1OK4A

Archaeal fructose 1,6-bisphosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
publication title Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Thermoproteus tenax
total genus 90
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ok4A00
1C8VA 1KBIA 1R46A 1Z44A 1ZENA 4XBKA 1D9EA 2V5LA 4JX4A 4RXFA 2GJNA 1B4EA 1W3TA 1PHWA 5CZJA 1FCQA 2QCHA 3QW4B 3IGXA 4AVFA 2PCQA 3ABRA 5LZLA 2QCGA 4HIBA 2NLIA 2TRSA 3NYZA 4RZ4A 5HMSA 2JGYA 3TC6A 1TPDA 3LCGA 3W22A 3QF0A 2QUTA 2QCDB 4O0ZA 3QSRA 2YW3A 1Q6QA 4Y6GA 3B4UA 4LWWA 1ZALA 3W1QA 2NX3A 2B7PA 2OZ0A 3DU0A 2RDTA 2GOUA 4I7WA 3G24A 5CKSA 4DPQA 3RU6A 1H7XA 1R47A 3W7MA 3SI9A 2GQ9A 4O10A 1GVQA 1H7PA 4JGDA 3HG5A 3PS7A 4CNPA 3RF9A 3GNNA 4LTSA 3GDTA 3UNDA 4AWSA 2WOQA 3EX2A 1KM6A 2A21A 4UTIA 1K8YA 3B0PA 2PRLA 1GTHA 3LOTA 1IIGA 3MHFA 1EA0A 2WQPA 1AL7A 1KFKA 4PTNA 5CPOA 5TIMA 2ALDA 1MSSA 4DXVA 1Q6RA 1VHCA 4UTKA 5LHEA 2DP3A 3LXCA 3NGJA 5E0KA 3EWUA 4DEFA 2R8WA 5FF4A 4KFPA 3C2RA 4JTHA 1VR6A 4XQ6A 4JD4A 5K4ZA 4XZ9A 2GQ8A 4UR7A 5MHBA 2NUWA 3A9IA 1L2UA 2H6RA 3MHUA 4FEZA 4H6KA 2QAPA 4YXGA 4GWEA 4UNLA 2VENA 1G4TA 3NQEA 5TBOA 2ZZ2A 4JTIA 2J9XA 4YMZA 3EX1A 3DKJA 4TO8A 3LCXA 3S42A 3DFNA 3P8JA 1TMHA 1I4NA 2ABAA 1TPFA 4QITA 5IBXA 1G4PA 3ATYA 1KM1A 1YTEA 4CCCA 3FKRA 2VXNA 4DF1A 4JX6A 4MPQA 3DXIA 3W23A 2B7QA 3CB8A 3L5AA 3P5YA 3TC7A 4EVZA 1T0OA 3G8RA 1XKYA 1XBZA 2YYUA 5D37A 5K9DA 3V1PA 1VCFA 3T40A 3MHGA 1GVRA 3QJAA 1AMKA 3W7CA 4DO6A 1XL9A 4O4WA 3DHFA 4RX0A 3UXDA 4N9BA 4O8RA 2WPBA 2C16A 2WO5A 3M5ZA 1TQXA 4JNMA 2ZZ5A 3BLFA 3TH6A 4ML9A 2OX1A 4NZJA 1YTDA 4OGZA 1I2OA 5C6MA 2Y7GA 3HIJA 2IQTA 1G6CA 1U5JA 2X30A 4CQ9A 3QZEA 1EX5A 4FNQA 3W71A 1PE1A 5LGZA 3P5ZA 5HNRA 4YWIA 2ISVA 1LBFA 5FF3A 4LNYA 4O0KA 4TR9A 2A1YA 1C29A 2OT0A 4PL1A 1B3OA 3N14A 3QQ0A 1VQTA 1RVGA 3KOFA 3M16A 3STGA 1SZFA 1S5WA 3O6DA 2Q8LA 4N6EA 1YXDA 4FHAA 2J27A 5LSMA 3W7EA 1R30A 3MBDA 3GX9A 3JR2A 3ZR4A 1ME7A 1EEPA 4DQWA 3L0NA 3Q2DA 4Z08A 5T26A 1GVOA 3CIWA 4AXKA 5IBXC 1IXOA 3PF3A 3LLDA 2G5WA 2RH9A 3R2GA 2BLEA 4XTIA 3B8DA 3UXAA 1PCKA 4BFAA 3ATZA 5CPNA 1KBJA 3O63A 3IIVA 3QEZA 5L9FA 1OJXA 3PWAA 4ORMA 3QC3A 1F6KA 5I3FA 1VHNA 2VEMA 3NQVA 4PODA 1TCDA 3WJXA 3FOKA 1ICSA 3LHYA 3NQDA 3W1UA 1H50A 1JUEA 4AF0A 1OHLA 1IXPA 4LU0A 4LS2A 2EHHA 1P0KA 3UWQA 2XN1A 1TTPA 1FCBA 4AAJA 5CSRA 4I7VA 3QMRA 2P1FA 3CU2A 4GFSA 3PM6A 3AJXA 1ZHAA 4QQ3A 1HO1A 4A3UA 1OX5A 1VS1A 3FYPA 4JICA 1FCUA 1JCJA 3RLVA 4DF0A 5DCDA 1KTCA 1NAL1 4J9JA 2CZEA 2CLLA 1VCGA 2HS6A 3S1UA 4BWLA 5LHFA 4GUIA 1AK5A 2CLFA 3TSDA 4BI7A 4U28A 1P0NA 3USBA 3NG3A 4FXSA 3W1PA 4P2VA 4ZVJA 1ZCOA 3MWAA 4HHPA 1XM3A 4DELA 1VH7A 4JTEA 1GJPA 4EWND 3FKKA 1WA3A 1H1YA 3JRKA 4ZL1A 1SFLA 2XFWA 2FB2A 5BNKA 2G95A 3G0UA 3TDFA 3S1XA 3Q94A 3W3OA 1NVMA 2C0AA 1G4SA 5I3KA 3W7QA 5AYXA 1XDMA 4PH6A 2XN2A 2NXIA 1W3NA 2ISSA 1FWNA 3UZJA 4PC8A 1HL2A 2YFOA 4TIMA 1WOAA 3HG3A 6ALDA 2A6LA 3NL5A 4CQ8A 4LT9A 1JULA 3T7VA 1W56A 1CX9A 1DQXA 1LLZA 4EIVA 3M5VA 3JS3A 1YDNA 2YR1A 3KVJA 4IMDA 5EMUA 1IXQA 3S9YA 2GPTA 1TPUA 3QFEA 4WY0B 3UWZA 3QYQA 1Q45A 4ZQMA 4UTHA 5C5YA 1I8JA 3HPZA 1QPQA 1JCXA 4POCA 3BGGA 4M7TA 5A5WA 4PEKA 2BZNA 3W7OA 4MYAA 3VNDA 4C1KA 2DJXA 2YW4A 3WJZA 4NXSA 2H90A 3MUXA 5FF7A 3W83A 5BMWA 1ALDA 2W79A 4FXRA 5KSWA 3QMTA 4Z1BA 4BWLC 3SFKA 2GVGA 1KFCA 4LRTA 3SSJA 3W6YA 3IV3A 3M43A 1XBYA 1W5NA 4LS1A 1WAUA 3V75A 4S2BA 3EXTA 4UTTA 5AHLA 2YYTA 2EPHA 3F1QA 4WUIA 4LVGA 1ONRA 4AB4A 3SR7A 4K8EA 5HINA 2B7NA 3WK3A 1EUAA 5DLCA 3ZFHA 4HSNA 4Z0SA 3HO8A 3NQ7A 3HBLA 3NQAA 1P4CA 4JDBA 1JCNA 4NJHA 1JCLA 1LCOA 3PUEA 2VFDA 3L66A 4UTJA 3SGUA 3U8GA 1W1ZA 5LNWA 1YADA 2QUVA 3FS2A 3PVFA 2QCNA 3F03K 1W8SA 1RPXA 4IGHA 4JTGA 3TROA 3B0UX 1ZAJA 2BSLA 3OVQA 4Y9AA 3OHIA 1J4EA 5U7SA 4LC8A 2E6DA 4GUGA 4IX0A 4MLRA 4AWUA 4B5NA 5K9XA 3HOJA 1SR9A 2NXHA 1PCWA 3BG3A 5F1VA 1KTBA 2KZHA 4LRSA 3W7RA 3ABOA 1XXXA 4AF0B 4YLWA 3MP5A 5H91A 4H4IA 3LBCA 3M0ZA 4A29A 1F73A 4N9EA 3O06A 3IGSA 1KM5A 3VI2A 5D2YA 5FEPA 2CW6A 1GTEA 4FB7A 3W73A 1BTMA 3UD6A 1ZFJA 1DJNA 2YZRA 5A8GA 1JRCA 2V2HA 5CG7A 2CLIA 4ICNA 1W31A 1YYAA 2HSAA 2NWRA 3M41A 1ADOA 4HPXA 3TCEA 2CZDA 3EX3A 4WXZA 3CIXA 4NJJA 1UUMA 3KHJA 4Z1CA 1LBLA 4DO5A 2NUXA 4XUGA 1GG0A 3MYPA 3G22A 4MKNA 2Z6IA 3GAKA 5DBTA 4S1FA 5G2WA 5F4WA 3O6YX 2B7OA 2J88A 4JTTA 3LB0A 4OQVA 3MW7A 4OBTA 2WJZA 2E5DA 2FJKA 4IXXA 3BG5A 1OFRA 3LRMA 4A2SA 3WFAA 2NV2A 2V0TA 2CLMA 4KWWA 4UTTC 3M44A 4JTLA 1GEQA 4WQ6A 4JYEA 1P5BA 4N4QA 3ELFA 1E51A 1I2PA 2I1OA 3NO5A 4AWTA 4NX0A 3DGRA 1JQVA 1T99A 4KFOA 4O50A 1WQ5A 2X1RA 3NM1A 5LKYA 3PY2A 1H7NA 3M47A 2QCFA 3VFLA 4OV4A 1R2RA 1OYBA 3GKAA 3U6WA 3LRKA 2Z6JA 2AGKA 3ABSA 2VFFA 2CWNA 3R12A 4UUIA 4HNUA 4O16A 3I7SA 3L5LA 1O5XA 1XCFA 5CZTA 1MZHA 2J24A 2QJGA 2VEPA 4O13A 3W07A 4GUHA 1MXSA 3GDMA 3HPSA 1FWWA 1XFBA 3LHWA 1RV8A 5EKYA 4IPJA 1DBTA 4M5PA 2YX0A 3P81A 1XDLA 1BWLA 3EXRA 2ZYFA 1W5OA 2A7PA 3SECA 3DFTA 4UFHA 5E1QA 3YPIA 4K36A 2A7RA 4UFLA 3PBUA 5AC6A 3HGOA 5AB3A 1O94A 5D09A 4WJEA 5HWMA 2WSQA 3NL3A 2TPSA 4HPJA 4GE8A 1WX0A 3W88A 4JX5A 1W5PA 1OABA 2X1UA 1FBAA 4IMGA 1SW3A 4Y96A 3B0VC 1H5YA 1KM3A 4O4VA 2ZZ3A 3VCRA 1KA9F 1QPRA 2E5BA 4LV4A 2RDWA 2W6RA 2ZRWA 2QDHA 3S5NA 1G4EA 4JEQA 1YDVA 4O28A 3L5MA 3DAQA 4CCEA 2HTMA 3B04A 3VE9A 2JKPA 2P0OA 3BW2A 2B0MA 3G1SA 1H60A 1H63A 1SW7A 4E0CA 1BKSA 1S5TA 3S8HA 1H7OA 5H2ZA 1T8XA 2C15A 3FLUA 1PHQA 3C56A 3TW6A 1VRDA 4DBEA 3S5YA 2C14A 3TNOA 3O1NA 4N9CA 3W7NA 4WD0A 3DFPA 3WK2A 1FDJA 4QISA 5AYYA 5AYZA 1EWEA 4LC6A 3G8EA 4N6FA 3W7PA 1NSJA 4LVBA 4MFDA 3DI1A 2YCEA 1DOSA 2NUYA 3N2MA 3LCIA 5CGQA 5C54A 3GDLA 4M6PA 3ZWTA 5LNSA 1VLIA 3EKLA 5DCBA 4LS0A 3W1XA 1THFD 1UASA 3W1NA 2D73A 4X9SA 3FYOA 4FIQA 3D0CA 1JUBA 1DV7A 3NA8A 1JCYA 4UFMA 1FX6A 3R5EA 3C2FA 2Z0IA 4Z1DA 4NJGA 2QCCA 4U4MA 7TIMA 1GWJA 3S1VA 2VFIA 2BWGA 5ABTA 4O19A 3LV5A 4JR5A 3PB0A 3RLUA 2E6YA 4WY0A 2QJHA 4UMCA 4NJIA 4HNTA 4JTJA 1GG1A 1YTKA 3W76A 1RR2A 2DZVA 1QMLA 1PVNA 2ZZ7A 3GR8A 3MI6A 4O53A 1RQBA 3WK1A 1I2NA 3G1DA 1SZGA 1OK6A 4RCXA 5F2MA 1C9DA 1LZOA 5LNVA 1F05A 3A24A 1L6SA 1ME8A 2C6QA 3A5VA 1EB3A 4I9AA 5K9CA 5E93A 3P61A 3M7WA 1DKWA 2QUUA 3M5XA 4QIUA 3NPXA 4QNEA 4K39A 2ZZ1A 1SZEA 4JS3A 3UWVA 4JY9A 1WYIA 5I3IA 3W7GA 2QAFA 3WJWA 2OCZA 1QPOA 1WBHA 3BPWA 3GAYA 1CW2A 2J9YA 3PULA 3KVMA 1FDZA 3QPYA 2X2GA 1VJIA 4DO4A 4IOTA 2V82A 4AHPA 4UIOA 1EP3A 3LX9A 2GJLA 4ZMGA 2A5HA 3TAKA 1K03A 2H3DA 1TPEA 4RR4A 1X6UA 1SZNA 3BV4A 1LOSA 1FWTA 3W1MA 3NQ6A 5KZEA 1SO4A 2AQWA 2VELA 5GVJA 3KVKA 2A6NA 4O1BA 2FDSA 5FESA 4TU1A 3IGUA 3PC0A 4AEOA 1A5CA 3KX6A 4LUIA 2VC6A 2UV8G 4JY8A 4MVAA 1ZAHA 3RFAA 2V2DA 4MJMA 4YL2A 2HS8A 5AC7A 4Y90A 3C3NA 2FB3A 3NM3A 1VYRA 3HMJG 4FX8A 1YPFA 4OHQA 2WKJA 4MJZA 1LOQA 1QR7A 2ZRZA 3BGJA 2E1DA 4K7VA 1KM0A 1OFQA 2ISWA 3GR7A 1OFBA 3W7IA 3VKJA 3HG2A 4TMCA 1QPNA 3GKFA 5LNUA 3M1ZA 1SO6A 4O1AA 2TMDA 2ZCGA 4JTSA 4L4LA 1LRTA 2C3ZA 4MLJA 5BW6A 3W2NA 4WZHA 4JIPA 4UTWA 4TMBA 2EKCA 1KFBA 4OE7A 3K30A 1M7PA 2PE4A 2DZUA 3SZ8A 4LW7A 3UPWA 5HQEA 1UB3A 4ADUA 4UFKA 3M5YA 2NWSA 4IUOA 3M6YA 2E77A 3UWUA 4R7JA 4LUJA 1JJKA 5K4XA 1D3HA 1QFEA 1DHPA 4RZ6A 3C52A 4CQAA 4QSHA 2NX1A 3PAJA 1OF6A 2QCLA 3IIXA 4RXGA 2EF9A 2BXVA 2DORA 3QM3A 2CZFA 3QW3A 5C55A 3LRLA 4DBDA 3EWZA 2C1HA 3P62A 4A22A 1Q6OA 4ALDA 4HNVA 1W5MA 3W9ZA 3TE9A 3LTPA 4E2DA 3LTSA 1F2JA 1WOBA 2DZXA 4FNRA 4UFIA 3W2MA 1D3GA 3TIMA 5CZSA 3BK0A 4K7YA 1QDSA 2Y6ZA 4IMEA 1DVJA 2DU2A 3SY5A 1X1OA 5AFDA 1ZY9A 3GYEA 3FA5A 3W7KA 2ATSA 3C8FA 3NQFA 3W1LA 3IVSA 3TJLA 1G69A 3EX4A 3S0CA 1RQEA 5D32A 3IRDA 3CHVA 3W1TA 1G67A 1PL9A 2GUUA 4FF7A 1B57A 3QSTA 4G1KA 4UXDA 4MY9A 4GXMA 4N02A 4IX2A 5D2VA 3LHUA 1R2SA 5DXXA 4I7UA 1PV8A 4S2CA 3LGEA 3W75A 1LROA 3E49A 1NEYA 3NZRA 1EIXA 4UR8A 4UTWC 1LM1A 3FJ6A 1RZMA 3IIOA 2ZBTA 5FI8A 3DKLA 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 5BRB A;  1WV2 A;  1VPX A;  1W37 A;  2H8X A;  4HNN A;  3KVL A;  1YLV A;  1KFE A;  2QJI A;  3NOE A;  3WJS A;  3N3M A;  5L6U A;  1OFO A;  4LVD A;  3I65 A;  3GB6 A;  4WOQ A;  3LHV A;  2ZFA A;  3S5Z A;  1ICP A;  1T96 A;  2VFH A;  3NNT A;  1L6W A;  2CZ5 A;  3FFS A;  4MY1 A;  1BEU A;  3F4W A;  3TAO A;  1TTI A;  5F2L A;  3SGZ A;  4FX7 A;  1KV8 A;  2X16 A;  4E38 A;  3EWY A;  3I7R A;  1LRN A;  1WXJ A;  5D2X A;  2I9E A;  3NR0 A;  1JCM P;  3QH2 A;  2DZW A;  3DI0 A;  2OMA A;  1XC4 A;  1RD5 A;  1SSD A;  3BO9 A;  4O15 A;  3C2V A;  1DOR A;  5DY3 A;  4ZQO A;  2E6A A;  1FQ0 A;  1QO2 A;  1TTQ A;  5D02 A;  3DFO A;  3C4U A;  2ATM A;  2GQA A;  2V5B A;  3SW6 A;  1HFB A;  3GK0 A;  3W84 A;  2A85 A;  4OWG A;  4O52 A;  1TSI A;  3B06 A;  1ZAI A;  3G0X A;  1SSG A;  1M7O A;  3O15 A;  1VGA A;  5HWN A;  1VZW A;  4ZQC A;  4IPI A;  1O60 A;  4RK8 A;  4O17 A;  4E2B A;  1A50 A;  4NZF A;  4QJ1 A;  3NL6 A;  3Q37 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UKQ A;  4D9P A;  1C8V A;  3A4A A;  1PTG A;  1B4E A;  1JIB A;  1FCQ A;  4J4K A;  3QW4 B;  2JE8 A;  3ABR A;  1EKO A;  4PBF A;  4Q8W A;  3B97 A;  4KGL A;  1TPD A;  1QUM A;  3LCG A;  1PUD A;  4LF2 A;  2QCD B;  1QAT A;  1PYM A;  3NIY A;  4LWW A;  2QXW A;  5IDZ A;  2Y8K A;  3W1Q A;  3VD7 A;  2NX3 A;  2OZ0 A;  2FH6 A;  3IK4 A;  1B5T A;  1GUV A;  3KS5 A;  2XUC A;  1AH4 A;  3VKD A;  3RF9 A;  3GNN A;  4Y9M A;  3GDT A;  4AWS A;  1R9Y A;  2UZ9 A;  3FAW A;  1K8Y A;  2BVY A;  3LOT A;  2UBP C;  5IXE A;  1EA0 A;  2HE5 A;  5FJU A;  1J0I A;  1AL7 A;  3K4W A;  1KFK A;  5TIM A;  2HRO A;  2ALD A;  4DXV A;  3V1H A;  1J96 A;  5E0K A;  2PGW A;  1U33 A;  4DEF A;  3CHE A;  3QOK A;  1XIE A;  4JTH A;  4JD4 A;  4JKL A;  2REQ A;  1V3M A;  4XZ9 A;  5CLT A;  2VTF A;  1RA0 A;  4GXW A;  1L2U A;  3SCN A;  1YBQ B;  4MWA C;  1DXE A;  1CB2 A;  3JU2 A;  3APG A;  4NAE B;  3DG6 A;  1AQF A;  2EEX A;  4YMZ A;  3ANV A;  4B2D A;  3LCX A;  3FW6 A;  3M4H A;  1FH8 A;  5IBX A;  1GW1 A;  3DIP A;  1AJZ A;  3ARO A;  1YTE A;  4RNI A;  1D8C A; 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 4EXB A;  4IH3 A;  3WJX A;  1IWP A;  3LHY A;  4R7O A;  3W1U A;  2D23 A;  1JUE A;  1OHL A;  1IXP A;  4ZOA A;  1QVB A;  2Z1X A;  4AD1 A;  3OYX A;  3PM6 A;  3AJX A;  1ZHA A;  2VZU A;  3VZX A;  2BHU A;  2WZI A;  4UQE A;  3FYP A;  1EXP A;  3CUG A;  1HKV A;  4DF0 A;  1OT2 A;  2GUB A;  3VGH A;  1VCG A;  4LQ1 A;  3S1U A;  2V3E A;  2DZA A;  3L2M A;  1F3T A;  1AK5 A;  4XZL X;  3QN3 A;  3P14 A;  3CHF A;  4P2V A;  5I03 A;  2OZT A;  4HHP A;  1XM3 A;  1VH7 A;  1DXF A;  4KCW A;  2Q8X A;  1WA3 A;  1H1Y A;  3BMW A;  5A6T C;  5BNK A;  2G95 A;  1Q63 A;  3TDF A;  1NVM A;  1ADD A;  2XN2 A;  2NXI A;  3S9Z A;  3ARU A;  4LUS A;  3E3H A;  2FZ8 A;  1TZZ A;  1UWS A;  3HG3 A;  2OG9 A;  2ZX6 A;  4F0K A;  5I23 A;  4CQ8 A;  3RR4 A;  4IQD A;  1CX9 A;  1CLX A;  1SGJ A;  4EIV A;  1YDN A;  4H19 A;  4JQ4 A;  5LIX X;  2RDX A;  1EDG A;  1IXQ A;  4LCQ A;  1TPU A;  4AZH A;  3VGD A;  1EJ7 L;  4QHR A;  3QYQ A;  4ZQM A;  1ECE A;  4YTQ A;  3OVG A;  4UTH A;  5C5Y A;  1URO A;  3ARS A;  1Q6D A;  1TV2 A;  1Z8A A;  4M7T A;  3HFY A;  3WD2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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