1Q8YA

The structure of the yeast sr protein kinase, sky1p, with bound adp
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
362
structure length
351
Chain Sequence
YHPAFKGEPYKDARYILVRKLGWGHFSTVWLAKDMVNNTHVAMKIVRGDKVYTEAAEDEIKLLQRVNDADNTKEDSMGANHILKLLDHFNHKGPNGVHVVMVFEVLGENLLALIKKYEHRGIPLIYVKQISKQLLLGLDYMHRRCGIIHTDIKPENVLMEIVDSPENLIQIKIADLGNACWYDEHYTNSIQTREYRSPEVLLGAPWGCGADIWSTACLIFELITGDFLFKDDDHIAQIIELLGELPSYLLRNGKYTRTFFNSLLRNISKLKFWPLEDVLTEKYKFSKDEAKEISDFLSPMLQLDPRKRADAGGLVNHPWLKDTLGMEEIRVPDRELYGSGSDIPGWFEEVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SR protein kinase
publication title Nucleotide-Induced Conformational Changes in the Saccharomyces cerevisiae SR Protein Kinase, Sky1p, Revealed by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 116
structure length 351
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-08-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1q8yA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1q8yA01
5JFVA 2C30A 2XVDA 3ODYX 4QTAA 2VTNA 3BHYA 2O3PA 3GQIA 1H26A 4M3QA 3FMLA 3MSSA 3ZLSA 5AP3A 4B4LA 1GZOA 5FM2A 3QC9A 4FV9A 2IO6A 4O81A 4IQ6A 4KKGA 1ZRZA 3QZGA 5AR3A 5IQGA 3G33A 4K9YA 3KREA 3D4QA 3S4QA 2GFSA 2YA9A 3FZ1A 4GUBA 3RINA 4MKCA 3GC9A 2V22A 3EN7A 4C02A 1I44A 1YI3A 4ZTLA 3GBZA 3KXHA 2R3FA 2GNJA 2VTQA 1H8FA 4FEQA 4TPTA 5HIDA 3F82A 5JT2A 2XNNA 3E63A 4UBAA 1YWRA 2BDJA 3LCKA 4L01A 1IAHA 2QOBA 4GFGA 2QO9A 2F49A 2QOLA 3A7HA 2HZNA 4FV0A 3UIBA 1J7IA 4YNEA 5IG1A 4IC7A 3ETAA 3VULA 4R3PA 2WNTA 3OCTA 4IWOA 4X6RA 1FGKA 1ZYCA 4DN5A 1J1BA 3LXKA 4U97A 2ZMCA 4DEHA 4IE9A 4O0WA 1HCLA 1OECA 2P4IA 3LXLA 3QTQA 4KSQA 1ZYDA 3FC1X 4D2PA 4C57A 4CZUA 3RCDA 5CI6A 3TT0A 4EC9A 3NUXA 3NUYA 3QQKA 2WQBA 3EQBA 2X4ZA 4LYNA 2YCFA 3VF9A 4GKIA 3ZO3A 4BDJA 3FMHA 3QCQA 3W2PA 5EH0A 5HTIA 4HOKA 1GAGA 1H27A 4B6LA 3LXPA 2CNUA 1G8AA 2X0GA 2CLQA 2OZOA 2X39A 3D9VA 3FMMA 3ZS5A 3V6RA 2QD9A 4FZ6A 2PK9A 5HLNA 1URWA 1MQBA 1IASA 2FO0A 2RKUA 2XS0A 4ANMA 4FV1A 4O22A 4QMUA 1XH4A 5E8YA 4HYIA 2XIKA 4IB0A 3TZMA 5H8GA 3H0YA 2JDOA 4A9YA 4BZDA 3OZ6A 5I9WA 1SNUA 3QX2A 5C8KA 2XYNA 3TCPA 4M0ZA 1JAMA 1R78A 3EJ1A 3NCGA 4FVQA 4PL4A 4PPCA 5CT7A 3UNZA 5KUPA 4QMVA 4DYMA 1QMZA 3VBXA 5FDXA 3W55A 1REKA 3HZTA 2VTTA 2PU8A 2ITZA 2CGWA 2YITA 5CVHA 2WU6A 3A8WA 3A7JA 4YHJA 4CFMA 2QI8A 3M2WA 5JGDA 3KC3A 3EWHA 4U40A 5E8ZA 4C4EA 3H3CA 4BDHA 2AC3A 2W06A 1OITA 2HCKA 4FTJA 3TNIA 5K4JA 5DNRA 3ZFMA 3I6WA 3BHHA 3EQPA 4YJPA 4YPDA 4AFJA 4AN9A 5M4IA 2X9EA 4CV8A 3SW7A 3GU8A 4BDAA 4O91A 3DTWA 5J9ZA 1KE9A 1XHAA 3EZRA 4AW1A 4YLJA 2DWBA 2W5HA 4JBQA 3EQHA 3UVQA 4D0WA 5BMMA 3LLAA 3HKOA 3B8QA 3NNVA 4U42A 4DGOA 2O65A 3EQIA 3F5UA 3KULA 5J8IA 3VBTA 2X7GA 1PMUA 1PY5A 4XG4A 1H1WA 4DFYA 4ZJVA 2PY3A 4TXCA 5A6OA 1CMKE 3F3WA 4G5PA 3BLQA 4IM2A 5C8MA 4LOPA 3FKLA 1PKGA 4XV2A 4PMTA 4U3ZA 1VYWA 3DDQA 3QRJA 3BHVA 4JT3A 2R3LA 5E7RA 5HZNA 4DEIA 4ERKA 3C7QA 3QXPA 1YXXA 3KK8A 4F9AA 3ID6C 2QKWB 3EKNA 3DU8A 3MH2A 4QMTA 4X2GA 4D1SA 2R3IA 5LCJA 3PXYA 4TTHB 4CFNA 3F2AA 1PF8A 2JGZA 1KUTA 3BLHA 3ORNA 4IHPA 1AD5A 2OF2A 1WBWA 4I22A 4IVBA 4C4FA 3ZEPA 4XG9A 3QQUA 2YJSA 1F5QA 2XIYA 2ZYBA 5KHXA 1IG1A 5HCXA 3PVWA 4RVTA 3AD6A 4ITJA 2WTKC 3I7BA 3R8ZA 2FSTX 1IA9A 2HY81 1RE8A 2W1CA 2XCKA 3IGGA 3OOMA 4EH4A 2YM8A 1PYEA 4ANSA 3EN6A 5FBNC 4EONA 2HWOA 3SA0A 4JJRA 4OTHA 3RVGA 4GK2A 1FQ1B 5JKGA 4O83A 4IACA 4RWJA 4GH2A 5ANJA 3LM5A 3GGFA 1P5EA 4X2KA 3S2PA 4M67A 3COIA 2XNMA 3NEWA 3UIUA 4C2VA 4CV9A 4O84A 4AAAA 3QQLA 1ZZLA 2RF9A 2FSMX 2IG7A 2A19B 3MA3A 2XP2A 4JRVA 4ANOA 1OL7A 3O71A 5CEOA 2VO6A 4PMMA 2QOCA 1PJKA 4DTAA 4HNIA 4JDHA 4CFVA 5AA8A 4JX3A 2VX3A 5AIRA 4FVPA 3RAKA 2YCRA 1WBPA 3C50A 3EL7A 2J5FA 3VJNA 1LR4A 3DBQA 1YHVA 5DI1A 5FD2A 3VUTA 3BIZA 4AW0A 4FNXA 4R7HA 2GU8A 3CD8A 2KTYA 4FEVA 1XH7A 2OFUA 2J0KA 3LIJA 5AV4A 5AWMA 3VS2A 4E20A 2R3GA 2EWAA 1JNKA 1MQ4A 3NUUA 3P0MA 1O9UA 2XIXA 2YM7A 1UA2A 2I40A 3DFAA 3TL8A 2GCDA 4W9XA 4RGJA 1P2AA 3KA0A 4ACCA 3RKBA 2UZLA 1U5QA 2OGVA 2R7BA 4O7ZA 3FEGA 2I0EA 3MIYA 3SLSA 5ANIA 3IECA 3L8PA 3MPTA 4DGNA 4BDKA 4LL5A 5K4IA 3QCSA 3CC6A 5IQDA 3L8XA 3ZBXA 3A2CA 5CNOA 3U51A 1W84A 4JDKA 2RG5A 3BQCA 3N51A 5LMAA 3WIGA 3VRYA 4Z9LA 5L6OA 1WVWA 4LL0A 2GS2A 5KMLA 2IZSA 2J50A 1XBBA 1B39A 4RA5A 2C3KA 3I4BA 4G17A 4X2JA 3PRIA 5HIEA 2IVSA 4F99A 3VS0A 5CF5A 4FNZA 4UEUA 3PJ8A 2G1TA 4O86A 4FZ7A 2HWPA 5L2IA 3VAPA 3ZUUA 3R28A 3PWDA 5CNNA 4ASXA 3G9NA 3NYOA 3KQ7A 5KMNA 4DGGA 4YTCA 3C4FA 4IAFA 4AF3A 2Z02A 3SG9A 4FTOA 5HE0A 3UOJA 2Z2WA 2UZOA 3CR0A 3TG1A 4CQEA 2B53A 4D58A 2JDRA 3AXWA 4CG8A 3BLRA 4BTMA 5BX0A 2BROA 4HPTE 5KMOA 3D7TB 5HU9A 4BDBA 3HV6A 1YOLA 4K2RA 3BWFA 3IW4A 3ZO4A 3HDNA 2QU5A 2RGPA 4R1YA 3P79A 4AN2A 2YDKA 5M53A 5HX6A 3G6GA 1UNGA 3ULZA 2ITYA 3FBVA 1OL5A 5TKDA 4FI1A 3ZDUA 3LCDA 3LAUA 2XBJA 2GQSA 1H0WA 4CEGA 3UMWA 4WBBB 4BCIA 3C9WA 4BKZA 4RRVA 3KL8A 3HP2A 4Z3VA 1CSNA 5ITAA 2VWVA 4MXOA 3GEQA 1IAJA 1A9UA 3R7UA 3V8SA 3FZPA 5IMEA 3A7FA 3Q52A 4DFZE 4HYHA 3C0HA 1Q8TA 2AUHA 2PVLA 3I0OA 3R73A 5JSMA 3E3PA 2BHEA 3GT8A 2C5YA 4MBJA 3ZZEA 3GUBA 4OTWA 3PJ1A 5J95A 5K0KA 4FTUA 3HLLA 3CGOA 2VTPA 4RC3A 3ELJA 3PIYA 4ZLOA 4KIPA 2BUJA 2WIPA 2WMAA 4FKTA 4UV0A 5A3XA 2EB2A 4E73A 4YR8A 5AUUA 1VEBA 4I21A 1JQHA 1OGUA 3Q4CA 5IQBA 4ZTRA 3NUPA 3ROYA 4IWQA 2BKZA 2GS6A 3MFRA 3V5JA 4JDIA 3VBWA 3DBCA 1R1WA 2WQEA 4U45A 3LFNA 2VWYA 3PY1A 1S9JA 2PMIA 3TTJA 4O0YA 5HLPA 3A62A 4S31A 3HRBA 4YP8A 4G1WA 4JBOA 4AFEA 2H34A 4DFNA 2YAAA 5AUWA 1V0OA 2CCIA 4LRKA 3IDCA 3UOLA 5IUGA 2E2BA 1VR2A 4D2VA 3U55A 5FBOA 2VTHA 3Q5IA 4WNPA 3NGAA 1XKKA 1OPJA 2RFSA 2V7OA 1WMKA 5AV0A 4ACDA 3W2OA 1PHKA 3TZ7A 2OJFE 2JDTA 2VWWA 4EJ7A 3H30A 1YHSA 3R8LA 4ANBA 4P90A 3FYKX 4IADA 2WTWA 3TZ9A 2W4JA 4JIAA 5HCYA 4Y83A 2W7XA 3O7LB 4MBLA 2WD1A 2X1NA 3U87A 4UMPA 4NJDA 2ZDTA 4BDFA 3HAMA 2ACXA 4FYNA 1B6CB 4LG4A 3QD0A 3QTUA 2WTJA 1KE5A 2I0YA 4ZZNA 3F88A 5JGAA 5JN2A 4RX9A 2A0CX 3OMVA 4IWPA 1KE6A 2B9FA 4QP9A 1WVXA 4YJTA 4MD7E 3TNHA 5HU3A 4YZDA 2XMYA 4QP4A 1H08A 5DEWA 5JGBA 4MHAA 1JKTA 2FVDA 3R01A 4XJ0A 5DH3A 3TJDA 1YXVA 3O51A 3VF8A 3CKWA 4I92A 2QHMA 2UW4A 3C51A 5CEQA 4E4LA 1JSTA 3ZLYA 4BTJA 4L7SA 2Y6OA 3ORPA 2PZRA 5FG8A 5HORA 4FV5A 3ZTXA 4DG2E 3W8LA 4BDEA 2B55A 2PULA 4FICA 2YM4A 1YVJA 4RX7A 3R2YA 5E91A 4HZRA 4AZFA 1UU8A 3FI4A 4YU2A 1XH5A 5A6NA 4NYEA 3P08A 4ORKA 4X6QC 2HAKA 3UBDA 3UQGA 4GRBA 4C61A 5LWNA 5LXMA 4XV3A 1H00A 5D12A 4C37A 3UODA 1ZWSA 2UZEA 3ACJA 3BWJA 1NA7A 3E7OA 3FC2A 3FE3A 3PVUA 1SVHA 3QCXA 5DRBA 2ITQA 4FKLA 5AP1A 5K5NA 5DWRA 4CMTA 4XEYA 4FVRA 3VIDA 3ZSHA 5BUJA 1W8CA 4PTCA 3EHAA 4EYJA 4FZAB 4UMQA 3CCNA 4DEDA 2ITVA 4FSQA 5LOHA 4F6WA 3V6SA 1GNGA 4JRNA 4CYIA 4E93A 5AEPA 4UALA 3EN9A 2J7TA 3FY0A 4QP8A 5C01A 4Q5HA 2WHBA 3FI8A 5EM6A 4BDDA 4DFLA 3DK3A 4EZ5A 2E9PA 4L3LA 4QPAA 3DBDA 1KV2A 3SV0A 2YFXA 3CKXA 4D28A 2ETRA 1P14A 3QZIA 4O7SA 1UU9A 4XG2A 2ITUA 4FSZA 3GCVA 4LFIA 2R3NA 2XK6A 3N9XA 2UUEA 2PMLX 4OAUC 4EOSA 4RZVA 5TE0A 1VZOA 4FT9A 4IVDA 3QUDA 1Q99A 1PMVA 3AC2A 1XWSA 3QALE 2RFEA 3AC3A 3KRLA 3VBYA 2BRGA 2X7FA 3F66A 3UTOA 1H07A 5TR6A 3HUBA 3HYHA 4Y46A 5BVEA 3ERKA 3GFWA 3RM6A 4CMOA 4IZ7A 4YZMA 2UW5A 3CPBA 4KB8A 4L00A 2HXLA 3JVSA 4MH7A 4QP6A 5DT4A 2X4FA 5HLWA 5CEPA 4UY9A 5CYIA 1JKKA 4QP2A 3DGKA 5IH6A 5HVKA 5HD7A 3PSBA 3VS7A 4FSWA 4RX8A 2UZWE 4PNKA 4RSSA 4XOZA 5ACBC 5AR2A 4BCQA 1FVVA 3RALA 5I9UA 3K54A 3U4WA 3ORZA 4NTSA 4XBUA 3DPKA 4FZDB 5AX3A 2O5KA 3HVCA 1JPAA 3UC4A 3LJ1A 1Z57A 4HPUE 3FL4A 5IA0A 2GSFA 4E1ZA 3U6IA 5CAVA 1LPUA 3RM7A 3BGQA 3UPXA 3ZSGA 3C5UA 4E5AX 2J9MA 3HV5A 4V05A 3OOGA 5IEXA 3OWJA 1YXSA 3PE2A 2VO7A 4J8NA 3UIXA 4EI4A 2Y9QA 5LWMA 3KF7A 4ASDA 2R3HA 4N4SA 2PSQA 4MXYA 2AYPA 1Q62A 3VVHA 2JFMA 4R6VA 4C34A 4MK0A 4P5QA 5IH5A 3QA0A 2CKQA 4MVFA 3ZXTA 4O7VA 2J4ZA 4JL9A 2C68A 5C9CA 3WI6A 4G5JA 5EHYA 5L6PA 4NL0A 4XH6A 4AZWA 1TVOA 4RJ5A 4BBFA 2YERA 4OTQA 2OW3A 4DBNA 2OG8A 5HICA 4BWPA 3P7CA 3IKAA 3AOXA 4YTHA 3AD5A 3HV4A 3P7AA 4FTMA 4QYGA 3GU6A 3VRZA 2J0LA 3K3IA 4FSTA 4EBWA 4IANA 3O17A 3AD4A 4ENYA 3KGAA 4IAKA 3QRKA 2G2FA 2ZV8A 4H3QA 4RC4A 1UU7A 5KBRA 4FTCA 4XS2A 4ZSJA 4FEWA 5IQIA 3EH9A 2R9SA 3FY2A 2UW9A 1K9AA 3W18A 2I1MA 5FGKA 4KBCA 5CAPA 5LMBA 4PPAA 4DH1A 4P5ZA 4FSUA 1QL6A 3P7BA 3FI2A 1J91A 2QLQA 3SQQA 3FSKA 4EH5A 2J0MB 3QC4A 2VX1A 2C5XA 1OIYA 3NNXA 2X9FA 4F64A 5HX8A 2X6DA 3ULIA 4FIHA 4UB7A 5FEQA 2OZAB 3NNWA 3ZSIA 3S00A 3BYUA 5C4KA 2Z7SA 1OUKA 4BF2A 2VNYA 5DE2A 1UNHA 5F20A 2PVJA 2AC5A 3BRBA 4C4JA 3JYAA 2CCHA 3VN9A 5JEBA 5CSPA 1R39A 4U43A 5AM6A 5FP5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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