1PYXA

Gsk-3 beta complexed with amp-pnp
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
352
structure length
343
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
publication title Structural characterization of the GSK-3beta active site using selective and non-selective ATP-mimetic inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 343
sequence length 352
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1pyxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1pyxA01
3I5ZA 3SOCA 3NNVA 2XNBA 4FTAA 2OZOA 4QQJA 1YKRA 2XNEA 4E1ZA 4FOBA 3FQHA 3CQEA 2BRMA 3U87A 3MVJA 4I92A 5IQFA 2CJMA 4XMOA 5HZNA 3R7YA 4CEGA 2JKMA 4GIHA 3PJ8A 4H58A 2VRXA 5AEPA 3JY9A 3FI3A 3GU5A 2G01A 4O7RA 3LQ3A 4FNWA 1PXPA 3WZEA 3KXGA 3D15A 3A4PA 3O8UA 5C03A 3OBGA 2V7OA 3FQEA 4ANLA 4M84A 2R9SA 1YHVA 1YVJA 4M13A 5E8WA 2PE0A 4IE9A 5E1SA 2E9VA 2X8IA 2Y6OA 3SV0A 4FG7A 3EQGA 1FBNA 5I9WA 1DI8A 4JAJA 3ATTA 3MW1A 5E9EA 4S30A 5FM3A 4F0FA 3R2YA 3R9RA 4CV8A 3VS0A 1JWHA 3R1NA 3W2CA 2XIKA 3DZOA 4KB8A 3R8LA 3TNIA 4DAWA 5CAOA 3FSKA 3LHJA 4PMTA 3EFWA 4DHFA 4MAOA 4RWJA 3P23A 4K18A 3IQ7A 4FTJA 2YISA 2VWBA 3ZUUA 2HWOA 1L8TA 5DEWA 1WMKA 2R3LA 3BGZA 3IKAA 4NTSA 3DT1A 3G9LX 3BQCA 3PPZA 3NIZA 5TT7A 4D1ZA 4IZYA 4MWIA 4E5BA 3TKUA 4O7VA 4IWDA 4CFWA 1UVRA 2O3PA 2WB8A 3KN5A 2E9OA 2IW8A 2YCQA 2XYNA 4FSQA 2XBAA 4NIFA 3F88A 4YJOA 5K4IA 2B0QA 4IC8A 1Q41A 2O65A 2XIZA 3BZ3A 3W32A 3DZQA 3V8WA 2WMRA 3ZONA 4CMOA 2I0HA 3TM0A 1P14A 3IK3A 3QRIA 4CFXA 1GAGA 3RAHA 3OVVA 5J5TA 4FEUA 3LJ2A 5JQ8A 2O63A 2VWWA 3AXWA 1J3HA 4ACCA 3R73A 4QMUA 3VN9A 5M06A 4P2KA 4A06A 4AWIA 3QCSA 4DFBA 1ZZ2A 2C3IB 4WOVA 4BCPA 4CFNA 3NUYA 3E64A 1HOWA 5M07A 3PY3A 3F69A 5H2UA 3H9RA 4OTGA 3WF6A 3VUGA 2BAQA 4OR5A 5AP3A 3R9HA 5BPYA 3A7HA 3LVPA 4IAAA 1Q3WA 1TQMA 2Q83A 3RPOA 4OBOA 4BZDA 2X7GA 4GH2A 2F7ZE 3VIDA 3BHHA 4JX3A 2C0TA 2YAKA 1JAMA 5L8LA 2R64A 2O8YA 1H1RA 2R3FA 2WTIA 4JG8A 5GJGA 2C0OA 4O7YA 2XA4A 5EM5A 1H0WA 3SAYA 4DC2A 2YM7A 4UMTA 4MYGA 5L2WA 3ZU7A 3V5JA 5G1XA 5DPVA 2BIKB 3FUPA 4FL2A 4IMYA 2ERKA 3FEGA 4CCBA 4GIIA 4UEUA 3NW5A 3ZUVA 4D4YA 4EH9A 4KBAA 5K3YA 3NZ0A 3IOKA 3R7VA 2PVHA 1KE5A 2YABA 4ACHA 2XKCA 3ULZA 2WTCA 4MH7A 4D4SA 3QWKA 2PMNX 4U5JA 5HIDA 4DT9A 3HAMA 4QD6A 1QL6A 4R78A 4L7FA 1GIIA 5I4NA 3NYVA 2YM8A 3ZS5A 2UVXA 4J53A 3F7ZA 4PMSA 3FY2A 1L3RE 5B0XA 5DYJA 5E4HA 3PLSA 4AT4A 4A9UA 4IXPA 5J9ZA 4OTFA 4YJNA 4ZZOA 1NVQA 1R0PA 3R8UA 3UP2A 2ZM3A 2I0EA 2J51A 4KIKA 5J9LA 4XUFA 4YHTA 5IA2A 2R3PA 4XRLA 3GB2A 2XP2A 3PE2A 2BTRA 4MEDA 1SZMA 4UXQA 5TR6A 3EWHA 4JDJA 3Q96A 3ZLYA 4JIAA 4QYFA 4BFMA 4I22A 3SRVB 2PPQA 3JXWA 4TYIA 5TO8A 3TCPA 4ZLOA 5J5SA 3QBNA 1UKIA 3DK6A 4WNMA 4FEWA 4BB4A 3F9NA 2HXQA 3VJOA 3DAEA 2IJMA 2VTMA 3F5XA 4ONAA 3LQ8A 3VVHA 1F5QA 1IA8A 4O1PA 4I20A 5JKGA 1OIQA 4WHZA 3HMPA 4RX9A 3EB0A 4DGOA 3RI1A 2PE2A 3ORMA 5J7HA 4N57A 3ORXA 4UB7A 3NAXA 1J1CA 4NT4A 5IUGA 5LQFA 1XBAA 5HG7A 5I3RA 4RBLA 2B9JA 2E9PA 2UW7A 3I6WA 4I5CA 2UZWE 2R3GA 3NGAA 4KSQA 5FQDC 5J9YA 2IPXA 1ZZLA 4M69A 4X21A 3VS4A 1FVTA 2XIRA 4C0TA 2C6LA 5M4CA 4ZMEA 3FZTA 2WGJA 4BTKA 1KUTA 4D2SA 5EQEA 3DBCA 5AV2A 3O96A 4DCAA 4I24A 4MD9E 3S00A 3R63A 5KKRC 5IQDA 4QP1A 4JIKA 2C6MA 2VN9A 5DR9A 3OCSA 5FTOA 2UW3A 3M1SA 4GUBA 3PPJA 5HIEA 4FIEA 3PSCA 4RRVA 1PYXA 3NUAA 2OKRA 2XM8A 3QTQA 4IJ9A 2VTAA 4NKAA 4UXLA 3II5A 2VWYA 1NVRA 3BYVA 1JKTA 4ZP5A 3IPHA 5EYDA 5JEBA 5EDPA 3V3VA 4UY9A 2HOGA 5CT7A 3UVPA 1OIUA 1Q61A 2JDSA 2WMSA 3PE1A 3TV7A 4IIRA 4HVIA 2JDOA 4J1RA 3CKXA 4IVAA 3F3ZA 4HCTA 5EW8A 5KMNA 4W8EA 1WFCA 3TKHA 1ZYSA 5F95A 5KNJA 3F2RA 2W4OA 3CD8A 1STCE 4NW5A 5D1JA 4FIHA 5KMMA 4GW8A 4BBFA 4O86A 2W1HA 4V0GB 4NEUA 4PNKA 4OTHA 5KMJA 5L6OA 3W2SA 5CTPA 2GNJA 4EUTA 3RMFA 5EHYA 5HBHA 2KULA 3QTSA 4F9WA 2CGVA 1U4DA 3DS6A 1H27A 4MK0A 3RINA 3PXZA 4XEYA 3KY2A 1KE6A 5FWKK 4BZNA 3LFCA 4EC8A 5L2IA 4UWYA 2GQSA 5DGZA 3QUPA 2WTDA 2YIYA 3EQIA 1R0EA 2B4SB 1W82A 1LEZA 2PVRA 3VRZA 2HCKA 4NSTA 1ZYJA 2YM3A 3UQCA 3MESA 2IVTA 2BVAA 3VS3A 5EH0A 4FT9A 1OKVA 1XWSA 3KXHA 3UMWA 5AP4A 4I4FA 3FYJX 4KRCA 4EUUA 4KBKA 4F1TA 4YTCA 3DJ5A 5AA8A 5HORA 1YXTA 4EH3A 1Y8GA 1DS5A 1YOJA 2XBJA 4QMPA 4QYEA 3SQQA 3VBXA 4JDKA 2WKMA 3OCGA 3L8PA 4E4LA 4EONA 2PTKA 1OBDA 4FL1A 4EK5A 1OIRA 3C0GA 1Y6BA 3RK7A 4BDEA 3L8XA 5FEEA 3R8VA 3AC5A 2J0IA 2Q0NA 3KN6A 4RX7A 5F4NA 5J95A 2QHMA 4YUQA 5CNOA 3ROYA 2BAJA 3CQWA 1AD5A 2R3JA 4QP2A 4YPDA 5LXMA 1WBOA 2XH5A 3HEGA 3WF5A 5HE2A 2VTQA 2GPHA 3OTVA 3E7VA 4L43A 4LL5A 2NRYA 1JOWB 3MIYA 3TNQB 4II5A 4M67A 3NUSA 2JBOA 3FI2A 4D1XA 3Q6UA 3EL8A 5FP6A 3U4UA 4O0UA 5E8YA 3UOHA 1GZ8A 1W8CA 2EXEA 4PRJA 4CYIA 1PXOA 3TNPC 5IMXA 2HW7A 3KCFA 3OMVA 4TWOA 3C5UA 3S0OA 1ZRZA 3IS5A 5D9HA 3BIZA 3PXYA 3CY2A 5ITAA 4OTRA 2ITNA 4FSUA 3RZFA 3NVMB 4IB1A 5ANJA 3O8TA 4LMNA 4AAAA 1RW8A 3BHYA 4G3CA 2IVSA 4GG5A 4HNIA 4YURA 3T3VA 4DFYA 1Q8ZA 4OTPA 4F9AA 3D0EA 2OJGA 2Y7JA 3DDQA 3UPXA 3GUBA 4IX6A 1VJYA 3MIAA 3QZFA 1OPJA 3CY3A 3PJ2A 2R0UA 4IAFA 5GJFA 4B8MA 4NIFB 1H1SA 3U8WA 5HE1A 5LVLA 2WELA 3O8PA 5IQAA 2YAAA 5CU6A 5FP5A 4W8DA 1M7NA 4D4VA 4QTEA 4Z16A 3WYYA 2YCRA 2UW6A 5DI1A 4LQMA 2YJSA 2RF9A 2HELA 1VYZA 3TZ8A 5HGIA 4F7JA 1SNXA 3POZA 4YZMA 5HOAA 5HBJA 2YDKA 4OBPA 4F9CA 3ZZEA 5F1ZA 3KKVA 5CXZA 1XHAA 3BBWA 2I1MA 4RVLA 3UNKA 3LLTA 1R39A 2J0LA 4I3ZA 5DLSA 3ZO3A 5CVHA 1B38A 3L9NA 4LGGA 3AQVA 4G9RA 3SXSA 3CJFA 1SM2A 3G0EA 4BYJA 3MTLA 3ZRMA 3UO5A 1K3AA 3GU8A 3LE6A 2GNIA 4Z3VA 1LP4A 1B6CB 4ZTRA 4O0SA 4YC8A 3QD0A 3S4QA 3B2TA 3BYUA 4H36A 4YTIA 3UBDA 2BDJA 5CEPA 3FZ1A 3TN8A 3LAUA 2XMYA 3ELJA 2B1PA 2Y4PA 2BMCA 5T3QA 3KRWA 3EN4A 4PPAA 3LFSA 4FUYA 3MFUA 3BKBA 3I6UA 3I81A 2WO6A 2YFXA 5DFPA 4JBOA 2VO6A 4ZSJA 3IDPA 5ACBC 1CDKA 2C6IA 4AW5A 4CRSA 4ZMFA 1WVYA 4NM3A 5C8KA 1TVOA 5HX6A 4UV0A 4S34A 1KE7A 4J7BA 4L00A 4L44A 4B99A 4CZUA 4D2VA 4EOSA 4O81A 3NYOA 3TTJA 3PSBA 3DB6A 5AUVA 4IX5A 5JT2A 5HQ0A 4DFUA 4AZWA 1IEPA 3BYSA 3HMNA 4AGDA 4XG9A 2FH9A 2J9MA 4Z7HA 1Q62A 3DBDA 5CSHA 1M7QA 3F6XA 3LFQA 4HGSA 4FV1A 3QRKA 2JD5A 1I44A 2XK6A 4PUZA 4EK8A 1UKHA 4GYGA 3TIYA 2GTMA 2C3KA 5J79A 4TYGA 3GI3A 5JFSA 3E8DA 4FTOA 3QYWA 1R1WA 3IOPA 4YZ9A 4O7NA 1J1BA 3MPTA 3GNIB 5A4EA 5D11A 3UZRA 4PV0A 4U41A 4XCUA 3PPKA 4L68A 3UP7A 1HCKA 5C1QB 3BLHA 2UZLA 2HK5A 1PXIA 4GS6A 4EQUA 4DH7A 2PZ5A 2WTKB 5DH3A 2OO8X 4YNEA 4Y72A 4EH4A 1GZKA 2VV9A 1H26A 3FKNA 2KTYA 4MQ1A 5E7RA 3VAPA 4C4JA 4ZY6A 2VWVA 2F2CB 3ATSA 2DQ7X 2R3HA 4LI5A 1PF8A 2C1AA 3OD6X 4FSZA 5A46A 1PJKA 3PDTA 5CU2A 2CKPA 4GJ3A 2G2IA 1UWJA 3MTFA 3ZEWA 4AZSA 5BVFA 4BWPA 1JQHA 3Q52A 3RHKA 5J1WA 4DEEA 2VX0A 3UIBA 4XG8A 1Y91A 5BMSA 3LFFA 3RHXA 4EOOA 4E6CA 4NTTA 4ZSAA 5HESA 1RE8A 3NSZA 1JLUE 2R3OA 5TF9A 1KWPA 4RA4A 3UJGA 4KINA 4X2JA 4B8LA 5JGDA 4IANA 2XB7A 3R30A 4L6QA 4AFJA 5JRQA 2I7QA 3Q4ZA 1CTPE 1YHSA 3CE3A 1YXVA 2AUHA 3A2CA 5HLWA 4DF3A 1I09A 3KK9A 2C5XA 1YXSA 3Q9ZA 4X3FB 4R1VA 4WG4A 3WIGA 3FLYA 5FM2A 4GSBA 4A9TA 3P7AA 2QHNA 1U54A 2E9UA 2XJ2A 1VR2A 2ZB1A 3BYMA 2YACA 3K5UA 2PVKA 3RWQA 3ZSGA 4F65A 4BCIA 4C4IA 4FEVA 4S33A 4AZFA 2W4JA 5D12A 1Q99A 5A3XA 4HZRA 2CNVA 4PDSA 3TJCA 4EBWA 2ETRA 2OBJA 4BTFA 4EJ7A 4WSQA 4YO6A 4HPTE 3CKWA 2WTJA 2PL0A 2CCHA 4I41A 5CANA 2OIQA 2ITPA 3EOCA 3NWWA 3PJ1A 3Q4UA 4FF8A 4I0TA 5J7BA 2Y8OA 2IVVA 5M44A 4L42A 5LMKC 2OFVA 4L01A 2BFYA 2FB8A 2Y0AA 3NRMA 4IZAA 3NYNA 5HO6A 4J52A 4NKSA 3PZEA 2Z7SA 4FK6A 3BEGA 4I0RA 1IRKA 4C02A 1MQ4A 4BGGA 3KRLA 4GUEA 2OJIA 3G15A 3SX9A 3G51A 5E8XA 5CX9A 2VWXA 1NT2A 2HYYA 4UBAA 4O84A 3NR9A 3V5PA 4C2VA 4FYOA 4ORKA 1X8BA 2B55A 5EW9A 2UZUE 3LFAA 3MS9A 4R3PA 4J97A 4JQEA 2IG7A 2QOHA 3HV3A 3V01A 4IVDA 2J6MA 2QOIA 2HY81 1BUHA 3TTIA 3R1QA 4C7TA 2PVYA 4I6FA 4V01A 4CNHA 4RFMA 2G9XA 4MNEA 4WNKA 3W2RA 4AQCA 3BRBA 2BROA 3NDMA 4TYJA 5IA1A 4RX5A 1RQQA 5BQ0A 3H9FA 5IU2A 3FL5A 3C51A 3LCDA 1KE9A 3ZRKA 4DG2E 5EM6A 4D9TA 3BWFA 1H1QA 3VBQA 3T9IA 3DBEA 3Q9WA 5I9UA 3MBLA 5CSPA 2ZDUA 3FBVA 4IVBA 4ZZMA 2VTOA 4GG7A 1G5SA 3MSSA 4BR3A 1YRPA 3GCSA 5HG5A 4M14A 2WTWA 4HYUA 5KZ0A 2XK8A 5AUYA 3SDJA 3QKLA 3C50A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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