The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I55 Q; 3OW2 P; 1VQ9 Q; 1VQ8 Q; 3G4S Q; 1YIJ Q; 1KQS P; 3CD6 Q; 3CC4 Q; 1VQN Q; 2OTJ Q; 3CC2 Q; 3G6E Q; 1KD1 R; 3CCM Q; 3CXC P; 3CCJ Q; 1YHQ Q; 1Q7Y R; 1M1K R; 3CCS Q; 1S72 Q; 1VQ4 Q; 3CCL Q; 1N8R R; 3CME Q; 1M90 R; 3CCV Q; 1YI2 Q; 3I56 Q; 1YJ9 Q; 1K8A R; 1VQ6 Q; 1VQ5 Q; 1VQ7 Q; 1VQP Q; 3CCQ Q; 1Q82 R; 1K73 R; 1W2B P; 1JJ2 P; 3CC7 Q; 1YJN Q; 1QVF P; 3CMA Q; 2QA4 Q; 1QVG P; 2OTL Q; 1VQM Q; 1VQK Q; 1YJW Q; 1VQO Q; 1Q81 R; 1KC8 R; 1NJI R; 1K9M R; 3CCE Q; 2QEX Q; 1Q86 R; 3G71 Q; 3CCR Q; 3CCU Q; 1YIT Q; 1VQL Q; 3CPW P; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OW2 P; 2YUN A; 2XI9 A; 2E3I A; 2L3P A; 2C0O A; 1RUW A; 2QQR A; 3V7R A; 3CCL Q; 5IH2 A; 5KYU A; 4IUT A; 4R55 A; 2L8D A; 3A8M B; 3RMQ A; 3SEM A; 4LUE A; 2VUB A; 3RBB B; 2X3W D; 1TH7 A; 1ZA1 B; 1LVK A; 3CMA A; 4PJM A; 3M59 A; 3E9F A; 5KYX A; 2P4T A; 4C92 F; 5HCK A; 3OS5 A; 4M7A C; 1AWX A; 4C5I A; 2EJG A; 3MP8 A; 1WLP B; 2JM9 A; 2RD1 A; 1WXT A; 4PJO C; 3A1P A; 3M58 A; 4HVV A; 3QII A; 3MJX A; 4E7Z A; 5KYU B; 1B34 A; 2VV5 A; 2V8I A; 4F17 A; 3PFS A; 4Z89 A; 1VYU A; 2FPE A; 4PJL A; 5LJ5 e; 3G4S A; 1YNZ A; 3OS0 A; 4A54 A; 4CC2 A; 3CCJ A; 3JB9 F; 2RHY A; 2DIQ A; 1RAB B; 2VGM A; 1KHC A; 5GJW B; 4ANJ A; 3BE3 A; 2XIC A; 1VQO Q; 1Q81 R; 4KUL A; 5IHK A; 2FPF A; 1VQN Q; 1PSE A; 2MAM A; 3ME9 A; 3H0H A; 3M4Y A; 4Y28 E; 1VQ8 T; 3I55 T; 2R5A A; 2J6F A; 1JBM A; 1B34 B; 1JQQ A; 2HQH A; 2GTO A; 4HCC A; 4BDY A; 3CCQ T; 4E6R A; 2DET A; 2KDS A; 3FEO A; 3TCJ A; 3CPW P; 4A4G A; 2O4X A; 4C92 B; 3E2U A; 3M0P A; 3TQ7 P; 1BCM A; 1X01 A; 3INZ A; 3CCR T; 2O31 A; 4J7I A; 3M0R A; 5KH6 A; 3PIO A; 4LXC A; 3CCM T; 1WQ7 A; 4EIK A; 2M9U A; 1QP2 A; 1VYT A; 5I22 A; 3JCM Q; 4M7A F; 1Y7X A; 2AKL A; 4FYX B; 2DXU A; 2DA9 A; 3OB9 A; 2KE9 A; 1CSK A; 1H3H A; 3GF5 A; 2EQJ A; 1VQK T; 3BDL A; 5HK3 A; 3VV0 A; 3SHW A; 2CZ6 B; 5GAO r; 2KMT A; 2A36 A; 2MMP A; 1S72 Q; 1OOT A; 4UC4 A; 2NYS A; 2YLB A; 2L89 A; 5I21 A; 4IUR A; 1K73 C; 2V1R A; 2NUP B; 1OV3 A; 3LGF A; 3HRT A; 4N4G A; 1E7O A; 1Y71 A; 1UGS B; 1YJN A; 2HAX A; 1BI0 A; 4DBH A; 4PFP A; 1HSQ A; 2JOY A; 1YIJ Q; 4C5E A; 2EYQ A; 3VUB A; 4M7A A; 2JJ9 A; 4M75 F; 1QWE A; 5D6X A; 5GAO q; 3G7Z A; 1K8A R; 2D9T A; 4PJO A; 1VQ4 T; 4WTO B; 4N4H A; 2DK3 A; 3L2Q A; 1TOV A; 3VS6 A; 1W70 A; 3JCM b; 2DL3 A; 3MP1 A; 3MEW A; 2BZX A; 2EKH A; 1KSW A; 1U1T A; 1V1C A; 4MZP A; 2WAC A; 3LX7 A; 1ARK A; 3FC3 A; 1IGQ A; 4RTT A; 1JJ2 P; 1GFC A; 3V8J A; 3JRZ A; 1OZ2 A; 1VQ7 A; 4OB3 B; 2LJ1 A; 2J6O A; 4M75 A; 4ZGJ B; 2OTL Q; 4M7A B; 1GCQ C; 2DIL A; 3JCM W; 4C92 E; 1G8X A; 1M8M A; 4NS5 A; 2BE9 B; 4L5G A; 1BCO A; 4KUD K; 3CPW A; 1RL2 A; 3NMZ C; 1C6V X; 3H41 A; 1VQ8 A; 1PKT A; 3OYA A; 1NLO C; 1JU5 C; 3QWY A; 3CCV Q; 2EGA A; 1MMA A; 4OGE A; 5EG2 A; 4KGV B; 2P0P A; 1QLY A; 2RJD A; 4DEY A; 4DEX A; 4AT1 B; 2YRD A; 2FB7 A; 3SFM A; 2A37 A; 1SF9 A; 3TVT A; 4ZN3 A; 4PFZ A; 2M0O A; 1N6A A; 3EFR A; 3CCR A; 4ELZ C; 1TUC A; 4M75 B; 2VGN A; 3MHX A; 4ZTJ A; 2DD5 A; 2O01 E; 3OYI A; 3CCM A; 1U8R A; 3J7A F; 1YHQ T; 2RK1 A; 2CH4 W; 2LP5 A; 1ZSG A; 2D0Q B; 1WJQ A; 3FJP A; 3GOX A; 2FRW A; 4LNP A; 2B86 A; 1YIT Q; 3PT9 A; 4J9D A; 3M0Q A; 1IRX A; 1IZ6 A; 3Q1J A; 5LL6 S; 1VQK A; 1UEB A; 3S6W A; 2PNI A; 2DYI A; 1VIE A; 2YUQ A; 1H64 1; 2E64 A; 4RMO A; 5CKB A; 2X4J A; 2RJF A; 3JCM V; 1QWF A; 3M56 A; 4F16 A; 2DRK A; 2SRC A; 3VJP A; 4X1V A; 1R77 A; 4IIO A; 4HCZ A; 1GCP A; 2A28 A; 1UG1 A; 1BI1 A; 4RTX A; 3G71 Q; 2O2O A; 3VS0 A; 4BY6 B; 4WF2 A; 5DM7 R; 3WXM B; 4D8D A; 3KBG A; 1N8R C; 2PUK B; 3M57 A; 4PK4 A; 3THK A; 2LZ6 B; 1BU1 A; 1VQ4 A; 5FU7 B; 1Q86 U; 1NE8 A; 1IRE B; 2RJC A; 1JJ2 A; 4PKC C; 2LT4 A; 2ZPF B; 2VXF A; 2FZK B; 1G3T A; 2HL5 C; 5DLO A; 2XG8 D; 3M4G A; 3C0C A; 3UWN A; 4RTZ A; 1TUG B; 2FZC B; 1I1J A; 2HNI A; 2K57 A; 2QQB A; 1VQ9 T; 3A98 A; 1Q95 G; 2XU8 A; 2LTO A; 1ABQ A; 1NYG A; 2DL5 A; 2DMO A; 2V26 A; 1GCQ A; 2KVQ G; 4RTU A; 2KXD A; 1WQW A; 1OU8 A; 3JCM X; 4PJJ A; 4M75 E; 4ZNX A; 5ECA A; 1EX4 A; 1TSF A; 3G1J A; 3CCS Q; 2FPD A; 4EMK A; 3QKJ A; 4AG2 C; 1YI2 Q; 2CZ7 B; 3TRE A; 5CIU A; 4E7S A; 3EG0 A; 3EGD A; 3WVD B; 3HL8 A; 3MEU A; 4AG1 C; 2EIF A; 3EAE A; 3V7C A; 4FT4 A; 3EHR A; 2F2X A; 4PFO A; 3L42 A; 3UAT A; 3CC4 Q; 1WHG A; 3QWX X; 1W4S A; 4HVU A; 5LJ3 e; 5KYY A; 1R0C B; 2ZPI B; 2AZV A; 3MCA B; 1RLP C; 2I0N A; 2CP0 A; 2LT1 A; 3M0T A; 5I2S A; 2OTJ T; 4M78 F; 1T3L A; 5DLQ E; 2OAW A; 4MZM A; 4II1 A; 1N9S A; 3OYD A; 2NUZ A; 2LMJ A; 1BYM A; 4MDW A; 4EMK B; 3JV3 A; 3OBY A; 2W10 A; 3REB B; 2DIG A; 3OSV A; 3EGD B; 4AFU C; 4QKU A; 3CXC A; 1U1S A; 1ZBX A; 3QZ5 B; 2QI2 A; 5GMK i; 3CD6 T; 2YRV A; 2QDY B; 1R8O B; 2MK5 A; 2K3X A; 4MZT A; 2K2V A; 3TU4 K; 1HXD A; 4OF1 A; 2L0A A; 1Y96 B; 5KYY B; 4BAC A; 4J6X A; 4XTU A; 2QA4 T; 4M78 A; 3DKM A; 2J6K A; 3QPH A; 3OYL A; 5GAM d; 2EYY A; 3OSS C; 2M1H A; 1QCO A; 1YP5 A; 1IB8 A; 1BBZ A; 2P0K A; 1T0H A; 3N5B B; 2CP3 A; 1U06 A; 3NTK A; 2QGF B; 2IG0 A; 3P8D A; 4FSS A; 2ZCF B; 1PC0 A; 1EIF A; 4F7U F; 1PWT A; 2IPO B; 3CBO A; 4XU3 A; 3CMA T; 1WI7 A; 4BB7 A; 2WSC E; 2DFU A; 3EG2 A; 1JXO A; 1MUZ A; 4C8Q D; 1VQ9 A; 1N5Z A; 2LJ3 A; 1X75 C; 1MGQ A; 2E5Q A; 2LCC A; 1ZLM A; 3HP9 A; 4M78 B; 2PQW A; 4J5Y A; 2CDT A; 2ABL A; 2CS7 A; 4N4I A; 1UGR B; 3CCE Q; 2HMA A; 5KYW B; 4RG8 A; 1VQM T; 3MKD A; 4HT9 A; 3RUX A; 5C6S A; 2ENM A; 1Q7Y R; 5KE2 A; 2SEM A; 1SHF A; 2BZ8 A; 1W2B A; 1OYX A; 2BIV A; 4C92 C; 3CBP A; 4M7D F; 2F1L A; 2XK0 A; 4AFS C; 2RPN A; 5LJ5 j; 2K79 A; 4JRK A; 3NTI A; 3SB2 A; 3GIB A; 3SWN A; 2RN8 A; 2Z0W A; 1AT1 B; 4HA8 A; 3L2V A; 1Q82 U; 3JB9 H; 4OMN A; 2G6F X; 2OTJ A; 2C0I A; 1YJ9 Q; 3NHN A; 3CC7 Q; 3QYH B; 1TTH B; 1VQ6 A; 2HEQ A; 1H8K A; 2CP2 A; 5LJ5 h; 2O88 A; 1VA7 A; 2R58 A; 2PVD B; 1GBR A; 2DF6 A; 4F7U B; 1UHC A; 3ZFJ A; 5DY9 A; 2CUB A; 1X6O A; 3LH0 A; 2XD0 A; 5CKH A; 2JMC A; 4JLI A; 1BI3 A; 1M3B A; 1JB0 E; 3SWN B; 2KEA A; 1U3O A; 1UUE A; 1LPL A; 2BUD A; 2QTV A; 2LX7 A; 4E7J A; 3CCU Q; 3UA6 A; 1VQO T; 3JB9 D; 3RKW A; 3VS4 A; 1WNL A; 2H3E B; 2MWO A; 1D1C A; 4CC7 A; 2EYW A; 2KI7 A; 2VC8 A; 2VXE A; 2D6F A; 2M02 A; 2E12 A; 4M78 E; 1BB9 A; 3I56 Q; 1VQN T; 1VQP Q; 1ABO A; 3RMS A; 2ROT A; 1FWZ A; 5FLX E; 2VB6 A; 1YJW Q; 4M7D B; 4DOV A; 1F1B B; 4FYW B; 2V8K A; 2GFU A; 4C0F A; 1YJN T; 2COW A; 5CQY A; 2E10 A; 3CC2 Q; 1FYN A; 4DBR A; 4FT2 A; 2DE0 X; 4FM4 B; 1UEC A; 2FHD A; 4GY5 A; 1G83 A; 4XTZ A; 3AHU A; 2COY A; 1I5O B; 1X43 A; 3JB9 G; 1NYF A; 1TG0 A; 2XHC A; 2KK4 A; 1PCX A; 1VQM A; 2A08 A; 3M0S A; 3R6N A; 1QVF S; 1KHI A; 5FWC A; 1M1K R; 2RHX A; 1B7T A; 1AD5 A; 3X25 B; 4BI4 A; 1M90 C; 4M7A D; 1WFW A; 3CCL A; 4OVA A; 1S72 T; 1V76 A; 3FLG A; 1QQJ A; 3ZEH A; 4C92 A; 4PJO D; 4LDV A; 4F7U E; 3CXC S; 2JTM A; 1OX8 A; 2K3Y A; 2EYX A; 4M75 C; 5GAN e; 1VQ7 T; 1M1K U; 4OMP A; 1K9M R; 1Q86 C; 2DJQ A; 2ZZD A; 5LJ5 g; 1OX9 A; 1I81 A; 2JXB A; 4LDU A; 3V7S A; 4RCC A; 3A8O B; 3MEA A; 4GLK A; 5GAN 7; 1MV0 B; 3EFO B; 3T9N A; 2YLC A; 1K9M U; 1Q81 U; 4AFQ C; 3H0F A; 1VQ5 T; 1NEG A; 4M75 D; 1M2V A; 3JCM d; 2NUP A; 4JS5 A; 4N0A C; 4M7A G; 2L5Q A; 3S3O A; 3H9N A; 4O6J A; 1PHT A; 4XTV A; 3KXT A; 4PJO G; 1NG2 A; 3S3M A; 4BE0 A; 4BY6 C; 4M7D E; 4B9X A; 2OJ2 A; 5LJ5 f; 3OYB A; 4Q5W A; 3FRN A; 2EFI A; 1RI9 A; 4HKE A; 2RHZ A; 3NFC A; 2OTL T; 1VQL Q; 5FU7 C; 1VQO A; 5HKC A; 2PZ1 A; 2E5K A; 2HDA A; 2IIM A; 5M9O A; 2D0N A; 2P4R A; 2DTO A; 4A4E A; 1VQN A; 2OX7 A; 1FMV A; 1M2V B; 5GAM e; 4M75 G; 4K11 A; 2GQI A; 2DPP B; 3MPU B; 5KCO A; 2DXT A; 3M9Q A; 3QSU A; 1NJI C; 4NL3 A; 3QHS A; 2BZY A; 1YWO A; 5GAO p; 5GAN 5; 5FWB A; 1W2B S; 2H3J A; 1RI0 A; 3PIP A; 2E1H A; 2CRE A; 3OQ5 A; 2EQM A; 3EFS A; 3RKX A; 1KIK A; 2VVK A; 2XDD A; 4AMC A; 1K76 A; 2QAS A; 4NOY A; 2M0Y A; 4RUG A; 2LCL A; 2CZ0 B; 2AK5 A; 4CRI A; 1AHJ B; 4X9C A; 3TSW A; 2YUO A; 4BE1 A; 3A8H B; 5GAO m; 3I55 Q; 2JTE A; 1K8A U; 1NEB A; 2A7Y A; 1AOJ A; 1KD1 C; 3GP8 A; 1YIT T; 2M51 A; 3EHQ A; 2GCX A; 2K5F A; 2AZS A; 2V1Q A; 1C0M A; 3CCQ Q; 1S72 A; 4J9C A; 2F2W A; 5IT9 E; 1XTD A; 2CGH A; 1UTI A; 2DD4 A; 3JSC A; 2I2L A; 2FL7 A; 5IAY A; 3EH2 A; 3CCR Q; 2MI6 A; 1R0B G; 1YCY A; 3ULR B; 1VIF A; 3FB9 A; 2C0T A; 3G71 T; 2J05 A; 2YSQ A; 3OMG A; 1NBE B; 4EMK C; 2DER A; 1G3S A; 2KR3 A; 4E47 A; 3HTR A; 1RAC B; 3H8Z A; 1VQ5 A; 2QYZ A; 4IUV A; 4JJC A; 3QZ9 B; 1VQK Q; 1GBQ A; 4LN2 A; 1AWJ A; 4LDY A; 2KNB B; 7AT1 B; 4N0A A; 3HKS A; 1QKX A; 3OBW A; 4BD3 A; 4CC3 A; 2C06 A; 2DRM A; 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4RCB A; 1M3C A; 2RI5 A; 5CO7 A; 4EMG A; 1P92 A; 2DZC A; 4M78 G; 5LJ5 d; 2CZ1 B; 3BFM A; 1D1A A; 1VOM A; 5GMK e; 2PVG B; 4LUD A; 3C95 A; 4OMO A; 3SWN C; 4ZN1 A; 2F69 A; 3O8V A; 2HBW A; 2QQS A; 3JCM e; 1Y96 A; 1K73 R; 1W2B P; 4Z8A A; 2RQU A; 2FVU A; 3MET A; 2LNH B; 1QVF A; 4KGZ B; 2CSI A; 1WGS A; 2FEI A; 1VQ6 T; 1XJW B; 1M8V A; 5IXB A; 2RM4 A; 3GNF B; 5LJ3 g; 3OYM A; 1K73 U; 3ASK A; 4IUU A; 3OY9 A; 1M5Q 1; 3X24 B; 2ROL A; 4M7D C; 2ZPH B; 3CCS A; 2J06 A; 1YI2 A; 5GJV B; 2E6N A; 2E3H A; 3NPF A; 4OML A; 1Q81 C; 5GMK m; 3RNJ A; 2ZPB B; 2MWP A; 3HSB A; 2LRQ A; 4KT0 E; 5GAO n; 2DYB A; 3M5A A; 5FRN A; 1VQ9 Q; 1XQH A; 4BE2 A; 3I9Q A; 1KD1 R; 4IUQ A; 2QAZ A; 3CC4 A; 3CME Q; 4XAX B; 4PNO A; 3EGU A; 2V8J A; 2HBP A; 3GPL A; 5IN1 A; 4DA4 A; 5KCH A; 3L2Z A; 4J9G A; 5CAI A; 5LJ3 f; 2HZY A; 4J9F A; 1KG1 A; 3VS2 A; 3U23 A; 4BI3 A; 2DXC A; 4B9W A; 4MMK A; 1I0C A; 3X28 B; 4OB2 B; 4LD6 A; 2HKQ B; 4JZ3 A; 2HD0 A; 4JPB W; 1MV3 A; 5L8R E; 1QMC A; 3JB9 J; 3I5R A; 1I8F A; 3JAM E; 2X35 A; 2RB6 A; 1ZUU A; 4RKU E; 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