1Q99A

Crystal structure of the saccharomyces cerevisiae sr protein kinsae, sky1p, complexed with the non-hydrolyzable atp analogue, amp-pnp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
363
structure length
354
Chain Sequence
GYHPAFKGEPYKDARYILVRKLGWGHFSTVWLAKDMVNNTHVAMKIVRGDKVYTEAAEDEIKLLQRVNDADNTKEDSMGANHILKLLDHFNHKGPNGVHVVMVFEVLGENLLALIKKYEHRGIPLIYVKQISKQLLLGLDYMHRRCGIIHTDIKPENVLMEIVDSPENLIQIKIADLGNACWYDEHYTNSIQTREYRSPEVLLGAPWGCGADIWSTACLIFELITGDFLFETKDDDHIAQIIELLGELPSYLLRNGKYTRTFFNSLLRNISKLKFWPLEDVLTEKYKFSKDEAKEISDFLSPMLQLDPRKRADAGGLVNHPWLKDTLGMEEIRVPDRELYGSGSDIPGWFEEVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SR protein kinsae
publication title Nucleotide-Induced Conformational Changes in the Saccharomyces cerevisiae SR Protein Kinase, Sky1p, Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 114
structure length 354
sequence length 363
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2003-08-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1q99A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1q99A01
3E8EA 3QGWA 2CNUA 1MRYA 1PY5A 4RJ7A 3TJCA 3K3JA 3LFQA 3TZ8A 3VBVA 5M06A 2ESMA 4XV2A 5FG8A 3BV2A 4XOZA 3VC4A 1KOAA 1RJBA 2HYYA 3IGGA 1IR3A 3QL8A 1XH7A 4KAOA 2KULA 3AC5A 5E90A 5HE1A 2JGZA 3NYVA 3BV3A 3FHIA 3CKXA 5CEQA 4ZZOA 3LCDA 4ASXA 2OXDA 3DS6A 3NUSA 2WIPA 4WG3A 5IUIA 3F5XA 4RIXA 4IWOA 5DI1A 2WMXA 5BUIA 4Y8DA 4K8AA 4TXCA 3S00A 4ZTLA 1KE8A 3HMMA 1ZZLA 3DJ7A 4FKGA 4YJSA 3NDMA 3G0FA 2B9FA 3A7JA 4HCTA 3KGAA 3SRVA 2WIHA 2VTMA 3D94A 1PMNA 5I3RA 1BMKA 4JR3A 4RC2A 4EC8A 3T9IA 3BIZA 4FKVA 5IUHA 3AMAA 3PJ8A 3ORNA 3HNGA 1SVGA 1OM1A 2ZB0A 2YLFA 5KO1A 5BUJA 1H08A 1URCA 2WEVA 2WMQA 5DNRA 5EI2A 2BRBA 2JFMA 4NIFB 3FY2A 2UVXA 4PTCA 2BROA 2JKMA 4RPVA 3ID6C 3PLAE 5JFWA 1U59A 1QMZA 2OJJA 4OR5A 3EQPA 3I7CA 4DAWA 3GFEA 3KXXA 5AP4A 4IFCA 2RFSA 2BZJA 1ZOEA 3UOKA 4YO6A 3BZ3A 3QRKA 4D2RA 2B1PA 3R2BA 4EEVA 5JEBA 3HA8A 4DN5A 4ALVA 4FNZA 3ATSA 1W98A 4DFNA 4F6UA 2YAKA 1JBPE 3CLYA 4G6NA 1YI4A 3V8WA 1KV2A 4I6BA 5FEQA 1OITA 3R8PA 4DLIA 3DBQA 3LFNA 3M2WA 3OWKA 5EW3A 2OICA 1FQ1B 4EOPA 4XS2A 1WVYA 4EQUA 3QCSA 4U5JA 4YJUA 4RVMA 3L8VA 4GIIA 4DITA 3UOJA 4OBQA 1EH4A 4K77A 1VR2A 2IVVA 4WBOA 4BZDA 4JVGA 2YLEA 3UO6A 2Y7JA 2YN8A 4G5PA 5J1VA 4R77A 3WZKA 4XP2A 4BGQA 4OTRA 4HPTE 3U8WA 2HZIA 1SVHA 1VYWA 4ENXA 1X8BA 5H3QA 4GFMA 3VAPA 2HY81 2X8DA 4R3CA 2OLCA 4I23A 4YC8A 2ITVA 2JDTA 1R3CA 2HIWA 4AW1A 4C4FA 5DRBA 4C34A 2CHLA 2PVMA 5DLSA 5M09A 3V5QA 3OBJA 2J0JA 1YHWA 2FA2A 5BVEA 3VUKA 5AFVA 2X6EA 3A99A 2W1DA 3IOKA 4Q2AA 4QQTA 1Q62A 2PMOX 4FSTA 2H34A 3ZS5A 1P2AA 4CSVA 3PG1A 4JRNA 1F0QA 4MWIA 2VWYA 1A48A 3LMIA 2BHEA 4YO4A 4XBRA 2ZV7A 1E1VA 1KV1A 3BCEA 4C7TA 2WMUA 3W2QA 3ZRMA 4RX9A 2W5BA 2QOCA 2UW0A 4CT1A 5JFVA 4G34A 4C37A 3FI4A 3ZEWA 5BPYA 3P86A 5HORA 1GNGA 2BCJA 4YJQA 5I9WA 3R1QA 4B6LA 2JAMA 4YC3A 3KL8A 3VS4A 2CKPA 4EOLA 4BWKA 3KRJA 1PXLA 3DAKA 4EH9A 4QP2A 1YWVA 2PUNA 3MFUA 4RJ8A 1Q61A 5CU6A 3RK7A 3C5IA 4O81A 2UZTA 2X9EA 4IEBA 5C1QB 4PMSA 3RINA 3GCSA 4WRGA 1HCKA 4FG9A 3W18A 4X2KA 5B2MA 4CD0A 4E4LA 3GGFA 5EQYA 3R04A 4G16A 1Q8UA 5L2TA 1JAMA 4AZFA 1YWRA 3O8TA 3QCYA 4NFMA 5AM6A 3ATTA 3OROA 3IG7A 2ACXA 4MBLA 5DGZA 3WZEA 4A7CA 3ZEPA 2JD5A 4ALUA 4YZNA 3RCDA 4AW5A 5IQEA 4LOOA 5AP2A 2GQRA 3F69A 3LMGA 3MI9A 3PFQA 4I0RA 5GJGA 3ZLYA 3D14A 3E7VA 4F7SA 3FLWA 2XKCA 4RQKA 4CT2A 5BYZA 3VJNA 2AC3A 4R3RA 1PW2A 5IA4A 5IQGA 2XIZA 4M13A 3EQFA 5HNGA 4S34A 2PVRA 2YM6A 4ZK5A 4M84A 3B8QA 4AS0A 3TKIA 1CTPE 4I41A 5CAUA 4DINA 1DI8A 3IECA 3QTZA 3DTWA 3EQRA 3BBWA 4NM7A 3QGYA 3LOKA 5M53A 3EB0A 3FZOA 4F64A 2ETRA 3OEZA 3EN6A 3VS7A 2C5VA 3II5A 5F1ZA 5I9XA 3NCGA 3IW4A 5FDXA 2HY0A 3AC1A 4N0SA 3ORXA 3EFKA 2I40A 1V0BA 4N57A 1JSTA 3UIMA 5EM7A 2CKOA 3EN9A 4M0YA 3F2RA 1PYEA 3JPVA 3HUBA 3RPRA 5KNJA 2YDJA 4L3PA 4AT3A 5AA9A 4QMPA 3ORZA 4D4RA 2ZB1A 4M69B 1FBNA 4MXYA 3GENA 4E20A 5D1JA 4RC4A 5IISA 2C30A 2QOHA 4ERKA 3OOGA 4E5WA 3WF6A 4FTNA 3FYJX 2ZV2A 4BDDA 4EOKA 3HV3A 5EQEA 2G1TA 4LG4A 1PXIA 3SW7A 2YZLA 3OW4A 3Q5ZA 4PPAA 3R9HA 2YA9A 4MK0A 5L6WL 5DR9A 5ANJA 2OFVA 4FNYA 4IM0A 1O6LA 4X3FC 5EM5A 5FP6A 2IG7A 2XBAA 3GU7A 3HP2A 4RC3A 5FUTA 3A8XA 3EJ1A 2PE1A 3OS3A 4IW0A 4BYIA 4ZS4A 3KFAA 1Q3DA 4MX9A 4RX8A 5E92A 2X7FA 3E62A 3LJ0A 4RIXB 4GIHA 4FL3A 3TTIA 3HL7A 5AIKA 4ZTRA 4C2WA 3MJ2A 2E9UA 3RALA 4CXAA 4FIIA 3BHUA 5EOBA 4XG9A 4OGRA 5FEEA 3R63A 4U6RA 4EQMA 5IA2A 2C1AA 3K3IA 5M08A 3MB7A 3UOLA 2J5FA 2FB8A 3FSKA 2PMIA 4FV6A 3P9JA 4TT7A 3ZM9A 3I6WA 4IX3A 4XCUA 1KE6A 3L8XA 5EHYA 1GOLA 4AXAA 5GZ8A 2QQ7A 4V0GA 3UPXA 2OK1A 2XNNA 1YXTA 2XRUA 4JG8A 4RVKA 3ZO4A 2ZMDA 3O71A 3I5ZA 1V0OA 4ZY4A 4I5PA 5CS6A 3S2PA 3VNTA 1GJOA 3MS9A 1OIRA 5HGIA 4ZJVA 3OXTA 3UJGA 4FKSA 3NW5A 4IDVA 4FKTA 5IQCA 2OIBA 5IQFA 3JS2A 3QU0A 4WD5A 4BDCA 4KB8A 2X4FA 3UIUA 4H3QA 1REJA 3EMGA 3QZIA 4J1RA 5A4TA 2O0UA 2PWLA 2WQNA 1RQQA 4ITJA 3H9RA 3CD3A 4EHEA 1H8FA 1XH9A 4W4XA 3UGCA 4AOJA 5CF4A 5J7HA 3P79A 3DBEA 2PHKA 3V04A 2AYPA 1H0VA 1REKA 3CGOA 4FV8A 4CVAA 4FTTA 4GG5A 2JKQA 3QFVA 5J79A 2LGCA 4JDIA 4Y46A 5BVWA 4IBMA 4IAZA 4OUCA 2BDJA 3CBLA 5CWZA 4NM5A 4X2JA 4B8MA 2VU3A 4TWNA 5CEMA 3ZRKA 3CP9A 4RVTA 3ZLXA 4C4HA 3UPZA 3RAKA 2B52A 4WT6A 4XP0A 2X9FA 2BKKA 2UW8A 2YISA 1J7UA 2OZAA 2R3KA 4YTFA 5KMOA 5ICPA 4EHZA 2UZBA 4JL9A 4WO5A 4FIHA 3PLSA 4NL0A 1Z5MA 1SYKA 2X81A 2WPAA 3CC6A 3QX2A 4HGEA 4IIRA 4DYMA 2OSCA 4NU1A 2BALA 4O0YA 4QTCA 1YHSA 4CFNA 2WMWA 3BKBA 2GQSA 3FYKX 5JH6A 4MQ2A 3EQGA 3HV7A 3W2OA 3BRBA 4O7RA 3UIBA 4C4JA 5CU4A 3HZTA 1WBNA 4BZOA 1M2RA 4DTAA 4OTQA 3FC2A 5CEIA 4TYGA 4B8LA 1ZMWA 3CKWA 2XM8A 5JQ8A 3QCQA 4IVCA 4TNBA 4RA5A 3KU2A 5JFXA 3SG9A 4H36A 2OGVA 3HV5A 2YEXA 4FGRA 4FG8A 1XH8A 4C4IA 3IPHA 3HRBA 3IW8A 4ARKA 3S4QA 3PSBA 4R5YA 4CV9A 5K5NA 4EI4A 4IHPA 3A8WA 3EFJA 3E63A 2DS1A 3PP1A 3QZHA 2CKEA 2RKUA 4ZY6A 1QPEA 2GFSA 3U6JA 4OAVB 3P1AA 5HD4A 5EYDA 3BYVA 1TQIA 1SMHA 4XG4A 2QD9A 3CTJA 3I1AA 3OTUA 5TR6A 1OPJA 4AX8A 3ETAA 4BZNA 4D9UA 3EQHA 2DUVA 2XNMA 3QKKA 5HE3A 5IG1A 2CKQA 3L9LA 1M7QA 4DEDA 2I0EA 4I4EA 4Z3VA 5HD7A 4DGGA 3R8MA 3PJCA 3GB2A 4RJ6A 3UMWA 5HNIX 1SM2A 3UQGA 3VUGA 1T46A 3ALOA 5CY3A 1ZXEA 4Q9SA 4ENYA 2V62A 1H00A 4X2GA 4IZAA 2JC6A 4A9YA 1Q4LA 4ZTQA 4BF2A 5L6PA 3REPA 4H05A 1Q97A 4JIKA 4IZ7A 2C0OA 2HENA 4EQCA 3NYNA 4ZIMA 4FT5A 3R7VA 2X6DA 3Q4ZA 3EWHA 5E8UA 3Q3BA 5HG7A 2PVKA 4OTWA 3LXLA 1ZRZA 3QWKA 2PTKA 5AUYA 5BUEA 1NVRA 3C9WA 5AUVA 4JQEA 3TKUA 4DG2E 5C4KA 1ZYLA 2JIUA 3FI8A 1CMKE 1HOWA 2EU9A 3LFEA 3QBNA 5EI6A 5GNKA 2JDVA 2QLUA 1YW2A 4O6EA 5TKDA 3MESA 1G8SA 1QPJA 3MVJA 1UVRA 3E87A 3F6XA 4CQGA 3VS1A 5EOLA 4EH2A 3UVQA 2J7TA 4LRJA 3Q32A 4QYGA 3AD4A 2W5HA 1WCCA 4U80A 4YHTA 1JOWB 3PZEA 1YVJA 2X4ZA 4YUQA 4RWLA 2OJGA 3QZGA 4FTAA 2C3KA 4QPMA 2XCHA 4ZXTA 2HOGA 3QTXA 2YCRA 4FVQA 2ONLA 5EW9A 4CNHA 4DBXA 2ZMCA 1BL6A 5HEZA 1S9IA 2HW7A 5EM8A 3DT1A 2F2CB 3O8UA 5E8VA 4Y73A 3RP9A 4ACCA 3U54A 1NT2A 3R1YA 4MQ1A 3QRJA 2C6TA 1YRPA 4RJ5A 3RPVA 2XNOA 4IZYA 1J7LA 5CVHA 2GNFA 1OECA 4JG7A 2A2AA 2EUFB 4K1BA 4WNPA 3NYXA 4V05A 1UNGA 4EZ3A 1H1PA 3QYZA 1U4DA 4AA4A 4MKCA 2VTPA 4AZVA 4C58A 3P08A 5BYYA 1PXPA 4HCUA 2JLDA 2EWAA 1OB3A 2HCKA 2XBJA 5IQDA 4QMXA 2VTAA 1J91A 4IZ5A 3DK3A 2GS6A 2CJMA 4P7EA 1H01A 5EYCA 3SXRA 5CANA 3Q5IA 1WFCA 3OMVA 3KRRA 2GNHA 3UO5A 4FSMA 5C8MA 4X2NA 2RG6A 2JIIA 3BI6A 4I1ZA 3VUIA 4FKRA 4CTBA 4GVAA 2GNJA 4ITHA 2BILB 2WXVA 2XP2A 3CE3A 1SNXA 3SV0A 4RVLA 2RFDA 4M68A 2QU6A 4YZBA 5GIOE 1JSUA 1FPUA 1ZWSA 2GHLA 3WI6A 3QQHA 2C3LA 4E3CA 4MWHA 4XHKB 3RPSA 1ZYCA 1UWHA 2O5KA 4ANOA 3PXYA 4FOBA 3KQ7A 4XEYA 3VJOA 1LP4A 3QYWA 4JJRA 5HTCA 4DGLC 3IKAA 5F9EA 4ZZNA 3F2NA 4U9AA 3QAME 3I4BA 2FGIA 1GIHA 3O0GA 4JS8A 2CCIA 3GCQA 3RM7A 4HW7A 2Q0BA 3ZFMA 2JIVA 2F4JA 3LQ5A 4KIKB 1ZMVA 3NIEA 4XV3A 3VULA 5IF1A 4TN6A 2OXXA 2YM3A 4AP7A 3EKNA 2A0CX 4ZY5A 4KS8A 3WF8A 1FVRA 1RW8A 3MBLA 4OTPA 3QRUA 3KF7A 1Q8TA 2O64A 2FSLX 3BBTB 4GW8A 5CX9A 4HYHA 5AX9A 5ETAA 1YOJA 3H9FA 4WNMA 4LL5A 1L3RE 3VRZA 2VN9A 4RZVA 3RZFA 4F0GA 1RE8A 5ETFA 4A9TA 5KZ0A 3LLTA 4UV0A 3VF9A 3EKKA 4JDKA 3W2SA 4MXCA 4FTMA 4N70A 4W9WA 4IWPA 3RMFA 3IO7A 4DFLA 5AR5A 5DRDA 3SG8A 2C68A 3D5WA 1OIUA 4K9YA 4D1SA 4ZZMA 2ZVAA 3G51A 4RFMA 4XRLA 2J51A 4GJ2A 3QD0A 1GZNA 4UMRA 4PPBA 4XYFA 4E6QA 4F65A 1I09A 3LW0A 4EOOA 2BFXA 2R3LA 3E5AA 4U43A 1PMVA 4FNWA 4KSQA 4S33A 2RF9A 2YWVA 4KINA 2VRXA 3OT3A 4EH8A 4DH5A 3EYGA 3OCTA 4RWJA 4IM3A 4ZTHA 1R0EA 5C8KA 4PDSA 4UN0C 3KN6A 2IVSA 2WEIA 5CASA 2IVTA 1VYZA 3DBCA 3RBWA 5KUPA 1PXJA 1Y8GA 2WTVA 3R8LA 1H1RA 4BFMA 4PP7A 2WKMA 2BRGA 4CFVA 4XX9A 3IONA 3R71A 4LGGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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