1OKMA

Carbonic anhydrase ii complex with the 1okm inhibitor 4-sulfonamide-[1-(4-aminobutane)]benzamide
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure-based design of a sulfonamide probe for fluorescence anisotropy detection of zinc with a carbonic anhydrase-based biosensor.
pubmed rcsb
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1996-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1okmA00
3V3IB 4K13A 3DV7A 3M1JA 2H15A 3OIKA 5L6KA 1CA3A 3CYUA 2NXRA 3M2XA 1CVBA 1KWQA 4X5SA 4GL1X 1Z93A 5FDIA 5EH7A 1CAHA 2HL4A 4QIZA 4BCWA 1URTA 4RFDA 5CA2A 4CA2A 3NJ9A 4YYTA 1BNUA 3IAIA 4HT0A 5DRSA 1OQ5A 5E5RA 2EU3A 1ZNCA 4HU1A 1BICA 4RUZA 5A25A 5FNGA 4MO8A 1CVFA 1YO2A 4YHAA 3KNEA 3T83A 2HOCA 1TB0X 5G03A 1FSQA 3Q31A 4Q9YA 3DCCA 3S77B 1HEDA 4PXXA 4JSZA 4XFWA 3SBHA 5IPZA 3P4VA 4FRCA 4ZWZA 5SZ5A 2CA2A 3EFIA 5JEHB 1RAZA 4QK2A 3OYQA 3D8WA 3MNKA 3JXGA 3ML5A 4QJOA 4FL7A 5JEPB 5SZ2A 3HLJA 2ILIA 4CQ0A 1F2WA 5E2RA 5JEGB 4E4AA 1UGBA 1CCUA 1AM6A 5FDCA 3MHMA 1XEVA 1CNIA 1HCBA 5DSRA 3M1QA 4Z1NA 3LXEA 4MLTA 3U45X 4HF3A 3B4FA 3N2PA 3MHLA 3EFTA 3PJJA 2NXSA 5DSKA 2CBCA 2IT4A 4KUWA 2X7UA 1HECA 4DZ7A 1FSNA 2NN7A 3KLDB 1CVCA 4KNNA 4Z1JA 3W6HA 4L5WA 3DCWA 2NNVA 3F4XA 1TG3A 4HEYA 1MUAA 1G52A 5FLQA 2VVBX 4QJ0A 2CBBA 1UGGA 3S9TA 3D92A 5EHEA 5FLRA 3MNAA 5FNLA 3RZ0B 2POWA 2NN1A 4Q7PA 3V3HB 4RUYA 1LG5A 1YO1A 5DSMA 5FLPA 2FOYA 1G53A 2WEOA 3S78B 3MZCA 1THKA 1CNBA 2ABEA 1LGDA 3DD8A 1HEAA 3P44A 3U47A 4KUYA 3IBNA 4K1QA 1FQNA 2NWYA 3S97A 1MOOA 4Q0LA 3IBIA 3CZVA 1G6VA 4QJWA 1G0EA 4PQ7A 1G4JA 3MHIA 3OYSA 1FR4A 4R5AA 7CA2A 3RZ1B 3RG4A 4M2WA 3BETA 1XPZA 3MWOA 3M40A 4WR7A 1IF5A 6CA2A 3RYVB 1CVHA 2HFWA 5DOHA 1KOQA 2CABA 3GZ0A 3M5EA 3T84A 1H9NA 1KWRA 3DC9A 3SBIA 2WD3A 2NWOA 4Z0QA 3T5ZA 12CAA 1CNWA 5JDVB 3FFPX 1BN3A 5FL6A 1RZAA 3IGPA 5AMLA 4YXOA 4ZWYA 1BN4A 1KOPA 1LZVA 4KP8A 3M04A 3PO6A 5FLOA 3ZNCA 3VBDA 2Q38A 4ZWXA 3RYXB 4QJPA 4JSWA 3OILA 5CACA 2ZNCA 3CAJA 4YGFA 1BZMA 1AVNA 4FU5A 3RLDA 5BRUA 3IBLA 4KP5A 3MYQA 4KNMA 1XQ0A 4HEZA 2FMGA 1I90A 3D0NA 2FOQA 4M2RA 4Q8YA 4Q7SA 5DSIA 1FQMA 1BN1A 3HFPA 3NI5A 4XE1A 4BF1A 3KKXA 3MNJA 5FLSA 4C3TA 4YVYA 2W2JA 5SZ1A 3V2JA 2GEHA 4K0SA 1V9EA 5HPJA 3FW3A 3UYQA 3TVNX 4QK1A 5JQ0A 1G1DA 4COQA 3BL0A 5DSQA 1CALA 4WUPA 3KONA 1YDDA 2QO8A 3DVDA 1CNJA 1FSRA 1ZH9A 3RYJB 4KV0A 4QTLA 3DC3A 4Q99A 1G46A 3M3XA 1IF6A 3RGEA 4Q49A 4ITPA 2FNMA 4YGLA 2FOVA 3P3HA 3R17B 5BRWA 3TMJA 4RIUA 1CANA 5EKJA 3D93A 1G45A 1ZFKA 2VVAX 1DCBA 1OKLA 3HKNA 4LU3A 3V3GB 1BNNA 3V3FA 9CA2A 4M2VA 1DCAA 1TEUX 4Q78A 1CNXA 4E3GA 4CNWA 3HKTA 4IDRX 1TH9A 1HEBA 4XZ5A 1FQRA 5E2NA 3ZP9A 1KEQA 3RYYA 4Q8XA 1CAJA 3P5LA 1CAZA 5EHVA 4Q06A 8CA2A 5EKHA 5AMDA 3M2ZA 1G4OA 3DAZA 4G7AA 2HD6A 5SZ3A 5G0BA 5CJFA 5EH5A 3DBUA 1ZSCA 3HKQA 4KUVA 3M1KA 3KWAA 1UGCA 4YWPA 1A42A 4WUQA 2NXTA 4Q6DA 4Q09A 5BYIA 1RAYA 5DSPA 1ZFQA 5DSJA 3HS4A 1HUGA 3K2FA 3DCSA 5FL4A 2GD8A 5SZ7A 3V7XA 5C8IA 4Q87A 5SZ6A 1RJ6A 4DZ9A 3RZ7A 4ILXA 1TTMA 3NB5A 1LG6A 1CAIA 3D9ZA 1RJ5A 1ZE8A 5DSNA 2NWZA 2FNKA 3M1WA 4RN4A 4RUXA 5J8ZA 3RZ8A 3U3AX 5SZ4A 3M14A 4IWZA 3IEOA 4Z1KA 1I9QA 5DSOA 1I9MA 4TWMA 1CAOA 4CNRA 1IF4A 4M2UA 1G54A 1TG9A 1HCAA 5E2KA 2CBDA 2FMZA 3N0NA 4ZAOA 3HKUA 3OIMA 3RYZA 3W6IA 2CBEA 5EHWA 2WEGA 4Q7WA 1DMYA 2HKKA 1I8ZA 2NNSA 3RJ7A 5JG5B 4MDMA 3F7UA 3S73B 4KAPA 3N3JA 1CAMA 1CNCA 1JCZA 1H9QA 2WEJA 3M67A 3P5AA 4JSAA 1BNQA 4UOVA 5E5UA 1YO0A 1RZEA 3P3JA 4QIYA 4YGJA 3U7CA 2OSFA 4N16A 3S72B 1CA2A 4E49A 2POVA 3RZ5A 1UGAA 4Q90A 4MTYA 2FOSA 3K34A 5E28A 3M2NA 1DMXA 3DD0A 3B1BA 3P55A 1TEQX 2CBAA 2Q1QA 5DVXA 1BV3A 5JGTB 1CAKA 5A6HA 3FE4A 1IF8A 1CZMA 1TBTX 5JGSB 4E9OX 1CRAA 3KOKA 4ITOA 1ZSBA 5FNHA 1G48A 1CVEA 3JXFA 1CNGA 1BNTA 4FVOA 1OKNA 2Q1BA 1G3ZA 4QSAA 4HBAA 3V5GA 5FNJA 2H4NA 2X7SA 1FQLA 4TWLA 4CACA 1ZGEA 4R5BA 3MNIA 3S76A 4ZWIA 1J9WA 1IF7A 1HUHA 3MHCA 1CIMA 4QY3A 3L14A 1UGDA 1BNWA 1I9NA 3C7PA 3DVBA 4K0TA 4R59A 2POUA 4Y0JA 2OSMA 3ML2A 1RZDA 4JSSA 4FVNA 5LMDA 1V9IC 1I9PA 1EOUA 1ZSAA 3F8EA 5BNLA 3OY0A 2NWPA 4N0XB 1CILA 5L3OA 3PYKA 3R16A 1G0FA 2AX2A 2WEHA 4WW6A 4E3DA 1Z9YA 4Q81A 1AZMA 1YDBA 3T85A 3M5SA 4LP6A 1JV0A 4KNIA 3V3JA 5DOGA 5E2SA 1XEGA 5FNIA 1CAYA 3MNHA 4Z1EA 1FLJA 1RZCA 1OKMA 4MDLA 4CNXA 2QOAA 3N4BA 1Z97A 4MDGA 3SAXA 3KIGA 1IF9A 4ZX1A 4XIXA 2FOUA 1CNKA 3UYNA 4ETQC 1LUGA 3M5TA 3M96A 1YDAA 3M2YA 5EIJA 3KS3A 4FPTA 4QEFA 1T9NA 3MNUA 1CVDA 4LHIA 3S71B 3DVCA 1CINA 4RIVA 3SAPA 4RFCA 4QJXA 3V2MA 4E3FA 3S74B 5E2MA 5SZ0A 4QSJA 4WW8A 5EH8A 4JS6A 2O4ZA 1CRMA 4K0ZA 5EKMA 2WD2A 4YGNA 2X7TA 3BL1A 5AMGA 1CCSA 5DSLA 1H4NA 5FLTA 5FNMA 4Q83A 1RZBA 3MMFA 5FNKA 4Q6EA 1BCDA 3CA2A 3KOIA 3RG3A 1UGFA 1Y7WA 4RH2A 4QSBA 4QK3A 1BNVA 4Q8ZA 4HEWA 4Q7VA 4ZX0A 3IBUA 1JD0A 3MDZA 1FR7A 3MHOA 5JQTA 1I9OA 2NNGA 1CVAA 4L5UA 4YXUA 4PYXA 4Q08A 1I91A 3QYKA 3OKVA 2NMXA 3T82A 4Q07A 4WL4A 1TE3X 1YDCA 4KNJA 2NNOA 4L5VA 3K7KA 4QSIA 4CNVA 1CNYA 2FNNA 4XIWA 1ZGFA 2AW1A 3S75B 3T5UA 1UGEA 2QP6A 5EZTX 5FL5A 3TVOX 3JXHC 2FW4A 1I9LA 3S8XA 2EZ7A 4HT2A 4FIKA 5G0CA 4YXIA 4E5QA 4QJMA 5G01A 5JESB 2HNCA 5JG3B 4G0CA 4YX4A 5EOIA 5BRVA 4YGKA 1HVAA 1CCTA 4PYYA 1CNHA 3DA2A 4MLXA 3M98A 3P58A 4BF6A 4E3HA 4PZHA 2F14A 3OKUA 3F7BA 1BNMA 2EU2A 5CLUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V3I B;  4K13 A;  3DV7 A;  3M1J A;  2H15 A;  3OIK A;  5L6K A;  1CA3 A;  3CYU A;  2NXR A;  3M2X A;  1CVB A;  1KWQ A;  4X5S A;  4GL1 X;  1Z93 A;  5FDI A;  5EH7 A;  1CAH A;  2HL4 A;  4QIZ A;  4BCW A;  1URT A;  4RFD A;  5CA2 A;  4CA2 A;  3NJ9 A;  4YYT A;  1BNU A;  3IAI A;  4HT0 A;  5DRS A;  1OQ5 A;  5E5R A;  2EU3 A;  1ZNC A;  4HU1 A;  1BIC A;  4RUZ A;  5A25 A;  5FNG A;  4MO8 A;  1CVF A;  1YO2 A;  4YHA A;  3KNE A;  3T83 A;  2HOC A;  1TB0 X;  5G03 A;  1FSQ A;  3Q31 A;  4Q9Y A;  3DCC A;  3S77 B;  1HED A;  4PXX A;  4JSZ A;  4XFW A;  3SBH A;  5IPZ A;  3P4V A;  4FRC A;  4ZWZ A;  5SZ5 A;  2CA2 A;  3EFI A;  5JEH B;  1RAZ A;  4QK2 A;  3OYQ A;  3D8W A;  3MNK A;  3JXG A;  3ML5 A;  4QJO A;  4FL7 A;  5JEP B;  5SZ2 A;  3HLJ A;  2ILI A;  4CQ0 A;  1F2W A;  5E2R A;  5JEG B;  4E4A A;  1UGB A;  1CCU A;  1AM6 A;  5FDC A;  3MHM A;  1XEV A;  1CNI A;  1HCB A;  5DSR A;  3M1Q A;  4Z1N A;  3LXE A;  4MLT A;  3U45 X;  4HF3 A;  3B4F A;  3N2P A;  3MHL A;  3EFT A;  3PJJ A;  2NXS A;  5DSK A;  2CBC A;  2IT4 A;  4KUW A;  2X7U A; 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