1P8ZA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin residues val26-glu156
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
365
structure length
354
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin precursor, plasma
publication title From the First to the second domain of gelsolin: A common path on the surface of actin?
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 354
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1p8zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1p8zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1p8zA04
3C7NB 3GDQA 3HI0A 3SMSA 3HBTA 2P9IA 3DXMA 4BR5A 3GOIA 5AQHA 4JHDB 4I6MA 2QWQA 1TUYA 1MDUB 2W41A 3EL2A 3H3OB 3P4IA 1JCEA 4H0TB 1WUAA 1QQMA 3MN5A 1YAGA 5EY4A 4IWVA 2V51B 3IMXA 5LJVA 3LM9A 3O4WA 3QBXA 3ULEA 3SLCA 2A40A 3CJ7A 3M1FA 4BRCA 1YUWA 2IVPA 5AQWA 1YXQA 1MA9B 4YDUA 5AQQA 4CZEA 3BF3A 3FR0A 1U2VB 4NO7A 1IG8A 3C0BA 3VEWA 4A2BA 2D4WA 4WYBA 3A8YA 4BRDA 1E4GT 1X3NA 4K42A 3DXMB 5KQDA 2QW9A 4FWRA 3DJCA 4IO8A 1KXPA 3VEYA 3D2FA 4GY2B 4L3QA 2D1KA 1HJOA 5FPMA 4FWPA 3TU5A 3J8AA 2QWOA 3H3NO 3CJBA 1RDWX 2E88A 3GE1A 1SQKA 2EWSA 2ASPA 2A6AA 5AQTA 2BTFA 3VERA 4PKIA 3WQTA 1V4SA 2ITMA 1T6DA 2KHOA 2CH6A 5AQUA 4BR2A 3U9ZA 3QFPA 3VESA 2P9SA 2GELA 3GBTA 3UKUA 4A2AA 5E84A 3ATVA 3EO3A 1ZXOA 1CZAN 3FZMA 3DAWA 2YHWA 1GLAG 2YJEA 3O08A 2E2OA 3D2EA 3EKSA 4HTLA 5LY3A 4BVOA 4FL9A 5BPNA 3CJCA 3FZLA 1P8ZA 5AZJA 5BN9A 2E2QA 3H45C 4BRLA 4IZ9A 3DXKA 3H46O 2QXLA 1HUXA 4LC9B 3JS6A 1X3MA 5AQYA 3VEZA 4ISGA 1KAZA 3O8MA 2QWNA 1JCGA 3O80A 5AQIA 3FE1A 4DHYA 2CGLA 3LDQA 3MMVA 4H0OA 4DCHA 4EHUA 3UKUB 2Q1NA 1ATNA 4CZJA 5AR0A 4O8KA 3VF4A 4FWKA 1YVNA 4JHDA 5BRHA 3D2EB 3S41A 1GLEG 4H0XB 5AQPA 1G99A 2BUPA 4BGBA 4NB4A 2GTDA 3I8BA 2A3ZA 5AZJB 2FSNA 5AQSA 3U9DA 1GLBG 1BO5O 4FPBA 3M6GA 1XC3A 4BROA 5ADXA 2VCPA 3WXIA 2OANA 2QWPA 3CQYA 4BRGA 1HKCA 3R9PA 4BR7A 3HSCA 3W0LA 4B1UB 5AQVA 4GNIA 3TPQA 5BRDA 2GWJA 4M7XA 3HTVA 4XH1A 3UKRA 1TYQB 1BA1A 1Z05A 3QICA 3EZWA 4K41A 1NGEA 4BRAA 2CGKA 3U4LA 1NGAA 1NGIA 1DKGD 3FZFA 2FXUA 3L4IA 1WOQA 2D0OA 3VGMA 4BREA 5JLHA 4CZLA 2J4RA 4XH5A 3OHRA 4WQ4A 4BC5A 3FZKA 3O1BA 4CD3A 5I9EB 4CZIA 4PL8A 3AAQA 3FGUA 3VOVA 4B1VA 4BRNA 4M63C 1BDGA 2P9NA 2HF3A 4BRHA 4F9OA 4K43A 5F2RA 3LM2A 5AQRA 2E2NA 5EXWA 3WEEB 1DGKN 4CZFA 4XEIA 1BA0A 4BR4A 3UKRB 4DQ8A 5AQKA 5AQJA 1NWKA 2YJFA 3O6WA 1E4FT 4CI6A 3QB0A 1S22A 2Q0RA 3KZBA 1NM1A 2IVOA 3VETA 4Z94A 3SK3A 2YHYA 1ZC6A 1QHAA 3CJ1A 1T44A 4A61A 2P9NB 2FSJA 1QQNA 1KAXA 2PAVA 1R59O 5JLFA 4BQLA 1SZ2A 4WQ5C 4FOIA 2GUPA 3A0IX 1LOTB 2A5XA 4H03B 3VEXA 3UE5A 2V7ZA 2V7YA 3MN9A 5F0XA 1BUPA 3FFKB 4KBOA 4MO5A 5AFUH 1ATRA 3LDOA 3AY9A 3I33A 3O1WA 4BC2A 4PL7A 2Q2RA 1BOTO 1QZ6A 3VF2A 4FWSA 4MLHA 2P9UB 4CJ7A 2HOEA 5KPRA 2GWKA 2HMPA 5AZIB 4C23A 4BQZA 1NGGA 3WT0A 1HLUA 1GLFO 4BRKA 1V4TA 1Z6RA 1GLCG 1ZBSA 2Q97A 4QS9A 2NZTA 4IXCA 3IDHA 1XQSC 3DWLA 5AQMA 3W3DA 2ZWHA 4CZMA 1OKJA 3WXJA 3H1VX 3ZX0A 4BRPA 4AM7A 5BRFA 3L0QA 3H1QA 4B1XB 4FO0A 1TYQA 1C0FA 3WQUA 2E8AA 3CETA 4JNEA 4ISEA 3D7EO 4BGAA 2W40A 4H0PA 4CD1A 4EAHD 3F9MA 5EOYA 3L6QA 1K8KB 5BR9A 2I7PA 5AQFA 4ISFA 2ASOA 3JXUA 4JD2A 3O5BA 5AQNA 4FSVA 2AA4A 1Q18A 2VWBA 3B8AX 3CHWA 4H5TA 4BRQA 1KAYA 2QWRA 4B1YB 3CI5A 3A5MC 4JN4A 3AAPA 3WEEA 3FZHA 3MN6A 4M7YA 2I7NA 4RCHA 3KVGA 1NGDA 1NGBA 4IJAA 5ELZA 1TUUA 3ATUA 5KPZA 4J8FA 5AQLA 3LL3A 3A5NC 4JAXA 4EHTA 4B1WB 4BG8A 1SAZA 5BREA 2P9PB 4FWNA 2YCHA 1NMDA 1NLVA 4E1JA 3MK6A 4JD2B 3SMPA 1S3XA 4CBWA 5E26A 4FOEA 2E1YA 3VEVA 1GLLO 3A5LC 1RGIA 3IUCA 5LJWA 2F9WA 1HPMA 4BRIA 1U6ZA 3LDLA 4WQ4C 1Y64A 2YI1A 2ZF5O 3BEXA 2A41A 2CGJA 3RSEB 2GEMA 3WXLA 2P9KB 3CJ9A 4FWOA 4B1ZA 3CERA 5EVZA 2UYTA 2D0PA 4CBUA 4YDUC 2YHXA 4RWTA 3ENOA 1ESVA 2DPNA 5JMVA 3VEOA 2H3GX 3GG4A 2FF6A 4B9QA 4MO4A 3LDNA 4RTFD 3WUHA 4H5VA 3MN7A 3QFUA 3SJHA 5AQZA 2P9UA 2IIRA 3KHYA 2P9LA 4CBXA 4FWQA 1J6ZA 4H0YB 2Q36A 5AZIA 5BPMA 2NRHA 1NGHA 2P9IB 2A42A 3H6EA 1LCUA 1T6CA 5F1XA 4I6MB 2E2PA 1NGCA 4QS8A 4BRFA 5KQ8A 3QBWA 2AP1A 4WQ5A 5AFUA 5JICA 3IFRA 4MLEA 3ULEB 2CH5A 3R6MA 3VF6A 1HKGA 3QDKA 1RFQA 4CZHA 4BC3A 5FPDA 2ASMA 3LDPA 3BF1A 1K8KA 3ZEUA 5CE3A 3G25A 4HWIA 3ZETA 4AM6A 2P9LB 4H5RA 3QMLA 1NGJA 4H5NA 3BUZB 4FPAA 4BR9A 3UB5A 2NLXA 2ZGZA 3EKUA 5KPTA 3HM8A 3VENA 1BG3A 3ZX3A 4Y0WA 2VYPA 3D2FB 1XUPO 1EQYA 3VPZA 3VGKA 5FPNA 5B8HA 3VGLA 3MDQA 4XH4A 4BG9A 1C0GA 3CQXA 2Q0UA 1HX1A 3AARA 3CJAA 3FLCO 4CZGA 3WXKA 1MWMA 2QWMA 3CIPA 1JCFA 4DB3A 3ENHA 1NGFA 1MWKA 1NBWA 1DEJA 2P9PA 1BU6O 3ZEUB 4CZKA 5FPEA 2WUSA 5BN8A 3M3ZA 3ZETB 2Q31A 1GLDG 4BRMA 2P9SB 4O5FA 1QQOA 3EN9A 4FWMA 2E20A 3MCPA 3HZ6A 2FF3B 4K25A 3C7NA 2FLOA 2FSKA 4BC4A 4FWLA 2ZGYA 3RSEA 1GLJO 5AQOA 2P9KA 2PBDA 4IJNA 1HKBA 5BPLA 2E1ZA 4H0VB 4H5WA 3A5OC 1QZ5A 5AQGA 5EX5A 1H1VA 3DXKB 3R8EA 2HF4A 4PKGA 2V52B 1X9JA 3BP8A 2QWLA 4BR0A 5AQXA 5TKYA 5ADXH 4QS7A 4EIAA 1ATSA 4EFHA 2F9TA 2QM1A 3U8XA 3GL1A 1D4XA 3ID8A 4PKHA 4BVPA 1BWFO 1U2VA 4A62A 2IVNA 1IJJA 3ZX2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C7NB 4E0DA 2JLEA 2E5LK 3GOIA 2QWQA 5LMUK 1MDUB 4CEOA 5M1OA 3DMJA 4BEBA 3LPUA 3DOLA 1QQMA 4MQ3A 5EY4A 3G4SN 5LJVA 2O8EA 4JRPA 3J7AP 3G71N 4ICLA 4FLUA 2DFFA 3SLCA 4B9TA 3AGKA 1YXQA 1K8AO 1MA9B 3BF3A 3FR0A 4YOTA 4YORA 3C0BA 4A2BA 3P39A 3IKMA 4BRDA 1E4GT 5KQDA 1O1WA 3DXMB 3THXB 1VSJA 3D6RA 4FLTA 4IO8A 1KXPA 2E6MA 3D2FA 5FPMA 1NK5A 4GW6A 4JI1K 4CFDA 4ELUA 3TU5A 1WB9A 3NVMA 3AVGA 5KRSA 4LF4K 4LH4A 1SQKA 2EWSA 2A6AA 4W5TA 3MXIA 3AVAA 1L3SA 3WQTA 3TTFA 3V4IA 2CH6A 4B08A 3UKUA 3EO3A 4RG8A 3L2WA 4M45A 3V1RA 2RF2A 2G8KA 3MXJA 1HPZA 3CJCA 4MDBA 5BN9A 3H45C 3DLKA 1QHTA 4LC9B 4Z0UA 2BANA 2D0AA 1L5UA 4HHTA 1N36K 3PUFA 1X3MA 5AQYA 3VEZA 1EKEA 1MU2A 3O80A 2EX3A 1LAWA 4CJUA 3Q7CA 4CE9A 4YHHK 3LDQA 3U6FA 4CEAA 1B92A 2Q1NA 1WBDA 2P1JA 4CZJA 5AR0A 4NLCA 3VF4A 4FK4A 3DI6A 4CF9A 3AA4A 1GLEG 5LL6Z 1U04A 3CG7A 2FSNA 3OYAA 3U9DA 4FPBA 4BROA 2YNFA 4A5BA 1IG9A 2QWPA 3NGZA 3CCMN 1K9MO 3CQYA 1VQPN 3KK1A 2HHXA 1HKCA 4ZHRA 3QERA 3HSCA 4KB1A 3PLAA 3W0LA 4L8RB 5DM6L 4OKEA 4E89A 2IS3A 3O4NA 3VQEA 4KHNA 3QICA 4K41A 3SQ1A 5J2QA 4BRAA 2CGKA 4CF8A 1VQNN 3AO2A 1NGIA 3VGMA 3QNNA 4OKJA 1RTHA 2IDOA 1RBVA 4WQ4A 4CVNE 4IDKA 2DY4A 1RBUA 4NXNK 3FGUA 4BRNA 2ZE2A 1YIJN 2HF3A 1EX4A 2OPQA 1CXQA 3F2KA 4K43A 5F2RA 3NH1A 3LM2A 2E2NA 2Z1IA 3TARA 4Y1DA 1HNXK 5EU7A 2VQFK 2RE2A 4IDHA 4XEIA 3UKRB 4OX9K 4Z4GA 4JKBA 4O8UA 3QLHA 3QB0A 1HNZK 4JI8K 2Q0RA 3KZBA 3CC7N 3DRPA 1Q8IA 4JI5K 2O8FA 1XNRK 1JLFA 1REVA 2UXCK 2RHKA 3SK3A 3VQ6A 3OYLA 1C0TA 4DTJA 2KZZA 1VQMN 4E7LA 4HVJA 3KLIA 5M1KA 4KTWA 4CK3A 4OPJA 1TVRA 2A5XA 4DTUA 4H03B 3ZSVA 3OYEA 5F0XA 3FFKB 4RW6A 5AFUH 3SBTA 4FJIA 3LDOA 3DM2A 4GVEA 3I33A 2NRTA 4IO9L 3RR8A 3VF2A 4FWSA 4MLHA 2VG5A 1VSKA 5KPRA 3PX0A 2GWKA 4AHVA 4BQZA 4N47A 3WT0A 1S9GA 1Z6RA 4ZTJA 1GLCG 1ZBSA 3V9WA 4QS9A 2F96A 1VAZA 1WSGA 3I55N 4BE2A 4FM1A 1VQ6N 2ZWHA 4JK7A 1E3MA 4DV4K 4DF4A 1TK0A 3LZJA 4LH5A 4BRPA 5BRFA 3L0QA 1HQEA 4JI7K 3OYGA 3WQUA 3TABA 1T7PA 3C6UA 3CETA 3LWLA 2W40A 4H0PA 3KLGA 3M8QA 1K8KB 5BR9A 4C8OA 2RN2A 3C6AA 2ASOA 4I9LA 1BQNA 2OTLN 4KHYA 4CGIA 1TAQA 2IGIA 1FK9A 3O5BA 5AQNA 2WFBA 4FSVA 1BCOA 1HNVA 4BRQA 4B1YB 5JS2A 3L3VA 2X6SA 4DR7K 1UWBA 5ELZA 3QEIA 3S3MA 5AQLA 3LL3A 4FM2A 1HNWK 5C10A 3A5NC 4JAXA 1S1XA 3MX5A 1YJNN 4LSLA 4B1WB 1L3UA 5HL7L 1NMDA 3MK6A 3OW2M 3PO5A 3HP9A 4Z4EA 1GLLO 4JKGB 1OH6A 3THWA 1RGIA 1SUQA 2E4LA 1W7AA 3ZSOA 1HPMA 1S5JA 1JLCA 3THYA 2XY8A 4M3RA 4WQ4C 2YI1A 4E72A 4N5SA 4ILGB 4CIGA 2CGJA 3RSEB 4F4KA 4O44A 3O9SA 2YNHA 1TL3A 4DS4A 4ID5A 2Q3SA 3O4QA 4BACA 1HYVA 3HPGA 5J2NA 1Z26A 4NXMK 2ITGA 5EVZA 2UYTA 3PX4A 1KQSM 2HHQA 3LWMA 2PYJA 3RR7A 3ENOA 5C12A 2O8DA 2DPNA 3WNHA 3VEOA 1RDCA 1SKSA 5T7BA 4LSNA 1JLAA 1SL2A 3QFUA 3SJHA 5AQZA 2O4IA 3KHYA 2UUCK 2O8BA 4H0YB 2Q36A 5BPMA 4DQSA 1NGHA 2O8CA 2A42A 2O4GA 3ZSQA 3HK2A 2XY5A 4DLGA 3CCVN 1NGCA 4DSJA 4QS8A 4Z4IA 5KGWA 1XMOK 3A2FA 4WQ5A 4JKAA 5AFUA 4FLZA 1UAXA 3R6MA 4CJTA 4CK1A 1FXXA 4IBNA 4UQGA 3AA2A 3SUOA 4HCBA 2P9LB 3AO5A 4FPAA 4DV3K 4AHUA 4A59A 1BG3A 3ZX3A 1KRPA 4QAGA 3D2FB 3VTIA 3HP6A 2IC3A 4XH4A 2ZD1A 4BG9A 3SAFA 4JI2K 1QSSA 4DFJA 3S3OA 1CZBA 4N76A 1HX1A 1KVCA 4CF2A 2HMIA 2OZMA 1M90O 4DU1A 3WXKA 4JKEA 1MWKA 1NBWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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