1QNSA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5
pubmed doi rcsb
source organism Trichoderma reesei
total genus 139
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnsA00
3FHAA 4W85A 2RGMA 4GI6A 2CYGA 1PZ3A 2A3CA 2J7FA 4EANA 3VGEA 1M03A 3WL1A 1WZMA 2DSWA 3A4WA 3AMKA 1IV8A 3MV11 4HP5A 1E70M 4UFIA 1AQ0A 5JBEA 1QHPA 5AYIA 4TX6A 1YQ2A 1BG9A 5M03A 3A6OA 4U31A 4CN4A 4X0NA 2DIJA 3DHPA 3U57A 3WMBA 5A8MA 1E6ZA 1WDPA 2DSUA 2V3EA 5M3WA 1XC6A 3K46A 3WF2A 3WEOA 1QHZA 3N04A 3RJXA 1QNRA 4DUVA 3W0KA 5A6KA 5A6BD 2D24A 4Z2GA 1R7OA 3CHEA 2EBNA 1QW9A 2YL6A 5DT7A 1ISZA 4EK7A 4QFUA 3OLDA 5HDRA 4TVCA 1WCGA 9CGTA 2D1ZA 3WMCA 1JFHA 4K68A 1KGUA 1HF6A 4AEFA 4XZBA 2V38A 1E0VA 3M46A 1HJWA 3W6LA 3KE0A 2CHNA 1UD3A 4KGJA 1MW2A 2J4GA 4J27A 1B3ZA 3WUFA 3A3HA 2ZUUA 1C8QA 1UD2A 1BYAA 5A3HA 2VUYA 2FGZA 3VGGA 1GQKA 1HP4A 1OT1A 4PMYA 3KEHA 4B16A 5E70A 2A3EA 2WMFA 3IK2A 3I3BA 2A3BA 1QVBA 3CUJA 4J3UA 4S3JA 1BVZA 1R8LA 1JGIA 3WQ6A 1GNXA 3VTRA 3EDJA 1MQQA 1UR2A 1UR9A 2WM0A 3UETA 4JCLA 2JE8A 3VMPA 1BYDA 1GORA 3VD4A 3OGVA 1H11A 1TMQA 2XM1A 4CN6A 1J11A 4IPLA 4PMXA 2WPGA 3LPPA 4V2XA 1J0HA 1E5NA 5E0CA 5A94A 1BQCA 3AROA 4CVWA 3NSNA 2CBJA 2J79A 5ABHA 4H8HA 3WF4A 3WH7A 4PMUA 4HA3A 2ZX6A 1ZS2A 2YIHA 1DWFM 3AMGA 3NCOA 1C8XA 1JZ7A 1TA3A 4DUWA 1KCLA 1DEDA 1HKKA 2XVKA 4YHGA 2DT0A 4OIFA 3WD1A 1QI2A 3U7VA 4JFVA 5IXEA 1UKQA 4HU0A 4CN1A 4M24A 1HJQA 2XGIA 1C7TA 3KL3A 3FAWA 4Q22A 5D9OA 5AC5A 5CSUA 2WVSA 4ZEPA 5JBDA 1VJZA 1KGWA 2X09A 1D2KA 2XVNA 4JKMA 1ZBVA 3AMLA 1E0XA 5A8OA 1GQJA 1MYRA 1UYQA 4UCFA 4DUXA 2X0YA 4HPGA 1B3VA 2W66A 3WQ5A 3VDAA 1FH9A 5M17A 3PTKA 1QHOA 1KXVA 2V5DA 3AHZA 3WFLA 4AWEA 4YN5A 1VB9A 2VRJA 3T0AA 3F5JA 3WENA 1V3LA 4Y7EA 2X8RA 1WDRA 1G5AA 1EDQA 1CGUA 1E6QM 3BAKA 3VMOA 2C0HA 5BYWA 4R5EA 5KZ6A 3WDQA 1K9EA 1PJ9A 5ABGA 2DSZA 4ATDA 1AMYA 4XZWA 2WB5A 3GNRA 2VX6A 4W8LA 4KWUA 5I5RA 1CGTA 1EHNA 7CGTA 1EDTA 2VR4A 3W26A 4HU8A 6TAAA 2CIPA 2JALA 1QBAA 4GI9A 1E4MM 4D6IA 2WVVA 2WNWA 1FOBA 1US3A 1JAKA 2D3NA 3AXXA 1E6PA 3AXHA 1QNOA 1WKYA 2WMIB 4FK9A 4GIAA 1J0IA 2OWWA 3QHOA 1EHAA 3UG4A 3ZJ8A 1V03A 3GXMA 3BAYA 1UD4A 3W82A 3ZO9A 3MUIA 1V6UA 4U3CA 5I24A 4M8UA 3CO4A 2DIEA 2DT1A 1JIBA 3HJEA 4UFHA 5I6SA 3WNPA 4PTMA 1A47A 2V5CA 4BQ4A 3K8LA 5FKYA 4E8CA 3MUZ1 1HVXA 3ARYA 4Z2IA 3WBAA 1B3YA 1DWAM 3AFBA 5DMYA 1QI0A 3CBWA 1Z32X 1MWOA 1LG2A 4GQRA 4UOJA 2BY2A 1H3GA 3CHCA 3NDYA 4M80A 5CGTA 3WDPP 2W5FA 2YA2A 4MJ4A 2ZE0A 3VDCA 4ZXOA 2JEPA 4PTVA 3PZVA 4OOUA 1CYGA 3VOCA 2BXZA 1ITCA 2JIEA 3AHYA 4J28A 1VJSA 4PSRA 3BCFA 4XUYA 4C7FA 1ZBKA 3UG5A 1OWQA 2FHCA 1DWHM 1KCKA 4QLJA 4F9JA 5A6AA 2VCCA 1NP0A 1PIFA 3AICA 4U2YA 5CG0A 2O92A 5A69A 3M7SA 1CWYA 1GJWA 2PWEA 3RM8A 4ZE4A 3M6DA 1D7FA 1IZJA 1CZ1A 2GUYA 4CD7A 4BCEA 2E3ZA 5A8QA 2VCBA 1G1YA 3ZM8A 3QR3A 1EO5A 2VTFA 5ECUA 5AYBA 2J8GA 3VMNA 1MW3A 1KBBA 3L4XA 1XRVA 1F4AA 3APGA 1UKPA 3AIWA 3CZLA 5EFFA 1JD9A 1WPCA 3TTYA 2J7DA 1UQYA 3SIMA 3L2LA 4GZIA 4JFUA 2BY3A 3TTQA 3WNNA 2J7EA 3GNPA 1XSIA 1QNPA 2W61A 1J12A 3CMJA 4TVUA 4U2ZA 4D6HA 1HN1A 1UWQA 3K4DA 2GVYA 2WCAA 3AZRA 2WW5A 2A3HA 4LYRA 3VVGA 3N17A 4IISA 2OYMA 1GQIA 1AVAA 1FP8A 1GOMA 5DO8A 1B2YA 2VC9A 3DECA 4AMCA 4WKHA 2C7FA 4AC1X 3L4VA 4ZFMA 2J47A 4ATLA 4BZYA 4D6CA 5CGMA 3RO8A 4PYSA 3CHFA 3BC9A 2UY3A 3VUPA 1D3CA 3OLIA 2GJXB 3RILA 3OB8A 4AD3A 3SUWA 1G0CA 3ZOAA 1FHDA 1G01A 3SCRA 5AY7A 4WLCA 5ABFB 2PBOA 4ACYA 1NQ6A 2W4XA 3ZT5A 1CNVA 5DFAA 1WP6A 3ZT7A 1MVYA 1M53A 4OUEA 3SCOA 4QAWA 3UEQA 1PPIA 4B9ZA 3LMYA 3AXIA 4JIEA 4W8BA 4UQAA 1BLIA 1OT2A 3BMVA 3U7BA 2XIBA 4LYQA 1S46A 3W37A 3ZQ9A 2YJQA 3EDKA 1L8NA 2VJXA 3IJ9A 3K8MA 5CLWA 1JNDA 3W27A 4WSJA 3TTOA 4GPNA 4CU6A 1BG4A 3N1AA 1J0ZA 1VRXA 3CZJA 1H4PA 4WJXA 3VM5A 6A3HA 3SCUA 2QF8A 1HIZA 4BS0A 2CBUA 4Z2JA 5DF0A 3VIFA 1E6RA 2VL4A 3OZOA 1BTCA 5DT5A 1B90A 3AMDA 4JCMA 1V0NA 1CXHA 1XD1A 1ODZA 2J7HA 1NP2A 5C70A 1DTUA 3VIGA 1W3HA 4E4PA 3WH9A 4H41A 1W1TA 3W29A 2E0PA 2E9LA 2UY5A 3AHTA 5CZKA 2B31A 3N15A 1JAEA 3KL5A 1RPKA 1PIGA 2PWHA 3F4VA 1WDQA 2XVGA 1J9YA 2EPLX 1VBRA 2BY1A 3VGDA 1XH1A 2BHUA 4D1JA 4MADA 2WZHA 3PBGA 1CTNA 2PI6A 4MDOA 3SCNA 1Q6EA 3AZSA 4RE3A 4J3WA 2FH6A 1C93A 1UD6A 2GK1A 3VU2A 2PWGA 1MXDA 4C7DA 2WANA 2X2YA 4V28A 4B9YA 3AIRA 2Q8XA 2J7CA 4URIA 4AY1A 1VENA 1VEPA 2BY0A 4D1IA 1UWUA 1V3HA 2OYLA 2DGAA 3AS0A 1B30A 1NOUA 3W25A 1GVIA 1V6YA 5EFDA 1WAWA 4UQCA 1ZBCA 1J10A 3HN3A 4BQ2A 2WBKA 1OB0A 5D4YA 1H49A 3QHMA 3W24A 4UOZA 1UUQA 1BF2A 4MB4A 1JI2A 3WFZA 3BXWA 1HKMA 2J8FA 1EOMA 4W5UA 3VINA 4GZEA 4B3KA 4CD6A 4X9YA 5I79A 2OYKA 3EMCA 2WZEA 2AOSA 1M01A 2XVLA 3VIHA 3AIUA 3N13A 2E4TA 3AISA 4W7WA 2WHMA 2IXUA 4F79A 2ZUVA 2JF7A 4OZOA 1GOOA 1Q6FA 3WD2A 4F8XA 1V6XA 5FCZA 1CPUA 4W93A 5JUVA 1ZJAA 1JZ3A 2XFRA 4UQBA 4HMCA 1UR1A 1VFFA 1WDSA 1C92A 3WELA 2OWXA 3U5UA 3J7HA 3PN8A 4AZGA 3DHUA 3PZOA 1MW0A 5E0FA 3CTTA 1XV8A 1ISXA 4HPHA 3AHXA 3AYSA 1EIBA 2YBUA 1PX3A 4U5IA 3TONA 1DWGM 3CMGA 4NI3A 2ZUNA 1FFRA 1B31A 1OIMA 1MFUA 4OBSA 4Z2LA 2OSYA 3WUBA 3UESA 3EYPA 1KWGA 1E72M 1NWRA 4GXPA 3WD3A 2G3JA 3WF1A 1ITXA 2CKRA 4ACZA 3E1F1 1GVYA 3CUFA 1KR1A 3AS2A 4D6DA 5BXTA 5FL0A 5CLTA 2XVPA 4NRSA 1PEZA 3WSUA 1W1VA 4AD2A 1TG7A 1U2YA 4W7VA 1E40A 4HTYA 1NOWA 4D6FA 5IDIA 1CLVA 1GJUA 5IHRA 1CXIA 4P8UA 3AQUA 1CEOA 4QCFA 3TP4A 3AZTA 5FOOA 2EPKX 2PBGA 4JL2A 2ZXDA 2WMJA 3VD7A 4UTFA 1HJVA 1BGGA 3CZEA 1V0LA 2ZX8A 3GNOA 4MNLA 4PTWA 3VIPA 1I75A 1WNOA 2YDRA 5E9AA 1HP5A 1TZ7A 3CLWA 3QGVA 4QLLA 1Y7VA 3WDRA 3PZIA 2ZUTA 2XSAA 3MV01 4QLKA 3I3DA 2VRKA 2YLLA 2O9TA 3CUIA 1K9TA 2XTKA 1OM0A 3BGAA 4JKLA 3THCA 5FL1A 4HMEA 5AC4A 3ZT6A 3WQVA 1C7SA 2AMGA 3A4AA 3W81A 4PMOA 1GOIA 1DWIM 5I2UA 3MSGA 1U30A 1EDGA 4EAMA 3GXFA 1JYXA 4YPJA 4GI8A 2WWCA 5FD0A 2XFFA 3W38A 5HPOA 3WF3A 5A95A 2DQXA 2PC8A 5GNYA 1M7XA 2YDQA 3SCVA 4OBRA 4JAWA 2WMHA 1CXKA 3NYDA 2CCRA 1VEMA 1BAGA 4WIWA 4AD4A 1UWRA 3O2LA 4W5ZA 2VT0A 2W67A 4W87A 1EQCA 3VGBA 2XUCA 1SMAA 1AQHA 4PSPA 4C7GA 3ZSSA 3ARRA 1E6SM 1WZLA 3VKKA 1W1YA 2ZUMA 3WNLA 3EBVA 3BAWA 2XYLA 2FGLA 1R7AA 2ZUSA 1MW1A 1XCWA 1KXTA 1TR1A 1Q6CA 4CU7A 1SMDA 1V0KA 4TX8A 4FLRA 1UR0A 1ZL1A 1V0MA 4H2CA 1VAHA 1JDAA 3VGHA 2G41A 4GQQA 2VMFA 1GONA 4RE4A 2CPUA 1X6LA 1H2JA 3NDZA 2Y2WA 4QCEA 2VVSA 2EEXA 3WQ4A 4B3LA 2W62A 4YHEA 7A3HA 3PHAA 3OIHA 2FHBA 4PEEA 2ZXBA 1E5JA 3GDBA 1H09A 3ZR6A 2E8YA 2YLAA 2VURA 2DH3A 3RCNA 3D3AA 4UQ9A 2VCAA 1V08A 3WBEA 3ZJ6A 1WZAA 1JZ6A 1HL9A 1HT6A 2WMGA 3T2QA 2WHKA 4P7QA 2A3AA 1W2PA 1PX4A 4W84A 4MPKA 3S2CA 1EGZA 4UZUA 2ZXQA 1OGBA 1PBGA 4PUEA 3G6MA 3LPOA 3GXDA 4XB3A 2VZUA 1JZ2A 5A8NA 1JG9A 3IJ8A 3NSXA 2PB1A 4D6JA 5BXRA 2BV9A 5D8ZA 1HXJA 3M07A 1J01A 3PZQA 1OINA 2WSKA 1XYFA 2W92A 1W3JA 2J25A 5HNNA 4D6GA 3DYPA 1FA2A 2J7GA 1CECA 4FLOA 2WVTA 2E9BA 4CD8A 2XM2A 3AIQA 2GDVA 4DM2A 3BMWA 3CIVA 1JYNA 2O9PA 2JFEX 1UKSA 1H0IA 3IAPA 1K6AA 1ISYA 8A3HA 4M29A 5A2AA 3AS1A 3ZSTA 1F4HA 2VQTA 3RM4A 5JBFA 5CPQA 1B9ZA 4AD1A 2DPEA 1NH6A 1QPKA 1ISVA 3SCQA 3EMQA 1BGAA 3MUAA 3MMWA 1PZ2A 3ARTA 2ZUWA 3RDKA 3RIKA 3O6AA 4NF7A 4AZCA 4V27A 3AIBA 4LGXA 1BYCA 1HX0A 2CXGA 4E2OA 2DSKA 4IPNB 2DSVA 2QPUA 4KMQA 3VILA 5ABEA 4M56A 3N12A 2EQDA 2OSXA 1E43A 2CERA 1LJYA 4CGTA 3MS8A 1KBKA 5KEZA 3N18A 2D22A 1R87A 1UWSA 4PMZA 4UNIA 1IZKA 4M81A 2WSPA 5A8PA 1JF6A 4R27A 2G3IA 2EJ1A 1G94A 4Z2KA 2E9MA 1LQ0A 4ZE5A 1SYTA 4U5KA 1W2VA 1GOWA 1MXGA 1NWUA 1GZJA 3EMZA 2IXVA 1U33A 4Q7NA 3MANA 4TVDA 2NT0A 4W7UA 3SCSA 4UFJA 3VPLA 2WMKA 4PMQA 1NM9A 1KQYA 1UA7A 2NSXA 4LX4A 2W63A 3MUY1 4HZ8A 3U5YA 2RGLA 1ECEA 1GUVA 2G3MA 3AJ7A 3CZKA 5EB8A 2D2OA 1E56A 4CUCA 2ZX9A 2XFYA 2CEQA 4RE2A 4NSBA 4CCDA 3MU7A 1ISWA 3JUGA 1CENA 4AISA 1X1NA 3S6TA 1E3ZA 3BH4A 3LPFA 2XWEA 3L2MA 3VD5A 1KWKA 3VX1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FHA A;  4W85 A;  2RGM A;  4GI6 A;  2CYG A;  1PZ3 A;  2A3C A;  2J7F A;  4EAN A;  3VGE A;  1M03 A;  3WL1 A;  1WZM A;  2DSW A;  3A4W A;  3AMK A;  1IV8 A;  3MV1 1;  4HP5 A;  1E70 M;  4UFI A;  1AQ0 A;  5JBE A;  1QHP A;  5AYI A;  4TX6 A;  1YQ2 A;  1BG9 A;  5M03 A;  3A6O A;  4U31 A;  4CN4 A;  4X0N A;  2DIJ A;  3DHP A;  3U57 A;  3WMB A;  5A8M A;  1E6Z A;  1WDP A;  2DSU A;  2V3E A;  5M3W A;  1XC6 A;  3K46 A;  3WF2 A;  3WEO A;  1QHZ A;  3N04 A;  3RJX A;  1QNR A;  4DUV A;  3W0K A;  5A6K A;  5A6B D;  2D24 A;  4Z2G A;  1R7O A;  3CHE A;  2EBN A;  1QW9 A;  2YL6 A;  5DT7 A;  1ISZ A;  4EK7 A;  4QFU A;  3OLD A;  5HDR A;  4TVC A;  1WCG A;  9CGT A;  2D1Z A;  3WMC A;  1JFH A;  4K68 A;  1KGU A;  1HF6 A;  4AEF A;  4XZB A;  2V38 A;  1E0V A;  3M46 A;  1HJW A;  3W6L A;  3KE0 A;  2CHN A;  1UD3 A;  4KGJ A;  1MW2 A;  2J4G A;  4J27 A;  1B3Z A;  3WUF A;  3A3H A;  2ZUU A;  1C8Q A;  1UD2 A;  1BYA A;  5A3H A;  2VUY A;  2FGZ A;  3VGG A;  1GQK A;  1HP4 A;  1OT1 A;  4PMY A;  3KEH A;  4B16 A;  5E70 A;  2A3E A;  2WMF A;  3IK2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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