1Q18A

Crystal structure of e.coli glucokinase (glk)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
TKYALVGDVGGTNARLALCDIASGEISQAKTYSGLDYPSLEAVIRVYLEEHKVEVKDGCIAIACPITGDWVAMTNHTWAFSIAEMKKNLGFSHLEIINDFTAVSMAIPMLKKEHLIQFGGAEPVEGKPIAVYGAGTGLGVAHLVHVDKRWVSLPGEGGHVDFAPNSEEEAIILEILRAEIGHVSAERVLSGPGLVNLYRAIVKADNRLPENLKPKDITERALADSCTDCRRALSLFCVIMGRFGGNLALNLGTFGGVFIAGGIVPRFLEFFKASGFRAAFEDKGRFKEYVHDIPVYLIVHDNPGLLGSGAHLRQTLGHIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal structures of Escherichia coli ATP-dependent glucokinase and its complex with glucose.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 92
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1q18A01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1q18A02
1ATRA 3D2FB 3D2FA 1QZ5A 3GG4A 3CJ9A 3O5BA 2V7YA 1IG8A 4CD3A 3HM8A 2E2NA 5AQVA 5EX5A 1NWKA 5AQKA 2GTDA 1ZXOA 2FLOA 3ZX0A 3O6WA 1YXQA 3AAPA 4FWPA 2WUSA 5JICA 2E2PA 2QW9A 1V4TA 5AR0A 2HF3A 1GLBG 2DPNA 3MN5A 2D4WA 4GY2B 4JD2A 4JD2B 3CIPA 3W3DA 3UKRB 3UKRA 1IJJA 4CZEA 1MWKA 1C0GA 3VEYA 4BRAA 2YCHA 4K41A 5E84A 5EY4A 4NO7A 4DCHA 3CQYA 5KPZA 4ISGA 3M1FA 2YI1A 5AQHA 3VGKA 3M6GA 3MDQA 3WXKA 4B9QA 1MDUB 1NBWA 1XQSC 4BG9A 2CH6A 3L6QA 3DJCA 2E2QA 3IDHA 2HF4A 2CH5A 2QWOA 4A61A 1JCEA 4WQ4C 4FOIA 3KHYA 4BQZA 4CZLA 3SMSA 1BOTO 5BRDA 4K25A 4NB4A 4LC9B 2CGLA 4BRIA 1HX1A 4MO4A 5AQUA 1ZBSA 4H5RA 4CZIA 3CJCA 3ULEB 2E20A 3ULEA 3ATUA 1C0FA 1GLCG 3ZETB 3ZETA 5FPDA 4O5FA 1S3XA 4CZHA 2P9IA 3TU5A 4BRFA 5LY3A 4B1WB 4CZJA 4BC3A 2V7ZA 3W0LA 3KVGA 1NGAA 1T6CA 3HBTA 3LDLA 2FF6A 1OKJA 3L0QA 4H5WA 1TUYA 4QS7A 5KPRA 1S22A 2YJEA 2P9UB 4HTLA 2P9UA 5EVZA 1X3NA 3CHWA 2QWMA 1NGCA 5KQDA 3TPQA 4BRQA 2IVNA 4CBUA 4DQ8A 3GBTA 2QWNA 2VCPA 3VF2A 3ZEUB 3EO3A 3ZEUA 3LL3A 2Q2RA 2FXUA 4BRHA 4RTFD 3EN9A 1SZ2A 2UYTA 4BR4A 3ATVA 2OANA 3QFPA 2P9NB 2I7NA 2P9NA 4BGAA 1GLDG 3VGLA 2HMPA 5LJVA 4BGBA 1NGFA 4FSVA 4IXCA 3D7EO 2QWQA 1E4GT 1D4XA 1GLAG 4CI6A 4BR0A 1K8KB 4WQ5A 1K8KA 3FZFA 1HPMA 3HI0A 3VENA 1NLVA 2W40A 4H5NA 3LM2A 5AZIB 4A2BA 1E4FT 5AZIA 3VF4A 2FSNA 5F1XA 5AQWA 5BPNA 2P9LB 1U6ZA 2P9LA 3EL2A 2ASOA 4CZKA 5BN9A 3EKSA 4IZ9A 2QWPA 2E88A 2PBDA 4L3QA 1U2VB 1GLLO 4PKIA 4RCHA 3J8AA 2GUPA 1XC3A 1DGKN 2FF3B 3AAQA 1QHAA 5B8HA 1NGGA 2QM1A 4CJ7A 2H3GX 4FO0A 1WUAA 3BUZB 2E8AA 1J6ZA 3AARA 5TKYA 5F0XA 2BUPA 1HKBA 3FZKA 4IWVA 3RSEA 3RSEB 3VF6A 3ENHA 3FZMA 1JCFA 4EFHA 2ZGZA 2J4RA 1X3MA 1QZ6A 1V4SA 1TYQB 4WYBA 4H5VA 1TYQA 5AQGA 1TUUA 4BR7A 3DXKB 2D0OA 3DXKA 3FZHA 5ADXA 4H0VB 4BRMA 4IJAA 3WT0A 4JAXA 1QQMA 3BF3A 4YDUA 4IO8A 4EAHD 1GLFO 4BR2A 3FFKB 2YJFA 2D0PA 5AQSA 3CJ7A 1BDGA 3LDOA 2P9SB 3VESA 4PL7A 2P9SA 2W41A 3P4IA 2NRHA 4BR9A 5E26A 2V52B 3WUHA 4MLHA 2ITMA 1P8ZA 4M7XA 3UKUB 3R9PA 3UKUA 5AFUA 1NM1A 3DAWA 5AQQA 1YAGA 4FWSA 4Z94A 1BG3A 1EQYA 3R8EA 3BEXA 4K42A 3FLCO 4O8KA 3CETA 1DKGD 3VEVA 2V51B 4AM6A 3SJHA 3ZX3A 3QBXA 4KBOA 5BRFA 4FL9A 4PKGA 4CZFA 5BPMA 1KXPA 2D1KA 4B1ZA 4H0PA 5F2RA 3WQUA 2E1ZA 2P9IB 1KAZA 3R6MA 2Q0UA 1YUWA 2FSJA 5JMVA 3QICA 3M3ZA 4BVOA 2A40A 2A42A 4GNIA 4BRKA 4CZGA 2PAVA 3OHRA 4H0OA 2P9KB 3D2EB 2P9KA 3D2EA 5AQIA 3H6EA 5AQRA 1YVNA 2NLXA 4EHUA 3O1BA 4FWMA 2ASMA 3SLCA 3CJBA 2GELA 5AQNA 2E2OA 3MN7A 5KPTA 5EXWA 4PKHA 1BUPA 3IMXA 1BA1A 2CGJA 3GDQA 1Y64A 1QQNA 4BRCA 5LJWA 2A3ZA 3GOIA 1ESVA 1HJOA 2Q1NA 5BN8A 4A2AA 4BRGA 5JLHA 2Q36A 2ZGYA 4C23A 4BR5A 4MO5A 4FWKA 4JNEA 3VERA 1RDWX 1DEJA 3DXMA 3A5MC 3ZX2A 4M63C 4FWRA 3A0IX 5CE3A 3H45C 4XH1A 1XUPO 3WXLA 2HOEA 3LDPA 1BU6O 1NMDA 5AZJB 4MLEA 5AZJA 4JHDB 4JHDA 2FSKA 3ENOA 3CJ1A 4IJNA 1H1VA 3UE5A 4I6MB 4I6MA 1RFQA 3H3NO 4CBWA 3G25A 3QBWA 3C7NB 3C7NA 3UB5A 4H5TA 1MWMA 1X9JA 1GLJO 1KAYA 2NZTA 3HZ6A 4M7YA 4WQ5C 5I9EB 1Z6RA 1RGIA 4FOEA 4J8FA 4ISEA 4K43A 1WOQA 3EKUA 1JCGA 2KHOA 3FGUA 2I7PA 4A62A 1G99A 1SAZA 2GWJA 1NGJA 3B8AX 3VGMA 4QS9A 4DHYA 4EIAA 3AY9A 5KQ8A 3KZBA 1T6DA 2AP1A 2E1YA 1ATNA 5AQFA 5AQPA 5AQTA 3H3OB 4JN4A 5AQYA 4FWLA 5AQOA 1NGEA 4FWOA 4BRNA 3MN9A 4BRLA 4H0TB 2GWKA 1LCUA 5JLFA 1CZAN 4BC2A 3CI5A 4BC4A 4Y0WA 1NGIA 3WXIA 3L4IA 4B1VA 3I33A 3VEXA 3WQTA 3U9DA 2YHYA 4XH5A 4WQ4A 3GE1A 4B1UB 5AQLA 4BRDA 3VEWA 4BVPA 1BA0A 3SK3A 3VEZA 2IVOA 4YDUC 3A5LC 5AQZA 4RWTA 3DWLA 2QWLA 1QQOA 3H1QA 4HWIA 5AQMA 5BREA 2Q0RA 3GL1A 2VWBA 3C0BA 2A6AA 3LDNA 2IIRA 4FPBA 3MN6A 4E1JA 3QB0A 3VETA 4BROA 3FZLA 2GEMA 1R59O 3QDKA 4CZMA 3FR0A 1NGBA 1ZC6A 2F9WA 3H46O 5FPMA 2ZWHA 4FWQA 3HSCA 4H03B 3MK6A 4H0YB 3MCPA 1Z05A 1ATSA 3MMVA 4FWNA 3WEEB 3F9MA 2IVPA 3WEEA 4B1YB 2P9PB 2P9PA 3CERA 1T44A 4QS8A 5EOYA 5BRHA 1BWFO 4CBXA 4BRPA 4B1XB 3I8BA 4ISFA 3CJAA 1HKGA 3JXUA 3VOVA 3U8XA 5AQJA 4H0XB 3O80A 3IFRA 4FPAA 5ADXH 3WXJA 4PL8A 2QXLA 4XH4A 1Q18A 3VPZA 3SMPA 3HTVA 2ASPA 3DXMB 3LDQA 2Q97A 3VEOA 2YHWA 3A5OC 4BG8A 3QFUA 4BREA 3EZWA 3O8MA 5FPNA 2CGKA 1KAXA 2YHXA 3A5NC 3CQXA 1MA9B 2Q31A 4XEIA 1SQKA 5BR9A 4DB3A 5BPLA 1LOTB 1NGDA 3BF1A 4EHTA 1BO5O 2BTFA 3LM9A 3O08A 3QMLA 5ELZA 2ZF5O 2F9TA 5AQXA 5AFUH 1HLUA 1HKCA 3O4WA 3FE1A 3ID8A 2EWSA 2QWRA 3IUCA 1HUXA 1NGHA 4BC5A 3S41A 4F9OA 4CD1A 3U9ZA 2VYPA 3O1WA 3H1VX 1GLEG 5FPEA 3U4LA 2AA4A 3A8YA 2A41A 2A5XA 4BQLA 4AM7A 1U2VA 3JS6A 3BP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 4JK9A 3D2FA 3LP1A 1EXQA 3CJ9A 3O5BA 2V7YA 4O0IA 2E2NA 5AQKA 2GTDA 3DOKA 4DSJA 1Q86O 3EYZA 5GIPA 1V4TA 3MXMA 3MN5A 4GY2B 1LWEA 3L4QA 4ZTFA 3A2FA 4A5BA 1C0GA 2O8DB 4FJMA 3O3HA 4DR5K 3ZT4A 3K2PA 5E84A 1JLGA 4TSXA 3CQYA 4ISGA 3QEXA 3C94A 5AQHA 3SV3A 4IDKA 1L5UA 3P5JA 1MDUB 1NBWA 4CESA 4BG9A 4LF9K 3S3NA 1N5YA 2E2QA 3IDHA 2QWOA 3L2QA 4DFJA 4A61A 1JCEA 4JLHA 4WQ4C 1JXEA 4CW7B 1IBKK 3AVNA 1ASUA 1L3VA 1JLCA 1JJ2M 4H8KA 3S9HA 4K25A 3CCRN 3V9SA 4N41A 4IFYA 4RW4A 1HX1A 2D0CA 2KTQA 2D5RA 4CZIA 3T3FA 3OYMA 4F3TA 3CJCA 2B4JA 4N5SA 1EETA 2KZMA 4CIEA 2P9IA 3TU5A 5LY3A 3CCSN 1VQ8N 4DLGA 3JYTA 1N36K 4KHYA 1WB9A 3HBTA 4Z4EA 4FJHA 3K59A 3L0QA 3L2UA 3HVTA 1TUYA 4B9NA 4HTLA 1X3NA 1QS4A 4E7IA 3CFOA 4AHSA 2IVNA 1A5VA 1BHLA 1RT1A 4CVNE 2VCPA 3VF2A 3ZEUA 1OVYA 3MX2A 4DR3K 1BCOA 2EX3A 3R1XA 2UYTA 2OANA 2P9NA 4YHHK 3VGLA 2HMPA 3NGZA 3OYBA 3AO3A 4IXCA 2XHBA 1TK8A 3D7EO 3AVLA 2ZJPL 4IG3A 4LSLA 2IDOA 3G6EN 4WFAL 5A2QO 1B9DA 4WFBL 3KLFA 3WXMB 2NRWA 3RMDA 1NNEA 3V1RA 2RHKA 2W40A 3EEQA 2WC9A 4AHUA 1X9MA 4Y1CA 5J1EA 5F1XA 5AQWA 5BPNA 1U6ZA 4DTUA 3Q7CA 1J9AA 1U2VB 1SUQA 1C1CA 3ZSZA 3K9JA 1RTIA 1RTHA 4H4MA 4BDZA 1XC3A 1S6QA 4AH9A 4DQRA 2F7TA 3RSEB 4DS4A 3FZMA 3VQQA 4EFHA 3QNNA 2J4RA 4CGJA 1TYQB 4H5VA 1TUUA 3OTOK 4JKGB 2D0OA 5HRSA 4H0VB 4CHZA 4B3TK 2G8UA 4JYAK 2BDPA 3AA4A 4CGGA 4YDUA 1ZBIA 4IO8A 3KKSA 2O8BA 3PX0A 4BR2A 3FFKB 4I7FA 4ELVA 5AQSA 1HNWK 1BDGA 1SL2A 1E3MA 3BY5A 2NRHA 3UKUA 5AFUA 1C1AA 4CECA 3AVJA 4Z94A 4FJ5A 1BG3A 4OPAA 3R8EA 2D0AA 2UUBK 1KRPA 3FLCO 3MECA 2R7YA 3CETA 2VQEK 3VEVA 4AM6A 2XY5A 1LWCA 3HO1A 1VQON 4O5BA 4PKGA 2UU9K 5SZTA 3I0SA 4MFBA 5F2RA 2VGMA 2E1ZA 3FFIA 4DMNA 1NJIO 2FSJA 3AVBA 3CF5L 3QICA 2HBKA 2P5OA 4DF4A 4BRKA 4CEBA 3D2EB 2VG5A 4JKCA 3DLHA 3AA3A 5AQRA 1YVNA 5BR8K 1HRHA 4X62K 4FWMA 3KTQA 3SLCA 3LWMA 1RBTA 2GELA 2E2OA 3MN7A 2HW3A 4M3ZA 3I0RA 2HHWA 3E1YA 3AGRA 3GDQA 3TSUA 5FROA 4CEFA 3TAGA 2A1RA 3ZLJA 1LW0A 1HJOA 1BIZA 2Q1NA 1JXBA 5BN8A 5JLHA 1IBMK 3VQ8A 2O8EB 2WBNA 2ZQBA 3OW2M 3DXMA 3A5MC 5C0YA 4FWRA 4LH5A 1I39A 1XUPO 3WXLA 4JI3K 2HOEA 3AA5X 1VSLA 4FJIA 5AZJB 3K5LA 4MLEA 1WSHA 1VSMA 1RDCA 2X74A 3H3NO 3LALA 3QBWA 1W0HA 3C7NA 3UB5A 4H5TA 4R79A 5HLFA 3PX6A 2NRZA 1KAYA 5LMUK 3ZSVA 5GADP 3CCEN 4CERA 5I9EB 4CEQA 1Z6RA 3LZJA 3S3OA 1JCGA 1EWRA 3DYAA 1NOZA 3FGUA 2OTLN 1J5EK 1G99A 2GWJA 2VQFK 1NGJA 3VGMA 1XC9A 3P39A 3M8RA 4B3OA 1RBVA 1T6DA 3P83D 5AQFA 5LL6Z 4C8NA 2G8VA 1K8AO 1HNIA 4JN4A 3E9LA 3KKRA 4JRPA 4HUFA 1VSDA 3CPEA 5AQOA 4BRLA 5JLFA 3SQ1A 3CM6A 4BC2A 3OYEA 1X9WA 1ZBUA 1RTDA 3TTDA 1LAVA 3HXMA 2YNGA 3ZSRA 4C8LA 4B1UB 4CFCA 2ATQA 4BRDA 3VEWA 2O8DA 1BA0A 3SUOA 3MXJA 3SK3A 3VEZA 3CM5A 4CK1A 3A5LC 4RWTA 1BI4B 5GAEP 4HWIA 3L8BA 1C6VA 4FCYA 5I42A 1XI1A 4KAZA 3OBWA 2W6LA 3QLHA 3MN6A 4BROA 1HPZA 1R59O 1HR0K 3QDKA 3FR0A 1ZC6A 2F9WA 1YVUA 5FPMA 4JI8K 4FWQA 3HSCA 1VHXA 1Z05A 3F9MA 3WEEA 2P9PB 1TKTA 3QIPA 4O55A 2XY7A 1HYSA 4EP4A 4FJJA 4NXMK 4ISFA 4R5PA 3LAMA 2IAJA 1HKGA 3O4QA 3ZSWA 1VSIA 3CCUN 4B9VA 1JLBA 4FPAA 5ADXH 3OJUA 3WXJA 2E6MA 4XH4A 1Q18A 3VPZA 1T3VA 2ASPA 1CZBA 3LDQA 4HCBA 2Q97A 1NK5A 2YHWA 1XNQK 5T7BA 2G8WA 3EZWA 4GV6A 1YITN 1NKCA 3A5NC 3KK3A 2RKIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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