2HZ2 A; 1FLP A; 1Y5F A; 1Y7D B; 1XZ4 A; 5CNG A; 3EOK A; 4L7Y B; 1CMY B; 1JW8 A; 2HHD B; 1SPE A; 2H8F A; 4JAC A; 2BMM A; 1BAB B; 1CBL A; 2M6Z B; 1NZ3 A; 4XS0 A; 1G9V A; 4F6B A; 2QSP A; 2KSC A; 1Y4R A; 3D17 B; 1V4W A; 2B7H B; 2O5B X; 4NS2 A; 4WJG A; 4C44 A; 4N7O B; 3MKB A; 3BA2 A; 1Y5J A; 3SZK A; 1LHT A; 1LH1 A; 1R1X A; 5C6E B; 1QSH B; 4U8U A; 3DUT A; 1A6G A; 4YU3 B; 2ZLT A; 1Z8U B; 1YIH B; 3EU1 B; 5EE4 C; 1MLR A; 5ILE A; 3K8B B; 2GKN A; 1TES A; 2RI4 B; 1QSI B; 1ABS A; 1K1K A; 2IG3 A; 2GNV A; 3ODQ B; 3WCV D; 5IKS A; 3W4U A; 1O1O A; 2R80 A; 1BVC A; 3UHC A; 1YHU D; 3CIU A; 1S56 A; 4F69 A; 4MU5 A; 1O1P B; 1JY7 B; 3UBV A; 1DTM A; 5JDO C; 4PQ6 A; 1FDH G; 1Y8I B; 2ZS1 D; 2GRF A; 4MQJ B; 3AQ8 A; 1O1M B; 1HGC B; 1Y4V B; 1MLK A; 1O1J A; 4ODC B; 3ZJR A; 1YGD A; 3B75 A; 3D4X A; 1Y35 B; 2LH6 A; 2D2N C; 1LJW B; 4H0B A; 1THB B; 5EUI B; 1NXF A; 4F6F A; 2D5Z B; 1OBM A; 3QM8 A; 1NQP B; 1Y0C A; 6HBW A; 1MLM A; 2NX0 A; 2O5O X; 1MLS A; 1YH9 B; 2BLH A; 4JYQ A; 1XY0 B; 5KDQ B; 2QFK A; 1MLU A; 1MGN A; 1YVT B; 1S6A A; 5CNC A; 3O89 A; 1UC3 A; 1WLA A; 106M A; 3QJC B; 1LH3 A; 102M A; 1ABY B; 4FC3 B; 4F4O A; 3P5Q B; 1CO8 A; 3WR1 B; 1R1Y A; 1MLH A; 3PEL A; 3QJD A; 2ZFO C; 3IC2 B; 2D6C A; 1CH1 A; 2LHB A; 2CMM A; 4N7P B; 1XQ5 B; 4F6I A; 2FAL A; 4DC7 A; 2MBW A; 4NXA A; 3A0G A; 2R50 A; 1RPS A; 3WCT B; 1X9F C; 2ZS0 D; 1YIE B; 4MBN A; 1JF3 A; 1GZX A; 3WTG B; 1Y7G B; 2QRW A; 2ZLX A; 1TU9 A; 3QM5 A; 1DWS A; 2OH9 A; 1RQ4 B; 5HLQ A; 1X3K A; 4H2L B; 1SPG A; 2AUR A; 3NML A; 1SDL B; 1BZ1 A; 1SHR B; 3LR9 A; 1HAC B; 1GBV A; 1DO4 A; 1MBA A; 3KUO A; 1MBS A; 1V4U A; 1HBB A; 3IA3 B; 5F2A A; 1G08 A; 2ZLV B; 3G4R A; 107M A; 5F0B A; 3QJB A; 1Y09 A; 1K0Y A; 1MLJ A; 1MOB A; 1ASH A; 2NSS A; 3D1A B; 4XDI A; 2AA1 A; 3MJU B; 1N9F A; 2YRS B; 1M9P A; 1DXT A; 3QM6 A; 1Y4P A; 1MYF A; 3ZJJ A; 1XZ5 A; 1V4X A; 1JP8 A; 1H1X A; 1SI4 B; 1RQA B; 3R5I A; 1Y83 B; 2O5S X; 3ARL A; 1DWT A; 2MGH A; 1YGF B; 2SPL A; 2Z6N A; 2R4Z A; 1YEN A; 1IWH B; 3ZJQ A; 1A3O A; 3HYU A; 1G0A B; 1OUT B; 1Y4Q A; 2O58 X; 1HBR A; 5SW7 B; 5HLU A; 1YE0 B; 1HAB B; 1Y8H A; 1S69 A; 2EKT A; 3LB4 A; 3WCV B; 1HGA B; 2VM0 A; 5HY8 B; 3RGK A; 3BJ1 A; 2W72 C; 1MNO A; 1YHU B; 2NRL A; 2ZSO A; 2VRY A; 1HDS A; 4NK2 A; 2ZS1 C; 3HRW A; 1UIW B; 1VXB A; 2MHB A; 1O1L B; 4N7N B; 1MTJ A; 3IXF A; 3GLN A; 3KUN A; 2D2N A; 1O1K B; 2HCO B; 4WJG 1; 1QXD B; 4ROM B; 3DR9 A; 3PT8 A; 1HGB B; 1JEB B; 1S0H A; 1LFV B; 1JZM A; 2DN3 A; 1IOP A; 1A01 A; 2OHA A; 3FS4 A; 1Y0D B; 1YE2 B; 1SWM A; 2MGB A; 1VXC A; 2QLS A; 5CHQ A; 1F5P A; 4M4A B; 1NEJ A; 1HBH B; 2D5X A; 2HHE A; 5C6Y A; 2ZLW B; 2ZSR A; 3OGB A; 2OHB A; 1ABW A; 2ZSN A; 3UHT A; 1Y0T A; 2GTL C; 2ZFO A; 2LH3 A; 5HAV A; 1NPG A; 3WFW A; 1BZR A; 2SPM A; 3WCW A; 4MXL A; 1Y45 A; 1NWN A; 3OVU C; 3GKV A; 2EF2 A; 2O5M X; 3IC0 A; 2AV0 A; 2FRI X; 1X9F A; 2MGD A; 3UBC A; 1JF4 A; 1URY A; 2AUP A; 3SDN A; 2G0Z A; 110M A; 3MBA A; 4B3W A; 3RJN B; 3S48 C; 3ECX A; 3UI0 A; 2H8F B; 2ZS0 B; 1MYJ A; 3GYS A; 1AJH A; 3ZJL A; 3UHK A; 1Y7C A; 1G9V B; 3M39 A; 1WMU B; 4OOD A; 2VLX A; 1J7W A; 3V2V A; 1Y4G B; 1HV4 B; 1HBI A; 1I3D A; 1NS9 A; 2V1H A; 3AT6 B; 109M A; 1DXU A; 3UHB A; 2G14 A; 2VYZ A; 1MOC A; 1Y5J B; 1CO9 A; 1ECA A; 2GDM A; 4U8U B; 2DN1 B; 1HJT A; 2ZLT B; 1CH5 A; 3ZJN A; 1IDR A; 3UGZ A; 1GDI A; 2HBE B; 3QQR A; 5EOH A; 3NG6 B; 2EB9 A; 105M A; 3WFT A; 1Y85 A; 1VHB A; 1EBT A; 3WHM B; 3UHX A; 1LA6 B; 2BK9 A; 3W4U B; 3PI8 B; 5CN8 A; 4ZVB A; 1O1O B; 2R80 B; 2XKI A; 1J41 A; 1MYT A; 4G1B A; 3CIU B; 1F5O A; 1Y4F A; 3WCP B; 1MKO A; 2ZST A; 1YG5 B; 4N8T A; 2W72 A; 4IRO A; 4AVE A; 3VRG A; 3QZZ A; 4G51 A; 5EYJ A; 3PI4 A; 1LUE A; 1DXD A; 1A4F A; 3D7O A; 4MQC B; 1COH B; 1YGD B; 1MNH A; 3D4X B; 6HBI A; 2FRF A; 1IT2 A; 1DKE A; 3HHB A; 3QM7 A; 1LFQ A; 1GCV A; 2ZLU B; 4HRR A; 1O1N B; 3TLD A; 1J3Z A; 1VXD A; 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1YEO A; 1L2K A; 1Y22 A; 1KR7 A; 3R5I B; 3AT5 B; 5JOM A; 2EVP A; 1BIJ A; 1UT0 A; 1GBU A; 3UHS A; 3VHB A; 2MGE A; 1Y4Q B; 3PI9 A; 1XZ7 A; 2OLP A; 5CN6 A; 3GQG A; 3GDJ A; 4M4B B; 3UHZ A; 1C7B B; 1FHJ A; 1U7S A; 1Y4B A; 2ZT1 A; 2G3H A; 2BKM A; 4PNJ A; 1YMB A; 3BJ1 B; 112M A; 1MZ0 A; 2GKM A; 4FWX A; 2MHB B; 2BNL A; 3U3E A; 4ROL B; 2QSS A; 4HSW A; 1UVY A; 1XXT A; 1C7C A; 1MLN A; 4ZVA A; 4ILZ A; 2D2N B; 1J3Y A; 1NWI A; 1YEU A; 3EDA A; 1UFP A; 2W6V A; 2WY4 A; 3WCT C; 5JGG B; 3WCU D; 3UHH A; 4WCH D; 3CY5 A; 5E29 B; 1NS6 B; 1Y7D A; 1IBE A; 1S0H B; 1A01 B; 3FS4 B; 2HHD A; 3MYM A; 1LFY B; 2QLS B; 1AJG A; 1C40 B; 1YCB A; 1CG8 A; 108M A; 2HHB B; 4YU4 A; 2D5X B; 1BAB A; 1G09 B; 2M6Z A; 3BJ3 B; 1ABW B; 5EYS A; 1Y0T B; 1MLQ A; 1BJE A; 3WFX A; 1EWA A; 2B7H A; 2VYW A; 4MQG A; 1FCS A; 3WCW B; 1NZ2 A; 1GCW B; 1Y45 B; 4N7O A; 3H58 A; 3KMF C; 1Y46 B; 4FWY A; 1FDH A; 5C6E A; 4U8U D; 4YU3 A; 1J7S A; 3UH5 A; 3ASE A; 1A00 A; 3K8B A; 5EET A; 1QSI A; 3ZJS A; 2XKG A; 4FWZ A; 2G0V A; 3UHD A; 4NI1 B; 1Y7Z B; 5HU6 A; 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