1OVYA

Solution structure of ribosomal protein l18 from bacillus stearothermophilus
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
GTTERPRLSVFRSNKHIYAQIIDDTKSATIVSASTLDKEFGLDSTNNIEAAKKVGELVAKRALEKGIKQVVFDRGGYLYHGRVKALADAAREAGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S Ribosomal Protein L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Bacillus stearothermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 13
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00861 Ribosomal_L18p Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ovyA00
3CC2N 4WFNL 1K9MO 1VQPN 3G71N 5H1SQ 3CCRN 3CF5L 5GAGP 4IOAL 3CCLN 5JVGL 1S72N 1YITN 1VQ4N 3CCJN 3I55N 3G6EN 1KQSM 2ZJPL 5HL7L 1N8RO 4WF9L 5DM6L 3OW2M 3DLLL 4IOCL 1YJ9N 2OTLN 5GAHP 1VQKN 2OTJN 1Q86O 3CXCM 5GADP 1ILYA 1YJNN 3CCEN 2QEXN 3CC4N 3CCSN 3G4SN 4WFBL 1VQ5N 1M1KO 1VQ8N 1M90O 5GAEP 1YHQN 5MLCQ 1VQLN 3CC7N 1W2BM 1OVYA 1VQ6N 1VQNN 1Q7YO 3PIOL 1K8AO 1QVGM 3J7ZO 1VQMN 3CMEN 4WFAL 2ZJQL 3CCVN 2QA4N 1KC8O 5DM7L 2ZJRL 3CCUN 3CCMN 1VQON 3PIPL 3CCQN 1VQ9N 3CPWM 4UY8O 3I56N 1K73O 5JVHL 1YIJN 4IO9L 1NJIO 1QVFM 1VQ7N 1JJ2M 1YJWN 3CD6N 4WCEL 4U67L 3CMAN 1Q81O 1YI2N 1KD1O 1Q82O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C8KA 4BRIA 3UKUA 4GKJK 2O8EA 2HHTA 3QNNA 1EKEA 3AV9A 4CIEA 3I0SA 3D2EB 3VENA 4KREA 3P31A 3O4NA 3ATVA 4KPYA 4CJTA 4DU3A 4BGAA 1P8ZA 1J54A 5CZ2A 4CF9A 2HHSA 3K5MA 2XHBA 4XH5A 1ASVA 3R9PA 2P9IA 3WNGA 4F8RA 4JK9A 3HTVA 3KK2A 4DTNA 3O1BA 2VWJA 3SV3A 3NDKA 4H5WA 4PKGA 3F73A 4GVMA 3G4SN 1BCOA 2D1KA 1RDWX 1N36K 3AVBA 4CJEA 3NMUA 3CPEA 4JKBA 3AVNA 1JLEA 1A5WA 1TYQB 3V4IA 1D8YA 1IO2A 4O0JA 4L3QA 1QQCA 3UKRB 4DLEA 2HBJA 4DV0K 1T6CA 3KHYA 3QEIA 3RSEB 1MA9B 3CJ1A 5EVZA 1KVCA 1W2BM 1VQNN 4B9QA 2Z1HA 2NRTA 1DKGD 4CK2A 3HM8A 4JS5A 3DLGA 3TI0A 4IJAA 4PKHA 2O8CA 3T1HK 2G8FA 1RNHA 1LOTB 2ZE2A 1QQMA 5TKYA 3U8XA 1BL3A 3CCMN 2NRHA 3FFIA 2E4LA 3V1QA 4JKEA 3H46O 3DLBA 5IT9O 1RBRA 4FL9A 3TWHA 3T3FA 2HF3A 5BN8A 4AM6A 4PHTX 5KRTA 4M3YA 2QWOA 3KD5E 3KLEA 1I3AA 5KGWA 5KPZA 3K59A 1VSJA 1Q82O 4JKHA 5BRHA 2BE2A 2P9SB 4ZTJA 2X78A 4HTLA 1T3VA 3ZLJA 3NH1A 1JCGA 4BQLA 1VQ4N 3NGYA 1IBMK 2Q0UA 1YTUA 4BR7A 2IVNA 3I55N 1N8RO 1Q9YA 4FZZA 1REVA 3H08A 1YJ9N 4CHPA 5GIOA 4CJ5A 1UOCA 1XWLA 1Q8IA 3ITHA 4B1WB 4B9UA 3TANA 3AO4A 3PO5A 3OVNA 3Q7BA 4NCAA 5GIPA 1MU2A 4YORA 2HVIA 3CCSN 3L8BA 1IKWA 2Z1GA 3LP0A 1SKWA 5C25A 1FXXA 1BA0A 2RE2A 4CCHA 3VQ9A 3S9HA 4H0XB 4H0PA 4E7IA 3VEYA 4EIAA 3DWLA 4LF9K 2GWJA 4AF1A 2CH6A 4X64K 4CEFA 4FLWA 3WXKA 1Q9XA 5AQUA 4CZKA 3VQCA 1A5XA 4YDUA 4F2SA 4LF8K 3K5NA 4JKDA 3OYEA 4ELTA 1HYZA 3AA4A 2G8HA 1HNIA 3MEDA 4DSLA 3BF3A 3QICA 2Q31A 4BRGA 3OJUA 4C8MA 3L2VA 3C0BA 3SUPA 4NYFA 1N32K 3QLHA 2ZGYA 5K14A 4DQQA 5IWAK 5AQPA 1Z25A 5I9EB 2OZSA 3FLCO 4MO4A 1TAQA 3NHGA 1FKOA 4JHDA 4E19A 3DAWA 1NGCA 2NRZA 1D9FA 4K43A 3V9UA 1SKRA 4DV5K 2ETJA 1T44A 4NLBA 1S1TA 3KK7A 2D0BA 4JRPA 4BRCA 1GLBG 4CIFA 2P5GA 3AVCA 2ZF5O 4FLVA 2FF6A 3BP8A 2QK9A 1YF5L 3C6TA 4Z4EA 1BWFO 4J2AA 4JNEA 2ZQBA 5CY4A 3G6EN 4I6MA 3THYB 4ELVA 1N33K 2IIRA 1B9FA 3O4QA 3DLLL 3VQ4A 1RBUA 3H3NO 1Q86O 3SAHA 4OPHA 4JK7A 2YI1A 2V52B 2QKBA 4YNQA 1U2VB 4KHYA 3N4PA 2YKNA 1RT7A 2YNFA 1HUXA 3HRGA 1NGDA 4NB4A 2YNGA 4RW4A 1RTHA 4OPKA 1HNVA 4H5VA 4B9VA 3VQPA 3NGZA 4DLGA 3TAMA 4F3TA 1QHTA 2E5LK 1G99A 4CE9A 3SPZA 1S5JA 1OH8A 3CYMA 3M8SA 3DXKA 4DTJA 3L2WA 3U9DA 1O13A 4CJ4A 5AR0A 2X74A 3PY8A 4FW2A 3LP1A 3GOIA 5GINA 2OA8A 4GKKK 4FWSA 1NMNA 3M8RA 4RW6A 3NH2A 5M1PA 2H3GX 5AJ3K 4FCYA 5AQVA 2BH1A 1S3XA 1ATNA 2F4VK 1SUQA 3AO2A 4KTQA 2V51B 5AQSA 3VQ6A 4F9OA 3A5LC 4LF7K 1RBTA 4UY8O 1S6QA 2NUBA 5BR9A 1NGGA 1U48A 3THYA 2NRVA 4O8KA 1MWKA 3FFKB 1E4GT 1VSKA 3TR8A 2XY6A 3KLGA 1L3TA 3ZSXA 5EY4A 3DRRA 1FJGK 1KXPA 3O5BA 3ULDA 2JWLA 1J53A 1HJOA 1U2VA 1EETA 4HCBA 3AVAA 3G0ZA 1TKZA 4E7JA 4UQGA 4TSXA 2F9TA 3A5MC 1QQNA 4B08A 4FWNA 4CJPA 3R3LA 4JRQA 4Y1CA 3LWLA 4CJUA 1C1CA 2ZJPL 4CBWA 2QTDA 4CEAA 1ATSA 4FJHA 4C1NK 1K6YA 4BR9A 4DSJA 4B1UB 1TKXA 3ZCMA 4DTOA 4BR5A 4LFBK 2O4IA 1ILYA 3HZ6A 2NNWA 3HPOA 3VF4A 2ZM6K 2EX3A 5CHIA 2G8IA 2PYJA 1BCMA 4DQRA 3R6MA 3SK3A 2BTFA 3OYAA 1RTDA 3VQBA 2BANA 3LP3A 4EZ9A 2HHVA 4FJIA 4BC5A 4DR5K 4H5NA 3NAEA 2YHYA 4CERA 3LDPA 5BRFA 5MLCQ 3FR0A 3JSMA 3SUQA 2YHXA 4CEEA 3VGKA 3FE1A 4CZMA 4DB3A 3WNFA 1BQNA 1W0HA 2WFBA 2W41A 2WC9A 3DM2A 1OH6A 4DQIA 1CZ9A 1XQSC 1ZBUA 1DLOA 4E89A 4JI3K 4N47A 3THXA 4ILHA 3V9XA 4FJXA 4CGDA 3LAMA 4ISGA 4YY3K 4AILC 1VQON 3RR8A 3PIPL 3MN9A 4CF2A 5JS1A 4FJLA 5FPNA 1RT4A 2D0PA 1C0TA 4Z0UA 5KI6A 1RBVA 4X65K 1QSLA 3VQ5A 3FZLA 3ZT0A 3RWUA 4CJRA 4CD1A 1RCHA 3GDQA 3IAYA 3VA0A 4O8UA 1NK8A 3JS6A 3K5OA 3MMVA 5J2MA 4KHQA 4IBNA 4FJMA 4OPJA 3CMAN 2FBYA 3CQ8A 1OVQA 4MFBA 2HMPA 5JLHA 4LD0A 4KFBA 2NRXA 3O3GA 3ENHA 5FPDA 2O8DA 3CJ7A 3F9MA 3ZEUA 5F0XA 3K58A 3MCPA 1LWEA 3O8MA 4IOAL 4BREA 4JI1K 3K0SA 3O4WA 3C7NA 3K9JA 2B6AA 2WONA 1HMVA 1TKTA 4BC3A 3L3UA 3HP9A 3O08A 2UXDK 2OTJN 4FPAA 1YJNN 2WUSA 3SQ0A 4MO5A 1VSHA 1SL2A 1KAYA 1W9HA 3HSTB 2B5JA 3M8PA 4WQ5A 3J7AP 4AHSA 1WSJA 4BRNA 1CZBA 2E2QA 2QWRA 3S3NA 1TK5A 4EP5A 3HJFA 1HQEA 4CZFA 1VK0A 4FJ9A 4MLEA 2AA4A 2QW9A 4B9SA 3GG4A 3DRSA 3A5OC 4ISFA 1T7PA 1I39A 3E66A 4BG8A 4BRMA 4FM0A 1LWFA 2KFNA 1DTTA 3HOSA 1SL0A 2HBMA 3OYFA 3VESA 5C42A 3MX5A 1TK0A 4H0TB 4CGFA 3OYNA 3M1FA 4H0OA 1ZYQA 5KQ8A 3V9SA 2A1RA 4F2RA 5CR4A 3CFRA 2P9IB 3N4QA 1GOAA 3HL8A 2FBVA 4B3OA 1VQ7N 4AHCA 1NM1A 1BHLA 4FJKA 3HYFA 1S1VA 5E84A 1IKYA 2FF3B 2XO7A 3HM9A 3EZWA 3MN6A 3KZBA 3BY5A 1YI2N 4IDKA 3V1RA 1VQ6N 3BGRA 1C0GA 4C23A 5HLFA 3WXJA 1RT2A 3O9UA 3AVKA 1JXBA 2QWPA 3D45A 4IZ9A 4FK2A 3TAFA 2UXBK 1TL1A 1HYVA 4BWMA 1SV5A 2VWBA 1WUAA 3DRPA 2PYLA 3CG7A 1OKJA 1HKBA 4CK1A 3KLHA 2EWSA 4H5RA 2OTLN 3ENBA 1NU0A 4B9LA 4DHYA 4FJ8A 3OYKA 2O8CB 4Z4IA 2NLXA 4FOEA 1BA1A 3SYZA 3VPZA 1JLCA 1BIZA 4CBXA 1DEJA 1C0UA 1G15A 4ILGB 4B1ZA 2Q3SA 2GUPA 4RWTA 2W40A 4EP4A 4A61A 1N34K 4NXNK 1KAXA 3BF1A 4IKFA 3EEQA 1LW2A 3GE1A 3CIPA 1HNWK 2GELA 3LAKA 3TSPA 2KKZA 4N76A 1E4FT 3PSFA 3SMSA 4BDPA 4B1XB 4M3ZA 4I9LA 2IAJA 3OYJA 4LFCK 3LP2A 1RGIA 4FW1A 3BZKA 4BDYA 1XNQK 4KV8A 5FDLA 3NFAA 5SZTA 3IRXA 5AQRA 3B6PA 2VCPA 3I0RA 4IG3A 3M8QA 1NWKA 1KC8O 2OZMA 3O80A 3OBWA 3L2UA 4JI2K 1ESVA 4CJQA 4CZGA 4EHUA 1HR0K 5ADXH 2VQFK 1V4SA 1RDCA 3VQDA 3SI6A 3S3OA 1TUYA 1RTIA 2F9WA 4OKJA 3PX4A 1D4XA 3U3YA 5I42A 1QVFM 4MQ3A 4JI8K 3ID6A 3M3ZA 2F7TA 3OYGA 4KRFA 2P9LA 4WYBA 4CGGA 1TAUA 3QBXA 3TTDA 5A2QO 4FK4A 1WAFA 4BRKA 4DTPA 3IS9A 2UUBK 4EZ6A 4E7LA 4FLUA 3I8DA 4IFEA 4FPBA 4FWRA 1LAWA 5HBMA 3VQQA 1XMOK 3C6AA 2GX9A 3LM2A 2HW3A 3KLFA 2CGJA 3PUFA 4A59A 2RPIA 2YV0X 3MN7A 1OH7A 1GLLO 4FVMA 3VTIA 1ZBIA 1JLGA 3O9TA 3KK1A 1U47A 3VGMA 3CFPA 4JEPA 3LM9A 4HHTA 1SQKA 2YHAA 3L6QA 4CHZA 2XY5A 5HRNA 2VYPA 3RR7A 1NK6A 2A5XA 4AQYK 1BDGA 4GNIA 4M7YA 2I7NA 2GBZA 1XMQK 3OS0A 3MECA 4M42A 5C10A 4DS4A 2OANA 4AH9A 2IOCA 5HRSA 4I7FA 2A3ZA 3RMBA 1CXQA 2IGIA 4JHDB 4GW6A 3SZ2A 1CXUA 4YOXA 1X3NA 4CJVA 3SV4A 5BPLA 2FXUA 5EX5A 1GOCA 5HOOA 1ZBSA 1WSFA 2QA4N 4H03B 2BUPA 3E9OA 4A2BA 1QZ6A 2OPSA 4EAHD 3NVKA 3QIOA 1XHZA 4I6MB 3CPWM 1F21A 1WB9A 3DI6A 3OS2A 3E01A 3P83D 1K73O 4OPAA 1IKVA 3TABA 1CZAN 3ZYYX 1ITGA 5J1EA 3IUCA 4CF8A 3MXJA 4C8LA 1HLUA 5SWMA 2KZZA 1WSGA 4CZHA 2GWKA 1JLAA 3F2KA 4WFNL 1W97L 3KLIA 4LSNA 5AFUA 4BC2A 3HK2A 3Q7CA 4I2PA 4DV3K 4CFDA 1BOTO 5JVGL 1NK9A 3E1YA 4CZIA 1BISA 2HHXA 1RFQA 1T8EA 4Q0BA 3IDHA 4WQ4A 3DXKB 1X9JA 5HL7L 1GLJO 5DM6L 4CF1A 3LZJA 4JI5K 3VEVA 1QTMA 3WT0A 1GOBA 3E9LA 2P9PA 4BWJA 3T19A 2HHQA 4GMJB 1J5OA 2FLOA 3ZSRA 1FW6A 1HQUA 5C2FA 4BR4A 4U7BA 4DV7K 1WNSA 5HRRA 3QEPA 4KHNA 1VSLA 3TU5A 4CHOA 3CFOA 4LH5A 3U6FA 4B9NA 3SMPA 4Z4FA 3HSCA 4O5FA 3QB0A 4RCHA 3TPQA 1XNRK 1S1WA 2Y1IA 4DUZK 4E7HA 5AQXA 1TKDA 4L8RB 1FKPA 4FSVA 3PIOL 2HHUA 3TAEA 2A1SA 3ATUA 3OY9A 1X9WA 3LDQA 4DU4A 4J8FA 4JK8A 3VERA 4W5TA 3CMEN 1NOZA 3H6EA 3KKRA 4X62K 1C1BA 2ZWHA 3WEEA 4IJNA 1XUPO 4ID1A 3ULEA 4H8KA 5F1XA 2FC0A 1KSPA 4FXDA 3KTQA 4G9ZA 4M3XA 4JV5K 1T05A 3JAMO 3IFRA 3U9ZA 1VHXA 4JD2A 4JI0K 1NJWA 4K42A 3K5LA 1WBDA 4BG9A 3H3OB 4BROA 3ISNC 3OA9A 5EU7A 4WE1A 4DQ8A 2XY8A 3AVIA 4IEIA 4CHYA 3NGIA 3OYHA 3LPUA 4BRFA 4FWQA 4DKWA 5M1OA 1SZ2A 5E41A 2YNIA 4BRHA 2W42A 3AGRA 1HKCA 3VEOA 3MXIA 4A5AA 4E0DA 2VG7A 4QS7A 4DR1K 1KQSM 2OYQA 4PQUA 1NGHA 3KKSA 4Z94A 1QSSA 4DS5A 2P9UB 3QFPA 2E20A 1VRUA 3SQ4A 2O8FA 3THXB 1Z6RA 1S1UA 2V7ZA 3ZX2A 4MDBA 5LY3A 1ZBHA 4W5RA 4OGCA 2IDOA 1YUWA 3MK6A 4MDAA 4JAXA 4XH4A 2UU9K 3M5RA 2Z1IA 3NCIA 2FSNA 3KD1E 3VETA 3NF8A 4O55A 3AARA 2Z1JA 4FOIA 2E1ZA 4YFUA 1JKHA 4PL8A 4CI6A 3DXMA 3VQEA 5D3GA 3HPGA 2G8WA 1D9DA 4GV9A 1OVYA 4OX9K 3K2PA 1P90A 2AP1A 4E1NA 1KVAA 4JKCA 1UA1A 2UUAK 1YVUA 3OYLA 4KBOA 1B9DA 3CQYA 4B1VA 2O8DB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC2 N;  4WFN L;  1K9M O;  1VQP N;  3G71 N;  5H1S Q;  3CCR N;  3CF5 L;  5GAG P;  4IOA L;  3CCL N;  5JVG L;  1S72 N;  1YIT N;  1VQ4 N;  3CCJ N;  3I55 N;  3G6E N;  1KQS M;  2ZJP L;  5HL7 L;  1N8R O;  4WF9 L;  5DM6 L;  3OW2 M;  3DLL L;  4IOC L;  1YJ9 N;  2OTL N;  5GAH P;  1VQK N;  2OTJ N;  1Q86 O;  3CXC M;  5GAD P;  1ILY A;  1YJN N;  3CCE N;  2QEX N;  3CC4 N;  3CCS N;  3G4S N;  4WFB L;  1VQ5 N;  1M1K O;  1VQ8 N;  1M90 O;  5GAE P;  1YHQ N;  5MLC Q;  1VQL N;  3CC7 N;  1W2B M;  1OVY A;  1VQ6 N;  1VQN N;  1Q7Y O;  3PIO L;  1K8A O;  1QVG M;  3J7Z O;  1VQM N;  3CME N;  4WFA L;  2ZJQ L;  3CCV N;  2QA4 N;  1KC8 O;  5DM7 L;  2ZJR L;  3CCU N;  3CCM N;  1VQO N;  3PIP L;  3CCQ N;  1VQ9 N;  3CPW M;  4UY8 O;  3I56 N;  1K73 O;  5JVH L;  1YIJ N;  4IO9 L;  1NJI O;  1QVF M;  1VQ7 N;  1JJ2 M;  1YJW N;  3CD6 N;  4WCE L;  4U67 L;  3CMA N;  1Q81 O;  1YI2 N;  1KD1 O;  1Q82 O; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4C8K A;  4BRI A;  3UKU A;  4GKJ K;  2O8E A;  2HHT A;  3QNN A;  1EKE A;  3AV9 A;  4CIE A;  3I0S A;  3D2E B;  3VEN A;  4KRE A;  3P31 A;  3O4N A;  3ATV A;  4KPY A;  4CJT A;  4DU3 A;  4BGA A;  1P8Z A;  1J54 A;  5CZ2 A;  4CF9 A;  2HHS A;  3K5M A;  2XHB A;  4XH5 A;  1ASV A;  3R9P A;  2P9I A;  3WNG A;  4F8R A;  4JK9 A;  3HTV A;  3KK2 A;  4DTN A;  3O1B A;  2VWJ A;  3SV3 A;  3NDK A;  4H5W A;  4PKG A;  3F73 A;  4GVM A;  3G4S N;  1BCO A;  2D1K A;  1RDW X;  1N36 K;  3AVB A;  4CJE A;  3NMU A;  3CPE A;  4JKB A;  3AVN A;  1JLE A;  1A5W A;  1TYQ B;  3V4I A;  1D8Y A;  1IO2 A;  4O0J A;  4L3Q A;  1QQC A;  3UKR B;  4DLE A;  2HBJ A;  4DV0 K;  1T6C A;  3KHY A;  3QEI A;  3RSE B;  1MA9 B;  3CJ1 A;  5EVZ A;  1KVC A;  1W2B M;  1VQN N;  4B9Q A;  2Z1H A;  2NRT A;  1DKG D;  4CK2 A;  3HM8 A;  4JS5 A;  3DLG A;  3TI0 A;  4IJA A;  4PKH A;  2O8C A;  3T1H K;  2G8F A;  1RNH A;  1LOT B;  2ZE2 A;  1QQM A;  5TKY A;  3U8X A;  1BL3 A;  3CCM N;  2NRH A;  3FFI A;  2E4L A;  3V1Q A;  4JKE A;  3H46 O;  3DLB A;  5IT9 O;  1RBR A;  4FL9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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