1QFEA

The structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase from salmonella typhi
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVSRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords PROTEIN (3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE)
publication title The two types of 3-dehydroquinase have distinct structures but catalyze the same overall reaction.
pubmed doi rcsb
total genus 89
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 1999-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qfeA00
5EYWA 4EF8A 3NA8A 1C29A 1EP1A 1KM4A 5AYYA 3HG2A 2YFNA 1PCKA 2B4GA 3PC0A 2J9ZA 3W84A 5L6UA 2QAFA 3L9CA 1QDSA 3ABQA 4ORMA 3W2LA 3R8RA 3C2VA 4EVZA 4LVAA 4JTKA 5DBTA 3C0JA 4BI7A 2NX9A 3CHVA 5KMYA 3BLEA 1WX0A 4IMGA 3ZWTA 4E38A 2Q8ZA 4WXYA 1XFBA 2HS6A 5LZLA 3LXBA 3NL2A 3WFAA 2GJNA 2ZZ2A 2QDHA 3MW7A 4K7VA 4BFAA 2QCDA 4DBDA 4LVGA 5CGQA 4OQVA 1I2RA 2R94A 3IVUA 3NQMA 4JX6A 1KW1A 3R89A 1O60A 4HNNA 1UJPA 2XFWA 4NQ1A 4GNJA 1ME7A 2DZXA 3TJXA 1K8ZA 2C1HA 2CLFA 3BLFA 1S5TA 3HIJA 5CPOA 4I7UA 5J5RA 3P67A 3PS7A 1EWEA 5LGZA 1KM1A 1FWNA 3B4UA 2DZPA 1NF7A 1YXYA 1DBTA 3C6CA 3R5EA 2PRHA 3N14A 5F4SA 1JVNA 4K8HA 1LRTA 1BTMA 4PFMA 3PWAA 1B57A 4O50A 4IMFA 2ZBTA 1J5TA 1S3HA 3TAKA 1QR7A 3HPSA 2ZRXA 4UTWC 1J2WA 5HQEA 2F84A 4MKNA 5F2GA 3PSVA 5AHIA 5FEZA 4LTSA 3A5VA 2WO5A 1IXOA 2Y88A 1YLVA 2Y7FA 3IVSA 3IVTA 5FF7A 5BW6A 1A5SA 1QCWA 3GNNA 4ML9A 4IWWA 4IX2A 1S5VA 4MY8A 3WJZA 4MIMA 3LHUA 4O4VA 4FIQA 4UIOA 5AC7A 3R2GA 1JUEA 2DJLA 3BG3A 3KRZA 4ZQRA 4HIBA 2ZYFA 4UTKA 4JTEA 2C18A 5HWMA 1ZFJA 3UWVA 1JRBA 4KFNA 1TPWA 4TO8A 3UXAA 4AHOA 4YLWA 4IOTA 5CZSA 5D2YA 3TX9A 3P84A 2BZNA 1T99A 1ZALA 1RQBA 3L0NA 3RU6A 3V1PA 4A29A 3EWYA 5K9CA 4BI5A 4KWVA 3CEPA 1DKWA 3F1QA 2BTMA 2E5BA 2YSWA 2B7NA 3QW4B 1K7FA 1TTQA 1EPXA 3BG5A 5I3JA 2QCMA 5HWJA 1DL3A 1G4SA 4NZJA 3NPXA 2OX1A 1KM5A 4P61A 3OA3A 4X9SA 4PH6A 3RFAA 3TW7A 3NL6A 4WXZA 4FNRA 1DOSA 3S1UA 1WOBA 1PIIA 3LRLA 4WX2A 1EUNA 5FEPA 1Q6OA 3S8HA 3IEBA 3SZ8A 3O05A 2G95A 1TPC1 3LBCA 2H3BA 3PF3A 2WSRA 2CLLA 5FF3A 5KTLA 3OBKA 1EA0A 2CZFA 2NUYA 2VELA 1I8JA 3SW6A 1GVFA 5K4ZA 3MWAA 3QYQA 5F2LA 1XL9A 3LDVA 1WOAA 5EY5A 3RF9A 1DHPA 2ZFAA 3P80A 2QCDB 2NX3A 5CSSA 4FX7A 1KBJA 3E0IA 3KX6A 1QPQA 4O1DA 1W0MA 1OFPA 3UWZA 4Y96A 4Z1AA 3GR7A 4HSNA 3DENA 3VNDA 3WK3A 5AC6A 1EUAA 4M6PA 3NQDA 4JEQA 4JD4A 3LB0A 2TSYA 3NQGA 4CNNA 4Y6GA 1K02A 3BV4A 2DZUA 3TAOA 2GPTA 1K3UA 3LRKA 2C15A 1LM1A 5FEXA 1H7NA 1D3HA 4OWGA 5H2ZA 1TPUA 2FQIA 1U5JA 2O7QA 2P1FA 1WV2A 1PE1A 3LCXA 3RLVA 2A1YA 2ZZ3A 1JRCA 3V75A 1X6UA 1JQVA 3KRUA 3BARA 5E0KA 1VCVA 5DN1A 4PC8A 3GAKA 1TV5A 2VEIA 4JTGA 3S42A 3THQA 2OT1A 1OFQA 1CX9A 3QFEA 4A2RA 3STEA 3W07A 3FKKA 5MHBA 2I14A 3NR0A 2GJLA 3T7VA 1R2RA 1R30A 3QRHA 4G1KA 5T26A 4N6FA 3LCHA 3PULA 4RX0A 1K8XA 1QFEA 2X1TA 4GC4A 4LC8A 3NPVA 1EB3A 3GB6A 4CCCA 1ZHAA 5D2VA 3LV5A 3E12A 3HPZA 3CIWA 4AMAA 4RXFA 3IIPA 2RDWA 3EX4A 3FYPA 3OHIA 5A5WA 1YPIA 3N9RA 3W76A 1RV8A 4S1FA 1TIMA 1D9EA 2ZTKA 4LS1A 4OV4A 2DORA 5AYZA 2GQ8A 2C3ZA 2VXNA 4QNWA 1THFD 3GDTA 2V81A 4AB4A 2CLIA 3KVMA 3M5VA 5D33A 4NU7A 1L9WA 1SFLA 2QJGA 1KM2A 2IQTA 3CTLA 4DEFA 3IGUA 4FXRA 1B4KA 2CLKA 4JIQA 3FLUA 3M7WA 4DF1A 5LNVA 1FCQA 4AXKA 4OE7A 3FFSA 4JGDA 2ATSA 1FDJA 1V7YA 5G5IA 1OK4A 3W1PA 2ZZ5A 4P2VA 3UZJA 3QMSA 1DV7A 1NFBA 4JYDA 4LV9A 4MYAA 1Q6LA 4ZQCA 3DBPA 5HINA 3S6DA 3MO7A 1TQXA 1VQTA 3P81A 1JCJA 4AF0A 5BMWA 3BW3A 3PBYA 2ZA3A 3P62A 4H4IA 4BK9A 3W7NA 4UTTA 5C55A 3W7RA 2OT0A 2GVJA 4XZ9A 1VHNA 1Z42A 5D03A 2CZEA 3G1FA 3SGZA 3PAJA 5HUOA 2RFGA 2JK2A 1EP3A 2OCZA 1UUMA 2FPVA 2YW3A 3M5ZA 1IIGA 3BK0A 2Y6ZA 4QQ3A 1FX6A 3L5MA 2ZCGA 3M5YA 3OVPA 4MFDA 1EIXA 5HWNA 2TRSA 4KFOA 3DH7A 4O54A 3L67A 1KFJA 3IIVA 4GUIA 1FY6A 4MZYA 4DO4A 3W9ZA 3N73A 2CWNA 4NXSA 2RDUA 3WK2A 3WK0A 3LTSA 3KVKA 4JR5A 2QDGA 1L6WA 2NXGA 4WY0F 3MP5A 1OX4A 4BF9A 3PG9A 1U83A 2Y85A 4IMDA 3ABRA 1K7XA 1XBVA 1L6SA 1RQEA 3WK1A 3HMJG 4O18A 4LT9A 1TTPA 3NDOA 4ZQPA 3ZS4A 2P10A 4DXVA 2YZRA 1KM0A 4M7TA 4UR8A 3HG3A 2ALDA 1FWRA 4A22A 1LRNA 3KVLA 3NXFA 3S5NA 4WJEA 3QM3A 1F76A 1KA9F 1GYLA 4GFSA 3NG3A 3O6YX 1H7OA 2ZZ6A 3KFTA 4JY9A 3QZEA 5DXXA 1FCUA 3NPWA 4AEOA 3NL5A 2ZRYA 1VH7A 5EMUA 3CWOX 3EB2A 4YWIA 3NNTA 2J9XA 4LC6A 3I7SA 4K7YA 2CLOA 4JTIA 1F6KA 4N9DA 1YTDA 1OYAA 3TMQA 1JUBA 1PS9A 3HGRA 1TRDA 4LY8A 4KFPA 5DLCA 5IBXC 2H6RA 4WOQA 3W7DA 2Y61A 1LLZA 2JKPA 3SECA 1W1ZA 4O16A 1GEQA 4O1AA 3G1HA 3L0GA 1TPFA 1EP2A 3LTPA 4K37A 5FF2A 3TROA 1GVRA 5D04C 1ZJIA 2YW4A 3G0UA 2HTMA 1H62A 5DBUA 3ZWSA 1W5QA 3NQCA 1OHLA 1X8FA 3UQNA 2V5BA 1LOSA 4UMAA 3IIXA 2VFFA 2AQWA 1BWLA 3USBA 1W5OA 2A5HA 4UFMA 5G4EA 1G7VA 3W1RA 4B5NA 3W74A 2H8ZA 1SQ7A 4NVTA 4JX4A 2XN2A 2EHHA 4RK8A 3C2RA 1SW0A 3QSTA 1M6JA 2YPIA 3EKLA 3W1XA 3LRMA 3TV8A 3P5YA 1DQWA 4NNBA 4N2YA 4AF0B 2H90A 1GJPA 1VHCA 4JYEA 1FQ0A 3LCGA 4RLIA 3W71A 1OF6A 3BPWA 3CLMA 4M5PA 2E09A 3W2KA 2FLIA 2V2DA 2FPTA 4MFEA 5A8GA 5K3VA 5C54A 4LVBA 3T78A 5CPMA 1XXXA 3L5LA 1PV8A 5GVJA 4ZVJA 2QCFA 1A50A 1YDOA 5G2IA 1NEYA 3QF0A 1LBFA 3C8FA 4JX5A 4XKYA 2EPHA 4JIPA 1OFOA 1ML1A 2NXHA 2PURA 6TIMA 1L2UA 1XDMA 2Y7DA 1M7OA 1WA3A 3CQ0A 1PHQA 2VC6A 3S1WA 2J6XA 2JGYA 1FXPA 1SO4A 4O13A 4CCEA 1I2PA 3U2OA 4UTWA 1VJIA 4LRSA 4MVAA 1SSDA 1O4UA 1XUUA 1JR1A 1OX4B 1LROA 2V30A 1YXDA 3B03A 4OT7A 1OF8A 2ZQ0A 4XTDA 3DHDA 3BGGA 3B04A 5KZEA 2CU0A 4CQ9A 3IIZA 4O4WA 4ZQMA 5LHFA 1TPB1 4AH7A 3HGOA 3LCWA 3W7CA 3DFSA 2YDAA 2Q3OA 2JGQA 4O1CA 3INPA 5BNKA 3W1AA 4NNCA 2D73A 4Y90A 4Q32A 5EA9A 1Y0EA 1PCWA 1TCDA 3C4UA 4O8RA 5IM51 3W2JA 2C19A 3HJZA 3G1XA 3F4NA 4RZ6A 5K7JA 1BWKA 1RPXA 1YADA 4TMCA 1ZY9A 3LCFA 1KV5A 4JTLA 4XQ6A 1O94A 3TA6A 3W2UA 4N6EA 5AHLA 3OEXA 3K30A 4XWUA 4TX9A 4MLRA 3NQ6A 3HGJA 4HNVA 3QW3A 3S5YA 4QJ1A 3H55A 5HULA 5LNSA 3M9YA 4NXKA 1JUKA 1LTDA 4NJKA 3EX6A 3DKLA 1QPRA 4R33A 1UUOA 2W0UA 4GE8A 2Q8LA 2E6DA 2QCEA 5J5DA 2FFCA 1OABA 1F05A 5AHEA 3C56A 1VRDA 2EF9A 3LLDA 3TFCA 2VFDA 4M6QA 4RZ5A 3W1LA 1OG0A 4TIMA 2C13A 4IPIA 5CPLA 2OJPA 3CU2A 4A3UA 2G96A 4UCGA 5AYXA 1K8YA 1G6CA 1H7RA 3PVFA 5LGXA 3BVJA 3STFA 5AB3A 4UTHA 2VEKA 3PY2A 4POCA 1Z41A 5K2ZA 4ADSA 4PEKA 4ONVA 3W73A 1AW5A 3VFLA 2ABBA 1WBJA 4QSHA 4FNTA 4TR9A 3W7MA 2ZRVA 1H1ZA 2HMCA 5BRBA 3BG9A 5CZ0A 1I2QA 2B7PA 3EX2A 1LORA 3FOKA 5HR6A 2PE4A 4EIVA 3NQVA 3STGA 3NOEA 3P5ZA 1TPEA 2KZHA 4UC5A 1EWDA 4K38A 3QQ1A 1KM3A 5HMSA 3EXRA 4GUFA 4H3DA 2X1RA 3LOTA 4C1LA 4Z1BA 5EL1A 1TPH1 3TUUA 2QKFA 4BR1A 2X1SA 3NAVA 5BMXA 3PB2A 2H8XA 4LVFA 4O0ZA 1SZGA 1T8XA 1ZAHA 3TQ0A 2BLEA 4NJIA 2R8WA 5F4WA 3NZRA 4XKYB 1KTCA 1P0KA 3O8AA 4M6VA 3PUDA 3MHFA 4ADTA 2A6LA 1AL7A 1KFBA 1TSIA 3FJLA 3U6WA 1W5MA 3HBLA 6ALDA 4WQ6A 3TXZA 2X1UA 1VC4A 5CSRA 3O15A 5DCDA 5CKSA 2V82A 3I68A 3W7EA 1Q6QA 1XBYA 3PB0A 3CB8A 2FJKA 1IXNA 1H5YA 2A85A 2CW6A 3PBVA 2C6QA 5FI8A 4IPJA 2NLIA 4W9TA 5G2HA 4FNUA 1I45A 1WQ5A 4OGZA 3W7KA 4N4PA 1KFKA 3MI3A 1MXSA 4DO5A 4EOUA 2RH9A 4JY8A 2VFEA 4YMZA 1VYSX 1XI3A 4H6KA 5EPDA 4IQLA 3OIXA 2HSAA 4LVDA 2WPBA 5AHMA 1V5XA 4DBEA 2YXGA 4LNYA 5HNRA 1B9BA 3M0ZA 5CZJA 1SO3A 4CCDA 3UNDA 2FDSA 3SGUA 2A2IA 3LV6A 3B0UX 1W5PA 3UY8A 3W1MA 3UYCA 3P74A 2Y70A 4DF0A 4FB7A 3NM1A 1ICQA 2FB3A 2WJZA 3Q94A 4RXGA 5DELA 1DJQA 3HO8A 3KRSA 5D2TA 4JNMA 1LLWA 4FXSA 4ZZ9A 1F5ZA 1UBSA 2PCQA 1UCWA 4XBSA 4YXGA 4E2BA 3O06A 3LHZA 3DFNA 1KBIA 1GOXA 3HGSA 4LV4A 1OJXA 3GKAA 2JKEA 5D05A 4LW7A 1LOQA 1YDNA 3W7HA 2GUUA 3GXPA 3DXIA 1HO1A 2YCEA 4M7SA 1QO5A 3P61A 1H61A 1RD5A 3EXSA 4NUWA 3BW2A 4MUZA 4AHPA 2E77A 1HO4A 1KFEA 3G3MA 3GK0A 4PTNA 5AC8A 1F73A 1F7BA 1WXJA 3EWUA 4NJGA 2G5WA 3W7IA 1W3IA 3UWUA 3LBMA 1D3GA 2DZVA 3B0PA 4JTFA 1GVOA 4UFKA 1M7PA 2R14A 4OV9A 3TR2A 4RKAA 2NXIA 3T55A 5LNUA 3MJYA 2YFOA 1AW1A 3ABSA 3HQ1A 1TB3A 1L6YA 3N2MA 1M5WA 2J9YA 2JBMA 1GVSA 1WAUA 3WJXA 4O14A 3UPBA 1AK5A 3I7RA 4ICNA 3PG8A 4TMBA 3MYPA 1QWGA 1X7FA 4UTJA 1XBZA 2LLEA 3FS2A 4DPQA 2CLHA 3KHJA 3O6DA 3MI6A 5LSMA 3BO9A 1ADOA 1W5NA 3L65A 3VCRA 3IGSA 4J9JA 1AMKA 4LWWA 1P1XA 3MBFA 4R34A 1SZFA 4O10A 4X22A 1B3OA 1VYRA 3G1DA 4BWLA 4ORIA 5AHFA 5K9DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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