1QI0A

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in the tetragonal crystal form in complex with cellobiose
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE B
publication title Insights into ligand-induced conformational change in Cel5A from Bacillus agaradhaerens revealed by a catalytically active crystal form.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 120
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1999-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qi0A00
4AZIA 2WCGA 2XVLA 4PBGA 4UQCA 2WCSA 1NWSA 2BHZA 1E55A 1AVAA 4NSBA 2E9BA 4V2XA 1Q6EA 3CZEA 1E3ZA 3SUVA 4CVWA 1E0VA 1QBBA 4TXEA 1VIWA 1CPUA 2CKSA 5IHSA 4WSKA 1C8QA 1KXVA 2VMFA 4KMQA 3KWXA 2GDUA 4YPJA 4LGXA 2OSXA 3VUPA 3AS2A 8A3HA 3CH9A 3WSUA 1LG2A 2JF7A 3AIBA 5I5RA 2VL4A 5CGMA 2D24A 5HXMA 2J62A 4UFHA 2G41A 4AC1X 2FGLA 2D3LA 4EK7A 1HX0A 4PTXA 1H0GA 2PWGA 5I78A 1UA3A 3PTMA 2WZHA 2OSWA 5E0FA 4OZOA 4UZSA 5IHRA 3L4WA 1MWOA 2PC8A 4AEFA 4XUYA 1KQYA 5JIWA 4PMQA 4LYPA 1X6NA 1QNPA 1E6PA 4UOQA 2W4XA 2IUZA 1A3HA 2ZE0A 2VQTA 1C90A 4U2ZA 2WWDA 4CVUA 1GOOA 4ZE4A 1EQPA 4XZWA 2WZIA 4B15A 1UA7A 1HNYA 1H41A 3OB8A 3VDBA 3WD4A 2OSYA 2DSZA 3K8LA 1XV8A 4OIFA 2WHKA 3EBVA 1WDSA 1WZKA 1V0NA 1QBAA 1MQRA 3WY1A 3VO0A 5CG0A 1V3JA 3UESA 1HP5A 2WKLA 3RCNA 1PIFA 1JDDA 5E9AA 3W27A 1R7AA 1E5NA 3BC9A 4J3VA 1WZAA 4L4OA 3AZTA 3OLGA 2VZUA 2W63A 1E0WA 3FW6A 3VDAA 3SCOA 1NOUA 4B9ZA 1AQ0A 3IJ7A 3IK2A 2XGBA 3VD5A 2PBGA 2QHAA 3CHDA 4JFUA 3OGVA 5E09A 1UQYA 2BXZA 3WDIA 3N1AA 4LXFA 4GI9A 2IXVA 5BXSA 1EH9A 4HP5A 3OLEA 3BAWA 4P8XA 4ZENA 5LA0A 3TTYA 3VGGA 2WHLA 3WF3A 3BSHA 2CIPA 1JAEA 3AI0A 1XH1A 3VU2A 1SR0A 5A2CA 3W82A 2O9PA 4MPKA 1E71M 3POCA 3OZPA 1BSIA 2WWCA 3GTNA 1GOIA 1GOQA 3E1F1 4CU6A 3VD4A 2ZX9A 3MSDA 3SCWA 4P8WA 3GBEA 4Z2LA 3CUHA 3VDHA 3BLPX 1W9XA 4OBRA 3L4YA 4Z2JA 2DPEA 2DSVA 1XD1A 1GJWA 1TVPA 1JYNA 4R27A 4CD4A 1K9DA 1E72M 4J27A 5DF0A 1VF8A 3FAXA 1C3FA 7TAAA 1UYQA 1JF5A 2V5DA 2XWDA 1UD3A 3PHAA 3ZOAA 1W1PA 1KR0A 4H04A 2ESCA 2YLLA 4FF5A 5BWFA 4GQRA 1C92A 1OSEA 5C71A 1E0XA 2V3GA 5DEZA 4PMXA 1ZB5A 4AZBA 5DO8A 2VZVA 3VM5A 2EJ1A 1E70M 3JUGA 3WNPA 2GJXB 4HZ8A 1LF1A 3MV11 5D8ZA 1SFSA 2WC4A 1I75A 3AIVA 2G4FA 3GXDA 4W8LA 4M81A 1DHKA 2WLYA 3VGEA 1LJYA 5A2BA 1JGIA 4PSPA 4D6IA 4PTWA 5I23A 2QMJA 3WQ6A 1KWKA 1ZBKA 1IZJA 3VD9A 3TONA 3VGBA 3PTQA 2X0HA 1JDCA 4QCEA 2VVSA 2VR4A 4PRWA 4IUGA 4X0NA 4UCFA 1BTCA 1CEOA 3OZOA 3VX0A 4UQBA 3I3DA 3VDCA 1PX4A 1KXTA 4GXPA 1CLVA 5JUVA 2OWXA 3NYDA 1PX8A 1VFUA 4TVCA 5A6LA 3K46A 5IFTA 5AYIA 4JHOA 2V38A 2J8FA 2CHOA 4Q22A 3AHXA 3WNMA 2XM1A 4JAWA 3MUIA 5A6SA 1FH9A 3CHEA 3CO4A 7CGTA 1WDRA 1MFVA 2X0YA 4KRUA 1ISVA 2WXDM 1V6WA 1QHOA 4QP0A 3M6DA 1V3LA 4XV0A 2WYSA 1K9TA 2YJQA 4W85A 2VX5A 1GHRA 3IAQA 3NDZA 1JYWA 1EO5A 3OG2A 4OOZA 4DUXA 1PZ3A 3FN9A 4AMCA 1J01A 4JFWA 3WH6A 5CPSA 4R5EA 1B3VA 5IDIA 3SCPA 5IFPA 1V0KA 1V0LA 2WAGA 2EXOA 3LPFA 5HOSA 3CZKA 4HA3A 1W3LA 5JBDA 4ATWA 1E56A 1XRVA 2VZOA 3M46A 5EBAA 4AD4A 4ZXOA 4Z2IA 2VO5A 3AYRA 2J78A 1E1FA 5DT7A 4EKJA 2XUCA 3EDJA 1MYRA 1PZ2A 3IANA 1ZL1A 2XJ7A 2BHUA 4NZCA 1H5VA 1CNVA 4AD1A 2JF6A 3GZAA 3SCUA 1ZJBA 1E6RA 1WDQA 2WZEA 4HOWA 4ACYA 1HXJA 1PPIA 3UG4A 3ARVA 5DT5A 2J74A 1OGGA 4W8BA 5BXTA 1LL6A 1JZ3A 3L2MA 2YLAA 1B30A 2EPLX 5FCZA 4ACZB 3A3HA 4W5ZA 1J0YA 1JF6A 3L4UA 4HU0A 4UR9A 4YHGA 2E9MA 1JDAA 4JL1A 4M29A 1TCMA 2FHCA 4H7VA 1UQZA 2XVGA 3HU7A 2WBGA 3CZGA 1TA3B 4M80A 3SIMA 1ISYA 4DM1A 5CJ5A 2W67A 5AC4A 2CBIA 1V6VA 3HN3A 4TX8A 4BF7A 4MTVA 2W91A 3ARQA 3F4VA 4QCFA 4D72A 4J3UA 1N82A 1MQPA 2QMKA 2WVTA 1B3YA 2YL8A 1WNOA 4RE3A 4XX6A 5A8QA 1H2JA 3BCFA 1V6XA 1UKPA 3QHOA 4UFLA 2EO7A 5CQ1A 1E5JA 1H11A 3EMZA 4OOUA 1GNXA 5D8WA 5A8OA 3MMUA 1V3HA 1R87A 1CYGA 1WPCA 1OM0A 4AWEA 3SCNA 1OWQA 1GQJA 2WVVB 2D3NA 5BYWA 2Q8XA 5A69A 1BYAA 1XYFA 3W6MA 4TVDA 3BAJA 1NWRA 1EHAA 2OYMA 1XH0A 1H0IA 4WKAA 1LLOA 4CCCA 1BPLB 3VM7A 3CZJA 4P7QA 3VIHA 2C7FA 2VOTA 3OA5A 3WUGA 1V6UA 3ZQ9A 4J7RA 1F4AA 1E15A 2WLZA 1BVNP 4MDPA 2A3BA 1MW1A 4U3AA 4CGTA 3AIRA 4D6CA 1HP4A 4W86A 1UZ1A 3ZT6A 3U5YA 4S3KA 3W26A 2QLYA 4JCMA 1HJXA 4ZFMA 3AHZA 3KL0A 2HVMA 1UKTA 2QPSA 1D3CA 2Y2WA 4A4AA 4XB3A 3TTOA 1GORA 3WD2A 2DSWA 3AXHA 3WMCA 2G8ZA 2BY0A 1OB0A 1PJ9A 5A8NA 1NARA 2GFTA 3ZT5A 3WQVA 1J0KA 2VRKA 2BFGA 5E70A 5FKYA 4AZ6A 4JL2A 2YIHA 3HMCA 2VNCA 3LPOA 3WH8A 4GIAA 1I1XA 3AOFA 1UR8A 2ZXBA 1FH8A 1HVXA 3VD7A 2HISA 3GDBA 4YN5A 4KWUA 4AIOA 4MNJA 3TTQA 1TUXA 4AD5A 4WF7A 4J3XA 1XCXA 4IISA 2D0HA 1UR0A 3BAKA 3J7HA 1CIUA 1HKKA 2WMIB 2BS9A 4DWSB 3W24A 3WDHA 1W9UA 2YL6A 4S3JA 4FLOA 5CLWA 4WIWA 3UR7A 2GK1A 2FGZA 4HOXA 2D23A 6A3HA 2BY3A 5CPQA 3T08A 2VCCA 1JIBA 3CPUA 3A4WA 1OBAA 1VRXA 5EB8A 2VT0A 1CDGA 1KGUA 2CBVA 2DDXA 1B3ZA 3A6OA 3PTKA 4HMEA 1CLXA 5TD4A 1AQMA 5EFFA 1BG9A 2UWFA 1CGVA 2UY3A 5JBEA 1Q6FA 3ARSA 2O92A 4AW7A 2W61A 5LA2A 2AOSA 3OGRA 1VJZA 2JEQA 3TA9A 1XSKA 1H4PA 3L4VA 4GI8A 5D9PA 4N42A 1G94A 1EHNA 1MQQA 2WPGA 2CCRA 5ABFB 1ZBVA 3UETA 1HIZA 2EPKX 2X8RA 5CXPA 3ZR5A 2W62A 1EIBA 4P7RA 3WDPP 3PZOA 3FY1A 1UWSA 1PIGA 1G1YA 1UD5A 4CD8A 4CU8A 4LYRA 3O2LA 4HMCA 3CZ8A 1BGGA 1JI1A 4AD2A 2CKRA 3WF0A 1BYBA 3U57A 1R86A 2XPKA 4P8UA 1WZLA 4KRTA 1V03A 5LYRA 2DT3A 3B9AA 2C0HA 2WVUA 4D71A 2V3EA 3WF4A 3MMDA 1HL8A 1VBUA 1JZ6A 2QF8A 2WMFA 1J0HA 3THDA 2XSBA 5FOOA 1L8NA 2J47A 1E9LA 1E40A 5CSUA 1VFOA 3GYCA 4HPGA 3WEMA 3VIIA 2A3CA 1UR2A 5BROA 4J3WA 4GZEA 4QLLA 3PZUA 1XSIA 3WNOA 3CUFA 1C8XA 1VEPA 4UOJA 1VBRA 2VZSA 4C7GA 2PB1A 3W37A 1HKMA 2J77A 4TTUA 1VEOA 2EBNA 2ZUTA 1U30A 1ZU8A 1K9FA 2D2OA 4A3HA 1C93A 3ZSTA 2E8ZA 1TG7A 2PBOA 5I24A 2BVDA 2VX4A 4IM4A 1WE5A 2XIBA 2D0GA 3AIWA 4ATDA 2BXYA 2WHMA 3GNRA 3W4RA 4H41A 4WK9A 1I1WA 4PMDA 3HJEA 3RM4A 3ZO9A 4CN4A 2AMGA 4DUWA 2CETA 1QI2A 2E9LA 4GINA 3T0DA 4F9DA 4IPNB 4M56A 1UUQA 2F61A 1Q4NX 5I77A 1W3JA 1W9PA 4U5IA 3OBAA 1CGYA 4GZJA 4H8UA 3TP4A 1QI0A 1JD7A 2C8NA 1JD9A 2EPMX 3CIVA 2A3HA 2QV4A 3RMEA 2ZXQA 3A4AA 3PZQA 1UWQA 2VTFA 1CXHA 1NM9A 2VCAA 2WMHA 3ECQA 4CU7A 1UD8A 3BSGA 2ZX8A 4RE2A 2VQUA 2PWHA 3WUEA 4AZ7A 5I6SA 4F8XA 2YDRA 5JBFA 1HVQA 3T0AA 5A6MA 3PZVA 1XHGA 3GXFA 1G5AA 4Z2HA 1V6YA 1GUVA 4W89A 4ML4A 3SCRA 4MDOA 4CUCA 3AYSA 3M7SA 3RDKA 2VR5A 3N15A 1WAWA 1EDQA 2ZUVA 2VURA 1W2VA 3WF2A 1JZ4A 2WHJA 4KGJA 1QNSA 1MFUA 2TAAA 3WD1A 2ZUSA 3U5UA 1RD6A 3WBAA 4AZ5A 4X9YA 4FLSA 3W25A 1X6LA 1G9HA 3DHPA 1M53A 2GJPA 3SUSA 1KCLA 3K8MA 1QW8A 8CGTA 4LYQA 1LL7A 4UQAA 2O9RA 4X0VA 3VIOA 2BY2A 1XSJA 4DM2A 2DH3A 3W28A 2WMGA 4PCTA 1R85A 3EMQA 1DTUA 4NRSA 5FL1A 1Q6DA 3DYMA 1W9BM 2JEPA 1E6QM 1S46A 4UQDA 1IT0A 4DUVA 2DQXA 1US2A 3DECA 3UR8A 4C7DA 3CUGA 2RGMA 3WUBA 3VNYA 1VJSA 2J75A 2EEXA 1QI5A 2YBUA 1QOXA 3CZLA 1WZMA 5GNZA 1GQKA 3SCQA 2YBTA 3W81A 3BCDA 2J7FA 4PSRA 3RM8A 3WD0A 3ZT7A 3RM9A 1GCYA 4W5UA 4BQ4A 1UH4A 4PCSA 3WFZA 1E3XA 2PWFA 3U7VA 1XH2A 5E6ZA 1KFWA 1E43A 4N0RA 3VILA 5CZKA 1MXGA 2WVSA 1OIFA 1QI4A 4EAMA 5A6JA 3ZR6A 3W38A 1CXLA 3LPGA 1KB3A 1NOFA 1PX3A 4CN6A 2XVPA 2XSAA 3KL5A 1ITXA 1W9DM 1JNEA 3AMGA 2DSUA 3A4XA 1D7FA 3WQ4A 2CYGA 1EO7A 3QGVA 5AY7A 3VGHA 4JCLA 3THCA 4MNKA 1JYVA 1UWTA 3DYOA 4CCDA 3LMYA 1HL9A 4URIA 2FHFA 4JFVA 3UEQA 5LA1A 5DMYA 3AICA 4JFTA 3SURA 1FFQA 4FMVA 1QVBA 3LPPA 5I79A 2UY2A 1U2YA 1HJSA 3ARPA 3ALGA 3ZJ7A 3T2PA 2ZWZA 2ZUNA 2YL5A 3SUUA 3N11A 5EMYA 3B9EA 3L4XA 1DWAM 3OGSA 3WH9A 4M1RA 4UFIA 3MS8A 4NRRA 2NT0A 4MAZA 2V5CA 2ZIDA 1UKSA 3AISA 4V27A 2XGIA 3SUWA 1ITCA 3VIPA 2FHBA 3OLDA 3OIHA 1ISXA 1JL8A 4TVUA 4M8UA 1V02A 3GXIA 1OD0A 3AS0A 2Y8KA 4W7VA 2WKGA 1ECEA 4WJXA 2CESA 4ZXLA 4TOQA 2XHYA 4F79A 4F66A 3O9NA 3POHA 3VOCA 1C7TA 2E3ZA 3TTSA 1G0CA 1PBGA 5AC5A 2GVYA 3BMWA 4QAWA 2EPOA 1E1EA 3SCTA 4UFMA 1ISZA 1UR9A 3GM8A 3PZGA 5D9OA 1DEDA 4AIUA 4PEEA 2YDSA 1UR1A 3MO4A 5C70A 1EGZA 2CERA 2D1ZA 1ISWA 4DWSD 4QLKA 3WMSA 2FH6A 4D1JA 3WUFA 3WDRA 4U3CA 5A6KA 1CXFA 3AQUA 3AZRA 5CLTA 1JZ2A 2X2YA 1EA9C 3D5HA 4MB3A 1BYDA 3FNDA 5D4YA 1M01A 3ZJ8A 1QNQA 1NWTA 3A47A 3NSNA 3VIJA 1CGTA 1MVYA 1E4IA 4P7OA 1TVNA 1WDPA 3AMDA 3WQ5A 2OYKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AZI A;  2WCG A;  2XVL A;  4PBG A;  4UQC A;  2WCS A;  1NWS A;  2BHZ A;  1E55 A;  1AVA A;  4NSB A;  2E9B A;  4V2X A;  1Q6E A;  3CZE A;  1E3Z A;  3SUV A;  4CVW A;  1E0V A;  1QBB A;  4TXE A;  1VIW A;  1CPU A;  2CKS A;  5IHS A;  4WSK A;  1C8Q A;  1KXV A;  2VMF A;  4KMQ A;  3KWX A;  2GDU A;  4YPJ A;  4LGX A;  2OSX A;  3VUP A;  3AS2 A;  8A3H A;  3CH9 A;  3WSU A;  1LG2 A;  2JF7 A;  3AIB A;  5I5R A;  2VL4 A;  5CGM A;  2D24 A;  5HXM A;  2J62 A;  4UFH A;  2G41 A;  4AC1 X;  2FGL A;  2D3L A;  4EK7 A;  1HX0 A;  4PTX A;  1H0G A;  2PWG A;  5I78 A;  1UA3 A;  3PTM A;  2WZH A;  2OSW A;  5E0F A;  4OZO A;  4UZS A;  5IHR A;  3L4W A;  1MWO A;  2PC8 A;  4AEF A;  4XUY A;  1KQY A;  5JIW A;  4PMQ A;  4LYP A;  1X6N A;  1QNP A;  1E6P A;  4UOQ A;  2W4X A;  2IUZ A;  1A3H A;  2ZE0 A;  2VQT A;  1C90 A;  4U2Z A;  2WWD A;  4CVU A;  1GOO A;  4ZE4 A;  1EQP A;  4XZW A;  2WZI A;  4B15 A;  1UA7 A;  1HNY A;  1H41 A;  3OB8 A;  3VDB A;  3WD4 A;  2OSY A;  2DSZ A;  3K8L A;  1XV8 A;  4OIF A;  2WHK A;  3EBV A;  1WDS A;  1WZK A;  1V0N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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