1OJXA

Crystal structure of an archaeal fructose 1,6-bisphosphate aldolase
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
publication title Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Thermoproteus tenax
total genus 88
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ojxA00
2Q8ZA 5CZTA 1SO6A 3DFOA 3HGSA 4PFMA 4LVGA 3PULA 4IXHA 2WSQA 2FJKA 3UXDA 3W75A 5D02A 3O07A 1G4EA 4HNTA 5KZDA 1XC4A 1XDMA 4IJBA 3Q37A 1ZAJA 1J2WA 3BG5A 1KFBA 2QCMA 3PVFA 1QCWA 3NQVA 4R33A 4Z0JA 3T55A 1SU5A 2CLFA 2QUTA 1SO5A 2UV8G 3G8EA 2CZFA 2Q8LA 3W7RA 3M41A 4AVFA 5LNVA 5F2GA 1I2NA 2C14A 3TX9A 4HSOA 4J9JA 4O57A 3CWOX 1IXPA 1UJPA 1TYGA 2QCEA 5EKYA 1TJPA 1GJPA 1ZAIA 4JTGA 2XN2A 4WOQA 4PL2A 2DP3A 2DZTA 3RU6A 1A50A 3FJLA 3PR2A 3PB0A 2CLLA 3S1XA 5MHBA 1KW1A 1UUOA 4JTIA 4UNKA 2Y89A 2JGYA 3DFQA 4I7VA 1KM5A 4JX4A 2O7QA 2NUYA 5K9DA 5KINA 1TRDA 4RZ6A 2E68A 3B04A 3FA5A 4AAJA 3HG5A 3BV4A 3WFAA 4L4MA 2J6XA 3G8RA 1Z48A 3C2EA 3ATZA 5IM51 3PM6A 5K2ZA 4HPJA 2X30A 2YX0A 4XKYA 2V81A 4E0CA 1OYAA 1O95A 3EX3A 3L0GA 1W1ZA 4O54A 3KFTA 1TTPA 4KFNA 3WJWA 3FYOA 4OBTA 1KBIA 2NWRA 5L9FA 2QUVA 1HO4A 4HIBA 2BZNA 1LROA 3DH7A 4MVAA 2WSYA 2C6QA 4FXSA 4ZQOA 3K30A 4N02A 3UWVA 5HINA 3W1XA 3OEXA 3UWYA 5U7SA 2JKEA 1T8XA 4K8EA 2J9ZA 3LXAA 3IVSA 1FY6A 1D3GA 3W7HA 3P62A 3MP5A 2JKAA 4P2VA 4EWND 2TMDA 2QCGA 2YPIA 3KVMA 4Z1BA 1J4EA 3TQ0A 3W9ZA 3EXTA 2Y88A 4MY9A 3W7NA 4DELA 1ICSA 1QFEA 4O1CA 1EA0A 1FX6A 4JTJA 2Z6JA 4MY1A 2ZRYA 2A4AA 2PCQA 3Q2DA 2CLMA 5D2XA 2A6LA 2VFEA 1WYIA 1RZMA 2WKJA 2ZA1A 1O60A 4Q32A 3LLDA 4DPPA 1GVRA 3N14A 3CTLA 5DN1A 4GJ1A 3S1UA 1NAL1 1H61A 1H63A 1EB3A 3HBLA 3P67A 4O12A 4UMBA 1IIGA 2CZDA 4NXSA 5T26A 1AK5A 1VH7A 4RXFA 5AOUA 1DVJA 1K7FA 5D04C 5AHNA 4O1DA 3EX2A 1VHNA 4Z1AA 3EWYA 2QJGA 3OVPA 2Y85A 1WAUA 3QPZA 2HS6A 4M7SA 1LORA 1PE1A 3TUUA 2V8ZA 4MOZA 1KFJA 2NV2A 1GVQA 1HUVA 2E5BA 2CFFA 1MO0A 2ZRUA 3BG9A 2ATSA 4JS3A 1FQ0A 7TIMA 5LHFA 5DLCA 3SZ8A 3W2KA 4OHQA 4U4MA 3M5YA 1HTIA 3EWUA 3W1AA 4E2DA 3LV5A 3DBPA 1W3TA 3ZWSA 5AYXA 1WOAA 2HS8A 1TPEA 2FTPA 3JS3A 5AHIA 3LOTA 1QNVA 2Y62A 5CGQA 3LBCA 3W7QA 3NQFA 3N3MA 5LZLA 4NZFA 1D9EA 1M5WA 3HGJA 3L68A 3OVQA 3OHIA 2H90A 3W73A 1PHQA 4HN4A 4IQLA 1TPVA 5G4WA 1CW2A 2WSRA 3CIWA 4YLWA 3L65A 1OABA 5C2XA 1ZJIA 3BO9A 4I7WA 3EWWA 2EHHA 2ZZ6A 2X2GA 3GDRA 4WY0B 1KM4A 3M5VA 1F6KA 3SW6A 1P0NA 1SW0A 5BMXA 1LCOA 1PHWA 5CPNA 3B0VC 4LRTA 3IIZA 1HFBA 4P61A 3F1QA 1I2RA 3PB2A 4WD0A 1VRDA 5AHMA 3GKAA 4RCXA 3UPBA 2QUUA 3P8IA 1TTQA 3MI3A 1SFJA 5AYZA 3M47A 3NNTA 5K9XA 3BW4A 3LCWA 1QOPA 1XUUA 3M16A 2PRLA 4HSNA 4LRSA 5LGXA 2NXHA 3HPSA 3M7WA 1K7XA 4Z1DA 1JCLA 3KOFA 4FNPA 4RLIA 2A2IA 3MP3A 3LI0A 3W1PA 1C8VA 1OFOA 2DZWA 5BRBA 1YTEA 2C19A 1DQWA 3BPWA 1H5YA 2WO5A 2NLIA 2TRSA 3LTYA 3WK2A 3M5ZA 2VFGA 2J88A 3BLFA 3QW3A 5IBXA 3T4CA 3C56A 3MYOA 4FNTA 1BTMA 1KTCA 1YPFA 2GJLA 3N73A 3RLVA 5H91A 4TR9A 2YGYA 4LUJA 1K8ZA 4XZ9A 2B0MA 4OU1A 1K02A 4ALDA 2V9DA 4O18A 2NXIA 1UCWA 1R2RA 4NT0A 3MHGA 5U4NA 1L2UA 1N8FA 3PBUA 1WQ5A 1GZGA 5G5IA 1S5TA 4BFAA 4LS0A 3LCIA 1EP2A 1B9BA 1L6SA 1W3NA 2YR1A 1JCYA 2QDHA 2NZLA 1S3HA 5CPLA 1VGAA 3EWZA 4DF1A 3UWUA 4WY0A 3GR7A 3PG8A 1Q45A 1G4SA 1TJRA 2R94A 3W2JA 5D2WA 5FF0A 4LC8A 3W3OA 1FDJA 1M6JA 1VLIA 1ZENA 4AWSA 4UFJA 2JBMA 3KX6A 1AL8A 3S5OA 4C1KA 5F1VA 4Y96A 3MYPA 1JVNA 2V2CA 4QAIA 3HO8A 4D2JA 4YL2A 2CW6A 1N55A 4GC4A 3USBA 2F7FA 3HQ1A 3LXBA 3P81A 3IIPA 1OFDA 4HPXA 4NX5A 5DBUA 3QW4B 4W9TA 1T96A 2R14A 1R30A 4UCGA 4NVTA 3STGA 3Q94A 2RH9A 3V1PA 4LS1A 2NX1A 3W1QA 1GPWA 4N9EA 3HG4A 4UFIA 2BSLA 1K8XA 3HJZA 4N4QA 2E6DA 3O6CA 3THQA 1BKSA 3L67A 4JTEA 3W1MA 2OJPA 1JCJA 4JX6A 1SQ7A 1DORA 4IX2A 1THFD 3VKJA 4UFHA 4AB4A 1K8YA 4DQWA 1TTJA 4NZJA 4A2RA 2C18A 3IGUA 2VFIA 3B0PA 3TR2A 3W7LA 3IVUA 2X1RA 5FESA 3QSRA 1LOQA 3TSBA 2H8XA 3IEBA 5TBOA 2AGKA 3GKFA 1ME7A 4IWWA 3NO5A 1H7RA 1J5TA 1XUZA 3GX9A 3P74A 4GUFA 4OE7A 4RXGA 5DCDA 2JK2A 4EF8A 3PSWA 4NU7A 4NJKA 3JR2A 3TIMA 4BR1A 3N2XA 1JUBA 3NYZA 3H55A 4NJHA 2WJZA 3BG3A 2W79A 4UMCA 1ZALA 3LLFA 5C6MA 1XKYA 1RVGA 4HNNA 1TPC1 3R2GA 3W86A 4WX2A 1ALDA 1AMKA 1BEUA 1YPIA 1LRTA 4OWGA 2QF7A 1H62A 4GUHA 3R5EA 2ZZ2A 3CPRA 3QC3A 1FCQA 1A5AA 4K7VA 3W83A 1XXXA 3OA3A 4N6EA 5CPMA 2R91A 2KZHA 5CZ0A 1TREA 2B7NA 3T78A 4NNBA 4LVFA 1R46A 4JTFA 4MKNA 2E6FA 1H7NA 1ONRA 1TQXA 2ZBTA 1YLVA 3O8AA 1EUNA 1B3OA 1EPXA 1TPFA 3NPWA 1ME9A 1DJNA 3VNDA 1SO4A 2YXGA 3V75A 4NQ1A 1QWGA 1MXSA 1EIXA 3CIXA 1LOSA 2QJIA 3C2RA 3KVLA 4DO4A 3PWAA 5DELA 4X2RA 3I65A 1RR2A 1L6YA 1KV5A 1SUXA 3NM1A 2XN0A 2WPBA 2E5DA 5D33A 2V30A 3MHFA 3M0ZA 3P5ZA 4UTWC 5AHEA 1TPDA 2DZUA 4LTSA 4C1LA 3STEA 3TK7A 5I3FA 1ICQA 5HUPA 2NXGA 4WXZA 1JR1A 4FNSA 1TPWA 4JN6A 4UTWA 3T44A 1TV8A 1PVNA 3LBMA 1KFCA 1YDOA 2GQ8A 4TO8A 3W85A 3ABSA 1S5WA 2V2DA 3IIVA 2CLOA 3ZFHA 2D73A 3NOEA 3DKLA 3QM3A 1B4KA 1TB3A 1VC4A 3PG9A 3L5MA 4O50A 3DGRA 2JGQA 1JQXA 3CQ0A 2RHGA 3R12A 1X7FA 3DHDA 5C5YA 4O1AA 3H53A 4M5PA 1W31A 3I6RA 4ONVA 1MZHA 1M7PA 5DCEA 3VE9A 3GDTA 3LTPA 5HNRA 3CHVA 1GT8A 3EX4A 3VI2A 4XBSA 3O06A 3CEPA 4L4LA 1Z42A 2TYSA 3N9SA 3LM7A 1PS9A 4LC6A 2NV1A 4MLJA 2YCEA 3HPZA 3G3MA 3DI1A 1AL7A 3IRDA 2FB3A 3LDVA 3DI0A 1HO1A 3W72A 3M6YA 2OCZA 2P10A 1H7OA 3LCHA 2QAPA 2A21A 4TU1A 4ORMA 4IMCA 4DO6A 3W1NA 3PBVA 3R13A 3DAQA 5J5RA 1RQHA 4IMEA 4MZ1A 3NVTA 2GVGA 5D2TA 3OIXA 3QQ1A 1PL9A 3CB8A 4UIOA 3NZRA 1X1OA 3NQMA 1LM1A 3NQ6A 3NPVA 5LNUA 2GVJA 3O1NA 2A7NA 3W7EA 4CQ9A 4MFEA 3W23A 4Y8FA 4UUIA 1YXDA 1I8JA 3M1ZA 1SPQA 1L9WA 2QCFA 2YW4A 3S1WA 1GG0A 2GQAA 5FEZA 2BWGA 2WNZA 3G18A 3KAOA 2FPVA 4O19A 3G1FA 4Y6GA 5D32A 2CLIA 2G5WA 1JULA 3GNDA 5K4XA 2FQIA 5D30A 3LRKA 3UY8A 3CC1A 3QMSA 2E09A 1QO2A 3UWWA 3A5FA 1AW2A 2PURA 1OVDA 2GVLA 4O17A 2WOQA 4DF0A 3UZ5A 1Y0EA 4NNAA 3QPYA 4ADSA 3UY7A 4RZ4A 4LVAA 5F2IA 2FIQA 2VEIA 2DZXA 4JTHA 1FWRA 3TU9A 5KTLA 3O05A 1XBZA 5BNKA 2QJHA 3NL6A 4HKPA 1XL9A 1H7XA 2V82A 2ABBA 3W6YA 3T7VA 4JGDA 4GUIA 1RD5A 4K39A 1W5NA 4MUZA 3TROA 3TQKA 4UTLA 2BLEA 1VYRA 3N9RA 4PCFA 1H60A 3TH6A 3TDFA 1UBSA 1RPXA 1LDCA 1TSIA 1M7OA 2NWSA 1DKWA 3W76A 3ABRA 4FNUA 2Y6ZA 1KFKA 2ZRXA 1W37A 3QFEA 1JQVA 4H3DA 5HR6A 3W88A 1VJIA 3RMJA 1VQTA 2QCCA 4XTIA 4R34A 5SWUA 3CWNA 1KM0A 1KM1A 2B7OA 3PY2A 3BW2A 4A3UA 5J5DA 1QPNA 3AJXA 4CQ8A 1P5BA 3W71A 4H6KA 1T0OA 2ALDA 3I7QA 3P80A 3QYQA 4NNCA 3NPXA 1UUMA 2QCLA 1SZFA 6TIMA 5EBUA 3U6WA 1FUYA 2VENA 3F03K 2V2HA 3FKRA 4MLRA 4AF0B 5F4XA 1SSGA 4ICNA 2FFCA 2C0AA 1I45A 5DBTA 1OX4B 1OYCA 3FOKA 4JYFA 3H54A 1O5KA 3B0UX 4XUGA 1X8FA 3P5YA 4WJEA 3EWBX 4Z0SA 3E96A 4O0ZA 2Y61A 4YMZA 5HUOA 5TQLA 3LX9A 1VR6A 4O53A 1LOLA 5FEPA 1X6UA 1B57A 3IV3A 3LXCA 4Y9AA 1I4NA 2AAMA 4Y90A 4CNNA 3UNDA 5HWNA 3W84A 2ZA2A 4FXRA 1SSDA 3GDKA 4LVBA 4KWVA 1KLZA 1YXYA 5I3JA 4N9DA 1ZAHA 5HULA 4R53A 4ZQPA 3LRMA 3G1HA 5G2IA 3UQNA 1EWEA 3B03A 3HB9A 1EX5A 4WOZA 2A7PA 2RDUA 4UFLA 4KFPA 4TIMA 4DBEA 5LNSA 4S2BA 4N2YA 1H1ZA 2G96A 3SY5A 3LHZA 4I7UA 1OX6A 2VELA 3S5NA 3NQ7A 1G6CA 2Z6IA 2GJNA 3GK0A 3S9YA 2ZRVA 1LBFA 1N7KA 3B05A 4MZYA 1L6WA 4HNVA 4PH6A 4RR4A 1DHPA 3LCLA 1XCFA 2J9XA 1F6PA 2W6RA 1KFEA 1TRIA 4LVDA 3GDLA 1K7EA 3A23A 2ISWA 1F7BA 1JCMP 2C1HA 3YPIA 1GWJA 4RZ5A 5D2YA 5F2MA 1IXNA 2I9EA 3NG3A 4IGHA 4B5NA 3BARA 1AG1O 2DZPA 5D05A 1XM3A 3L0KA 5HJLA 3SSJA 2BXVA 3NA8A 3G22A 3LGEA 3EX6A 4XWUA 5IBXC 4AF0A 1IF2A 3BK0A 1TQJA 4RV8A 3STCA 1OX4A 2QKFA 5E0KA 1G4PA 3S1VA 4O8RA 3TCEA 1U5JA 5D09A 3NQ8A 2Z1BA 4U28A 1OFAA 4LS2A 5CG7A 4R7JA 4UTJA 2ZDRA 4TMCA 3UWQA 4N6FA 4M6VA 1GQNA 3TW7A 5AYYA 1KM3A 4JTSA 4O1BA 2QR6A 4CCDA 5KITA 1H7WA 4LNYA 2DZSA 1LYXA 2PC4A 1WDWA 2I1OA 3NQEA 3P84A 3ZS4A 2YYTA 3P60A 1GEQA 4M19A 1F5ZA 1HL2A 1Q6OA 3EEGA 2HSAA 1RV8A 2IQTA 1RQEA 3S8HA 1HG3A 3W7CA 3M44A 5AN7A 3TQVA 3B06A 4AH7A 3N34A 2RKXA 4PC8A 4OGZA 3W22A 1QPRA 2HMCA 2CZ5A 3PUOA 2EGZA 2Z0IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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