The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
|
sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
|
| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
21
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| structure length |
83
|
| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UGV A; 2GGR A; 1PKT A; 4JJC A; 1PHT A; 1TUD A; 3CQT A; 1WA7 A; 1FYN A; 1NYG A; 1A0N B; 2J06 A; 4HCK A; 3M0S A; 2YUQ A; 3I5S A; 5IXB A; 2CT4 A; 1UJ0 A; 2L0A A; 4RUG A; 2JS2 A; 2K9G A; 2OAW A; 4J9B A; 2D0N A; 2AKL A; 4Z89 A; 4KRT A; 1PRM C; 3QWX X; 3H0F A; 2AK5 A; 2DX1 A; 2O31 A; 5IH2 A; 3REA B; 4AG2 C; 3VS5 A; 4J9E A; 2KT1 A; 3UA6 A; 4LN2 A; 3I9Q A; 2RF0 A; 1HD3 A; 1OPK A; 2RQT A; 1U5S A; 2CH4 A; 2CH4 W; 2O9S A; 4HVU A; 2VWF A; 4F14 A; 1ZLM A; 1NEG A; 1NLP C; 2FPD A; 1MUZ A; 2FEI A; 1AWO A; 2KXC A; 1UE9 A; 2K2M A; 1UTI A; 2X3X D; 1K0X A; 1B3Q A; 1RLP C; 2NWM A; 3LH5 A; 3C0C A; 1JEG A; 1I1J A; 1T0J A; 1YWO A; 4M4Z A; 2ROL A; 1J3T A; 4AFZ C; 3IQL A; 2AKK A; 2IIM A; 2YUO A; 2F2V A; 2XMF A; 2C0I A; 1X43 A; 3M0Q A; 4D8K A; 1GFC A; 3I35 A; 5FWC A; 5L23 A; 3UAT A; 1JXM A; 1SSH A; 2PZ1 A; 4DEX A; 4R0K A; 4J9I A; 2W0Z A; 4RTT A; 1CKB A; 4AFQ C; 4JPB W; 4D8D A; 1UUE A; 4OMO A; 2DL5 A; 2RQU A; 4RTX A; 2EYX A; 2ED0 A; 1ZUU A; 3H0H A; 2DM1 A; 2DBK A; 1XOV A; 4OML A; 2YUP A; 1M3B A; 1AZE A; 3VS0 A; 2DF6 A; 5IHK A; 3A98 A; 2LX7 A; 1JXO A; 2YSQ A; 1S1N A; 2BZ8 A; 4OMQ A; 2M51 A; 2DRK A; 1GBQ A; 3R6N A; 2D8H A; 2HCK A; 2JTE A; 2YT6 A; 4RTW A; 1K0S A; 2GBQ A; 2CT3 A; 2JMA A; 4RTY A; 1M3C A; 5I22 A; 1JQQ A; 3GBQ A; 5GJW B; 1M3A A; 2KBT A; 2DIL A; 1H8K A; 2RN8 A; 3M0R A; 2FPF A; 4QT7 A; 2LNH B; 2K7A A; 1ZBJ A; 1OV3 A; 2FRW A; 2B86 A; 1KFZ A; 2LJ0 A; 1K4U S; 3QWY A; 3NMZ C; 1QCF A; 1BU1 A; 4CC2 A; 2QDL A; 1BBZ A; 2ROT A; 4OMN A; 1SRM A; 3RNJ A; 2C0T A; 5GJV B; 2L3Q A; 4Z88 A; 1MV0 B; 2L2P A; 2KRN A; 2RNA A; 2VVK A; 2W10 A; 1CKA A; 3EGU A; 2EKH A; 2DJQ A; 1WIE A; 1T3S A; 4ZNX A; 1QLY A; 3EG3 A; 2F2X A; 2BTT A; 2YUN A; 2MOX A; 2C0O A; 2JXB A; 2HSP A; 3NPF A; 2KYM A; 1YP5 A; 2X3W D; 3JV3 A; 3TSW A; 3SHW A; 3RBB B; 1G83 A; 3U23 A; 1WXU A; 1T3L A; 1M30 A; 2DVJ A; 1G2B A; 3O5Z A; 4JJB A; 2A37 A; 3M0T A; 3PE0 A; 2DE0 X; 4OMP A; 1NYF A; 4HVW A; 2FRY A; 2KXD A; 1PWT A; 1JO8 A; 3KFV A; 2KNB B; 2EYY A; 3REB B; 1WYX A; 1GFD A; 3EHR A; 1UHF A; 2HBW A; 3THK A; 2LQN A; 1VYV A; 1IO6 A; 1FMK A; 4CC4 B; 1K1Z A; 2F2W A; 2NUZ A; 1TUC A; 1E6G A; 2DRM A; 4A63 B; 3ZL7 C; 4WCI A; 2BZX A; 1EFN A; 2RQW A; 2GTO A; 2A36 A; 2GQI A; 4Z8A A; 4DEY A; 2OJ2 A; 2KR3 A; 2MCN A; 2GTJ A; 1ZX6 A; 4HXJ A; 1QKX A; 4LE9 A; 3VS4 A; 1K9A A; 2DYB A; 1YNZ A; 1NG2 A; 2J6F A; 3M0U A; 1JU5 C; 1AEY A; 1YWP A; 3TVT A; 1GCP A; 1GRI A; 2DL4 A; 2J05 A; 4RTU A; 2GNC A; 2JS0 A; 4LUD A; 5EC7 A; 3NGP A; 3VS3 A; 2RMO A; 1CSK A; 2J7I A; 4Y92 A; 3EG1 A; 4AFS C; 2EGE A; 1H92 A; 1NM7 A; 1WFW A; 1ABQ A; 1VA7 A; 1ABO A; 2LMJ A; 2AZV A; 1PNJ A; 4LUE A; 1I0C A; 3VRZ A; 1GCQ A; 2KRM A; 1QWE A; 1W1F A; 4CC7 A; 2JW4 A; 1I07 A; 3VS6 A; 2HEQ A; 2DL3 A; 1V1C A; 4RTV A; 1MV3 A; 1OOT A; 1WX6 A; 1AZG B; 1UFF A; 2JM8 A; 5FWB A; 3UA7 A; 2RQR A; 2KRO A; 2KYB A; 2L3P A; 5I11 A; 1KJW A; 2J6O A; 5ECA A; 4F17 A; 1YCS B; 3M0P A; 2HDA A; 4LNP A; 1X6G A; 2RPN A; 1UJY A; 4GBQ A; 2EGA A; 2DLP A; 2L3S A; 1K76 A; 1PKS A; 1N5Z A; 1AVZ C; 2A28 A; 1BB9 A; 1OEB A; 1SHF A; 1X2Q A; 1AWW A; 2K3B A; 1SEM A; 4FSS A; 1X2K A; 2KRS A; 1AWX A; 1U3O A; 1B07 A; 2KE9 A; 1RI9 A; 2EGC A; 2D1X A; 2DL8 A; 1SPK A; 4K11 A; 1ARK A; 1AWJ A; 2A08 A; 1YN8 A; 2DNU A; 1E6H A; 4F16 A; 2ESW A; 1HJD A; 3ULR B; 4J9H A; 2O88 A; 2EYZ A; 1Z9Z A; 4ESR A; 2EBP A; 2PTK A; 4JJD A; 2FO0 A; 2DA9 A; 4HVV A; 2LJ3 A; 4J9D A; 4J9F A; 2OI3 A; 2CRE A; 1GCQ C; 2M0Y A; 2CSQ A; 4J9G A; 1ZUY A; 1TG0 A; 1UEC A; 2I0N A; 1RLQ C; 2LCS A; 2E5K A; 1ZUK A; 2CUB A; 2EYW A; 1X69 A; 2V1R A; 2ABL A; 1M8M A; 1WDX A; 1Y57 A; 1KSW A; 4IIM A; 1T0H A; 2ED1 A; 2J6K A; 2G6F X; 1LCK A; 2PNI A; 3EG2 A; 4CC3 A; 2ECZ A; 2CUD A; 2VKN A; 5HCK A; 2YDL A; 2CSI A; 1AOJ A; 1Z9Q A; 3PVQ A; 2SEM A; 5FW9 A; 2P4R A; 4X1V A; 1WXT A; 2O9V A; 3TSZ A; 1UHC A; 2KT8 A; 3I5R A; 2FPE A; 2K79 A; 1SRL A; 2V1Q A; 1Y0M A; 1HSQ A; 1QWF A; 1H3H A; 1GBR A; 4ORZ A; 1WLP B; 3FJ5 A; 1VYU A; 2D8J A; 1E7O A; 4IIO A; 2LP5 A; 5IHI A; 2BZY A; 4JZ4 A; 1W70 A; 1NEB A; 3EHQ A; 2CDT A; 3VS1 A; 2FG0 A; 2EPD A; 4E6R A; 4OMM A; 1UDL A; 2JT4 A; 3VS2 A; 2DL7 A; 1U06 A; 2LQW A; 3EG0 A; 3SEM A; 1UG1 A; 5IHN A; 1OPL A; 2EW3 A; 4GLM A; 3NHN A; 5IXF A; 1WI7 A; 4EIK A; 2SRC A; 1BK2 A; 1M27 C; 3UF4 A; 2JM9 A; 2ENM A; 3PVL A; 1KIK A; 2H8H A; 1NLO C; 2K6D A; 1X6B A; 1SHG A; 1QKW A; 1PRL C; 2EQI A; 2EVR A; 2DBM A; 1W6X A; 1AD5 A; 4JZ3 A; 4AFU C; 1RUW A; 1ZSG A; 3VRY A; 3VS7 A; 3H41 A; 1X27 A; 2MIO A; 2KEA A; 2O2O A; 1GL5 A; 4RTZ A; 2LZ6 B; 3H0I A; 1VYT A; 2LJ1 A; 2DMO A; 2AZS A; 2JMC A; 2RQV A; 2KGT A; 4J9C A; 4AG1 C; 1WXB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAM f; 4XTZ A; 2VYT A; 1TWB A; 4JJC A; 3CQT A; 4QVC A; 2V26 A; 1WA7 A; 3QXE B; 1NYG A; 2E12 A; 5LJ3 h; 3CC4 T; 3I56 T; 3AT1 B; 4HCK A; 3M0S A; 5I2S A; 2HD0 A; 2DEU A; 2YUQ A; 3HPW A; 1ZQ1 A; 2EQM A; 5CCA A; 4M7A D; 4QKU A; 1VQ5 A; 3BDU A; 1D09 B; 2EIF A; 1MMG A; 2JS2 A; 4M7A G; 2RK2 A; 1AHJ B; 4J9B A; 2JZ2 A; 2P84 A; 1R77 A; 3ASK A; 3REA B; 4AG2 C; 1RAE B; 5AT1 B; 3BY7 A; 4FSX A; 2XID A; 1XNI A; 1YBY A; 3NTK A; 4J9E A; 1VQK A; 4ZGJ B; 4LN2 A; 3Q1J A; 3V7R A; 2RQT A; 4HVU A; 2CH4 W; 1K73 R; 5LL6 S; 1UTI A; 5DLQ E; 2NWM A; 2X35 A; 3LH5 A; 3RDV A; 3OYD A; 3TRE A; 1JEG A; 3M55 A; 4M7A B; 4RG2 A; 2CGH A; 4AFZ C; 3IQL A; 4A4F A; 4M78 G; 5CQY A; 4B9X A; 2GF7 A; 2F2V A; 2CS7 A; 3EGX B; 1JB0 E; 1X43 A; 1QVG S; 2RHI A; 2YXY A; 3I55 T; 2PZ1 A; 4N0A C; 1YJW Q; 2EJ9 A; 2W0Z A; 4RTT A; 4AFQ C; 3JB9 I; 1D1A A; 3S3M A; 1BCM A; 1X75 C; 4QQD A; 3WXM B; 2CZ1 B; 1VQ8 Q; 3V7S A; 3FC3 A; 2DM1 A; 1VQP Q; 1YFN A; 4OML A; 3L2Q A; 4MML A; 3OW2 S; 2OX7 A; 3GPL A; 4JS5 A; 1S1N A; 2QA4 A; 2RHY A; 1GBQ A; 4KGV B; 3R6N A; 4M78 F; 3MEW A; 2CT3 A; 2JMA A; 3EGX A; 1JQQ A; 5GJW B; 4M7D F; 2DIL A; 1UGQ B; 2FYK A; 2LNH B; 4JUV A; 4A4G A; 3CCU T; 1TTH B; 3EGD B; 1KFZ A; 5GAN j; 1IHV A; 2E6Z A; 3QWY A; 2XKO C; 5GAM j; 2L5Q A; 2ZPB B; 4PJO E; 1BBZ A; 1LOJ A; 4HCC A; 1VQN T; 4WTO B; 5KE2 A; 3EH1 A; 3RES A; 4BI8 B; 1MV0 B; 2HQE A; 1VQK T; 1CKA A; 1VQM Q; 1S72 A; 1VQ7 A; 5AYF A; 4ZNX A; 3EG3 A; 2YUN A; 2C0O A; 2EYQ A; 2FZK B; 2X4Y A; 3JCM b; 2JXB A; 2HQX A; 3NPF A; 4KGX B; 1N8R U; 3TSW A; 3OB9 A; 1T3L A; 1G2B A; 4JJB A; 4MZP A; 1YJW A; 1M2O A; 2DE0 X; 4J8O A; 1WQW A; 4PL6 A; 2LQK A; 1NYF A; 4OMP A; 3EGD A; 3HRU A; 2MAM A; 1JO8 A; 3V7C A; 1WYX A; 5GMK e; 2HBW A; 2R57 A; 3OSV A; 5IAY A; 2E3H A; 4J6X A; 4BDY A; 5FRN A; 1FMK A; 1QW1 A; 1K1Z A; 4J6Y A; 3JCM d; 1VQP A; 1HYO A; 3RKW A; 1Y71 A; 4WCI A; 1JRI A; 1WQ7 A; 4PJL A; 2HMA A; 1ZA2 B; 1Q7Y C; 1EFN A; 2RQW A; 2A36 A; 3EG9 B; 5GAN 5; 2E41 A; 1K9A A; 2DYB A; 1VQ6 T; 1KQ2 A; 2J6F A; 3ME9 A; 4M7D C; 3UPU A; 2QA4 T; 1V29 B; 3QZ5 B; 1OZ2 A; 1GCP A; 1GRI A; 2PUK B; 3L42 A; 2J7I A; 3EG1 A; 4AFS C; 1PSF A; 1G3S A; 1Q86 R; 1WFW A; 2DEQ A; 1I81 A; 1PNJ A; 4LUE A; 3FRN A; 3CXC S; 4EMH A; 4CC7 A; 4M77 F; 2DZ9 A; 2JW4 A; 4M78 E; 3G4S A; 3JCM V; 2R58 A; 3RKY A; 3JCM f; 3EG9 A; 5LJ5 f; 1MV3 A; 2JNG A; 1UFF A; 4PKC C; 4NL2 A; 5D6Y A; 4LDW A; 5FWB A; 3UA7 A; 2WSF E; 3OQ5 A; 2OTJ A; 4J7F A; 5I11 A; 1YCS B; 4FIB A; 4PJJ A; 4FYX B; 1S72 T; 1VQ7 T; 4LNP A; 2RPN A; 3PTA A; 1RAA B; 2EGA A; 3OYM A; 1NBE B; 2DLP A; 3EFR A; 2A28 A; 2CP3 A; 4ELZ C; 4XTY A; 1W2B A; 1R0B G; 1X2Q A; 1RAI B; 2JOY A; 2K3B A; 4X9D A; 1AWX A; 2PVD B; 3JB9 F; 2DXT A; 1RI9 A; 3L2V A; 1SPK A; 2QQA A; 1YIT A; 3CCS T; 1PD0 A; 2K5F A; 4II1 A; 4TVR A; 1ZSZ A; 5DLO A; 1YN8 A; 2ZGW A; 1HJD A; 1JJ2 A; 3ER0 A; 2EBP A; 3OA6 A; 1TH7 A; 4HVV A; 2LJ3 A; 4J9D A; 4KGZ B; 2CRE A; 2M02 A; 3P8D A; 2YLB A; 3OBW A; 2LTO A; 1ZUY A; 5IN1 A; 1TG0 A; 5FRO A; 3R6O A; 2LCS A; 2ZPE B; 1VQL Q; 2E5K A; 1ZUK A; 2CUB A; 3SB2 A; 2ABL A; 3OY9 A; 2OTL T; 1KSW A; 4XTV A; 1T0H A; 3OYA A; 2LNV A; 4UC4 A; 3EG2 A; 5LJ3 f; 4XU2 A; 3QUI A; 2BE7 D; 4CC3 A; 5GAM g; 2K5I A; 3JCM c; 3SWN B; 1EZZ B; 2ZZD A; 1YJ9 T; 2FZC B; 3DLM A; 3G4S T; 3HKS A; 5GAN 2; 1WXT A; 3CMA Q; 4HT8 A; 3X25 B; 3TSZ A; 4L6V 5; 3FLG A; 2LVM A; 3KUF A; 3M4G A; 5GAN 7; 3C4S A; 3E9G A; 3I5R A; 2FPE A; 1YIJ Q; 1SRL A; 4C92 D; 1Y0M A; 1HSQ A; 1H3H A; 4FYV B; 3M56 A; 4ORZ A; 2RH2 A; 2OTJ T; 1ZSZ C; 4M77 E; 3CC4 Q; 4C92 G; 1VIF A; 2LP5 A; 2ZCF B; 3OS5 A; 4E6R A; 3TEE A; 1M1F A; 5GAN 4; 5KYU B; 1OPL A; 3M58 A; 4E2F B; 4OGC A; 3SWN A; 4GLM A; 2LRQ A; 3HRT A; 2LQ8 A; 3NHN A; 5CR2 A; 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2AHJ B; 3HTR A; 5L23 A; 4KUL A; 3GOX A; 2RJC A; 4KH0 B; 4J9I A; 1VQK Q; 3RMQ A; 3A8H B; 1C0M A; 1Q82 U; 3QYH B; 3M4Y A; 2BIV A; 4EPC A; 1M2V A; 4LD9 K; 2RJD A; 3H0H A; 3QG1 A; 4DBF A; 3VJP A; 4FYW B; 3BE3 A; 2QI2 A; 2YUP A; 1AZE A; 3I55 A; 1IZ6 A; 2A0F B; 3S6W A; 1BIB A; 2P0Q A; 2DRK A; 1HK9 A; 2CP5 A; 1RAF B; 1D3B B; 4C8Q C; 2D8H A; 3CCL T; 2DET A; 2HCK A; 2JTE A; 2YT6 A; 4RTW A; 1K0S A; 2O01 E; 4RTY A; 4OB1 B; 5I22 A; 2HAX A; 2R5M A; 1M3A A; 2MF2 A; 2KBT A; 4M75 C; 1Y07 A; 2CZ7 B; 3M0R A; 1GXI E; 4QT7 A; 1R0C B; 2HSE B; 3ZBD A; 2NUT B; 1KQS A; 2B86 A; 1K4U S; 1N6A A; 1SRM A; 3HFO A; 4LDY A; 2KAF A; 5GJV B; 4PJO B; 1XJW B; 1VQ6 Q; 1LNX A; 2VVK A; 4MZT A; 1K73 U; 2QA4 Q; 3V8K A; 4OMF B; 3CCU A; 1IGU A; 2DIQ A; 1T3S A; 1QLY A; 2BTT A; 1D3B A; 3LLR A; 3JCM g; 5LJ5 g; 5KYY B; 5HK3 A; 3CXC P; 1D0Z A; 1MGQ A; 3KBG A; 1VQN A; 1G83 A; 3U23 A; 1WXU A; 5A0D A; 1M30 A; 4JRQ A; 2DVJ A; 5DY9 A; 3O5Z A; 4NOY A; 1TOV A; 3MCA B; 2RJE A; 3CCV A; 5CIU A; 3M59 A; 3REB B; 1WJR A; 3EHR A; 2B8A A; 3THK A; 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