The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
SPKAVALYSFAGEESGDLPFRKGDVITILKKSDSQNDWWTGRVNGREGIFPANYVELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics
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| molecule keywords |
Hypothetical 40.4 kDa protein in PES4-HIS2 intergenic region
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from a S. cerevisiae hypothetical 40.4 kDa protein at 1.39 A resolution
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-03-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UFF A; 4RTV A; 2DL5 A; 2CDT A; 1M3B A; 1AWO A; 1WX6 A; 1JXM A; 1FYN A; 2BZY A; 1T0H A; 3M0U A; 4LUE A; 1K1Z A; 1GFC A; 2K9G A; 4Z89 A; 2C0T A; 1K4U S; 2FPE A; 2D0N A; 4J9C A; 1H8K A; 5I11 A; 2J05 A; 4DEY A; 2L3S A; 2GNC A; 2CT3 A; 2M51 A; 1UE9 A; 1M3C A; 1YWP A; 2JW4 A; 1WXT A; 5FWB A; 1AWJ A; 2LMJ A; 1W6X A; 1AZG B; 3PVL A; 1N5Z A; 4F17 A; 1JO8 A; 1WLP B; 2W0Z A; 2K2M A; 1H92 A; 2KE9 A; 2EPD A; 1JU5 C; 3EG2 A; 3RNJ A; 3M0S A; 2PTK A; 1NEG A; 2F2V A; 1GCP A; 2KXD A; 1GFD A; 4RTX A; 1OV3 A; 2FRW A; 2HSP A; 1GRI A; 2KRM A; 2EGE A; 2CRE A; 2LNH B; 1OOT A; 2LZ6 B; 1OEB A; 2KT1 A; 1M27 C; 1ZUU A; 3SEM A; 2J6O A; 1UUE A; 2K6D A; 4WCI A; 2A36 A; 1MUZ A; 2YT6 A; 1ABQ A; 2L2P A; 2J7I A; 2LX7 A; 2B86 A; 4RTZ A; 1RLQ C; 2GQI A; 3VRY A; 1KIK A; 1UEC A; 1EFN A; 2FO0 A; 1X2Q A; 1VYU A; 1V1C A; 4OMM A; 2DL8 A; 2NWM A; 2K3B A; 2DRM A; 2AKL A; 2CUD A; 2KRS A; 3EG3 A; 4JJD A; 1WYX A; 1Z9Q A; 4AG2 C; 2YUO A; 5IHK A; 3UA6 A; 3VS0 A; 3TVT A; 1WFW A; 2X3W D; 1JQQ A; 2VVK A; 1M8M A; 1AOJ A; 1W1F A; 1E7O A; 3UA7 A; 1NYG A; 1VA7 A; 1ARK A; 1QCF A; 2A37 A; 1NLO C; 1M3A A; 4CC2 A; 4QT7 A; 2MOX A; 2JS0 A; 2EW3 A; 4J9F A; 1PRM C; 4J9G A; 2LP5 A; 1H3H A; 1ZBJ A; 2JMA A; 2XMF A; 1QWE A; 4GBQ A; 2BTT A; 4CC7 A; 4OMN A; 1CKA A; 4JZ3 A; 1CSK A; 2DE0 X; 1MV3 A; 3GBQ A; 4HCK A; 3VS6 A; 2DJQ A; 3C0C A; 1T3S A; 2DL3 A; 2EYX A; 1E6G A; 2CSQ A; 1BBZ A; 2RPN A; 3NMZ C; 3REB B; 1XOV A; 2HEQ A; 1W70 A; 2CUB A; 1HJD A; 3TSZ A; 2RQU A; 5IXF A; 1A0N B; 1U3O A; 2W10 A; 1MV0 B; 4AG1 C; 2E5K A; 3M0R A; 4OML A; 5IXB A; 1BK2 A; 3M0P A; 3EHQ A; 1U06 A; 4EIK A; 2LQW A; 2PZ1 A; 1S1N A; 1ZX6 A; 2RN8 A; 2VWF A; 5ECA A; 1K0S A; 5IH2 A; 4J9I A; 4HVW A; 4K11 A; 2VKN A; 2EGA A; 1WIE A; 2YUQ A; 1I07 A; 1Y0M A; 2AZV A; 2KEA A; 2BZX A; 1ZSG A; 1WDX A; 4IIO A; 1CKB A; 2YDL A; 1SRM A; 4ZNX A; 1OPL A; 2GTO A; 2RF0 A; 3EGU A; 5I22 A; 2EBP A; 3I5R A; 2HCK A; 4RTW A; 2JM8 A; 2KBT A; 2EYZ A; 1J3T A; 2DM1 A; 3FJ5 A; 3TSW A; 2EYW A; 5FWC A; 4D8D A; 1NYF A; 3SHW A; 2BZ8 A; 4RUG A; 3NPF A; 4J9B A; 2D8H A; 1I1J A; 4OMQ A; 2M0Y A; 2HBW A; 2RQW A; 3THK A; 4JPB W; 5IHI A; 4J9D A; 3VS4 A; 2IIM A; 3H0H A; 2H8H A; 4Z8A A; 2FEI A; 4HVU A; 2EKH A; 1GCQ C; 3I35 A; 3LH5 A; 3REA B; 1G2B A; 2KYM A; 1UDL A; 1X6G A; 2RQR A; 1PKT A; 1AVZ C; 2D1X A; 2KNB B; 4F16 A; 4A63 B; 1YCS B; 2KRO A; 3EHR A; 1SEM A; 1X6B A; 2DMO A; 2DBK A; 2J06 A; 1LCK A; 2ED0 A; 2SEM A; 4OMP A; 2JTE A; 5EC7 A; 1QKW A; 1UTI A; 4E6R A; 1B3Q A; 1G83 A; 2NUZ A; 1X2K A; 1YP5 A; 1BU1 A; 2CH4 W; 1QLY A; 1WA7 A; 1ZUY A; 2DLP A; 1KSW A; 1Z9Z A; 1K0X A; 1YN8 A; 3UF4 A; 1VYV A; 2FRY A; 2X3X D; 2O9V A; 4F14 A; 1M30 A; 3VRZ A; 1RI9 A; 2C0O A; 2K7A A; 2K79 A; 2ABL A; 4D8K A; 1ZUK A; 2LJ0 A; 1WXU A; 2JMC A; 1SHG A; 2ENM A; 2LJ1 A; 4HVV A; 1SSH A; 2FG0 A; 2RMO A; 3NGP A; 2MIO A; 1TUD A; 3IQL A; 4J9H A; 4GLM A; 3ULR B; 4RTU A; 2SRC A; 1X43 A; 1HD3 A; 1T0J A; 2GGR A; 1ABO A; 1KFZ A; 2C0I A; 3A98 A; 4JJB A; 4ESR A; 2L3P A; 3VS2 A; 3H41 A; 1UHF A; 2KR3 A; 4IIM A; 2ROT A; 2L3Q A; 2GTJ A; 2YUN A; 4RTY A; 2CSI A; 4X1V A; 2EGC A; 1YWO A; 2KGT A; 1E6H A; 3VS5 A; 1X27 A; 4HXJ A; 1T3L A; 2MCN A; 1JXO A; 3VS7 A; 2FPD A; 2ESW A; 1NEB A; 3JV3 A; 1GL5 A; 2QDL A; 1SPK A; 3U23 A; 1U5S A; 4AFZ C; 3KFV A; 4CC4 B; 1B07 A; 2DIL A; 1NLP C; 3NHN A; 4KRT A; 2DRK A; 2D8J A; 2O2O A; 4RTT A; 3VS3 A; 2O9S A; 1K9A A; 5HCK A; 1TG0 A; 2A28 A; 1PWT A; 2ECZ A; 2RQV A; 1SRL A; 3I5S A; 2DF6 A; 2FPF A; 4DEX A; 1PRL C; 1UG1 A; 1JEG A; 2LJ3 A; 4Y92 A; 5GJV B; 1UJ0 A; 2V1R A; 2OJ2 A; 3VS1 A; 1PNJ A; 4Z88 A; 3EG1 A; 1HSQ A; 1I0C A; 2V1Q A; 1ZLM A; 2CH4 A; 2YSQ A; 2A08 A; 1RLP C; 3O5Z A; 3H0I A; 1Y57 A; 1AD5 A; 2YUP A; 2DL7 A; 4AFU C; 4CC3 A; 2L0A A; 2DL4 A; 2I0N A; 1AEY A; 2F2X A; 2KT8 A; 5L23 A; 2DBM A; 2EYY A; 3CQT A; 4LNP A; 2OAW A; 2DYB A; 1TUC A; 2F2W A; 3H0F A; 1RUW A; 1VYT A; 1AWX A; 1UGV A; 3PE0 A; 2P4R A; 1UHC A; 2G6F X; 2JT4 A; 4FSS A; 4R0K A; 2AK5 A; 4AFQ C; 3PVQ A; 2DX1 A; 1PHT A; 1X69 A; 1GBR A; 4OMO A; 2ROL A; 1FMK A; 4AFS C; 3QWY A; 3I9Q A; 2JS2 A; 2RNA A; 2J6K A; 1IO6 A; 4JZ4 A; 1AZE A; 1GBQ A; 1AWW A; 3M0Q A; 5IHN A; 2AZS A; 2HDA A; 1SHF A; 3RBB B; 2EQI A; 4LN2 A; 2DVJ A; 2RQT A; 1OPK A; 4LUD A; 4LE9 A; 1KJW A; 2ED1 A; 4JJC A; 1PKS A; 2LQN A; 2CT4 A; 2O31 A; 3EG0 A; 2JXB A; 1GCQ A; 3QWX X; 1QKX A; 2KRN A; 2LCS A; 2PNI A; 4ORZ A; 4J9E A; 1NG2 A; 2J6F A; 2KYB A; 1WXB A; 1K76 A; 3R6N A; 2EVR A; 2O88 A; 2JM9 A; 5FW9 A; 1UJY A; 2AKK A; 3UAT A; 2DNU A; 5GJW B; 1QWF A; 1BB9 A; 2DA9 A; 3ZL7 C; 2KXC A; 2OI3 A; 1YNZ A; 1NM7 A; 2GBQ A; 1WI7 A; 4M4Z A; 3M0T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UFF A; 2XK0 A; 3L2V A; 1X01 A; 2YRD A; 1AWO A; 3MP8 A; 4M7D E; 1JXM A; 4M78 D; 3OYD A; 3JCM J; 3RIR A; 3ME9 A; 3UPU A; 1KQS S; 1FYN A; 3OB9 A; 1T0H A; 1V76 A; 3CCJ A; 2K9G A; 4Z89 A; 5LJ3 d; 2CKK A; 3CCE T; 2OTJ A; 4FT4 A; 1D3B A; 3FEO A; 3X24 B; 4M7A B; 3VKI A; 2J05 A; 2WSC E; 5CKE A; 4DEY A; 3NFC A; 2GNC A; 2QEX T; 2R57 A; 1UE9 A; 2JW4 A; 4FW1 A; 2RA2 A; 2VAS A; 3CCQ Q; 4D6W A; 4E7S A; 2QA4 A; 3X20 B; 1H92 A; 1KC8 U; 1Y7X A; 3I55 T; 4M7A D; 2PTK A; 1NEG A; 2F2V A; 3HFO A; 4ATO A; 1XJW B; 4IUU A; 4KGX B; 2KMT A; 3E1S A; 3P8B B; 2QK0 A; 1OOT A; 2LZ6 B; 2KT1 A; 2YXY A; 3M4G A; 1Y07 A; 2K6D A; 2YHT A; 4C5I A; 2RO0 A; 1OI1 A; 2A36 A; 5GAN 3; 1MUZ A; 1ABQ A; 3CCM Q; 4M7D F; 3V8L A; 1KIK A; 2GQI A; 2ZPF B; 4ME7 A; 4XU0 A; 1UEC A; 1EFN A; 3UDC A; 2OTL T; 4OMM A; 4OMF B; 4PJO A; 2RI2 A; 4LDY A; 2F5K A; 2DRM A; 2VYT A; 4JJD A; 1M90 R; 3OYK A; 2EQJ A; 1W2B S; 2COW A; 5LJ3 h; 3TVT A; 4M78 C; 3SWN B; 1M8M A; 1W1F A; 4JS4 A; 1QCF A; 3OYE A; 4F04 B; 3CCL Q; 1VQ9 T; 4M77 G; 2KY9 A; 1JB0 E; 5CCA A; 4XTY A; 2DZ9 A; 4GBQ A; 3E9F A; 4CC7 A; 2DJQ A; 2F5T X; 1KC8 C; 3C0C A; 2DL3 A; 2EYX A; 2K4Y A; 3MPU B; 3QJ6 A; 3A8O B; 5I21 A; 1QVF A; 2KQW A; 2CUB A; 4E7I A; 1BCM A; 1U3O A; 1VQN T; 1MV0 B; 5GAM f; 1VQP Q; 1G3T A; 1LPL A; 3CCR T; 4M7A C; 5A0G A; 2CS7 A; 1AHJ B; 2ZCF B; 3M0P A; 2K5F A; 2E10 A; 2PZ1 A; 1DJ7 B; 2M1H A; 1IRE B; 1BI1 A; 3QHS A; 2H3E B; 3OMC A; 4M75 D; 2VWF A; 3UT1 A; 5ECA A; 1K0S A; 2JOY A; 2EGA A; 2O01 E; 1MMD A; 3VJP A; 1VQM Q; 4C92 A; 2BKD N; 5A0D A; 2Y90 A; 2QDY B; 2KEA A; 2PVD B; 2GF7 A; 1ZSG A; 3VU3 C; 4TVR A; 1VQK T; 1I4K 1; 4ZNX A; 2GTO A; 2RM4 A; 1OX8 A; 3EGU A; 5I22 A; 4RTW A; 2EWN A; 1K9M U; 3A8H B; 1IHV A; 2PU9 B; 2DAQ A; 4Q5W A; 1RAE B; 1QVG P; 4RUG A; 3TRE A; 1M1G A; 3NPF A; 3CPW A; 2D8H A; 1I1J A; 2E3I A; 2FB7 A; 4OMQ A; 2QXF A; 4BB7 A; 3LYI A; 2ZPB B; 4OP0 A; 4J9D A; 1D0X A; 3CD6 Q; 3OYG A; 2NLU A; 5GAN g; 2P0Q A; 3I35 A; 3OYJ A; 3LH5 A; 3V8K A; 4PJO F; 1I5O B; 1G2B A; 2XID A; 4JLI A; 4C92 E; 3CCS T; 1VQO Q; 2RQR A; 1YHQ A; 2HSE B; 2MI6 A; 4B6M A; 1YCS B; 3SWN C; 3GNF B; 4E7J A; 2CP0 A; 1M1K U; 1LCK A; 4OMP A; 3MEA A; 4E6R A; 1G83 A; 4E7K A; 1TH7 A; 1X2K A; 1YP5 A; 4M7D G; 3TQ7 P; 2CH4 W; 1QLY A; 4F7U A; 5GAN 8; 3S6W A; 1QMC A; 1K0X A; 1YN8 A; 2BE7 D; 5KE3 A; 2O9V A; 4M75 C; 4F14 A; 1VQ7 Q; 3VRZ A; 1RI9 A; 5GAN e; 2RHU A; 1R0C B; 2K7A A; 5LJ3 f; 4A4E A; 3V7C A; 4C8Q E; 1K9M C; 4N0A A; 3V8J A; 1SHG A; 2LT1 A; 1NBE B; 2ZPG B; 1WHJ A; 2LJ1 A; 4HVV A; 3PMT A; 1MGQ A; 4ZTJ A; 2XDD A; 1SSH A; 2YRV A; 2YWW A; 3D7S B; 4GLM A; 5HK3 A; 5CKD A; 2VGM A; 2SRC A; 1OU8 A; 2C0I A; 4X34 A; 4J6X A; 5CKF A; 3VS2 A; 2VXE A; 3BDL A; 2LCC A; 2KDS A; 1M4Z A; 4C92 F; 4RTY A; 3F70 A; 4X1V A; 4FSX A; 2EGC A; 1YJ9 T; 4F7U E; 1E6H A; 5GAO p; 4MML A; 5LJ5 g; 3U23 A; 3CME T; 5IT9 E; 2KVQ G; 4A53 A; 4AFZ C; 1YI2 Q; 2RJF A; 3KFV A; 5GAN 4; 1RAH B; 5IAY A; 2DIL A; 3QJY A; 5GAM g; 3G4S Q; 1YIT T; 2NUP A; 1QP2 A; 2A28 A; 3I5S A; 2LTO A; 4WTO B; 2RHI A; 1UG1 A; 1KD1 U; 2P0K A; 3EGD B; 1RAF B; 1JEG A; 2MYS A; 5GJV B; 2CZ0 B; 4J7I A; 2FHD A; 2Z0W A; 2RB6 A; 4ZGJ B; 1W2B A; 4XTU A; 1HSQ A; 3DB4 A; 2EFI A; 5FLX E; 1RLP C; 3CC7 T; 3X25 B; 1Y57 A; 1LJO A; 3LGL A; 1NZ9 A; 3G6E A; 2CGH A; 2DL4 A; 1XNI A; 2DBM A; 5KCO A; 1R0B G; 3M53 A; 1Q86 R; 2F2W A; 5LJ5 e; 3H0F A; 1RUW A; 4M77 B; 1AWX A; 5A0L A; 1ZBX A; 1QP3 A; 3PE0 A; 3RKX A; 4FSS A; 3CCU Q; 4AFQ C; 3A8G B; 1R8O B; 1YIJ A; 1YIJ T; 4F7U F; 4PJJ A; 2CP2 A; 2AHJ B; 2DIG A; 2QGF B; 1N27 A; 4OMO A; 2ROL A; 4AFS C; 3QWY A; 3I9Q A; 2JS2 A; 2J6K A; 2HMA A; 4M77 A; 4PJO G; 2VV5 A; 2HKQ B; 3RBB B; 5C0M A; 3OS1 A; 3I56 T; 5DLO A; 3JCM b; 3TEE A; 3CC4 Q; 4LE9 A; 1RAA B; 4FIB A; 2LQN A; 2DEU A; 3AHU A; 4J8O A; 1GCQ A; 2RK1 A; 2KRN A; 2LCS A; 4ORZ A; 2A3L A; 1UGP B; 1JRI A; 3JCM Q; 1G3W A; 2QQR A; 1WHL A; 1KD1 C; 3RDV A; 1QWF A; 3JB9 H; 2DA9 A; 3ZL7 C; 2OI3 A; 3CCQ T; 3FC3 A; 3CC2 A; 1YNZ A; 1NM7 A; 2GBQ A; 4PNO A; 3EGX A; 2M9U A; 3M0T A; 3G71 Q; 2HNI A; 2VXF A; 3E9G A; 4RTV A; 4KUI A; 1YJW Q; 2CDT A; 3EFO B; 1GXI E; 4CRI A; 2BZY A; 5KYY A; 1MND A; 1M90 U; 4LXC A; 1GFC A; 2C0T A; 1YCY A; 1K4U S; 2DXC A; 1NE8 A; 1ZA2 B; 1C1A A; 2PUK B; 1S72 Q; 2L8D A; 2VB6 A; 2M51 A; 1C6V X; 4J7F A; 3CCM T; 1K8A C; 1VQ8 A; 1YWP A; 1WXT A; 5FWB A; 4QW2 A; 5KH6 A; 4JDS A; 3H8Z A; 4PFZ A; 4C92 G; 1JO8 A; 2K2M A; 4BE2 A; 1VQ6 Q; 3JAM E; 4DBF A; 1TWB A; 3CCV A; 1OV3 A; 2FRW A; 2HSP A; 2RJE A; 1GRI A; 4FW2 A; 2EGE A; 3FJP A; 3ZEH A; 3JCM P; 3Q1J A; 5GAO q; 1D0Y A; 2WAC A; 3S3N A; 4M7D B; 1OEB A; 3HRS A; 2V8I A; 1M27 C; 1ZUU A; 2YLB A; 4DQ2 A; 2J6O A; 3CCL T; 5KYX A; 4WCI A; 3M9Q A; 2YT6 A; 1VQL A; 2KAF A; 5KYU B; 2B86 A; 2MWO A; 3VRY A; 1WHH A; 2CZ6 B; 1IZ6 A; 4M77 F; 2CYZ B; 4J5Y A; 3QDF A; 2L5Q A; 2F69 A; 3DLM A; 3A8M B; 1UGS B; 2DL8 A; 4M7D D; 3M59 A; 2K3B A; 4E7Z A; 1VQ4 Q; 2AKL A; 3EG3 A; 2K2V A; 2K5I A; 1WYX A; 2V26 A; 1M90 C; 1QCN A; 2PVG B; 4AG2 C; 3OYN A; 1PSF A; 5IHK A; 1VQP T; 2LX9 A; 1WFW A; 1E7O A; 3L2U A; 3CXC S; 3CMA A; 1ARK A; 1YJN Q; 1NLO C; 1MHN A; 1PCX A; 5GMK h; 2JS0 A; 4F7U G; 1KD1 R; 4J9F A; 1PRM C; 2ZZD A; 2A0F B; 2XMF A; 1NPR A; 4QVZ A; 1VQM T; 4IUP A; 1BIB A; 1CKA A; 4JZ3 A; 1Q95 G; 4JRP A; 3GPL A; 3GBQ A; 1UGR B; 4HCK A; 1MNE A; 5D6W A; 1ACM B; 2RPN A; 1RAC B; 3REB B; 1SF9 A; 1XOV A; 4EMG A; 1JJ2 P; 4JRK A; 3LWI A; 1TTH B; 3SFM A; 2K57 A; 3OYC A; 4C0D B; 5IXF A; 1A0N B; 5DY9 A; 1KG1 A; 2W10 A; 3I56 Q; 3KUF A; 4KH0 B; 1ZA1 B; 3PIO A; 3CCE A; 4RCB A; 1IGQ A; 4MZM A; 2QEX A; 3CD6 T; 1K8A R; 4HVW A; 2HQE A; 4JLG A; 2DKG A; 2DVE A; 2QAZ A; 4C0Z A; 1WIE A; 2YUQ A; 1I07 A; 4BI4 A; 1LVK A; 1Y0M A; 5I2S A; 1VQO T; 3QKJ A; 1F1B B; 3RMS A; 4A4H A; 1CKB A; 4BE0 A; 1SRM A; 2RHY A; 1G8X A; 1P92 A; 2RF0 A; 2G3R A; 3OSV A; 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