1OGUA

Structure of human thr160-phospho cdk2/cyclin a complexed with a 2-arylamino-4-cyclohexylmethyl-5-nitroso-6-aminopyrimidine inhibitor
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
300
structure length
296
Chain Sequence
PGSMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Structure-Based Design of 2-Arylamino-4-Cyclohexyl Methyl-5-Nitroso-6-Aminopyrimidine Inhibitors of Cyclin-Dependent Kinases 1 and 2
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 296
sequence length 300
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1oguA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1oguA01
5FTGA 1OUKA 3DK6A 3VQUA 4BVUA 1XH4A 3L8SA 4CKIA 2E9UA 3BHVA 5L6PA 3KULB 3FBVA 4CEGA 2W9ZB 4CCUA 3R71A 4U41A 3UZPA 2ZB0A 3VN9A 2XNMA 3BU3A 2YJRA 5LMAA 1OBDA 3LCSA 3FWQA 1Q24A 1ZY5A 2ZB1A 4M15A 3WE8A 1OKWA 3BELA 4PMSA 2BTSA 4N57A 3R73A 4YJUA 2WZJA 3Q9ZA 5E7RA 2J9MA 4MK0A 2BAKA 1ZOEA 3E8NA 4R5YA 3V6RA 3MESA 4X3FC 4HYUA 4F63A 2CMWA 5GZ8A 1S9JA 3O2MA 3OP5A 1KE8A 3RK9A 4X0MA 4X6QC 4ZTHA 2YZAA 3LOKA 5CAUA 3K54A 4FKSA 4WO5A 5EYDA 5J95A 4ZZOA 4DTKA 4FX3A 4IFGA 4BCHA 3QF9A 5BQ0A 5D41A 3ORXA 5CU4A 4ZP5A 2VWIA 3VF8A 2GNIA 2H34A 4S34A 3H30A 4Y5HA 4DA5A 5HBJA 5AX9A 2JLDA 5HQ0A 1GNGA 2C47A 3M42A 1OKVA 3QCYA 4JIAA 5DRBA 3NYXA 1MRYA 2C5YA 5AEPA 3FXZA 4NT4A 5HI2A 4M68A 3I4BA 3A8WA 1U54B 1JVPP 4BIBA 4KA3A 4NIFB 4IVBA 4O91A 3TV4A 4J71A 3GVUA 4LQMA 4RVMA 3UQGA 3ENMA 1M2QA 1OM1A 4IW0A 4TNDA 2O8YA 5L2TA 3EL8A 3ORTA 5DNRA 3VHKA 3P23A 5L4QA 3PIYA 4NM0A 4N0SA 1XBBA 3R00A 4FKUA 3PIXA 3VJNA 1PW2A 4JX3A 4FGRA 3EQBA 4P5ZA 3GQLA 4O1PA 1KOAA 4ANOA 2Z2WA 2F7EE 3C4CA 2G01A 5EDQA 4CYJA 3FZPA 3ZO1A 1OITA 3QA8A 2Z7SA 1OIRA 3G2FA 3JYAA 3LQ8A 3P7BA 3POZA 3NGAA 4EOIA 2VUWA 2OGVA 3SRVB 2C6IA 2VX0A 3ET7A 3A61A 3TDVA 3ZTXA 3LQ5A 3QWKA 3FQHA 2HY0A 5HG9A 4QMLA 5LVNA 5I9XA 3UOKA 4L52A 3HV4A 3V5LA 3MH2A 5AAFA 4NM5A 4DGNA 4YZBA 3H0ZA 3OTUA 1R0EA 4EOKA 1RDQE 1UKIA 4L00A 4YSMA 2OFUA 2XK8A 2QR7A 3LFNA 3V51A 3VS5A 5KZ0A 5HORA 5IA1A 4H36A 1H24A 5HHWA 3R9OA 5DN3A 2H9VA 4FTRA 2YEXA 1LR4A 2IN6A 2ONLC 2QURA 4FG8A 2IZUA 4APCA 1Y8GA 2BZKB 3DQWA 3KQ7A 3UG1A 1XH6A 3JY9A 4C4GA 5HLWA 1CM8A 3SV0A 4UWCA 4DG0E 1BUHA 4JDIA 2ZV8A 3IK3A 5IA0A 5IH5A 4ZLZA 4GCJA 5IQFA 3FSFA 4OR5A 3H10A 1CSNA 2OIBA 4K33A 2X4ZA 4YZDA 5ANOA 3LFCA 5TT7A 3EQCA 3VS7A 1MRUA 4UZHA 3PG1A 4LGGA 4M12A 2WNTA 4IJ9A 4NYEA 3RGFA 5ANDA 2LAVA 2X4FA 3BEAA 4YC6A 5E8ZA 2GS7A 3KMWA 4NFNA 1ZARA 3SGCA 5C03A 2XJ0A 1OKZA 5CXHA 3GC0A 2CN5A 3GFEA 2QHNA 4JQEA 3IS5A 3TIYA 3D7TA 4HCVA 4E26A 1M17A 2PL0A 2NRUA 1U46A 3TN8A 2FSLX 3FL5A 5A6NA 5EYMA 3FUPA 3OXZA 2BR1A 4GV1A 3Q6WA 2BRBA 2VTOA 5FRIA 4ZSAA 3LLAA 3RALA 5HE0A 4UB7A 5L8KA 3O8TA 3OCBA 4RJ7A 4AA4A 5I9WA 3HZTA 4AA0A 1JSUA 4U44A 4BTMA 3EYGA 4FTCA 3G9LX 3OCGA 3D9VA 3PY3A 5LCKA 3HYHA 4LYNA 2UZUE 2CNQA 4W4YA 4PL5A 2Z7RA 1H27A 1TQIA 4YJTA 1Q8ZA 1W84A 2PHKA 4CFXA 3GFWA 2EB3A 2PY3A 3P5KA 1JSVA 2BKKA 2BCJA 5JFWA 4WHZA 3QUEA 2PUPA 4YNOA 5M4UA 4KBKA 3QUPA 3EN9A 3UMWA 4BCIA 4LL5A 2J4ZA 1PMNA 3POOA 4ZY6A 5E92A 4XMOA 4PF4A 3PJCA 5AUYA 4ZEGA 3RK5A 3WIKA 3DCVA 4FTQA 5DGZA 1OZ1A 4R3PA 2BAJA 4TY1A 4EOQA 5I0BA 4EBVA 4GYIA 5AV0A 3VBTA 1UU9A 2JAVA 3LXKA 2ITXA 5J79A 4R7BA 2X8DA 3HECA 4AZTA 3VAPA 3M2WA 3GNIB 1RQQA 2NRYA 2IZSA 4U3YA 3VUMA 4YP8A 2VWVA 4LGDA 4YJSA 2QOLA 1LEWA 3KREA 3L9NA 2Y8OA 3WF8A 4PPAA 2HK5A 1WBVA 3HEGA 4FSQA 2Z7LA 4F99A 1NT2A 2JC6A 2X8IA 5AJQA 3NX8A 4TZRA 2OW3A 2I0VA 2VO7A 4BZOA 4USEA 5JZJA 4ZAUA 3EQRA 3LXNA 4M13A 3LIJA 3R7UA 2I40A 1WMKA 5ANEA 3SKCA 3F82A 2V55A 4QP1A 5M4FA 4BFMA 3FZOA 4OTRA 3RMFA 3DY7A 3KKVA 3BHHA 3F5GA 4WUAA 1YRPA 4Z7HA 4JBPA 4BCMA 2XIZA 1I44A 2DS1A 3KEXA 2WMAA 2YN8A 4L46A 5DH3A 3P08A 2VRXA 3BHTA 1FBNA 3PVBA 2W1EA 3HMIA 4NH1A 5HD4A 5JFVA 4PTCA 3OT8A 4HCUA 2PZ5A 5J5SA 4JLCA 4U43A 5KZIA 4F4PA 1BI7A 2BHHA 2BILB 4HYSA 4FKLA 4DC2A 2HZIA 2O0UA 4RT7A 5AR7A 3TKHA 1UWHA 3UYSA 5FTQA 4O22A 4FTIA 4II5A 3GU4A 4FKRA 5E1SA 1FGIA 4FVRA 4ERWA 5M09A 3QRTA 5B2KA 4BCQA 1AGWA 4LGHA 2YERA 4UWYA 4NW6A 5BYLA 5ANKA 2ZV9A 3SX9A 1YOLA 3QU0A 4FV1A 1PXPA 5AADA 5FDXA 4ERKA 4CFUA 4U9AA 3ZZWA 2ITYA 2X2LA 4XX9A 3EQGA 4KAOA 4OT6A 4FODA 3BYOA 3P1AA 1JAMA 1B38A 2WMBA 2VTHA 1SM2A 2DWBA 3TG1A 2YM3A 4D4YA 3U6IA 3OTVA 5DBXA 4IX5A 3A2CA 3I5ZA 2XK4A 3QBNA 5AA8A 4UALA 1URWA 4IWOA 3QX4A 4DGGA 3NMUF 4JVGA 3KRLA 4BC6A 4C57A 3N4TA 2Z7QA 4YU2A 3ENHA 3BEGA 4C3PA 4E6AA 3DKOA 3LVPA 4YZCA 4IM3A 4I5MA 4EORA 4AXAA 3EKNA 4PL3A 5HX8A 2CGUA 4TTHB 3PRFA 1NXKA 1QL6A 2X6EA 4DITA 4FIHA 4FKQA 4GT3A 2UW8A 5I4NA 3R63A 4DCAA 3NLBA 2GFSA 3QZHA 4W4XA 4QP2A 3W2QA 4FL1A 5AP3A 4BKYA 5KMMA 3UQCA 3RTPA 3BQRA 3QTRA 4DFUA 3D5VA 4OW8A 3LM5A 3U6HA 5L6WL 3VRZA 5H2UA 4N4SA 1IAJA 4A9RA 4N6YA 2YIXA 4X21A 1KV2A 2R2PA 1YOMA 4F70A 2C3KA 1GZ8A 4JG7A 3QYZA 4WG5A 4JG6A 4EH2A 4EQUA 5GIPE 4DFYA 4PX6A 2WTCA 1Q8UA 1OPLA 3SLSA 1ZXEA 5DPVA 3MPTA 4FL2A 3ZLXA 3HMOA 3GCQA 3BLQA 3BE9A 4ITJA 4MXXA 4QP7A 4J7BA 4DF3A 5IA4A 4AA5A 2R3OA 4XG2A 4I92A 4OGRA 3W2RA 2WQBA 3F61A 3Q4CA 1J1CA 4HGLA 4UEUA 1UKHA 4IC8A 4MWHA 1H00A 2UW4A 3HLLA 2HELA 4P2KA 4HPTE 2Q0BA 5C1QB 3W32A 4F7SA 3TNHA 3RPVA 4RBLA 3EWHA 1JKLA 4RFZA 3V04A 5BVOA 5CF8A 1H25A 5EOBA 1WBSA 1OUYA 3COIA 4QPAA 3E93A 4MX9A 3QQGA 3OC1A 4E6CA 3GC8A 5KMIA 4FKGA 1ZRZA 4YZMA 2UVXA 1U5QA 3ORIA 5L2SA 3IG7A 3PVUA 1PKDA 2PK9A 3ZDIA 4L3JA 2OJGA 3C13A 1Q97A 4ZTNA 4P7EA 3TNPC 2JDRA 1UA2A 1WBWA 4RVKA 3RKBA 4JG8A 4EBWA 5K0XA 3HAVA 3ZLSA 5K4JA 4ACGA 2WQOA 5H3QA 2V22A 3AMAA 1LEZA 4JDHA 4O0XA 3DJ6A 3U4UA 1OL1A 4IZ7A 3WF6A 3DTCA 3F7WA 2R3MA 4IIRA 1P5EA 2BZJA 3QRUA 2WTVA 1H01A 5KKRC 2BDFA 4TT7A 2XNNA 3UYTA 4FSTA 3EYHA 3PSBA 5CF6A 3NVMB 4RFYA 1Y6BA 5LVMA 4DEEA 5J9LA 1YWRA 4H3BA 4F64A 4CLJA 5CQWA 3U4WA 4B0GA 3C4ZA 5AP7A 4FSWA 2YHVA 3H3CA 2B1PA 3C7QA 4IANA 4I1ZA 5IQGA 5DE2A 2NP8A 2W96B 4PDSA 3ZBXA 4YTCA 3I0OA 3MBLA 3WF7A 4WA9A 2F4JA 4XP2A 4MD8E 2P2IA 4NJ3A 1NVQA 1U4DA 3FL4A 4BWXA 3WIGA 2WOTA 5K4IA 2NNWB 5CEKA 3SXRA 4OBPA 2IPXA 5EYCA 4ZS4A 4UMTA 3NUSA 4G31A 5A4TA 3FC2A 4GMYA 4KBCA 1OKYA 2XM8A 2HW7A 2YIQA 3OHTA 2W9FB 3GOKA 2RGPA 5IUHA 5HLPA 3RZFA 3HDNA 3KMMA 3WI6A 1JOWB 4ANBA 3NUAA 4YO6A 3OT3A 3IECA 3TKIA 1Q8TA 2PMNX 1PKGA 2BALA 4LRKA 2OJIA 1WFCA 3D2KA 4TWOA 2PVNA 4R1VA 1KUTA 3KK8A 3V8SA 2BUJA 3R8PA 3PXQA 3PP0A 1BI8A 2PVMA 2P55A 3QD4A 3W8LA 1H26A 5GJFA 3CQEA 3UP7A 1FOTA 3QA0A 4ARKA 3HV5A 4OTQA 3MY5A 3NW7A 2UW6A 5AR8A 5IZFA 1ZZ2A 5DEWA 3E8DA 4S2ZA 3BRBA 1JWHA 3UBDA 3DPKA 4RLLA 5I9VA 4MF0A 4PTEA 3UPXA 3UVPA 5CANA 3CXWA 2B9JA 3VULA 4DH3A 2CKEA 2OXYA 2PPQA 3I6UA 3LCKA 3GU7A 4KIPA 4HJOA 4EI4A 3DU8A 1XH9A 4M69B 5EM5A 4K18A 1QCFA 4RWKA 3MVLA 1RJBA 1WBPA 4KABA 4GUBA 5HNGA 3T3UA 4G1WA 4ASZA 5EDPA 1VEBA 5HVYA 2W1FA 4YLJA 1PXJA 4Y83A 4KB8A 3ULZA 1WZYA 2WMTA 3O8PA 4GK3A 2PUNA 1XKKA 3VS3A 4FIIA 4CMTA 3TV6A 4YNEA 3ORLA 4Y73A 1K2PA 2QU5A 2OK1A 3RNYA 4CRLA 4OUCA 3R83A 3RI1A 4YMJA 3UOHA 4FBXA 5HLNA 4FEWA 2E9VA 5KMNA 4U3ZA 4XV1A 2CGWA 4WBOA 3ROCA 4TN6A 2HWOA 2B55A 4IZAA 5FEDA 4C4HA 3ATSA 4BN1A 5FG8A 4I93A 4AT5A 2I0EA 1J7UA 4O7NA 3G0EA 1JKKA 1IA8A 2V62A 5C9CA 1JNKA 3HGKA 3LCTA 3QALE 4K0YA 3SXFA 2CJMA 5AP0A 3FLWA 5AUUA 3FE3A 5TOZA 2R3JA 2VTAA 1OBGA 1OI9A 3QQFA 3IW7A 4IWPA 3CTHA 2R4BA 4CXAA 5E8WA 2YAAA 5CY3A 2I0HA 3SW7A 3ZO4A 2RFEA 1GIIA 4LV8A 4UY9A 4QTAA 2CKPA 3PXRA 5CEQA 5A6OA 5CAPA 2R3QA 2OJJA 3R0TA 3NUYA 3MJ1A 4QT1A 4DH8A 2ITQA 2YJSA 3I5NA 5HZNA 4X2GA 3O7LD 5E8TA 1Q41A 3UQFA 1A48A 3NNUA 4DFXE 2XYNA 3BWFA 4EOSA 5H8EA 4RIXB 3D5UA 3QX2A 4HGSA 3SOCA 2R3NA 3TUDA 2UW0A 3LE6A 3PZEA 4FV9A 3WBLA 1GOLA 2W1ZA 3DAKA 5B2LA 4GT4A 4IBMA 3O7LB 4HNFA 2XNOA 5TE0A 2J5EA 2WELA 2VTIA 3VBQA 3MS9A 5C4KA 2WD1A 3QKMA 3Q9XA 3QWJA 4V04A 3FMKA 3OUKA 4IVCA 3RJCA 4O96A 2ITOA 4FT3A 4AT4A 3L8VA 4KUJA 5HBEA 3IOPA 4BDHA 4YC3A 3V5QA 1FINA 3RAWA 2ITUA 3AT4A 4JNWA 2OIDA 2R3FA 3FXWA 4YPDA 4BF2A 4F1TA 4FT0A 3COKA 3MVHA 4F0GA 5IDPA 2VAGA 3Q4TA 4XNEA 5HKMA 3OUNB 3A7GA 2VTSA 4BWKA 4MCVA 3RBWA 1GAGA 4WKQA 1TQPA 2RKUA 3ORPA 4FOBA 4FVPA 2B52A 3KFAA 1SVEA 1NVRA 3MY1A 4RJ4A 4PNKA 5AX3A 4YR8A 2W1HA 3RM6A 2QOCA 5CSWA 3EN7A 3II5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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