The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Complex (signal transduction/peptide)
|
| molecule keywords |
C-SRC TYROSINE KINASE SH3 DOMAIN
|
| publication title |
Two binding orientations for peptides to the Src SH3 domain: development of a general model for SH3-ligand interactions.
pubmed rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
5
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1994-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CKA A; 2HBW A; 1AVZ C; 2LQW A; 2O2O A; 2NWM A; 5L23 A; 1RLQ C; 1OPL A; 4J9G A; 1SSH A; 2LJ1 A; 2GTO A; 4J9E A; 1KIK A; 2EPD A; 2MIO A; 3M0R A; 4RTY A; 1M3A A; 2ENM A; 2LJ0 A; 1WI7 A; 2EKH A; 4Z8A A; 3R6N A; 1EFN A; 2KRM A; 2DL3 A; 3FJ5 A; 2L3S A; 2AZV A; 3H0H A; 3H0I A; 5FWC A; 2CT3 A; 1B3Q A; 2PZ1 A; 2W10 A; 2M51 A; 2XMF A; 4Z88 A; 1HJD A; 2YUP A; 1NEB A; 1UDL A; 4AFZ C; 3UF4 A; 4DEX A; 1TUD A; 2CRE A; 3QWX X; 2YDL A; 5I11 A; 2GTJ A; 2CH4 A; 2KRN A; 2DL7 A; 2EGE A; 2C0I A; 1MV0 B; 2DVJ A; 4OMM A; 4E6R A; 1MUZ A; 4IIM A; 1GCP A; 1OPK A; 4QT7 A; 1BBZ A; 1WFW A; 1X6B A; 3TVT A; 4F17 A; 1ABO A; 1Z9Z A; 1VA7 A; 2ESW A; 4FSS A; 4JZ4 A; 4JJB A; 1RLP C; 2VKN A; 2ECZ A; 4RTW A; 5I22 A; 1AEY A; 1UHC A; 1TG0 A; 3EGU A; 2YSQ A; 1YN8 A; 2HEQ A; 1M27 C; 2D8J A; 2NUZ A; 4Y92 A; 1FMK A; 2PNI A; 1MV3 A; 3QWY A; 5FWB A; 2AZS A; 3NPF A; 3M0P A; 1WDX A; 3UAT A; 2CH4 W; 2LX7 A; 4CC7 A; 1AWW A; 2O31 A; 2EYW A; 1SRL A; 3UA7 A; 1VYU A; 2K6D A; 4EIK A; 2K3B A; 4HVU A; 4F14 A; 1JEG A; 2YT6 A; 1V1C A; 4CC3 A; 2KYB A; 1SPK A; 2O9S A; 4ESR A; 2J06 A; 3GBQ A; 5GJV B; 3M0S A; 1QCF A; 1IO6 A; 2EGC A; 5IHN A; 1KJW A; 1FYN A; 1GRI A; 3RNJ A; 2JS0 A; 2RQR A; 4AG2 C; 1UEC A; 2EVR A; 2O9V A; 4JZ3 A; 3VS1 A; 3VS6 A; 5FW9 A; 3SEM A; 3TSW A; 2DLP A; 3EHQ A; 1ARK A; 1YWO A; 2KT1 A; 1M3B A; 1W70 A; 1W6X A; 1SEM A; 2ABL A; 2RQW A; 1WXT A; 2BZX A; 4DEY A; 2C0T A; 2CSI A; 2KT8 A; 2KXC A; 1E7O A; 1JU5 C; 4JPB W; 4RTX A; 1AWX A; 2RMO A; 4D8D A; 1AZE A; 2KRO A; 2J7I A; 2BZ8 A; 2F2W A; 4AG1 C; 4RUG A; 4HVW A; 1WXB A; 1PRM C; 1AWO A; 1ZUU A; 2DL8 A; 1X69 A; 2FPE A; 2M0Y A; 1UG1 A; 2V1R A; 3EG0 A; 1U06 A; 4OMQ A; 3NGP A; 1E6H A; 4Z89 A; 1AZG B; 3A98 A; 2FPF A; 1PKS A; 4HXJ A; 2DMO A; 2KYM A; 1SHG A; 5HCK A; 2L3P A; 4JJC A; 2E5K A; 1UFF A; 2GGR A; 2X3W D; 1K1Z A; 1ZLM A; 2BZY A; 1K0S A; 1LCK A; 3M0Q A; 2KXD A; 2F2V A; 1WLP B; 1ZSG A; 1S1N A; 1UJ0 A; 1JXM A; 2CT4 A; 2JM8 A; 1X2K A; 1NLO C; 2EBP A; 2FPD A; 2X3X D; 1XOV A; 1X43 A; 1GCQ A; 2SEM A; 2RN8 A; 1OV3 A; 2AKK A; 2JW4 A; 2RNA A; 3EG2 A; 1GFC A; 2D0N A; 2L0A A; 2EYY A; 2HCK A; 1ABQ A; 2MCN A; 2L3Q A; 1UTI A; 3VS5 A; 2KE9 A; 4IIO A; 2DM1 A; 2KEA A; 4OMO A; 5ECA A; 3LH5 A; 1QWF A; 2DBK A; 1TUC A; 2J05 A; 2DL5 A; 2K79 A; 1K9A A; 1M30 A; 2V1Q A; 1OOT A; 1WA7 A; 1YP5 A; 3TSZ A; 5IHI A; 4OMN A; 1U3O A; 4R0K A; 1QKW A; 2JTE A; 1NEG A; 3REB B; 4J9H A; 2RQV A; 2OI3 A; 4ORZ A; 2ED1 A; 2ED0 A; 2EQI A; 2FRW A; 5IXF A; 2O88 A; 1J3T A; 3VS7 A; 1CSK A; 3CQT A; 3I9Q A; 4M4Z A; 2KGT A; 3VRZ A; 1NG2 A; 1QWE A; 1RUW A; 2DBM A; 2J6O A; 1K76 A; 1X27 A; 2D8H A; 4RTU A; 2GBQ A; 1VYV A; 4LUD A; 4HVV A; 3RBB B; 3VS2 A; 2SRC A; 1H92 A; 3H0F A; 1GCQ C; 1NYG A; 1Z9Q A; 4RTT A; 2LCS A; 3NMZ C; 1HSQ A; 2CUB A; 5IHK A; 2B86 A; 2JS2 A; 4J9D A; 2F2X A; 3PVL A; 2VWF A; 2DX1 A; 2P4R A; 4ZNX A; 1M8M A; 2DRK A; 3O5Z A; 1UJY A; 3JV3 A; 1WIE A; 1W1F A; 2DIL A; 2YUN A; 2GQI A; 2MOX A; 1K0X A; 3VS4 A; 1X2Q A; 2DJQ A; 4J9C A; 2FRY A; 2HSP A; 2YUQ A; 4CC2 A; 1G2B A; 3IQL A; 1YCS B; 2ROL A; 3VS3 A; 1ZBJ A; 2DA9 A; 1AD5 A; 1ZX6 A; 3EG3 A; 3H41 A; 1YNZ A; 2KRS A; 4A63 B; 4RTZ A; 4J9I A; 3THK A; 1JO8 A; 1NLP C; 2YUO A; 3REA B; 2DRM A; 4AFU C; 2J6F A; 2VVK A; 2H8H A; 2OAW A; 1NM7 A; 2QDL A; 3I5R A; 1K4U S; 2LP5 A; 2K7A A; 2RF0 A; 1OEB A; 1PKT A; 1UUE A; 2A08 A; 2EGA A; 2KR3 A; 1NYF A; 2EYX A; 3VRY A; 2LQN A; 5IH2 A; 2FO0 A; 3NHN A; 2W0Z A; 2RPN A; 1WYX A; 1AOJ A; 1KFZ A; 1ZUY A; 4HCK A; 5GJW B; 1UHF A; 1WXU A; 2ROT A; 3I35 A; 2CDT A; 1X6G A; 1U5S A; 5EC7 A; 1JXO A; 2J6K A; 2I0N A; 4F16 A; 2EYZ A; 2RQU A; 1A0N B; 1WX6 A; 3M0U A; 4WCI A; 2D1X A; 1UE9 A; 4LE9 A; 2A28 A; 2FEI A; 1RI9 A; 4X1V A; 2A37 A; 3VS0 A; 1BU1 A; 1HD3 A; 3I5S A; 2LZ6 B; 1GBR A; 1GL5 A; 1PNJ A; 1T0J A; 2K2M A; 3SHW A; 4AFQ C; 4LUE A; 3UA6 A; 2RQT A; 1UGV A; 2CUD A; 4GLM A; 4GBQ A; 2L2P A; 1I0C A; 1E6G A; 4J9B A; 1BB9 A; 4JJD A; 1T0H A; 2K9G A; 2DYB A; 1GFD A; 4KRT A; 1H3H A; 1SRM A; 2JM9 A; 2PTK A; 3M0T A; 1PRL C; 3PE0 A; 3C0C A; 2LNH B; 1H8K A; 1JQQ A; 2JMC A; 4LN2 A; 2A36 A; 2GNC A; 1B07 A; 2JXB A; 2AKL A; 1I1J A; 1M3C A; 2AK5 A; 1PWT A; 1BK2 A; 4CC4 B; 2KBT A; 4D8K A; 4K11 A; 1N5Z A; 3EG1 A; 3KFV A; 1AWJ A; 2DL4 A; 2FG0 A; 2HDA A; 1T3S A; 2LJ3 A; 3ULR B; 1GBQ A; 1QKX A; 5IXB A; 2OJ2 A; 2KNB B; 2C0O A; 4RTV A; 2BTT A; 1G83 A; 2DE0 X; 1KSW A; 4OMP A; 2DNU A; 2DF6 A; 1QLY A; 1ZUK A; 1YWP A; 1T3L A; 4LNP A; 1PHT A; 1VYT A; 2EW3 A; 1SHF A; 4OML A; 3ZL7 C; 2LMJ A; 2CSQ A; 1Y0M A; 3PVQ A; 1CKB A; 1Y57 A; 3U23 A; 2IIM A; 1I07 A; 2JMA A; 2JT4 A; 2G6F X; 4J9F A; 3EHR A; 4AFS C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RHZ A; 2LQW A; 2O2O A; 2LCC A; 2DTO A; 1RLQ C; 3RKY A; 1QP3 A; 3WXM B; 2IPO B; 1VQN Q; 2MIO A; 3X25 B; 2ENM A; 1WI7 A; 4HT8 A; 2H3E B; 2NUP A; 3FJ5 A; 3H0I A; 3JCM f; 5GAO p; 4F04 B; 2PZ1 A; 2M51 A; 2ZPH B; 2RI5 A; 2YUP A; 4DEX A; 1QVF P; 4AFZ C; 3JB9 D; 1TUD A; 1B7T A; 2BE7 D; 1NE8 A; 4C92 G; 1N27 A; 1UGQ B; 3S6W A; 3VKI A; 4PJO A; 4PJO F; 2EGE A; 3P8D A; 3QZ9 B; 1RAB B; 1MV0 B; 3J7A F; 1KQS S; 5FLX E; 3CCV A; 2D6F A; 4DA4 A; 3CME A; 3CCQ A; 1ABO A; 5GAN g; 4JZ4 A; 3CPW S; 2EJ9 A; 4NS5 A; 1I4K 1; 1UHC A; 2ZCF B; 3MCA B; 3NTH A; 3JCM g; 3JRZ A; 1I8F A; 2NUZ A; 1IRE B; 1FMK A; 4EMK A; 4JS4 A; 2LT1 A; 2OTJ Q; 3X24 B; 2E1H A; 3V7S A; 1M1K R; 3UAT A; 1ZA1 B; 1UB4 A; 2MWP A; 4FIB A; 3OS0 A; 2EWN A; 3UA7 A; 3CCM T; 1Y07 A; 3G4S T; 1C0M A; 1GXI E; 5LJ3 h; 2DXB A; 2YT6 A; 4IUR A; 5FU7 B; 1YBY A; 3CC2 A; 1IHW A; 2O9S A; 4M77 C; 4ESR A; 3SWN B; 3OYB A; 4L5G A; 1IO6 A; 3L2W A; 1Q82 R; 3CPF A; 5KYW B; 3KXT A; 2O9V A; 2E70 A; 3MP6 A; 3VS1 A; 1Q7Y R; 5HY6 A; 3VS6 A; 3SEM A; 2DLP A; 4WF2 A; 3EHQ A; 1M4Z A; 2YRC A; 3PT9 A; 1VQN T; 2KT1 A; 1BI3 A; 1XQH A; 2RQW A; 1WXT A; 2R5A A; 1QP2 A; 2MAM A; 4C0F A; 2KXC A; 4N4H A; 1K9M U; 2QQS A; 1E7O A; 4JPB W; 4RTX A; 2RMO A; 4RCC A; 3J81 E; 1K73 U; 1AZE A; 2E4H A; 2J7I A; 2XK0 A; 1S72 T; 3WVE B; 1JRI A; 4AG1 C; 2C06 A; 2VUB A; 1WNL A; 1AWO A; 4HT9 A; 4QQD A; 1UG1 A; 3CXC A; 2K5I A; 3HTR A; 4C5E A; 1OYX A; 1KG1 A; 2ZGW A; 2RB6 A; 3JB9 G; 2CP6 A; 1PKS A; 2DMO A; 1G3T A; 3M54 A; 5HCK A; 2D9T A; 3EAE A; 4MZT A; 1ZLM A; 2QYZ A; 2LC4 A; 5I21 A; 3M0Q A; 2KXD A; 3P8H A; 1UJ0 A; 1JXM A; 2XI9 A; 4B9X A; 2CT4 A; 5HKC A; 3SFM A; 2XDD A; 1Q86 C; 2K57 A; 2X3X D; 3UPU A; 1X43 A; 1GCQ A; 2AKK A; 5GMK e; 2OTJ T; 2L0A A; 2EYY A; 3VS5 A; 2E64 A; 4OMO A; 1EIF A; 2DBK A; 2DJZ A; 2PUO B; 3MET A; 3JCM Q; 2YRD A; 2QEX Q; 1WA7 A; 2YHT A; 5LJ5 d; 1YP5 A; 1YFN A; 3V7R A; 3HRU A; 1U3O A; 1K8A U; 4XTZ A; 3BDL A; 3PMI A; 4RCB A; 3OA6 A; 5A0D A; 2O88 A; 2DYI A; 3VS7 A; 3CQT A; 2CP0 A; 3VRZ A; 1RUW A; 3CCR A; 2J6O A; 2HL5 C; 1N9R A; 4M78 D; 1G8X A; 2HQE A; 3G4S A; 2QG9 B; 5GAO m; 4ANJ A; 3RBB B; 1JJ2 S; 2SRC A; 3A8O B; 4EPC A; 2GF7 A; 3C4S A; 1X01 A; 1Z9Q A; 4PJN A; 4C8Q D; 2KI7 A; 2QTX A; 2MMP A; 1Y96 A; 5FU7 C; 3MEU A; 3P8B B; 2QQR A; 2DZC A; 5IHK A; 1D1B A; 2RI2 A; 3OMC A; 4ZNX A; 4QQG A; 4DOW A; 5GAM e; 1WIE A; 2DIL A; 4EMK C; 4XTW A; 4N0A A; 3E1S A; 3JB9 I; 4J9C A; 2RJF A; 1PD0 A; 5GAN 3; 3J80 E; 4CC2 A; 2YUQ A; 1VQ7 Q; 2JZ2 A; 4BAC A; 1D0Z A; 1AD5 A; 1ZX6 A; 2DER A; 3EG3 A; 3H41 A; 1HYO A; 1YNZ A; 2KRS A; 1LNX A; 4F7U G; 1VQM Q; 3F70 A; 4RTZ A; 1S72 A; 4J9I A; 1RAG B; 3FDR A; 3G71 A; 1JJ2 A; 1Y96 B; 4M78 A; 2H3J A; 4M78 F; 1K4U S; 2A0F B; 2K7A A; 4MDW A; 5GAN h; 1PKT A; 5A0G A; 3UWN A; 2EGA A; 3VYH B; 4XTU A; 5IH2 A; 4C8Q A; 4M77 E; 1KC8 U; 1TUG B; 4C8Q F; 2HAX A; 5GAN 4; 2RK1 A; 4DBQ A; 3GNF B; 3INZ A; 3KUF A; 3HFN A; 2RA2 A; 3RDV A; 4B6M A; 3NTK A; 3RUX A; 1JXO A; 1FWZ A; 2EYZ A; 1KD1 U; 5KYN A; 1A0N B; 2QEX T; 5GAN j; 3CD6 Q; 2DET A; 4X1V A; 1KQ2 A; 4M78 B; 1G3S A; 5HK0 A; 2MI6 A; 2JOY A; 1GBR A; 4IUQ A; 3BE3 A; 4BY6 B; 3E2U A; 2QAS A; 2RJD A; 2K2M A; 3CCV Q; 1EX4 A; 3CME Q; 3EH2 A; 3CCQ Q; 4C8Q B; 1UGV A; 2CUD A; 4GBQ A; 4DBH A; 1I0C A; 3CXC P; 1VQ5 A; 4J9B A; 1BB9 A; 4X34 A; 5KCH A; 2K9G A; 4M7D F; 4KRT A; 3JCM b; 1QW1 A; 2JM9 A; 2Y4Y A; 1PRL C; 2COY A; 2X4J A; 1QVG S; 2V26 A; 4XU1 A; 5LJ3 f; 2V8I A; 2LNH B; 3CCS A; 1H8K A; 4LN2 A; 2PUK B; 4BE0 A; 2LT4 A; 2LQK A; 4PLI A; 1BK2 A; 1PSF A; 1N8R U; 3ER0 A; 4J8O A; 4XAX B; 1D1A A; 4K11 A; 4J83 A; 3EG1 A; 3ZBD A; 3CC4 A; 2LJ3 A; 1M90 R; 3ULR B; 1R8O B; 3FIF A; 2F5T X; 3CC2 Q; 2PVG B; 1VQ7 T; 5GAN 2; 2KNB B; 2HQX A; 2NLU A; 2QGG A; 4IUU A; 3S3O A; 2E10 A; 4LDX A; 2EQJ A; 3CEY A; 4KGX B; 4KH1 B; 2CGH A; 1PHT A; 1TU0 B; 1VYT A; 2QK0 A; 1VQ6 T; 4JRK A; 3M59 A; 4BI4 A; 1Y0M A; 1QVG A; 3PVQ A; 1CKB A; 1Y57 A; 2CZ1 B; 1I07 A; 2DXC A; 2JMA A; 4HKE A; 2JT4 A; 4BI8 B; 2RHI A; 2AT1 B; 1AVZ C; 2LJ1 A; 3M58 A; 2GTO A; 4J9E A; 2BKD N; 4RTY A; 4J7F A; 3CMA A; 3MEW A; 4B9W A; 2LJ0 A; 2XDP A; 1Q81 U; 1UGS B; 1VQL A; 3G1J A; 2EKH A; 2COZ A; 1EFN A; 2DK3 A; 3O8V A; 2KRM A; 2DL3 A; 3EG9 A; 4NOY A; 4PJO E; 2LCL A; 5GAO r; 1B3Q A; 1VQP T; 3BFM A; 2CP3 A; 3CD6 T; 1OI1 A; 2XMF A; 4Z88 A; 1YJW A; 1UDL A; 2CRE A; 3QWX X; 3FEO A; 3M57 A; 1DJ7 B; 2GTJ A; 2FZC B; 4N0A C; 3CME T; 4N4I A; 3VV0 A; 2DXU A; 2CH4 A; 1VIE A; 2C0I A; 4C92 D; 4BDZ A; 4PL6 A; 4AMC A; 3M4G A; 1MUZ A; 2EAY A; 1O75 A; 4AT1 B; 5CR2 A; 1X6B A; 4F17 A; 3V8L A; 1IZ6 A; 2O01 E; 1NJI C; 2COW A; 1IHV A; 3MPU B; 1Z9Z A; 1VA7 A; 4FSS A; 1TXQ A; 5CVI A; 3V7C A; 1AEY A; 1MND A; 3CCU T; 4M78 C; 3EGU A; 1TG0 A; 4A4H A; 2YSQ A; 2WAC A; 2KMT A; 2GCX A; 4BY6 C; 3LX7 A; 1W2B A; 2EKO A; 1MV3 A; 1WDX A; 4C8Q C; 1OX9 A; 4BB7 A; 4C5H A; 1SKU B; 4IUV A; 2LX7 A; 2F1L A; 3OYJ A; 2O31 A; 2OX7 A; 3CBP A; 3CC2 T; 2ZPB B; 1ZBX A; 3VUZ A; 1VYU A; 4EIK A; 2K3B A; 3VYG A; 4HVU A; 3OYN A; 4E2F B; 4II1 A; 4F14 A; 1JEG A; 2EQU A; 2VB6 A; 1V1C A; 4CC3 A; 2ZPI B; 3CCR Q; 1N6A A; 1X6O A; 5GJV B; 5KYY A; 2E3H A; 3G4S Q; 1QCF A; 4E7I A; 4ZGD B; 1KJW A; 4O6J A; 5LJ3 d; 1GRI A; 4EDU A; 2RQR A; 4OMF B; 4AG2 C; 4JZ3 A; 4LDY A; 5GMK h; 1KHC A; 2Z0W A; 4HA8 A; 3MEA A; 4MZP A; 2YLB A; 1MMD A; 1W70 A; 1W6X A; 2LDM A; 1IXD A; 2ABL A; 2BZX A; 2BUD A; 5LL6 S; 5LJ5 e; 1VQ6 A; 5KH6 A; 5KYX A; 1AWX A; 1FXX A; 4D8D A; 3LGF A; 2CS7 A; 2L8D A; 1LVK A; 2AIR B; 3SDZ A; 3R6O A; 3MP1 A; 4KGV B; 3PTA A; 4RUG A; 1QCN A; 5GAN f; 4C92 B; 5KYY B; 1WXB A; 4MMK A; 3I55 A; 4CRI A; 3HRS A; 2DL8 A; 3C94 A; 2V1R A; 5GMK j; 1U06 A; 4OMQ A; 3NGP A; 1S72 Q; 3L1A A; 3G71 Q; 2XIC A; 4HXJ A; 2PVO B; 1BI2 A; 1UFF A; 3RES A; 4LDW A; 3RKX A; 3OYC A; 1LCK A; 1VQP A; 4R56 A; 4BE2 A; 3JB9 H; 4JDS A; 2DFU A; 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