1OGGA

Chitinase b from serratia marcescens mutant d142n in complex with inhibitor allosamidin
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDINWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
publication title Structure of the D142N Mutant of the Family 18 Chitinase Chib from Serratia Marcescens and its Complex with Allosamidin
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 164
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1oggA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1oggA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1oggA01
1WE5A 3VMOA 1EXPA 2BNJA 3A4XA 4FK9A 1JZ5A 3GNRA 4TUFA 1CWYA 3MV01 3WH7A 4FLRA 3ZJ7A 3EDEA 3VO0A 5JIWA 2EJ1A 2E8ZA 4PEEA 4F9JA 3WD0A 2RTSA 2QLYA 2VX7A 2E4TA 4ZFMA 3BAWA 5BXSA 4KGLA 5A6AA 5A2AA 2NSXA 4AXNA 3EBVA 3VIIA 3SCWA 1JYVA 1D7FA 4WSKA 3GNPA 2D1ZA 1GOIA 1BYCA 1FHLA 4GZIA 4H41A 4PTWA 1VEOA 4H8VA 4UOJA 1UR1A 2XJ7A 4JAWA 2WZIA 3ZSSA 4ZEPA 3ZSTA 2VX4A 3UR8A 3UESA 1HF6A 2BXYA 4DM1A 1B3VA 4AEEA 1XYFA 5CLTA 1W9BM 5A69A 3IJ9A 2J47A 1KB3A 1W3KA 2A3CA 1UWUA 2GFTA 1V3JA 1GQIA 4PUEA 1LL4A 5JBFA 4UCFA 3PZQA 2XUCA 2BHYA 3PZMA 2TAAA 2OWXA 1ZB5A 1GORA 3AXXA 4D6IA 3AIRA 4W7VA 3VIMA 4ATLA 3VGDA 5FOOA 1JFHA 2XVLA 1ZU8A 1HJWA 3ARUA 5FIPA 4UFHA 2CYGA 1VJZA 1ZBVA 3KEHA 4U2YA 4YPJA 1JF5A 1U2YA 1XSJA 2WYSA 5HBFA 2UY4A 3WQ6A 4IM4A 1O6IA 1JL8A 5FCZA 4Z2JA 1K6AA 4W8LA 3TA9A 1JZ3A 3T0DA 4P7QA 4MB4A 1W9XA 4W86A 4UQCA 4AD5A 2RGLA 1EQCA 4PRWA 1XD0A 1HVXA 4AIOA 5CQ1A 4AEFA 3T0BA 5CJ5A 1BTCA 3RIKA 4YN5A 4DUVA 2ZWYA 4CU7A 3ZQ9A 5GNYA 2WVSA 1HKIA 1H0IA 3QOMA 4Z2LA 3ARZA 1OD0A 2WLYA 4UOQA 3SCTA 3SCOA 3DHUA 1BQCA 1HVQA 4NZCA 3UG5A 3L2LA 4PMQA 2J4GA 2BS9A 4PTMA 5DT7A 1BYAA 4HMDA 2EPLX 1AQHA 5CPQA 3BAJA 2BY3A 2IXVA 1V0NA 2YLLA 4EANA 1J0KA 2QPUA 2VJXA 2ZXBA 2CKSA 3MKKA 1BAGA 4OKDA 3WEOA 1OBAA 4CD7A 2EXOA 4B9YA 4UTFA 1US3A 4B16A 2BHZA 5BXTA 3WY1A 1JYWA 2YBUA 1E55A 4UQAA 1JIBA 1UWRA 3QOKA 4MDOA 3PBGA 1B31A 1E0WA 1RH9A 1JYXA 1M53A 3K8LA 2VT0A 1V08A 1WNOA 2ZUNA 1XCXA 4LXFA 3SIMA 1FP9A 1EDQA 5FL1A 5A8PA 4UFIA 3BGAA 3EYPA 5A6SA 1ED7A 3GH7A 5CGMA 4MB5A 2V3FA 1CLVA 4CU6A 1UKOA 3EDKA 2OLHA 4AD3A 1W1TA 5GNXA 1J0HA 2PB1A 2JALA 1E3XA 1KR1A 4R5EA 2YBTA 2Q8XA 4BQ5A 5ECUA 3ZJKA 4C7DA 2WCSA 1B3YA 1E6NA 2ZOXA 3EDFA 2XTKA 3S6TA 4M1RA 3SUVA 4GQQA 3ARXA 1V03A 2WVVB 2GJXB 3IJ8A 3GM8A 4J3WA 3UEQA 3KL5A 1HKKA 4IPNB 1W91A 1TMQA 4MNMA 2NT0A 2DSWA 2DT1A 3SCSA 1J0JA 1GQKA 2VZVA 2UWFA 2PWHA 3U7BA 1RP8A 1Y7VA 1SR0A 5HDRA 2D23A 3ALGA 2VR5A 1GJUA 1ZS2A 2YA2A 2CXGA 2WVVA 4U3CA 2GJXA 4YHEA 1JD9A 2J62A 5BCAA 2A3HA 3VGFA 1C91A 1E4MM 3VM7A 2JFEX 1KGWA 4LYQA 3VNZA 3BAXA 2BY1A 3GTNA 2XYLA 1SMDA 3VMNA 1XC6A 1WPCA 3VD7A 4EKJA 2J7EA 6CGTA 1JD7A 1R86A 3JUGA 1QBBA 3M46A 2G41A 3SCQA 3AI0A 2V3EA 2D22A 2WK2A 4GXPA 1BVZA 2DSVA 1JAEA 2VOTA 3AHYA 1G0CA 2BHUA 3AIUA 2G4FA 1C93A 5A94A 3AFBA 4CUCA 1K9DA 3WL0A 2XVPA 3AYSA 3LPFA 1GUVA 2O9TA 3WNLA 4D6GA 2G3NA 3AOFA 5A2BA 2A3BA 1GVYA 3SURA 5FL0A 3MMDA 4MB3A 1JDAA 4M81A 3AS0A 1TVNA 2ZUMA 4P8UA 3RDKA 1I75A 5A8QA 4FLQA 1OIMA 2X8RA 5A6LA 1OIFA 4MNKA 3A6OA 2VZTA 1XCWA 2WMIB 2DSKA 3MUZ1 3WEMA 1JZ7A 3OLEA 2WC4A 4WSJA 4UZSA 1AVAA 1MQQA 3A47A 2DIJA 1J9YA 2XSBA 1E3ZA 2ZE0A 1EQPA 1BGAA 5E0CA 1OCQA 1JAKA 3O6AA 2O9RA 4D6FA 1FH8A 5ABGA 4HZ8A 1Q6EA 1FA2A 4P8WA 4JFSA 1JXJA 1PAMA 3CZEA 3PHAA 1UKQA 2WMIA 3WH9A 1IT0A 4BS0A 2DGAA 4HOXA 2CKRA 4UFLA 3ALFA 1JDDA 4WF7A 1QI4A 1WDRA 6TAAA 1KR0A 3WNNA 1OGGA 1SMAA 1NQ6A 1WDQA 2DEPA 1KGXA 3AISA 3WEZA 1ISVA 3QGVA 3DYPA 4DWSC 2D3NA 4BA0A 1KXHA 4QLJA 3WNKA 4GI6A 3TTSA 3WENA 1NP2A 3WKZA 2CPUA 3K46A 2CITA 4WK9A 2OYKA 1AQ0A 2OSXA 3RJYA 5A3HA 1E9LA 2F61A 4JKKA 1EDTA 3W25A 4PMOA 2X2YA 1GHSA 1CDGA 9CGTA 2IXUA 1ECEA 3OLIA 3MU7A 2VR4A 3B9DA 3AMDA 3CHCA 4PMUA 3WSUA 4OBSA 3AXIA 2EPOA 2VVSA 1CENA 1H1NA 4JFTA 4HOZA 1GCYA 2JF7A 1WB0A 3DHPA 5ABFA 4AZ7A 2ZUWA 1PIGA 3M7SA 3ARYA 2IUZA 1GQLA 3AS1A 1O7AA 4HOWA 4CD6A 1VEMA 3U7VA 1L0PA 1PBGA 2O9PA 3GYCA 1CECA 1BFNA 1FH9A 4QFUA 1HP5A 4OUEA 4W7WA 2J25A 3CIVA 3BAYA 5A6KA 5IHSA 2XGBA 2WHMA 2HISA 2YL6A 4GIAA 3WIJA 4KRUA 3HU7A 4PTXA 2EO7A 1CEOA 3WMSA 2YJQA 3FN9A 3BXWA 1D3CA 3W6MA 1VBUA 4W85A 1ZBWA 4CVWA 2CESA 1K9TA 1UD5A 2XWEA 3W37A 4C7FA 2J7HA 4Q7NA 2YDQA 3VD9A 4OZOA 3GXDA 2C0HA 3WUFA 1OT1A 4OOZA 1LWHA 2YDSA 4AZHA 1JZ8A 1J18A 2JIEA 3VKKA 4GI9A 3VGBA 1CXKA 3UG4A 4KRTA 1Q6DA 1LLOA 3ARSA 3NDYA 1TFVA 1JNEA 1G1YA 4L4OA 2G8ZA 3M6DA 1ITCA 4J3TA 4YHGA 4U5KA 1AQMA 2AMGA 2WAGA 2E9BA 4CN4A 2DH2A 4CGTA 4URIA 2DH3A 3MMWA 1QOXA 1BGGA 1PX4A 2V3GA 3AIQA 1R8LA 1FP8A 3WUGA 4TVDA 1G5AA 1I1XA 3GBDA 1JYNA 3OLDA 2ZX8A 4P7RA 3WUBA 4KWUA 1QW9A 4RL3A 2NW0A 3DC0A 1MQPA 1MXGA 3DYMA 2WNWA 1V3KA 4AD4A 2VZOA 4TXEA 1LWJA 3PZUA 1W9DM 1LJYA 2QHAA 4JCLA 4P7NA 2RGMA 5E70A 1B2YA 1JI2A 4AD2A 2ZUSA 4AISA 4J3XA 2FGLA 2CHNA 3AIEA 3UG3A 3ZM8A 3OZPA 1EHAA 4AMCA 4KMQA 4PSPA 5I24A 2GSJA 3F5LA 2PBOA 3CZKA 4HU0A 1HL8A 2D3LA 1KBBA 5CSUA 4W93A 1NWTA 1MXDA 3UERA 5A6JA 1W1YA 1H09A 2E9MA 1Q6CA 1E6RA 2XFRA 3UETA 1CGTA 4V28A 2JF6A 1F4HA 4UNIA 4CN6A 5A8OA 1HJSA 1SYTA 1V6XA 1QVBA 3WQWA 4XZWA 1GW1A 1E15A 4J3SA 3OZOA 4GQRA 5BRPA 1OINA 4TX6A 1H5VA 1QI5A 3MUAA 2XVNA 1XGZA 4D6DA 5AYIA 4HPHA 3RJXA 3WFLA 5E09A 4PMVA 3ZJ8A 1E1EA 3L4UA 2WPGA 3WF3A 5CGTA 3W38A 3L4XA 1EOMA 1WDSA 1QPKA 2Z1KA 3PZ9A 1W2VA 2VTFA 5JIPA 1CLXA 4JKLA 5JUVA 1HP4A 4MAZA 1HIZA 1YHTA 1BYBA 1E5JA 1H49A 2JEQA 5TD4A 1WZAA 1UH4A 3WL1A 4W5ZA 1UR4A 2Y8VA 1ISYA 5IHRA 5M17A 2OWWA 5A2CA 1MW1A 1EHNA 1UYQA 1PX8A 3U5UA 4CVUA 4RE2A 2ZX6A 1MW0A 3BC9A 4HZ7A 1JI1A 4H8HA 1J10A 3BCDA 3B9EA 1UR9A 5BRQA 1NP0A 2Y4SA 1CTNA 3SCVA 1QNSA 2VL4A 3WBAA 4MDPA 4W84A 5HPCA 1MQRA 2EPKX 2YA1A 2J75A 3WD1A 3GXFA 2DPEA 3FHQA 1H41A 1OB0A 3RM9A 3N1AA 3B8SA 2D49A 3RM8A 1CGYA 5BROA 3CUGA 1E5NA 2V5DA 3A3HA 5I6SA 1MW2A 1P6WA 1QHOA 2XFFA 4QDMA 3WF1A 4ZE4A 5A1AA 4IISA 3CBWA 2ZXAA 4HU8A 3L4TA 4JFVA 2WBKA 3S2CA 5AYBA 3KE0A 3CZ8A 2ZIDA 2X05A 4W89A 3E1F1 4JCMA 4AZ6A 2Y2WA 2OWCA 1WP6A 2GJPA 3ARVA 3QR3A 4AZBA 4HA1A 4AW7A 3CHEA 5D8WA 4F66A 2CNCA 1WO2A 2WC7A 2B31A 1TVPA 5DEZA 3VPLA 1E6XM 1UWTA 3WD4A 1TCMA 1UD4A 2ZUTA 1E70M 4U2ZA 5I2UA 4P8VA 4JL2A 1GNXA 2J7BA 1B0IA 4MJ4A 3ZT7A 4B3LA 4KGJA 1J0YA 1HJQA 4PMRA 4ACZB 4W8AA 2X0HA 4TX8A 2W62A 1MWOA 3T2PA 2E0PA 4GI8A 2YA0A 1TUXA 3DECA 4M29A 4PMNA 3A4AA 4D6HA 3AHXA 1MFVA 4QCEA 1V3IA 3CMJA 4U33A 4QLLA 4A3HA 1UZ4A 1J0ZA 3U57A 1FFQA 4UR9A 3EMQA 4ACZA 4CD5A 1UQZA 2WHKA 3IANA 4DUWA 1GZJA 2O92A 2WHJA 3CZLA 2WMJA 3KL3A 4H8UA 5KZ6A 5EFDA 4KH2A 1E43A 3GDBA 3AHTA 4BQ3A 2CIPA 4M80A 2WSPA 1B3XA 4D6EA 3WDPP 1E71M 1XH2A 2VX6A 1E4LA 1FFRA 3A4WA 1EIBA 3W0KA 1V6VA 3WUEA 3KZSA 2GJRA 1VIWA 1TR1A 1W3LA 1HL9A 3ARQA 2FH8A 4XZBA 1J0IA 3D3AA 3N11A 3T2OA 2Z1SA 2ESCA 4FLSA 3SEPA 2WMKA 3VNYA 2ZXDA 3ZMRA 3N04A 1M04A 1V6UA 3GH4A 1XSIA 3GH5A 5A6MA 4WKAA 3WH6A 1L8NA 3FHAA 1UD2A 2UY5A 1EH9A 1X6NA 3NSXA 3FNDA 3PTKA 1BSIA 3AHZA 1B3WA 2VZSA 3WD3A 3B9AA 1QI0A 1C8QA 2WMFA 2J78A 1UKSA 3MMUA 3VOCA 4BF7A 1DEDA 3F5KA 2V3DA 4JKMA 2PWGA 4ZXOA 3WN6A 3NSMA 1NOFA 5LYRA 5ABHA 1RD6A 1KQYA 1EA9C 3AIBA 4J7RA 1U30A 4S3KA 1J12A 3CTTA 5BYWA 2O9OA 1PZ3A 1V6WA 3VDAA 4UZUA 1HKJA 2YIHA 4TVCA 5CPSA 4UOZA 3AIWA 1CGXA 2J7CA 2D2OA 3G6LA 4D1IA 2F2HA 1IV8A 1V6YA 2V38A 2PF0A 1W32A 2PI6A 3SUTA 1WAWA 3W27A 1HX0A 1BPLB 4B15A 1HT6A 1UWSA 2WVTA 1H4PA 1OSEA 1VFFA 4LX4A 1CXIA 4MADA 3VDCA 3UR7A 4CCEA 3WMCA 3BAIA 1J01A 2J74A 1VENA 1B30A 4AIUA 3GZAA 3WH5A 4AWEA 3NSNA 5C71A 1ITXA 1CZ1A 4BCEA 3UCQA 3ZT6A 1FOBA 1C90A 2VX5A 1BG9A 1XHGA 4B3KA 1W1PA 2WM0A 4NF7A 4U31A 5FD0A 3VIOA 2YDRA 4CD8A 2DT2A 2C7FA 2J77A 2GUYA 2CBJA 2VVNA 1GOMA 1VBRA 3WF2A 1GOQA 1JFXA 1DWIM 2Y24A 1HNYA 4A3YA 3ARTA 1BG4A 3VD3A 1VFOA 3O9NA 5D4YA 4JHOA 4L4PA 5LA1A 3I3DA 1CXHA 2ZWZA 5EBAA 1GOKA 1UR0A 3VX0A 3BSGA 1M7XA 3LPPA 5LA2A 5ABFB 1R87A 4B9ZA 3WNMA 2QF8A 1R7OA 2DSZA 2HVMA 1KCLA 4JHZA 2WZHA 5ABEA 4M8UA 1KWGA 2BVYA 3ARPA 3ZIZA 1MFUA 1UR2A 5A6BA 5I23A 2ZX7A 2QV4A 3OGRA 3MV11 1ZBCA 3AQUA 1E72M 4F79A 3IAQA 1EOKA 1DHKA 2FHFA 2OYMA 2WANA 2WZEA 2MANA 3II1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3QHO A;  4QCF A;  4UFM A;  4DM2 A;  3WQ5 A;  3ZR6 A;  3EMZ A;  3AXH A;  5HPO A;  1CNV A;  1HJV A;  1UKT A;  4EAM A;  4NRS A;  4DWS B;  1HJU A;  1QNP A;  2DIE A;  3NJ3 A;  5M5D A;  1CYG A;  2AOS A;  2GK1 B;  4R27 A;  4WLC A;  4V2X A;  3IJ7 A;  1V02 E;  2VRJ A;  4ZXL A;  4Z2G A;  3OGS A;  1GON A;  5BXP A;  1NH6 A;  1GOO A;  2XGI A;  2X09 A;  4N0R A;  4AD1 A;  4W5U A;  4W8B A;  2VRQ A;  3NDZ A;  2QMJ A;  1ODZ A;  3T0A A;  1US2 A;  2DSU A;  3BMV A;  4E8D A;  1UWQ A;  2VI0 A;  4IUG A;  2VC9 A;  4UQD A;  4Q22 A;  4FF5 A;  2GK1 A;  4AZC B;  2OYL A;  2QPS A;  1KXT A;  4WKH A;  4LYR A;  1ZL1 A;  2WKG A;  3AMK A;  2BY2 A;  1VEP A;  1E6S M;  1V3M A;  2BY0 A;  3HN3 A;  1V3L A;  3KWX A;  1XH0 A;  2CET A;  5AC4 A;  1F4A A;  3VDH A;  4W88 A;  1CIU A;  1NAR A;  3GXM A;  4QLK A;  1GJW A;  3AZR A;  1E4I A;  1QNO A;  3N9K A;  3BLK A;  2EBN A;  2EEX A;  1MYR A;  1C8X A;  4J27 A;  2XVK A;  4NI3 A;  4PMD A;  2VO5 A;  2XVG A;  1XSK A;  4UQ9 A;  4AZC A;  1WZK A;  5D9M A;  2WXD M;  1E0V A;  2Y5E A;  3WDQ A;  4J28 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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