1PF8A

Crystal structure of human cyclin-dependent kinase 2 complexed with a nucleoside inhibitor
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title SU9516: biochemical analysis of cdk inhibition and crystal structure in complex with cdk2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 69
structure length 298
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1pf8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1pf8A01
2P4IA 4DH1A 4QP7A 2I0VA 5CT0A 5ETFA 4BZNA 4HOKA 3FSFA 5E8SA 4A9TA 5AIKA 4JBQA 3WF5A 4ALWA 3SG8A 2X1NA 5CAOA 1QPJA 3GU6A 4EC9A 4V0GA 5A6OA 5DG5A 4O84A 3UOJA 2PUNA 2G2IA 4OTPA 2I0EA 4AW1A 4UV0A 3VBTA 4QMTA 3CIKA 4IZYA 3HX4A 4MH7A 1HCKA 3K2LA 3KRWA 3QKLA 1OL1A 5CS6A 5TF9A 3BCEA 3UG1A 3GB2A 4F9WA 2GNJA 3ZM9A 5EW9A 1U59A 2X9FA 2EB2A 2HWOA 3Q04A 3H10A 1S9JA 4FTUA 1V0PA 3R8MA 3RPSA 3UZRA 2VWVA 5AAGA 4NJDA 4YJSA 4IDVA 1UWJA 5L2IA 3TUCA 3PVUA 5IQAA 4AX8A 3ZXTA 3F88A 3PIZA 4YZBA 4N57A 3ZHPC 3F3WA 1XH9A 2XEYA 3NW6A 3FKNA 4FTLA 4QQ5A 5AP5A 5L2QA 3ZBXA 3R9HA 1OL6A 5KNJA 3BI6A 3ZC5A 2HZIA 3KEXA 4M69A 5A3XA 5AP7A 3W2CA 4WRGA 4JAJA 2UW9A 3BE2A 3ZSHA 2CGWA 2HZ0A 2YIRA 3T3VA 3VS5A 4ANNA 3UMWA 5CEMA 4OGRA 3QRIA 5KBRA 5L6PA 3JS2A 3KK8A 5FLFA 3LM0A 4OAUC 1KSWA 4C0TA 3DPKA 3OCGA 4KD1A 1YOLA 4J95A 4MF0A 4PMSA 4EOKA 4AOIA 4YTCA 4UYAA 4YNEA 3O8TA 3W2PA 3DJ6A 3PJ2A 3U54A 3R8UA 1CKPA 2VWBA 1VJYA 3ENHA 4RRVA 4E1ZA 4FZAB 3QKKA 3EOCA 4X2KA 5HQ0A 4D4VA 2YM7A 2ZYBA 4RC2A 3C50A 3RNIA 4D2RA 2WGJA 3KMUA 4N4SA 4RBLA 4U8ZA 1PKDA 4ANOA 4BB4A 5GZ8A 4J1RA 4JX7A 4MX9A 5K4JA 4IMYA 5D1JA 3FEGA 3NUYA 3EQIA 4FYNA 5FQDC 3RI1A 2QKWB 2ITVA 3F3ZA 3CTJA 5C4LA 3AD5A 2QG5A 2LAVA 5K9IA 1MQ4A 4W9XA 1WBVA 3PVWA 3LJ1A 4JIAA 4DGMA 3VBXA 3V5JA 5AP1A 5CEIA 5JRSA 4JJRA 2I0YA 3OWPA 4L3PA 3QU0A 3FKLA 4IC7A 4EEVA 1KUTA 1HCLA 3BEAA 4E7WA 3PRIA 3FLYA 4PL4A 3C0GA 3TJCA 4BF2A 3COMA 3SX9A 1Y6AA 1OZ1A 4RC4A 4E5AX 3TL8A 2IVSA 5CEOA 3WZUA 3R7VA 3UIMA 2ZMDA 3TZ9A 4HZRA 4UN0C 4D4SA 3KMMA 5CI6A 4EK4A 4GIIA 5FTGA 4I6HA 2R3GA 4YP8A 4QP8A 5CAUA 2VAGA 4O82A 4FNWA 4FV0A 1FVTA 3FI8A 3R7GA 4QP2A 4B4LA 4ANLA 3SXSA 2CCIA 4QMWA 5DNRA 3QQHA 4QQCA 2YCQA 4ZP5A 2R3IA 5JFWA 2OSCA 4FL2A 2RSVA 3OG7A 4ACCA 4D2PA 5EOBA 5GHVA 3HAMA 4ALVA 1BLXA 3ZO4A 2FVDA 3NDMA 2PPQA 3BQRA 1JKSA 3P86A 4TY1A 4GG5A 5M4UA 3OT3A 5ANIA 4AT5A 2BUJA 5AX3A 5ANKA 3PG3A 1IRKA 4F09A 3KULA 4UMQA 4TZRA 5JKGA 4RZWA 4C3RA 3IK3A 2UZDA 2J5EA 3AT2A 2OXYA 4FTTA 4U3ZA 4DLJA 4FTKA 4QRCA 4BI2A 1U46A 3U55A 1JKLA 1LPUA 2LGCA 2BR1A 3FZPA 3R02A 2PVFA 5CSVA 4K18A 1OITA 2V0DA 5AP6A 3RM7A 1XH5A 2RFSA 3HMNA 4O2PA 2AUHA 3AQVA 4ARKA 2ZOQA 4F1TA 3V01A 2R7BA 4I94A 3PJCA 4M8TA 2PVKA 4KSQA 2F7XE 5H3QA 5H9BA 3RPVA 5JZJA 3Q96A 5EM8A 4YMJA 2F9GA 4I4FA 4BTMA 1DI9A 3KVXA 5D41A 2Z7QA 3PPJA 2PVMA 1OUYA 4TWOA 4M7IA 2BIKB 2R3PA 3G2FA 5HVKA 4FEQA 4ITHA 3H9OA 2JBPA 3ZEWA 3CKXA 2I40A 3MH1A 1JQHA 3V04A 5AEPA 2P3GX 1NVQA 3P7AA 5K3YA 4DEEA 2B1PA 3ELJA 4JDIA 4HYUA 5TT7A 2W17A 4FSTA 3QX2A 3VUKA 4FZ7A 4LQMA 2JFLA 3NMUF 2VWWA 3M42A 3H3CA 5ETCA 5KMNA 2VTIA 3AOXA 5CVHA 4RFMA 2XNGA 4CEGA 3HUBA 4MF1A 4FNZA 2XCHA 5IQHA 4YO6A 3MVHA 1YOJA 1Q61A 3GOKA 2VO0A 1GIJA 3OF0A 2H34A 2GTNA 2R64A 5I9ZA 4ZS4A 3OWJA 3DY7A 2GNHA 3GU5A 1ZOGA 4UMPA 4IWOA 4E4XA 5J79A 4X3FC 5J7HA 1GIIA 3PJ8A 4CFFA 3GI3A 2OU7A 2XK8A 3GENA 4PDPA 4YGAA 4USFA 5EW8A 3CSVA 4MQ2A 4DEIA 2R4BA 3DBEA 2G2FA 3EN4A 5BUIA 4K6ZA 4Z7GA 5BYYA 3OFMA 4EH7A 2W06A 3HUCA 4I23A 2WFYA 3W10A 4IC8A 3I4BA 3BIZA 4AE9A 5AA8A 4ACMA 4YZDA 4DBNA 4ZY5A 2OJFE 5CEKA 5JQ8A 3AMYA 1CM8A 2C0IA 4CFVA 2BFYA 4XP2A 3P79A 3QCYA 3F69A 3ORZA 3QUPA 4JQEA 1FQ1B 2C3JA 3ATSA 3EIDA 4IFGA 3DS6A 1YI4A 3OXZA 2PSQA 3NCZA 4FSQA 2JKKA 3TV4A 2ERZE 4MVFA 2YAKA 3THBA 2F7ZE 5AJQA 3ZDUA 3QQLA 4EWHA 4EH8A 3K5VA 4GFMA 2ITYA 2UV2A 5F20A 4TL0A 2O64A 4MWIA 3QKMA 2W4JA 2CJMA 3TUBA 5E1EA 2OBJA 1M7NA 3GBZA 2XJ0A 2UVXA 1NXKA 1OL5A 3QCQA 4GUEA 3BQCA 4IACA 4QMOA 4RIYA 1SZMA 5DT0A 1H07A 4E4MA 4KBKA 3R83A 3BWJA 2QO9A 3VS0A 2C6MA 4YU2A 2QO2A 4FL3A 5HO7A 4JQ7A 3PXRA 1U5QA 2BFXA 3QGWA 2B53A 1XQZA 5C1QB 1Y8YA 1FVRA 4EHGA 3RKBA 3OWLA 1Q5KA 2X81A 4IW0A 3GC8A 3B8QA 4JLCA 4ACDA 2W4KA 3QLGA 2VO7A 4J53A 4FEXA 4WBOA 5GIOE 2V55A 4DFYA 3Q9ZA 4F0IA 4CZYB 3C4ZA 1PXPA 5LWNA 3W2SA 4XRLA 1YHSA 5FBNC 5AUWA 1BI8A 4AGCA 2XRUA 2FSOX 5A4EA 3LXKA 3JR1A 2XIRA 3DCVA 4ALUA 2JDSA 4QNYA 4W4VA 2YJRA 1Z57A 4L01A 3ZU7A 3FLNC 1H1SA 3E8NA 5JT2A 3EQCA 1R39A 2WTKB 3R9OA 2OF2A 4EOJA 3F2AA 4RFYA 3F5PA 3SOAA 3W1FA 2VU3A 1WZYA 2W4OA 5AR2A 2YIQA 4MAOA 3FMMA 1UKHA 4W4WA 4JS8A 3MTLA 4WIHA 2GQRA 4X2JA 3TNHA 2UW0A 1F0QA 4MD7E 4FGBA 2YCRA 4FKOA 4J52A 2BZHB 4IM0A 3NEWA 4W4XA 5DFPA 3JVRA 3VWAA 4A4OA 4Y8DA 5L8KA 3MPTA 1OPKA 1Q97A 2JC6A 3NIEA 1XO2B 4BCKA 3F9NA 4XMOA 4DEBA 4BYJA 2YDJA 3PPZA 1OECA 3R6XA 2ZAZA 5HG5A 4EZ3A 1IR3A 3BWFA 4AUAA 4IJ9A 2ONLA 2IN6A 2IZSA 3PXFA 3HRCA 4M67A 4DCAA 2GSFA 1A06A 4LOQA 5CAVA 1PMVA 4RX8A 3L8SA 4MTAA 5CI7A 3MIYA 2O5KA 2W7XA 2FGIA 2WTCA 4M84A 4QP4A 1YQJA 3DJ5A 2BTRA 4LM5A 1Y8GA 2J7TA 5AFVA 3EKKA 1B38A 1SVHA 4GK3A 5AV0A 3B2TA 4L00A 4XH6A 2C6EA 3QYZA 3ORKA 2EB3A 5AV3A 1XHAA 2ZDTA 2VTTA 3R7YA 1GJOA 4R1VA 3EJ1A 1ATPE 1J1BA 3U87A 3A7HA 2C0TA 2YM8A 1M14A 3I0QA 4FUYA 5IA5A 1XH4A 1G5SA 4JBVA 4EKLA 4LYNA 2JAVA 2VGOA 2VTMA 3AT4A 4I20A 3R8ZA 4I6FA 3DBCA 3OOMA 4PQNA 4X7QA 3KN5A 2Y0AA 4QP9A 4UEUA 4C59A 3QWJA 2XK7A 3FC2A 4D2WA 4BCOA 4FVRA 4QMMA 4FIJA 5HICA 4DE4A 5EHLA 4DTAA 2VTOA 3KXNA 4A9SA 2R3JA 5C9CA 1Y6BA 1ZZLA 3OW3A 1XWSA 2FSTX 4O2ZA 4BKJA 1Y57A 2CN5A 3OW4A 4GU6A 5J5TA 5KUPA 5HIEA 4IHPA 1PXJA 4FTJA 3AC2A 1V0BA 2UUEA 3EFJA 4JI9A 4LUDA 4EK6A 3MY5A 4BTFA 4EH4A 1PMUA 2XS0A 3PPKA 4BBMA 5FP5A 5JN2A 4USEA 2WMXA 4IWPA 5DYJA 4LV8A 3EKNA 2ZMCA 2UZTA 3FL5A 2CLXA 2QHMA 3DK6A 2VTNA 3I79A 3TNQB 4BGQA 4CTCA 5IQGA 5LMKA 3UTOA 5FGKA 3GU4A 3O23A 2B52A 2PE1A 4CQGA 3H9RA 2O0UA 4WT6A 4HGEA 4IB3A 3G6GA 1UNLA 4AGWA 4U41A 5JQ5A 4DH3A 5GIPE 5GJFA 3PVBA 3PE1A 4EOLA 4OTHA 1GOLA 2GHGA 5IF1A 4XOZA 1GZ8A 3L9PA 4DH7A 3TG1A 3QLFA 1HOWA 1R0PA 5IEXA 1OI9A 2WIHA 4IM2A 3ZLXA 4L42A 4M0ZA 4FC0A 4U81A 4C7TA 3QHRA 4KBAA 3N51A 1LEZA 5CEPA 2WMQA 1IG1A 5ANOA 3BGZA 2PK9A 2ETMA 4EHVA 5CQWA 2VN9A 3P4KA 3GC7A 4GFOA 1AQ1A 4QQJA 4PNKA 4FUXA 2H8HA 4S33A 5CENA 2JGZA 3CJFA 3FDNA 3O8UA 5FP6A 2OZAA 4APPA 3SGCA 3R1YA 3WYXA 3BELA 4CYIA 3W2OA 3BGPA 1OKZA 3ORMA 1Q8UA 5LMAA 3RWQA 3PWYA 3UNJA 4DTKA 4EI4A 3NVMB 4TW9A 3RK9A 4F9YA 3MB6A 3C9WA 2C0OA 2OJ9A 3VF8A 2B9HA 2VX0A 5A4CA 3IOPA 3Q53A 5CU0A 3KB7A 4EBVA 1DS5A 3JUHA 3PG1A 4EONA 4M13A 4O22A 3P7CA 4XG9A 3ZFYA 3M1SA 1YHWA 3RM6A 4BRXA 4GSBA 4AN9A 3HMMA 4HYSA 1UA2A 4BIEA 4DAWA 3H4JA 4Z7HA 2X4FA 2QOOA 5H8EA 2CNQA 3D7ZA 3R7EA 3II5A 2BROA 4FKTA 4LFIA 5C27A 4C36A 1JSVA 3FMDA 3GOPA 5FD2A 3A61A 3OWKA 2DS1A 3MWUA 2BRNA 3UJGA 1PW2A 4H3PA 4RWJA 1QCFA 4MD9E 3NAXA 4E93A 4J99A 4XBUA 4XHKB 4D0WA 2OIQA 4F6UA 2Q0NA 4FKLA 4BYIA 4GKIA 2OLCA 2C6KA 2Z2WA 2HXLA 4CNHA 2ZVAA 3KCKA 3UIXA 5JSMA 1KE8A 2PVYA 3EQPA 5EW3A 5DHJA 4TKSA 2GS2A 3P0MA 3PP1A 5FRIA 4XG3A 4BDKA 1FBNA 2W9ZB 5IQBA 4C4GA 3AGLA 3WOWA 4QQTA 5IDNA 2P2HA 2PZPA 3KCFA 5T6KA 4IIRA 1YWVA 3HRFA 3V5PA 3AXWA 3PIYA 4AZVA 2FO0A 2BZKB 3V8TA 3DKFA 3VNTA 4C58A 5CZHA 5DI1A 4BDBA 2Q0BA 5LVOA 3NYOA 4BI0A 5KMLA 3JXWA 4NM5A 1OBGA 3VS2A 4JBOA 4F9AA 3OCTA 5F94A 2WOUA 4XV9A 1PXMA 4KKEA 2WQNA 3AC4A 2WHBA 5AUYA 5JRQA 4C57A 3KA0A 3VQUA 3R28A 3LCTA 3POOA 4EC8A 5IH4A 5AUVA 1ZLTA 2W1GA 2JKMA 2B55A 3NUSA 2C6IA 1FVVA 3FQEA 3GCPA 4QOXA 5ANDA 5DWRA 5DRBA 5HE2A 2PVJA 3ALNA 4DEHA 2XKDA 5AR5A 4BCJA 3HP2A 4TN6A 1JVPP 4BDIA 3AMBA 5CVGA 3RINA 2V7OA 3ZXZA 4C34A 4R7HA 3RTPA 4ITIA 4U9AA 5I9UA 3QUDA 1PXOA 4BKYA 1YDSE 4NTTA 1K2PA 3W2RA 5CF6A 2OF4A 4MXZA 5HI2A 4Q9ZA 5K0XA 3S1HA 1URCA 2QOQA 2WQEA 3E63A 3FLZA 5CSHA 4YJQA 4TYHB 4EH6A 2G15A 2YLFA 3I7BA 5CSXA 4EK3A 3R00A 1NT2A 2XIKA 4RVTA 4BTJA 4NU1A 1R3CA 2UVZA 2WMTA 2ETKA 3CBLA 4IWDA 1IASA 1FMKA 2WXVA 3QC4A 1Q3DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P4I A;  4DH1 A;  4QP7 A;  2I0V A;  5CT0 A;  5ETF A;  4BZN A;  4HOK A;  3FSF A;  5E8S A;  4A9T A;  5AIK A;  4JBQ A;  3WF5 A;  4ALW A;  3SG8 A;  2X1N A;  5CAO A;  1QPJ A;  3GU6 A;  4EC9 A;  4V0G A;  5A6O A;  5DG5 A;  4O84 A;  3UOJ A;  2PUN A;  2G2I A;  4OTP A;  2I0E A;  4AW1 A;  4UV0 A;  3VBT A;  4QMT A;  3CIK A;  4IZY A;  3HX4 A;  4MH7 A;  1HCK A;  3K2L A;  3KRW A;  3QKL A;  1OL1 A;  5CS6 A;  5TF9 A;  3BCE A;  3UG1 A;  3GB2 A;  4F9W A;  2GNJ A;  3ZM9 A;  5EW9 A;  4AXC A;  1U59 A;  2X9F A;  2EB2 A;  2HWO A;  3Q04 A;  3H10 A;  1S9J A;  4FTU A;  1V0P A;  3R8M A;  3RPS A;  3UZR A;  2VWV A;  5AAG A;  4NJD A;  4YJS A;  4IDV A;  1UWJ A;  5L2I A;  3TUC A;  3PVU A;  5IQA A;  4AX8 A;  3ZXT A;  4DDG A;  3F88 A;  3PIZ A;  4YZB A;  4N57 A;  3ZHP C;  3F3W A;  1XH9 A;  2XEY A;  3NW6 A;  3FKN A;  4FTL A;  4QQ5 A;  5AP5 A;  5L2Q A;  3ZBX A;  3R9H A;  1OL6 A;  5KNJ A;  3BI6 A;  3ZC5 A;  2HZI A;  3KEX A;  4M69 A;  5A3X A;  5AP7 A;  3W2C A;  4WRG A;  4JAJ A;  2UW9 A;  3BE2 A;  3ZSH A;  2CGW A;  2HZ0 A;  2YIR A; 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