1OG0A

Crystal structure of the mutant g226s of the tyrosine-regulated 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from saccharomyces cerevisiae complexed with phenylalanine and manganese
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
352
structure length
344
Chain Sequence
GAEEDVRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDLSIIMRAYLWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTTESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMSVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSVAEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGIPAEGKAGLKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRREVNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, tyrosine-inhibi
publication title Crystal Structure of the Mutant G226S of the Tyrosine-Regulated 3-Deoxy-D-Arabino-Heptulosonate -7-Phosphate Synthase from Saccharomyces Cerevisiae Complexed with Phenylalanine and Manganese
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 126
structure length 344
sequence length 352
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2003-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1og0A00
3LCFA 4IXXA 3TJXA 3TSDA 3CIXA 2DZSA 3W83A 3HMJG 3B06A 1RZMA 5EKYA 3SW6A 4WJEA 2JGQA 2X30A 3CWNA 3A24A 4DO4A 4JS3A 3W9ZA 1T96A 4Q33A 1P1XA 3JR2A 5DCEA 4A22A 2NLIA 3HBLA 3W87A 5HWMA 3PULA 4LTSA 1P4CA 4R33A 3NQFA 2TSYA 4FEZA 1VCFA 1SW3A 1JUEA 1MO0A 3EWZA 3LCLA 3DENA 1YDOA 4BF9A 1Q45A 2Y85A 4M7TA 1BKSA 4UUIA 1TPUA 5AYXA 3NQCA 4LV4A 3B8DA 1VR6A 3BVJA 1WBHA 2BLEA 4TR9A 4Y96A 1G4SA 3STGA 3BG3A 2V2DA 3STFA 4X2RA 4DPQA 3LRLA 3QRHA 1TPEA 3FJLA 2QCDB 3GDLA 4CNOA 2CLKA 1UUMA 3RU6A 4JX5A 3W75A 3ZWTA 4UTLA 5D2YA 4KWWA 4KWVA 3KFTA 1GQNA 2A6NA 3F03K 3EKLA 1VJIA 1GVRA 3C2OA 3Q2DA 2VFGA 1RPXA 5DBUA 3NDOA 5J5DA 5C6MA 3STCA 3O8AA 2X16A 2Y89A 4O8RA 3DFQA 3UY8A 2OT1A 1SSGA 4I7UA 2H90A 3L9CA 4N6EA 4WOQA 3USBA 4IMFA 1NFBA 3FOKA 1MZHA 5D02A 4FX7A 1ZAJA 4AHOA 2VENA 3DFPA 2V0TA 3W2JA 4P61A 1JULA 4J9JA 5BRBA 4BFAA 1V7YA 1HUVA 1WBJA 4LOCA 2YW4A 4JYFA 1ICSA 3M5XA 4UMAA 2QUTA 1H1ZA 3IV3A 2GJLA 1YADA 3NM1A 5CZSA 4XQ6A 3EWUA 7TIMA 3T40A 4GJ1A 1XCFA 1W5PA 2G96A 1GZGA 5SWUA 4EVZA 1WX0A 4FX8A 1GEQA 3KAOA 3NL5A 5F4XA 5KMYA 3SSJA 1TV8A 4IWWA 4JIPA 4MOZA 5LHFA 1FCUA 5FF7A 1FWSA 3NQMA 3P74A 3MP5A 1MEIA 3W1XA 1DV7A 5FF0A 4NJKA 4OGZA 1NVMA 3A21A 3LHYA 4O13A 3W72A 4QJ1A 3G1HA 4O19A 3B4UA 2VKZG 4AEOA 5EMUA 1L6SA 2ZRYA 1H1YA 1W5OA 1RQEA 2E77A 4O28A 5H2ZA 5K7JA 4QSHA 5LSMA 1HFBA 2A21A 4QISA 3PVFA 4LVAA 3G3MA 1DL3A 4LY8A 3E12A 3BLFA 4XTDA 4N4PA 4AB4A 1TPWA 1XKYA 3CHVA 3FYOA 2X1RA 1VHNA 5HWNA 1FCBA 1KBJA 1OYBA 3DHFA 4MLRA 5MHBA 3A5FA 3BV4A 3LI1A 1R2RA 1W5NA 3TCEA 1QO5A 4OWGA 1BTMA 1QOPA 2YZRA 3VE9A 1IXQA 5HJLA 5D04C 2GVGA 3DKLA 5J5RA 4ZQMA 4Z1BA 1QFEA 5AHMA 3EWBX 3I7SA 3O06A 5DELA 3CC1A 2C18A 2E5CA 2P1FA 1OF6A 3HG2A 4NXKA 3ANYA 5BMWA 2NZLA 3IIVA 3NL2A 4ALDA 4XZ9A 1YPIA 1LDCA 3NM3A 2PRMA 4YXGA 4S1FA 4O16A 3SY5A 4WXZA 4JTHA 2Q3RA 3LBCA 1JCXA 2QCCA 2WV8A 1RR2A 2ZRXA 5CPLA 4E2DA 3E0IA 4MJZA 3SI9A 3NPUA 1ZAIA 1CX9A 2ZZ6A 2ZA1A 3P5ZA 2XN0A 2RH9A 4BK9A 4TMCA 5CPMA 2ALDA 2JKEA 3HGOA 4UIOA 2WSYA 3I6RA 3MBFA 3R12A 1KM2A 4UTHA 2ZYFA 4Z08A 3UWVA 3S0CA 1X8FA 4MLJA 3GXNA 1WYIA 1VYSX 4EOUA 1F6PA 3W2LA 1AK5A 3LV5A 4IX0A 2V9DA 4GUFA 4K8EA 2EAWA 3BLIA 3O1NA 1ZALA 4Z1DA 4IX2A 3RF9A 1Y0EA 1K02A 4FHAA 3QSTA 2W6RA 4HNUA 4GUIA 4PL1A 3CWOX 1M6JA 3PM6A 4N6FA 1WOBA 2Q8LA 5AFDA 3L0GA 1YTDA 4LRSA 1FWRA 3O63A 4UTTA 4NJHA 2EGZA 2A85A 2E6FA 2WNQA 4N9CA 3JS3A 4JTGA 4O54A 5TBOA 2QUUA 2NXGA 5DBTA 1OF8A 3FYPA 1TTPA 1KV5A 3QZEA 5D2XA 1IGSA 4JTFA 3S5YA 1VLWA 2BXVA 1LBLA 4UMBA 3TQKA 3W22A 2NXHA 3ABOA 3HPSA 3W76A 3C6CA 2XN2A 2DJLA 3C56A 4O4WA 4RCXA 3PC0A 3TX9A 3DFSA 3TSBA 4AMAA 1TQJA 1XDLA 5AB3A 3C4UA 1W1ZA 4JR5A 3ZR4A 3M9YA 2FB3A 5CSSA 2CFFA 3T55A 2Y62A 5DXXA 3THAA 1HTIA 1TPH1 3H53A 2OZ0A 3EX6A 1PHWA 1I4NA 3GK0A 2I14A 2H6RA 3P5YA 4AF0A 3BW4A 2JKPA 1LRQA 3L5AA 3LCIA 4HSNA 3O05A 3F4NA 3NG3A 3R8RA 2CZFA 3PBVA 1OFOA 1W8SA 2CLEA 4BR1A 3TJLA 3WJSA 2RDWA 5DCDA 2WSQA 5D32A 5EPDA 4PODA 3N19B 1J2WA 2W79A 4JDBA 3SECA 4RK8A 1SZNA 4QNEA 3OIXA 4IGHA 3LTSA 1QAPA 4IOTA 2ZZ3A 1VYPX 1OFBA 2E09A 1IXPA 3LCHA 4BWLC 4LUIA 1O5KA 4PL2A 3UZ5A 1GG0A 1K8ZA 1QDSA 5EY5A 2NX1A 2Y70A 4FB7A 2VC6A 4CLMA 4MZ8A 2C13A 3M6YA 1ICPA 4HN4A 1EUNA 4LUJA 1H7XA 3KVMA 3OVPA 3W7PA 3QSRA 5D2VA 3N2MA 3LXCA 5AHNA 5HUOA 3MI3A 4P2VA 2FFCA 3GDTA 3FIGA 1M7OA 5C2XA 1TTIA 3S1VA 3DZ1A 2CU0A 2QCGA 3P67A 4UNLA 5F2IA 3QMTA 4NNBA 1H50A 2R14A 1O5XA 1EP2A 2CLLA 2JK2A 1G67A 2W0UA 1TPC1 2PE4A 3MWAA 4K6AA 2A7PA 4DF2A 4O1CA 4JTSA 2HS8A 2C15A 3C2FA 3LBMA 3DH7A 3U6WA 2B7QA 3MHUA 4R53A 4D2JA 3TC6A 1AW2A 2PC4A 2Z6IA 3GZ3A 4M19A 1SO4A 3H54A 1KTBA 1JQVA 1WQ5A 4RXFA 2X1TA 3QW3A 1W31A 2OX1A 4H4IA 1DJQA 3IGXA 1G69A 2J24A 1ZENA 2V30A 5KZDA 3TR2A 3L68A 3MHGA 4PFMA 4ZQRA 1VQTA 4MYXA 3VCRA 5D05A 3GKAA 3BK0A 3OVRA 3SGUA 1I45A 4PA8A 1SPQA 1TCDA 1VGAA 2ZA3A 1TRIA 4FNSA 3UPWA 1SU5A 3QW4B 1PV8A 4GFSA 1LRTA 3N2XA 3GR7A 4MVAA 1B9BA 3G1DA 3V1PA 3BO9A 3G1XA 4N2YA 3HG3A 3DU0A 4IPJA 1MSSA 1V5XA 3G1YA 2VFFA 3GDRA 3NA8A 2DZVA 3LTYA 3UY7A 4KFPA 3S1XA 1A5SA 4WY0A 2C1HA 1WXJA 4UTTC 3NR0A 5CSRA 2ZRVA 4EF9A 1O4UA 4HNTA 2O7SA 1VS1A 3OBKA 4WY0F 3NQ8A 3N34A 1R2TA 3MJYA 1FY6A 6ALDA 2H3BA 1UCWA 3RLVA 4NXSA 1O60A 3PF3A 5EYWA 1QPQA 1R30A 3PSWA 4Q4KA 2A1YA 4O4VA 3W73A 1ME8A 4UFLA 1XUUA 3LCXA 1XFBA 2J9YA 4S2BA 1NSJA 1TPDA 4WZHA 4K37A 3F1QA 2G5WA 2E5DA 2CLHA 2E5BA 1F76A 4DO5A 2ATSA 5DCBA 3G0SA 3QFEA 4ZVJA 3PBYA 1I2RA 2YFOA 3UXAA 5D2WA 4UTIA 1PCWA 2VEKA 2ZDRA 1A5BA 2R94A 1VLIA 1ZJIA 1BWKA 1EWEA 1Z48A 3MUXA 2ZZ4A 4RZ4A 2VFHA 4M6VA 4DBDA 4ORIA 3KHJA 3P84A 3UPBA 1FBAA 1OFAA 2BTMA 1OFEA 3CEPA 2O7QA 5D03A 2A2IA 4O0KA 3TC7A 1EPXA 3HG5A 3O6DA 3LRKA 3P8IA 4E0CA 1K3UA 1THFD 4OQVA 4UFHA 2E6AA 1M7PA 1OHLA 4HT3A 1GVSA 3W6YA 4ONVA 4L4MA 3M5VA 4LC6A 3LX9A 3EX4A 5I3IA 1VPXA 2NX9A 1BEUA 4MFEA 1EEPA 2X2GA 1JCJA 4RZ6A 3M5YA 3S5ZA 2P10A 1OFQA 1GYNA 2ISSA 4HNVA 2GPTA 2NV1A 2Y7EA 3OA3A 5A5WA 2GQ9A 3G1VA 3S1UA 5CZJA 1KM1A 2Y7GA 2G95A 4NX0A 4BI5A 4NJJA 5BMXA 3W1PA 4FNTA 3MP4A 3IEBA 1J5TA 2B7OA 3W3OA 4HSOA 2ATMA 3TXZA 3PBWA 2QCEA 1F5ZA 3TUUA 5FF4A 4MJMA 3P60A 1GPWA 4NNCA 1L2UA 2ABAA 1LCOA 5TQLA 3NQ6A 1GWJA 5KITA 2R91A 4JYDA 2DZUA 4GWEA 3W84A 2QF7A 4OV4A 4IMCA 1F6KA 1ZCOA 3O16A 4QITA 1JR1A 5F1UA 1RD5A 2HSAA 2QCHA 4IMDA 5L9FA 5I3KA 3AJXA 4MY1A 1SFLA 1SO6A 1A5AA 2FTPA 4S2CA 4JTJA 2P0OA 1T99A 3B05A 3LOTA 3HF3A 5K3VA 3GDKA 1WA3A 3B03A 4JIQA 3W74A 1SSDA 3TFCA 3W1UA 1G4TA 3EEGA 3T4CA 4N9BA 2PRLA 2CLMA 4O1BA 1B4EA 1G4PA 3MP3A 1AG1O 2UV8G 4HIBA 3W86A 2QDHA 4A3UA 4R7JA 3VI2A 3W2KA 2CLIA 5LNSA 4BWLA 5K2ZA 1H7NA 4AWTA 1OX4B 2WNZA 3W7RA 1QPRA 2V5LA 1XXXA 4GUGA 4WQ6A 1FCVA 1ML1A 2IQTA 3SIZA 3M43A 4FX6M 4N9DA 5EA9A 1K8XA 3KRSA 5AYZA 4JN6A 3BARA 2EF9A 3E96A 1SW0A 4CQ8A 4CQAA 3HJZA 2QDGA 1OJXA 2HMCA 1A5CA 1KFJA 4Z0SA 3S42A 2V81A 3FA5A 2GQAA 5F1VA 4Y8FA 1AMKA 1FCQA 3GAYA 4JGDA 1LBFA 2G97A 3W71A 4IMGA 2FJKA 1QPOA 3HPZA 1OK4A 4MYAA 5G2IA 3W7GA 3QPZA 2YSWA 2QAFA 3MHFA 1GG1A 4O10A 4YCPA 1ZY9A 2ZRWA 3ABQA 3M47A 1JJKA 3S9YA 1AW1A 4PC8A 4UNKA 1H7PA 4FF7A 3NNTA 3IIOA 3W2MA 3W1TA 2R8WA 3GXPA 1WOAA 2DZTA 2YX0A 3UZJA 3TU9A 3Q94A 4XTIA 4PCFA 5G1TA 2CZEA 4FNRA 3PUOA 2F7FA 2FB2A 2I9EA 3W1RA 2VELA 4JX4A 3RMJA 3S5OA 2GQ8A 4RZ5A 4C1KA 1OABA 1YDVA 1YXYA 4I9AA 5KZMA 5LNUA 1TRDA 2A7NA 2CLFA 3IGUA 2AGKA 3QMSA 4TMBA 2JBMA 5D30A 2V82A 4PEKA 1XBXA 5FEPA 4N02A 1I2QA 4QIUA 3SR7A 3P8JA 3NPXA 3G1AA 3ABRA 5AC7A 3U2OA 1KFEA 5D38A 4XKYA 3KRUA 4MIMA 2C0AA 1TTQA 1I2NA 3KRZA 1TJRA 2TRSA 2WJZA 4AWUA 3C0JA 3CLMA 4LS1A 1WV2A 1OVDA 1LTDA 1DOSA 2ZZ1A 4HPJA 4Q32A 3FKRA 3DFTA 2DP3A 4KFOA 4JDYA 1TV7A 3C8FA 3MYPA 3PUEA 3NOEA 2J6XA 4IUOA 3RK8A 4ADTA 3TNOA 3L0KA 4M5PA 1WAUA 1AL8A 3L66A 2E6YA 4WX2A 3W7HA 3KOFA 1JUBA 1H7RA 4DF0A 4JTKA 3D0CA 2YGYA 2ZTKA 4AHPA 4X3ZA 3G0XA 3W1NA 1W0MA 4POCA 4LT9A 1HG3A 1QOQA 3PUDA 2I1OA 4RR4A 1LP6A 2Y61A 4GUHA 2DZXA 4ZQOA 3OEXA 1EUAA 3NQDA 3B0PA 4A29A 4UR8A 5E0KA 4UCGA 4AVFA 1X1OA 2QCMA 4EIVA 4RJEA 3LB0A 2ISVA 3V75A 4Z0JA 4XUGA 2BWGA 3T78A 2BX7A 2YXGA 4OU1A 1TJPA 4O0ZA 2CZDA 4ZQPA 3GDMA 3P81A 1YTKA 2CW6A 1R2SA 1IXNA 1OYAA 4NJGA 2ZZ2A 5K9XA 4ADSA 3L21A 2BSLA 2PRHA 1VCVA 1DKWA 4LRTA 2E6DA 5AHFA 1MXSA 2C3ZA 4GC4A 1H63A 2B7NA 3FS2A 4U28A 2DZWA 4UC5A 2RHGA 5D37A 4M6QA 3W23A 1Z44A 1GYLA 3W7EA 3UXDA 5IM51 5IBXC 2YYTA 2GVJA 3U8GA 3EX3A 5U7SA 1R46A 1EP1A 3B0VC 4N4QA 4E2BA 3E02A 1LRNA 2Y7DA 5AOUA 2OT0A 1L9WA 1EB3A 1JRCA 4WUIA 4UXDA 1KTCA 4K36A 4IJBA 1PVNA 1FWTA 2ZZ5A 3O6YX 1HL2A 3PR2A 1R47A 2QCDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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