The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKLADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
59
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3HXN A; 1F65 A; 3QM8 A; 3QJD B; 2D2M D; 2HHE B; 1LFZ B; 4MQK B; 3RGK A; 107M A; 1DWR A; 3QM5 A; 2AV3 A; 1MLL A; 3QJE B; 1C7C B; 1Y7C B; 1DXV B; 3ARJ A; 3S66 B; 1HGA B; 1A0U B; 4B4Y A; 1CH4 A; 1CMY B; 3UBV A; 3H57 A; 1QXE B; 2KSC A; 1Y4P B; 3WCV C; 1MTI A; 2FAM A; 1G9V B; 3MOU A; 3EOK B; 5CHQ A; 1DXU B; 3MVC A; 1GZX B; 2HHD B; 2RAO B; 3CIU B; 3ZJI A; 2OIF A; 3D1K A; 1MLK A; 4MQJ A; 1NEJ A; 3E4N A; 1QPW B; 3WCT D; 1MYT A; 3S65 A; 3UGZ A; 1MOH A; 3GQP A; 1VRF A; 3LB1 A; 1YHU D; 1LFY A; 1XQ5 A; 1M6C A; 2R80 B; 3EDB A; 1YVT A; 3EU1 B; 4ROM A; 1THB B; 1LH6 A; 1DLY A; 1QXD A; 2DN2 A; 2ZT0 A; 1DWS A; 2DC3 A; 3K9Z A; 1HBH B; 3UHE A; 1Y4Q B; 2PGH A; 2G0Z A; 3WCP A; 1O1J A; 1GBV A; 1J3Y B; 5C6E A; 1Y5F B; 2MBW A; 1Y5J B; 2VEE A; 1A01 B; 1NIH B; 3G4W A; 1CG5 B; 1YGF B; 4XDI A; 2ZST A; 2BWH A; 1YH9 A; 4F6J A; 1OR6 A; 3FH9 B; 2ZT4 A; 1CBL A; 3MN0 A; 4ROL B; 3W4U B; 2G11 A; 5E29 A; 3WTG A; 1UVY A; 3A9M A; 2DXM B; 1YFF B; 1NZ5 A; 1FSX B; 1UVX A; 3ZJR A; 1G08 B; 1HCO A; 5ILM A; 3NG6 B; 2ZLX B; 4L2M A; 1GLI A; 1YGD B; 1Y0D B; 3G52 A; 2H35 A; 4FWZ A; 3OVU C; 1A6K A; 3DHR A; 1XZ4 B; 1HBA B; 5JGG B; 1RQ4 A; 4KN3 A; 1DKE A; 1OUU B; 3HF4 B; 1Y85 B; 2ZWJ A; 2DN1 B; 3UHX A; 2O5M X; 3ODQ B; 3QJC A; 1BAB A; 1B0B A; 1YG5 A; 2D5Z A; 1XY0 A; 1UIW B; 5ILE A; 1ECN A; 1X3K A; 1V4X A; 2ZS0 C; 3PI8 B; 1Y0W A; 3PIA A; 1Y7G B; 4N8T A; 2VYY A; 2V1G A; 2VM0 A; 2D60 A; 4ZVA A; 4MQH A; 1XZU A; 1URY A; 1CO9 A; 7HBI A; 3QJB B; 3V2Z A; 2XKG A; 2ZLT B; 3A2G A; 1Y46 A; 2ZSX A; 3ZJP A; 1LH2 A; 1KFR A; 1WMU A; 3VAU A; 1RVW A; 2O5O X; 3MKB A; 2D2M A; 1R1Y A; 1UX8 A; 5F2A A; 1YIE A; 3KMF A; 2WTH A; 4MXL A; 4G51 B; 3HRW A; 1J7W A; 2R1H B; 1NZ4 A; 1BVD A; 2BW9 M; 5EYS A; 1RQ3 A; 5EU2 A; 3D1K B; 3AT6 A; 3QM9 A; 1DTI A; 1ABS A; 1Y31 A; 1YCB A; 4MBN A; 1MBD A; 1O1M B; 3SZK B; 3WFX A; 1B86 A; 3WCU D; 1Y45 B; 4F6B A; 4F6G A; 1JWN A; 1OBM A; 2O58 X; 5EUI B; 4WJG A; 1BJE A; 3PT8 A; 4NI0 A; 1LFL A; 3WCT A; 5AZR A; 4DC8 A; 5CN7 A; 3OJ1 A; 2AA1 A; 1YHU A; 3D1A A; 3GKV B; 2PGH B; 1OUT B; 1CH1 A; 1J40 B; 1MNI A; 1RPS A; 3D7O A; 3O7N A; 4NXA A; 4G1V A; 3OK5 A; 4O4Z A; 1Y8I B; 1ECD A; 3QZX A; 5ILP A; 5EE4 C; 1MTJ A; 1DTM A; 4ODC A; 1YH9 B; 3GQG B; 4PQB A; 1M9P A; 1NS9 B; 1Y8H A; 1MNK A; 3UHI A; 1HBS B; 5EET A; 1YEQ A; 1KD2 A; 3WTG B; 3AQ6 A; 1FHJ A; 3QQR A; 111M A; 2ZFO C; 1BIJ B; 2FRF A; 5EOH A; 1V4W B; 3ARK A; 4KMV A; 5AZQ A; 1C7B A; 1Y22 B; 1DO7 A; 2MYA A; 2HBS B; 4C0N A; 1O1L A; 1RQ4 B; 1UC3 A; 2HCO B; 1FAW A; 4U8U C; 1COH A; 3H58 A; 4G1B A; 1DM1 A; 1V4U B; 3B75 A; 1BZ0 B; 2BLI A; 2W6V A; 1BAB B; 1MOA A; 4NI1 A; 2GTL C; 3HHB B; 3AQ7 A; 2AUR A; 2MHB B; 2OH9 A; 3GDJ A; 2RI4 B; 2LH6 A; 3PIA B; 4N8T B; 4F68 A; 2M6Z B; 1HDA A; 4FH6 A; 1S61 A; 1HDB A; 4O2G A; 3AQ9 A; 2ZLW B; 3QJD A; 2O5Q X; 3QZZ A; 5JDO F; 4FC3 B; 2HHE A; 4MQK A; 2MGC A; 1AJ9 B; 3ORD A; 5KKK A; 3DR9 A; 1C7C A; 3S1J A; 1DXV A; 1HBB B; 2QU0 B; 1IOP A; 1VXD A; 3ASE A; 1HGA A; 1A0U A; 3IXF A; 1MLF A; 3MKB B; 3IC2 B; 1ABW B; 1DO3 A; 3UBC A; 1CMY A; 2ZLU A; 3PT7 A; 5M3S A; 1QXE A; 3SDN A; 1DLW A; 1J7W B; 5CN4 A; 1CH2 A; 1Y4P A; 1JF4 A; 3D4X B; 1SDK B; 1G9V A; 1MNJ A; 3EOK A; 2HHD A; 1ECO A; 2RAO A; 3CIU A; 2HZ3 A; 3UHC A; 2LH5 A; 1RQA A; 2WTG A; 4M4B B; 1QPW A; 1HRM A; 1NWN A; 3AQ8 A; 1JEB B; 1Y8W B; 2R80 A; 4F4O B; 2LH1 A; 2HZ2 A; 2Z6N B; 3EU1 A; 1J52 A; 1MWC A; 2R4X A; 1Q1F A; 4MXK A; 1O1K B; 1VXB A; 2AV0 A; 2LH2 A; 1KR7 A; 2ZSY A; 1N9F A; 1HBH A; 2IG3 A; 5CNF A; 1NPG A; 3GOU B; 1HBI A; 1J3Y A; 3G4Y A; 1D8U A; 1X9F C; 1Y5F A; 3ECL A; 3WHM A; 1ITH A; 2EB9 A; 2ZT2 A; 3ZJQ A; 1CG5 A; 1YGF A; 3K8B B; 1Y0T B; 4HSX A; 1BZR A; 2DN3 B; 2GNW A; 1YEO A; 3FH9 A; 4NK2 A; 4ROL A; 3PI4 A; 3W4U A; 2W6W A; 1YEQ B; 1KD2 B; 1GJN A; 5MBN A; 2DXM A; 2ZSR A; 2SPM A; 1YEN B; 1BZZ B; 1HSY A; 1GDK A; 3MBA A; 3PI3 A; 3NG6 A; 1OFK A; 1YGD A; 1Y0D A; 2W72 B; 1GDJ A; 1SWM A; 1RTX A; 5JGG A; 1FAW B; 2MGA A; 1OUU A; 3OZW A; 1K1K B; 3HF4 A; 1IRC A; 1Y8K B; 1Y85 A; 3OZV A; 2DN1 A; 5E83 B; 3WCW B; 1ECA A; 4NI1 B; 1YHE B; 3ODQ A; 2G14 A; 1UIW A; 1YOH A; 1OJ6 A; 5HLQ A; 2QSS B; 2ZLV A; 3PI8 A; 1A9W A; 1HDA B; 1Y7G A; 1YCA A; 4F69 A; 3VRE A; 3QJB A; 1CBM A; 4HSW A; 2OH8 A; 3M3A A; 2ZLT A; 1LH7 A; 2BLH A; 1U7S A; 4MQG B; 2V1H A; 2PEG B; 3ONZ A; 5HU6 B; 3LB3 A; 5E6E B; 1T1N A; 1EBT A; 1O1O B; 1FDH A; 3RJN B; 112M A; 2ZLU B; 3A5A A; 1CQ2 A; 1FN3 B; 3PT7 B; 1XZ2 A; 4G51 A; 2GKN A; 1IWH A; 2R1H A; 2H8F B; 3DHT B; 2ZS1 D; 1UX9 A; 1J3Z B; 3QM6 A; 2R4Z A; 4MAX A; 1MYJ A; 2QMB B; 4AVE A; 1RQA B; 106M A; 2MGG A; 2EKT A; 1OR4 A; 1NAZ A; 1S5Y A; 1Y09 B; 1LH1 A; 1O1M A; 3SZK A; 1EMY A; 1Y45 A; 3G4V A; 1JF3 A; 1HGB A; 5EUI A; 1MBO A; 1YEV B; 1JPB A; 2R4Y A; 3RJ6 A; 1CH9 A; 1LH5 A; 1O1I B; 1MLN A; 3VHB A; 3UHG A; 3WCU B; 1VXF A; 4DWT A; 2VYW A; 1WLA A; 5KDQ B; 1BBB B; 3GKV A; 1NZ3 A; 1OUT A; 5JDO D; 1J40 A; 1Y7Z B; 1JZM A; 3UHU A; 3UGY A; 1I3D A; 4FWY A; 5HBI A; 1MDN A; 2ZSN A; 3WHM B; 2D2N B; 1R1X B; 4U8U D; 3WR1 B; 2GLN A; 1QI8 A; 1Y8I A; 3ZOM A; 4IT8 A; 3BOM B; 1C7D B; 2Z6S A; 3GQG A; 1YEO B; 1GCV B; 3FS4 B; 1NS9 A; 1VXH A; 2BK9 A; 1YE2 B; 3UHS A; 1HBS A; 2GRZ A; 4JYQ A; 1BIJ A; 5EQM A; 1SHR A; 4MBA A; 2MGJ A; 1V4W A; 1YOG A; 3M3B A; 1Y22 A; 2GKM A; 1MKO B; 2Z6T A; 3SDH A; 3UH7 A; 3WCW D; 2HBS A; 1MYH A; 2HHB B; 4NXC A; 2HCO A; 3KUN A; 1M6M A; 1FCS A; 1IBE B; 1Y4G A; 1FSL A; 3ZOL A; 1V4U A; 1SPE A; 1BZ0 A; 1MYI A; 4M4A B; 2VEB A; 3NMM B; 3UHT A; 3HHB A; 3O89 A; 3VRF A; 1VHB A; 2MHB A; 4X0L B; 1CG8 A; 1J41 A; 2RI4 A; 1HLB A; 2ZLV B; 2HBG A; 2FAL A; 2MGI A; 2M6Z A; 1Y4V B; 1NS6 B; 1XZV B; 2ZLW A; 2AUQ A; 1A6N A; 3NML A; 3M38 A; 3A59 B; 3VRE B; 4FC3 A; 3HC9 A; 1A9W E; 1Y7D B; 3WCV B; 3E55 A; 1AJ9 A; 2AUO A; 1J7Y B; 2ZSO A; 1RTE A; 1HBB A; 2QU0 A; 3UHR A; 4NZI A; 1HHO B; 2W6X A; 3ONZ B; 4UZV A; 1TES A; 3IC2 A; 1ABW A; 1T1N B; 3TM3 A; 6HBI A; 4JAC A; 3VRG B; 2MGD A; 4O1T A; 1XZ2 B; 1IWH B; 3ZJM A; 1G0B B; 4PQC A; 5CNB A; 3ZHW A; 3AT5 B; 3D4X A; 3BA2 A; 1SDK A; 1GVH A; 1N9X A; 1CP0 A; 1X9F D; 1MLS A; 1F5P A; 1O1P B; 5CN9 A; 3A0G B; 1S5Y B; 4M4B A; 2ZS1 A; 4QAU A; 3V2V A; 5EV5 A; 2G10 A; 3BJ3 B; 1HGB B; 1JEB A; 1Y8W A; 4F4O A; 1S5X A; 2Z6N A; 4F6D A; 2MGF A; 3P5Q A; 1Y01 B; 2D2M C; 3KMF C; 1LJW B; 1O1K A; 2D2N D; 2ZSZ A; 4UUR A; 4H2L B; 3BJ2 B; 5B85 A; 3HYU A; 3GYS B; 1F5O A; 1A0Z A; 4HRR B; 3GOU A; 1Z8U B; 1N9H A; 1S69 A; 3AG0 A; 101M A; 2MYB A; 1QI8 B; 1XXT A; 2NSR A; 2W31 A; 5HLX A; 3K8B A; 1A00 A; 1Y0T A; 2C0K A; 3GQR A; 1C40 B; 3MYN A; 2B7H A; 1MBA A; 2DN3 A; 3E5I A; 1LFT B; 4TWV A; 4O4T A; 1MLH A; 1S6A A; 2EB8 A; 1CP5 A; 2JHO A; 2W6Y A; 3WCT C; 3PEL B; 4ZVB A; 1SHR B; 1YEN A; 3ZH0 A; 1BZZ A; 3PI2 A; 105M A; 4XS0 B; 1HJT A; 1GCW B; 3IA3 B; 5D5R A; 1YHU C; 3DUT B; 1Y2Z B; 1HBR A; 2AUP A; 2W72 A; 2ZS0 B; 3U3E A; 2MGM A; 1Y4R B; 1DXC A; 2DHB B; 1J3F A; 1Y4G B; 110M A; 1UFJ A; 1K1K A; 1Y8K A; 5HLU A; 5ILR A; 5E83 A; 4IRO A; 3WCW A; 1YHE A; 4B3W A; 4YU4 B; 2GDM A; 2HBF B; 3VRF B; 1HAB B; 4AVD A; 1CG8 B; 1J41 B; 1X46 A; 2QSS A; 4PNJ A; 3WCV D; 1LFV B; 3WI8 A; 109M A; 5HY8 B; 4LPI A; 4MQI B; 5CMV A; 2E2Y A; 1MLJ A; 3EDA A; 2VYZ A; 1SPG A; 3ZJH A; 2EF2 A; 1EW6 A; 3UHY A; 1MLU A; 4MQG A; 3MYM A; 1O1N A; 2MGH A; 1HGC A; 2PEG A; 1V9Q A; 1OFJ A; 108M A; 5HU6 A; 5E6E A; 1JL6 A; 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1A6M A; 2MYC A; 2HHB A; 5CHR A; 2V1J A; 1UT0 A; 1IBE A; 4SDH A; 4IRO B; 2ZSQ A; 4M4A A; 1IDR A; 3NMM A; 4X0L A; 1IRD B; 1Y4V A; 3UHN A; 2ZFB A; 1NS6 A; 1XZV A; 1LA6 B; 3GK9 A; 2OLP A; 3A59 A; 1SPG B; 1Y7D A; 2BNL A; 3WCV A; 1Y5K B; 3HEO A; 1J7Y A; 1MWD A; 5C6Y A; 2V1I A; 1O1N B; 1HGC B; 3WFT A; 3BJ1 B; 1HHO A; 1XZ5 B; 2HBD B; 3A5B A; 3VRG A; 2O5T X; 3OO5 B; 2D6C A; 2EVK A; 3OO4 A; 1G09 B; 1G0B A; 1GBU A; 3GLN A; 1BIN A; 1J7S B; 2MGK A; 3AT5 A; 3ZJJ A; 1DXT B; 4HHB B; 1O1P A; 3A0G A; 1HDS B; 1JP9 A; 1VRE A; 5EE4 D; 1DWT A; 4N7O B; 1LHS A; 3BJ3 A; 1XZ7 A; 1MZ0 A; 1X9F B; 2BLJ M; 1YMB A; 1MYM A; 3LR7 A; 2G0V A; 1A3O B; 3G4Q A; 2ZFO D; 1VXC A; 1LJW A; 2ZSP A; 2V1K A; 1HAC B; 2QLS B; 1JP6 A; 4H2L A; 3BJ2 A; 3GYS A; 3BCQ B; 4HRR A; 3R5I B; 5CN8 A; 1HV4 A; 2LH3 A; 1VWT A; 1CIO A; 4HRT A; 2LH7 A; 4F6F A; 2MGE A; 2D5X A; 1YDZ A; 1V75 B; 1QSI A; 1C40 A; 1EWA A; 3LB4 A; 2GTL D; 1S0H B; 1Y0A A; 103M A; 5SW7 B; 1AZI A; 3CY5 B; 1LFT A; 3MJU B; 1Y4B B; 3QMA A; 1BZP A; 1JY7 B; 1BUW B; 4NS2 A; 3PEL A; 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